DE06801706T1 - Verfahren zur identifizierung des merle-gens - Google Patents

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Abstract

Verfahren zur Identifizierung von Individuen mit Mutationen im SILV-Gen, umfassend:
(a) Erhalten einer biologischen Probe aus einem Hund oder Menschen; und
(b) Analysieren der biologischen Probe auf Mutationen innerhalb des SILV-Gens oder humanen Äquivalents.

Claims (15)

  1. Verfahren zur Identifizierung von Individuen mit Mutationen im SILV-Gen, umfassend: (a) Erhalten einer biologischen Probe aus einem Hund oder Menschen; und (b) Analysieren der biologischen Probe auf Mutationen innerhalb des SILV-Gens oder humanen Äquivalents.
  2. Verfahren gemäss Anspruch 1, worin der Organismus ein Merle-Allel aufweist.
  3. Verfahren gemäss Anspruch 2, worin das Merle-Allel SEQ ID NO: 25 oder eine Sequenz ist, die mit dieser unter stringenten Bedingungen hybridisiert.
  4. Verfahren gemäss Anspruch 1, worin der Hund ein kryptisches Merle-Allel aufweist.
  5. Verfahren gemäss Anspruch 4, worin das kryptische Merle-Allel SEQ ID NO: 34, 35 oder 36 oder eine Sequenz ist, die mit dieser unter stringenten Bedingungen hybridisiert.
  6. Verfahren gemäss Anspruch 1, worin die biologische Probe eine Zelle oder ein Gewebe, erhalten aus einem Hund, ist, die/das genomische DNA enthält.
  7. Verfahren gemäss Anspruch 1, worin die biologische Probe mittels Durchführung von PCR unter Verwendung von genomischer DNA als Templat und Polyacrylamid-Gelelektrophorese analysiert wird.
  8. Verfahren gemäss Anspruch 1 zum Sichten eines Menschen auf Defekte in dem analogen Humangen.
  9. Verfahren gemäss Anspruch 8, worin der Mensch Kinder mit auditiven oder visuellen Defekten erzeugt hat oder dem Risiko unterliegt, Kinder mit auditiven oder visuellen Defekten zu erzeugen.
  10. Verfahren zum Identifizieren eines Gens, das auditive oder visuelle Defekte in einem Menschen verursacht, umfassend das Erhalten von Proben aus von WS2 betroffenen Patienten und normalen Individuen, und sequenzieren der DNA, um jedwede Nonsense-, Missense-, Insertions-, Deletions- oder Splicemutation in den Proben in einer zu dem SILV-Gen analogen Region zu identifizieren, die in den von WS2 betroffenen Patienten, jedoch nicht in normalen Individuen vorkommt.
  11. SEQ ID NO: 25 oder eine Sequenz, die mit dieser unter stringenten Bedingungen hybridisiert.
  12. SEQ ID NO: 34, 35 oder 36 oder eine Sequenz, die mit dieser unter stringenten Bedingungen hybridisiert.
  13. Kit zum Sichten eines Hundes oder Menschen auf das Vorliegen des Merle-Gens oder analoger Defekte in einem Humangen, umfassend SEQ ID NO: 25 oder eine Sequenz, die mit dieser unter stringenten Bedingungen hybridisiert, und Reagenzien zur Bestimmung des Vorliegens des Merle-Gens oder eines analogen Humangens in einer aus einem Hund oder Menschen erhaltenen Probe.
  14. Kit zum Sichten eines Hundes oder Menschen auf das Vorliegen des Merle-Gens oder analoger Defekte in einem Humangen, umfassend SEQ ID NO: 25 oder eine Sequenz, die mit dieser unter stringenten Bedingungen hybridisiert, und Reagenzien zur Bestimmung des Vorliegens des Merle-Gens oder eines analogen Humangens in einer aus einem Hund oder Menschen erhaltenen Probe.
  15. Kit zum Sichten eines Hundes oder Menschen auf das Vorliegen des kryptischen Merle-Gens oder analoger Defekte in einem Humangen, umfassend SEQ ID NO: 34, 35 oder 36 oder eine Sequenz, die mit dieser unter stringenten Bedingungen hybridisiert, und Reagenzien zur Bestimmung des Vorliegens des kryptischen Merle-Gens in einer aus einem Hund oder Menschen erhaltenen Probe.
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* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
BR8108820A (pt) 1980-09-24 1982-08-24 Cetus Corp Processo e sonda de diagnostico
US4582788A (en) 1982-01-22 1986-04-15 Cetus Corporation HLA typing method and cDNA probes used therein
EP0084796B1 (de) 1982-01-22 1990-05-02 Cetus Corporation Verfahren zur Charakterisierung von HLA und die darin benutzten cDNS-Testmittel
GB8311018D0 (en) 1983-04-22 1983-05-25 Amersham Int Plc Detecting mutations in dna
US4683194A (en) 1984-05-29 1987-07-28 Cetus Corporation Method for detection of polymorphic restriction sites and nucleic acid sequences
US4683202A (en) 1985-03-28 1987-07-28 Cetus Corporation Process for amplifying nucleic acid sequences
CA1284931C (en) 1986-03-13 1991-06-18 Henry A. Erlich Process for detecting specific nucleotide variations and genetic polymorphisms present in nucleic acids
CA1338457C (en) 1986-08-22 1996-07-16 Henry A. Erlich Purified thermostable enzyme
US5202231A (en) 1987-04-01 1993-04-13 Drmanac Radoje T Method of sequencing of genomes by hybridization of oligonucleotide probes
GB8810400D0 (en) 1988-05-03 1988-06-08 Southern E Analysing polynucleotide sequences
US4988617A (en) 1988-03-25 1991-01-29 California Institute Of Technology Method of detecting a nucleotide change in nucleic acids
US5143854A (en) 1989-06-07 1992-09-01 Affymax Technologies N.V. Large scale photolithographic solid phase synthesis of polypeptides and receptor binding screening thereof
US5424186A (en) 1989-06-07 1995-06-13 Affymax Technologies N.V. Very large scale immobilized polymer synthesis
FR2650840B1 (fr) 1989-08-11 1991-11-29 Bertin & Cie Procede rapide de detection et/ou d'identification d'une seule base sur une sequence d'acide nucleique, et ses applications
DK0528882T3 (da) 1990-05-03 2008-01-14 Cornell Res Foundation Inc DNA-amplifikationssystem til påvisning af genetiske sygdomme ved hjælp af termostabil ligase
DE69132843T2 (de) 1990-12-06 2002-09-12 Affymetrix Inc N D Ges D Staat Identifizierung von Nukleinsäuren in Proben
US6004744A (en) 1991-03-05 1999-12-21 Molecular Tool, Inc. Method for determining nucleotide identity through extension of immobilized primer
RU1794088C (ru) 1991-03-18 1993-02-07 Институт Молекулярной Биологии Ан@ Ссср Способ определени нуклеотидной последовательности ДНК и устройство дл его осуществлени
US5324633A (en) 1991-11-22 1994-06-28 Affymax Technologies N.V. Method and apparatus for measuring binding affinity
EP1382386A3 (de) 1992-02-19 2004-12-01 The Public Health Research Institute Of The City Of New York, Inc. Neue Ordnungen für Oligonukleotide und ihr Nutzen zum Sortieren, Isolieren, Sequenzierung und Manipulieren von Nukleinsäuren
US5795714A (en) 1992-11-06 1998-08-18 Trustees Of Boston University Method for replicating an array of nucleic acid probes
EP1423531A4 (de) * 2001-05-25 2005-06-08 Dnaprint Genomics Inc Zusammensetzungen und verfahren zur ableitung von pigmentierungsmerkmalen
FR2857979B1 (fr) * 2003-07-25 2005-09-23 Agronomique Inst Nat Rech Utilisation du gene silver pour l'authentification de l'origine raciale des populations animales et de leurs produits derives

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