DE4011730A1 - Elektrophoresevorrichtung vom fluoreszenzerfassungstyp - Google Patents
Elektrophoresevorrichtung vom fluoreszenzerfassungstypInfo
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Description
Die vorliegende Erfindung betrifft eine Elektrophoresevorrichtung vom Fluoreszenz
erfassungstyp und insbesondere eine Elektrophoresevorrichtung vom Mehrfahrb-
Fluoreszenzerfassungstyp bzw. Vielfarb-Fluoreszenzerfassungstyp. Im besonderen
betrifft die vorliegende Erfindung eine Elektrophoresevorrichtung vom Vielfarb-
Fluoreszenzerfassungstyp, die vorzugsweise geeignet ist zum Bestimmen einer DNA-
Basensequenz einer DNA oder dergl. auf eine Art und Weise, daß eine Vielzahl
von Fluorophoren unterschiedlicher Emissionswellenlängen verwendet werden, um
die Fragmente der DNA oder dergl. vielfarbig zu markieren, und daß jeder der
fluoreszierenden Lichtstrahlen der DNA-Fragmente, die nach der Elektrophorese
trennung emittiert werden, erfaßt wird.
Eine herkömmliche Technik zum Bestimmen der DNA-Basensequenz ist die
Autoradiographie, bei der ein radioaktiv isotopes Element zum Markieren
verwendet wird. Es besteht jedoch ein neuer Trend dahingehend, eine Technik zu
verwenden, wobei fluoreszierende Markierungen verwendet werden, um die DNA-
Fragmente optisch und automatisch zu erfassen, um die DNA-Basensequenzen
automatisch zu bestimmen. Diese Technik verwendet ein Verfahren, wobei die vier
DNA-Fragmente unterschiedlicher Anschlußgattung bzw. technischer Spezies bzw.
endständiger Basen mit jeweiligen Fluorophoren unterschiedlicher Emissions
wellenlängen markiert werden und die DNA-Fragmente durch Gel-Elektrophorese
separiert werden. Die DNA-Fragmente werden von einem Laserstrahl auf bzw. in
die Migrationspfade bzw. Verschiebungswege bzw. Wanderbahnen bestrahlt. Die
emittierten Fluoreszenzlichtstrahlen werden von einem Detektor mit vier
Bandpaßfiltern empfangen, bei denen die Übertragung bzw. der Durchgang für die
jeweiligen emittierten Wellenlängen maximal ist. Ein herkömmlicher Detektortyp
wird verwendet, so daß ein Photomultiplizierer mit vier Bandpaßfiltern auf einer
rotierenden Platte in Synchronismus mit einem abtastenden bzw. scannenden
Laserstrahl bewegt wird (siehe "Nature", Bd. 321, 1986, S. 674-679).
Es ist eine alternative Technik dokumentiert, bei der ein Laserstrahl auf eine
elektrophoretische Platte, die ausgerichtet ist, bzw. auf einer Linie ausgerichtet ist,
angelegt ist, und die Abbildung der emittierten Fluoreszenzlichtzeile wird durch ein
Prisma in Spektren aufgeteilt, die wiederum von einem hochsensiblen zweidimensio
nalen Detektor erfaßt werden (siehe US-PS 48 32 815).
Es ist wichtig, die hohe Empfindlichkeit des zuvor erwähnten Fluoreszenzlicht
detektors zu erreichen. Bei dem Fluoreszenzmeßsystem, bei dem der Detektor
abgetastet bzw. gescannt wird mit bzw. durch Scannen des Bestrahlungslichtes unter
Verwendung eines Rotationsfilters, wird der Anteil bzw. die Proportion der Meßzeit
α für einen Meßpunkt des Gels ausgedrückt durch
α = d /4 l,
wobei l eine Länge eines Meßbereiches und d eine Breite des bestrahlenden
Laserstrahls angibt. Im allgemeinen ist α kleiner als oder gleich 10-3, wenn d =
0,2 bis 0,3 mm und l länger als oder gleich 100 mm ist.
Dies ist dahingehend nachteilig, daß es zu einer Empfangslichtmenge so wenig wie
bzw. weniger als 1/1000 der kontinuierlichen Lichtbestrahlung und des Erfassungs
verfahrens führt, was in einer zu geringen Empfindlichkeit resultiert.
Andererseits werden bei der Technik, bei der ein Laserstrahl in eine Seitenend
fläche des flach aufgebrachten Gels bzw. Flachbettgels kommt, um jeden Meßpunkt
kontinuierlich zu bestrahlen, die erhaltenen Fluoreszenzlichtabbildungen über ein
Prisma in Spektren aufgeteilt, die wiederum von einem zweidimensionalen Detektor
erfaßt werden, wobei die Lichtempfangsmenge hoch und die oben erwähnte
Schwierigkeit beseitigt ist. Die Lichtaufteilungsgenauigkeit ist jedoch zu gering, um
eine hochpräzise DNA-Basengattung zu identifizieren. Das heißt, daß bei dieser
Technik die Fluoreszenzspektren zu breit sind, so daß die emittierten Wellenlängen
der Fluorophore nur um etwa 20 nm bei maximalen Wellenlängen getrennt
werden. Es ist demgemäß auf nachteilige Weise schwierig, die Fluoreszenzlicht
strahlen ausreichend zur Erfassung zu trennen, die unter weiten festgelegten
Winkeln von den Emissionspunkten der Fluoreszenzlichtabbildungen emittert sind.
Wie oben erwähnt, sind die herkömmlichen Techniken nachteilig, da keine
Anstrengungen hinsichtlich höherer Empfindlichkeit und hochpräziser Wellenlängen
trennung unternommen sind.
Eine Aufgabe der vorliegenden Erfindung liegt darin, die obenerwähnten
Schwierigkeiten zu beseitigen und eine Elektrophoresevorrichtung vom Vielfarb-
Fluoreszenzerfassungstyp zu schaffen, die in der Lage ist, DNA's mit hoher
Präzision und hoher Empfindlichkeit zu trennen und zu erfassen.
Als Ergebnis ihrer Studien fanden die Erfinder heraus, daß die oben genannte
Aufgabe ausgezeichnet erreicht wird dadurch, daß eine Fluoreszenzlichtabbildung,
die erhalten wird durch Anlegen eines Laserstrahls auf eine Elektrophorese-
Trennplatte, in eine Vielzahl von virtuellen Abbildungen aufgeteilt wird, dann die
einzelnen aufgeteilten Abbildungslichtstrahlen über Bandpaßfilter wellenlängen
selektiert werden und diese sich ergebenden Abbildungen auf einen Detektor für
geeignete Trennung und Detektion fokussiert werden. Die Erfinder setzten ihre
Studie auf der Basis dieser neuen Erkenntnis fort und vervollständigten die
vorliegende Erfindung.
Daher umfaßt die erfindungsgemäße Elektrophoresevorrichtung vom Fluoreszenz
erfassungstyp zumindest eine Gelplatte zur Elektrophoresetrennung, eine Anregungs
laser-Strahlquelle zum Emittieren von Fluoreszenzlicht, einen Fluoreszenzlicht
detektor zum Erfassen des emittierten Fluoreszenslichtes, und die Vorrichtung ist
dadurch gekennzeichnet, daß die Vorrichtung aufweist eine Abbildungsaufteilungsein
richtung für eine lineare Fluoreszenzlichtabbildung, die erhalten wird durch Anlegen
eines Laserstrahls auf eine geeignete Position der Gelplatte zur Elektrophorese
trennung, Bandpaßfilter unterschiedlicher Durchgangswellenlängen, die in ihrer
Anzahl der Anzahl der von der Abbildungsaufteilungseinrichtung unterteilten
Abbildungen entsprechen, und eine optische Einrichtung zum Fokussieren der
einzelnen Fluoreszenzlinienabbildungen unterschiedlicher Transmissionswellenlängen,
die durch die jeweiligen Bandpaßfilter gebildet werden auf den Fluoreszenzlicht
detektor.
Bei einer praktischen Konstruktion der erfindungsgemäßen Elektrophoresevor
richtung vom Fluoreszenzerfassungstyp wird die Lagerstrahlbestrahlung auf die
geeignete Position der Gelplatte zur Elektrophoresetrennung auf ein Flachbettgel
der Gelplatte zur Elektrophoresetrennung gerichtet und geht durch dieses durch,
und zwar parallel zu der Gelplatte zur Elektrophoresetrennung durch die
Seitenendfläche der Gelplatte, und eine Fluoreszenzlicht-Lichtabbildung, die durch
die Laserbestrahlung erhalten wird, ist entlang eines Weges des Laserstrahls in
dem Flachbettgel ausgerichtet.
Die Abbildungsaufteilungsvorrichtung kann aufweisen ein Prisma oder Prismen, die
dem laserstrahl-bestrahlten Abschnitt und/oder dem Fluoreszenzlicht empfangenden
Abschnitt hinzugefügt wird, bzw. werden; oder eine Vielzahl von Reflektions
spiegeln, die parallel zu einer Achse eines Laserstrahls in der Gelplatte zur
Elektrophoresetrennung angeordnet bzw. ausgerichtet sind; oder zumindest eine
Vielzahl von Linsen unterschiedlicher optischer Achsen oder eine Linse, die in
Fragmente unterschiedlicher optischer Achsen aufgeteilt ist, und die auf einem Pfad
vorgesehen sind bzw. ist, in dem Fluoreszenzlicht, welches von einem Laserstrahl
bestrahlenden Abschnitt der Gelplatte zur Elektrophoresetrennung emittiert wird,
zu der Fokussierposition auf dem Fluoreszenzlichtdetektor kommt. Die Abbildungs
aufteilungseinrichtung kann ein zusätzliches Prisma oder einen Spiegel enthalten
zum Aufteilen der Fluoreszenzlichtabbildung auf einen Weg bzw. Pfad, auf dem
Fluoreszenzlicht bzw. Lichtstrahlen, die von einen Laserstrahl abstrahlenden
Abschnitt der Gelplatte zur Elektrophoresetrennung in die Fokussierposition des
Fluoreszenzlichtdetektors kommen, und zwar um die Abbildungsaufteilungsfunktion
der obigen Abbildungsaufteilungseinrichtung zu unterstützen.
Die Vielzahl von Linsen bzw. Objekten unterschiedlicher optischer Achsen, die
zuvor erwähnt wurden, können vorgesehen sein durch Überlappen von zwei oder
vier rechteckförmigen Kondensorlinsen in vertikaler Richtung, wobei ihre längeren
Seiten horizontal liegen.
Bezüglich des Vorsehens der einzelnen Linse, die in Fragmente mit abweichenden
optischen Achsen aufgeteilt ist, wie zuvor erwähnt, kann z. B. eine kreisförmige
Kondensorlinse radial in zwei oder vier Fragmente auf einer Linie oder auf Linien
unterteilt werden, die durch einen Mittelpunkt derselben gezogen sind, und die
Fragmente können integriert bzw. zusammengesetzt werden, wobei jedes Fragment
um ein bis zwei Grad gegenüber einer Ebene mit rechten Winkeln zu der
optischen Achse der Originallinse geneigt wird.
Um die Abbildungsaufteilungsfunktion bzw. Abbildungstrennfunktion der Abbildungs
aufteilungseinrichtung zu realisieren, kann z. B. das zusätzliche Prisma oder der
zusätzliche Spiegel folgendermaßen angeordnet bzw. ausgelegt sein. Zwei Spiegel
von 10 mm auf 100 mm sind an ihren längeren Seitenkanten in dem Zustand
miteinander verbunden, daß die Spiegel von einer Ebene um etwa 1 Grad
abweichen. Der so integrierte Spiegel kann in eine Position 5 bis 10 mm hinter
dem Laserstrahl abstrahlenden Abschnitt gesetzt werden. Das Prisma mit 150 Grad
Scheitelpunkt bzw. das Prisma mit 150 Grad Scheitelwinkel kann in eine Position
20 mm vor dem Laserstrahl bestrahlten Teil gesetzt werden, wobei seine Kante
parallel zu dem bestrahlten Abschnitt ist.
Wenn die Abbildungsaufteilungseinrichtung eine Vielzahl von Reflexionsspiegeln
umfaßt, werden die Bandpaßfilter unterschiedlicher Transmissionswellenlängen, die
in ihrer Anzahl der Anzahl der Reflexionsspiegel entsprechen, auf den jeweiligen
Fluoreszenzlichtpfaden von den Reflexionsspiegeln vorgesehen, und zwar auf
Fokussierpositionen auf einem Fluoreszenzlichtdetektor.
Vorzugsweise sind die Vielzahl von ebenen Reflektionsspiegeln auf einem Umfang
einer Ellipse angeordnet, die einen Punkt des Laserstrahls innerhalb der Gelplatte
zur Elektrophoreseseparation als einen Mittelpunkt hat.
Zur praktischen Anwendung bzw. Verwendung kann die Vielzahl von Reflektions
spiegeln z. B. auf eine solche Weise angeordnet sein, daß vier Spiegel mit 10 mm
auf 100 mm an ihren längeren Seitenkanten verbunden bzw. geklebt sind, wobei
die vier Spiegel auf einer Biegelinie angeordnet sind, um die Ellipse zumindest
virtuell zu berühren.
Weiterhin kann die Abbildungstrennung- bzw. -aufteilung vollzogen werden unter
Verwendung eines Prismas, um die Aufgabe der vorliegenden Erfindung zu lösen.
Zunächst wird die durch Anlegen des Laserstrahls auf die Platte zur Elek
trophoreseseparation erhaltene Fluoreszenzabbildung in eine Vielzahl von virtuellen
Abbildungen unter Verwendung eines Primas aufgeteilt. Jede der aufgeteilten
virtuellen Abbildungen wird dann bezüglich der Wellenlänge durch Bandpaßfilter
aufgespalten bzw. getrennt, um die Abbildung auf den Detektor zu fokussieren, um
die getrennten Abbildungen zur Lösung der erfindungsgemäßen Aufgabe zu
erfassen.
In diesem Fall umfaßt die Elektrophoresevorrichtung vom Fluoreszenzerfassungstyp
zumindest eine Gelplatte zur Elektrophoreseseparation, eine Laserstrahlquelle und
einen Fluoreszenzlichtdetektor mit einem Prisma, das eine Vielzahl von Licht nach
außen führenden Ebenen hat, um eine Fluoreszenzlicht-Linienabbildung aufzuteilen
bzw. zu trennen, die erhalten wird durch Anlegen eines Laserstrahls an eine
geeignete Position der Gelplatte zur Elektrophoreseseparation, und ein optisches
System zum einzelnen Fokussieren einer Vielzahl der Fluoreszenzlinienabbildungen
auf den Fluoreszenzlichtdetektor, wobei die Fluoreszenzlinienabbildungen durch die
Vielzahl der Licht nach außen führenden Ebenen des Prismas aufgeteilt sind.
Das optische System hat ein Bandpaßfilter mit einzelnen unterschiedlichen
Transmissionswellenlängen, das auf jeweiligen entsprechenden Pfaden der
aufgeteilten Abbildungslichtstrahlen vorgesehen ist, die aus der Vielzahl der Licht
nach außen leitenden Ebenen des Prismas herauskommen.
Das Prisma kann auf praktische Weise derart gebildet sein, daß - wie in der
Zeichnung beispielhaft gezeigt - es ein Polyeder sein kann, der symmetrisch zu
einem Abschnitt ist, der Kanten bzw. Ecken eines mittleren Spitzenpunktes bzw.
-winkels oder ein polyederartiges Trapezoid enthält, welches symmetrisch zu einem
Mittelabschnitt ist.
Das Prisma muß aus einem Material mit hohem Lichtbrechungsindex hergestellt
sein, wie BaF01, LaF3 oder SF3 Glas, und zwar insbesondere bei der erfindungs
gemäßen Elektrophoresevorrichtung vom Vielfarb-Fluoreszenzerfassungstyp.
Das Prisma kann vorzugsweise derart positioniert sein, daß zumindest eine Ecke
bzw. Kante des Prismas in einer Ebene liegt, die die Fluoreszenzlicht-Linien
abbildungen enthält, die als das Ergebnis von einer Laserstrahlbestrahlung auf eine
geeignete Position der Platten zur Elektrophoreseseparation erhalten werden, und
einen Mittelpunkt der Fokussierposition des Fluoreszenzlichtdetektors enthält und
parallel ist zu den Fluoreszenzlicht-Linienabbildungen, oder andererseits derart, daß
das Prisma nach oben und unten bezüglich einer Ebene symmetrisch ist, die die
Fluoreszenzlicht-Linienabbildungen enthält, die als Ergebnis einer Laserstrahlbestrah
lung auf eine geeignete Position der Platten zur Elektrophoreseseparation erhalten
werden, und ein Mittelpunkt der Fokussierposition des Fluoreszenzlichtdetektors und
ein Spitzenpunkt des Prismas ist im Mittelpunkt parallel mit den Fluoreszenzlicht-
Linienabbildungen. Das Prisma kann in jeder Position zwischen der Elektrophorese
platte und dem Bandpaßfilter vorgesehen sein.
Die Aufgabe der vorliegenden Erfindung kann geeignet derart gelöst werden, daß
die Elektrophoresevorrichtung vom Vielfarb-Fluoreszenzerfassungstyp, Einrichtungen
zur Abbildungsaufteilung und Wellenlängenselektion der Fluoreszenzlicht-Abbildung
teilweise enthalten können eine zylindrische konvexe Linse und eine zylindrische
konkave Linse, wobei die mit einem breiten Winkel von der Fluoreszenzlicht
abbildung emittierten Fluoreszenzlichtstrahlen unter Verwendung der zylindrischen
konvexen Linse kondensiert bzw. gebündelt werden können und auf die Licht
empfangsebene über die zylindrische konkave Linse fokussiert werden können.
In diesem Falle umfaßt die Elektrophoresevorrichtung vom Vielfarb-Fluoreszenz
erfassungstyp zumindest eine Gelplatte zur Elektrophoreseseparation, eine
Laserstrahlquelle und einen Fluoreszenzlichtdetektor und ist dadurch gekennzeichnet,
daß Einrichtungen zur Abbildungsaufteilung und Wellenlängenselektion der
Fluoreszenzlicht-Abbildung aufweisen eine zylindrische konvexe Linse, eine
zylindrische konkave Linse und ein Bandpaßfilter.
Auch in diesem Fall, da die praktisch verwendete Einrichtung zur Abbildungsauf
teilung, z. B. das Bandpaßfilter, ein unterteiltes Filter mit mehreren Ebenen sein
kann, d. h., ein Prisma mit mehreren Ebenen mit einem Bandpaßfilterfilm auf jeder
Licht nach außen leitenden Ebene oder auf den Abschnitten der Lichteinfallebene,
die den jeweiligen Licht nach außen leitenden Ebenen entspricht, kann hierdurch
eine Abbildungsaufteilung erzielt werden. In diesem Zusammenhang kann das
unterteilte Filter mit mehreren Ebenen zwischen der zylindrischen konvexen Linse
und einer Fokussierlinse vorgesehen sein. Weiterhin ist es vorzuziehen, daß Ebenen
des unterteilten Filters mit mehreren Ebenen Bereiche haben, die derart bezüglich
der Größe sind bzw. Abmessungen haben, daß die Mengen des sie passierenden
Fluoreszenzlichtes im wesentlichen gleich sein können.
Als ein weiteres Beispiel der Einrichtung zur Abbildungsaufteilung umfaßt die
zylindrische konvexe Linse eine Vielzahl von unterteilten zylindrischen konvexen
Linsen, wodurch die Fluoreszenzlicht-Abbildung unterteilt werden kann.
Weiterhin ist es vorzuziehen, daß, um die Lichtemission von anderen Abschnitten
als dem Emissionspunkt durch Laserbestrahlung vor beeinflußter Messung zu
bewahren, ein Schlitz parallel zu den Fluoreszenzlicht-Linienabbildungen zwischen
einem Emissionspunkt der Fluoreszenzlicht-Linienabbildungen und einer zylindrischen
konvexen Linse vorgesehen ist, um die oberen und unteren Teile der Fluoreszenz
lichtstrahlen abzuschneiden, bzw. abzublocken, die von dem Emissionspunkt emittiert
werden, der höher oder niedriger ist als bestimmte Winkel.
Weiterhin ist es vorzuziehen, daß eine Schlitzbreite schmaler gemacht wird als ein
Abschnitt bzw. Intervall von virtuellen Objektpositionen.
Für den Fall, daß die erfindungsgemäße Elektrophoresevorrichtung vom Fluo
reszenzerfassungstyp verwendet wird als Elektrophoresevorrichtung vom Vielfarb-
Fluoreszenzerfassungstyp zur Trennung und Erfassung von vielfarb-markierten
Proben, ist die Trennungs- und Erfassungsprobe, die zum Wandern bzw. Versetzen
in der Platte zur Elektrophoreseseparation verwendet wird, eine vielfarb-markierte
Probe. Die Fluorophore, die zum Vielfarbmarkieren verwendet werden sind FITC
(Fluorescein-Isothiocynad) mit 515 nm Emissionswellenlänge, NBD-F (4-Fluor-7-
Nitrobenzofurazan) mit 540 nm Emissionswellenlänge, TRITC (Tetramethylrhoda
min-Isothiocyanat) mit 573 nm Emissionswellenlänge und Texas Red mit 610 nm
Emissionswellenlänge.
Die Bandpaßfilter, das im Zusammenhang mit dem Vielfarbmarkieren verwendet
wird, ist ein dielektrisches Mehrlagenfilter oder dergleichen mit 20 bis 40 nm
Transmissionswellenlängenbreite, wobei die zentrale Wellenlänge derselben mit der
Emissionswellenlänge zusammenfällt. Es kann auch eine Kombination eines
dielektrisch bedampften Mehrlagenfilters mit einem Farbglasfilter sein.
Der verwendete Fluoreszenzlichtdetektor ist normalerweise ein zweidimensionaler
Fluoreszenzlichtdetektor.
Als Proben zur Trennung und Erfassung, die bei der erfindungsgemäßen
Elektrophoresevorrichtung vom Fluoreszenzerfassungstyp verwendet werden, können
DNA's oder RNA's angezeigt bzw. verwendet sein, deren Basissequenzen zu
bestimmen sind. Es können auch Proteine oder dergl. gezeigt sein. Weiterhin kann
die Vorrichtung als Diagnosevorrichtung für menschliche Gene verwendet werden.
Die erfindungsgemäße Elektrophoresevorrichtung vom Fluoreszenzerfassungstyp kann
- wie zuvor beschrieben - am bevorzugtesten verwendet werden als Elektrophorese
vorrichtung vom Mehrfarb-Fluoreszenzerfassungstyp. Sie kann auch verwendet
werden für die Erfassung von einfarbigen Fluoreszenzen. In diesem Fall bietet die
erfindungsgemäße Elektrophoresevorrichtung vom Fluoreszenzerfassungstyp ebenfalls
einen Vorteil dahingehend, daß eine genaue Trennung und Erfassung erreicht
werden kann, da die möglichen Meßfehler aufgrund von Veränderungen der
Meßbedingungen wie Fluktuation der Laserstrahl-Bestrahlung der Elektrophoresevor
richtung vom Fluoreszenzerfassungstyp kompensiert werden können. Dies kann mit
einem kombinierten Bandpaßfilter geschehen, welches derart ausgewählt ist, daß
eine Fluoreszenzlicht-Linienabbildung z. B. in zwei Abbildungen unterteilt wird, von
denen eine verwendet wird zur Messung eines Spitzenwertes des Fluoreszenzlichtes
und die anderen verwendet wird, um spezifische Lichtstrahlen niedriger Wellenlängen
zu messen.
Wie zuvor erläutert, wird erfindungsgemäß die Fluoreszenzabbildung, die erhalten
wird durch Anlegen des Laserstrahls auf die Platte zur Elektrophoreseseparation
zunächst in eine Vielzahl von virtuellen Abbildungen durch die Abbildungsauf
teilungseinrichtung unterteilt, die aufweist den Reflexionsspiegel, eine Vielzahl von
Linsen unterschiedlicher optischer Achsen, die unterteilte Linse mit optischen
Achsen, die voneinander abweichen, ein Prisma oder dergl. Dann gehen die
einzelnen unterteilten Abbildungslichtstrahlen durch den Wellenlängendispersions
prozeß des Bandpaßfilters, um auf den Detektor zur erforderlichen Separation und
Detektion fokussiert zu werden.
Weiterhin sind erfindungsgemäß die Einrichtungen zum Unterteilen der Fluoreszenz
abbildung und Trennen der Wellenlängen teilweise aus der zylindrischen konvexen
Linse und der zylindrischen konkaven Linse gemacht. Die Fluoreszenzlichtstrahlen,
die mit weiten Winkeln von den Fluoreszenzlichtabbildungen emittiert werden,
können über die zylindrische konvexe Linse gebündelt bzw. konzentriert werden
und über die zylindrische konkave Linse auf die Lichtrezeptionsebene fokussiert
werden. Dies bedeutet, daß die Fluoreszenzlichtstrahlen, die mit weiten fest
stehenden Winkeln von dem Emissionspunkt jeder Fluoreszenzlichtabbildung
emittiert werden, in weitem Maße bzw. extensiv verwendet werden können. Die
Fluoreszenzlichtstrahlen, die von den Geräten abbildungsaufgeteilt und wellenlängen
selektiert wurden, werden auf unterschiedliche Positionen des zweidimensionalen
Detektors oder dergl. fokussiert. Diese Signale können verarbeitet werden, um hohe
Empfindlichkeiten der Messungen der DNA-Fragmente zu liefern.
Im folgenden wird im Detail einer der Fälle beschrieben, bei dem das Prisma als
abbildungsaufteilende Einrichtung verwendet wird. In der erfindungsgemäßen
Elektrophoresevorrichtung vom Fluoreszenzerfassungstyp wird die Kante von der
Spitze des Mittelteils des Prismas vorzugsweise überlappend auf den Linienemissions
teil gelegt, so daß er in Richtung auf den Abstrahlungsteil von der Pupille der
Lichtrezeptionslinse zeigt. Die Lichtstrahlen, die die oberen und unteren Teile des
Prismas passieren, können als zwei Abbildungen auf dem zweidimensionalen
Detektor fokussiert werden, und wenn sie von unterschiedlichen Punkten und zur
gleichen Zeit emittiert werden, können sie nach oben und unten wellenlängen
dispiersiert werden. Die zwei Lichtstrahlen, die aus den jeweiligen Teilen des
Prismas herauskommen, passieren die unterschiedlichen Filter in Richtung auf den
Detektor. Die Signale, deren Wellenlängen nicht aneinander liegen, werden zur
Trennung und Detektion durch das Durchleiten durch die Filter zugelassen, die
unterschiedlich gemäß dem oberen und unteren Teil sind, durch die die
Lichtstrahlen passieren. Die Signale mit großer Wellenlängendifferenz werden zur
Dispersion und Detektion durch das Prisma zugelassen.
Daher kann bei Verwendung irgeneiner der abbildungsaufteilenden Einrichtungen,
die zuvor erwähnt wurden, die erfindungsgemäße Elektrophoresevorrichtung vom
Fluoreszenzerfassungstyp die Fluoreszenzlichtstrahlen unterschiedlicher Emissions
wellenlängen mit hoher Genauigkeit und gleichzeitig ohne Zeitteilung bzw.
Zeitversatz trennen und detektieren, das heiß auf eine Art, daß die Messungen
hinsichtlich der Zeit nicht unterteilt werden müssen.
Demgemäß kann die erfindungsgemäße Vorrichtung vorzugsweise verwendet werden
zum Bestimmen der Basensequenz der vielfarbfluoreszenzmarkierten DNA-
Fragmente.
Darüber hinaus bietet die erfindungsgemäße Elektrophoresevorrichtung vom
Fluoreszenzerfassungstyp eine große Menge an Rezeptionslicht für eine hohe
Empfindlichkeit, da die bestrahlten Teile kontinuierlich über die Seitenfläche
bestrahlt werden und der zweidimensionale Detektor den ganzen bestrahlten
Bereich zur gleichen observieren kann.
Weitere Vorteile, Merkmale und Anwendungsmöglichkeiten der vorliegenden
Erfindung ergeben sich aus der nachfolgenden Beschreibung in Verbindung mit der
Zeichnung, wobei
Fig. 1 eine Kombination aus Blockdiagrammen, teilweiser Schnittansicht und
teilweise perspektivischer Ansicht ist, die die Elektrophoresevorrichtung
vom Fluoreszenzerfassungstyp in einer erfindungsgemäßen Ausführungsform
zeigt, bei der ein Spiegel verwendet wird;
Fig. 2 eine Schnittansicht des optischen Systems der in Fig. 1 gezeigten
Elektrophoresevorrichtung ist;
Fig. 3a eine Kombination aus Blockdiagramm, teilweiser Schnittansicht und
teilweise perspektivischer Ansicht der Elektrophoresevorrichtung vom
Fluoreszenzerfassungstyp in einer erfindungsgemäßen Ausführungsform ist,
bei der eine Vielzahl von Linsen unterschiedlicher optischer Achsen
verwendet werden;
Fig. 3b eine Draufsicht und eine Schnittansicht der vielfach unterteilten Linse mit
abweichenden optischen Achsen zeigt;
Fig. 4 eine Kombination aus Blockdiagramm und teilweiser Schnittansicht der
Elektrophoresevorrichtung vom Fluoreszenzerfassungstyp in einer
erfindungsgemäßen Ausführungsform ist, bei der ein Prisma verwendet
wird;
Fig. 5 eine Schnittansicht des optischen Systems der in Fig. 4 gezeigten
Elektrophoresevorrichtung vom Fluoreszenzerfassungstyp ist;
Fig. 6 eine Schnittansicht des optischen Systems der Elektrophoresevorrichtung
vom Fluoreszenzerfassungstyp in einer erfindungsgemäßen Ausführungsform
ist, bei der ein Prisma mit vielen Ebenen verwendet wird;
Fig. 7 eine schematische Ansicht der Elektrophoresevorrichtung vom Fluoreszenz
erfassungstyp in einer erfindungsgemäßen Ausführungsform ist, bei der
zylindrischen Linsen verwendet werden;
Fig. 8 eine Schnittansicht des optischen Systems in der Fig. 7 gezeigten
Elektrophoresevorrichtung vom Fluoreszenzerfassungstyp ist;
Fig. 9 eine Drauf- und eine Seitenansicht des vierfach unterteilten Filters zeigt,
welches in dem in Fig. 8 gezeigten optischen System verwendet wird;
und
Fig. 10 eine schematische Ansicht ist, die eine abbildungsfokussierte Charak
teristik des optischen Systems mit dem vierfach unterteilten Filter zeigt.
Unter Bezugnahme auf die Fig. 1 und 2 wird eine erste erfindungsgemäße
Ausführungsform im folgenden beschrieben.
Ein Laserstrahl 4, der von einer Argonlaserquelle 3 mit 400 nm Wellenlänge und
10 mW Ausgangsleistung erzeugt wird, wird auf ein Flachbettgel bzw. Slabgel bzw.
Plattengel 2 aus Polycrylamid mit 6% Konzentration angelegt bzw. gerichtet,
welches zwischen zwei Lagen von Glasplatten oder Quarzplatten 1 gehalten ist, die
um 0,3 mm voneinander beabstandet sind und 300 mm auf 200 mm auf 5 mm
messen, wobei der Laserstrahl über die Seitenendfläche auf das Slabgel 2 gerichtet
ist. Es ist anzumerken, daß die Konzentration des Polyacrylamid im folgenden als
seine gesamte monomere Konzentration in Gewichtsprozent pro Volumen (g/ml)
angegeben wird. Ein bestrahlter Teil 17 ist als ein Punkt in einer Schnittansicht
von Fig. 2 gezeigt.
Die DNA-Proben, die mit vier Arten von Farbfluorophoren für die jeweiligen vier
Anschlußgattungen markiert sind, werden in Probeninjektionslöcher bzw.
-vertiefungen (nicht gezeigt) auf der Oberseite des Slabgels eingeführt und wandern
nach unten. Dort können eine Vielzahl von Migrationswegen bzw. -bahnen
angeordnet sein. In diesem Fall kann der Laserstrahl 4 jedoch alle Migrations
bahnen bestrahlen. Ein Fluoreszenzlichtstrahl wird mit der Bestrahlung des
bestrahlten Teils 17 emittiert. Bei einem der herkömmlichen Verfahren, bei denen
eine einfarbige Fluoreszenzmarkierung verwendet wird, um die Anschlußgattung
durch einen Unterschied bezüglich der Migrationsbahn zu identifizieren, wird eine
Fluoreszenzlicht-Intensitätsveränderung über der Zeit derart beobachtet, daß die
Fluoreszenzlicht-Abbildungen auf einen Liniensensor oder einen zweidimensionalen
Detektor über eine Linse fokussiert werden, der ein Filter zum Abschneiden des
Anregungslichtes hat. Die vier verwendeten farbigen Fluorophore sind FITC, NBD-
F, TRITC und Texas Red, wie zuvor erwähnt. An Stelle dieser kann auch ein
Fluorophor aus einem metallischen Komplex verwendet werden. In diesem Beispiel,
wo vier farbige Fluorophore verwendet werden, sind vier rechteckige Spiegel 5 mit
1 cm Höhe und 10 cm Breite in einer Position hinter der Elektrophoreseplatte
2 positioniert, die dem zweidimensionalen Detektor 9 gegenüberliegt, um die
Fluoreszenz-Linienabbildungen zu reflektieren, so daß vier virtuelle Abbildungen
von der Detektorseite betrachtet werden können. Die vier Spiegel 5 sind in einer
Positionen auf einem Umfang einer Ellipse mit 20 cm Hauptachse angeordnet, wobei
die Mittelpunkte derselben an einem Punkt einer Pupille der Linse 7 und einem
Abschnitt des Gels liegen, das mit dem Laserstrahl bestrahlt wird, so daß die
Abstände von dem Detektor zu den vier virtuellen Abbildungen zueinander gleich
sind. Die vier virtuellen Abbildungen werden auf den zweidimensionalen Detektor
9 über die Linse 7 als vier Linien fokussiert. Dort sind vier Bandpaßfilter 8 mit
515 nm, 573 nm, 540 nm und 610 nm Übertragungs- bzw. Transmissions
wellenlängen angeordnet, die den jeweiligen vier Fluorophoren vor der Fokussier
position entsprechen, um die virtuellen Abbildungen über die Wellenlänge zu
selektieren bzw. zu trennen. Alternativerweise können die Bandpaßfilter an einer
Stelle zwischen den Spiegeln und dem zweidimensionalen Detektor 9 positioniert
sein anstelle des Ortes rechts vor dem zweidimensionalen Detektor. Die von dem
zweidimensionalen Detektor überwachten Abbildungen sind vier Linien 14, wie sie
auf einem Monitor 13 gezeigt sind. Diese Linien sind Signale, die von den
Fluorophoren unterschiedlicher Wellenlängen gegeben werden; das heißt, die Signale
kommen von den DNA-Fragmenten mit unterschiedlichen Anschlußgattungen. Die
Abszisse des Monitors repräsentiert eine seitliche Richtung der Elektrophoreseplatte.
Die Signale in der gleichen Position der Abszisse der vier Linienabbildungen sind
Information der Proben, die in der gleichen Migrationsbahn enthalten sind. Die
Signale können miteinander verglichen werden, um die Anschlußgattung zu
bestimmen.
Fig. 2 erläutert die Details eines optischen Systems der vorliegenden Ausführungs
form. Die Fluoreszenzlichtstrahlen, die von vier Spiegeln 5 reflektiert werden,
können die virtuellen Abbildungen auf dem Umfang einer Ellipse bilden, deren
Mittelpunkt in der Pupille der Linse ist.
Es gibt einen Streifenreflexionsspiegel 15 mit 1 mm Breite, der durch einen
Aufdampfungsprozeß auf die Glasplatten auf der Seite eingepaßt bzw. aufgebracht
ist, die in Kontakt mit dem Slabgel ist, um so die Menge von empfangenen Licht
zu erhöhen und zur gleichen Zeit zu verhindern, daß die Fluoreszenzlichtstrahlen
des bestrahlten Abschnitts direkt in den Lichtempfangssektor kommen. Der
Reflexionsspiegel hat eine Fläche, die ausreicht, um die gesamten Lichtstrahlen
zu reflektieren, die den Lichtempfangssektor erreichen können. Alternativerweise
kann er an einer Stelle zwischen dem Detektor und der Migrationsplatte angeordnet
sein. Es kann auch mit einem Spiegel kombiniert sein, der ein Prisma hat, um
den Lichtpfad einzustellen.
In der Figur ist gezeigt: der Spiegel 6 zum Abschneiden bzw. Ausblenden des
Anregungslichtes, eine Steuereinheit 10, eine Datenverarbeitungseinheit 11 und ein
Display 12.
Im folgenden wird unter Bezugnahme auf Fig. 3a eine zweite Ausführungsform
der vorliegenden Erfindung beschrieben. Ein Laserstrahl 4, der von einer
Argonlaserquelle 3 mit 400 nm Wellenlänge und 10 mW Ausgangsleitung erzeugt
wird, wird auf ein Slabgel 2 aus Polyacrylamid mit 6% Konzentration gerichtet,
welches zwischen zwei Lagen von Glasplatten oder Quarzplatten 1 gehalten ist, die
300 mm auf 200 mm auf 5 mm messen und 0,3 mm voneinander beabstandet
sind, und zwar über eine Seitenendfläche der Anordnung. Ein bestrahlter Abschnitt
17 ist in einer Schnittansicht als ein Punkt angedeutet, wie in dem Fall von Fig.
2. DNA-Proben, die mit vier Arten von farbigen Fluorophoren für jeweilige vier
Anschlußgattungen markiert sind, werden in Probeninjektionsbohrungen (nicht
gezeigt) auf der Oberseite des Slabgels injiziert und wandern nach unten. Eine
Lage einer elektrophoretischen Platte kann normalerweise zwanzig bis dreißig
Migrationsbahnen halten bzw. enthalten. Der Laserstrahl 4 kann alle Migrations
bahnen zur gleichen Zeit bestrahlen. Ein Fluoreszenzlichtstrahl wird mit der
Bestrahlung von dem bestrahlten Teil 17 emittieren.
Die mit den vier Fluorophoren markierten DNA-Fragmente werden gemäß deren
Länge bzw. Weg auf unterschiedlichen Migrationsbahnen für die jeweiligen Proben
getrennt. Die DNA-Fragmente können Fluoreszenzlichtstrahlen unterschiedlicher
Wellenlänge gemäß der Arten von Anschlußgattungen emittieren, wenn sie durch
den Abschnitt passieren, auf den der Laserstrahl gerichtet ist. Die emittierten
Lichtstrahlen können entlang der bestrahlten Fläche als Linienabbildungen gesehen
werden. Wenn die Fluoreszenzlichtstrahlen unter Verwendung eines Prismas in
Spektren aufgeteilt bzw. getrennt werden, können die jeweiligen Signale nicht
hinreichend getrennt werden aufgrund der zu geringen Wellenlängendispersion.
Bandpaßfilter sind vorteilhaft zum Trennen der Fluoreszenzlichtwellenlängen. In
dieser Ausführungsform wird - wie in Fig. 3a gezeigt - eine Einrichtung 7 2 mit
vier Linsen unterschiedlicher optischer Achsen verwendet, um die Abbildungen
aufzuteilen, um eine vierfache Fluoreszenzabbildung zu erhalten, wobei eine
Bandpaßfiltereinrichtung 8 3 in eine Position vor oder hinter den Linsen 7 2 gesetzt
wird. Die Einrichtung 7 2 mit vier Linsen besteht aus vier rechteckigen Linsen, die
parallel angeordnet sind, wobei ihre Längskanten miteinander verbunden sind
derart, daß die optischen Achsen voneinander unterschiedlich sind.
Das Bandpaßfilter 8 3, das in dieser Ausführungsform verwendet wird, ist ein
Mosaikfilter, welches aus einem mehrlagigen dielektrischen Material wie das für
das zuvor erwähnte Bandpaßfilter hergestellt ist. Alternativerweise kann das
Bandpaßfilter 8 3 vor die jeweiligen Linsen der Einrichtung 7 2 mit vier Linsen
gesetzt werden.
Die auf dem zweidimensionalen Detektor überwachten Abbildungen sind gleich der
einen, die durch das Bezugszeichen 14 gezeigt wird.
Abschnitte, bzw. Teile, die jeweiligen zu überwachenden Linien entsprechen, werden
ausgelesen und durch eine Lichtintensitäts-Korrekturberechnung kompensiert, um
Lichtintensitätsveränderungen der jeweiligen DNA-Fragmente zu erhalten.
Alternativerweise kann die Einrichtung 7 2 aus vier Linsen, die aus vier Linsen
unterschiedlicher optischer Achsen besteht, wie es in Fig. 3 gezeigt ist, durch
eine unterteilte Linseneinrichtung ersetzt werden wie die, die in Fig. 3b gezeigt
und derart hergestellt ist, daß eine Linse radial in vier Linsenfragmente unterteilt
ist, die wieder zusammengesetzt werden, wobei deren optische Achsen voneinander
abweichen. In diesem Fall muß die Bandpaßfiltereinrichtung gemäß der Struktur
der unterteilten Linse radial hergestellt sein. Zusätzlich kann zum Unterteilen der
Abbildung in dieser Ausführungsform ein Reflektionsspiegel oder ein Prisma
zusammen mit der zuvor erwähnten unterteilten Linse verwendet werden.
Unter Bezugnahme auf die Fig. 4 und 5 wird eine dritte Ausführungsform der
vorliegenden Erfindung nun beschrieben. Fig. 4 ist eine schematische Ansicht der
Elektrophoresevorrichtung gemäß der vorliegenden Ausführungsform. Das optische
System ist im Schnitt gezeigt. Ein Argonlaser von 400 nm Wellenlänge und 10 mW
Ausgangsleistung wird auf ein Slabgel 102 aus Polyacrylamid mit 6% Konzen
tration, welches zwischen zwei Lagen aus Glasplatten 101 gehalten ist, die um
0,3 mm voneinander beabstandet sind und 300 mm auf 200 mm auf 5 mm
messen, über die Seitenendfläche der Anordnung gerichtet. Ein bestrahlter
Abschnitt 103 ist als ein Punkt in der Schnittansicht gezeigt. Licht, welches von
dem bestrahlten Teil nach oben weggeht, wird über ein oberes Prisma 104
gebrochen und dann über eine Linse 106 auf eine untere Seite eines zweidimensio
nalen Detektors 109 fokussiert. Andererseits wird Licht, welches nach unten geht,
über ein unteres Prisma 105 gebrochen und dann über die Linse 106 auf eine
obere Seite des zweidimensionalen Detektors 109 fokussiert. In dieser Ausführungs
form sind DNA-Fragmente als Proben zur Fluoreszenzerfassung fluoreszenzmarkiert
mit Fluorophoren vier unterschiedlicher Wellenlängen entsprechend den vier Arten
von Anschlußgattungen, wobei die Fluorophore FITC (Fluorescein Isothiocyanat)
mit 515 nm Emissionswellenlänge, NBD-F (4-Fluor-7-nitrobenzofurazan) mit 540
nm Emissionswellenlänge, TRITC (Tetramethylrhodaminisothiocyanat) mit 573 nm
Emissionswellenlänge und Texas Red mit 610 nm Emissionswellenlänge sind.
Demgemäß werden vier Lichtstrahlen der zuvor erwähnten Wellenlängen von dem
Emissionspunkt emittiert und über die Prismen gestreut bzw. dispersiert. Das
gestreute Licht kann - wie in Fig. 5 gezeigt - vier Linien (vier Punkte in der
Schnittansicht) auf der oberen und auf der unteren Seite produzieren. Die
Bezugszeichen 115 bzw. 115′, 116 bzw. 116′, 117 bzw. 117′ und 118 bzw. 118′
zeigen jeweils Abbildungen mit gleicher Wellenlänge an, und zwar entsprechend
den Lichtstrahlen bzw. Lichtbündeln, die das obere und das untere Prisma
passieren. Insbesondere deuten die Bezugszeichen 115 und 115′ Lichtabbildungen
an, die von Texas Red emittiert werden, 116 und 116′ solche, die von TRITC, 117
und 117′ solche, die von NBD-F und 118 und 118′ solche, die von FITC emittiert
werden. In diesem Beispiel können die Lichtabbildungen 115 und 116 und die
Lichtabbildungen 117 und 118 nicht hinreichend durch Wellenlängendispersion
mittels des Prismas jeweils voneinander unterschieden bzw. identifiziert werden
aufgrund der geringen Wellenlängenunterschiede. Die Lichtabbildungen 115 und 117
und die Lichtabbildungen 116 und 118 können jedoch jeweils voneinander gut
unterschieden bzw. identifiziert werden. Die obere Seite 107 des Bandpaßfilters hat
zwei Transmissionswellenlängen, nämlich 515 nm und 573 nm, und die untere Seite
108 hat zwei Übertragungswellenlängen, nämlich 540 nm und 610 nm, wodurch
eine Identifizierung von vier Farben ermöglicht ist. Fig. 5 erläutert die
vorangegangenen Ausführungen. Wenn die Filter nicht vorgesehen sind, wobei ein
Filter 119 zum Abschneiden des Anregungslichtes vorgesehen ist, wird der
zweidimensionale Detektor acht Linien überwachen bzw. aufzeigen; benachbarte
Linien derselben können jedoch noch nicht deutlich voneinander getrennt werden.
Wenn die Filter 107 und 108 angebracht bzw. vorgesehen sind, können die vier
Linien zur Erfassung voneinander getrennt werden. (Siehe obere rechte Ansicht von
Fig. 5 und das Monitorbild von Fig. 4.) Die über die vier Fluoreszenzlicht-
Abbildungen erhaltenen Signale können unabhängig unter Zuhilfenahme von einer
bis drei horizontalen Abtast- bzw. Scanninglinien des zweidimensionalen Detektors
ausgelesen werden. Die erhaltenen Signale können zur Bestimmung der DNA-
Basensequenzen unter Verwendung einer Datenverarbeitungseinheit 111 in
Information über vier Anschlußgattungen der DNA-Fragmente gewandelt werden.
In dieser Ausführungsform sind die Prismen 104 und 105 einstückig ausgebildet,
wobei eine schmale Spitze derselben einen Winkel α von 30 Grad bildet. Das für
die Prismen verwendete Material ist BaF Glas. Die Spitzen der Prismen sind
derart bestimmt, daß Licht, welches durch einen dicken Abschnitt des Prismas 104
passiert, gebrochen werden kann, um unterhalb einer unteren Kante der Linse 106
zu passieren. Dies ermöglicht, daß das Licht bzw. die Lichtstrahlen unter einem
festgelegten Winkel, den die Linse "sieht", in die Linse eintreten kann.
Alternativerweise können in dieser Ausführungsform die Prismen 104 und 105 in
einer anderen Position zwischen der Elektrophoreseplatte und dem zweidimensiona
len Detektor angeordnet sein.
In Fig. 4 sind eine Steuereinheit 110, ein Monitor 113 und Linienabbildungen
114 gezeigt.
Fig. 6 zeigt ein Beispiel, bei dem eine polyedrische Prismeneinrichtung verwendet
wird. Licht, welches von einem Emissionspunkt 103 emittiert, kann durch ein
oberes Prisma 104 oder ein unteres Prisma 105 geleitet werden und kann auf
unterschiedliche Positionen eines zweidimensionalen Detektors 109 über eine Linse
106 fokussiert werden. Wenn sowohl das obere Prisma 104 als auch das untere
Prisma 105 - wie gezeigt - zwei Oberflächen unterschiedlichen Winkels haben, wird
das Licht, welches durch das obere und das untere Prisma passiert, auf den
Detektor 109 mit jeweils zwei Abbildungen fokussiert, was insgesamt vier
Abbildungen ergibt. Obwohl sich die Anzahl der Abbildungen erhöht, wird ein
fester Gesamtlicht-Empfangswinkel größer, wenn man auf die Prismen sieht, und
somit wird sich die Menge des Lichts für jede erfaßte Fluoreszenzlicht-Abbildung
kaum verändern, verglichen mit dem Fall, wo keine Prismen verwendet werden.
Es sind Filter 120 unterschiedlicher Transmissionswellenlängen an jeweiligen
abbildungsfokussierten Positionen oder rechts hinter den Prismen 104, 105
angeordnet, um die Wellenlängen zu separieren, um Signale zu erfassen. Wenn
Bandpaßfilter eine scharfe Trennung bzw. ein scharfes Abschneiden der
Übertragungswellen bzw. -signale bieten, können sie die Wellenlängen mit höherer
Genauigkeit trennen als die Prismen, die diese Signale zum Trennen nach
Wellenlänge streuen. Das für die Prismen in dieser Ausführungsform verwendete
Material ist BK5. Die Winkel 121 und 122 der Prismen betragen 15 bzw. 30
Grad.
Unter Bezugnahme auf die Fig. 7 bis 10 wird nun eine fünfte Ausführungsform
der vorliegenden Erfindung beschrieben.
Die in dieser Ausführungsform verwendeten markierenden Fluorophore sind Texas
Red mit 605 nm Emissionswellenlänge und drei Arten von Phthalocyanin
fluorophoren mit 680 nm, 703 nm und 725 nm Emissionswellenlängen. Zum
Anregen des ersteren Fluorophors wird ein He-Ne-Laser 201 mit 543 nm
Wellenlänge verwendet und zum Anregen der letzteren drei wird ein He-Ne-Laser
202 mit 633 nm Wellenlänge verwendet. Das von den beiden Lasern abgestrahlte
Licht kann durch Spiegel 203 und 204 überlagert werden, um einen Laserstrahl
235 zu bilden. Der Laserstrahl 235 kann dann über eine Linse (nicht gezeigt)
fokussiert werden und eine Gelplatte zur Elektrophorese (Slabgel) 205 über eine
Seitenendfläche derselben bestrahlen. Das Slabgel ist 0,3 mm dick und wird von
Quarz- oder Glasplatten 206 gehalten. Das Slabgel mit einer Breite von 200 mm
wird in seinem Mittelabschnitt mit 120 mm Breite zur Analyse verwendet. Das von
dem bestrahlten Teil emittierte Fluoreszenzlicht wird durch einen Schlitz 231
geleitet und dann werden seine Komponenten nach oben und unten gestreut und
rechtwinklig zu dem Bestrahlungslaserstrahl über eine konvexe zylindrische Linse
207 in parallele Lichtstrahlen konzentriert. Da die konvexe zylindrische Linse 207
einen festen Lichtempfangswinkel achtmal in Richtung nach oben und unten
vergrößert, liefert sie eine hohe Empfindlichkeit. Der Schlitz 231 mit 5 mm
Abständen wird in eine Position 5 mm weg von dem Licht emittierenden Abschnitt
gesetzt. Dies verhindert, daß durch Streulicht emittierte Fluoreszenz die Messung
beeinflußt. Die von dem Streulicht emittierte Fluoreszenz tritt auf, wenn eine
große Menge von markierter DNA wandert und andere Abschnitte passiert als den,
auf den der Laserstrahl gerichtet ist. Ein Streulicht-Abschneidefilter 208 ist
vorgesehen, aufweisend ein Farbglasfilter und einen Totalreflexionsspiegel für das
Licht mit Anregungswellenlängen, was nur das von den vier Arten von Fluoropho
ren emittierte Fluoreszenzlicht passieren läßt. Das Fluoreszenzlicht, welches pasiert,
wird räumlich hinsichtlich der Wellenlängen selektiert, um über ein vierfach
unterteiltes Mehrebenenfilter 209 auszutreten, welches vier Ebenen zum Austritt
von Licht hat, die auf den jeweiligen unterschiedlichen Ebenen liegen, die in Fig.
8 gezeigt sind. Alternativerweise kann das Mehrebenenfilter 209 durch eine
Vielzahl von zylindrischen Linsen ersetzt werden, die oben und unten mit
unterschiedlichen Vertikalwinkeln angeordnet sind. Das getrennte Fluoreszenzlicht
wird richtungsmäßig über eine zylindrische konkave Linse 210 kompensiert, so daß
vertikale Fokussierpositionen derselben mit horizontalen Positionen derselben
ausgerichtet werden können. Dann werden sie auf einen zweidimensionalen
Detektor 212 über eine fokussierende Linse 211 fokussiert. Die Linse 211 ist vom
Typ CF25L von Fuji Optical Instrument Inc.′s mit 25 mm Brennweite und 0,85
F. Das vierfach unterteilte Filter 209, wie es in den Fig. 8 und 9 gezeigt ist,
ist derart aufgebaut, daß die Licht nach außen leitende Ebene in vier Ebenen
unterteilt ist. Jede Ebene hat ein Bandpaßfilter aus einem dielektrischen
Mehrlagenfilm einer bestimmten Transmissionswellenlänge aufgedampft, die sich
voneinander unterscheiden. Die Aufteilung der Licht nach außen leitenden Ebene
ist derart ausgelegt, daß 5 mm oder mehr Intervalle von virtuellen Abbildungen
geschaffen werden. Die zylindrische konvexe Linse 207, die in dieser Ausführungs
form verwendet wird, hat 22 mm Brennweite, ist 22 mm hoch (vertikale Breite)
und 120 mm breit (horizontale Breite), um einen Parallelstrahl mit 22 mm
vertikaler Breite zu liefern. Bezüglich der vertikalen Komponenten des Fluoreszenz
lichts werden die Fluoreszenzlichtstrahlen rechtwinklig zu dem Filter über die
zylindrische konvexe Linse 207 gemacht, um eine höhere Filtergenauigkeit zu
liefern.
Das unterteilte Filter 209 ist 30 mm lang und 30 mm breit oder ausgelegt, einen
Kreis mit 30 mm Durchmesser zu umgeben. Bereiche bzw. Flächen der unterteilten
Filter, über die das Licht passieren kann, sind derart eingestellt, daß die Menge
an Licht, die durch die Filterebenen passiert, virtuell gleich sein kann. Die Breite
der Filterabschnitte des unterteilten Filters ist, gemessen unterhalb dessen Spitzen,
10 mm, 5 mm, 5 mm und 10 mm, wie es in Fig. 9 gezeigt ist. Jede Ebene des
unterteilten Filters ist ausgelegt, um parallel zu den jeweiligen Emissionslinien zu
sein. Da nicht jede Filterebene auf der gleichen Ebene liegt, zeigt der zweidimen
sionale Detektor 212 vier Fluoreszenzlinienabbildungen. Eine Abweichung x von
jeder Fluoreszenzlinienabbildung von dem Ursprung hängt von einem Winkel R,
der zwischen den benachbarten, Licht nach außen leitenden Ebenen des Filters
besteht, und einem Abstand l von dem Objekt 218 zu dem Filter ab. Die
Abweichung x kann unter Zuhilfenahme eines Diffraktionsindexes n etwa
ausgedrückt werden zu x = l tan (n - 1) R. Das durch die jeweiligen Ebenen
227, 228, 229 und 230 geleitete Fluoreszenzlicht wird - wie in Fig. 10 gezeigt -
nach außen in Ausbreitungsrichtung geändert wie angedeutet durch die Lichtpfade
223, 224, 225 und 226. Das Licht wird dann fokussiert, als wenn Objektpunkte bei
den Positionen 219, 220, 221 und 222 bestehen würden. In dieser Ausführungsform
ist, da l = 150 mm und R = 4 Grad, die resultierende Abweichung x = 6 mm.
Da die Intervalle bzw. Abstände des Schlitzes 231 gleich 5 mm sind, werden die
durch die Filterebenen geleiteten Abbildungen nicht mit ihren peripheren
Satellitenabbildungen bzw. Nebenabbildungen überlagert, so daß die Messung nicht
beeinflußt wird. Das heißt, die Winkel, die zwischen der Fluoreszenzlicht-
Auffallebene des unterteilten Filters zu den Licht nach außen leitenden Ebenen
gebildet werden, werden zu 6 Grad, 2 Grad, 2 Grad bzw. 6 Grad gewählt,
gemessen von deren Spitze, so daß vier Linien mit Intervallen von 6 mm Abstand
jeweils beobachtet werden, die für die Objektpunktposition berechnet werden. Die
von einem Bildfokussiersystem erhaltenen Abbildungen, das einen Vergrößerungs
faktor von 1/8 hat, können 0,7 mm voneinander beabstandet auf einem
Lichtempfangsgerät R von Hamamatsu Photonix Inc. beobachtet werden, welches
welches eine Integration eines Bildverstärkers und eines CCD's ist, wie es durch
vier Linien 217 auf dem Monitor angedeutet ist, was in Fig. 7 gezeigt ist.
Diese Leistungsfähigkeit ist gleich etwa 25 Vertikalkanaltrennungen, was genug ist
zur Trennung und Erfassung der Abbildungen.
Als Material für das unterteilte Filter 209, welches die aufgedampften Filme hat,
wird ein Glas mit einer geringen Wellenlängendispersion verwendet oder einem
großen ν d, z. B. BK-7 oder dergleichen. Eine große Wellenlängendispersion führt
auf nachteilige Weise zu dicken, zu beobachtenden Abbildungslinien.
Die vier Linienabbildungs-Signale werden geeignet in Basissignale für die jeweiligen
Proben durch eine Erfassungsschaltung 213 und eine Datenverarbeitungseinheit 124
gewandelt und an eine Ausgangseinheit 215 ausgegeben.
In den Figuren vergebene Bezugszeichen und Symbole bezeichnen im wesentlichen
identische Teile oder Einrichtungen.
Wie aus der obigen Beschreibung deutlich ersichtlich, werden erfindungsgemäß
zunächst eine Abbildungsunterteilungseinrichtung wie ein Spiegel, Prisma oder
Linsen mit unterschiedlichen optischen Achsen verwendet zum Bilden bzw.
Herstellen einer Vielzahl von Fluoreszenzlicht-Abbildungen, und jede Abbildung
wird auf ein Lichtrezeptionsgerät fokussiert, wenn es durch jeweilige Filter geleitet
ist, die unterschiedliche Emissionswellenlängen des zu übertragenden Lichtes
identifizieren bzw. durchlassen. Diese Technik kann die Signale von den
vielfarbmarkierten DNA-Fragmenten mit hoher Präzision bei simultanen Messungen
identifizieren. Dies erlaubt eine Trennung und Detektion oder Bestimmung der
DNA-Basenfrequenz mit einer höheren Empfindlichkeit und höheren Genauigkeit.
Weiterhin kann der im wesentlichen feste Lichtrezeptionswinkel durch Abbildungs
unterteilung, nicht durch Zeitunterteilung, erfindungsgemäß größer gemacht werden.
Das Licht bzw. die Lichtstrahlen von den vierfarbig fluoreszenzmarkierten Objekten
kann unter Verwendung einer zylindrischen konvexen Linse gemessen werden, ohne
daß die Lichtmenge abnimmt.
Bei der erfindungsgemäßen Elektrophoresevorrichtung vom Fluoreszenzerfassungstyp
sind keine beweglichen Teile wie Rotationsfilter vorgesehen, was eine etwaige
Besorgnis bezüglich des mechanischen Betriebs auslöscht. Herkömmlicherweise ist
das Herstellen eines großen Bandpaßfilters schwierig, bei der vorliegenden
Erfindung kann das Filter jedoch klein gemacht werden, da es als unterteiltes
Filter in der Nähe der fokussierenden Linse vorgesehen ist.
Claims (27)
1. Elektrophoresevorrichtung vom Fluoreszenzerfassungstyp, aufweisend zumindest
- (i) eine Gelplatte (2, 102, 205) zur Elektrophoreseseparation,
- (ii) eine Anregungslaserstrahlquelle (3, 201, 202) zum Emittieren von Fluoreszenzlicht durch Anregen von Fluorophoren, die eine Probe markieren, und
- (iii) einen Fluoreszenzlichtdetektor (9, 109, 212) zum Erfassen des emittierenden Fluo reszenzlichtes;
dadurch gekennzeichnet,
daß die Vorrichtung eine abbildungsunterteilende Einrichtung für eine
Fluoreszenzlichtabbildung hat, die erhalten wird durch Anlegen eines
Laserstrahls (4, 235) an die Gelplatte (2, 102, 205) zur Elektrophoresesepara
tion, eine Wellenlängenauswahleinrichtung für Licht bzw. Lichtstrahlen hat, die
den aufgeteilten Abbildungen entsprechen, und eine optische Einrichtung hat
zum Fokussieren auf den Fluoreszenzlichtdetektor (9, 109, 212) von
Fluoreszenzlicht-Abbildungen, die durch die Abbildungsunterteilungseinrichtung
und die Wellenlängenauswahleinrichtung gelaufen sind.
2. Elektrophoresevorrichtung vom Fluoreszenzerfassungstyp, aufweisend zumindest
- (i) eine Gelplatte (2, 102, 205) zur Elektrophoreseseparation,
- (ii) eine Anregungslaser-Strahlquelle (3, 201, 202) zum Emittieren von Fluoreszenzlicht durch Anregen von Fluorophoren, die eine Probe markieren, und
- (iii) einen Fluoreszenzlichtdetektor (9, 109, 212) zum Erfassen des emittierten Fluo reszenzlichts;
dadurch gekennzeichnet, daß die Vorrichtung eine abbildungs
unterteilende Einrichtung (5, 7 2, 104, 105, 209) einer Fluoreszenzlicht-
Linienabbildung hat, die erhalten wird durch Anlegen eines Laserstrahls auf
eine geeignete Position der Gelplatte zur Elektrophoreseseparation, und
Bandpaßfilter (8, 8 3, 107, 108, 120, 227-230) unterschiedliche Transmissions
wellenlängen hat, entsprechend den jeweiligen Abbildungen, die von der
Abbildungsunterteilungseinrichtung unterteilt sind, und die gleiche Anzahl haben
wie die unterteilten Abbildungen, und eine optische Einrichtung hat zum
Fokussieren auf den Fluoreszenzlichtdetektor (9, 109, 212) der einzelnen
Fluoreszenz-Linienabbildungen, die von der Abbildungsunterteilungsein
richtung unterteilt sind und erzeugt durch die jeweiligen Bandpaßfilter,
wodurch sie aus unterschiedlichen Transmissionswellenlängen bestehen.
3. Vorrichtung nach Anspruch 2, in der die Laserstrahl-Bestrahlung auf die
geeignete Position der Gelplatte zur Elektrophoreseseparation von einer
Seitenendfläche der Gelplatte in Richtung auf ein Slabgel gerichtet ist und das
Slabgel der Gelplatte zur Elektrophoreseseparation parallel zu der Gelplatte
zur Elektrophoreseseparation durchdringt, und eine Fluoreszenzlicht-Linien
abbildung, die erhalten wird durch Laserbestrahlung, wird entlang eines Weges
emittiert, den der Laserstrahl in dem Slabgel einnimmt.
4. Vorrichtung nach Anspruch 2, in der die Abbildungsunterteilungseinrichtung
aufweist eine Vielzahl von Reflektionsspiegeln, die parallel zu einer Achse
eines Laserstrahls in der Gelplatte zur Elektrophoreseseparation angeordnet
sind, und in der die Bandpaßfilter unterschiedlicher Transmissionswellenlängen,
die in der Anzahl der Anzahl der Reflektionsspiegel gleich sind, auf jeweiligen
Wegen vorgesehen sind, die das Fluoreszenzlicht bzw. die Fluoreszenzlicht
strahlen, die von den Reflektionsspiegeln reflektiert werden, auf fokussierende
Positionen eines Fluoreszenzlichtdetektors führen.
5. Vorrichtung nach Anspruch 2, in der die Vielzahl von Reflektionsspiegeln auf
einem Umfang einer Ellipse angeordnet sind, deren einer Mittelpunkt auf
einem laserbestrahlten Abschnitt des Gels zur Elektrophoreseseparation liegt.
6. Vorrichtung nach Anspruch 2, in der die Abbildungsunterteilungseinrichtung
aufweist zumindest eine Vielzahl von Linsen unterschiedlicher optischer Achsen
oder eine Linse, die in Fragmente mit unterschiedlichen optischen Achsen
unterteilt ist, und die auf einem Weg vorgesehen ist, auf dem sich Fluo
reszenzlicht, welches von einem laserbestrahlten Abschnitt der Gelplatte
zur Elektrophoreseseparation emittiert, ausbreitet in Richtung auf die
fokussierende Position des Fluoreszenzlichtdetektors.
7. Vorrichtung nach Anspruch 6, in der ein zusätzliches Prisma oder ein
zusätzlicher Spiegel zur Unterteilung der Fluoreszenzlicht-Abbildung vorgesehen
ist auf einem Pfad, auf dem sich Fluoreszenzlicht, welches von einem
laserstrahlbestrahlten Abschnitt der Gelplatte zur Elektrophoreseseparation
emittiert, in Richtung auf eine Fokussierposition auf dem Fluoreszenzlicht
detektor ausbreitet.
8. Vorrichtung nach Anspruch 1, in der der Fluoreszenzlichtdetektor ein
zweidimensonaler Detektor ist.
9. Vorrichtung nach Anspruch 1, in der die Elektrophoreseseparation vom
Fluoreszenzerfasssungstyp eine Vorrichtung zum Separieren und Detektieren von
DNA's oder RNA's ist.
10. Elektrophoresevorrichtung zum Fluoreszenzerfassungstyp, aufweisend zumindest
- (i) eine Gelplatte (102) zur Elektrophoreseseparation,
- (ii) eine Anregungslaser- Strahlquelle zum Emittieren von Fluoreszenzlicht durch Anregen von Fluorophoren, die eine Probe markieren, und
- (iii) einen Fluoreszenzlicht detektor (109) zum Erfassen des emittierten Fluoreszenzlichtes,
dadurch
gekennzeichnet, daß die Vorrichtung aufweist ein Prisma (104, 105) mit einer
Vielzahl von Licht nach außen leitenden Ebenen zum Unterteilen einer
Fluoreszenzlicht-Linienabbildung, die erhalten wird durch Anlegen eines
Laserstrahls auf eine geeignete Position der Gelplatte zur Elektrophoresesepa
ration, und mit einem optischen System zum einzelnen Fokussieren auf den
Fluoreszenzlichtdetektor (109) einer Vielzahl der Fluoreszenz-Linienabbildungen,
die durch die Vielzahl von Licht nach außen leitenden Ebenen des Prismas
unterteilt sind.
11. Vorrichtung nach Anspruch 10, in der die Laserbestrahlung auf die
geeignete Position der Gelplatte zur Elektrophoreseseparation von einer
Seitenendfläche der Gelplatte in Richtung auf ein Slabgel gerichtet ist und das
Slabgel der Gelplatte zur Elektrophoreseseparation parallel zu der Gelplatte
zur Elektrophoreseseparation durchdringt, und wobei eine Fluoreszenzlicht-
Linienabbildung, die erhalten wird durch Laserbestrahlung, entlang eines Weges
emittiert wird, entlang dessen sich der Laserstrahl in dem Slabgel ausbreitet.
12. Vorrichtung nach Anspruch 10, in der das optische System ein Bandpaßfilter
einzelner unterschiedlicher Transmissionswellenlängen hat, das auf jeweiligen
entsprechenden Pfaden des unterteilten Abbildungslichtes vorgesehen ist,
welches sich aus der Vielzahl von Licht nach außen leitenden Ebenen des
Prismas ausbreitet.
13. Vorrichtung nach Anspruch 10, in der die Elektrophoresevorrichtung vom
Fluoreszenzerfassungstyp eine Elektrophoresevorrichtung vom Vielfarb-
Fluoreszenzerfassungstyp ist und die Separations- und Erfassungsprobe zum
Wandern in der Platte zur Elektrophoreseseparation eine vielfarbig markierte
Probe ist.
14. Vorrichtung nach Anspruch 10, in der zumindest eine Kante des Prismas in
einer Ebene ist, die die Fluoreszenzlicht-Linienabbildungen enthält, die erhalten
werden als Ergebnis einer Laserstrahlbestrahlung auf eine geeignete Position
der Platten zur Elektrophoreseseparation, und einen Mittelpunkt der
Fokussierposition des Fluoreszenzlichtdetektors enthält und parallel ist zu den
Fluoreszenzlicht-Linienabbildungen.
15. Vorrichtung nach Anspruch 10, in der das Prisma nach oben und unten
bezüglich einer Ebene symmetrisch ist, die die Fluoreszenzlicht-Linien
abbildungen enthält, die als Ergebnis einer Laserstrahl-Bestrahlung auf eine
geeignete Position der Platten zur Elektrophoreseseparation erhalten werden,
und einen Mittelpunkt der Fokussierposition auf den Fluoreszenzlichtdetektor
enthält, und eine Spitze des Prismas im Mittelpunkt parallel ist zu den
Fluoreszenzlicht-Linienabbildungen.
16. Elektrophoresevorrichtung vom Fluoreszenzerfassungstyp, aufweisend zumindest
- (i) eine Gelplatte (205) zur Elektrophoreseseparation,
- (ii) eine Anregungs laser-Strahlquelle (201, 202) zum Emittieren von Fluoreszenzlicht durch die Anregung von Fluorophoren, die eine Probe markieren, und
- (iii) einen Fluoreszenzlichtdetektor (212) zum Erfassen des emittierten Fluoreszenzlichts,
dadurch gekennzeichnet, daß Geräte zum Abbildungsaufteilen und Wellenlän
genselektieren der Fluoreszenzlichtabbildung aufweisen eine zylindrische konvexe
Linse (207), eine zylindrische konkave Linse (210) und ein Bandpaßfilter (227,
228, 229, 230).
17. Vorrichtung nach Anspruch 16, in der die Laserstrahlbestrahlung auf die
geeignete Position der Gelplatte zur Elektrophoreseseparation von einer
Seitenendfläche der Gelplatte in Richtung auf ein Slabgel gerichtet ist und
ein Slabgel der Gelplatte zur Elektrophoreseseparation parallel zu der
Gelplatte zur Elektrophoreseseparation durchdringt, und wobei eine Fluo
reszenzlicht-Linienabbildung, die erhalten wird durch Laserbestrahlung, entlang
eines Pfades emittiert wird, entlang dessen sich der Laserstrahl in dem Slabgel
ausbreitet.
18. Vorrichtung nach Anspruch 16, in der das Bandpaßfilter ein unterteiltes
Mehrebenenfilter ist, durch das die Fluoreszenzlicht-Abbildung unterteilt wird.
19. Vorrichtung nach Anspruch 18, in der das unterteile Mehrebenenfilter
vorgesehen ist zwischen der zylindrischen konvexen Linse und einer
fokussierenden Linse.
20. Vorrichtung nach Anspruch 19, in der Ebenen des unterteilten Mehr
ebenenfilters Flächen haben, die derart bemessen sind, daß sie passierende
Fluoreszenzlichtmengen im wesentlichen gleich sein können.
21. Vorrichtung nach Anspruch 16, in der die zylindrische konvexe Linse aufweist
eine Vielzahl von unterteilten zylindrischen konvexen Linsen, durch die die
Fluoreszenzlicht-Abbildung unterteilt werden kann.
22. Vorrichtung nach Anspruch 16, in der ein Schlitz parallel zu den Fluoreszenz
licht-Linienabbildungen vorgesehen ist zwischen einem Emissionspunkt der
Fluoreszenzlicht-Linienabbildungen und einer zylindrischen konvexen Linse, um
obere und untere Teile des Fluoreszenzlichts abzuschneiden, die von dem
Emissionspunkt höher oder niedriger als bestimmte Winkel emittiert werden.
23. Vorrichtung nach Anspruch 22, in der eine Breite des Schlitzes schmaler
gemacht wird als ein Intervall von virtuellen Objektpositionen.
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