CN1795382A - 用于分拣颗粒和提供性别分拣的动物精子的设备、方法和程序 - Google Patents

用于分拣颗粒和提供性别分拣的动物精子的设备、方法和程序 Download PDF

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Abstract

本发明涉及用于分拣颗粒和提供性别分拣的动物精子的设备、方法和程序,包括:收集精子;选择着色条件;利用DNA选择性荧光染料对精子着色;根据性别染色体含量分拣精细胞;和低温储藏分拣的精子群组直至人工受精。一实施例包括利用共享一整体平台的多个流式细胞术单元分拣精细胞的设备和方法。在一实施例中,流式细胞术分拣包括使用下列设备和方法:具有挡板的定向喷嘴;外照射光学系统;在细胞核内的局部DNA区域的狭缝扫描;数字信号处理,包括模拟输出信号的同步采样、在脉冲的一个点处的脉冲波形的第一级导数的近似值的脉冲波形的特征抽取;多种分拣策略中的任何一种;以及自动分拣校准系统。在一实施例中,数字信号处理包括在相对于从照射激光发出的脉冲的时间处对模拟输出信号采样。其它实施例与上述的大不相同,包括涉及可用于任何各种应用(包括颗粒分析)的各个步骤或者系统的实施例。

Description

用于分拣颗粒和提供性别分拣的动物精子的设备、方法和程序
技术领域
本发明涉及动物精子收集的设备和方法,更具体地说,涉及利用包括流式细胞术的各种技术产生富含具有一个或者多个所需特征的精细胞的精子群(例如根据动物养殖业所使用的DNA特征分拣的活精细胞群)以预先选择动物后代性别的设备和方法。
背景技术
利用人工受精(AI)使得动物受精和在体外受精后进行胚胎移植是一种常规实施方法。在畜牧业中,朝向具有一个或者多个所需特征的后代而影响生殖结果的能力具有显而易见的优点。例如,在乳品加工业中趋向于雌性预先选择后代以确保乳牛的养殖是具有经济效益的。如在美国专利US6,357,307(Buchanan等)、US 5,985,216(Rens等)和US 5,135,759(Johnson)中公开的,人们已经对利用分拣X和Y精细胞的流式细胞术来实现这个目标进行了尝试。但是,这些尝试都没有导致能够产生大量具有足以有效受精的游动性的性别相对纯的精细胞的商业上成功的高生产能力的系统的形成。
因此,在动物养殖业中目前需要一种在商业上使用的基于DNA特征(或者其它特征)有效隔离精细胞以产生大量的这样的细胞的可行的高速系统。还需要一种当这样的被隔离的精子被隔离系统处理时能够保持其生存力以及在准备使用能够保存这样的被隔离的精子的精子管理系统。本发明满足这些需要。
更概括地,本发明涉及流式细胞术的改进。一般地,流式细胞术被定义为通过一种测量装置当颗粒基本单列在流体流中通过时测量各个颗粒的特征,流式细胞术通常提供根据所选择的特征对颗粒分类的信息。或者,接着可利用一些技术(包括液滴分拣、液滴干涉分拣和流体交换)对颗粒进行分类。另一种选择是选择性地分裂不想要的颗粒,例如利用光切除。
在基于光学的流式细胞术系统中,利用光学器件将光束(例如可见光或者UV光)引导和聚焦在含有颗粒的流体流中并且收集来自于颗粒的辐射(包括散射光和/或来自于颗粒荧光辐射)。例如在一种常用的光学系统中,光束(例如激光束)被聚焦在流体流上并且辐射被一对收集单元收集,一个位于激光器前面以收集散射光辐射,另一个垂直于流体流和激光器设置以收集荧光辐射。每一个收集单元包括分离的光检测器,这增加了系统的费用。另外,在常规光学系统中,光检测器将所收集的辐射转化为电信号,利用模拟系统分析电信号以根据所选择的颗粒特征对颗粒分类。模拟系统是较低廉的,但仅有限的信息可从信号中得出。
人们还试图开发可用于处理精细胞以得到富含具有所需性别染色体的精子的精细胞群的技术。但是,现有的技术达不到这里所述的本发明技术。
例如,Johnson等(美国专利US 5,135,759)描述了利用流式细胞计/细胞分拣器根据DNA内容将完整的带X和Y染色体的精子群分离成带X和Y染色体的精子富集群。如该文献所述的,精子在30至39℃的温度下在1小时(39℃)至1.5小时(30℃)与DNA选择性染料结合。接着利用流式细胞计测量当精子通过刺激染料的激光束时发出的荧光量。由于带X染色体的精子含有比带Y染色体的精子更多的DNA,并且大多数动物具有3至5%的差异,因此带X染色体的精子发出比带Y染色体的精子多的荧光。为了说明荧光测量可根据精细胞的转动取向而改变的情况,使用两个光检测器。首先确定精细胞取向是否适当,然后进行测量以根据具有X或者Y染色体对精子分类。利用振荡器使得包含精子的流体流在精子通过激光束的位置的下游分裂成液滴。具有预定荧光强度的包含单个精子的液滴被提供电荷并且被静电偏转到收集容器中。被收集的性别强化精子群接着用于显微注射、体外受精或者人工受精。
Seidel等(WO 02/43574)还描述了利用流式细胞术将精子分成带X和Y染色体的细胞的性别强化群。Seidel等描述了在30℃和40℃之间的温度下对细胞着色。
美国专利申请公开号为2003/0157475 A1(Schenk,2003年8月21日)描述了一种低温冷藏已经根据X或者Y染色体含量进行分拣的精细胞的方法。如这里所述的,需要在精细胞被低温冷藏之前为精细胞添加一种防冻剂以在低温冷藏过程中保护精细胞。例如,甘油是一种通常在低温冷藏之前添加到牛的精细胞的防冻剂。但是,为了从防冻剂获得更好的保护,需要在使得精细胞处于低于0℃的温度下之前等待防冻剂与精细胞平衡。在平衡时间内,防冻剂渗透细胞膜以除了由防冻剂提供的细胞外保护以外还提供细胞内保护。这样,在美国专利申请公开号为2003/0157475 A1中描述的低温冷藏方法描述了在精细胞被冷至5℃之后添加一种包含甘油的添加剂。接着在精细胞遭遇较低的温度之前使得精细胞和甘油在1和18小时之间的时间内在5℃下平衡。所披露的内容建议3和6小时之间的平衡时段以获得最佳结果。
遗憾的是,3至6小时的平衡时间所涉及的时间和费用对于商业精子分拣方法的收益带来负面影响。另外,对于商业精子分拣方法,相信通常通过减小精子收集和低温冷藏之间的时间(其它因素是等同的)来改善精子的健康。也从该观点出发,希望可以使用不需要长平衡时间来达到防冻剂最佳效果的低温冷藏技术。另外,据说已知的低温冷藏技术对精子的游动性产生有害的影响,这表明精子生育力降低。这样,需要与常规技术相比保存精子生育力的低温冷藏技术。
发明内容
本发明涉及一种基于一个或者多个所需的特征分析、分类和分拣颗粒的改进系统(方法和设备);在一个实施例中,提供这样一种系统,即使用流式细胞术根据DNA含量精确地隔离和分拣细胞的系统;在某些实施例中,提供这样一种系统,即包括能够使得系统的产量作为一个或者多个因素的函数被控制的分拣协议的系统,这些因素包括需要分拣的颗粒群的纯度、所需颗粒群被收集的速度、没有被分拣到所需群中的所需颗粒的损失以及其它因素;在一个实施例中,提供这样一种系统,即高速操作以提供适合动物养殖业商业使用的性别分拣精子的系统;提供这样一种系统,即可在不对细胞(包括精细胞的游动性)产生很大的不良影响的情况下用于分拣细胞的系统;提供一种系统,该系统可用于在对细胞(包括精细胞的游动性)产生的最小不良影响的情况下保存分拣的精细胞直至需要它们时;提供这样一种系统,当该系统涉及有性别精子的产生时,该系统包含提高速度和分类准确度和精细胞的分拣的技术;提供一种流式细胞术系统,该系统利用外照射(epi-illumination)光学器件检测待分析以及(可选择的)待分拣的颗粒的各种特征;提供这样一种制造经济的外照射流式细胞术系统;在一个实施例中,提供这样一种系统,该系统包括多个流式细胞术单元,所述多个流式细胞术单元共享一个集成平台以便以高生产率分类和(可选择地)分拣颗粒(诸如一般意义上的细胞,特别是精细胞);提供这样一种多通道系统,该系统共享公共部件和系统以减小通道之间的差异以更有效的操作;以及在一个实施例中,提供这样一种分拣系统,该系统包括能够使得一个样本被迅速测试以确定样本的质量以可评价进一步分拣的收益性的协议。
另外,本发明涉及用于数字处理表示荧光的信号的改进系统(方法和设备);在一个实施例中,提供这样一种数字系统,该系统用于检测作为背景特征的函数的模拟数字转换脉冲;在一个实施例中,提供这样一种数字系统,该系统用于鉴别参数初始化;在一个实施例中,提供这样一种数字系统,该系统用于检测对应于波形脉冲的数字信息;在一个实施例中,提供这样一种数字系统,该系统用于包括特征抽取的数字信息分析;在一个实施例中,提供这样一种数字系统,该系统用于分类脉冲和限定判定边界;在一个实施例中,提供这样一种数字系统,该系统使用液滴分裂传感器控制换能器振幅;以及在一个实施例中,提供这样一种数字系统,利用该系统分配和收集用于商业流通的细胞。
另外,本发明涉及在从雄性动物收集的精子样本时通过包含比存在于所收集的精子中的更多的具有所需染色体特征的精子的精子样本的低温冷藏对动物精子进行商业处理的改进的综合系统(方法和设备);在一个实施例中,提供这样一种系统,该系统能够对商业量的活的性别强化精子进行有效处理;在一个实施例中,提供这样一种系统,通过对该系统调节能够计算日常的和动物之间的精子特征的变化;在一个实施例中,提供这样一种系统,该系统能够利用一个流式细胞术单元每小时以85%的纯度生产约18,000,000个性别强化精子;在一个实施例中,提供这样一种系统,该系统能够对一批精子(例如,从一个雄性动物收集的精子量)进行完全处理以85%的纯度生产具有所需性别特征的活精子样本并且在1小时的处理时间内具有所需性别特征的收集的精子的损失小于10%。
总体上,本发明涉及在本申请权利要求中所述的设备和方法。
本发明的其它目的和特征部分是明显的并且部分在下文中提及。
附图说明
图1是本发明的一个示例性精子分拣程序的作业流程图;
图2是本发明的流式细胞术液滴分拣系统的一个实施例的示意图;
图3是本发明的用于液滴分拣的流式细胞术设备的一个实施例的一部分的侧视图,其中示出将刺激射束聚焦在由喷嘴系统产生的向上移动流体流上的外照射光学组件;
图4是本发明的喷嘴和喷嘴支座的一个实施例的一个端视图;
图5是沿图4的切割平面5-5得到的图4的喷嘴和喷嘴支座的截面图;
图6是本发明的一个实施例所涉及的在由椭圆形射束斑点询问的流体流中输送的精细胞的示意图;
图7是表示精细胞的所需取向的角包络线的示意图,其中来自于光学系统的光束将照射细胞的基本宽大的宽面;
图8是本发明的喷嘴主体的一个实施例的横截面图;
图9是表示通过喷嘴主体的一系列切割平面(A-A至H-H和J-J至K-K)的图8中所示的喷嘴主体的侧视图;
图9A-9H和9J-9K是沿着图9的相应平面(A-A至H-H和J-J至K-K)的在图8和图9中所示的喷嘴主体的截面图;
图10是喷嘴中具有定向挡板的喷嘴系统的一个实施例的横截面的透视图;
图11是图10中所示的喷嘴系统的横截面图;
图12是图10和11中所示的喷嘴系统的一部分的局部放大横截面图;
图13是与图12中所示的图类似的局部放大横截面图,但是从垂直于图12中的观察方向的方向取得的;
图14是固定挡板的挡板支架的一个实施例的侧视图;
图15是图14中所示的挡板支架和挡板的顶视图;
图16是以使得挡板支腿与平行于喷嘴中的椭圆D的长轴的线相交的方式在喷嘴中转动定向的挡板支架的一个实施例的顶视图;
图17是以使得挡板支腿与垂直于喷嘴中的椭圆D的长轴的线相交的方式在喷嘴中转动取向的挡板支架的一个实施例的顶视图;
图18是包括挡板的喷嘴系统的一个实施例的侧横截面图,其中示出通过喷嘴和挡板的一系列切割平面(A-A至E-E);
图18A-18E示出在图18中所示的喷嘴系统中在各个点处的横截流动区域;
图19是通过具有垂直于喷嘴的纵向轴线的挡板的喷嘴得到的与图12类似的横截面图;
图20是通过图19上所示的切割平面20-20得到的图19中所示的喷嘴的横截面图;
图21是与图18的横截面图类似的横截面图,其中示出在偏置位置处具有样本引入导管的喷嘴系统;
图22是安装在本发明的喷嘴座的喷嘴系统的一个实施例的透视图;
图23是多个排成一列的精细胞当通过本发明的一个开孔元件朝向询问位置时转动取向的示意图;
图24是表示在本发明的一个实施例所涉及的喷嘴下游的液滴分裂(脱落,break-off)位置的示意图;
图25是本发明的分裂传感器系统的一个实施例的示意图;
图26是本发明的一种流式细胞术系统的正试图;
图27是图26中所示的系统的一部分的放大透视图,并且为了清楚起见去除该系统的一些部分;
图28是本发明的一种外照射光学系统的一个实施例的示意图;
图29是本发明的一种外照射光学系统的一个实施例的透视图;
图30是图29中所示的外照射光学系统的侧视图;
图31是图29和30中所示的外照射光学系统的顶视图;
图32是沿着图30的平面32-32的外照射光学系统的截面图;
图33是沿着图31的平面33-33的外照射光学系统的一部分的截面图;
图34是仅示出在图29中所示的外照射光学系统的二向性滤光器后面的滤光系统的元件的透视图;
图35是包括柱面透镜的平移调节的本发明的另一种外照射光学系统的透视图;
图36是本发明的一个实施例的询问位置的示意图,其中示出以偏斜入射角聚焦在喷嘴的下游的流体流上的激光束;
图37是本发明的分拣校准系统的一个实施例的示意图;
图38是与图37中所示的分拣校准结合使用的外照射传感器的一个实施例的示意图;
图39是本发明所涉及的数字细胞分析器(DCA)和处理器的一个实施例的框图;
图40是本发明的多通道分拣器的一个实施例的示意图,其中示出两个通道;
图41是本发明的多通道分拣器的一个实施例的作业流程图,其中示出四个通道;
图42是本发明所涉及的模拟细胞分析器(ACA)的一个实施例的框图;
图43是表示来自于从以每秒10,000个细胞的平均速度流动的细胞检测荧光脉冲的光检测器输出的波形脉冲流的图表;
图44是图43的分解图,其中示出来自于从以每秒10,000个细胞的平均速度流动的三个细胞检测三个荧光脉冲的光检测器输出的流;在该图中100MHz液滴时钟的正方形波已经被叠加以表示在三个脉冲和液滴时钟的正方形波脉冲之间的同步;
图45示出精细胞相对于具有窄宽度的激光束斑点的移动;
图49是对应于来自于以105MHz的连续采样率基于122个样本检测一个荧光脉冲的光检测器的时间改变模拟输出的数字信息的示例性图示;
图50是表示在本发明的一个实施例中的在激光脉冲、由激光脉冲导致的来自于细胞的荧光发射以及光检测器输出的数字样本之间的时间关系的示意图;
图51是表示图50中所示的数字样本如何形成脉冲波形的示意图;
图52是表示X精细胞在脉冲波形中的较高峰值强度的与Y精细胞的脉冲波形同步的X精细胞的脉冲波形的示意图;
图53是表示可用于脉冲分析的一个阈值和积分窗的脉冲波形的示意图;
图54是表示利用缝隙扫描技术达到的高分辨率的包含X和Y精细胞的样本的直方图;
图55是表示利用标准照射达到的较差分辨率的包含X和Y精细胞的样本的直方图;
图56-59示出荧光直方图和峰值相对于精子核和活精细胞的区域的散布图;
图60-61示出精细胞的荧光强度直方图的四元模型-图60示出原始数据,以及图61示出基于图60中所示的数据利用本发明的一种迭代算法的一个实施例产生的模型曲线;
图62-63示出精细胞的荧光强度直方图的三元模型-图62示出原始数据,以及图63示出基于图62中所示的数据利用本发明的一种迭代算法的一个实施例产生的模型曲线;
图64示出CSD特征的非线性;顶部板条表示用于带X或者带Y的精细胞的平均M图表;中间板条示出小于平均的带Y的荧光发射脉冲的峰值高度的用于信号振幅值的这些平均M图表(即M′)的第一导数的图表;以及底部板条示出作为信号振幅的函数的第一导数(M′x-M′y)之间的差异;
图65示出其中CSD特征是穿过荧光发射脉冲上的两个点的直线的计算斜度的一个实施例;
图66-69示出利用CSD特征抽取达到的改进区别;
图70示出设置在CSD相对于脉冲区域(area)散射的散射图表上的二元变量分拣区域;
图71示出用于其中左板条对应于高回收/重合接受分拣策略(无重合中止策略)以及右边板条对应于高纯度/重合拒绝接受分拣策略(重合中止策略)的测试的流式细胞术再次分析的一个实施例;
图72是本发明的数字信号处理的一个实施例的作业流程图;
图73是可根据本发明的一个实施例使用的k平均(k-menas)聚合策略的一个示例;
图74是可根据本发明的一个实施例使用的对于脉冲特征数据应用Bayes Minimum Error(贝叶斯最小误差)判定规则的概念图和图表表示;
图75是可根据本发明的一个实施例使用的利用Bayes Minimum Error判定规则获得的结果和Mahalonobis(马氏)距离脱粒支持获得的结果的图表表示;
图76可是根据本发明的一个实施例使用的移动窗统计表以提供“遗忘”的概念图;
图77是根据本发明的一个实施例使用的漂移补偿的图表表示;
图78示出包含示例性颗粒分布的流体流;
图79是表示作为使用重合接受分拣策略的流体输送率的一个函数的纯度的图表;
图80是表示作为使用重合拒绝分拣策略的流体输送率的一个函数的被成功地分拣成可用群组的所需颗粒的百分比的图表;
图81是表示接受分拣到所需颗粒的群组中的重合液滴的百分比和拒绝分拣到该群组中的重合液滴的百分比之间的反向关系的图表;
图82是表示本发明的分拣设备的一个实施例的总体操作的判定流程图;
图83是取向适于产生具有水平速度分量的液滴流的细胞计和收集液滴的收集系统的侧视图;
图84是关于喷嘴系统和偏转器板所示的图83中所示的收集系统的放大透视图;
图85是本发明的收集系统的一个实施例的示意性图表;
图86是图83中所示的收集系统的截断装置的正试图;
图87是图83中所示的收集系统的截断装置的侧视图;
图88-95示出几个精子离心分离试验的图表结果;
图96-98是表示本发明的过滤方法的一个实施例中的步骤的示意图;
图99是用于过滤精细胞的过滤系统的一个实施例的示意图;
图100是用于过滤精细胞的另一种过滤系统的示意图;
图101和102示出精细胞过滤试验的图表结果;
图103是本发明的低温保藏方法的一个实施例的工作流程图
图104示出精细胞低温保藏试验的图表结果;
图105是用于本发明所涉及的处理精细胞的方法的一个实施例的作业流程图;
图106是本发明的多通道颗粒分拣器的一个实施例的透视图,其中部分被拆下以示出分拣器的内部特征;
图107是可用于图106的多通道颗粒分拣器中流体输送的歧管系统的透视图;
图108是图107的歧管系统的透视图,其中示出歧管系统的内部流体连通;
图109是图106中所示的颗粒分拣器的透视图,其中附加的元件被去除或者部分去除以更好地示出分拣器的内部特征;
图110是图106中所示的颗粒分拣器的正试图;
图111是图106中所示的颗粒分拣器的侧视图,其中壳体的侧壁被去除以示出分拣器的内部特征;
图112是图106中所示的颗粒分拣器的侧视图(从与得到图107的侧面相对的侧面取得的),并且侧壁被去除以示出分拣器的内部特征;
图113是从分拣器后面的一个角度得到的图106中所示的颗粒分拣器的侧视图并且背盖被去除以示出分拣器的内部特征;
图114是图106中所示的颗粒分拣器的一部分的透视图,其中示出多喷嘴系统在横梁上的安装;
图115是图106中所示的颗粒分拣器的一部分的透视图,其中示出收集系统和颗粒分拣器的其它部分的相对位置;
图116是用于本发明的多通道分拣器的流体输送系统的一个实施例的示意图;
图117和118是两种不同激光束分裂系统的示意图;
图119和图120是本发明的另一种多通道分拣器的透视图;
图121-134示出各种实施例的图示结果;
图135是本发明的喷嘴系统的一个可选择的实施例的示意图,其中喷嘴通过毛细管引导流体流;
图136是本发明的一种光损害分拣系统的一个实施例的示意图;
图137是基于可用于使用本发明的技术的设备中的流体转换的一种可选择的分拣系统的示意图;以及
图138是基于使得带有分析的颗粒的流体流的所选择的不连续区段的一种高速液滴干涉流的一种可选择的分拣系统的示意图。
在附图中相应的部件由相应的附图标记表示。具有对应于每一个部件的相关附图标记的部件列表如下。部件列表设有基本对应于说明书中的段落标题的段落标题以便于部件列表的使用。一般地,部件列表的每一个段自身为在详细描述的相应段落中第一次引入的部件提供附图标记。
具有对应于每一个部件的相关附图标记的部件列表
总体概述
39   精子收集
41   为精子贴标识
41A  增加缓冲剂
43   质量控制
47   清洗
48   着色流体
49   着色
51   培育
53   装入流式细胞计的样本引导装置
54   通过流式细胞术增加鞘流体
55   分拣
57   收集分拣的精子
58A  增加收集流体
58B  浓缩精细胞
58C  增加低温充填剂(膨胀剂)
59   将分拣的精子装在试管中
61   低温保藏
63   包装在液氮中
65   分配
67   销售
69   储藏
71   人工受精
流式细胞术
1    系统(总体)
3    载流体的供给
7    鞘流体的供给
9    具有分拣能力的流式细胞术设备
15   流体输送系统
17   载流体
19   鞘流体
21   流体流
23   颗粒流
25   电磁辐射束
31   来自于颗粒的电磁辐射发射
33   液滴
35   包含在液滴中的颗粒
流式细胞术设备(单通道)
101   喷嘴系统
103   喷嘴孔
105   换能器
107   液滴分裂
109   光学系统
115   询问位置
117   光检测器
119   分拣系统
123   第一不同组或者群组的液滴
125   第二不同组或者群组的液滴
2201  收集系统
131   处理器
喷嘴系统
133   圆柱形流动主体
135   中心纵向孔
137   喷嘴
139   漏斗形喷嘴主体
141   通过喷嘴主体的通道
145   带有内螺纹的沉孔
149   带有螺纹的凸出部或者螺柱
155   O形密封件
157   导管(管形针)
167   环形空间(间隙)
173   流动主体中的径向孔(鞘流体)
183   第二径向孔(附加鞘流体)
189   载流体的中心孔
191   流体的外同轴鞘
细胞取向
201   牛精细胞
205   桨形头部
207   平宽的相对的表面
209   窄边
211   精子赤道
213   核
215   尾
217   核长度
219   头部长度
221   头部宽度
223   总长
225   在核内的定位区域
227   流体流的方向
229   其中光束照射在宽面的具有一定角度的包络线上
R1    角度范围
P     平面
喷嘴设计
231   喷嘴主体的内部
233   喷嘴主体的内表面
235   第一轴向锥形区域
237   第二轴向锥形区域
239   第三轴向锥形区域
247   喷嘴的纵向轴线
249   喷嘴内部的第四区域
251   第四区域的轴向长度
255   孔元件
257   在喷嘴前端的沉孔
259   第一扭转区域
261   第二扭转区域
263   第一扭转区域的表面
267   第二扭转区域的表面
271   扭力
273   第一扭转区域的轴向长度
275   第一锥形区域的轴向长度
277   第二锥形区域的轴向长度
279   第二扭转区域的轴向长度
309   孔元件的圆锥形上游表面
315   孔元件的圆锥形下游表面
317   圆锥形上游表面的轴向长度
327   下游表面的轴向长度
定向挡板
2001  定向挡板
2003  挡板
2005  挡板支座
2007  上游支腿
2009  下游支腿
2015  交线
2017  喷嘴主体的中心轴线
2019  上游支腿的弯曲边缘
2025  下支腿向下游延伸的距离
2027  挡板支座的总长
2029  挡板支座的外径
2031  挡板支座的内径
2033  交线和喷嘴中心线之间的距离
2035  挡板的上游端
2037  挡板支座的倾斜表面
2039  下游支腿的侧边
2041  下游支腿的下游边
2049  挡板和挡板支座之间的间隙
2051  挡板支座的内表面
2053  挡板后的体积
2055  喷嘴的内部体积
2057  圆柱形挡板支座的纵向轴线
2059  通过椭圆D的长轴的线
2061  注射针和挡板之间的距离
2067  挡板支座的下游端
2069   挡板支座和喷嘴之间的接触点
2071   O形圈
2077   喷嘴座(凸台)的下游端
2079   凸台的内径
2081   芯流和喷嘴表面之间的鞘流体部分
2087   上游横截面(A)
2089   在挡板(B)处的横截面
2091   在挡板(C)处的横截面
2093   在挡板(D)处的横截面
2094   在挡板下游(E)处的横截面
2097   垂直挡板系统
2095   空气泡
2099   垂直挡板
2101   垂直挡板的弯曲边缘
2103   垂直挡板的直边缘
2105   O形圈
2107   喷嘴中的环形台肩(架)
2109   样本注射针(导管)的外径
2151   具有偏置样本引入导管的喷嘴系统
喷嘴安装和调节
331   喷嘴座
333   第一线性级
337   第二线性级
339   X轴线
341   Y轴线
343   第三转动级
345   Z轴线
347   固定的第一级元件(未示出)
349   固定的第一级元件的框架
355   活动的第一级元件
357   用于第一级的致动器(测微器)
359   固定的第二级元件
361   活动的第二级元件
363   用于第二级的致动器(测微器)
365   固定的第三级元件
371   活动的第三级元件
373   用于第三级的致动器(测微器)
375   包含细胞的流的一般向上的方向
377   向上方向的角度
换能器和液滴形成
379   套环
381   压电元件(未示出)
383   端子
D     流的直径
分裂传感器
389   分裂传感器
391   微处理器
393   光源
395   线性光敏元件阵列(光二极管)
401   用于液滴分裂传感器的透镜
405   电流电压运算放大器电路
407   跟踪/保持放大器
409   正弦波发生器(跟踪/保持信号)
411   A/D转换器
412   摄影系统
413   选通
414A   遮光板
414B   遮光板中的缝隙形开口
外照射光学系统
415   外照射光学系统
417   外照射器具
419   纵向光学轴线
425   束斑
427   聚焦照射束的轴线
429   矩形底座
431   反射滤光器
435   激光器或者弧光灯
437   调节透镜组件
439   二向色腔室的侧壁中开口
441   二向色腔室的侧壁
443   二向色腔室
445   扣环
447   中性密度滤光片
449   圆柱形透镜
455   透镜支座
457   防松螺母
459   束斑的椭圆形横截面
461   用于反射滤光器的夹子
463   滤光器支座
465   滤光器支座的有角度的表面
467   滤光器支座中的开口
469   用于滤光器支座的线性级
471   X轴线
473   悬臂梁
475   用于线性级的致动器
477   二向色滤光器
479   用于二向色滤光器的夹子
485   用于二向色滤光器的框架
487   向前的方向
489   光学仪器的纵向光学轴线
491   聚焦透镜组件
497   细胞发出的荧光脉冲波形或者信号
498   刺激空间功能
501   物镜适配器
503   二向色腔室的前壁中的开口
505   二向色腔室的前壁
507   聚焦镜筒
509   透镜支座筒
511   聚焦透镜
513   向后方向
515   套管式焦点调节
517   准直发射光
519   滤光系统
521   发射滤光器
523   发射滤光器支座
525   在二向色腔室的后壁中的开口
527   二向色腔室的后壁
529   校准薄膜组件
531   校准薄膜的滑块
533   用于滤光器组件部件的导轨
535   用于校准薄膜的滤光器支座
539   薄膜滤光器元件
541   用于将滤光器元件固定到滤光器支座的夹子
543   校准薄膜相对于光学轴线的角度
545   用于将滑块固定在底座上的紧固件
547   底座中的平行狭槽
549   非球面透镜
551   用于非球面透镜的支座
553   用于非球面透镜的框架
557   用于非球面透镜的紧固件
559   空间滤光器
561   孔板
563   用于空间滤光器板的框架
567   垂直缝隙
571   水平缝隙
573   孔
575   垂直尺寸
577   水平尺寸
579   收集体积
583   板支座
587   用于板支座的紧固件
589   用于孔板的衬背元件
449A  可调节的安装组件
449B  狭槽
449C  狭槽
450   反射荧光发射的外照射
451   二向色滤光器
光检测器
591   用于光检测器的安装板
595   用于光检测器的紧固件
束入射角
605   询问位置和喷嘴之间的距离
609   束轴线
A     入射角
聚焦的束斑
L1    沿着长轴的长度
W1    沿着短轴的宽度
分拣系统
627    充电装置
629    充电的检测器板
631    充电元件
633    充电元件中的开口
635    用于检测器板的电源
5001   可调节的安装组件
5003   安装组件调节板
5005   安装组件背衬
5007   紧固件
5009   狭槽
5011   平移轴线
5013   平移轴线
5015   安装组件调节板
5017   紧固件
5019   狭槽
5021   固定支承件
5023   紧固件
5025   弹簧
自动装置分拣校准
4201   校准系统
4203   外照射传感器
4205   光纤缆线
4207   二向色滤光器
4209   透镜系统
4211   来自于液滴中的颗粒的荧光发射
4213   光检测器
4215   束挡
分拣系统错误校正
5047   用于充电元件的碎屑去除系统
5048   用于检测器板的碎屑去除系统
5051   用于充电元件的支承
5053   真空通道
5055   真空线
5057   靠近充电元件的开口
5058   配件
5059   压缩气体线
5061   歧管
5063   空气通道
5064   开口
5065   配件
5066   检测器板的侧面
分拣的样本的保护
4033   收集容器
4041   污染防止机构
4043   气动致动器
4045   摆臂
4047   摆臂端
流体输送系统
645   注射泵
647   从泵到载体供给的流线
649   用于包含载流体供给的容器
651   从泵到注射针的线
657   从注射泵到针的供给线
659   变速马达
661   用于鞘流体供给的第二容器
667   用于使得鞘流体与喷嘴中的径向孔相连的供给线
669   在供给线中的控制阀
671   用于鞘流体的气体压力系统
675   加压气体源
679   加压气体气线
681   用于控制被供给到鞘流体罐的压力的调节器
683   空气线中的双向阀
控制(装置)
689   A/D转换器
693   移动通过束斑的斑点经历的相对束强度
695   来自于穿过束斑的精子的相对束强度
d     喷嘴和液滴分裂位置之间的距离
信号处理
701   来自于光检测器的输出信号
703   液滴产生时钟信号
705   数字信号处理(数字细胞分析器)
707   来自于A/D的数字信号
735   PC/计算机端子
737   主时钟(128×时钟信号)
739   数据获得(HH1′)
741   初始化检测参数(HH1)
745   初始化识别(辨别)参数(HH2)
747   数字脉冲检测(HH3)
749   数字脉冲分析-特征抽取(HH4)
753   脉冲区域(HH5)
755   脉冲峰值(HH6)
757   脉冲识别(HH7)
759   分拣(HH8)
761   漂移分析(HH9)
763   用于Bayes规则的判定边界
769   初始化
771   系统检查
773   使用者相互作用
775   重试(最多三次)
777   闪光
779   珠质量控制
781   吸气采样
783   采样质量控制
785   开始采样
787   分拣进行
789   采样完成
791   连续采样
793   分拣停止
795   X/Y识别最佳
797   设置X/Y识别
799   识别OK
801   速度最佳
803   设定注射速度
805   速度OK
807   系统检查
809   系统复位
811   系统OK
813   示例性总操作流
825   积分器
827   宽度/区域比较器
829   动态阈值计算器
831   脉冲识别
833   JTAG端口I/O
837   窗比较器(区域)
839   脉冲宽度和触发器逻辑
841   分拣判定
843   I/O控制器
845   从属控制器
847   分拣控制器板
849   USB
851   DSP板SDRAM
853   分拣信号
854   低通滤波器
855   I/O板SDRAM
857   处理器I/O
859   外围I/O总线
861   分拣脉冲发生器
863   数据管理处理器
865   脉冲检测处理器
867   特征抽取处理器
873   分拣处理器
875   DSP板RAM
OL     可用群组中的重合液滴和不可用群组中的重合液滴之间的逆关系
P1     对应于85%纯度的线OL上的点
LL     对应于60%的所需颗粒的收集的线OL上的点
OR     操作范围(P1和LL之间的OL段)
6000   原始数据
6001   第一未排列的细胞群组
6003   第二未排列的细胞群组
6005   排列的Y群组
6007   排列的X群组
6010   原始数据
6011   未排列的细胞群组
6015   排列的Y群组
6017   排列的X群组
多通道系统
1001   多通道系统
1003   流式细胞术单元
1005   公共颗粒供给
1007   共电磁辐射源
1009   公共壳体
1011   公共控制输入
1019   公共输出
1021   公共流体输送系统
1023   公共温度控制系统
1025   公共电源
1027   公共废物回收系统
1029   公共偏转板系统
1031   公共清洁系统
公共壳体
1069   底座
1071   两侧壁
1073   下肩对
1075   下盖板
1077   壳体前部
1081   上肩对
1083   上盖板
1085   壳体后部
1087   用于安装多个细胞计数单元的框架
1089   附着在壳体侧壁的横梁(用于连接喷嘴座)
1093   在侧壁之间延伸的有角度的安装板
公共流体供给(源)
1105   用于载流体的泵
1107   载流体的公共供给(源)
1115   用于鞘流体的气体压力系统
1117   鞘流体的公共供给(源)
1121   歧管系统
1123   包含载流体的公共供给的容器
1125   容器支座
1133   支承块
1135   用于接收容器的腔
1137   用于缓冲材料的第二腔
1139   用于缓冲材料的容器
1141   注射泵
1147   从注射泵到歧管的供给线
1149   控制载流体和缓冲流体的三向阀
1155   用于鞘流体的公共供给的容器
1157   从鞘流体容器到歧管的供给线
1161   加压气体源
1163   气体线
1165   在气体线中的调节器
1167   在气源和鞘流体罐之间的气线所用的两向阀
1169   对清洁溶液的供给加压的气体线
1173   用于清洁溶液的罐
1175   用于清洁溶液的气线的两向阀
1177   歧管
1179   分层块
1181   通道
1185   流体流路
1189   与注射泵相连的入口
1191   与鞘流体的供给连接的入口
1193   用于载流体和鞘流体的出口
V1-V6  用于控制通过歧管通道的流体流的阀
1203   框架元件(用于连接歧管块)
1205   拧在块中的配件
1207   样本存储室
V1A-V1D   双向阀(用于控制样本流体到喷嘴的流动)
1217   样本存储室的针
1221   废物系统
1223   废物罐(容器)
1225   诸如真空泵的机构(用于产生真空)
1227   废物线(将阀V1A-V1D连接到废物罐)
1233   憎水过滤器(在连接废物罐和真空泵的线中)
1235   用于鞘流体的流路
V2A-V2D   双向阀(用于控制鞘流体到喷嘴的流动)
1241   鞘供给线
1247   连接鞘流体流路与废物罐的废物线
公共电源和控制
1249   公共电源
1251   公共动力输送系统
1253   公共输入(装置)(GUI)
1255   公共输出(装置)(连接到微处理器)
公共温度控制
1257   温度控制系统
1259   流体流路(到温度控制)
1263   流体通道(用于固定块中的温度控制)
1265   控制单元
1269   流体通道(用于歧管中的温度控制)
V6     关闭阀
公共光束和射束分裂系统
1270   射束分裂器
1270A  来自于射束分裂器的第一光束
1270B  来自于射束分裂器的第二光束
1271   第二射束分裂器
1271A  来自于第二射束分裂器的第一光束
1271B  来自于第二射束分裂器的第二光束
1272   第三射束分裂器
1272A  来自于第三射束分裂器的第一光束
1272B  来自于第三射束分裂器的第二光束
1273   射束引导系统
1279   下滤光组件
1281   上反射镜组件
1285   底座(用于下滤光组件)
1289   级(用于下滤光组件)
1291   用于移动级的机构(测微器)
1293   在级上的可倾斜的平台
1295   反射镜(在平台上)
1297   底座(用于上镜组件)
1299   级(用于上镜组件)
1301   可倾斜的平台(用于上镜组件)
1303   镜(用于上镜组件)
1305   用于移动上级的机构
1309   目标板(附着在壳体的侧壁上)
1311   垂直排列的孔(在目标板中)
1315   第一反射滤光器
1317   第二反射滤光器
1319   第三反射滤光器
1321   第四反射滤光器
公共检测器板
1331   两个公共检测器板
1333   框架(用于将公共检测器板安装在壳体上)
模块式多通道系统
4001   多通道系统
4009   模块式细胞计数单元
4011   用于模块单元的壳体
4013   公共壳体
4015   激光器
4017   射束分裂和引导系统
4021   用于使得激光进入模块式壳体的孔
4023   覆盖出口孔的板
4025   用于系统的收集系统
毛细管喷嘴系统
1335   毛细管喷嘴系统
1337   毛细管
1341   充填有透光介质的腔
可选择的分拣系统
1351   光分裂分拣系统
1353   第二激光器
1355   收集容器
1357   流体转换系统
1359   流体转换装置
1361   分支到第一收集容器的毛细管
1365   分支到第二收集容器的毛细管
1367   换能器(用于产生压力波以选择性地控制流体流的方向)
1369   在喷嘴的端部上的毛细管
1371   液滴干扰流分拣系统
1373   高速液滴干扰流
1375   用于高速液滴流的液滴产生系统
1377   高速喷嘴系统
1379   高速流体流
1381   用于液滴干扰流产生的换能器
1383   高速液滴
1387   用于高速液滴偏转的电子偏转板
1389   未充电的液滴
1391   充电的液滴
1397   流体流的转向段
1399   高速液滴流与同轴流体流的相交部分
1403   收集毛细管
收集系统
2201   收集系统
2203   截取装置
2205   冲击表面
2207   收集容器
2211   液滴入口通道
2213   吸液管的球管
2215   吸液管
2217   吸液管的内壁
2225   导管
2227   收集系统框架
2229   圆形支架
2231   用于截取装置高度的调整螺钉
2233   安装板
2235   用于横向调节的调节螺钉
2241   横向狭槽
2243   用于放置收集容器的托架
2245   出射窗
2247   第一截取装置
2249   第二截取装置
2265   离散液滴
收集流体
2301   收集流体
过滤
2401   过滤器
2403   用于过滤的收集容器
2405   包含精细胞的浓缩浆
2409   注射器机构
2411   套管过滤器
2413   再悬浮流体
2419   第二容器
2421   用于过滤试验的注射器
2423   用于过滤试验的样本
2425   用于过滤试验的过滤器
2427   用于过滤试验的真空泵
2431   用于过滤试验II的注射器
2433   用于过滤试验II的样本
2435   用于过滤试验II的过滤器
2437   用于过滤试验II的真空泵
低温保藏
2501   调节浓缩
2503   增加低温保护剂
2505   增加蛋白质源
2507   装在试管中
2509   冷却到保温温度
2511   保持在保温温度下
2513   冷却到达到临界区域的温度
2515   通过冰晶形成的范围的冷却
2517   浸没在液氮中
公共收集系统
2801   公共收集系统
2803   用于截取装置的公共框架
2805   废物槽
2807   用于收集容器的托架
脉冲激光系统
3001   脉冲激光
3003   激光脉冲传感器
3005   激光脉冲
3007   荧光脉冲寿命衰减
3009   数字样本
具体实施方式
下面所述的实施例涉及动物精子的收集和处理,特别涉及处理来自于家畜的精子以根据特定DNA特征分拣精细胞(例如,预先选择后代性别的X/Y染色体含量)。多种本发明的技术被组合以达到下面描述的结果。但是,应该理解的是,在不脱离本发明的保护范围的情况下这里所述的本发明技术可用于其它应用。
概述
图1是提供在本发明的一个示例性程序中的步骤概况的作业流程图。该程序始于从一个或者多个雄性动物(例如公牛)收集纯精子样本(步骤39)。精子样本被贴上标识以便于识别(步骤41),与缓冲剂接触(步骤41A)并且被输送到处理设备。除了缓冲剂以外,还加入添加物(步骤41A),例如包括能量源、蛋白质源、抗生素和/或在细胞内和/或细胞外调节氧化/还原反应的组分。可选择的质量控制测试可被执行(步骤43)以确保每一个样本的质量(例如,精子的游动性)足以指示最终的产物可能符合最低质量标准。可选择的洗涤步骤可执行(步骤47)。在步骤47A,通过利用各种为部分样本着色的着色协议接着分析每一部分的分拣性以识别用于特定样本的所需着色协议来选择用于处理的着色协议。通过将包含化学染料(例如一种DNA选择性荧光染料)的着色流体48加入到每一个样本中来执行根据所选择的着色协议的着色(步骤49)。除了着色流体以外,添加物也可在步骤48被增加,例如包括能量源、蛋白质源、抗生素和/或在细胞内和/或细胞外调节氧化/还原反应的组分。在步骤51培育样本以使得精子摄取染料。接着在步骤53将样本装在流式细胞计的样本引入装置中。在步骤54,样本流体与鞘流体一起被引入到流式细胞计中。除了鞘流体以外,还可在步骤54增加添加物,例如包括能量源、蛋白质源、抗生素和/或在细胞内和/或细胞外调节氧化/还原反应的组分。在步骤55,流式细胞计根据特定的DNA特征分拣精细胞,如下面描述的。当在步骤57利用流式细胞计的收集系统收集分拣的细胞时,它们被加入到包含收集流体或者低温填充剂的收集容器(步骤58A)。除了收集流体以外,还可在步骤58A增加添加物,例如包括能量源、蛋白质源、抗生素和/或在细胞内和/或细胞外调节氧化/还原反应的组分。此时,精细胞在已经被在该过程中被增加的各种流体稀释的溶液中。因此,具有所需DNA特征的精细胞群组在步骤58B被浓缩以用于商业上的人工受精。在步骤58C,低温填充剂被加入到浓缩的分拣的精细胞。除了低温填充剂以外,还可在步骤58C增加添加物,例如包括能量源、蛋白质源、抗生素和/或在细胞内和/或细胞外调节氧化/还原反应的组分。精细胞接着被包装在管式容器中(在饲养业中被称为“试管”)(步骤59)和低温保藏(步骤61)。被低温保藏的精子被包装以在液氮中储藏(步骤63)。被低温保藏的精子接着通过商业分配系统被分配(步骤65)并且被销售到动物饲养者(步骤67)。动物饲养者可储存低温保藏的精子(步骤69)直至它们准备使用精子对雌性动物(例如奶牛)人工受精(步骤71)。如下面描述的,本发明的一个实施例包括基本在整个过程中进行温度控制。同样,在有限的期限内完成各个步骤是本发明的另一个实施例的一个方面。整个过程仅是本发明可如何使用的一个示例,并且应该理解的是,上述一些步骤可被取消和/或增加其它步骤。被分拣的精细胞还可用于显微注射或者其它体外受精,接着胚胎被移植到接受的雌性动物体中。
包含本发明的进步的整个过程的步骤在下面将被详细描述。尽管所述的一种特定的程序涉及分拣动物精子(例如公牛精子),但应该理解的是,本发明的各个方面可用于任何类型的精子(马、猪以及其它),可用于任何类型的细胞,可用于任何类型的颗粒,有机的或者无机的,包括乳胶颗粒、磁性颗粒、染色体、亚细胞成分、原生质体和淀粉颗粒。这些颗粒的尺寸在0.5至200微米的范围内,但本发明的技术不限于该范围。
样本收集和稀释
样本收集
待分拣的精子样本可是来自于源动物的刚收集的样本,包括公牛、马、猪或者其它哺乳动物源,或者解冻的以前低温保藏的样本。另外,样本可是来自于同一个哺乳动物的一次射出的精液、多次汇集的精液或者来自于两个或者多个动物的多次汇集的精液。
各种收集方法是已知的并且包括带手套的-手方法、利用人工阴道和电刺激射精。精子优选被收集或者快速输送到隔热容器中以避免生理温度(通常35℃至39℃)的快速温度变化。一次射出的精液通常包含每毫升5亿至150亿个精子,这取决于种类和特定的动物。
不管收集方法,可从精子样本中抽取一部分并且对各个特征进行评估,诸如精子浓度、精子游动性、精子前进机动性、样本pH、精子膜完整性以及精子形态。例如可利用Hamilton-Thorn游动性分析器(IVOS)根据标准的和公知的程序(例如见Farrel等的Theriogenology(1998)49(4):871-9;以及美国专利US 4,896,966和US 4,896,967)通过对精子的检验来获得数据。
稀释
精子样本可与缓冲剂(采用固体或者溶液的形式)结合以形成精子悬浮液。特别是,缓冲剂可通过抵抗pH或者渗透压力的重大变化缓冲悬浮液来增强精子的生存力。一般地,缓冲剂对于细胞是无毒的并且与用于使得细胞着色的染料相容。示例性的缓冲剂包括磷酸盐、二磷酸盐、柠檬酸盐、醋酸盐、乳酸盐及其组合。目前优选的缓冲剂包括TCA、TEST、柠檬酸钠、HEPES、TL、TES、柠檬酸一水合物、HEPEST(Gradipore,St.Louis,MO)、PBS(Johnson等Gamete Research,17:203-212(1987))以及Dulbecco′s PBS(Invitrogen Corp.,Carlsbad,CA)。
一种或者多种缓冲剂可结合在一起或者与下面所述的添加剂结合在一起以形成缓冲的溶液,并且缓冲的溶液与精子样本结合形成精子悬浮液。缓冲的溶液还可包含一种或者多种添加剂,如下面详细描述的。示例性缓冲的溶液被示出在表1中。优选的缓冲溶液包括一种在pH为7.0的水中包含3%的TRIS基、2%柠檬酸一水合物和1%的果糖(w/v)的溶液,在表1中被标示为TCA#1的溶液和在表1中被标示为TCA#2的溶液。
表1   缓冲溶液
  组分   TCA#1   TCA#2   TEST   柠檬酸钠   HEPES   TL
  氯化钠(NaCl)   7.6g   5.84g
  氯化钾(KCl)   0.3g   0.23g
  碳酸氢钠(NaHCO3)   2.1g
  磷酸二氢钠(NaH2PO4-H2O) 0.04g
  2-羟基丙酸(乳酸钠)   3.68g
  氯化镁(Mg2Cl)   0.1g   0.08g
  N-(2-羟基乙基)哌嗪-N′-(2-乙磺酸)(HEPES) 2.38g 2.38g
  三(羟甲基)氨基甲烷(TRIS基) 30.3g 32.02g 10.28g
  柠檬酸一水合物   15.75g   18.68g
  柠檬酸钠二水合物   29g
  2-[(2-羟基-1,1-(二)羟甲基)乙基]氨基乙磺酸(TES) 43.25g
  果糖   12.5g   2.67g   10g   2.52g
  D-葡萄糖   2g
  链霉素   0.25g
  青霉素-G   0.15g
  水   1升   1升   1升   1升   1升   1升
  目标pH   7.35   7.35   7.35   7.35   7.35   7.35
  目标摩尔渗透压浓度(毫渗克分子/千克水) ~314 ~300 ~302 ~316 ~298 ~298
或者,精子可与代谢抑制物结合以形成抑制的精子悬浮液。代谢抑制物通过模拟哺乳动物的附睾或者附睾管的流体环境使得精细胞模仿哺乳动物(例如公牛)的附睾的精细胞。这样一种抑制物可减小或者抑制精子的游动性或者新陈代谢活性。这类抑制物的示例包括基于碳酸盐的抑制物,例如在Salisbury & Graves,J.Reprod.Fertil.,6:351-359(1963)中披露的。这类优选的抑制物包括NaHCO3,KHCO3和C6H8O7-H2O。这类一种优选的抑制物包括每25毫升纯水的0.204g的NaHCO3,0.433g的KHCO3和0.473g的C6H8O7-H2O(在水中,NaHCO3为0.097摩尔/升,KHCO3为0.173摩尔/升以及C6H8O7-H2O为0.090摩尔/升)。
除了缓冲剂以外,精子悬浮液还可包含多种添加物以增强精子的生存力或者游动性。示例性添加物包括能量源、蛋白质源、抗生素和/或在细胞内和/或细胞外调节氧化/还原反应的组分。这些添加物中的一种或者多种在精子悬浮液形成之前可被引入到缓冲剂中或者缓冲的溶液中,或者可被独立地引入到精子悬浮液中。
一个或者多个能量源可被加入以大大减小或者阻止精细胞氧化细胞内磷脂和其它细胞成分。示例性的能量源包括单糖,诸如果糖、葡萄糖、半乳糖和甘露糖,以及二醣类,诸如蔗糖、乳糖、麦芽糖和海藻糖,以及其它多糖。例如,所得到的精子悬浮液可包括1%(w/v)至4%(w/v)的能量源。如果包括的话,能量源优选是果糖并且精子悬浮液包含约2.5%(w/v)。
为了使得稀释震动最小化,为细胞提供支承或者使得细胞分散在整个悬浮液中,蛋白质源也可被包括在缓冲剂、缓冲溶液或者精子悬浮液中。示例性蛋白质源包括蛋黄、蛋黄提取物、牛奶(包括热均质化和撇渣)、牛奶提取物、大豆蛋白、大豆蛋白提取物、血清白蛋白、牛血清白蛋白、人血清替代品补充物及其组合。白蛋白,特别是牛血清白蛋白(BSA)是一种优选的蛋白质源。例如,如果包括的话,以小于5.0%(w/v),优选小于2%(w/v)、更优选小于1%(w/v),最优选小于0.1%(w/v)的BSA可存在于精子悬浮液中。
蛋白质源(例如BSA)的使用仅可起动精细胞在悬浮液中的百分比中的获能过程。优选,该过程发生在雌性生殖道中。因此,为了在稀释过程中以及在随后的着色和分拣过程中阻止获能起动,一种可选择的蛋白质源或者蛋白质替代物可被包含在精子悬浮液中。可选择的蛋白质源或者蛋白质替代物具有常规蛋白质源(例如BSA)的有益效果而且还有在细胞在精子悬浮液中的较大百分比中阻止获能起动的能力。可选择的蛋白质源的示例包括人血清替代品补充物(SSS)(Irvine Scientific、Santa Ana、CA)和胆固醇强化因子BSA,而蛋白质替代物的一个示例包括聚乙烯醇(诸如分子量为30000至60000的低至中粘性的聚乙烯醇)。一般地,如果包括的话,这些成分将以与上面关于BSA描述的相同的量存在,缓冲剂或者缓冲溶液的总白蛋白含量通常不超过5.0%(w/v)。
抗生素可被加入到精子悬浮液以抑制细菌生长。示例性抗生素例如包括泰乐菌素、林肯霉素、奇放线菌素、Linco-Spectin_(林肯霉素氢氯化物奇放线菌素)、青霉素、链霉素、羧噻吩青霉素或者其任何的组合。抗生素可以每毫升精子50□克至800□克的浓度存在,而与精子是否纯、被缓冲或者包含附加的物质(例如,这里所述的任何一种添加剂)无关。精子鉴定服务机构(CSS)和动物饲养员国家协会(NAAB)已经发布关于抗生素在精子收集和应用中的使用的指南。
在细胞内和/或细胞外调节氧化/还原反应的成分也可被包含在精子悬浮液中。这样一种成分可为精细胞提供一种保护性效果,诸如利用保持精子生存力或者前进游动性。这样一种成分的示例例如包括丙酮酸盐、维生素K、硫辛酸、谷胱甘肽、淡黄霉素、醌、超氧化物歧化酶(SOD)和SOD拟态。如果被包括在精子悬浮液中,这样一种成分可以足以在不对精子健康造成不良影响的情况下达到保护效果的浓度存在。示例性浓度范围包括约10mM至约50mM,取决于诸如所用的特定成分或者精子在悬浮液中的浓度之类的因素。例如,丙酮酸盐可以约1mM至约50mM、优选约2.5mM至约40mM、较优选约5mM至25mM、更优选约10mM至15mM、最优选约15mM,最最优选约10mM的浓度存在于精子悬浮液中。维生素K可以约1mM至约100mM、优选约10mM至约100mM、更优选约100mM的浓度存在于精子悬浮液中。硫辛酸可以约0.1mM至约1mM、更优选约0.5mM至约1mM、最优选约1mM的浓度存在于精子悬浮液中。
待分拣的细胞的着色
一般地,可利用形成包含精细胞、缓冲剂和染料的着色混合物使得精细胞被着色。如上面关于样本收集和稀释描述的,精细胞可由刚得到的精子样本或者解冻的低温保藏精子样本得到。
如果精子样本是解冻的在前低温保藏精子样本,精子优选在着色之前立即解冻。一般地,包含冷冻精子的试管或者其它低温冷藏容器可被放置在水池中,水池的温度优选超过精细胞膜的玻璃态转化温度(即,约17℃),但不高至对精子健康产生不良影响。例如,可通过将低温冷藏容器浸入到保持在17至40℃的温度下的水池中持续30至90秒来解冻冷冻精子。
在获得后,精细胞可以纯精子的形式或者以源于精子的悬浮液的形式(例如上面关于样本收集和稀释描述的精子悬浮液)被引入到着色混合物中。
染料可采用纯固体或者液体成分的形式。染料也可被溶解或者分散在未缓冲的液体中以形成染料溶液。或者,染料可采用包括染料和与精细胞生理相容的缓冲剂或者缓冲溶液的染料悬浮液的形式。多种示例性的缓冲剂或者缓冲溶液是上面关于样本收集和稀释描述的。例如,在可用的缓冲剂中,一种是在pH为7.0的水中包括3%的TRIS基、2%的柠檬酸一水合物和1%的果糖的TCA缓冲溶液,或者一种在每25毫升的纯水中包括0.204g的NaHCO3、0.433g的KHCO3和0.473g的C6H8O7·H2O的基于碳酸盐的抑制剂溶液(水中包含0.097摩尔/升的NaHCO3、0.173摩尔/升的KHCO3和0.090摩尔/升的C6H8O7·H2O)。这样,例如,一种着色混合物可通过纯精子与染料结合而形成。或者,着色混合物可通过纯精子与缓冲剂或者缓冲溶液和染料结合而形成。另外,着色混合物可通过精子悬浮液与染料结合而形成。
如前面在美国专利US 5135759和WO 02/41906中描述的,可利用一种或者多种UV或者可见光激发的DNA选择性染料来形成着色混合物。示例性的UV光激发的选择性染料包括Hoechst 33342和Hoechst 33258,每一种都可从Sigma-Aldrich(St.Louis,MO)商业获得。示例性的可见光激发染料包括可从Molecular Probes,Inc.(Eugene,OR)商业获得的SYBR-14和在WO 02/41906中描述的bisbenzimide-BoDIPY_共轭物6-{[3-((2Z)-2-{[1-(二氟硼烷基)-3,5-二甲基-1H-吡咯-2-基]亚甲基}-2H-吡咯-5-基)丙醇]氨基}-N-[3-(甲基{3-[({4-[6-(4-甲基哌嗪-1-基)-1H,3′H-2,5′-二苯并咪唑-2′-基]苯氧基}乙酰基)氨基]丙基}氨基)丙基]乙酰胺(“BBC”)。这些染料中的每一种可单独使用或者结合使用;或者,可单独使用或者与上述染料结合使用其它细胞渗透UV和可见光激发染料,只要在以这里所述的能够分拣的浓度使用时染料不对精细胞的生存力产生达到不可接受的程度的不良影响即可。
DNA选择性染料在着色混合物中的优选浓度是包括细胞相对于所选择的染料的渗透性、着色混合物的温度、允许着色发生的时间和在后续的分拣步骤中所需的浓缩程度的多个变量的函数。一般地,染料浓度优选在不对精子的生存力产生很大的不良影响的情况下在相当短的时间内达到所需的着色程度。例如,Hoechst 33342、Hoechst 33258、SYBR-14和BBC在着色混合物中的浓度通常在0.1μM至1.0M之间,优选在0.1μM至700μM之间,优选在100μM至200μM之间。因此,在一组着色条件下,Hoechst 33342的浓度优选为100μM。在另一组着色条件下,Hoechst 33342的浓度优选为150μM。在另一组着色条件下,浓度优选为200μM。
除了缓冲剂以外,其它添加剂可被包括在着色混合物中以增强精子的生存力或者游动性;这些添加剂可作为精子源、染料源的一部分被提供或者相对于着色混合物单独提供。这样的添加剂包括能量源、抗生素、在细胞内和/或细胞外调节氧化/还原反应的组分和精液浆,前三种是上面关于样本收集和稀释描述的,最后一种是下面关于收集流体描述的。这样的添加剂可在这里所涉及的着色技术过程中被加入。
特别是,已经观察到,在着色混合物中加入在细胞内和/或细胞外调节氧化/还原反应的组分可有助于在高的着色温度下、在高的染料浓度下、在长的着色时间内或者它们的组合下保持精子的生存力。这些成分的示例和它们的使用参照上面关于缓冲剂和稀释剂的描述。这些成分可在这里所涉及的着色技术过程中被加入。
着色混合物可被保持在任何温度范围内;通常,范围在4至50℃之间。例如,着色混合物可被保持在“较低”的温度下,即4至30℃之间的温度下;在该实施例中,温度优选在20至30℃之间、温度优选在25至30℃之间,优选为28℃。或者,着色混合物可被保持在“中间”的温度范围内,即30至39℃之间的温度下;在该实施例中,温度优选在34至39℃之间、优选为37℃。另外,着色混合物可被保持在“较高”的温范围内下,即40至50℃之间的温度下;在该实施例中,温度优选在40至45℃之间、温度优选在40至43℃之间,优选为41℃。优选温度的选择通常取决于多个变量,例如包括细胞相对于所用的染料的渗透性、染料在着色混合物中的浓度、细胞被保持在着色混合物中的时间和在分拣步骤中所需的浓缩的程度。
使得精细胞在着色混合物中摄取染料持续足以达到DNA着色的所需程度的时间。该时间通常是染料足以粘合精细胞的DNA以使带有X和Y染色体的精细胞可基于它们之间的不同的和可测量的荧光强度被分拣的时间。通常,该时间不大于160分钟、优选不大于90分钟、优选不大于60分钟、优选在5分钟至40分钟之间。
因此,在一个实施例中,形成浓度在100μM至200μM之间的包括精细胞和染料的着色混合物,并且着色混合物在41℃的温度下保持一段时间。在另一个实施例中,着色混合物还包括浓度为10mM的丙酮酸盐、浓度为100μM的维生素K和浓度为1mM的硫辛酸。
在另一个实施例中,形成浓度在100μM至200μM之间的包括精细胞和染料的着色混合物,并且着色混合物在28℃的温度下保持一段时间。在另一个实施例中,着色混合物还包括浓度为10mM的丙酮酸盐、浓度为100μM的维生素K和浓度为1mM的硫辛酸。
在另一个实施例中,形成浓度在100μM至200μM之间的包括精细胞和在每25毫升的纯水中包括0.204g的NaHCO3、0.433g的KHCO3和0.473g(水中包含0.097摩尔/升的NaHCO3、0.173摩尔/升的KHCO3和0.090摩尔/升的C6H8O7·H2O)的新陈代谢抑制剂的着色混合物,并且着色混合物在28℃的温度下保持一段时间。在另一个实施例中,着色混合物在41℃的温度下保持一段时间。
鞘流体
为了分拣精细胞,着色的细胞作为样本流体被引入到下面描述的流式细胞计的喷嘴中。作为程序的一部分,样本流体通常被鞘流体包围。鞘流体使得样本流体中的精细胞被抽成下面描述的一个列。利用流式细胞计的收集系统使得鞘流体和精细胞一起被收集,从而形成精细胞的分拣后环境的一部分。这样,优选在细胞和鞘流体接触后鞘流体为细胞提供保护效果。
鞘流体通常包括缓冲剂或者缓冲溶液。可用于鞘流体中的缓冲剂或者缓冲溶液的示例和它们的说明性浓度如上面参照样本收集和稀释描述的。在一个特定的实施例中,鞘流体包括在pH值为7.0的水中的0.96%的Dulbecco′s磷酸盐缓冲盐(w/v),0.1%的BSA(w/v)。
或者,鞘流体也可包含多种有益于精子生存力和游动性的添加剂。这样的添加剂例如包括能量源、蛋白质源、抗生素、在细胞内和/或细胞外调节氧化/还原反应的组分、备选的蛋白质源和聚乙烯醇。这些添加剂的每一种和它们的示例如上面参照样本收集和稀释描述的。依照其,这样的添加剂可被加入到鞘流体中。
在分拣步骤前,鞘流体也可被过滤。可存在于鞘流体中的杂质,诸如不可溶解的颗粒,可干扰分拣。因此,在其被引入到流式细胞计中之前鞘流体可被过滤。这样的过滤器及其使用方法在本领域是公知的。通常,过滤器是0.1微米至0.5微米的薄膜,优选为0.2微米至0.3微米,优选为0.2微米。
着色的细胞可在着色后的任何时间被引入到鞘流体中。通常,在样本流体中的着色细胞流在流式细胞计的喷嘴内被注入到鞘流体流中。开始,由于下面详细描述的流体层流的缘故,样本流体与鞘流体基本没有接触。优选,样本流体和鞘流体基本保持间断流直至样本流体中的颗粒(例如着色的精细胞)已经被分析。但是,在一些地点,样本流体与鞘流体相互接触。例如在液滴分拣流式细胞计(下面描述的)中,当液滴在询问位置下游形成时鞘流体和样本流体开始相互接触。
在引入着色的细胞和鞘流体时,着色的细胞和鞘流体可在4至50℃的温度下。鞘流体和着色的细胞可处于相同或者不同的温度,其中一个的温度高于另一个。因此,在一个实施例中,在引入着色的细胞和鞘流体时,鞘流体和着色的细胞处于相同的温度;例如,在“较低”温度下,例如5℃至8℃;或者在“中间”温度下,例如25℃至30℃;在“较高”温度下,例如40℃至43℃。在另一个实施例中,着色的细胞的温度高于鞘流体,诸如,细胞在40℃至43℃之间,鞘流体在室温下或者5℃。在另一个实施例中,着色的细胞的温度低于鞘流体。
流式细胞计
本发明的一个实施例在流式细胞计中使用创造性的技术以分析和分拣精细胞。现参见图2和3,本发明的流式细胞术系统的一个实施例整体用附图标记1表示。如图中所示,流式细胞术系统1用于根据所选择的特征分类和分拣颗粒,诸如精细胞。一般地,系统1包括包含待分拣的颗粒的载流体17的供给3、鞘流体19的供给7、用附图标记9表示的具有分拣能力的流式细胞术设备和用于在压力下将载流体17和鞘流体19从供自的供给3、7输送到流式细胞术设备9的流体输送系统15。流式细胞术设备9适于接收载流体17和鞘流体19以使得载流体17和鞘流体19结合形成加压流体流21以将带有颗粒的流21引导通过聚焦的电磁辐射束25(例如,UV激光),以及分析由通过聚焦束25的颗粒发出的电磁辐射31(例如,荧光)。设备9还用于将流21分裂成包含待评估的颗粒的液滴33以及根据包含在液滴33中的颗粒的一个或者多个特征基于上述测量分拣液滴33。尽管本发明可用于分析优选分拣任何类型的颗粒,但是它特别适用于根据细胞的一个或者多个所需特征(例如,尺寸、DNA含量、形状、密度、基因排序等)分拣细胞。本发明特别适用于分拣动物饲养业商用的动物精细胞以用于体内或者体外人工受精,如下面详细描述的。
单通道分拣设备和方法
流式细胞术设备
图3中所示的流式细胞术设备9包括喷嘴系统101,喷嘴系统101用于在压力下将包含颗粒(例如着色的精细胞)的流体流21输送通过喷嘴孔103,并且细胞基本排成一列,对于精细胞,精细胞的不对称头部基本在将描述的所需取向上。如在常规的流式细胞术液滴分拣系统中,与喷嘴孔103相对地设置换能器105以将声能引入流体流21中,使得流21在与喷嘴孔103间隔的“液滴分裂”位置107处分裂成包含各个细胞的液滴33。系统1还包括光学系统109,光学系统109用于使得电磁辐射束25(例如,350-700纳米UV或者可见激光)在“询问”位置115处聚焦在流体流21上,在所述实施例中,询问位置105在喷嘴孔103和液滴分裂位置107之间。这样,所述实施例是一种空气中喷射系统。在其它实施例中,询问位置107可在喷嘴孔103内或者在孔103上游。在任何情况下,细胞适于在询问位置107处穿过光束25,激发细胞中的化学着色剂(或者其它报告的介质)以形成波长不同于束25的荧光发射31(例如,如果照射光25的波长为350-370纳米,荧光发射31的波长可为460纳米)。光检测器117可检测这些发射31以及将它们转变为电信号,所述电信号被处理并且用于根据所选择的特征(诸如精细胞的X/Y染色体含量)对细胞进行分类。流式细胞术设备9还包括分拣系统119和收集系统2201(图2),分拣系统119用于根据包含在液滴33中的细胞的分类将液滴33分拣成不同的组或者群组(例如,两个群组123、125),收集系统2201用于收集液滴33和保持不同群组123、125的分离。
系统的操作受到处理器131的控制,诸如微处理器或者其它数字或者模拟控制和/或处理器或者它们的组合,处理器131以将描述的一种方式控制系统1的部件的各种功能。重要的是,处理器131还响应于颗粒分析信息以基于包括不同参数的所选择的控制和分拣策略控制控制系统1的输出,包括其中一个被分拣的颗粒群组的所需纯度、与在一个或者多个其它群组中的所需颗粒的量(或者百分比)相比的在其中一个群组中的所需颗粒的可接受的量(或者百分比),和后面将描述的其它参数。
下面详细描述系统1的各个部件。
喷嘴系统
参见图4和图5,在一个实施例中,喷嘴系统101包括通过其的具有中心纵向孔135的基本圆柱形流动主体133和在流动主体133上的具有漏斗形喷嘴主体139的喷嘴137。通道141与流动主体133中的孔135同轴地贯穿喷嘴主体139和在喷嘴137的前端处终止于上述喷嘴孔103。喷嘴主体139在其后端处具有带内螺纹的沉孔145以螺纹地接收在流动主体133的前端处的螺纹突起或者螺柱149以可拆卸地使得喷嘴137和流动主体133相连,该连接被O形密封件155密封。应该理解的是,喷嘴可以其它方式以可拆卸的方式与流动主体相连,或者部件可整体地形成一体。
利用同轴地位于流动主体133的孔135中的导管157将颗粒输送到喷嘴137。导管157的外径小于孔135的内径以使环形空间167形成在导管157周围。在一个特定实施例中,导管157是管状针(例如,内径为0.01英寸的16-ga.针),导管157具有延伸到在喷嘴后部的沉孔145中的前端。导管157的后端与流体输送系统15相连以将载流体15(例如,包含精细胞的着色混合物)输送到导管157。围绕导管157的环形空间167通过流动主体133中的径向孔173与流体输送系统15相连以将鞘流体19输送到环形空间167中。如图3和图5中所示,可选择的第二径向孔183可设置在流动主体133中以使得环形空间167与另一个管线(未示出)相连以将附加的鞘流体19供给到喷嘴137中。
如在常规流式细胞术设备中,鞘流体19被引入到包围导管157的环形空间167中。当鞘流体19流过导管157的尖端时的速度远高于离开导管157的载流体17的速度,以使载流体17和包含在其中的细胞(例如,精细胞)被朝向喷嘴137的孔103的鞘流体19加速。该加速用于在基本一列布置中将细胞分隔以由光学系统109进行单独分析。鞘流体19包围载流体17,产生具有载流体17的中心芯189和包围中心芯189的鞘流体19的外同轴鞘191的流体流121(见图6)。流式细胞术领域的技术人员应该理解的是,中心芯189的层流和液压力集中趋于将颗粒限定在芯189,基本不与喷嘴137中的鞘流体19和载流体17混合。另外,当流21移动通过喷嘴系统101时,中心芯189基本完整地保持在鞘191内,直至液滴33形成在分裂位置107处时。这种类型的同轴流动特别适于流式细胞术,这是因为待分析的颗粒被限制在流中的较窄芯部189内。因此,聚焦在流21的中心或者芯部189上的光束25将照射颗粒以使它们可基本以一次一个的方式被分析。用于将芯189限制在足够窄的直径内,因此人们可获得在芯流体189中的更均匀的颗粒照射。为了达到良好的分析效果,包含颗粒的芯的直径优选在7至20微米的范围内,优选在7至14微米的范围内。可通过相对于鞘流体19的输送速度调节载流体17的输送速度来增大或者减小芯流189的直径。
细胞取向
为了使得分析结果达到最佳,优选在具有不对称形状的颗粒穿过来自于光学系统的光束时使得它们处于所需的取向。如本领域技术人员已知的,来自于不对称颗粒的荧光发射趋于各向异性(即,发射的强度在所有方向上是不均匀的)。这里所用的术语“所需取向”指的是使得处理系统识别具有不同特征的细胞的准确率在70%至100%的范围内、优选在80%至100%的范围内、优选在90%至100%的范围内,优选为95%或者更大的取向。
为了说明这个方面,牛精细胞201被示出在图6和图7中。通常,细胞具有桨状头部205和在头部205中的包含细胞的染色体DNA物质的核213以及从头部205延伸的尾部215,桨状头部205具有较平宽的相对表面207和窄边209,尾部215提供有效受精所需的游动性。平均牛精细胞201的头部长度219为8微米,头部宽度221为4微米,从头部前部到尾端的总长为100微米。在平均牛精细胞201中,核213占据头部体积的大部分并且仅略微小于精子头部205。这样,核长度217基本等于头部长度219,长度也为8微米。已经观察到,在牛中,精细胞201的X/Y染色体位于核中的在头部205的纵向中线或者赤道或者中心下方并且紧相邻的区域225(图6)中。特别是,该赤道下的区域225在核213的下半部(朝向尾部215)上延伸不大于核长度217的20%,优选在核213的下半部上延伸不大于核长度217的10-15%,优选在核213的赤道下面延伸不大于1.0-1.5微米。
当精细胞穿过激发束25时,优选细胞基本成一列并且每一个细胞201的头部205基本为类似取向以减小细胞和细胞之间的取向差异,从而提供更均匀的细胞测量。还希望,细胞具有能够在X和Y细胞之间进行准确区分的取向。优选,该取向是这样一个取向,即,其中精细胞201的长度基本对准流体流227的方向(头前端(图6所示)或者头部末端)并且精细胞201的头部205在其纵向轴线上转动以使头部205落入其中来自于光学系统109的光束25将照射细胞201的宽面(一般为宽侧)(如图7中示意性示出的)而不是细胞的窄边209的具有角度的包络面229内的取向。优选,限定所需取向的包络面229是由精细胞201相对于基本垂直于入射光束25的平面P转过角度范围R1形成的,如在穿过流21横向截得的横截面中看到的。范围R1优选为0-90度,优选为0-60度,优选为0-30度。本发明的喷嘴能够以高达90%或者更高的准确度到达所需取向。
精子取向的容限(即,由角度范围R1限定的包络面229的尺寸)与用于收集来自于精细胞的荧光发射的透镜的数值孔径有关。在图7中所示的实施例中,例如,光学系统109具有由55度的立体角限定的荧光发射31检测量579。当在精子移动通过束25时精子头部205的转动取向在由R1限定的包络面229外时,来自于精子头部205的边缘209的较强的荧光发射31被光学系统109收集,防止处理器131将荧光发射31的强度与精细胞201的X/Y染色体含量联系起来。但是,只要在精子通过询问位置115时其头部205的转动取向在包络面229内,光学系统109就不收集来自于精子头部205的窄边209的较强的荧光发射31。这样,在图7中所示的实施例中,只要精子头部205的窄边209被限制在角度R1内,那么精细胞的取向不导致较强的沿边荧光发射的收集。可利用具有减小数值孔径的透镜来减小收集量579的立体角,从而增大角度R1和取向差的精子的容限。但是这也减小了可被光学系统109收集的光子量,这可通过减小被光检测器检测的发射31的强度影响荧光发射31的测量。同样,如果光学系统109利用高数值孔径的透镜收集荧光发射31以获得被光检测器检测的荧光发射的较强的强度,接着精子取向的容限减小。这样,在设计本发明的系统中,人们需要在精子取向的容限和数值透镜孔径之间权衡利弊。最佳的平衡取决于取向能力和系统的光学敏感性。在一个希望的实施例中,例如,使用数值孔径为0.65的透镜。
喷嘴设计
在一个实施例中,如图8和图9中所示,在沉孔145的下游的喷嘴主体139的内部231具有内表面233,所述内表面233包括第一、第二和第三轴向锥形区域235、237、239以在朝向喷嘴孔103的下游方向上逐渐提高流体流21的速度。如上所述,该加速用于分隔流21中的颗粒(例如细胞),使得它们呈现一种单列形式,从而它们基本可被一次一个颗粒的形式被分析。这些区域的至少两个,并且优选所有三个235、237、239在相对于喷嘴137的纵向轴线247成直角截得的横截面中基本为椭圆形(卵形),如图9A-9H和图9J-9K所示。喷嘴主体139的内表面233还具有在头三个区域235、237、239下游并且就在喷嘴孔103的上游的非锥形的第四区域249,在一个实施例中,第四区域249形成在固定于喷嘴主体139前部的沉孔257中的单独孔元件255中。在一个实施例中,第一区域235和第二区域237的基本椭圆形的横截面形状以基本相同的方向取向以限定第一扭转区域259,并且构成第二扭转区域261的第三区域239的基本椭圆形的横截面形状以相对于第一区域235和第二区域237的基本椭圆形的横截面形状成一定角度(例如90度)取向。该取向使得喷嘴主体139的内表面233在流体流21上施加扭力,从而当精细胞201通过喷嘴孔103时使得精细胞201定向于上述所需取向。优选,第一扭转区域259具有3.0-4.5毫米的轴向长度273、优选为3.6毫米,并且构成区域259的第一锥形区域235和第二锥形区域237具有基本相等的轴向长度275、277(例如1.8毫米)。第二扭转区域261具有3.0-5.0毫米的轴向长度279、优选为4.45毫米。第四区域249优选基本为圆柱形。在第一区域235、第二区域237和第三区域239的边界处的每一个横截面形状基本为椭圆形A-D(图8)具有长轴直径和短轴直径,图8和下面的表1中示出它们的示例性尺寸。
表1
  椭圆   长轴直径(毫米)   短轴直径(毫米)   比率
  A   7.0   6.0   1.2
  B   6.1   5.3   1.15
  C   2.1   2.1   1
  D   0.9   0.2   1.45
应该理解的是,上述尺寸是示例性的,并且其它尺寸和形状也是可以的。功能上,长轴直径和短轴直径之间的比率变化和区域的椭圆形的不同取向产生作用在每一个细胞201上和施加可使得细胞201在其纵向轴线上转动的扭力271的侧作用力,从而使得其宽面207与第一扭转区域259中的短轴对准以及当细胞适度扭曲(例如90度)与第二扭转区域261中的短轴对准。锥形表面235、237、239中的每一个还用于使得流过喷嘴101的流21(和细胞)加速。在一个实施例中,在第一区域235和第三区域239中平缓加速以及在第二区域237中迅速加速。例如,第一区域235的锥度可在11-14度的范围内;第二区域237的锥度可在42-48度的范围内;以及第三区域239的锥度可在8-12度的范围内。喷嘴主体139是由诸如模制塑性(ABS)或者金属的适合材料形成的。
孔元件255(图8)优选由硬的、耐磨材料制成,诸如蓝宝石,它可以精确尺寸被机加工或者成型。在一个实施例中,孔元件255本身具有基本为圆形横截面的圆锥形上游表面309,其直径从0.92毫米减小到0.060毫米并且具有0.54毫米的轴向长度317和39度的锥角。孔元件255还具有基本为圆柱形的下游表面315,其直径为0.060毫米并且轴向长度327为0.36毫米。这些尺寸仅是示例性的,应该理解的是,孔元件255可具有其它的尺寸和形状。例如,上游表面309的横截面形状可基本为椭圆形(卵形),在喷嘴137的下游端处的孔103的直径可在40至100微米或者更大的范围。优选,孔103的尺寸是这样的,即,使得离开喷嘴101的细胞在流21的芯189内基本为单列形式并且基本在所需取向,如上所述。例如,对于精细胞,在下游端处具有60-62微米的直径的孔103已经被发现是适合的。优选,喷嘴孔103用于使得流21进一步加速和设定流21的形状和尺寸以使得细胞分隔、细胞取向和液滴33形成达到最佳,如下面将描述的。
当细胞离开喷嘴137时的速度将取决于各个因素,包括鞘流体19被引入到喷嘴系统101中的压力。在压力为20psi时,当基本为圆柱形的流21包含基本类似地取向在流21的芯189处的细胞时,细胞将以16.6m/s的速度离开上述实施例的喷嘴孔103。在鞘压力为30psi时,细胞速度将为20.3m/s。在鞘流体19的压力不同的情况下,流21的速度将改变。
芯流到扭转区域的引入
可通过改变流体流21通过取向喷嘴的流动可获得颗粒的改善取向以使包含待取向的颗粒(例如,精细胞)的芯流189沿着流动路径被引导,所述流动路径的至少一部分偏离喷嘴中心以使颗粒经受由喷嘴产生的液体动力取向力同时它们处于偏离喷嘴中心的位置。沿着偏离的流动路径引导芯流189还可改善颗粒在常规喷嘴(即,没有任何扭转区域的喷嘴)中的取向。在许多喷嘴中,人们可确定一个已知位置偏离喷嘴的中心,这是因为它从喷嘴的纵向轴线移动。人们也可认识到,特定位置偏离喷嘴的中心,这是因为它从流体流流过的喷嘴的横截面的几何中心移动。
多个技术可用于沿着偏离喷嘴中心的流动路径引导芯流189。例如,取向挡板可位于喷嘴中以使得芯流偏转到喷嘴的一侧。类似地,用于引导包含样本颗粒的芯流189的导管157可从喷嘴的常规中心重新定位到偏离位置。另外,可以预见的是,偏离样本导管157可与取向挡板结合使用。取向挡板的使用和偏离样本导管的使用的实施例如下面描述的。
利用取向挡板和/或偏离样本导管157达到的颗粒(例如精细胞)的改进取向可取决于多个因素。一个因素是,芯流189的偏转和/或流动区域的横截面的尺寸和形状导致趋于定向不对称颗粒的液压动力的施加(Kachel,et al.Histochemistry and Cytochemistry,25(7):774-80(1977))。另一个因素是,已经发现不对称颗粒(特别是精细胞)当它们在流体流中流动时趋于接近固体表面取向。这样,通过引导芯流189以使其接近喷嘴的内表面或者挡板表面,人们可获得颗粒的改进取向。另外,挡板和/或偏离样本导管可与在不对称颗粒上施加附加的取向力(例如,扭转力)的取向喷嘴结合使用。在该情况下,挡板可操作以引导流体流以使包含待取向的颗粒的芯流沿着偏离喷嘴中心的路径流动同时颗粒经受由一个或者多个扭转区域产生的扭力。
定向挡板
图10-13示出一个位于上述取向喷嘴137中的示例性取向挡板2001。但是,挡板2001可在不脱离本发明的保护范围的基础上与不同的喷嘴结合使用,包括非取向喷嘴。挡板2001位于喷嘴中在孔103的上游和样本注射针157的下游。参见图14和15,挡板包括被挡板支架2005定位的挡板2003。在所示的实施例中,挡板2003基本为L形并且由基本刚性、耐用的和耐腐蚀材料构成(例如不锈钢)。L形板2003具有上游支腿2007和下游支腿2009,优选上游支腿2007和下游支腿2009基本相互垂直(例如在5度的垂直度以内)。在该图中所示的示例性实施例中,L形板2003的两个支腿2007、2009在垂直于喷嘴的137的纵向轴线2017的线2015处相交。如图14中所示,交线2015与挡板支架2005的纵向轴线2057分隔短的距离2033(例如约0.3毫米)。L形板2003的上游支腿2007从远离喷嘴137的纵向轴线2017的交线2015一直延伸到挡板支架2005的边缘,如图15中所示。这样,上游支腿2007形成有紧密匹配挡板支架2005的形状的弯曲边缘2019。如图14中所示,上游支腿2007以与垂直于挡板支架2005的纵向轴线2057的方向成15-25度的角度AA倾斜。L形板2003的下游支腿2009以在与垂直于挡板支架2005的纵向轴线2057的方向成60-80度的范围内的角度BB从两个支腿2007、2009的交线2015向下游延伸约2.0-2.5毫米的距离2025。
挡板支架2005的尺寸和形状适于安装在喷嘴137内,如图10-13中所示。挡板支架2005优选由可模制的材料(例如,聚丙烯)制成,尽管在本发明的保护范围内,挡板支架2005可由其它材料构成。如图14和15中所示,在该实施例中所用的挡板支架2005基本被形成为总长度2027为4.0-4.5毫米的中空圆柱形壳。挡板支架2005具有约5-6毫米的外径2029和约2.5-3.5毫米的内径2031。如果挡板支架2005将被模制,微小斜度(未示出)可被提供在支架2005的表面上(例如,以使得挡板支架容易从注射模制机器取出)。示例性挡板支架2005的上游端2035具有以与L形板2003的上游支腿2007相同的角度AA倾斜的倾斜表面2037。L形板2003的上游支腿2007抵靠挡板支架2005的倾斜表面2037并且被其支承。L形板2003的下游支腿2009的侧边2039(图15)被部分埋(例如被接收在槽中)在挡板支架2005中以将挡板2003固定在下游支腿2009基本从挡板支架2005的一边跨到另一边的位置。在该实施例中的下游支腿2009的下游边缘2041形成基本垂直于挡板支架2057的纵向轴线的直线。在下游支腿2009的下游边缘2041和挡板支架2005的内部圆柱形表面2051之间具有间隙2049(图14)。间隙2049提供由L形板2003的支腿2007、2009和挡板支架2003的内部圆柱形表面2051限定的体积2053和喷嘴137的内部体积2055的其余部分之间的连通。
挡板支架2005优选位于喷嘴内,并且挡板支架2005的纵向轴线2057基本与喷嘴137的纵向轴线2017对准以使其将L形板2003固定在上述位置。优选,示例性挡板2003转动取向以使板2003的两个支腿2007、2009的交线2015平行于穿过椭圆D的长轴延伸的线2059,如图16中所示。但是,当L形板2003的两个支腿2007、2009的交线2015垂直于穿过椭圆D的长轴延伸的线2059(如图17中所示)时,示例性挡板2001也能够很好地发挥作用。另外,在不脱离本发明的保护范围的情况下,挡板可具有任何转动取向。如图12中所示,在该实施例中的样本注射针157优选在挡板2001的最上游部分2035的上游与其保持约0.25-1.0毫米的距离2061。优选,样本注射针157优选在挡板2001的最上游部分2035的上游与其保持约0.55-0.65毫米的距离。
挡板支架2005可以多种方式相对于喷嘴被固定在所需位置。参见图14,挡板支架2005的下游端2067是阶梯形的以使其在喷嘴137中安装在更远的下游处。支架2005的阶梯形下游端2067为圆形并且抵靠喷嘴137的椭圆形内表面233。这样,在喷嘴137的内表面233和挡板支架2005之间的接触基本被限制于两个点2069,如图13中所示。一对O形圈2071在喷嘴137和流动主体133的螺纹突起149之间围绕挡板支架2005(图11-13)并且密封喷嘴系统101防止其泄漏。O形圈2071可由Viton_制成,或者由任何其它类似的材料制成。当喷嘴137被拧在螺纹突起149上时,两个O形圈2071被压缩以提供流体密封。在该实施例中使用两个O形圈2071,因为由于挡板支架2005的长度2027而使得一个O形圈不能被压缩在喷嘴137和流动主体133之间的空间内。在不脱离本发明的保护范围的基础上,任何数量的O形圈或者不同类型的密封可被使用,只要O形圈的数量和其它类型的密封被选择以便当喷嘴137被拧在流动主体133上时具有流体密封即可。这将取决于多个因素,包括喷嘴137、流动主体133、挡板支架2005和O形圈2071的尺寸和形状以及密封的类型。O形圈2071还有助于将挡板支架2005固定在所需位置。O形圈2071占据挡板支架2005周围的空间,从而限制挡板支架2005在喷嘴137内左右移动。在O形圈2071和挡板支架2005之间的摩擦力还抵抗挡板支架2005的转动。
如图12中所示,当喷嘴137被固定在流动主体133上时,在本实施例中,螺纹突起149相对于流动主体133的下游端2077采用凸台的形式,下游端2077基本与挡板2001的最上游部分2035平齐。从而,使得挡板支架2005在流动主体133(在挡板支架2005的上游端2035处)和喷嘴137的内表面233(在挡板支架2005的下游端2067处)之间被轴向限制。可使用其它保持机构。在该图中所示的实施例中,在螺纹突起149的下游端处的凸台2079的内径(图12)基本与挡板支架2005的内径2031相等。
本领域技术人员应该理解的是,尽管具有挡板2001,但通过喷嘴系统101的流仍然保持层流,这是因为流体流过的小的横截区域对于所述流产生低雷诺数。如图11中所示,挡板使得芯流189和鞘流191偏离喷嘴137的中心纵向轴线2017并且朝向喷嘴137的内表面233偏转。在一个实施例中,当芯流189在第一扭转区域259和第二扭转区域261之间的过渡部分之间通过时,芯流189还很靠近喷嘴137的内表面233流动。但是,鞘流体流191的一部分2081保持在芯流189和喷嘴137的内表面233之间,因此在芯流189中的颗粒实际上不冲击或者接触喷嘴137的内表面233。在喷嘴137的更远下游,液体动力将芯流189朝向喷嘴137的中心推回(例如,与喷嘴137的纵向轴线2017对准)。
参见图18A-18E,挡板2001改变形状和减小喷嘴137中的流动横截区域的尺寸。(为了清楚起见,图18A-18E未示出挡板下游的任何喷嘴结构。在图18A-18E的每一个中的流动区域用粗体描绘轮廓以清楚示出)。在挡板2001上游(图18A),流动横截区域2087基本为圆形或者椭圆形。在挡板2001的上游端2035,流动区域开始从圆形变化到在挡板2003的支腿2007、2009的交线2015处的基本为半圆形的形状2089(图1B),尽管其它形状可是适合的。横截流动区域2089小于挡板上游的流动区域2087。图18C示出当流体流过挡板支架2005的一部分时的流动区域2091,图18D示出在挡板2003的下游支腿2009的下游端2041的更远下游的流动区域2093。可以观察到,由于挡板2003的下游支腿2009的角度定向,流动区域2093略微大于流动区域2091。在挡板2003下游(图18E)的通过挡板的流动区域2094对应于挡板支架2005的内表面2051的形状,它在所示实施例中是圆形的。(其它形状可是适合的)。在挡板支架2005的下游,喷嘴137的扭转区域259、261优选提供上述扭力。
如图11中所示,可以观察的是,一个或者多个气泡2095可被捕获在L形板2003的下游支腿2009和挡板支架2005之间的体积2053中。另外,气泡2095的一部分可延伸通过在下游支腿2009的边缘2041和挡板支架2005之间的间隙2049。这样,气泡2095可占据L形板2003的下游支腿2009下游的横截流动区域的一部分,可能影响流体通过喷嘴137的流动。已经发现,示例性挡板2001在具有和没有气泡2095的情况下都能很好工作。这样,在不脱离本发明的保护范围的情况下,在不带入任何气泡的情况下,挡板可用于定向精细胞。
图19和20中示出另一个示例性取向挡板2097。挡板2097包括在上述取向喷嘴137中的平的基本为半圆形的挡板2099。挡板2099位于喷嘴137中在样本导管157的下游并且基本垂直于喷嘴137的纵向轴线2017。挡板2099具有基本匹配喷嘴137的内表面233的曲率的弯曲边缘2101,从而在挡板2099的弯曲边缘2101和喷嘴137的内表面233之间没有大的间隙。挡板2099还具有经过喷嘴137的纵向轴线2017延伸一小段距离的直边2103以使其基本与样本导管157的外径2109对准。利用挡板2099在类似于以上参照L形挡板2001描述的O形密封件2071类似的O形密封件2105和形成在喷嘴137内部的环形台肩或者支架2107之间的压缩形成的摩擦来使得挡板2099定位。如图19中所示,通过偏转流体流来操作取向挡板2099以使包含待取向的颗粒的芯流189沿着其流动路径的一部分偏离喷嘴137的中心纵向轴线2017。例如,当芯流189流过第一扭转区域259以及第二扭转区域261的至少一部分时可沿着偏离喷嘴137的中心纵向轴线2017的流动路径引导芯流189。因此,颗粒(例如精细胞)经受由扭转区域259、261产生的扭力同时它们处于偏离喷嘴137的中心纵向轴线2017的位置。
本领域技术人员应该理解的是,可在不脱离本发明的保护范围的基础上对上述示例性挡板2001、2009进行大的改变。所需要的是,挡板被构造以使得芯流189和鞘流191朝向喷嘴的内表面偏转或者使得芯流189和鞘流191流过尺寸和/或形状发生改变的横截面区域。另外,应该理解的是,在不脱离本发明的保护范围的基础上,取向挡板结构可与喷嘴整体形成或者与喷嘴和流动主体整体形成。
偏置的样本导管
可通过使得样本导管157从其在喷嘴137的中心处的常规位置重新设置到一个偏置的位置可使得芯流189沿着偏离喷嘴137的中心纵向轴线2017的流动路径被引导。例如,图21示出具有偏置样本导管157的一种示例性偏置样本引导喷嘴系统2151。除上述内容以外,喷嘴系统2151基本与图4和图5中所示的喷嘴系统101相同。最大的差异在于,样本导管157已经被移离喷嘴137的中心以使其不再与喷嘴的纵向轴线2017对准。这样,芯流189沿着偏离纵向轴线2017的流动路径被引导到取向喷嘴137的扭转区域259、261中。尽管图21中所示的示例性喷嘴系统2151使用了上述示例性取向喷嘴137,可以预见到,偏置样本导管157以可与不同取向的喷嘴或者非取向喷嘴结合使用以使得在芯流189中的颗粒定向。
喷嘴安装和调节
利用喷嘴座331以一种选择的取向和位置安装流动主体133和喷嘴137。在一个实施例中(图22),座331包括多个级,包括分别沿着X和Y轴339、341提供流动主体133和喷嘴137的线性调节的第一和第二线性级333、337和围绕对应于流动主体133和喷嘴137的纵向轴线2017的Z轴345提供转动调节的第三转动级343。这些级333、337、343在设计上可是常规的,适合的级可在商业上得到,例如从Newport Corporation of Irvine CA获得。特别是,第一线性运动级333包括安装在框架349上的固定第一级元件(未示出)、可沿着X轴339在固定的第一级元件上滑动的可动第一级元件355以及用于精确地将可动第一级元件355移动到选择的X轴线位置的致动器357(例如测微计)。第二线性运动级337包括安装在可动第一级元件355上的固定第二级元件359、可沿着Y轴341在固定的第二级元件359上滑动的可动第二级元件361以及用于精确地将可动第二级元件361移动到选择的X轴线位置的致动器363(例如测微计)。转动(第三)级343包括安装在可动第二级元件316上的固定的第三级元件365,转动地安装在固定的第三级元件365上以围绕Z轴345转动的可动的第三级元件371和用于精确地使得可动第三级元件371相对于Z轴345转动到所选择的角位置的致动器373(例如测微计)。利用这些级333、337、343提供的三轴调节使得喷嘴137和离开喷嘴孔103的流体流21相对于光学系统109精确定位。喷嘴137围绕Z轴345转动是特别有益的,这是因为它能够使得离开喷嘴137的流21转动以将被喷嘴137定向的细胞(例如,精细胞)带到其中来自于光学系统109的光束25将落在细胞的所需表面上(例如,精子头部205的平面207)的位置,如图23中所示。其它喷嘴座可是适合的。例如,4轴喷嘴安装系统也可被使用,提供沿着X、Y和Z轴的线性调节和沿着Z轴的转动调节。另外,优选使用一个或者多个具有自动对准特征的级,诸如伺服或者步进马达控制微型平移级(例如,Polytech PI,Inc.of Aubum,Michigan的部件号M-110.2DG)。
在图36中所示的实施例中,例如,喷嘴137取向以在基本向上的方向上引导包含待分析的流21。在流体流21的方向和水平方向之间的角度377优选在5至85度的范围内,优选在15至75度的范围内、优选在30至65度的范围内、优选在45至60度的范围内、优选在50至55度的范围内。该取向的优势在于,被俘获在喷嘴系统101中的任何空气容易被去除。另外,在液滴33的收集之前流体流21的速度在重力作用下逐渐减小。相信液滴33的逐渐减速不会对分析的细胞产生压力,对于精细胞,这可使得收集后的分拣精子的游动性较高。当然,在本发明的其它实施例中,喷嘴101被定位以当流体流21离开孔103时使流体流21具有基本向下的速度,这对于空气喷射细胞计数器是常规的。
非强制地,喷嘴系统101的部件,诸如流动主体133和喷嘴137,涂有不反射的不发射的材料(例如,当经受UV激光时不发光的阴暗油漆或者环氧树脂)以减小可能导致信号噪声或者对光学系统109产生其它不良影响的这些元件133、137的任何反射和/或发光。
换能器和液滴形成
在一个实施例中,用于将能量引入到流体流21中的换能器105包括包含固定在喷嘴系统101的流动主体133周围的压电元件(未示出)的套环379(图3-5)。换能器是常规设计的,诸如从Beckman Coulter,Inc.as part No.6858368得到的。换能器具有连接适合的声能源的端子383以使得能量可以将使其在距离喷嘴137下游保持距离d的液滴分裂位置107处分裂成液滴33的频率被输送到流体流21(图24)。流式细胞术领域技术人员应该理解的是,液滴形成的特征受到下列方程式1控制:
(V=fλ)                     式1
其中V是流21的速度;f是施加在通过喷嘴137的流体流21的频率;以及λ是“波长”或者液滴33之间的距离。流式细胞术的一个已知原理是,液滴33将以规则的形式形成,并且液滴33之间的距离是流21的直径的4.54倍。由于流21靠近喷嘴137的直径D对应于喷嘴孔103在其下游端的直径,因此可利用下列方程式2容易计算流21(和喷嘴137)必须被振动以形成液滴33的频率:
(f=V/4.54D)                      式2
换能器105可被操作以产生每秒30000-100000个液滴33。例如,换能器105可产生每秒50000-55000个液滴。假设频率是每秒55000个周期(55kHz),并且还假设在流21中的细胞浓度是这样的,即,细胞以基本每秒55000个细胞的匹配流量离开喷嘴137,接着平均每一个液滴具有一个细胞。(实际上,一些液滴33将不包含细胞,一些将包含一个细胞,一些将包含多于一个细胞)。当然,多种因素的任何一个可被被改变以改变该平均值,包括频率(f)、流21(孔103)尺寸(D)和流21速度(V)的变化。实际上,这些因素应该能够在处理过程中减小施加在细胞上的应力值,特别是对于保存游动性是重要的精细胞。
分裂传感器
参见图2,分裂传感器389可用于确定流21开始形成自由液滴33的位置(例如,分裂位置107)。分裂位置107将根据包括流21的速度、流体的表面张力和换能器105的振幅的几个因素改变。通过监测分裂位置107,换能器105的振幅可被改变以使得分裂位置107保持在给定的范围内以使每一个液滴33分裂的时间可被微处理器131更精确地预测。这使得微处理器131精确地控制液滴33的电荷,这可通过选择性地控制流21的电荷来完成。由于液滴33的电荷与就在液滴33形成之前的流21的电荷相同,因此微处理器131通过选择性地对流21充电来控制液滴33的分拣,如下面描述的。
概括地,分裂传感器与在分裂位置被分裂成液滴的任何连续流体流结合使用。(在图2的实施例中,分裂传感器389位于喷嘴137和向外位置115的下游。)图25中示意性地示出一个示例性分裂传感器389。光源393位于流21的一侧以在分裂位置107被保持的给定范围内照射流21。位于流21的另一侧的线性光敏元件阵列395适于沿着基本平行于流21的轴线被取向。因此,光敏元件阵列395检测穿过液滴33的来自于光源393的光和提供对应于检测光的输出信号。
输出信号被处理以确定分裂位置107的位置。例如,输出信号可被数字化并且被提供给处理器131以处理。或者,如图25中所示,光源393可是LED或者其它产生可见光谱的近红外部分的光源。在液滴33之间穿过的光被透镜401放大并且被引向8×1的线性光电二极管排395。每一光电二极管产生与照射在其上的光强度成正比的电流。该电流被供给到8个电流电压运算放大器电路405。运算放大器的输出电压是耦合在8个跟踪/保持放大器407中的AC。放大器所用的跟踪/保持信号409来自于换能器105。跟踪/保持放大器的输出被供给到微处理器单元(MPU)391的A/D转换器411中。MPU391计算的数值将被提供到系统控制微处理器131。系统控制微处理器131可使用查阅表和/或算法以在分裂位置107漂移和换能器105的电压调节之间转换。或者,MPU391的输出可是诸如具有对应于换能器105的振幅变化的振幅的DC电压的模拟信号。DC电压可被提供给驱动液滴换能器105的高压放大器以改变振幅。因此,这样一种处理器391将构成用于接收光敏元件阵列395的输出信号并且提供对应于分裂位置107的位置的位置信号的控制器。这样一种处理器391还构成用于接收表示液滴33的分裂位置107的位置的输出信号以及作为分裂位置107的位置的函数改变换能器105的操作的控制器。
或者,本领域技术人员公知的是,摄像机和闪光灯可用于监测和控制液滴分裂位置。这样,如图26-27中所示,摄像机系统412和闪光灯413可被提供以监测分裂位置107。优选将闪光灯413放置在障板414A(例如,具有缝隙形开口414B的盖)后面以限制进入光学系统109的由闪光灯413产生的光量(图27)。
外照射光学系统
光学系统109适于将电磁辐射束(例如激光束)25以束斑的形式聚焦在流体流21上,从而使得待分析的细胞穿过束斑。束25可是在光谱的可见光或者紫外线部分中的激光,例如波长为350-700纳米,但其它波长也可使用。激光的波长可被选择以使其能够激发用于分析颗粒的特定的荧光染料。如果光学系统109用于分析利用Hoechst 33342着色的精细胞,例如,波长可被选择以在350-700纳米的范围内。激光的功率输出可在50和300mW之间改变。例如,可利用200mW的激光分析精细胞。参见图28-34,系统109是一种包括具有纵向光学轴线419的仪器417的外照射系统415。如这里所用的,术语“外照射”指的是,其中来自于穿过束斑的细胞的至少一些荧光发射沿着与聚焦束25相同的轴线但相反的方向引导返回通过光学仪器的光学系统。这种类型的系统的优点在于,与检测前和侧荧光和使用两个或者多个光检测器的常规系统不同,仅需要一组光学器件,仅包括一个光检测器117。但是,应该理解的是,尽管外照射系统是优选的,但本发明的许多方面可被应用而与所用的光学系统的类型无关。
在一个实施例中,外照射仪器417包括支承多个光学元件的矩形底座429。下面利用具有相关尺寸、焦距的特定示例和部件标号对这些光学元件进行描述。本领域技术人员应该理解的是,该信息仅是举例说明,在不脱离本发明的保护范围的情况下可使用其它可选择的光学元件。
参见图28-34,光学元件包括反射滤光器431,反射滤光器431反射来自于激光器或者弧光灯435的准直光束25例如通过安装在从底座429向上延伸的二向色腔室443的侧壁441中的开口439中的调节透镜组件437。在该特定实施例中,调节透镜组件437包括卡环445、中性密度滤光片447、柱面透镜449、透镜支座455和防松螺母457。柱面透镜449将一维发散性引入到束25中并且将其引向能够使得束形成所需横截面形状459的光学元件(下面描述的),优选基本为椭圆形。例如,柱面透镜449可是焦距为16毫米的平凸透镜。束扩展器(未示出)也可被安装在仪器417中以对椭圆形束斑459的形状进行调节。
利用夹子461将反射滤光器431安装在滤光器支架463的具有角度的面465上,滤光器支架463中具有开口467以使得束25离开滤光器431朝向仪器417的光学器件反射。支架463固定在线性级469上,线性级469可沿着X轴线471相对于固定在底座429上的悬臂梁473和二向色腔室443移动,可利用适合的装置475(例如测微计)使得级469移动以使得支架463和反射滤光器431精确地定位,从而在适合的位置处将束25反射到仪器417中。二向性滤光器477被夹子479固定在安装于二向色腔室443中的框架485上并且用于沿着轴线489在向前的方向487上反射成形光束25,在该特定实施例中,轴线489对应于该仪器的纵向光学轴线419。束25穿过聚焦透镜组件491,聚焦透镜组件491将束25以具有上述基本椭圆形459(图6)的束斑聚焦在流体流21上,并且椭圆的长轴基本垂直于流21的流动方向227延伸。当每一个细胞通过束斑459时,细胞中的荧光染料(或者其它报告剂)被刺激以发出荧光31(图23)。对于着色有DNA选择性荧光染料的精细胞,X细胞具有比Y细胞多的DNA,包括更多的荧光染料,并且发出比Y细胞强的信号(例如3.8%),这提供了识别和分拣细胞的基础,如将描述的。在一个实施例中,聚焦透镜组件491包括安装在二向色腔室443的前壁505中的开口503中的物镜适配器501、调焦镜筒507、一对透镜座筒509和其透镜511,透镜可是从Oriel Corporation得到的部件号为41209的直径为12.5毫米以及焦距为16毫米的平凸透镜,并且具有适于波长在340-550纳米的范围内的光的防反射涂层。透镜511可由石英玻璃制成。其它的聚焦透镜也是适合的,诸如无限调整荧光显微镜物镜。聚焦透镜组件491具有常规收缩式焦点调节515以将椭圆形束斑459聚焦在流21的芯189上。
当细胞通过束斑时所发出的输出荧光31具有不同于入射激光25的波长(由于斯托克斯频移,比入射光的波长长)。一些荧光发射31沿着入射束轴线在向后方向513上被传输回到通过收集和校准荧光发射31的聚焦透镜511。准直的荧光发射517在向后的方向上从透镜511传送到二向色滤光器477,二向色滤光器477传送荧光发射517。例如,二向色滤光器477可是从Omega Optical得到的部件号为XF2001,400DCLP的滤光器。
光学系统415包括沿着仪器417的光学轴线419位于二向色滤光器477后面的滤光系统519。在一个实施例中,滤光系统519包括在安装于二向色腔室443的后壁527中的开口525中的支架523中的发射滤光器521。发射滤光器521衰减通过二向色滤光器477传输的任何激光散射或者其它不希望的电磁辐射。例如并且非限定性的,发射滤光器521可是适于传输大于90%的波长大于480nm的光的薄膜宽带滤光器,如从Omega Optical得到的部件号为XF3097的滤光器。调准薄膜组件529沿着光学轴线419向后与发射滤光器分隔。该组件包括可在平行于仪器417的纵向光学轴线419的底座429的纵向延伸的导轨533上移动的滑块531、固定在滑块531上的滤光器支架535、薄膜滤光器元件539和用于以相对于仪器417的光学轴线419成一定角度将薄膜滤光器元件539固定在滤光器支架535上的夹子541。薄膜滤光器元件539具有与二向色滤光器477相同的厚度并且用于将准直的荧光发射517传送回到仪器417的光学轴线419上。在导轨533的相对侧面上的通过在底座429中的平行狭槽547向上延伸的紧固件545沿着光学轴线419在所需位置处将滑块531固定在底座429上。被安装在框架553中的支架551固定的非球面透镜549在调准薄膜组件529后面并且与其保持一定间隔,所述框架553还可在导轨533上滑动并且被适合的紧固件557固定在所选择的位置处。非球面透镜549将准直的荧光发射517聚焦在空间滤光器559上,空间滤光器559滤出来自于源的反射或者发射而不是来自于待分析的细胞的反射或者发射。非球面透镜549例如可是从Oriel Corporation得到的直径为12.5毫米以及焦距为15毫米的非球面透镜。透镜549优选具有适于可见光发射波长的防反射涂层,但由进一步衰减激光散射的材料(例如,燧石玻璃)制成。
如图34中所示,在一个实施例中,空间滤光器559包括被安装在仪器417的底座429上的框架563以可拆卸的方式固定的一对孔板561。每一个板561中具有缝隙567、571,一个缝隙567优选基本是垂直的,而另一个571优选是水平的,该布置是这样的,即,使得缝隙567、571相交以形成孔573。在一个实施例中,孔573的形状基本为矩形并且具有100微米的垂直尺寸575和500微米的水平尺寸577。孔573的尺寸和形状可改变(甚至可通过改变孔板被调节),只要它用于去除反射和来自于除收集量579以外的任何源的光即可。固定孔板561的框架563优选具有两个部分,即,可在底座429的导轨533上滑动并且被紧固件587固定在选择位置的板支架583以及用于使得孔板461定位在板支架583上的衬背元件589。
在一个实施例中,空间滤光器559中的孔573的较小(垂直)尺寸575的尺寸适于(或者被调整)能够利用“缝隙扫描”技术评估细胞。该技术在本说明书中的“聚焦束斑”部分中被详细描述。
图35中示出外照射光学系统的另一个实施例450。该实施例与图28-34中所示的实施例基本相同,不同之处如下面描述的。一个明显的差异是,二向色滤光器477被不同的二向色滤光器451代替,二向色滤光器451传送(而不是反射)照射束25并且反射(而不是传送)荧光发射31。另外,由于荧光发射31被二向色滤光器451反射而不是被传送,因此无需在外照射光学系统450的该实施例中的校准薄膜539。这样,外照射系统450仅是关于在不脱离本发明的保护范围内如果需要的话可如何重新布置光学系统的一个示例。
另外,柱面透镜449安装在可调节的安装组件449A上。安装组件449A使得柱面透镜449在垂直于照射束25的平面中进行两轴平移。可松开的紧固件(例如,螺钉(未示出))穿过狭槽形孔449B延伸(图35上仅可以看到其中一个)。紧固件的松开使得透镜449在垂直于束25的第一方向上平移。类似的紧固件(未示出)穿过狭槽形孔449C延伸,使得透镜449在垂直第一方向的第二方向上平移。这使得柱面透镜449和束25的相对位置能够微调以使束25和透镜449的相交部分可穿过透镜449的表面移动,从而使得由柱面透镜449提供的聚焦的变化很小。在透镜449处于所需位置后,紧固件可被紧固以将其固定在那里。
光检测器
穿过空间滤光器559的发射的荧光落在光检测器117上,光检测器117在外照射仪器417的后部被紧固在可在底座429的导轨533上的滑动的安装板591上并且可被紧固件595固定在固定位置上(图32)。光检测器117检测荧光发射31并且将它们转换成可被处理以分析细胞的所需特征的电信号,如下面详细描述的。光检测器117可是一种常规的装置,如从Hammamtsu得到的光检测器。光检测器117优选包括前置放大器和使得外照射系统产生发射强度对于被分析的特定着色细胞为最佳的PMT增益。
一般地,当200至2000伏的电压被提供给真空管时,PMT增益为最佳。例如在检测Hoechst 33342的荧光发射的情况下,当400至800伏的电压被提供给真空管时,PMT增益为最佳。一个特别优选的光检测器包括光谱范围为185-830纳米(530纳米峰值)、0.01mA的最大平均阳极电流、通常为70mA/W的阴极辐射灵敏度、140μA/lm的阴极光灵敏度、300A/lm的阳极光灵敏度、1nA(通常为0.1nA)的最大阳极暗电流和1.4纳秒的上升时间的PMT。该PMT是显示大于37MHz的平坦增益并且在50Ω的负载具有1V的峰值输出以及小于400纳秒的恢复时间的DC耦合放大器。优选,该放大器还能够在不使信号噪声比减小到小于800dB的情况下进行高压调节以补偿PMT效率变化。
束入射角
图36示意性地示出光束和流体流的相交部分的一个所需取向。应该注意几点。如图所示,光束25在位置115处聚焦在流21上,所述位置115与喷嘴137的排出孔103仅保持短的距离605,优选小于1.0毫米,甚至在喷嘴137内,以使细胞在穿过斑459时仍然基本保持所需取向,如前面所述的。这对于在流体流21中移动的细胞(包括精细胞)是特别重要的。
应该注意的另一点是,本实施例的束25可沿着以入射角A与流体流21相交的束轴线609被引向流体流21,从流21的一侧观察,入射角A相对于流体流21的纵向轴线上倾斜的(偏离90度)(见图36)。当分拣某些颗粒时,已经发现,可通过以非零的入射角照射流21获得不同类型的颗粒的更好识别。例如,优选以在5至45度的范围内的入射角A照射精子核,优选在15至30度的范围内、优选在18至24度的范围内。当光束25基本垂直于流体流21时(即,当角度A为0时),其它颗粒(例如,活精细胞)更容易询问。这样,可以预见的是,在不脱离本发明的保护范围内,角度A可为任何角度。
角度A的适当选择能够提高在某些颗粒中的信号噪声识别,并且从而基于那些颗粒的不同特征(例如,具有X和Y染色体精细胞的精子核)可以更精确地进行识别。该提高可能是由于多个因素造成的,包括进入聚焦透镜511的激光散射减小。由于聚焦束斑459优选宽于流21,在束25和流21的相交部分115处产生不同的图案。当角度A大于12度时,反射的衍射图样不落在透镜511上。另一个因素可能是,倾斜角A使得束25非常靠近喷嘴孔103聚焦,以使喷嘴主体139不干涉透镜511。相关地,细胞靠近喷嘴137更均匀的排列,从而束斑459靠近喷嘴137聚焦产生提高的信号。另外,以倾斜角A提供给透镜511(束25)的细胞的较多的“头部相对”型面减小由于细胞的任何未对准(unaligned)导致的总荧光强度的变化。在这点上,对于精细胞,束25优选落在每一个精细胞201的其中一个宽面207上,如上所述,并且喷嘴101和光学系统109被设置以达到该结果。
尽管倾斜的入射角A被认为对分拣一些颗粒是有益的,但可以预见的是,在不脱离本发明的保护范围的情况下,在束轴线和流之间的相交角度可为90度或者任何倾斜角度。还可以预见的是,最佳入射角可根据被分析的特定颗粒的性能大大改变。
聚焦束斑
参见图6,所示的一个实施例的聚焦束斑的形状基本为椭圆形(卵形)459,它具有沿着基本以相对于流体流动方向227的直角延伸的长轴的长度L1和沿着基本平行于流体流动方向227延伸的短轴的宽度W1。在一个实施例中,宽度W1小于精细胞219的头部的长度,优选小于细胞的包含染色体DNA物质的区域225的长度,对于牛精细胞201,其长度小于1微米。对于具有直径为60微米的鞘流体191和包含牛精细胞201的芯流189的流21,示例性长度L1为80微米,示例性宽度W1为1.5微米。通过将束斑459聚焦到宽度W1,宽度W1小于精细胞201(或者被分析的任何其它细胞或者颗粒)的头部205的长度,优选小于精细胞201的头部205的DNA区域225的直径,可达到较大的信号分辨率,如“缝隙扫描”技术领域的技术人员应该理解的是。这是一种使束25变窄使得宽度小于细胞的长度(即,细胞在流体流方向上的尺寸)从而当细胞移动通过窄流时在细胞的长度上测量来自于细胞的光子发射31的技术,如后面描述的。这样,可获得关于沿着细胞的长度的结构变化的信息,包括DNA材料。缝隙扫描技术还有助于识别“重合”细胞,即重叠或者挨在一起的细胞。
如上所述,也可通过设置空间滤光器559的孔573以具有垂直尺寸575来实现缝隙扫描以使从细胞发射的仅对应于在流体流方向上的细胞长度的一部分的一部分光通过所述孔达到光检测器117。另外,可通过调节束宽度和/或空间滤光器的孔的尺寸以使得它们共同起作用提供形状适合缝隙扫描的束斑,从而使得信号分辨率达到最佳。
调节束斑459的形状的一种方式是通过改变为不同的柱面透镜和/或对光学系统109中的束扩展器进行调节。在本发明的保护范围内,其它任何使得束25成形以形成椭圆形束斑459的方法是可以预见的。其它形状和尺寸的束斑也可被使用并且可以预见到这也落在本发明的保护范围内。
分拣系统
图2示出分拣系统119的一个示例性实施例。分拣系统119包括根据包含在液滴33中的颗粒的分类(例如,精细胞的X/Y染色体含量)对液滴33充电和/或不充电的静电充电装置627以及一对用于根据它们的电荷将液滴33分拣到不同的组123、125中的静电充电偏转板629。偏转板629优选涂有暗淡的低发射性涂层(例如,环氧树脂或者油漆)以限制被偏转板629反射或者发射的光。可利用任何适合的电源635为偏转板629充电。优选,两个完全充电的偏转板629之间的电势在2000-4000伏的范围内。但是,在偏转板629之间的电势可为1000和6000伏之间的任何一个数值。
充电装置627包括充电元件631,充电元件631中具有开口633,流21在靠近液滴分裂位置107的一个位置处(例如,在5个液滴长度或者更近的位置)通过开口633。充电元件631优选装有有助于相对于液滴分裂位置107调节充电元件631的位置的机构。例如,如图26、27中所示,充电元件631和偏转板629可与可调节的安装组件5001相连,安装组件5001使得充电元件631和偏转板629相对于喷嘴系统101平移和倾斜调节。为了能够沿着平行于流21的轴线5011平移,安装组件5001包括被穿过板5003中的狭槽5009的可拆卸紧固件5007紧固在背衬5005上的板5003,狭槽5009的取向基本平行于轴线5011。为了能够沿着垂直于流21的轴线5013平移,利用穿过第二调节板5015中的狭槽5019的可拆卸紧固件5017使得第二调节板5015被紧固在第一板5003上,狭槽5019的取向基本平行于轴线5013。充电板631和偏转板629固定在第二调节板5015上。这样,通过松开紧固件5007和/或5017,人们可在平行于流体流21的平面中相对于喷嘴系统101调节充电元件631和偏转板的位置,接着紧固紧固件5007和/或5017以固定安装组件5001。
为了能够沿着垂直于头两个轴5011、5013的第三轴线平移,利用可调节的紧固件5023(例如,拧在固定支承件5021中的螺纹孔中的螺栓)使得背衬5005紧固在固定的支承件5021上。在一个实施例中,每一个可调节的紧固件5023通过位于背衬5005和固定支承件5021之间的弹簧5025。可通过紧固或者松开各个紧固件5023调节任何弹簧5025的压缩量。以相同的量调节所有弹簧5025的压缩导致沿着第三轴线的平移。可通过改变一个或者多个弹簧5025相对于一个或者多个其它弹簧5025的相对压缩使得安装组件5001实质上可在任何方向上倾斜。
在该实施例中,充电元件631和偏转板629的相对位置相互之间保持固定,这是由于它们都被固定在同一个调节板5015上。这防止安装组件5001的调节影响充电元件631相对于偏转板629的定位。
充电元件631在处理器131的控制下与适合的电路(例如90伏选择性充电电路)相连并且与用于为充电元件631提供电荷的电源相连。该电路用于就在分裂位置107处形成液滴33之前根据液滴33是否包含具有所需特征的颗粒(例如,至少一个活的X染色体精细胞)来对流21充电或者不充电。充电元件631静电地位于流21附近或者由流21形成的液滴33附近以相对于流21的静电极性提供电参考。在液滴33从流21分裂时,液滴33带有与流21相同的电荷。充电的或者未充电的液滴33接着在偏转板629之间通过并且通过充填在收集系统2201的收集容器2207中而被分拣。尽管分拣产生了在图2中的两个液滴组或者群组123、125,但颗粒可被分离成通过将不同的电荷放置在各个组中的液滴33上以及提供适合数量的收集容器而分拣的从1到N的任何数量的群组,每一个收集容器的位置适于收集不同的液滴群组。
自动液滴延迟校准
在上述的分拣系统119中,处理器131必须评估颗粒从询问位置115移动到液滴分裂位置107所需的时间以当在液滴分裂位置107处颗粒在最后一个附着的液滴33中时需要被施加到包含该颗粒的液滴33的电荷(或者缺少电荷)被施加。如果处理器131所用的延迟设定是错的,根据液滴33的含量,液滴33将没有被分拣。类似地,如果电荷施加到液滴33与液滴33的形成略微不同步,那么这可对分拣造成不良的影响,这是因为没有一个液滴33将被完全充电并且假设具有中性电荷的液滴33将带有小的正或者负的电荷。这将改变液滴33通过在偏转板629之间的电场的路径。
检验处理器131的最佳方式是利用适合的延迟设定或者调节液滴延迟设定(即,校准系统的9个液滴延迟设定)分拣多个液滴33和检查结果。通过递增地改变延迟设定和监测结果,人们可选择最佳的延迟设定。通常,该分拣校准是人工实现的。最近,自动校准系统已经被设计以对分拣的液滴流中的液滴含量采样或者检查并且在没有人为干涉的情况下自动地调节延迟设定。例如,美国专利US 6,372,506(Norton)和US 5,643,796(vanden Engh)都披露了自动分拣校准系统,这两篇专利文献在这里合并参考。这些系统的声称的优点是,它们节省劳动力并且能够在整个分拣过程中而不是仅在开始设定时检验延迟设定。缺点是它们是笨重的并且不必要地占据有价值的空间。
(i)外照射传感器
参见图37,本发明的用于荧光激发液滴分拣细胞计数系统的自动连续校准系统4201包括位置适于检测液滴33的含量以检验用于液滴充电的延迟设定的一个或者多个外照射传感器4203。参见图38,每一个外照射传感器包括光源(未示出)、光纤光缆4205、二向色滤光器4207、透镜系统4209、光检测器4213和控制系统。在一个实施例中,处理器131用作控制系统,但其它处理器或者控制器也可被代替使用。
光源可是专用于自动校准系统4201的低功率固态激光器。或者,可使用束分裂器(未示出)以将用于询问流体流21中的颗粒的束25中的一部分能量(例如,约5%)转移到一个或者多个外照射传感器4203。类似地,光纤光缆4209可位于束挡块4215中(图26)以在其通过询问位置115后从束25收集光。来自于光源的光必须包括波长能够激发被分拣的颗粒中的荧光剂分子的光,从而产生从颗粒的荧光发射4211。例如,如果利用Hoechst 33342对颗粒着色,光源可提供波长为350纳米、407纳米或者任何其它能够激发Hoechst 33342分子的波长的光。
光纤光缆4205从光源延伸到询问位置115的下游的一个位置。例如,在该实施例中,光纤光缆4205通向与移动通过在偏转板629之间的电场的液滴流的其中一个的轨迹相邻的位置。二向色滤光器4207传送具有由光纤光缆4205传导的光的光谱特征的光,但反射具有荧光发射4211的光谱特征的光。这样,二向色滤光器4207可具有与前面关于外照射光学仪器417描述的二向色滤光器477相同的技术要求。基于传感器4203和液滴33之间的预期的距离选择透镜系统4209的焦距以使得每一个传感器4203的照射/检测量基本等于液滴33的量。
参见图37中所示的实施例,外照射传感器4203位于三个分拣的液滴流4225、4227、4229的每一个的轨迹附近以检测在各个流中的液滴33含量。细胞计数系统9包括用于安装两个偏转板629的电绝缘支承4221。支承件具有多个孔4223,一个靠近每一个分拣的液滴流4225、4227、4229的轨迹。外照射传感器4203位于每一个孔4223处以通过各个孔4223观察在其中一个液滴流4225、4227、4229中的液滴33。该紧凑的构造占据很少的空间并且避开校准系统4201的部件,能够更好地接触细胞计数系统9的其它部件。
如果包含荧光剂颗粒的液滴通过传感器4203的照射/检测量,这导致荧光发射4211的闪光,其中一些被透镜系统4209收集并且从二向色滤光器4207反射到光检测器4213。来自于光检测器4213的信号被提供到处理器131。基于从光检测器4213接收的信号,处理器131可确定在每一个分拣的液滴流4225、4227、4229中的液滴33的含量。
如果当处理器131期待包含荧光剂颗粒的液滴33通过传感器4203时传感器4203不能检测荧光发射4211的闪光,那么处理器131可利用该信息调节延迟设定或者调节液滴分裂位置107的位置。同样,如果当处理器131不期待通过传感器4203的包含颗粒的液滴33时传感器4203检测荧光发射4211,那么处理器131可进行调节。另外,传感器可比较来自于分拣的液滴流4225、4227、4229的荧光剂发射4211的相对频率以看被检测的荧光发射4211的频率是否与所期待的频率相符。处理器131还可调节被施加在充电元件631上的电荷幅值以增大或者减小分拣的流4225、4229偏转以使得被检测的荧光发射4211的强度达到最大的量。这将保持被检测的液滴流4225、4229的轨迹的调准,从而使得液滴直接通过外照射传感器的收集量。因为传感器4203的位置适于在流4225、4227、4225移动通过偏转板629之间的电场时观察它们,如果它观察到流4225、4227、4229在偏转板下游的自由下落区域中,那么校准系统具有比其短的响应时间。
(ii)空液滴测试流
可通过产生和监测基本仅包含空液滴33的校准测试流来布置校准质量的一个敏感性指示。参见图37中所示的分拣校准系统4201,包含所需颗粒的液滴33被分拣到流4225中并且包含任何其它颗粒的液滴33和大部分空液滴33被分拣到流4229中(即,废物流)。通过将中性电荷提供给空液滴33的至少一部分(例如,每10个中的1个)产生测试流4227。基于颗粒在询问位置115的达到时间和在流体流21中的评估的液滴形成边界,对于常规的分拣目的被认为是“空的”的许多液滴33实际上是包含颗粒的液滴33的可能性低的液滴33。这些“空的”液滴不应该被分拣到测试流4227中,这是因为这不可避免地导致一些颗粒在测试流4227中的检测。
相反,对于测试流4227,处理器131应该仅选择处理器131认为具有包含颗粒的基本为零的可能性的液滴33以形成基本没有颗粒的测试流4227。包含细胞的任何随机选择液滴33的可能性是已知的并且约是平均细胞分析率除以液滴产生率。这意味着,通过监测测试流4227中的错分拣的比率能够评估匹配液滴33的形成的相所需的液滴充电的相关系的部分调节。例如,处理器131可选择液滴,它估计包含颗粒的可能性为15%或者更低、包含颗粒的可能性为10%或者更低、包含颗粒的可能性为5%或者更低、包含颗粒的可能性为1%或者更低、包含颗粒的可能性为0.1%或者更低、包含颗粒的可能性为0.01%或者更低、包含颗粒的可能性为0.001%或者更低、包含颗粒的可能性为0.0001%或者更低。可基于分拣速度、杂质的容限或者其它分拣参数选择基本为零的可能性的概率截止点,该截止点包括液滴将包括用于高速分拣的颗粒或者当具有更大的杂质的容限时的较高可能性。
如通过在测试流4227中对多于包含颗粒的液滴33的阈值数量的检测所指示的,处理器131产生基本没有无颗粒的测试流4227的失败(即,包含颗粒的液滴33与液滴总数的比率适合用于为测试流4227选择液滴33的概率截止点的测试流4227),是非最佳分拣的明确指示并且促使处理器131调节液滴延迟设定。关于用于选择测试流4227的液滴33的概率截止点和为测试流4227选择的液滴33的总数确定阈值水平。理想地,可为测试流4227选择一些液滴33,即使在流体流21中的一个或者多个颗粒相对接近用于各个液滴33的评估的液滴形成边界以使得系统4201对略微非最佳液滴延迟设定更敏感。
当然,在不脱离本发明的保护范围的情况下,分拣校准系统可为测试流所选择的液滴提供非中性电荷并且使得所述液滴偏转。在不脱离本发明的保护范围的情况下,流4225、4227、4229的相对顺序也可被重新安排,尽管将测试流4227设置在废物流4225和所需颗粒流4229之间(如实施例中所示)减小废物流对分拣的样本交叉污染的危险。另外,在不脱离本发明的保护范围的情况下,如果颗粒不发射荧光,不同的传感器可用于检测由测试流中的颗粒产生的任何散射光。
(iii)分拣校准系统的影响
在本发明的一个实施例中,自动校准系统4201能够自动地确定和设定在液滴形成和液滴充电之间的相关系为最佳相的5%之内(即,在+/-18度内)。在另一个实施例中,系统4201能够自动地确定和设定相关系为最佳相的1%之内(即,在+/-3.6度内)。在另一个实施例中,校准系统4201能够连续监测高速液滴分拣系统并且自动将相关系保持在最佳相的10%之内(即,在+/-36度内)。在另一个实施例中,系统4201能够连续监测高速液滴分拣系统并且自动将相关系保持在最佳相的3%之内(即,在+/-10.8度内)。
分拣系统错误校正
有时,液滴33偏离其正常轨迹并且撞击充电元件631或者偏转板629。如果一个或者多个液滴33撞击充电元件631,充电元件631可不能正确地使液滴33充电。另外,液滴33通过充电元件631的正常轨迹可被阻塞,使得更多的液滴33累积在充电元件631上。另外,如果偏离的液滴33撞击偏转板629,它们可扭曲或者中断偏转板629之间的电场线,从而改变分拣的液滴流123、125的轨迹。
这样,优选具有碎屑去除系统以从充电元件631和/或偏转板629去除碎屑。在一个实施例中,如图26和27中所示,系统9包括用于充电元件631的碎屑去除系统5047和用于偏转板629的碎屑去除系统5049。
参见图27,利用固定在可调节的安装组件5001的板5015上的支承件5051使得充电元件631定位。真空通道5053(如阴影线所示)穿过支承件5051延伸到靠近充电元件631的开口5057。利用连接在支承件5051上的配件5058上的真空线5055使得真空通道5053与适合的真空源(未示出)相连。提供适合的控制器以选择性地在通道5053中施加真空,从而将任何不需要的材料(例如,偏离的液滴33)从充电元件631吸走并且恢复充电元件631的正常功能。
相关地,如图27中所示,紧固在安装组件5001上的歧管5061中具有空气通道5063网络(如阴影线所示),空气通道5063网络通过空气线5059和配件5065与压缩空气或者其它气体源(未示出)相连。通道5063具有沿着每一个偏转板629的一面5066设置的开口5064并且通道5063中通向开口5065的部分5067采用这样的取向,即,使得通过歧管5061吹送的压缩空气将任何偏离的液滴33或者其它碎屑清离偏转板629。从偏转板629吹走的任何材料将撞击盖板(未示出)和排放到适合的废物收集装置(未示出)中。
在一个实施例中,如果处理器或者其它传感器确定偏离的液滴33已经撞击充电元件631或者偏转板629,例如由上述分拣校准系统所显示的,处理器可自动地启动错误校正程序或者模式,错误校正程序或者模式可包括为通道5053提供真空以从充电元件631吸走材料和/或输送压缩空气通过通道5067以将材料吹离偏转板629。
在错误模式下的分拣样本的保护
系统9的一个实施例还包括污染防止机构4041(图26),污染防止机构4041可由处理器131启动以在分拣系统处于错误校正模式下时限制或者防止分拣样本的污染。污染防止机构包括能够在保护位置(图26所示)和非保护位置(未示出)之间选择性地移动摆臂4045的气动致动器4043。在保护位置,摆臂4045的端部4047覆盖收集容器4033的开口,从而阻止收集容器4033收集液滴33。在非保护位置,收集容器4033不被覆盖。正常地,摆臂4045处于非保护位置,但在处理器131确定存在污染的危险时处理器131使得致动器4043将摆臂4045移动到保护位置(例如,喷嘴系统101堵塞、液滴分裂位置107变得不稳定或者偏离的液滴33已经撞击充电元件631或者偏转板629)。摆臂4045的端部4047为溜槽形以将由摆臂4045收集的任何流体排放到废物容器4035中。
流体输送系统
上述系统1能够有效地生产被选择的特征分拣的大量颗粒(例如,X精细胞)。可通过改变流体输送系统15(图2)将载流体17和鞘流体19输送到喷嘴137的速度来提高或者降低生产率。在一个实施例中,流体输送系统包括注射泵645,这样一种泵的一个示例是从Hamilton Company得到的MICROLAB_Model PSD/3。泵645能够以20μl/min的速度将载流体17输送到喷嘴137。一般地,泵645应该能够在10-50μl/min的范围内的速度将样本流体输送到喷嘴137。利用流线647使得泵645与载流体17的供给源3相连,载流体17的供给源3可是包含一定量的待分析和分拣的材料的适合容器649。在待分析的颗粒的温度是一个因素的情况下,例如对于精细胞,容器649的温度可受到一个适合的温度控制系统控制,诸如加热/冷却池(未示出)。注射泵645可移动通过吸入行程以从供给容器吸入载流体和通过排出行程以将载流体17通过供给线651分配到喷嘴系统101的注射针157。优选在处理器131的控制下利用变速马达(未示出)驱动泵645。例如,可利用步进式马达驱动泵645,步进式马达以选择的可变速度操作以便以获得所期望的生产量所需的速度将载流体17泵送到针159。其它类型的流体输送系统可被使用以代替注射泵。为了仅提供一个示例,在不脱离本发明的保护范围的情况下,可利用加压气体源对容器649加压。另外,优选使得线647、651尽可能短,这是因为线环境不利于可能在载流体17中的敏感性细胞(例如,精细胞)的健康。
鞘流体19的供给源7包括装有适合体积的鞘流体19的第二容器661(例如图2中的罐),第二容器661通过其中具有控制阀173的供给线667与喷嘴系统101的流动主体133中的径向孔173相连。在图1的实施例中,鞘流体容器661被气体压力系统671加压,气体压力系统671包括加压气体源675(例如,空气或者其它气体,诸如氮),加压气体源675通过空气线679与罐661连通,空气线679中具有用于控制被供给到罐661的压力的调节器681。空气线679中的两通阀683可在罐661和气体源675之间建立连通的第一位置和使得罐661排气的第二位置之间移动。气体压力调节器681是一种常规的调节器,优选在处理器131的控制下。通过控制罐661的压力,鞘流体19被输送到流动主体133的压力也可被控制。该压力可在16至100psi的范围内,优选在10至50psi的范围内,优选在15至40psi的范围内、优选在20至30psi的范围内。在不脱离本发明的保护范围的情况下,可利用其它方式控制鞘流体19被输送到流动主体133的压力。
在一个实施例中,如图26中所示,流体输送系统15包括鞘流体罐(未示出)和样本台4051。样本台包括适于装样本管4055的两部分压力容器4053。压力容器的底部4057可相对于压力容器4053的上部4059在可装载或者卸载样本管4055的打开位置(图26所示)和关闭位置(未示出)之间上下移动,在所述关闭位置,压力容器4053的两部分4057、4059合在一起形成密封以容纳用于将载流体17从样本管4055泵送到喷嘴系统101的加压气体。
当压力容器打开时,弹簧偏压摆臂4071移动到用于将载流体17输送到喷嘴系统101的线651下方的一个位置(也可见图119中的标号4071′)。摆臂4071为溜槽形并且适于收集通过线651反冲回来的流体并且通过端口4073将反冲回来的流体排放到废物容器。当压力容器4053从其打开位置移动到其关闭位置时,与压力容器4053的底部4057相连的凸轮板4075抵抗其弹簧偏压移动摆臂4071以清洁两个部分4057和4059之间的区域并且使得压力容器4053关闭。
控制装置
参见图2,微处理器131(或者其它数字或者模拟控制装置和/或处理器,或者其结合)控制系统1的操作。如下面参照图39描述的,微处理器可以一个系统控制处理器和用于控制信号处理的四个处理器的形式实现。或者,一些或者所有的功能可结合在一个或者多个处理器中。例如,可利用四个信号处理处理器中的一个来实现系统控制微处理器(见图36)。另外,如下面所述的,可利用一个模拟电路(例如图39中所示的模拟细胞分析器)或者模拟和数字电路的组合来实现信号处理。
微处理器131响应于从外照射系统415接收的输入信号提供输出信号以控制流体输送系统15(下面所述),响应于从分裂传感器389接收的输入信号提供输出信号以控制换能器105,以及响应于从外照射系统415接收的输入信号提供输出信号以控制分拣系统119(下面所述)。微处理器131可将输出信号提供给这里所述的细胞计数系统9的其它部件。另外,微处理器131可适于处理信息和实时提供输出信号。概括地讲,这里所用的术语“实时”指的是处理器的操作与人类感知时间匹配的操作或者处理器131的操作速度匹配相关的物理或者外部处理的速度的操作。在一个含义上,术语“实时”可表示在事件过去之前系统对事件作出反应。
一般地,来自于外照射系统415的电信号被A/D转换器转换成数字信息,A/D转换器为微处理器131提供相应的数字信息。响应于该信息,微处理器131控制分拣系统119和流体输送系统15,如下面描述的。
外照射系统415的光检测器117输出的电信号是表示随时间变化的模拟电压信号,该随时间变化的模拟电压信号表示在细胞被激光束25照射时每一个细胞在任何时刻产生的发射荧光31的幅值。这样,模拟信号(也被称为模拟输出)呈随时间变化的波形脉冲497的形式,如图52和53中所示。一般地,波形脉冲497被定义为包含一个或者多个脉冲或者一个脉冲的一些部分的变形或者变形的一部分。这样,每一个波形脉冲497在任何时刻的幅值表示在细胞通过激光束25时每一个细胞在该时刻的光子发射31的相对速率。X染色体牛精细胞的DNA含量高于Y染色体牛精细胞(例如,约3.8%)。因此,被上述荧光着色剂标记的活X细胞将产生不同于来自于其它任何标记的细胞的脉冲的波形脉冲497。通过如下面所述的分析波形497(见信号处理、缝隙扫描和临界效率差),每一个细胞可被识别为X细胞或者没有被识别为X细胞(~X)。一般地,如这里所用的,X细胞指的是活X细胞,Y细胞指的是活Y细胞,~X细胞指的是活Y细胞和可产生能够检测的荧光发射31但不能以相当大的可能性被识别为活X细胞的细胞的组合。
每一个波形脉冲497的时限表示每一个细胞在流21中的位置。由于通过喷嘴137被输送的鞘流体19的速度保持恒定,以及由于喷嘴137和液滴分裂位置107之间的距离d(在图25中)是已知的,因此每一个液滴33的位置是已知的并且在每一个液滴33内的细胞(如果有的话)是已知的。这样,微处理器131可计算每一个形成液滴通过充电套环631的时间并且可控制套环631的极性,从而控制液滴33是否被充电以被分拣系统119的充电元件631偏转。由于微处理器131知道液滴形成速度并且识别液滴内的细胞为X或者~X,因此微处理器131知道每一个液滴33的细胞含量并且留意(或者计数)在每一个群组123、125中的细胞数。根据分拣策略(下面所述的),微处理器131确定液滴33被充电以偏转或者液滴33不被充电以使它们不偏转。
信号处理
A.数字采样介绍
如上所述,激光束25和颗粒之间的相互作用产生被光学系统109的收集透镜俘获并且被输送到光检测器117的“脉冲”光子发射31(例如荧光发射)。光检测器117在任何时刻将光子能量转换成幅值随时间变化的模拟电压输出。该输出是包含可用于在颗粒群组之间识别的许多特征的一系列波形脉冲497(图43和44)。这些特征包括总光子发射、作为颗粒通过激光束空间传送的函数的光子发射速度、在传送过程中的最大光子发射速度、在传送过程中的平均光子发射速度和传送所需的时间。激光束几何形状459、颗粒尺寸、通过颗粒体积的发射源的分步和颗粒速度确定波形脉冲497的频谱。对于上述牛精子所用的系统1,已经确定每一个细胞201在800纳秒和1200纳秒之间的时间内产生一个波形脉冲497。还已经确定,作为频率的一个函数,在波形脉冲497中的大于97%的功率以低于30MHz的频率被输送。该频谱将在后面描述,它涉及尼奎斯特采样理论。将这些波形脉冲497联系在一起形成来自于光检测器117的输出信号701,它是表示颗粒流通过该设备的传送的连续、随时间变化的信号。除了用于在群组中识别的各个脉冲的特征以外,随时间变化的信号提供了关于通过该设备的各个颗粒之间的相对间隔(时间和位置)和移动通过该设备的颗粒的相对速度的精确记录。该精确时间、位置和速度记录可与如图44中所示的液滴产生时钟信号703同步以确定颗粒是由液滴形成设备105形成的特定液滴33的组成部分。该信息可用作确定在一个液滴33中的所需要的和不需要的颗粒的“重合”或者存在情况。精确地确定在一个液滴33中的每一个颗粒的数量和分类的能力提供精确有效的分拣。
图72中所示的数字信号处理705可用于分析由来自于光检测器117的同步采样输出信号701所表示的荧光脉冲31的检测。该处理可在利用如这里所述的指令和/或算法的脉冲分析软件中来实现。光检测器117的随时间变化的模拟输出信号701被提供给对其同步采样的A/D(模拟/数字)转换器689。同步采样指的是产生对应于模拟输出的数字信息的采样。同步采样也被称为连续采样或者流获得。如下面描述的,采样率取决于模拟输出的频谱。
转换器689提供包括数字信息707的输出,数字信息707被提供给微处理器131或者其它利用脉冲分析软件分析数字信息707的数字分析装置。一般地,脉冲分析软件可包括数字脉冲检测HH3、脉冲特征抽取HH4和脉冲识别HH7。
B.采样频率以及信号频谱
来自于PMT117的信号输出701被高速模拟数字转换器689(ADC)俘获,高速模拟数字转换器689(ADC)以105MHz的频率连续对输出701采样。应该理解的是,当对随时间变化的信号采样时,采样频率必须至少为被采样的信号中包含的最大频率的两倍。这被称为尼奎斯特采样理论。因此,来自于PMT117的信号输出701首先被输送通过40MHz的低通滤波器854(见图39)以确保包含在信号701中的最大频率低于由采样率所施加的52.5MHz限度。重要的是,注意到设备1的光学系统1、流体系统15和检测系统已经被调谐以产生适于以105MHz速度采样的最佳频率特征的波形脉冲497。在不脱离本发明的保护范围的情况下,采样率可在25至200MHz之间变化。
C.脉冲处理
在共享存储器并且通过高速并行端口互连的四个(4)TigerSharc DSP处理器中进行脉冲处理。如图39中所示,四个处理器为:1)接收来自于使得来自于光检测器117的输出信号701数字化的高速ADC689的数据的数据管理处理器863;2)检测由数字信息表示的波形脉冲497的脉冲检测处理器865;3)从检测的脉冲497抽取特征并且基于抽取的特征识别脉冲497的特征抽取和识别处理器867;以及4)基于抽取的特征和识别确定每一个脉冲497的分拣分类的分拣处理器873,分拣处理器873确定对于相应的细胞和液滴33的分拣判定并且与液滴形成105同步。一般地,处理器863、865、867、873完成一个任务并且设定一个“标记”以使同伴处理器知道具有可用于处理的数据。
每一个处理器863、865、867、873相互独立工作,使得总处理量达到最大,这是由于它们相互不中断。这样,任何处理器863、865、867、873可执行任何功能并且一个或者多个处理器或者功能可被结合在一个处理器中或者分散到多个处理器。处理器863、865、867、873按照上述分类并且该应用仅是便于使用并且不是以任何方式对其限定。
所有四个处理器863、865、867、873与用于信息交换的DSP板SDRAM851链接并且与外围I/O总线859同步和通信的处理器输入/输出(I/O)857链接,外围I/O总线859与PC735和分拣脉冲发生器861相连。处理器I/O857可由通过通信链路连接的两个或者多个SharcFIN I/O处理器来实现。利用外围I/O总线857将分拣信号853提供给PC735并且分拣信号853用于控制分拣脉冲发生器861以控制液滴33的充电。
处理器I/O857从模拟/数字转换器(ADC)689接收输出707,例如Bitware Corp.105MHz/1-频道,能够支持105MHz/1-频道的14比特。ADC689与光检测器117输出相连以将其随时间变化的模拟输出信号701转换成数字信息707,ADC689还与I/O板SDRAM855相连以存储来自于ADC689的数字信息块。
一般地,来自于光检测器117的模拟输出信号701表现为特征A或者特征B(例如,X或者~X)。A/D转换器689将来自于流动细胞计数系统1的光检测器117的模拟输出信号701转换成相应的数字信息707。处理器863、865、867、873分析和分类数字信息707以及为分拣系统119提供作为被检测的和分类的数字信息的函数的分拣信号。
D.数据获得
如上所述,来自于光检测器117的输出信号701被以105MHz的频率连续对输出采样的高速模拟数字转换器(ADC)689俘获。数据(数字信息707)被立即转移到用于缓冲输入数据的高速存储块(I/O板SDRAM)855中。这些存储块855以一种保持数据流707的完整性和顺序的方式被组织。这些存储块855也可利用直接存储器存取(DMA)由数字信号处理(DSP)处理器863、865、867、873存取。这样,处理器863、865、867、873在不中断ADC689的情况下可存取输入数据707。这有助于数据707有效转移到这些处理器863、865、867、873以特征抽取、分析和分拣分类。在这整个过程中,数据管理处理器863保持脉冲取样707的次序和索引的时间(相对于主时钟737,它是125乘以液滴33频率)以保持它们对“实时”或者细胞通过激光束25的实际时间的参考。ADC689在两个输入之间前后往复转换工作,连续对包括波形脉冲497的随时间变化模拟输出信号701采样以及将它们转换成数字信息707,数字信息707在数据管理处理器863的控制下被提供在I/O板SDRAM的块855中。处理器863将信息707汇编为连续流。
E.初始化检测参数
为了有效识别背景噪声,数字脉冲检测软件747应该设有当没有荧光脉冲497时表示信号背景二阶统计的信息,即,来自于光检测器117的输出电压信号701的性能的认识。可利用软件来学习这些统计以就在系统1的启动后的初始化阶段以无人管理的方式使得检测参数741初始化。一般地,脉冲可被定义为背景值的2或者3个标准偏差。
由于载流体17引入鞘流体流191可能导致背景荧光发射变化,因此载流体17应该存在以便于检测参数的初始化。输出电压信号值的时序的二阶统计的简单计算可过高估计背景的标准偏差(由于在该顺序中的荧光发射497的可能存在)。因此,迭代程序是优选的以逐渐消除该影响。脉冲检测软件747可这样实现该迭代程序,即,通过计算总信号(背景+脉冲)701的统计、利用这些值提供脉冲检测逻辑,在被检测的样本不在脉冲内的情况下再次计算信号统计以及重复该程序直至背景统计评估收敛(或者迭代的固定最大次数出现)。通过利用细胞存在评价背景,所期望的校正脉冲497幅值的更精确的表示可被确定。表II概括了利用脉冲检测软件确定检测参数的检测初始化程序。
  算法:初始化检测参数
  输入:浮动PMTvolts的矢量;浮动statWindowSize、整数maxIterations
  输出:浮动bckgmdMean;浮动bckgrndSTD
  程序:1.将PMTvolts矢量和numIterations的最后statWindowSize样本的背景矢量bckgrnd、lastSampleMean和lastSampleSTD初始化为0:
  Bckgrnd=PMTvolts[1 to statWindowSize]lastSampleMean=0lastSampleSTD=0numIterations=02.计算bckgrnd和增量迭代计数的样本平均以及样本标准偏差:sampleMean=sum(bckgrnd)/statWindowSizesampleSTD=sum(bckgrnd-sampleMean)2/statWindowSizenumIterations=numIterations+13.检查收敛或者超过迭代最大数:exitFlag=((sampleMean-lastSampleMean)<eps∧(sampleSTD-lastSampleSTD<eps))∨(numIterations>maxIterations)如果exitFlag是正确的,去步骤6(其它的继续步骤4)4.提供脉冲检测算法,获得脉冲样本的矢量和新的背景样本的评估:[pulse,bckgrnd]=pulse_detect(bckgrnd,sampleMean,sampleSTD)5.记录来自于该迭代的统计评估和重复lastSampleMean=sampleMeanlastSampleSTD=sampleSTD去步骤26.将背景统计评估设定为样本统计并离开:bckgrndMean=sampleMeanbckgrndSTD=sampleSTD
表II.脉冲检测算法参数的初始化
一般地,A/D转换器689将来自于光检测器117的模拟输出信号701转换成表示特征A或者特征B(例如,X或者~X)的相应的数字信息707。数字信号处理器865确定与其对应的来自于数字信息707的随时间变化的信号701的背景特征,检测作为被确定的背景特征的函数的来自于数字信息707的波形脉冲497,并且为分拣系统119提供作为被检测的脉冲497的函数的分拣信号853。
F.初始识别参数
与检测参数类似(并且接着如表II中所示的它们的初始化),用于识别算法中的参数可以无人管理的方式被初始化。但是,与检测算法不同的是,无需一个迭代程序。在这种情况下,用于使得识别参数745初始化的软件检测预定数量(例如,100,000)的荧光脉冲497,计算用于每一个检测脉冲497的识别的特征以及使用群集程序(见关于选择物群集程序的概述的表II)以为这些脉冲497分配所关注的群组(例如,X、~X)。
 算法名称  算法
k-Means  在每一个群组内的点之间(Euclidean或者Mahalanobis)平方距离的和的迭代(局部)最小化[1]
 模糊k-Means  (Gaussian)混合模式的期望-最大化[2]
聚集体系  合并“最近的”群(从作为其自身的群的每一个数据点开始)直至达到所需的群数。“最近的”群的确定的各种手段包括最近点之间的距离、最远点之间的距离、在群平均数(平均值)之间的距离以及点之间的平均距离。[1]
表2.用于识别算法参数初始化中被考虑的群集方法的概述。
图73包含基于分配统计限定群组1和群组2的k-Means群集程序的应用的结果的一个示例。这些群组的二阶统计接着用于设定识别所需的参数(1或者2阶多项式判定函数的系数)。表IV概括了识别初始化程序。
  算法:初始化识别参数
  输入:浮动detectedPulseData的矩阵、浮动popPriorProbabilities的矢量
  输出:对于每一个分类群组i:浮动Wi的矩阵、浮动wi的矢量、浮动wi0
  程序:1.计算来自于检测脉冲的特征值(每一个脉冲的n值,其中n是特征空间的维数):featureValues=feature_extract(detectedPulseData)2.群集在特征空间中的特征值以获得群组成员数Populations=群集(featureValues)3.计算群组的2阶统计:(对于i=1至m,其中m是群组/分类的数量)(对于j=1至n,其中n是特征空间的维度)popMeani[j]=sum(featureValues[populationsi,j])/populationsi中的样本#(对于k=1至n,其中n是特征空间的维度)tmpVal[j,k]=(featureValues[populationsi,j])-populationMeani[j])·(featureValues[populationsi,k])-populationMeani[k])popCovariancei[j,k]=sum(tmpVal[j,k])/populationsi中的样本#4.计算多项式判定函数的系数:(对于i=1至m,其中m是群组/分类的数量)Wi=-1/2·popCovariancei -1wi=popCovariancei -1·popMeaniWi0=-1/2·In(|popCovariancei|)-1/2·popMeani T·popCovariancei -1·popMeani+In(popPriorProbabilitiesi)
表IV.识别算法参数的初始化
一般地,A/D转换器689将来自于光检测器117的模拟输出信号701转换成表示特征A或者特征B(例如,X或者~X)的相应的数字信息707。数字信号处理器867产生对应于数字信息707的产生识别参数,识别作为初始识别参数的函数的数字信息,并且为分拣系统119提供作为识别的数字信息的函数的分拣信号853。
G.数字脉冲检测
第一处理步骤是由脉冲检测处理器865执行的脉冲检测以确定一个特定的波形是否是对应于细胞的荧光发射31的波形脉冲497。处理器865执行脉冲检测算法,所述脉冲检测算法识别可能表示目标为分拣到一个群组中的颗粒或者由于可能是群组中的杂质而目标为可能被避免的颗粒的样本组。对于牛精子分拣,染料被加入以断开不能生存的细胞的发射31,使得它们相关的脉冲强度为活细胞的强度的1/3。不能生存的细胞不被认为分拣目标或者可能的污染。它们不被认为检测脉冲497。对于高于背景水平的连续数量的样本,通过监测样本的强度来检测来自于活细胞的脉冲497。在该水平与统计确定的阈值交叉后,处理器865跳越到基本为75%的活细胞的期望脉冲497的宽度的更迟的时间。如果该水平仍然在阈值以上,该系列样本被认为是脉冲497。来自于检测脉冲497的样本被移动到由特征抽取处理器867所用的存储块。
统计异常检测手段是可由数字脉冲检测软件747使用的一个实施例,尽管可以预见到,可使用用于识别和/或隔离数字化的脉冲497的其它手段。本质上,来自于从背景检测统计异常的荧光的光检测器117的输出电压信号701的数字样本707被认为是脉冲497的一部分。为了增加强度(以使得噪声检测最小化),可包括附加的暂时标准。
脉冲检测进行如下。当来自于光检测器117的电压输出信号701不是脉冲时,信号701的输入样本707的背景的Mahalanobis距离被计算并且与预先设定的阈值相比较。如果给定样本的距离超过阈值,被认为是脉冲497的可能启动,脉冲检测软件开始缓冲输入样本。如果接下来的预定数量的样本(图25)也超过阈值,脉冲497被认为已经启动和缓冲持续直至符合脉冲结束标准;或者,缓冲被再次设定并且恢复对脉冲的启动检查。尽管在脉冲497中,如果样本在阈值以下,那么它被认为是脉冲可能结束并且缓冲位置被记录(但样本缓冲继续)。如果接下来的预定数量的样本(图25)也低于阈值,脉冲497被认为已经结束并且脉冲497包括到达记录位置的缓冲样本。表V概括了脉冲检测算法,并且图49提供在数字获得荧光脉冲497上的脉冲检测的结果的图示。
 算法:数字荧光脉冲检测
 输入:浮动digSamples的矢量、浮动bkgrndMean、浮动bkgrndSigma、浮动pulseStartThresh、浮动pulseEndThresh、整数numStartSamples、整数numEndSamples
 输出:浮动pulseBuffer的矢量
 程序:1.初始化inPulseFlag=0、pulseStartCount=0、pulseEndCount=02.对于digSamples中的每一个样本,计算背景Mahalanobis距离mhDist[i]=(digSample[i]-bkgrndMean)/bkgrndSigma3.如果inPulseFlag没有设定,去步骤4,其它去步骤6。4.如果mhDist>pulseStartThresh,将样本放入pulseBuffer中,增加pulseStartCount,并且去步骤5;其它设定pulseStartCount=0,去步骤2。5.如果pulseStartCount>numStartSamples,设定inPulseFlag并去步骤2。6.如果mhDist<pulseEndThresh,将样本放入pulseBuffer中,将lastpulseSample设定为当前缓冲位置,增加pulseEndCount,并去步骤7,其它将pulseEndCount设定为零,并且去步骤2。7.如果pulseEndCount大于numEndSamples,返回pulseBuffer[1至lastpulseSample]和离开。
表V.数字荧光脉冲检测的概述
一般地,A/D转换器689将来自于光检测器117的模拟输出信号701转换成表示特征A或者特征B(例如,X或者~X)的相应的数字信息707。数字信号处理器865分析数字信息并且处理器873为分拣系统119提供作为检测的数字信息的函数的分拣信号853。
H.特征抽取和识别
下面的处理步骤是由特征抽取和识别处理器867执行的特征抽取。该处理器响应于由脉冲检测处理器865设定的标记。来自于检测的脉冲的样本被放在与特征抽取处理器867共享的存储器中。对于每一个脉冲497确定诸如区域、脉冲宽度、脉冲高度、Gaussian校正系数和/或其它特征的特征。在一些情况下,脉冲497被确定为“双重的”或者无效的,并且特征不被抽取。对于牛精子201,仅对于具有普通振幅和活X或者Y细胞的宽度的脉冲497抽取特征。通常,活精细胞的脉冲振幅在700-900mV的范围内,尽管该范围也可宽至500-1000mV。在特征被抽取后,它们与为分拣选择的群组限定的特征空间比较。如果特征符合分拣识别的特征空间,接着处理器867设定指示分拣处理器873的正分拣命令的标记。一般地,由识别处理器867进行特定细胞的分类并且由分拣处理器873进行分拣判定。
表示荧光发射31(以及产生它们的相应细胞的特征)的数字信息707基于对于所关注的不同群组在特征空间(由作为轴的n特征形成的n维正交空间)中表现明显不同的统计性能的特定特征或者特点被软件757识别。因此,用于识别的分析数字信息707中的第一步骤是这些特征的计算,一种由处理器867执行的脉冲分析软件749执行的所谓的特征抽取的步骤。表VI列出了几个选择特征,软件749可用于该应用。这些特征的一个或者多个将被选择以形成用于分类的特征空间。应该注意的是,具有附加的提供加强分离的特征以使该列表是示例性的,非全面的。例如,软件749可使用子程序753确定脉冲497的区域和/或可使用子程序755确定脉冲497峰值。
  特征名称  特征说明
  脉冲区域  接近脉冲样本的和(或者平均值)
  脉冲峰值  脉冲样本的最大值
脉冲“内”区域  内TBD脉冲样本的和(或者平均值)(以脉冲平均值为中心)
  脉冲宽度  脉冲中的样本数
脉冲“Gaussianity”  具有相同的2阶统计的Gaussian形状的脉冲的MSE或者校正系数
  脉冲“滞后峰值”  在TBD样本过去峰值(或者平均值)的脉冲值
临界斜度差(CSD)  沿着由具有特征A的颗粒生产的脉冲的第一导数和由具有特征B的颗粒生产的脉冲的第一导数之间的差最大或者接近最大的脉冲的一个点处的脉冲斜度
表VI.用于关于特征抽取的数字脉冲分析中被当前考虑的选择特征的概述
I.缝隙扫描
一般地,由照射系统109提供的椭圆形斑点459测量细胞中的相对DNA含量差。可通过分析由光检测器117检测的荧光发射31的脉冲497的更可能包含被评估的特征的部分来进一步提高分辨率。某些细胞(例如,牛精细胞)的生理现象是X/Y染色体定位在接近赤道区域225中,接近赤道区域225紧挨着细胞201的核213的纵向中线或者赤道或者中心,并且其长度为1微米(见图6)。事实上,X/Y染色体不一定处于核213的中心。这样,可通过将光检测器117的随时间变化的模拟输出701转换成数字信息707以及分析数字信息中对应于荧光发射31的脉冲497的部分(例如对应于从接近赤道区域225发出的光,诸如在脉冲497峰值周围定中心的20-60%特别是20-30%的波形脉冲)的一部分来提高分辨率。
如上所述,缝隙扫描可用于从每一个细胞染色质的一部分而不是从整个染色质获得荧光测量。上述外照射系统415提供的椭圆形斑点459从染色质的特定部分测量细胞中的相对DNA含量差,以提高X细胞和~X细胞相互之间的分辨率。如上所述,缝隙扫描测量技术是聚焦激发光束25以如图6中所示使得聚焦斑点尺寸459的大小远小于细胞直径的荧光测量手段。这样,当细胞通过椭圆形束斑459时利用激光束25扫描细胞201。检测由缝隙扫描照射产生的荧光发射31的光检测器117的输出701产生的所得到的波形脉冲497包含关于荧光沿着细胞201的长度定位的信息。如图45-48所示,当细胞201横穿椭圆形束斑459时,随时间改变的波形脉冲497(红/橙线)是相对束强度(蓝线)和相对发出脉冲强度(当细胞横穿束时对应于椭圆形斑激发的着色的荧光发射并且由于沿着细胞轴线的荧光分配改变而改变)的卷积。
通过一次仅照射细胞染色质的一部分,来自于光检测器117的所得到的随时间变化的模拟输出701包含沿着细胞201的纵向轴线的专用于在染色质内的荧光定位的信息。尽管来自于缝隙扫描的检测的荧光发射31小于来自于由具有相当于细胞直径的斑宽度的束25扫描的检测的发射31,形成来自于具有较低的脉冲振幅的缝隙扫描的波形脉冲497,但是在带有X染色体的细胞和带有Y染色体的细胞之间的大部分差异表现在波形脉冲497的中心20-30%至20-60%中。如果仅图53中的矩形区域725被认为用于识别X-Y精细胞,那么可在与细胞的总DNA含量相比的对应于矩形区域725(由于X和Y染色体存在于该区域内)的染色质的部分内的DNA含量的定位变化之间测量较大的相对差异。例如,牛X-Y精细胞在总DNA含量中的差异为3.8%。来自于X和Y染色体的荧光发射31将被包含在矩形区域725中。如果该矩形区域725计算对应于荧光发射31的总波形脉冲497的20%,那么在该区域内将存在相对DNA含量的14%的差异。通过测量来自于染色质的特定部分的相对DNA含量差异,提高X-Y精细胞差异的分辨率(例如,从3.8%至14%)。图54示出利用缝隙扫描照射和仅处理从脉冲497的中心20%的区域(即图53的矩形区域725)得到的分辨率。图54的直方图使得带有X染色体的细胞和带有Y染色体的细胞的很高百分比(例如,98%)以高的置信度(例如,95%)被识别。相比较,图55的直方图示出当使用标准照射技术可获得的分辨率,说明缝隙扫描对于利用标准照射技术得到的结果有很大的提高。
如图53中所示的可用于获得波形脉冲497的中心部分的区域725的两种手段是如这段将描述的数字化光检测器117的随时间变化的模拟输出701的数字信号处理(DSP)或者如下面描述的利用模拟阈值触发的模拟积分。如这里所述的,DSP处理包括对来自于光检测器117的随时间变化的模拟输出701连续采样以获得对应于输出701的数字信息707以及为数字信息707提供DSP算法以从对应于波形脉冲497的中心部分725的数字信息中抽取特征,诸如区域尺寸,波形脉冲497的中心部分725对应于由于X或者Y染色体存在于不同的细胞201中而造成的DNA含量的差异。作为一个简单示例,利用分析对应于其的数字信息707使得每一个波形脉冲497的总区域的中心20%将被确定。该分析可用于产生诸如图53中所示的直方图。
J.脉冲激光扫描
在一个实施例中,可以预见的是,系统1包括照射细胞的脉冲激光。在该实施例中,缝隙扫描(如上所述)可或者不可被使用。例如,模式锁定固态激光器可用于以50-150MHz的脉冲频率和100-500毫瓦的平均功率输出发射一系列具有1-100皮秒的脉冲宽度发出一系列电磁脉冲。一种适合的激光器是Vanguard350模式锁定固态激光器(来自于Spectra-Physics,Mountain View,CA 94039),它可用于以每秒85000000个脉冲的频率和350毫瓦的平均功率输出发射一系列具有12皮秒的脉冲宽度(持续时间)发出一系列电磁脉冲。由于350mV的功率是以12皮秒的极短脉冲输送的,这样一个激光器的功率输出大于平均功率的几百倍(例如,800倍)。
这样一个激光器的输出可被描述为准连续波(quasi-cw),由于对于许多应用,脉冲重复率足够快以接近连续波(cw)输出。事实上,可以与利用cw激光器操作相同的方式利用quasi-cw激光器操作上述系统。这提供了某些缺点,这是由于固态激光器通常以更高的效率工作,无需过大的冷却系统,并且与大多数其它激光器相比需要很少的维护。
quasi-cw脉冲固态激光器还可利用数字信号处理技术大大提高信号信号噪声比。定时电路可被包括并且能够产生表示激光脉冲到达询问位置115(即,激光束25照射流21)的定时信号。例如,定时电路可是图40中所示的激光脉冲传感器3003以检测对应于包括由每一个激光脉冲和流体流21相互作用产生的散射光和/或包括来自于激光脉冲的光的激光脉冲的光。或者,对于可被触发的激光,触发信号可被提供给微处理器131和/或A/D转换器689以使得微处理器131和/或A/D转换器689与激光脉冲同步,如下面参照图50所述的。在任何一个实施例中,激光脉冲定时可为系统提供时钟信号。
参见图50,时序图表示激光脉冲LP和当细胞通过束斑459和光检测器输出701的数字样本DS时由于激光脉冲LP的重复激发而导致的来自于细胞的荧光发射FE之间的定时关系。如图45-49所示,当细胞通过激光束斑459时,荧光发射31根据细胞中产生荧光发射31的部分的照射量而变化。图50示出当细胞通过流式细胞计1的询问区域115时影响细胞的20个激光脉冲LP1-LP20。每一个激光脉冲LP1-LP20分别对应于荧光发射FE1-FE20,在激光脉冲的基本瞬时激发后荧光发射FE1-FE20指数衰减。
在一个实施例中,微处理器131控制A/D转换器689(见图40)以使转换器689在每一个荧光发射FE1-FE20的峰值或者其附近对光检测器117的输出信号701取样,分别如数字样本DS1-DS20所示。换言之,定时电路使得A/D转换器689的采样率与荧光发射FE1-FE20。颗粒通过询问区域115所产生的数字信号是可由来自于连续波激光器的脉冲波形497的数字化所产生的数字信号的功能等同。如图51中所示,例如,通过在数字样本DS1-DS20中考虑荧光强度以及不考虑在激光脉冲LP1-LP20之间的荧光强度减弱,作为时间函数的荧光强度是脉冲波形497。这允许微处理器131从由脉冲激光产生的数字信号707抽取特征以分析提供荧光发射FE1-FE20的细胞。在一个实施例中,具有2纳秒或者更低的较快响应时间的更敏感的光检测器可被使用以更精确地检测荧光发射。
这样,脉冲激光在流式细胞术系统1中提供的优点是,能够使用低功率脉冲激光获得与以高于脉冲脉冲的平均功率的平均功率操作的cw激光获得的基本相同的分析。另外,来自于脉冲激光的高峰值功率趋于使得荧光团饱和以使荧光发射到达最大,从而减小光检测器的输出信号的信噪比。换言之,利用包含比使得荧光团饱和所需的更多的能量的激光脉冲,激光的输出中的变化不会导致荧光发射31的变化。
本领域技术人员应该理解的是,具有多种使得激光器发射一系列脉冲的方式。应该理解的是,在不脱离本发明的保护范围的基础上,其它脉冲激光器,包括其它模式锁定激光器、Q切换激光器和腔倒空激光器,可代替上述模式锁定激光器被使用。类似地,定时数字采样和处理所得到的信息的许多其它方式从以上的描述中是显而易见的。例如,在不脱离本发明的保护范围的基础上,数字采样可被定时,从而在激光脉冲和数字样本之间存在不同的延迟(或者没有延迟)。类似地,在不脱离本发明的保护范围的基础上,每一个脉冲的数字样本的数量或者在数字采样之间消逝的脉冲数量还可被改变。
K.群组特征的评估
如上所述,流式细胞术可用于基于3.8%的它们DNA含量的相对差异识别带X的牛精细胞和带Y的牛精细胞。通过对用于当着色的细胞通过询问位置115时记录荧光发射31的由光检测器117产生的随时间变化的信号701的特征的分析进行识别。这种相互作用被示出在图45-48中。图45-48示出脉冲波形497如何由在激光束25和着色精细胞201之间的相互作用导致的荧光发射31产生的。发射脉冲497是激发空间函数498和细胞201的发射空间函数的卷积积分。荧光脉冲波形497的特征用于将细胞分为X、Y或者不确定的。在一个实施例中,X-Y识别依赖两个脉冲特征:峰值脉冲高度和脉冲区域。
这些特征被示出在出现于图52和53中的示例脉冲上。图52和53是来自于带X和带Y精细胞的脉冲497的示例。脉冲497是由假设利用具有Gaussian束腰W1(图6)为2微米的椭圆形束斑459的激光束25激发照射和DNA含量差在细胞201的中心20%上均匀分布的计算机模型产生的。这些假设表示以上更详细描述的具有局部DNA差的牛精细胞201的缝隙扫描照射。脉冲497的积分导致在用于X细胞的脉冲区域497和用于Y细胞的脉冲区域497之间的3.8%的平均差异。
能够产生着色细胞和核的脉冲497的峰值和区域特征的直方图和散布图。图56-59包含着色核和活细胞的脉冲区域特征的直方图、着色核和活细胞的脉冲497区域和峰值特征的正散布图。可限制活细胞识别的一些项目并且最终细胞分拣速度在这些图中是显然的。注意的是,图57的活细胞直方图,对于较小的程度,图56的核直方图具有通常属于哺乳动物精细胞的荧光强度直方图的左肩。已经确定的是,左肩是由略微不对准的细胞(即,由于略微偏离最佳对准但不没有脱离以使得来自于精子头部205的窄边209的较亮的荧光发射31被光学系统109收集的产生较弱的荧光发射的细胞)的一个或者多个群组形成的。在活细胞区域直方图中仅可容易地识别一半的X细胞。其余的与Y细胞群组和未对准(unaligned)细胞群组重叠。即使当增加峰值脉冲高度时,如图56-59中的散布图中所示,带X的细胞的分类可被大大限制。
图60-61示出X和Y群组分布的重叠。在图60-61中,四分量计算机模型已经被用于原始数据6000(图60)以评估未对准的细胞(6001、6003)、对准的活Y细胞(6005)和对准的活X细胞(6007)的两个群组的群组统计(图61)。优选作为X和Y群组的方差系数(CV)的一个函数识别X和Y群组。例如,优选使得X和Y群组的方差系数(CV)最小化以提高识别。特别是,当需要分拣的X细胞的群组时,X细胞群组的CV优选小于1.5%,优选为1.3%,优选小于1.3%。通常,精细胞的荧光强度的分布的CV相对于仅两个群组(X和Y)的分布函数已经被考虑。相对于CV的质量控制已经被限制于X和Y群组的CV的粗略的主观评估以判定是否进行连续分析或者是否值得分拣。
根据本发明的一个实施例,微处理器131的一个功能上利用图60-61中所示的四分量模型提供X群组的CV的自动评估。为了评估存在于特征(例如脉冲区域)分布中的群组的CV,需要评估群组分布的2阶统计。这可通过提供一种已知形式的模型并且寻找该模型与所观察的数据的最佳拟合来实现。
给定正常分布数据的期望值,已经选择包括基于非参数密度评估的Parzen Window(利用一种Gaussian kernel函数)接着应用Gaussian混合参数模型的手段。特别是,图60-61中所示的四分量模型包括四个单变量Gaussian分布的和(或者混合),这四个分量是对应于对准的X细胞、对准的Y细胞和两分量未对准的细胞群组的特征分布。表征该模型的参数接着是群组平均数(平均)(4)、群组标准偏差/方差(4)和先验概率(总分布的期望的%)(4)。这12个参数接着可变化以达到模型与所观察的直方图的最佳拟合。对于这样评估的模型分量参数,可根据评估发群组标准偏差和平均数来确定所关注的(特别是,X细胞)的群组的CV的评估:
CV=(标准偏差/平均数)100%
为了减小计算的复杂性,约束已经被置于模型上以减小参数空间的维度。特别是,对应于对准的X和对准的Y群组的模型分量的标准偏差已经被限制以使它们相同。另外,对准的X和对准的Y分量已经被限制以构成总混合的相同百分比-这样,未对准的群组为假设的50%的X细胞和50%的Y细胞。
在模型拟合之前应用非参数密度评估以获得基于原始直方图数据的总密度函数(分量密度的总和)的提高评估。该特定的技术被称为“ParzenWindows”(Duda,Hart,and Stork,2001),由于假设的基础密度的Gaussian和的性质,这里使用Gaussian kernel或者窗口函数。Gaussiankernel的标准偏差被选择为构造直方图框的数量的1%;该数值已经被经验观察以提供适合的但不过大的直方图的平滑。在直方图中的每一个数据点接着使得kernel函数在包含数据点的直方图框上定中心。接着,获得密度评估作为kernel函数的总和。
达到与数据最佳拟合的模型参数的变化所选择的方法被称为期望最大化(见Duda R.O.,Hart,P.E.,and Stork,D.G.,2001,Pattern 2nd Ed.,JohnWiley & Sons;and Moore,A.,“Very Fast EM-based Mixture ModelClustering using Multiresolution kd-trees,”in M.Kearns and D.Cohn,Eds.,Advances in Neural Information Processing Systems,pages 543-549,1999,Morgan Kaufman)。所用的该特定算法实现如下:
1)设定用于模型参数的初始条件。在Parzen密度中的顶部两个局部最大值用作初始Y和X平均位置(被评估为右峰值的幅值的X和Y群组的最大值的初始幅值)。初始X和Y群组方差被评估为在左峰值和右峰值之间出现的局部最小值的右边的数据相对于右峰值位置的方差。另外,初始X和Y群组先验概率被设定为落在该局部最小值的右边的所有点的百分数。接着利用这些参数计算初始的X和Y群组Gaussian密度评估并且从总Parzen密度评估中减去。接着,计算剩余的数据点的平均值和方差并且用于使得两个分量为对准群组模型进行如下的初始化。两个群组平均值被设定(任意地)为相隔5%(在总未对准平均数的上下2.5%)。已知等先验和等方差的设定,接着,分量方差被给出:
σ 1,2 2 = σ tot 2 - 1 4 ( μ 2 2 - μ 1 2 )
其中σ2是方差,μ是各个群组的平均数。
2)利用Parzen密度评估计算分量群组统计(平均数、标准偏差和先验)的更新的评估。利用在框中的Parzen密度评估在统计计算中对每一个直方图框位置加权。另外,每一个数据点有助于使所有分量群组统计计算基于当前的分量群组参数被加权到认为该点属于一个已知的群组的程度。全体成员(membership)的这种程度被确定为在该数据点处已知的分量群组(Gaussion)概率密度值与所有分量群组概率密度值的总和的比。这样,我们具有(对于在该直方图中的所有数据点x,群组cp∈{cx,cy,cz},以及群组参数矢量θp=[μp,σp,Pp])用于更新参数评估的计算的群组分量全体成员,更新参数评估的计算被给出:
P ( c p | x , θ p ) = P p · 1 σ p 2 π exp [ - ( x - μ p ) 2 2 σ p 2 ]
membership ( c p | x , θ p ) = P ( c p | x , θ p ) Σ n ≠ p P ( c n | x , θ n ) · ParzenDensityEstinate ( x )
接着利用由这些全体成员(membership)数值加权的Parzen densityestimate(Parzen密度评估)值计算更新的平均值和方差,更新的先验由在所有数据点上的每一个分量群组的平均全体成员给出的。
3)参数更新程序持续进行直至所有参数达到稳态(即,从一个更新迭代到下一个停止发生很大的变化(或者最大可允许的迭代数出现))。
如上所述,对准的X和Y群组在该程序中被限制以具有相同的方差和先验概率。利用在每一个迭代中通过上述程序计算的X和Y方差和先验值的平均值实现该限制。
或者,类似的建立模型的手段可用于三分量模型(图62-63),其中包括在四分量模型中的两个未对准群组6001、6003的细胞被处理为一个Gaussian分布6011而不是两个截然不同的子群组。未对准的细胞可被模型建立为具有由原始数据6010(如图62所示)的左台肩和左主峰值最佳拟合所确定的平均和标准偏差的三个Gaussian分布(如图63所示)。三群组模型还评估了对准的Y群组6015和对准的X群组6017的统计。三分量模型的一个优点是,它仅需要9维参数空间(与四分量模型所需的12维参数空间相比)。但是,已经发现四分量模型通常产生更紧密匹配原始数据的评估密度函数。
本领域技术人员应该理解的是,多种统计技术可用于评估对准X和对准的Y的群组的特征。这样,在不脱离的本发明的保护范围的情况下,可利用任何参数或者非参数计算机算法实现四分量模型、三分量模型或者其它模型以评估对准X和对准的Y的群组的特征。
L.着色条件的基于CV的选择
几个因素影响将一个群组内的着色细胞分拣到浓缩的细胞子群组中的效率。在这些因素中,一个是在着色群组内的各个细胞子群组之间的差分荧光量。通过染料摄取来影响差分荧光,染料摄取基于着色因素变化,诸如着色剂的浓度、着色时间、着色发生的温度以及与着色剂一起被包括的或者被加到着色混合物的任何添加剂的浓度和数量。因此,这些因素中的一些或者所有可被调节以增大着色细胞的群组的分拣效率(细胞以某些纯度和/或所需细胞最小的损失可被分拣到至少一个浓缩的细胞子群组中的速度)。另外,人们可通过调节每一个样本的这些因素中的一个或者多个来增大多样本分拣系统的效率,从而对抗任何样本与样本的变化。在牛精子分拣的范围内,例如,可通过从一个精子到下一个调节上述着色因素中的一个或者多个来提高分拣效率以对抗公牛与公牛的变化或者在同一个公牛内的样本与样本的变化。
待分拣的细胞群组的已知荧光发射特征的方差系数(“CV”)的确定是一种确定是否应该对着色条件进行调节以达到所需分拣效率的方式。例如,人们可作为从由细胞移动通过询问位置所产生的脉冲波形抽取的任何特征的CV的一个函数调节着色条件,诸如表示总荧光强度或者峰值荧光强度(包括总荧光强度和峰值荧光强度)的任何特征。如上面更详细描述的,CV是可测量的性能分布或者群组特征的均质性或者一致性的标志,例如给定群组的特定子群组的荧光发射特征。可通过用样本平均数除样本的测量特征的标准偏差来确定CV。还可利用流式细胞术系统9自动确定CV,诸如利用上面详细描述的迭代CV评估算法的实现。CV越低,测量特征的分布的均质性或者一致性越大。
当被用于精细胞的着色和分离时,带X和Y染色体的精细胞的样本的特定荧光发射特征的CV可受到着色条件的影响。着色剂的浓度、着色时间、着色混合物的温度和/或添加剂的浓度和数量影响给定荧光发射特征的CV。增大着色剂的浓度、着色时间和着色混合物的温度和/或减小添加剂的浓度和数量将降低CV。这样的条件可被独立或者结合被改变。另外,如果这些因素中的任何一个是这样的,即,使其能够增大荧光发射特征的CV,例如,通过缩短着色时间,接着其它条件中的任何一个或者多个可被调节以使其对第一效应产生反作用,例如,通过增大染料浓度,并且总结果是荧光发射特征的CV减小到足以达到所需分拣效率的水平。因此,通过以这种方式控制这些因素中的任何一个或者任何组合,带X和Y染色体的群组的荧光发射特征的CV可被减小到能够使得精子样本分拣到包括带X染色体细胞的所需百分比纯度的性别浓缩精子的子群组中的数值。
遗憾的是,趋于降低带X精细胞的CV的变化可具有副作用,诸如提高成本或者减小精子的游动性或者生存力。例如,其它条件都相同,优选利用降低的着色剂浓度和较短的着色时间以使得着色工艺对精子的任何有害影响达到最小。注意到这点,人们可预定将达到可接受的分拣效率的CV。接着,待分拣的细胞样本的一部分被着色并且经受流式细胞术分析。该部分的荧光发射特征被确定,并且该部分基于特征被分类到子群组中。荧光特征的CV相对于子群组(浓缩子群组)中的一个的细胞被确定。如果浓缩子群组的细胞的荧光发射特征的CV等于或者小于分拣发生的预定CV,那么细胞样本的其余部分根据该部分被着色的条件被着色。接着,例如样本被分拣,根据这里所述的方法。如果浓缩子群组的细胞的荧光发射特征的CV大于分拣发生的预定CV,那么以一种类似的方式分析同一个样本的另一个部分,但在被认为达到更低CV的着色条件下。在这样一种情况下,例如可通过增加着色时间、增大染料的浓度、增大该部分被着色的温度或者其任何组合来降低CV。这些步骤(即,从待分拣的样本中去除一部分、着色条件的调节和CV的确定)重复直至浓缩子群组的细胞的荧光发射特征的CV被确定等于或者小于预定CV。接着,样本的其余部分因此被着色并且可被分拣,例如根据这里披露的方法。在本发明的一个特定实施例中,细胞样本包括精子样本,并且浓缩子群组的细胞包括带X染色体的精细胞。
因此,本发明的一个实施例是一种评估一组用于分拣细胞群组着色的条件的方法,该群组包括第一类型和第二类型的细胞。所述程序包括:(a)在一组着色条件下利用荧光染料使得细胞群组的一部分着色;(b)当着色的细胞以速度R通过流式细胞计的询问位置时使得着色细胞暴露在电磁辐射下;(c)确定暴露的细胞的荧光发射特征;(d)利用确定的荧光特征将暴露的细胞分类成两个或者多个细胞的子群组,其中一个子群组是第一细胞类型的浓缩子群组;(e)确定浓缩子群组的细胞的荧光发射特征的变异系数;以及(f)确定在细胞被着色的情况下改变任何着色条件或者着色的细胞通过流式细胞计的询问位置的速度R。在另一个实施例中,在一组不同的着色条件下对细胞群组的另一部分着色并且对于该部分重复步骤(b)至(e)。该方法可在两个、三个、四个或者任何数量的附加部分上执行。在另一个实施例中,同时从样本抽取多个细胞部分。每一个部分可被同时着色或者在前面的部分通过流式细胞计后可使得每一个被着色。在前一种情况下,每一个部分可在其自己独特的一组着色条件下被着色并且步骤(f)可包括利用各个CV确定待用于对附加的细胞着色的一组着色条件。在后一种情况下,随后着色的部分的着色条件可根据步骤(7)的确定相对于在前分析的部分被改变。在一个实施例中,该方法被重复直至CV被确定为等于或者小于特定CV(例如1.3%)。
或者,在人们已经预定可接受的分拣效率将被达到的CV后,整个细胞样本可被着色。细胞样本的一部分被去除并且经受流式细胞术分析。该部分的荧光发射特征被确定并且用于将细胞分类到两个或者多个子群组中。相对于浓缩子群组的细胞确定荧光发射的CV。如果浓缩子群组的细胞的荧光发射特征的CV等于或者小于分拣发生的预定CV,那么细胞样本的剩余部分接着被分拣。如果浓缩子群组的细胞的特定荧光发射特征的CV大于分拣发生的预定CV,那么以一种类似的方式分析同一个样本的第二部分并且确定同一个荧光特征的CV。例如可通过增加着色时间、增大染料的浓度、或者其任何组合来降低第二部分的CV。这些步骤(即,从待分拣的样本中去除一部分和CV的确定)重复直至浓缩子群组的细胞的荧光发射特征的CV被确定等于或者小于预定CV。接着,样本的其余部分因此被着色并且可被分拣,例如根据这里披露的方法。在本发明的一个特定实施例中,细胞样本包括精子样本,并且浓缩子群组的细胞包括带X染色体的精细胞。
因此,本发明的另一个实施例是一种评估一组用于分拣细胞群组着色的条件的方法,该群组包括第一类型和第二类型的细胞。所述程序包括:(a)在一组着色条件下利用荧光染料使得细胞群组的一部分着色;(b)当着色的细胞以速度R通过流式细胞计的询问位置时使得着色细胞暴露在电磁辐射下;(c)确定暴露的细胞的荧光发射特征;(d)利用确定的荧光特征将暴露的细胞分类成两个或者多个细胞的子群组,其中一个子群组是第一细胞类型的浓缩子群组;(e)确定浓缩子群组的细胞的荧光发射特征的变异系数;(f)确定在细胞被着色的情况下改变任何着色条件或者着色的细胞通过流式细胞计的询问位置的速度R;以及(g)为细胞群组的区域部分提供改变的着色条件。在另一个实施例中,对于细胞群组的至少一个其它部分至少一次重复步骤(a)至(f)。步骤(a)至(f)可重复一次、二次、三次、四次或者更多次数。在另一个实施例中,同时从样本抽取多个细胞部分。每一个部分可被同时着色或者在前面的部分通过流式细胞计后可使得每一个被着色。在后一种情况下,随后部分的着色可根据步骤(7)的确定相对于在前分析的部分被改变。在另一个实施例中,该方法还包括在步骤(g)之前,选择产生最低的荧光发射特征的方差系数的改变的着色条件。在另一个实施例中,该方法包括步骤(a)至(e)的重复直至至少一个部分的荧光发射特征的方差系数为1.3%或者更低。在本发明的另一个实施例中,该方法还包括在步骤(g)之前,选择产生1.3%或者更低的方差系数的改变的着色条件。
如上面详细描述的,在分拣整个样本之前,除了执行这样的分析以外,可进行类似的分析同时尽量使得样本的着色和分拣发生以保证分拣效率的维持。因此,在另一个实施例中,已经在前被着色的样本的一部分或者在该方法中待分拣的所述样本的一部分的浓缩子群组的细胞的荧光发射特征的CV如上所述被确定。根据上面关于预分拣调节描述的方法对这些样本被着色的着色条件进行调节。
可接受的分拣效率将被达到的预定CV的选择基于几个因素,例如包括待分拣的细胞类型、分拣速度和相对于群组分拣成浓缩的子群组所需的纯度。一般地,选择CV使得分拣达到所需的浓缩子群组的百分比纯度同时使得达到所需的浓缩子群组的百分比纯度的所用的时间最小,例如,达到浓缩子群组的85%的纯度同时使得着色时间最短。考虑到这些因素,浓缩子群组的细胞的荧光发射特征的CV一般在2.0%和1.0%之间,优选在1.5%和1.0%之间、优选为1.4%、优选为1.3%。
M.临界斜度差特征抽取
用作细胞分拣器的一部分的如图40中所示的带有数字信号处理(DSP)的微处理器131′能够抽取分辨荧光发射脉冲的时间的特征,特别是利用模拟技术不易或者不能廉价获得的特征。特别是,表现非线性并且大大提高颗粒A和B(例如,提高活的对准的X精细胞的识别)的分离度以及分辨率的脉冲特征是一个被称为临界斜度差(CSD)的特征。CSD是荧光发射脉冲在由颗粒A(例如,带X的细胞)产生的脉冲的第一导数和由颗粒B(例如,带Y的细胞)产生的脉冲的第一导数之间的差接近最大值的信号振幅处的斜度的量化。
利用作为时间函数的信号振幅描述荧光发射脉冲的函数可表示为:y=x(t)。在检测CSD特征的范围内,利用作为信号振幅的函数的脉冲持续时间描述荧光发射脉冲的函数可被限定。该函数可被称为M函数。利用下面所示的变换荧光发射脉冲函数可得到M函数。
荧光发射脉冲函数:y=x(t)
M函数:t=M(y)
t=脉冲持续时间
y=信号振幅
常规X和Y牛精细胞的M函数的比较表示CSD特征的识别功率。图64的顶部板条表示带X或者带Y的精细胞的平均M图表。图64中的中间板条示出小于平均的带Y的荧光发射脉冲的峰值高度的用于信号振幅值的这些平均M图表(即M′)的第一导数的图表。在该图中可以看出,当信号振幅接近带Y脉冲的平均峰值高度时,第一导数(M′Y和M′X)之间的差大大增加。绘制在图64的底部板条中的是作为信号振幅的函数的第一导数(M′x-M′y)之间的差。该CSD特征量化了在出现第一导数中的最大差的区域附近的一个脉冲的M的斜度(M′)(或者在荧光发射脉冲函数上的对应点处的斜度)。为了识别带X和带Y的精细胞,如图62-63中所示,在脉冲的前沿与CSD阈值相交的点处确定每一个脉冲的CSD。在一些实施例中,CSD可取决于照射束的特征,诸如束宽度,无论束上连续的或者脉冲的。下面参照图65描述一种用于确定CSD的算法。
图64示出在一些情况下CSD特征具有非线性,诸如在分拣X-Y精细胞群组的情况下。当CSD阈值接近Y脉冲的峰值时导数之间的差(M′x-M′y)增大。该差异的非线性特征使得未对准的细胞和对准的Y细胞的平均值低于在CSD特征空间中的对准的X细胞的平均值。对准的X细胞的CSD特征空间中的标准偏差基本不受影响(即,与在峰值或者区域特征空间中看到的类似)。它是增大可被精确识别的对准的X细胞的数量的CSD特征的该非线性高增益性质。
图65示出一种用于确定给定脉冲的CSD值的计算有效方法。CSD阈值可作为荧光发射脉冲的峰值高度的函数被确定。特别是,它可基于荧光发射脉冲的平均峰值高度被确定。CSD阈值被维持在来自于活的对准细胞的脉冲峰值的约25%落在阈值或者其以下的点处。因此,在基于连续峰值高度分布分拣的过程中CSD阈值被动态调节(即,相对于平均峰值高度)。例如,阈值可基于峰值高度的加权连续平均值(较新的测量提供比较旧的测量更多的加权)。CSD值是通过脉冲上的两个点的线的斜度。这些点是CSD脉冲阈值和脉冲峰值。这样,在该实施例中,CSD值仅是在脉冲前沿和CSD阈值的相交部分处的脉冲波形497的斜度的近似值。但是,关于给定脉冲的其它计算CSD的方法是显而易见的,如果需要的话,其中一些可提供更精确的CSD值。
在另一个实施例中,CSD阈值作为颗粒子群组的CSD特征抽取的CV的函数被动态调节。例如对于分拣精细胞,通过从较低水平增加CSD阈值(例如,脉冲检测阈值),CSD阈值将达到使得Y细胞的CSD的CV大大增加但仍然足够低以致于X细胞的CSD的CV的增加远低于Y细胞中的CV增加的水平。当一个子群组分散在总CSD分布中时该效果可在CSD分布中被观察。可通过使得CSD阈值保持在该水平来达到CSD特征的良好识别。
应该注意的是,在流式细胞术中使用缝隙扫描技术可增大CSD特征的识别功率。束斑459的形状可影响脉冲波形497的形状。例如,使用具有较小宽度W1的束斑459,在样本颗粒中的局部荧光差异(例如,由于X或者Y染色体在精子核213的中心区域225中而导致的局部荧光强度差异)对脉冲波形的第一阶导数产生较大的影响。因此,本发明的一个实施例包括缝隙扫描技术与CSD特征抽取结合使用。相反,使用具有太大的束腰(例如,等于或者大于颗粒的直径)的激光可防止CSD特征有效使用以识别颗粒。聚焦照射束的束腰的宽度的可接受的范围将取决于多个因素,包括颗粒的尺寸和形状、被分析的颗粒内的染料分布和被识别的颗粒的典型波形脉冲之间的差异量。对于精细胞,从利用具有小于3微米的束腰的激光激发牛精细胞201产生的波形脉冲497进行CSD特征抽取如下面所示将工作得很好。当然,利用在缝隙扫描部分中描述的任何形式的缝隙扫描进行的CSD特征抽取被认为在本发明的该方面的范围内。
利用CSD特征大大增加系统的产量,特别对于分拣X-Y精细胞群组,这是由于它允许更多的对准的X细胞的收集。由于在峰值相对于区域或者上升时间相对于区域的特征空间中被限定的群组中的重叠,可以约或者大于85%的可靠性识别不大于70%的对准的X细胞。当使用CSD特征时,95%或者更多的对准的X细胞可被识别,从而在不使得收集的X细胞的群组的纯度降至所需纯度以下的情况下大大增加可被收集的活X细胞的百分比。
这在图66-69中所示的活细胞数据中被图示。CS特征的非线性使得X细胞被隔离以分拣。在施加在图68所示的散布图中CSD上的粗选导致70%的纯X区域群组。当双变量分拣识别用于该区域和CSD特征空间(图68)中时,>95%的对准的X细胞可被识别以分拣。图66-69中的数据在四个通道细胞计数系统(见下面描述的多通道系统)的一个通道上以每秒22000个活细胞的总细胞处理量被收集。即使能够进行重合检测(高纯度),可以至少85%的纯度每秒收集超过6000个X细胞。
图66-69示出当用于识别带X和带Y精细胞时的CSD特征的一个优点。图66和67是图68和69所示的散布图中限定的特征空间的荧光发射脉冲的区域特征的直方图。在图68中,CSD特征已经将大部分未对准的和对准的Y细胞从散布图的显示中移出。这在散布图的框中留下了70%的纯X群组,这是在图66中的脉冲区域直方图中所示的。非CSD识别被示出在图69中所示的脉冲区域/上升时间散布图中。对准的X细胞构成了相应区域直方图的30%(图67)。利用识别的CSD特征可使得大于95%的对准的X细胞以大于85%的纯度被收集。通过比较,可利用右边的传统特征空间使得不大于70%的对准的X细胞被识别。
利用CSD相对于脉冲区域、双变量识别技术已经完成了几种活细胞分拣。图70是表示设定在该二维特征空间中的分拣区域如何用于排除未对准细胞和Y细胞的一个示例。图70示出设定在CSD相对于脉冲区域散布的散布图上的双变量分拣区域。注意分拣区域如何在高CSD值的区域特征上降低(CSD从左向右增大并且区域从底部到顶部增大)并且当CSD降至较低的数值时在区域特征上上升。在上述CSD相对于脉冲区域散布的散布图上设定的双变量分拣区域用于在输入活细胞速度为每秒26000个的情况下以大于每秒6000个X细胞的分拣判定速度分拣X细胞。基于流式细胞术重新分析的纯度为87%。
CSD特征能够制订高产量非重合中止(即,重合接受或者高回收)分拣策略。在一些实施例中,脉冲特征可提供接近基线分离以及活X和Y精细胞的100%的准确分类。该条件能够在不中止包含被分类为X和非X(不确定的或者Y)的细胞的液滴的情况下以很高的速度分拣细胞。该分拣策略被称为高回收或者重合接受策略。利用CSD特征进行一个试验来测试其。在四通道流式细胞计的一个通道上以每秒12000个活X细胞的输入速度进行重合接受分拣。77%的X细胞完全被对准,每秒使得4600个X细胞可能用于分拣。在这些条件下,每秒4300个细胞被分拣到X细胞群组中。随后的纯度分析表明在不对死细胞校正的情况下该分拣的纯度大于87%以及在对死细胞校正的情况下该分拣的纯度为89%。紧接着在相同的条件下在该分拣后执行高纯度重合拒绝检测分拣。观察到每秒3500个细胞的收集速度。纯度分析表明在不对死细胞校正的情况下该分拣的纯度为92%以及在对死细胞校正的情况下该分拣的纯度为94%。
上述试验的结果表明,在以每秒12000个活X细胞的速度输入时,可以大于85%的纯度收集大于92%的对准的X细胞。这表明CSD特征提供所有对准的X细胞的95%的准确分类。在这些情况下,细胞分拣器的产量主要受到正确细胞排列的限制。
图71示出用于其中左板条对应于高回收/重合接受分拣策略(无重合中止策略)以及右边板条对应于高纯度/重合拒绝接受分拣策略(重合中止策略)的测试的流式细胞术再次分析的一个实施例。左板条(87%的纯度)对应于在没有重合中止的情况下每秒4400个X细胞的输出。右边板条来自于在相同条件下完成的分拣,不同之处在于包含污染细胞的液滴被中止。该分拣的纯度为92%。这些分拣说明当CSD用于识别时高回收无重合中止分拣是可能的。
CSD特征的使用不限于精细胞或者任何特定种类的精细胞的分拣。本领域技术人员根据上面披露的内容可以看出,CSD特征可适于提高在产生具有不同的第一阶导数特征的信号没吃的任何颗粒群组之间的识别,而与产生这种差异的原因无关。
N.识别
在脉冲的特征已经被脉冲分析软件749抽取后,利用由处理器867执行的脉冲识别软件757完成脉冲的识别(例如,分类),所述脉冲识别软件757使用诸如Bayes Minimum Risk判定规则的逻辑应用。该规则是允许关于进行不同错误分类(例如识别)判定的不同成本的分配(和调节)的BayesMinimum Error判定规则的变型。
Bayes Minimum Error计算判定边界763或者判定表面作为等于在特征空间中的群组之间的后验概率的表面。对于(假设)Gaussian概率分布,该表面一般是二次方的,尽管在某些条件下也可是线性的(或者能够很接近超平面)。首先通过计算在特征空间中的给定点的后验概率(一般根据类别调节概率密度或者利用Bayes规则的已知的/假设的后验概率)接着为具有最高的后验概率的群组选择类别标记来进行分类(例如识别)判定。
Bayes Minimum Risk包括当需要分配造成不同分类错误的不同成本(例如,将“Y”细胞分类成“X”细胞比将“X”细胞分类成“Y”细胞可能成本更高)时允许调节判定边界763的因素。在本申请中,这允许在分拣的样本纯度和回收之间的权衡。在该判定规则中,将每一个可能的分类际记分配给特征空间中的一个点的“危险”被计算为在每一个群组中的全体成员的后验概率乘以关于被分类成在每一个其它群组中的当前群组给定的真实的全体成员的成本的总和。表6概括了Bayes Minimum Error分类的程序。注意的是,对于多变量Gaussian密度,获得后验概率的Bayes规则的评估可被减小到表VII中所示的二次函数的评估,已知的是,系数W、w和w0为在表3中给出的识别算法参数初始化程序中计算的。图74示出利用该程序分类的一个图表示例。左边的示意图是两个群组1和2以及分离群组的判定边界763的示意图。右边的直方图示出限定X和Y区域的两组同心椭圆,其中判定边界763为由椭圆的相交部分限定的线。
  算法:Bayes Minimum Error荧光脉冲分类(识别)
  输入:对于每一个分类群组i的浮动pulseFeatures的矢量:浮动Wi的矩阵、浮动Wi的矢量、浮动Wi0
  输出:整数classLabel
  程序:1.对于每一个分类/群组i,计算识别函数gi的数值:gi=pulseFeaturest·Wi·pulseFeatures+Wi t·pulseFeatures+Wi02.对于每一个分类/群组i,计算危险函数riski的数值:初始化riski=0,接着对于每一个分类/群组j:riski=riski+costij*gi3.找到j s.t.=min(riski)_i。返回classLabel=j并且退出。
表VII.利用Bayes Minimum Error判定规则的数字荧光脉冲分类(识别)的概述
对于附加的加强,在数字荧光脉冲的分类中采用附加的步骤。计算特征空间中的脉冲与通过Bayes Minimum Error分配的群组的Mahalanobis距离,如果大于一个阈值,那么该脉冲被标记为“不被分类”或者其它一些表明其不可能是任何已知的群组中的一员的适合的指示。图75示出该附加步骤的效果,再次使用了根据数字获得的荧光脉冲数据计算的特征。
一般地,A/D转换器689将来自于光检测器117的模拟输出信号701转换成表示特征A或者特征B(例如,X或者~X)的相应的数字信息707。数字信号处理器865从数字信息中抽取特征并且处理器873为分拣系统提供作为被抽取的特征的函数的分拣信号853。
O.分拣分类和液滴同步
第四个分拣处理器873管理液滴分类、执行分拣策略并且输送与分拣所选择的液滴同步的分拣触发脉冲853。该处理器873接收来自于识别处理器867的细胞分类信息并且使得该信息与液滴产生时钟703相关联(即,使得分拣到群组中被分类的颗粒的位置与液滴的形成一致)。它确定在液滴中是否存在重合并且管理基于预定分拣策略的重合。它维持所有细胞分类的FIFO和设定在当实时观察颗粒时和当颗粒到达最后达到的液滴时之间的校正延迟的液滴分拣判定。它将对于每一个分拣选择的液滴产生极性和振幅适合的适当定时的输出脉冲853。
一般地,A/D转换器689将来自于光检测器117的模拟输出信号701转换成表示特征A或者特征B(例如,X或者~X)的相应的数字信息707。数字信号处理器867识别表示特征A或者表示特征B(例如,X或者~X)的数字信息707并且为分拣系统119提供作为识别的数字信息的函数的分拣信号853。
一般地,数字信号处理器863、865、867、873包括用于检测由数字信息表示的波形脉冲的指令、用于在检测的脉冲中抽取特征的指令和用于识别作为它们的抽取特征的函数的检测脉冲的指令。另外,处理器包括用于限定在表示特征A的抽取特征和表示特征B的抽取特征之间识别的判定边界763的指令。另外,处理器863、865、867、873可相对于表示特征A的抽取特征和相对于表示特征B的抽取特征作为下列至少一个因素的函数调节判定边界763的相对位置,这些因素包括:这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。例如,处理器可移动判定边界763以包括小于群组1和大于群组2,或者反之亦然,基于特定样本的输出或者基于所需输出(例如,如上面关于调节不同成本的判定边界的Bayes Minimum Risk判定规则)。
P.漂移补偿
已知的是,对应于荧光发射的波形脉冲可随时间变化或者随时间表现偏移(由于着色差异、温度变化、样本老化和/或其它因素,例如),该系统可使用限定动态阈值的漂移分析软件761(图72),所述动态阈值变化以补偿任何漂移效果。特别是,对于信号背景特征中的任何缓慢的变化,软件747所使用的脉冲检测阈值可被调节,并且软件757的识别算法可调节判定边界763(图74)以说明特征空间中的群组中的任何漂移。
对于脉冲检测软件747所使用的算法,漂移补偿软件761通过基于在终止于当前样本的给定长度的样本(例如10-100个样本)的移动窗内计算的样本统计评估更新背景平均值和标准偏差评估来完成漂移补偿。已知相对于数据获得频率的慢(假设的)漂移速度,对于每一个样本,背景统计无需被更新;相反,背景统计更新可周期性发生(例如,每6秒;见参考标记795和图82)。另外,窗可包含小于1的加权以在统计计算中提供相对于较新的样本对较旧的样本去加权的“忘记”速率。图76示出在没有和具有“忘记”速率的情况下在移动窗内的统计(平均值)计算的概念。
与检测算法漂移补偿类似,脉冲识别软件757所使用的识别算法通过在特征空间中的群组的2阶统计的周期性更新来实现漂移补偿。但是,在这种情况下,仅使用被分配给给定群组的脉冲的那些特征值来更新群组的统计。另外,可使用非1的加权以包括“忘记”速率。图77示出将该技术用于特征空间中的群组的效果的概念图。图77示出对于特征空间中的群组统计的漂移补偿的一个示例。黄色表示群组1(X)、绿色表示群组2(Y),菱形表示分类平均评估(具有漂移的放大图示),块箭头表示在恒定σ椭圆的变形中反映的群组协方差评估中的变化。
一般地,数字信号处理器863使用分析数字信息的检测阈值,该阈值是在终止于当前样本的移动窗内计算的取样随时间变化的输出信号的背景平均评估和标准偏差的函数。
Q.全数字技术相对于模拟技术的优点
使用全数字分拣系统的一个主要优点是,没有关于脉冲检测和分析的“停滞时间”。对于模拟系统,总有在脉冲发生和检测后重新设定电子器件所需的有限的“开关时间”。该时间通常为至少1微秒。由于数字系统俘获连续流,因此它实际上没有停滞时间。
数字系统的另一个优点是围绕分拣分类脉冲及时前后观察的能力。一般地,数字信号处理需要5个液滴时段用于分析。优选,在液滴照射115和液滴信息107之间的时间延迟为7个液滴时段。这使得该系统基于由特定颗粒的特征表示的它将污染可用的群组的概率以及基于特定颗粒与另一个分类颗粒的接近程度对特定颗粒进行分类。作为一个示例,分拣处理器873可拒绝观察到的具有50%的概率为活X细胞的颗粒,而分拣处理器873可接受观察到的当该颗粒与观察到的具有95%的概率为活X细胞的第二颗粒相符的具有50%的概率为活X细胞的颗粒。
R.模拟细胞分析
还预见到,来自于光检测器的随时间变化的输出信号可被模拟电路819处理,诸如场可编程门阵列,其成本低于数字细胞分析器。图42是可作为本发明所涉及的系统的一部分所使用的模拟细胞分析器的一个实施例的框图。图53图示了模拟分析。设定阈值以基于脉冲高度产生触发脉冲。该阈值断开接通模拟积分器的积分窗以积累电荷。该窗在固定时段内保持断开状态或者直至脉冲振幅降至触发脉冲阈值以下。这样,仅在积分窗内的脉冲部分的区域用于相对荧光测量。
参见图42,光检测器117的输出701被提供给使得与液滴时钟703同步的输出信号701积分的积分器825。积分信号被提供给宽度/区域比较器827以将积分信号的水平与限定脉冲的阈值水平进行比较(例如,脉冲可被定义为具有某一阈值的40%的积分信号)。动态阈值计算器829的功能类似于上述的漂移补偿,它监测积分信号水平并且它改变阈值水平,其中宽度/区域比较器用作平均积分信号水平的变化的函数。
脉冲识别信号被提供给窗比较器837以确定脉冲区域在可接受的范围内。脉冲识别信号也被提供给脉冲宽度和触发逻辑电路839以确定脉冲宽度在可接受的范围内。如果区域和宽度是可接受的,逻辑为表示分拣判定841的I/O控制器843提供触发信号。这样,窗比较器837和脉冲宽度和触发逻辑电路839对于细胞是否应该被分类为X细胞或者~X细胞作出判定。
I/O控制器843为分拣控制器板847提供以X或者~X信号的形式的分拣判定841。I/O控制器843还包括用于连接PC735的通用串行总线(USB)接口849,并且可具有用于连接其它通道的从属控制器845的I/O端口。模拟细胞分析器还包括用于为宽度/区域比较器、窗比较器和脉冲宽度和触发逻辑编程的接合测试存取组(JTAG)端口833。
还可预见的是,模拟细胞分析器可与数字细胞分析器705同时使用。例如,模拟分析器可用于调节由数字分析器使用的电压阈值。另一方面,数字分析器可用于识别脉冲的各个特征并且该特征信息可用于配置模拟细胞分析器,特别是如果它以门阵列的形式实现。
控制策略
一般地,微处理器131被编程以执行能够在处理量和/或所需的颗粒损失方面使得系统1的效率达到最佳以符合分拣产品的任何成本要求的控制和分拣策略。例如,这可包括平衡至少一个收集的群组的高纯度的需要和从被分拣的样本回收所希望颗粒的至少最小百分比的需要。达到这样一个平衡是重要的,特别是在成本和收益率是重要的考虑因素的商业应用的范围内。
因此,微处理器131执行控制策略,所述控制策略是控制诸如流体输送量和/或分拣参数的系统变量的一系列指令和/或算法。微处理器还执行一个分拣策略,分拣策略限定用于确定如何分拣每一个颗粒或者颗粒组的判定方法。每一个特定的控制策略可使用一个或者多个分拣策略。各个分拣策略可根据诸如所选择的控制策略、颗粒检测系统和/或关于流体流中的颗粒分布的信息的因素被使用。
关于颗粒分布,图78示出包含颗粒示例性分布的流体流。在该特定示例中,利用与上述喷嘴类似的喷嘴形成流,所述流包含具有不同特征A和B(例如,X和Y精细胞)的颗粒的混合物。如图所示,细胞通常是在一列中一个跟着另一个,可被看作包括连续的颗粒组。这些组包括每一个包含具有特征A(例如,表示活X精细胞)的一个或者多个颗粒的第一颗粒组、每一个包含具有特征B(例如,表示活Y精细胞、更具体的,非活X细胞的精细胞(~X),诸如Y细胞、或者死X或者Y细胞)的一个或者多个颗粒的第二颗粒组以及每一个包含其中至少一个具有特征A和其中至少一个具有特征B的两个或者多个近间隔的颗粒(例如,一个或者多个X精细胞和一个或者多个~X精细胞)的第三颗粒组。第三颗粒组下面也被称为“重合”颗粒组。
无论一个特定颗粒被认为自身构成一组或者另一组的一部分都将主要取决于其空间位置和/或相对于相邻颗粒的间隔。例如,在液滴分拣系统中,各个颗粒组将由液滴中的颗粒限定。在其中激光用于除去(杀死或者破坏)所选择的颗粒组以提供具有所需含量的收集的群组的光破坏分拣系统中(如在下面的“光破坏分拣”系统段落中描述的),各个颗粒组将由颗粒的空间接近度限定,即,颗粒之间的空间间隔是否足以能够对颗粒进行精确的分类和/或能够在不除去一个或者多个所需颗粒的情况下利用激光除去一个或者多个不需要的颗粒。类似地,在其中包含所选择的颗粒的流的部分被转向以提供具有所需含量的收集的群组的流体切换分拣系统中(如在下面的“流体切换分拣”系统段落中描述的),各个颗粒组将由颗粒的空间接近度限定,即,颗粒之间的空间间隔是否足以能够对颗粒进行精确的分类和/或使得所选择的颗粒转向。
从上述内容中可以观察到,提供给不同颗粒组的分拣判定可被改变,取决于系统的所需结果或者处理量。例如,在液滴分拣系统中,所用的分拣策略可取决于“重合”液滴的处理,即,包含第三颗粒组的液滴。例如,在这里所述的流式细胞术液滴分拣系统和方法中对牛精细胞的处理中,为了增强在至少一个收集的群组中的X精细胞的数量,可优选使用这样一种策略,其中包含X精细胞的每一个重合液滴被接受和分拣好像它仅包含一个X精细胞,即使该液滴也可包含一个~X精细胞(重合接受策略)。另一方面,为了增强在所述群组中收集的X精细胞的纯度,可优选拒绝包含~X精细胞的每一个重合液滴即使该液滴也可包含一个X精细胞(重合拒绝策略)。一般地,如下面所述的,具有许多可用于使得颗粒的处理量最大化的控制策略以及许多可与每一个特定控制策略结合使用的分拣策略。可利用流式细胞术使得策略应用到各个分拣技术,例如液滴分拣、光破坏分拣和流体切换分拣。另外,上述策略可用于根据颗粒的任何所需特征分拣任何类型的颗粒。
根据一个实施例,微处理器控制作为系统的其它变量的函数的流体输送系统输送包含颗粒的流体的速度。例如,微处理器可作为所需输出结果的函数控制流体输送速度。由于微处理器确定每一个颗粒的身分并且确定其是否涉及至少一个收集的群组,因此微处理器可通过改变控制策略和/或通过改变分拣策略确定和控制输出结果。所需输出结果通常可被定义为下列至少一个:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度(“高回收”);以及(2)在所述至少一个群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量(“高纯度”)。作为另一个示例,系统可使用基本恒定的流体输送速度,并且微处理器可作为所需输出结果的函数控制分拣参数。在该后一个示例,所需输出结果通常可被定义为(1)在至少一个收集的群组中的颗粒的纯度和(2)可用于流中但不被包括在所述群组中的所需颗粒量(“恒定流速”)的结合。
一般地,假设当分拣两个群组时被识别的细胞可具有成为一个群组或者另一个群组的一部分的50/50的概率。但是,还可以预见到,未被识别的细胞可能实际上具有除了成为一个群组或者另一个群组的一部分的50/50的概率以外的其它一些概略。这其它的概略可由实验分析或者其它关于被分拣的样本的特征来确定。
下面详细讨论几个不同的控制策略。
A.高回收控制策略
一种控制策略可被称为“高回收”控制策略。该策略的目的是,使得被分拣到所需颗粒的群组中的所需颗粒的数量达到最大,只要群组的纯度为可接受的纯度或者在其上。
按照该策略,上述第一颗粒组被分拣到所需颗粒的群组中,这是由于这些组中的每一个都包含具有所需特征A的一个或者多个颗粒。第三颗粒组也被分拣到所需颗粒的群组(重合接受)中,这是由于这些组中的每一个也都包含具有所需特征A的一个或者多个颗粒,虽然附有具有特征B的一个或者多个颗粒。另一方面,第二颗粒组被拒绝(即,不被分拣到所需颗粒的群组中),这是由于它们不包含具有所需特征的颗粒。为了利用该策略使得处理量达到最大,微处理器增大流体输送,只要收集的群组的纯度为可接受的纯度或者在其上。反过来说,流体输送速度增大,只要所需颗粒的群组的污染的可能水平为可接受的水平或者在其上。
作为一个示例,考虑用于分拣在图78的流体流中的X和Y精细胞的高回收控制策略的使用。所需的结果可是将所有X细胞分拣到X细胞的群组中,只要群组保持在可接受的纯度或者其上,例如,只要X(X+Y)大于85%或者其它一些可接受的水平。为了达到该结果,第一颗粒组被分拣到X细胞群组中,这是由于它们仅包含一个或者多个X细胞。第三颗粒组也被分拣到X细胞群组中,这是由于它们也包含一个或者多个X细胞,即使它们也可包含Y或者(~X)细胞。第二颗粒组被分拣到其它一些群组中,这是由于它们不包含一个或者多个X细胞。在该示例中,流体输送系统输送包含颗粒的流体的速度可持续增大,只要X细胞的群组的纯度大于85%。相反,如果X细胞的群组的纯度低于85%,流体输送速度减小。
在液滴分拣系统的范围内,从Poisson′s等式中可以得知,对于任何给定的液滴发生速度,当细胞输送速度增大时多细胞液滴的数量将增大。换言之,增大包含细胞的流体的输送速度将增大多细胞液滴的数量。因此,如果使用重合接受分拣策略并且包含第三颗粒组的重合液滴被分拣到所需颗粒的群组中,增大流体的输送速度将导致被收集的群组的纯度减小,这是由于流体的输送速度较高,更多的重合液滴被产生和收集。图79示出对于两(2)颗粒流体的该结果以使100%的所需颗粒被俘获。如图所示,以很低的流体输送速度(沿着x轴的FDR),所导致的收集的群组的纯度(y轴)很高,这是由于极少的包含第三颗粒组的重合液滴被产生和收集。当流体输送速度增大时(FDR沿着x轴向右边增大),所产生的重合液滴的百分比增大,使得更多的重合液滴被收集和减小可用群组的纯度(沿着y轴)。在该所示的特定的示例中,在80%的纯度下,流体输送速度为30K颗粒/秒。
使用高回收策略的结果可是戏剧性的,如由其中利用液滴分拣方法使得X和Y精细胞被分拣的一个简单示例所示。假设,例如液滴以60K/sec的速度产生,并且精细胞以30K/sec的速度被输送到询问位置。根据Poisson′s等式,如果所有包含X细胞的液滴被分拣到X细胞的群组中,包括包含X和Y细胞的重合液滴,每秒约15000个X细胞将被收集。收集的群组将包含2600个Y细胞,群组中关于X细胞的纯度减小到85.2%。但是,收集的X细胞的数量(15000)表示相对于重合液滴不被收集的策略的大大增大,如在下面描述的高纯度策略中或者模式中。在高纯度模式中,以40K/sec的液滴频率和40K/sec的细胞输送速度操作(比在上述的高回收描述示例中的大10K/sec),每秒仅约11800个X细胞将被收集,或者比在高回收策略中少3800个X细胞。例如,当使用高纯度策略时,约损失或者浪费9200个X细胞,这是由于重合液滴没有被分拣在X细胞的群组合作。因此,如果小于100%的纯度是可接受的,优选可使用高回收模式以增大被收集的X细胞的数量或者反过来说,减小X细胞损失的数量。
概括地,在利用重合接受分拣策略的高回收控制策略中,颗粒输送速度相反地涉及所需颗粒的收集群组的纯度(有时被称为“可用”的群组)。
B.高纯度控制策略
第二种控制策略可被称为“高纯度”控制策略。该策略的目的是保持收集的群组相对于具有所需特征的颗粒的纯度在高水平,只要在收集的群组中的所需颗粒的量相对于可用于流中的所需颗粒的总数在可接受的量或者在其以上(即,只要在流中的没有被收集的所需颗粒的量保持在可接受的量以下)。按照该策略,上述第一颗粒组被分拣到所需颗粒的群组中,这是由于这些组中的每一个包含一个或者多个具有所需特征A的颗粒,并且由于这些组包含没有污染的颗粒。另一方面,第二和第三颗粒组被分拣到一个或者多个“不可用”的群组(重合拒绝)中,这是因为它们包含污染的颗粒(即,特征B颗粒)。为了利用该“高纯度”策略使得处理量达到最佳,微处理器增大流体输送速度,只要被分拣到可用的群组中的所需颗粒的量相对于可用于该流中的所需颗粒的总数保持在可接受的量或者在其以上。
作为一个示例,考虑用于分拣在图78的流体流中的X和Y精细胞的高纯度控制策略的使用。所需的结果可是将所有X细胞分拣到X细胞的群组中,只要从流收集的X细胞的量保持在可接受的量或者在其以上,例如,至少60%。为了达到该结果,第一颗粒组被分拣到可用的群组中,这是由于它们仅包含一个或者多个X细胞。另一方面,第二和第三颗粒被分拣到一个或者多个不可用的群组中,这是由于它们包含一个或者多个污染(~X)细胞。在该示例中,流体输送系统输送包含颗粒的流体的速度可持续增大,只要作为已经被分拣的X细胞的总可用量的百分比的在可用群组中收集的X细胞的量保持在60%或者以上。相反,如果没有被收集在可用群组中的X细胞的量大于被分拣的X细胞的总可用量的40%,流体输送速度减小。
如上所述,在液滴分拣系统的范围内,已知增大流体输送速度将增大多细胞液滴的数量,以及包含第三颗粒组的重合液滴的数量。由于当使用重合拒绝分拣策略时重合液滴没有被分拣到收集的X细胞的群组中,这意味着,增大流体输送速度将导致在不可用的群组损失的活X细胞的量增大。
图80示出对于两(2)颗粒流体的该结果以使可用的群组具有所需颗粒的100%纯度。如图所示,以很低的流体输送速度(沿着x轴的FDR),在可用群组中的所需颗粒的百分比很高,这是由于极少的重合液滴被产生和拒绝。当流体输送速度增大时(FDR沿着x轴向右边增大),包含第三颗粒组的重合液滴的百分比增大并且更多的这样的组被拒绝。这减少了被分拣在可用群组中的所需颗粒量相对于在可用在流中的所需颗粒的总量(即,流中的被收集在可用的群组中的所需颗粒的百分比)。在所示的特定实施例中,流体输送速度为40K颗粒/秒,并且75%的所需颗粒被分拣到可用的群组中。
概括地,在利用重合拒绝分拣策略的高纯度控制策略中,颗粒输送速度相反地涉及在收集的群组中所需颗粒的百分比(即,在可用的群组中的所需颗粒的高纯度)。
C.恒定流速控制策略
第三种控制策略可被称为恒定流速控制策略。在该策略中,微处理器保持流体输送速度恒定(或者在恒定范围内)并且改变收集的(或者拒绝的)重合液滴的百分比,只要至少一个收集群组的纯度在可接受的水平或者在其上以及只要在该群组中的所需颗粒的量相对于已经处理的所需颗粒的总量在可接受的水平或者在其上。反过来说,流体输送速度是恒定的并且接受的(或者拒绝的)重合液滴的百分比改变,只要可用群组的污染的可能水平在可接受的纯度水平或者其下并且只要损失于除了所述(可用)的群组以外的群组的所需颗粒的可能的量在可接受的量或者其下。
作为一个示例,考虑用于分拣如图78中所示的流体流的恒定流速控制策略的使用。所需的结果可是将X细胞分拣到纯度至少为85%的可用群组中并且收集流中的至少60%的X细胞以使不大于40%的X细胞被分拣到不可用的群组中。在该示例中,流体输送系统输送颗粒的速度保持恒定并且收集或者拒绝第三颗粒组(重合组)的百分比将被改变,只要可用群组关于X细胞的纯度等于或者大于85%,并且只要被分拣到不可用的群组中的X细胞的百分比小于40%以使被分拣到可用群组中的所需颗粒的百分比等于或者大于60%(可变的重合接受分拣策略)。当接受的第三颗粒组的百分比增大时,可用的群组的纯度减小,但被分拣到不可用的群组中的所需颗粒(例如X细胞)的量减小。相反,当接受的第三颗粒组的百分比减小时,可用的群组的纯度增大,但被分拣到不可用的群组中的所需颗粒(例如X细胞)的量增大。
如上所述,从Poisson′s等式中可以得知,对于恒定的流体(细胞)输送速度,多细胞液滴的数量(从而包含第三颗粒组的重合液滴的量)恒定。由于在该控制策略中重合液滴的数量恒定,因此被分拣到可用的群组中的重合液滴的百分比将影响可用群组的纯度和被分拣到不可用的群组中而被浪费的X细胞的量。这是由于在被接受并且被分拣到收集的不可用群组中的重合液滴中的不希望的Y(或者~X)细胞的百分比相反地涉及被拒绝从而没有被分拣到收集的可用的群组中的重合液滴中的X细胞的百分比。
图81示出对于两(2)颗粒流体采用可变重合拒绝分拣策略的在这里所述的流式细胞术液滴分拣系统和方法中的恒定流体输送速度控制策略。如图中所示,线OL表示拒绝的重合液滴的百分比(X轴)与接受的重合液滴的百分比(Y轴)之间的相反关系。当接受的重合液滴的百分比很低时,拒绝的重合液滴的百分比很高。相反,接受的重合液滴的百分比很高时,拒绝的重合液滴的百分比很低。线OL表示这种反关系并且表示在给定的恒定颗粒流速下的可变重合接受分拣策略的操作线。在图81中沿着操作线OL的点P处,可用的群组的纯度是一个给定的百分比,取决于颗粒流速,例如85%的纯度。当接受的重合液滴的百分比沿着操作线OL增大(向左和朝上)时,被分拣到可用群组中的不需要的颗粒的数量增大并且纯度降至85%以下,这可能是不能接受的。当可接受的重合液滴的百分比沿着操作线OL减小时(向右和朝下),纯度达到85%以上并且是可接受的。
在沿着操作线OL的点LL处,75%的重合液滴被拒绝(即,被分拣到不可用的群组中)以使被分拣到不可用的群组中而被浪费的所需颗粒的百分比是基于颗粒输送速度的给定的百分比,例如,40%。当被拒绝的重合液滴的百分比沿着操作线Ol增大(向右和朝下)时,被分拣到被可用的群组中的所需颗粒的百分比减小(例如,小于60%),这可能是不能接受的。当被拒绝的重合液滴的百分比沿着操作线Ol减小(向左和朝上)时,被分拣到被可用的群组中的所需颗粒的百分比增大(例如,大于60%)并且是可接受的。这样,根据本发明的该方面,对于采用可变重合接受分拣技术的恒定流速控制策略,微处理器可操作该系统使得被接受的和拒绝的重合液滴的百分比在如箭头OR所示的点P1和LL之间的操作范围中变化。注意的是,操作范围OR可包含更多的或者更少的操作线,取决于所需颗粒相对于不可用的群组的不纯和损失的容限水平。
概括地,在利用可变重合接受分拣策略的恒定流速控制策略中,被接受的第三颗粒组的百分比相反地涉及可用的群组的纯度以及相反地涉及通过被分拣到不可用的群组而浪费的所需颗粒的量。
D.控制策略的概括
下面的表概括了上述控制策略。
  控制策略  高回收   高纯度   恒定流速
  被控制参数  流体输送速度   流体输送速度   分拣参数
控制参数  群组的纯度   所需颗粒在群组中的量   群组的纯度和所需颗粒在群组中的量
  分拣策略  重合接受   重合拒绝   可变重合接受
X/Y分拣策略  收集X液滴和X+~X液滴;拒绝~X液滴   收集X液滴;拒绝X+~X液滴;拒绝~X液滴   收集X液滴;改变收集的X+~X液滴的百分比;拒绝~X液滴
定义  流体输送速度增大只要群组中关于X颗粒的纯度在可接受的水平或者在其上   流体输送速度增大只要在可用的群组中的所需颗粒的量相对于在流中的X颗粒的总量在可接受的量或者在其上   重合液滴在群组中的百分比增大只要群组中关于X颗粒的纯度在可接受的水平或者在其上;为了继续操作,在可用的群组中的所需颗粒的量相对于在流中的X颗粒的总量在可接受的量或者在其上
相反的定义  流体输送速度增大只要可用群组的污染的概率在可接受的纯度水平或者在其下   流体输送速度增大只要所需颗粒在不可用的群组中量的损失的概率在可接受的量或者在其下   流体输送速度增大只要可用群组的污染的概率在可接受的纯度水平或者在其下以及只要所需颗粒在不可用的群组中量的损失的概率在可接受的量或者在其下
所需的结果  大于最小的可接受的纯度;例如,大于85%的纯度   大于最小的可接受的量;例如,大于被俘获的所需颗粒的60%(小于40%的所需颗粒损失)   大于最小的可接受的纯度和大于最小的可接受的量;例如,大于85%的纯度以及大于被俘获的所需颗粒的60%(小于40%的所需颗粒损失)
相关地,利用上述控制策略中的一个获得的分拣的样本可与第二样本结合使用以得到具有所需特征的最终(例如,商业)样本。例如,根据用于生产100%的纯度的群组的高纯度策略分拣的样本可与80%纯度的被分拣的相同量的群组结合以生产纯度为90%的最终样本。或者对于高纯度的分拣的动物精子,分拣的精子的等分量可与未分拣的精子的等分量结合以便以低于利用上述分拣方法的任何一种分拣整体精子量的成本生产所需纯度的最终样本。
控制策略的上面描述假设精确识别和包括每一个重合液滴的每一个液滴的分拣。实际上,由于许多原因,100%的准确率是不可能。为了使得污染最小化,因此,优选可拒绝不能确定分类为属于所需群组的颗粒。另一方面,如果在某些所选择的概率内某些颗粒可被识别和分类在所需群组中(例如,对于精细胞大于50%)。优选可将颗粒分类为属于所需群组以使它们不损失于不可用的群组。这样,如上所述,诸如精细胞的颗粒对于基于这样的颗粒属于可用群组中的概率分拣到所需细胞的群组中可被接受或者拒绝。
上面的表和说明书中所用的术语“可用的”和“不可用的”仅是便于使用并且没有以任何方式被限定。这样,“可用的”群组包括任何“第一”群组,无论如何或者是否使用,并且一个“不可用的”群组包括不同于可用的群组的任何“第二”群组,无论如何或者是否使用。类似地,“所需的”群组指的是根据所选择的颗粒特征分拣的任何群组。
微处理器将其数字处理软件构成用于处理来自于光检测器的电信号以根据颗粒的特征分类颗粒(例如,一般的颗粒和特别是精子颗粒)和获得关于如上面参照图78所述的颗粒分布的信息的系统。另外,微处理器构成了响应于信号处理软件作为所获得的关于颗粒分布的信息的一个函数改变流体输送系统将颗粒输送到喷嘴系统的速度的控制系统。另外,微处理器构成了响应于信号处理软件作为所获得的关于颗粒分布的信息的一个函数改变分拣策略的控制系统。
一般地,微处理器构成了响应于从流式细胞术设备接收的信息控制分拣系统以改变其分拣策略或者控制流体输送系统的控制系统。换言之,微处理器能够以第一模式操作以改变分拣策略、能够以第二模式操作以控制流体输送系统、能够以第三模式操作以改变分拣策略和控制流体输送系统,并且可以其它模式操作。当以第一或者第三模式操作时,微处理器能够作为下列因素至少一个的函数改变输送流体速度,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
收集系统
需要收集系统以在它们在偏转板之间通过后收集液滴。常规细胞计数器的收集系统可仅为用于在它们在偏转板之间通过后俘获在各个液滴流中的液滴的收集容器。类似的常规收集系统可在本发明的一些实施例中被使用。
但是,在其中喷嘴被定向以向上的角度引导流体流从而为液滴提供水平速度分量的本发明的实施例中使用常规的收集系统可能是困难的。一个问题是,液滴在它们开始向下移动之前将沿着它们的弧形轨迹移动一些水平距离以适于落在收集容器中。例如,如果喷嘴在45度至60度的范围朝上并且液滴以15m/s和20m/s之间的速度离开,液滴在达到它们的轨迹的顶点并且开始向下移动之前距离喷嘴具有几米的水平距离。这样,实验室的好注意是空间被液滴流占据。另外,在几米的范围内,确保液滴落在适合的收集容器中也是困难的。当细胞计数器的一个或者多个操作条件改变时,液滴流的轨迹可改变(例如,调节流体输送速度导致流体在喷嘴孔的速度中的变化)。液滴流的轨迹的变化将被液滴移动的距离加大。这样,不导致在比较靠近喷嘴的点处的液滴位置的明显变化的轨迹变化可导致在离喷嘴较远的位置处液滴位置的很大变化。如上所述,本发明的一些实施例使用对液滴信息的反馈和/或样本流体输送系统以使得液滴流不断地改变其轨迹。一种方式也可想改变鞘流体被输送到喷嘴的压力。空气流、温度变化和湿度变化还可改变液滴流的轨迹。可改变液滴流的轨迹的任何因素还需要收集容器重新定位以使液滴落入适合的收集容器。相反,在具有方向向下的喷嘴的常规细胞计数器中的液滴流的轨迹不易改变。例如,液滴流具有基本向下的初始速度的情况意味着在孔处的流体速度的变化不导致轨迹中的任何很大的变化。另外,收集容器比较靠近喷嘴,使得收集系统更易于接受液滴流中的轨迹变化。
图83-85示出一个收集系统2201的实施例,收集系统2201可用于收集在本发明的系统中的分拣液滴。收集系统特别适用于当细胞计数器喷嘴系统101被定向以向上的角度或者其它任何具有水平分量的角度引导流体流21时的液滴33的收集。当液滴在偏转板629之间通过时,它们被分拣到具有不同的弧形轨迹的多个液滴流123、125(例如,两个)中。如图84和85中所示,每一个液滴流的轨迹通向两个液滴截取装置2203中的一个。如果液滴被分拣到多于两个液滴流中,需要为每一个附加的液滴流提供独立的截取装置。这样,在本发明的收集系统中的截取装置的数量将取决于液滴被分拣到其中的流的数量。
在示例性收集系统中的每一个截取装置2203具有横跨其中一个液滴流的轨迹以使得沿着轨迹移动的液滴偏转到位于每一个截取装置下方的收集容器2207的冲击表面2205。该冲击表面优选由柔韧材料制成。在没有被特定的理论限定的情况下,相信柔韧材料减缓液滴撞击截取装置的表面的冲击,从而减小对液滴中的颗粒的损伤(例如,精细胞)。例如,截取装置可由聚丙烯、聚乙烯或者其它类似的聚合物构成。参见图86和87,截取装置2203是通过在吸液管2215的球管2213的一侧中切割液滴入口2211(例如,矩形窗)构成的。这样,球管的内壁2217的与液滴入口相对的一部分形成横跨各个液滴流的轨迹的弯曲冲击表面2205。通常,吸液管的管体用作可将流体从冲击表面引导到收集容器的引导件2225。
参见图84,截取装置可被紧固在收集系统框架2227上以使得它们被定位。为了说明液滴流的轨迹中的变化,优选能够调节截取装置的位置。例如,可通过在超过支架2229的圆孔中上下滑动导管来调节每一个截取装置的垂直高度。当截取装置处于所需高度时,调节螺钉2231可被拧紧以将其固定在该高度处。支架可与安装板2223相连,安装板2223与收集系统框架相连,例如利用调节螺钉2235(例如,两个调节螺钉)。调节螺钉2235穿过安装板中的水平槽2241以允许截取装置的横向调节。在调节后,调节螺钉可被拧紧以将圆形支架固定在所需位置。本领域技术人员应该理解的是,在不脱离本发明的保护范围的情况下,其它多种紧固装置可被使用以调节截取装置的位置。收集容器2207在截取装置下方被设置在用于支承收集容器的托架2243中的槽2241中。这样,如果需要的话,每一个收集容器可在各自的槽内移动以使其保持在各自的截取装置下方的位置。另外,如果需要的话,水池(未示出)可围绕收集容器被提供以控制收集容器的内容物的温度。
参见图85,在本发明的一个实施例中,在其中一个截取装置2247的背面切割离开窗2245(例如,矩形窗)以使得一个或者多个液滴流通过截取装置。第二截取装置2249被设置在离开窗后面以截取通过所述窗的液滴。第二截取装置的一个示例性进入窗的尺寸基本与第一截取装置的示例性离开窗相同。由于显而易见的原因,离开窗优选远小于第一截取装置的进入窗。例如,第一截取装置的一个示例性进入窗的高为5/8英寸,宽3/8英寸。相反,一个示例性离开窗的高为1/8英寸,宽5/16英寸。
在细胞计数器的操作过程中,收集系统截取分拣流中的液滴。接着被截取的液滴通过截取装置2203的导管2225被向下抽并且进入收集容器2207中。在其中细胞计数器具有用于沿着弧形轨迹引导液滴流的方向向上的细胞计数器喷嘴的情况下,例如,截取装置使得液滴在它们的轨迹上的与液滴可能被常规收集系统(即,没有截取装置的收集系统)收集的点相比很靠近喷嘴的点处被截取。
沿着它们的弧形轨迹(例如,当它们仍然向上移动时)较早截取液滴流减小在液滴第一次遇到收集系统时液滴位置变化量。因此,收集系统可容忍比常规收集系统可容忍的更多的液滴流的轨迹的变化。类似地,液滴基本不可能被空气流冲击,这是因为它们对于收集系统的较短的路径。
在移动截取装置2203比较靠近喷嘴101以增大轨迹变化的容限和移动截取装置离喷嘴孔较远以当液滴冲击截取装置时减小或者最小化冲击力之间必须实现平衡,例如通过使得截取装置定位以使得它们基本在它们的轨迹的顶点处截取液滴流。因此,截取装置的最佳位置将取决于被分拣的颗粒(例如,精细胞)的持久性、液滴速度和液滴流轨迹的变化的期望值。例如,在包含牛精细胞的液滴在喷嘴孔处具有16至20m/s的速度的情况下,截取装置可位于距离喷嘴孔4-6英寸的范围内。在其中第一截取装置具有离开窗和第二截取装置位于第一截取装置后面的实施例中,例如第一截取装置可在距离喷嘴4和5英寸的范围内。优选,第一截取装置距离喷嘴4.5英寸。第二截取装置可在距离喷嘴5和6英寸的范围内。优选,第二截取装置距离喷嘴5.5英寸。
其中一个截取装置2203能够截取通过另一个截取装置的离开窗的液滴的构造特别在人们不担心其中一个被分拣的群组的纯度(例如,在用于奶牛养殖而分拣精子的情况下的带Y染色体的精子)时具有优势。本领域技术人员已知的是,除了如图85中所示的分拣流中的液滴以外,具有未知的含量的离散液滴2265的数量(例如,离散液滴雾)可由细胞计数器产生。第一截取装置应该被定位以使被分拣到对于杂质具有最大的容限的群组中的液滴流撞击第一截取装置的冲击表面2205并且纯度最为重要的流通过离开窗2245以撞击第二截取装置的冲击表面。这样,大部分离散液滴被收集在包含基本不关心纯度的群组的收集容器2207中,如图85中所示,并且将不污染纯度重要的群组。还通过截取和收集离散液滴,从而避免了每次如果离散液滴脱离收集系统进行清洁的需要。与第一截取装置相反,第二截取装置仅使得通过较小的离开窗的液滴偏转。这有助于被第二截取装置收集的群组的纯度的保持。
本领域技术人员应该理解的是,在不脱离本发明的保护范围的情况下,示例性收集系统可以多种方式被容易地变型。例如,在不脱离本发明的保护范围的情况下,能够构成在其下方具有整体形成的(或者连接)收集容器的液滴截取装置。类似地,尽管如图83-87中所示的实施例中的截取装置是变型的吸液管,但应该理解的是,在不脱离本发明的保护范围的情况下,截取装置2203可采用多种形状中的任何一种。例如,每一个截取装置可包括平的或者曲线形片、勺、碗或者其它类似的形状。唯一的要求是,截取装置可截取沿着液滴流的各自的轨迹移动的液滴并且使得被截取的液滴转向到收集容器中。但是,利用容易得到的和较低廉的产品(例如,吸液管)构成截取装置的一个优点是,在每一个样本用完后更换和抛弃所使用的截取装置而不是在样本使用之间清洁截取装置时,可是更经济的。这可有助于减小操作收集系统的成本。
收集流体
分拣的精子在包含收集流体2301的容器中被收集(图56和57)。通常,收集流体的目的包括减缓精细胞与收集容器的冲击或者为细胞提供流体支持。与这些考虑因素一致,收集流体可包括缓冲剂或者缓冲溶液和蛋白质源。
如果被包括,可用于收集流体中的缓冲剂或者缓冲溶液的示例如上面参照样本收集和稀释描述的。通常,这些缓冲剂或者缓冲溶液将在0.001M至1.0M的浓度中并且具有4.5至8.5的pH,优选为7.0。在一个实施例中,收集流体包含包括pH为7.0的0.96%的Dulbecco′s PBS(w/v)的缓冲剂。在另一个实施例中,收集流体包含包括一种在每25毫升的纯水中包括0.204g的NaHCO3、0.433g的KHCO3和0.473g的C6H8O7·H2O的新陈代谢抑制剂溶液(水中包含0.097摩尔/升的NaHCO3、0.173摩尔/升的KHCO3和0.090摩尔/升的C6H8O7·H2O)。
如果包括的话,蛋白质源可是不影响精细胞的生存力的任何蛋白质源并且与所用的特定缓冲剂或者缓冲溶液相容。常用的蛋白质源的示例包括牛奶(包括热均质化和撇渣)、牛奶提取物、蛋黄、蛋黄提取物、大豆蛋白和大豆蛋白提取物。这样的蛋白质可在1%(v/v)至30%(v/v)的浓度中被使用,优选在10%(v/v)至20%(v/v)之间,优选为10%(v/v)。尽管牛奶可与缓冲剂或者缓冲溶液结合使用,但一般在没有缓冲剂或者缓冲溶液的情况下使用牛奶,这是由于牛奶本身是一种可起到与缓冲剂或者缓冲溶液相同的作用的溶液。在这样的情况下,收集流体可包含80%(v/v)至90%(v/v)的牛奶。
除了蛋白质源以外或者代替蛋白质源,收集流体也可包括精液浆。精液浆具有提高精子生存力和游动性以及稳定精子膜(从而在精子的收集和存储过程中防止能育力获得)的两个优点。Maxwell等,Reprod.Fert.Dev.(1998)10:433-440。精液浆可来自于与获得精子样本相同的动物,或者来自于相同种类不同的动物,或者来自于不同种类的动物。如果被包括在收集流体中,精液浆的百分比通常在0.5%(v/v)至10%(v/v)的范围内。如果与蛋白质源结合使用,诸如蛋黄或者牛奶,精液浆和蛋白质源的总百分比在1%(v/v)至30%(v/v)的范围内。在这种情况下,精液浆的百分比将与蛋白质源的百分比成反比。因此,在一个实施例中,收集流体包括精液浆。在另一个实施例中,收集流体包含在0.5%(v/v)至10%(v/v)的范围内的精液浆,优选包含在4%(v/v)至6%(v/v)的范围内的精液浆,优选包含5%(v/v)的精液浆。在另一个实施例中,收集流体包含蛋白质源和精液浆。在另一个实施例中,收集流体包含精液浆和蛋黄,它们的总百分比在1%(v/v)至30%(v/v)的范围内。
另外,收集流体也可包含多种对于精子生存力或者游动性有益的添加物。这样的添加物的示例包括能量源、抗生素和在细胞内和/或细胞外调节氧化/还原反应的组分,每一种已在上面关于样本收集和稀释的描述中被论述。这样的添加物可根据上述内容被添加到收集流体中。
因此,在一个特定实施例中,收集流体包括在水中的0.96%Dulbecco′sPBS(w/v)、1%(w/v)的果糖、10%(v/v)的蛋黄,pH为7.0。在另一个实施例中,收集流体还包括10mM的丙酮酸盐、100□M的维生素K或者1mM的硫辛酸。
或者,代替收集流体的使用,分拣的细胞可被收集在包含或者涂有在随后的低温保藏步骤(下面将对其进行描述)中使用的低温增补剂的容器中。因此,在一个特定实施例中,分拣的细胞被收集在低温增补剂中。在另一个实施例中,收集的细胞被分拣在包括水、Triladyl_(Minitube,Verona,WL,包括丙三醇、三氨基甲烷盐酸缓冲液、柠檬酸、果糖、5mg/100ml的泰乐菌素、25mg/100ml的庆大霉素、30mg/100ml的奇霉素和15mg/100ml的林肯霉素)、蛋黄和丙酮酸。在另一个实施例中,收集流体为包括在75mL的水中的25gTriladyl_、25g蛋黄和10mM丙酮酸。
应该理解的是,这里所述的在收集流体中的蛋白质的百分比浓度是在添加流动的分拣细胞之前的百分比浓度。流动的分拣细胞的加入可将收集流体的最终浓度稀释到在添加流动的分拣细胞之前的百分比浓度的1/20。因此,例如,收集流体最初可包括10%(v/v)的蛋黄。在流动的分拣细胞被收集在包含收集流体的收集容器中后,蛋黄的最终浓度将减小到0.5%(v/v)。
截取装置和/或收集容器的预处理
为了使得可根据本发明被分拣的颗粒(例如,精细胞)受损的可能性达到最小,截取装置2203和/或收集容器2207(图56-60)可在使用前被处理。这样的预处理例如可包括在包含一种用于使得颗粒与截取装置之间的冲击最小化的组分的池中接触或者浸泡截取装置和收集容器。在从该池中取出截取装置和收集容器后,一定量的组分将保留在截取装置和收集容器上并且用作液滴中的颗粒的缓冲剂。因此,该组分应该具有适于提供所需缓冲效果的特征。另外,该组分应该与被分拣的颗粒或者细胞、鞘流体和收集流体相容。与这些考虑因素一致,用于处理截取装置和收集容器的组分可包括缓冲剂或者缓冲溶液、鞘流体、收集流体、低温增补剂、包含在缓冲溶液、鞘流体、收集流体或者低温增补剂中的任何成分,或者其任何组合。根据本发明的方法用于精细胞的着色和分离的缓冲剂、缓冲溶液、鞘流体和收集流体如上所述。因此,在一个实施例中,截取装置和收集容器与鞘流体接触(例如,被浸泡和冲洗)。在另一个实施例中,截取装置和收集容器与收集流体接触。在另一个实施例中,截取装置和收集容器与下面所述的低温增补剂接触。
截取装置和收集容器的与该组分的接触和浸泡优选进行足以使得组分附着在截取装置和收集容器的表面上的一段时间。这样的时间段一般可小于90分钟、优选小于60分钟、优选为30至60分钟、优选为60分钟。在另一个实施例中,截取装置和收集容器仅在使用前与该组分接触。
代替或者与截取装置和收集容器与上述组分接触结合,截取装置和收集容器也可与包含在鞘流体、收集流体和/或低温增补剂中的特定成分接触,例如,BSA、SSS、蛋黄、蛋黄提取物、牛奶(包括热均质化和撇渣)、牛奶提取物、大豆蛋白和大豆蛋白提取物。因此,在一个实施例中,截取装置和收集容器与鞘流体接触随后与0.1%(v/v)的牛血清白蛋白接触。在另一个实施例中,截取装置和收集容器与鞘流体接触随后与10%(v/v)的蛋黄接触。在一个实施例中,截取装置和收集容器浸泡在收集流体中随后与0.1%(v/v)的牛血清白蛋白接触。在另一个实施例中,截取装置和收集容器浸泡在收集流体中随后与10%(v/v)的蛋黄接触。
尽管在上述每一个实施例中截取装置和收集容器接收相同的预处理,但在不脱离本发明的保护范围的情况下,可对于截取装置和收集容器使用不同的预处理方法。同样,在不脱离本发明的保护范围的情况下,截取装置或者收集容器中的一些可接收一种预处理,截取装置或者收集容器中的其它可接收一种不同的预处理。在不脱离本发明的保护范围的情况下,仅对截取装置或者收集容器进行预处理也可获得某些优点。
浓缩
如上所述,被流式细胞计收集的被分拣的精子已经通过加入各种缓冲剂和增补剂、着色流体、鞘流体和收集流体而被稀释。通常,在如上所述被流式细胞术分拣后的精细胞的浓度在0.7-1.4×106个精细胞/毫升的范围内。因此,浓缩被分拣的精细胞以使得对精子的稀释冲击达到最小并且获得适于低温保藏和人工受精的浓度。在动物养殖业中的标准实践,例如是以20×106-40×106个精细胞/毫升的浓度对精子进行人工受精。浓缩精细胞的一种方式是对由流式细胞计收集的流体进行离心分离。浓缩精细胞的另一种方式是使得由流式细胞计收集的流体通过过滤系统。下面详细描述这些方法。
A.离心分离
任何常规的离心分离设备可用于浓缩精子。但是在商业应用中,优选使用能够一次对大批量的精细胞进行离心分离的离心分离设备。在离心分离过程中,大量精细胞将由于作用在精细胞上的离心力的作用而被收集在离心分离管的底部处的丸中。离心力的大小通常被规定为离心力超过重力的倍数。由于离心力是重要的参数并且在任何给定速度(角速度)下的离心力的大小将取决于曲率半径的长度,因此离心分离的速度通常由规定离心力的大小来定义。例如,600g的力指的是离心分离的角速度被选择以使得所得到的离心力为重力的600倍。大部分流体和逃避被离心分离到丸中的任何精细胞将在上清液中。通常,上清液被去除并且丸中的精细胞被再次悬浮以如下面所述的进行进一步处理。重要的是,使得被浓缩在丸中的精子的百分比达到最大,同时使得对精细胞的伤害达到最小。
根据本发明的一个方法,包含10×106个分拣精细胞的离心分离管被放置在离心分离设备中。为了有助于浓缩,离心分离管可用作在细胞计数器的收集系统中的收集容器。这避免了在离心分离之前将分拣的精细胞转移到离心分离管的需要。该管以一定速度进行离心分离并且持续一段足以使得浓缩精细胞的丸形成在管的底部中的时间。优选在考虑几个因素的情况下选择离心分离的速度和时间,这些因素包括:精细胞是脆弱的并且可能在多大的速度下被离心分离破坏的情况;离心分离管的尺寸将影响精细胞移动到管底部所需的时间;以及离心分离持续的时间越长精细胞在给定速度下被离心分离破坏的可能性越大。这样,在本发明的一个实施例中,离心分裂管在550-800g下在6-10分钟的时间段内被离心分离。根据本发明的另一个实施例,离心分裂管在650-750g下在6-10分钟的时间段内被离心分离。在本发明的另一个实施例中,离心分裂管在700g下在6-10分钟的时间段内被离心分离。在本发明的另一个实施例中,离心分裂管在700g下在7分钟的时间段内被离心分离。
如在下面的实验中证明的,离心分离设备的速度和离心分离的时间可影响被回收的精细胞的百分比和被回收的精细胞的游动性。在实际上不分拣精细胞的情况下进行实验。相反,包括缓冲剂、增补剂、鞘流体和着色流体的各个流体被加到精子样本以模拟分拣方法。接着样本在浓缩精细胞的一个实验中被离心分离。
离心分离示例I
在离心分离示例I中,如上所述牛精子被收集和评估。利用一定量的pH为7.3的三氨基甲烷盐酸缓冲液-柠檬酸(“TCA”)对精子样本稀释以获得150×106个精细胞/毫升的浓度。在41℃下在20分钟的时间内利用Hoechst33342(100μM)对精子着色。预备两个用于模拟的具有缓冲剂的15毫升的管。管1部分地充填具有10%的蛋黄的750μl的磷酸盐缓冲盐水(“PBS”)和具有0.1%的牛精液浆(“BSA”)的14.25ml的PBS。管2部分地充填具有10%的蛋黄的750μl的TCA和具有0.1%的BSA的14.25ml的PBS。两个管的每一个接收100μl的包含着色的精子的溶液,接着在室温下孵化20分钟。两个管被分成每一个7ml的两等份。每一个管的一个等份在固定桶离心分离设备中以2250rpm(约540g)离心分离7分钟。两个管的每一个的另一个等份以2500rpm(约660g)离心分离7分钟。在离心分离后,立刻使用10ml的吸液管从每一个等份中去除和保存上清液。丸被重新悬浮在具有10%的蛋黄的200μl的TCA中。在相差显徽镜下观察离心分离前和后的精子游动性。50μl的固定液(在3.4%的柠檬酸钠中的0.1%的戊二醛)被加入到每一个丸和上清液以利用血球计确定浓度。基于由血球计确定的相应的精子浓度乘以所用的/回收量计算精子的总数。利用丸中的总精子数和上清液中的总精子数的总和除丸中的精子总数来计算回收率。
如图88和89中所示的结果显示了通过改变离心分离速度导致的精细胞的游动性的很小的差异。该结果还显示利用TCA与PBS相比游动性略好。
离心分离示例II
在离心分离示例II中,来自于三个公牛的精子样本如上所述被收集和评估。其中一个样本由于不符合初始质量控制标准而被取消资格。利用一定量的pH为7.3的TCA对另外两个精子样本稀释以获得150×106个精细胞/毫升的浓度。在41℃下在20分钟的时间内利用10μM的Hoechst 33342对精子着色。包含具有10%的蛋黄的1500μl的PBS和具有0.1%的BSA的28.3ml的PBS的模拟缓冲剂被加入到两个管中的每一个。200μl的着色的精子(30×106)被加入到每一个管中,接着在室温下孵化20分钟。从两个管的每一个取精子混合物的三个9ml的等份。两个样本的每一个的一个等份分别以下列速度中的每一个在15ml的离心管中离心分离7分钟,这些速度为:550g;650g;和750g。在离心分离过程中的温度为22℃。在离心分离后,立刻使用10ml的吸液管去除上清液,在丸中留200-300μl的上清液。丸被重新悬浮在pH为7.0的具有10%的蛋黄的200μl的TCA中。在相差显徽镜下观察离心分离前和后的精子游动性。在来自于两个公牛的其中一个的离心分离后的样本中注意几个精子凝集。50μl的固定液(在3.4%的柠檬酸钠中的0.1%的戊二醛)被加入到每一个丸和上清液以固定精子便于确定浓度。根据在离心分离试验I中提及的公式确定回收率。
结果如图90中所示。结果显示以650g与550g相比提高了精细胞的回收率。但是,在650g和750g之间的回收率的差异很小。改变离心分离速度导致的精细胞的游动性差异很小。
离心分离示例III
对于离心分离示例III,利用在不同日期的相同的三个公牛基本重复离心分离示例II的程序。结果如图91中所示。结果确定在650g和750g之间的回收率的差异很小。
离心分离示例IV
在两个的不同的日期从两个不同的公牛收集精子。以上述的方式输送和评估精子。基于原始精子的精子浓度,利用三氨基甲烷盐酸缓冲液-柠檬酸(TCA,pH7.3)加10mM丙酮酸盐对精子稀释以获得150×106个精细胞/毫升的浓度。在41℃下在20分钟的时间内利用10μM的Hoechst 33342对精子着色。在着色后,通过添加下列模拟的缓冲剂使得267μl的包含着色精子的溶液被稀释到1×106个精细胞/毫升的浓度,这些模拟的缓冲剂包括:2ml具有10%(v/v)的蛋黄的PBS;以及37.733ml具有0.1%(w/v)的牛精液浆(BSA)的PBS。着色的精子和模拟的缓冲剂在室温下孵化20分钟。从来自于每一个公牛的着色精子和模拟的缓冲剂混合物中取四个9ml的等份。来自于第一公牛的四个等份以下列顺序以离心分离速度和持续时间的变化组合被离心分离:
(1)对于第一等份,700g持续7分钟;
(2)对于第二等份,700g持续10分钟;
(3)对于第三等份,650g持续10分钟;以及
(4)对于第四等份,650g持续7分钟。
来自于第二公牛的四个等份以下列顺序以离心分离速度和持续时间的变化组合被离心分离:
(1)对于第一等份,700g持续10分钟;
(2)对于第二等份,700g持续7分钟;
(3)对于第三等份,650g持续10分钟;以及
(4)对于第四等份,650g持续7分钟。
在摆动头离心分离设备(Allegra 6R,Beckman Coulter Inc.Fullerton,CA)在22℃下在15ml的离心分离管中进行所有的离心分离。在农场收集精子和在实验室进行离心分离之间的时间间隔为4-5小时。在离心分离后,立刻使用10ml的吸液管去除上清液,在丸中留250μl的上清液。丸在250μl的Delbecco′s PBS(pH7.0)中被重新悬浮。在着色后但在离心分离前以及在离心分离后利用Hamilton-Thorn Motility Analyzer(每一个样本两个滑块;每一个滑块两个腔室)观察精子游动性和前进游动性。通过对已经放置在冷冻器中的离心分离前的着色精子和模拟缓冲剂混合物的100μl的等份和与90μl的固定剂(在3.4%的柠檬酸钠中的0.1%的戊二醛)混合的重新悬浮的丸的10μl的等份的血球剂测量来确定精子浓度。如在离心分离示例I中的确定回收率。结果如图92和93中所示。
数据显示在以650g或者700g持续7或者10分钟离心分离后可回收85%的精子(图92)。但是,回收率在700g略好(95%)。在所有处理中在离心分离后的游动性下降(与离心分离前相比),这是由于不能承受离心力应力的死/异常/脆弱精子的存在。在所有处理中精子游动性下降10-14%(图93)。以650g持续7分钟的精子游动性下降较高(14%),这是由于在700g后以650g进行离心分离使得精子暴露在模拟的缓冲剂下的时间较长。离心分离没有显示对精子的前进游动性产生不良影响,相反提高2-3%。
离心分离示例V
在两个的不同的日期从一个公牛收集精子。精子被评估、稀释和利用Hoechst 33342着色,并且如在离心分离示例IV中所述的在模拟缓冲剂中被进一步稀释。对于两个精子样本中的每一个,获得着色精子和模拟的缓冲剂混合物的四个9ml的等份。来自于第一样本的等份以下列顺序以离心分离速度和持续时间的下列任何一种组合被离心分离:
(1)对于第一等份,750g持续10分钟;
(2)对于第二等份,750g持续7分钟;
(3)对于第三等份,700g持续10分钟;以及
(4)对于第四等份,700g持续7分钟。
对于来自于第二样本的等份,离心分离速度和持续时间的组合相同,但顺序改变如下:
(1)对于第一等份,750g持续7分钟;
(2)对于第二等份,750g持续10分钟;
(3)对于第三等份,700g持续7分钟;以及
(4)对于第四等份,700g持续10分钟。
在摆动头离心分离设备(Allegra 6R,Beckman Coulter Inc.Fullerton,CA)在22℃下在15ml的离心分离管中进行离心分离。在农场收集精子和在实验室进行离心分离之间的时间间隔对于第一样本为6.5小时,对于第二样本为4小时。离心分离后处理,即,上清液的去除、丸的重新悬浮、精子浓度的确定和利用Hamilton-Thorn Motility Analyzer评估游动性以与示例IV中所述的相同的程序进行。结果如在图94和95中所示。
结果表明,以650g或者700g持续7或者10分钟离心分离后可回收在高度稀释的悬浮液中的85%以上的精子群组(图94)。g作用力增大到750g没有大大提高回收率。如在离心分离示例IV中的情况,在所有处理中观察到在离心分离后的游动性下降(与离心分离前相比)。在本试验中,精子游动性下降13-20%(图95),略高于离心分离示例IV。变化可能是由于精子样本的变化以及在一个样本中从精子收集到离心分离的时间间隔较长(6小时)导致的。如在示例IV中描述的,低速度离心分离(700g,7至10分钟)的精子游动性下降(约20%)是由于在750g离心分离后进行离心分离使得精子暴露在模拟的缓冲剂下的时间较长。前进游动性下降可忽略(1-5%)。
B.二次离心分离
为了回收可能在上清液中损失的精子,可在上清液与丸分离后对其离心分离。在没有受到一个特定理论限定的情况下,申请人相信丸/上清液界面阻止精子移动到丸中。通过使得丸与上清液分离来去除界面将使得上清液进一步离心分离使得留在上清液中的精细胞形成第二丸。第二丸可被重新悬浮和被添加到来自于第一丸的重新悬浮精子。
C.过滤
可用于避免上清液中的精细胞损失的一种可选择的浓缩方法是过滤。如图96中所示,根据一个实施例,过滤器2415装在收集容器2403中。在过滤器中的孔的尺寸优选在0.2-1微米的范围内。优选,过滤器不是深度过滤器(例如,具有可将精子尾部留在其中的曲折通道的过滤器)。相反,优选过滤器可尽可能薄。例如,优选过滤器厚度在50微米至500微米的范围内;优选过滤器厚度在75微米至250微米的范围内;优选过滤器厚度在100微米至150微米的范围内。低水平真空2417被提供以当液滴33被收集时去除通过过滤器的流体。重要的是,使用低水平真空(小于20英寸水银,例如,15英寸水银)避免对精细胞造成伤害。在一个实施例中,真空足够低以使流体去除速度为1.0ml/15秒。根据本发明的另一个实施例,间歇地施加真空以为精细胞通过回收的机会。在另一个实施例中,过滤器2415由与精细胞相容的材料构成,对于它们还没有粘合亲和力。在分拣完成时,约80-90%的流体将被通过过滤器去除。但是,足够的流体保持(约10-20%)精细胞在浓缩的浆2405中,从而防止精细胞形成滤饼。浓缩的悬浮液可被转移到另一个容器2419,例如,如图97中所示。具有套管尖过滤器2411的注射器机构2409可用于从该容器2419去除剩余液体中的一些。但是,足够的流体被留在容器中以防止精细胞粘结在过滤器2411上。与在收集容器中的过滤器2415相同的考虑因素用于套管尖过滤器2411。这样,套管过滤器2411孔尺寸优选在0.2-1.0微米的范围内并且套管过滤器较薄以避免精子尾部被捕捉在过滤器中的曲折通道中。例如,DynaGard_中空聚丙烯纤维注射器尖过滤器,它可从Spectrum Laboratories,Inc.of Rancho Dominguez,CA商业得到,可用于套管尖过滤器。如图98中所示,重新悬浮流体2413通过套管尖过滤器被冲洗以将可能粘在过滤器表面上的细胞冲回到浆中。重新悬浮流体可包括一定量的过滤流体和/或适合的增补剂。在足以从过滤器去除精细胞的一定量的重新悬浮流体已经通过过滤器被回冲后,如果需要的话,可增加附加的重新悬浮流体。重新悬浮流体的总量被选择以使得浓度达到所需浓度(例如,约20×106个精细胞/毫升)。这样,该实施例的过滤方法是三步方法,包括在收集容器中使用过滤器、利用套管过滤器进行过滤和重新悬浮以获得所需浓度。
在一个可选择的两步过滤方法中,上述三步方法的第一和第二步骤结合以使所有流体的去除通过套管过滤器。在该方法中,被分拣的精细胞被引导到没有过滤器的收集容器。利用上述的通过套管尖过滤器2411被施加的低真空和/或间歇真空去除流体。当精细胞在浓缩浆中时,重新悬浮流体,诸如一种增补剂,通过套管过滤器冲回以获得精细胞的所需浓度。
过滤示例I
过滤示例I示出在利用本发明的三步过滤方法浓缩后的精细胞的回收率和游动性。精子样本从三个公牛被收集并且如在上面的样本制备段中提供的被评估。三个精子样本中的一个由于不符合初始质量控制标准而被取消资格。利用一定量的达到150×106个精细胞/毫升的浓度所需的TCA(pH7.3)稀释剩余两个样本。500μl的具有10%蛋黄的PBS和9.5ml的具有0.1%BSA的PBS被添加到两个15ml试管中的每一个。76μl的精子样本(约10×106个精细胞)被添加到每一个试管中并且室温下孵化20分钟。参见图99,使用真空泵2427施加负压以通过过滤器2425抽取稀释精子2423的四毫升等分量。过滤器2429被收集在注射器2421中。在过滤器上的过滤精细胞被在15ml的管中的1ml的TCA缓冲剂冲回后,真正评估精子游动性。过滤前和后的样本与固定剂(在3.4%的柠檬酸钠中的0.1%的戊二醛)混合以固定精细胞。利用血球计确定精子浓度。基于精子浓度乘以量计算精子的总数。利用在过滤前在等分量中的精细胞的总数除在回冲部分中的精细胞的总数来计算回收率。利用不同的过滤器重复该过程。利用下列两个过滤器进行实验:(1)1.0μmPTFE(不是FTPE)膜盘(注射器)过滤器(从PallCorporation,Life Science Group,Ann Arbor,MI,Cat # PN4226T或者VWR,Batavia,IL,Cat.# 28143-928);和(2)0.8SFCA(无表面活性剂的醋酸纤维素)膜盘(注射器)过滤器(Corning.Inc.,Corning,NY,Cat.#431221;VWR Batavia,IL,Cat.# 28200-028)。结果如图101中所示。与PTFE过滤器相比,利用醋酸纤维素过滤器回收更多的精子,即,67对33%,这是由于醋酸纤维素的低蛋白质粘合亲和力。被回收的精子的真实游动性的范围在63%(PTFE)至68%(醋酸纤维素)之间。
过滤示例II
过滤示例II示出在利用本发明的二步过滤方法浓缩后的精细胞的回收率和游动性。精子样本从三个公牛被收集并且如在上面的样本制备段中提供的被评估。利用一定量的达到150×106个精细胞/毫升的浓度所需的TCA(pH7.3)稀释三个样本。1.5ml的具有10%蛋黄的PBS和28.3ml的具有0.1%BSA的PBS被添加到每一个50ml试管中。200μl的精子样本(约30×106个精细胞)被添加到每一个试管中并且室温下孵化20分钟。参见图100,使用注射器2431施加负压以通过过滤器2435从每一个试管抽取稀释精子2433的六毫升等分量。过滤器被放置在过滤器支架2437中(来自于MilliporeCorporation,Billerica,MA Cat # SX0002500的Swinnex过滤器支架)。在过滤后,过滤器支架2437与注射器和管分开,使得过滤器支架完整。通过转动过滤器组件使其颠倒收集过滤器上的精子并且利用在15ml试管中的在顶部具有一小段管的3ml注射器使得过滤器上的过滤精细胞被1ml的TCA缓冲剂冲回。真正评估精子游动性。过滤前和后的样本与固定剂(在3.4%的柠檬酸钠中的0.1%的戊二醛)混合以固定精细胞。利用血球计确定精子浓度。如在过滤示例1中所述的计算精细胞的总数和回收率。该过程重复两次以测试不同的过滤器。利用下列两个过滤器进行实验:(1)0.2μmTeflon膜过滤器(从X-Partek,P.J Cobert Associates Inc.St.Louis Cat.#944106;和(2)0.8醋酸纤维素膜过滤器(Millipore Corporation,Billerica,MA Cat.# AAWP 02500)。结果如图102中所示。在两种过滤器中,精子的回收率低(约25%)。如在示例I中在Teflon过滤器中它是低的。但是,在醋酸纤维素过滤器中的低回收率和回冲精子的真实游动性可能是由于不同卖家使用的材料和/或精子与过滤器支架/组件附着的能力导致的。
D.致密介质浓缩
浓缩所收集的精子的另一种可选择的方法取决于精细胞在高密度介质中的浮选。根据该方法,高密度介质被加入到被收集的精细胞以将悬浮液的比重提高到1.3以上。例如,胶态氧化硅悬浮液(诸如,在Percoll_和Isolate_的商标下得到的)可用于增大悬浮液的比重。这些精细胞将漂浮在悬浮液的顶部,在那里它们可被撇去或者收集,这是由于悬浮液的比重增大。悬浮流体被添加到已经从表面收集的细胞以形成最终的20×106个精细胞/毫升浓度。在添加高密度介质之前可利用上述过滤方法中的一种去除一些悬浮流体以减小需要获得所需比重的高密度介质的量。
低温延展
A.低温保护
在精子已经被分拣和收集在收集容器中后,它们可用于使雌性动物受精。这可基本立刻进行,需要很少的精子的附加处理。同样,精子也可被冷却或者冷冻以在稍后的日期使用。在这样的情况下,精子可受益于附加处理以使得对由于冷却或者冷冻导致的生存力或者解冻后的游动性的影响达到最小。
一般地,低温增补剂包括缓冲剂或者缓冲溶液、蛋白质源和低温保护剂。可用于低温增补剂中的缓冲剂或者缓冲溶液的示例如上面参照样本收集和延展描述的。通常,这些缓冲剂的浓度为0.001M至1.0M,pH为4.5至8.5,优选7.0。
如果包括的话,蛋白质源可被添加以为细胞提供支持并且减缓细胞与收集容器的接触。蛋白质源可是不影响精细胞的生存力的任何蛋白质源并且与所用的特定缓冲剂或者缓冲溶液相容。常用的蛋白质源的示例包括牛奶(包括热均质化和撇渣)、牛奶提取物、蛋黄、蛋黄提取物、大豆蛋白和大豆蛋白提取物。这样的蛋白质可在10%(v/v)至30%(v/v)的浓度中被使用,优选在10%(v/v)至20%(v/v)之间,优选为10%(v/v)。尽管牛奶可与缓冲剂或者缓冲溶液结合使用,但一般在没有缓冲剂或者缓冲溶液的情况下使用牛奶,这是由于牛奶本身是一种可起到与缓冲剂或者缓冲溶液相同的作用的溶液。在这样的情况下,收集流体可包含80%(v/v)至90%(v/v)的牛奶。
低温保护剂优选被包括在低温增补剂中以减小或者防止冷冲击或者保持精子的生育力。多种低温保护剂在本领域是已知的。适于与给定的增补剂结合使用的低温保护剂的选择可改变,并且取决于获得的被冷冻的精子的种类。适合的低温保护剂的示例例如包括丙三醇、二甲亚砜、乙二醇、丙二醇、海藻糖、Triladyl_及其组合。一般地,如果包括的话,这些低温保护剂以1%(v/v)至15%(v/v)的量存在于低温增补剂中,优选以5%(v/v)至10%(v/v)的量、优选以7%(v/v)的量,优选以6%(v/v)的量。
在一个特定实施例中,低温增补剂包括水、Triladyl_、蛋黄和丙酮酸。在另一个实施例中,低温增补剂包括在75mL的水中的25gTriladyl_、25g蛋黄和10mM丙酮酸。
另外,低温增补剂也可包含多种有益于精子生存力和游动性并且防止或者减小低温保藏的有害副作用的添加物。这样的添加物例如可包括能量源、抗生素、或者在细胞内和/或细胞外调节氧化/还原反应的组分,这些都在上面关于样本收集和稀释描述过。因此,这样的添加物可被添加到低温增补剂中。
B.分拣的精细胞的低温保藏
在大多数情况下,不可能使用如上所述的已经被分拣的精细胞立刻进行人工受精。特别是在商业性精子分拣操作的情况下,分拣的精细胞在它们可被用于人工受精之前必须被分拣和/或运输。这通常需要精细胞的低温保藏。分拣的精子可被装在细长的筒体(在养殖业中被称为“试管”)中并且被低温保藏以在运输和储存过程中保藏精子。低温保藏的精细胞可在液氮中被长时间存储。为了使用低温保藏的精子,试管可被浸入热水池中以使得精子解冻。接着试管被装到人工受精枪中以使得磁性动物受精。几个防护措施必须考虑以在低温保藏过程中保护精细胞。否则,精细胞将被破坏(如5-10%的低解冻后的游动性率所示)使得它们不适于用于人工受精。
常规的低温保藏方法包括接连添加蛋白质源(例如,蛋黄)、将精子冷却到4-5℃的温度,添加低温保护剂(例如,丙三醇),在4-5℃的范围内的稳定温度下使得精子和低温保护剂保持足以使得精细胞与低温保护剂平衡的时间,接着使得精子过冷,例如将精细胞浸没在-196℃的液氮中以进行存储。本领域技术人员应该理解的是,蛋白质源的目的是当它们从14℃冷却到8℃时防止精子受到破坏,这是精细胞最容易受到冷冲击的温度。相反,低温保护剂防止精细胞在0℃以下的温度下受损。即使在低温保藏中所涉及的温度在冷冻以下并且术语“冷冻”有时用于描述低温保藏,本领域技术人员还知道的是,低温保藏的精子实际上没有被冷冻。准确地说,低温保藏的精子处于过冷状态。在精细胞和低温保护剂保持在稳定温度下的过程中的常规时间段可在任何地点持续60分钟至多个小时。利用常规方法完成低温保藏的总时间通常超过四个小时。另外,相信,高达50%的精细胞在常规低温保藏过程中被杀死。尽管根据本发明的一些实施例利用常规的方法低温保藏精子,但本发明的其它实施例使用能够减少低温保藏所需的时间和/或改善被低温保藏的精子的健康的改进的低温保藏方法。
图103示出概括描述根据本发明的一种改进的低温保藏精子的方法的一个实施例的步骤的流程图。在步骤2501,包含分拣的精细胞的溶液的浓度被调节到约1000000-40000000个精子/毫升的范围内,取决于具体消费者所有的标准(例如,关于养殖)。例如,精子浓度可被调节到约20000000-24000000个精子/毫升的范围内。精子浓度的调节可包括添加重新悬浮流体、缓冲剂和/或增补剂到上述的浓缩的精子。在步骤2503,在精子冷却前低温保护剂(例如,丙三醇)被添加。在它们与低温保护剂接触后精细胞立刻开始与低温保护剂平衡。在步骤2505,蛋白质源(例如,蛋黄)也被添加到上述包含精细胞的溶液中。
在步骤2507利用常规的装载机使得精细胞溶液、蛋白质源和低温保护剂被装在常规的0.5或者0.25人工受精试管中。本领域技术人员熟悉多种可用于将精子装到试管中的常规的设备和技术。例如,于1993年10月5日授权的Cassou等的美国专利No.5,249,610并且在这里合并参考,提供了关于利用抛弃型注射器喷嘴使得试管中充填精子的教导。另外,充填试管的设备在商业上可从位于Verona WI的Minitube of America获得。这些或者类似的常规装载方法和设备中的任何一个可用于将分拣的精细胞装到试管中。
在装载后,在步骤2509精细胞被冷却到保持温度。一般地,保持温度应该在考虑下列因素的情况下被选择:使得精细胞保持在太高的温度下(例如,10℃)可能导致冷冲击带来的不必要的损伤;精细胞与低温保护剂(例如,丙三醇)的平衡被认为在4-5℃的范围内的温度下最积极;以及使得精细胞保持在太低的温度下(例如,小于0℃)被认为会对精细胞造成损伤。这样,根据一个实施例,保持温度在0-8℃的范围内。优选,保持温度在2-6℃的范围内。优选,保持温度在4-5℃的范围内。在另一个实施例中,该步骤2509所用的冷却速度被选择以使得对精细胞的损伤达到最小。例如,冷却速度可被控制(例如,基本恒定)以提供均质冷却和防止精子遭受温度冲击。冷却速度应该使得精子的冷却足够快以在它们导致膜受损之前减小它们的新陈代谢,但也应该足够慢以使得它们不遭受温度冲击。人们可通过将包含精细胞的试管放置在可使得它们冷却的可编程的冷冻装置(例如,从位于Verona WI的Minitube of America商业获得的IceCube 1810CD冷冻装置)中来控制冷却速度。根据一个实施例,可编程的冷冻装置从室温(通常在22至24℃的范围内)以0.1和0.3℃/分钟的恒定冷却速度冷却精子。优选,冷却速度在0.15和0.25℃/分钟的范围内。优选,冷却速度为0.2℃/分钟。在另一个实施例中,冷却速度被选择以使精子在90分钟的时间内从它们的初始温度冷却到保持温度。在另一个实施例中,冷却速度被选择以使精子以恒定的冷却速度在90分钟的时间内从它们的初始温度冷却到保持温度。上述冷却速度实际上指的是可编程的冷却装置的腔室的冷却速度,但由于试管的薄壁和长且薄的形状(例如,长5.25英寸、小于3毫米的直径和0.15毫米的壁厚)和试管的传导性能,精细胞和冷却腔室之间的温度差不大。
在精细胞已经被冷却到保持温度后,在步骤2511,它们在该温度下或者附近保持使得它们与低温保护剂的平衡基本完成的时间段。例如,上述的可编程的冷冻装置可被编程以在该阶段中使得精细胞保持在稳定温度下。根据本发明的另一个实施例,精细胞在保持温度下保持与常规方法相比较短的时间内,这是因为精子已经在冷却过程中与低温保护剂平衡。例如,时间段可在10和60分钟的范围内。优选,时间段可在20和40分钟的范围内。优选,时间段为30分钟。在另一个实施例中,该时间段小于60分钟。在另一个实施例中,该时间段小于40分钟。较短的保持时间段在商业性精子分拣方法中具有多个优点。首先,它减小了处理分拣的精子所需的时间,可转换为节省成本。另外,精细胞还在0至8℃的范围内的温度下执行新陈代谢过程,从而减少精子需要保持在该温度下的时间,可提高精细胞的健康,对于关心人工受精成功率的动物养殖人员,这将增大精细胞的量。
在精细胞已经在保持温度下被保持上述的时间段后,在步骤2513精细胞被冷却到接近精子低温保藏的临界温度区域的温度。本领域技术人员已知的是,临界温度区域是冰晶形成和渗透压力变化破坏精细胞的区域。该温度可根据精细胞被低温保藏的溶液变化,但临界温度区域一般在-18和-35℃的范围内。有时,据说临界温度区域在-18和-30℃的范围内。这样,根据本发明的另一个实施例,用于使得精细胞从保持温度冷却到接近-18℃(例如-15℃)的温度的冷却速度被选择以保护精子的健康。应该考虑的相关因素包括在该过程中精细胞仍然与包围保护剂平衡的情况、精子仍然进行一些新陈代谢的功能的情况以及精子仍然略微对快速温度变化敏感的情况。另外,优选,冷却速度是可控制的速度,诸如可被编程到上述可编程的冷冻装置中的速度。优选,用于使得精细胞从保持温度冷却到接近-18℃的温度的冷却速度是恒定冷却速度。这样,根据本发明的另一个实施例,精细胞以在1.0至5.0℃/分钟的范围内的冷却速度从保持温度冷却到-15℃。优选,冷却速度在2.0至4.0℃/分钟的范围内。优选,冷却速度为3.0℃/分钟。
步骤2515包括使得精细胞快速冷却通过临界温度区域以限制精细胞在其中停留的时间。这样,根据本发明的一个实施例,通过临界温度区域(例如-18℃至-30℃)的冷却速度被选择以远大于用于将精细胞冷却到保持温度的冷却速度和用于将精细胞冷却到接近临界温度区域的温度的冷却速度。这样,较陡的冷却速度优选在8至40℃/分钟的范围内。优选,较陡的冷却速度优选在8至12℃/分钟的范围内。优选,较陡的冷却速度为10℃/分钟。使用较陡的冷却速度的温度范围可延伸超过临界温度区域。这样,在本发明的另一个实施例中,精细胞以上述其中一个较陡的冷却速度从-15℃冷却到-40℃。在本发明的另一个实施例中,精细胞以上述其中一个较陡的冷却速度从-15℃冷却到-80℃。以较陡的冷却速度使得精子冷却通过临界温度区域的步骤可在上述可编程的冷冻装置中完成。
在精细胞已经被冷却到临界温度区域以下(例如,到-80℃)后,在步骤2517包含分拣的精子的试管被浸没在液氮(-196℃)中以提供分拣的精细胞的最大使用寿命。存储低温保藏的精子的液氮的使用在动物养殖业中在未分拣的精子的范围内是普遍的。这样,本领域技术人员熟悉包含精子在液氮中的运输和存储的技术,这里无需详细论述。应该注意的是,常规容器用于提供大量的人工受精试管在液氮中的长时间存储并且较小并且更轻便的容器也可用于提供人工受精试管在液氮中的存储以运输到客户和/或运输到具有一个或者多个需要利用低温冷藏的精子受精的雌性动物的农场。
这里所述的低温保藏方法的一个优点是,在比根据常规方法需要的更短的时间完成低温保藏。由于本发明所涉及的低温保藏而使得游动性可能仅降低5%至11%,如下面示例描述的。这样,如表明根据本发明低温保藏的精细胞在它们在37℃的水池中解冻50秒后具有大于50%的游动性(例如60%)的实验所示,本发明所涉及的低温保藏保护精细胞的健康。如上所述,精子游动性可被自动机器(例如来自于Hamilton Thorn Research的IVOS精子分析器)或者通过可视检查被分析。
应该注意的是,上述低温保藏方法可用于商业规模的精子分拣方法中。这样,根据本发明的一个实施例,这里所述的本发明方法的步骤在一批分拣的精细胞上同时执行以便以保存它们的健康的方式快速低温保藏整批精细胞。例如,利用下面所述的多通道流式细胞术设备,能够在20分钟的时间内在设备的收集系统中得到840×106个分拣的带X染色体的精细胞。这足以使得精细胞充填几个冷冻的试管。另外,一批可包含利用两个或者多个不同分拣细胞计数器的组合的精细胞。在如上所述被浓缩后,精细胞可被装在任何数量的试管中并且作为一批被低温保藏。例如,根据本发明的一个实施例,将增补剂(包括蛋白质源和低温保护剂)添加到一批精细胞中需要5分钟,利用自动装载设备将精细胞装到人工受精试管中需要15分钟。在一个可编程的冷却装置中对于在该批中的所有试管同时冷却。另外,一些可编程的冷冻装置的能力允许同时对几千个人工受精试管同时低温保藏。例如,上述IceCube 1810CD冷冻装置具有同时低温保藏2500个0.5ml的试管或者3800个0.25ml的试管的能力。这样,人们可等待启动冷却步骤直至已经得到多批。或者,利用使得多个多通道流式细胞术设备(见下面)并行操作并且在一个可编程的冷冻装置中同时冷却一起从其获得的多批来基本同时获得多批。在本发明的一个实施例中,将精细胞从室温冷却到过冷状态并且将它们浸没在液氮(-196℃)中需要少于220分钟的时间段。在另一个实施例中,过冷时间段小于190分钟。在另一个实施例中,过冷时间段小于150分钟。
本领域技术人员应该注意的是,在不脱离本发明的保护范围的情况下,可对上述示例性方法进行多种变型。例如,精细胞可被低温保藏在容器中而不是人工受精试管中。类似地,包括改变或者维持温度的方法中的步骤可利用任何适合的装置来执行,例如包括水池、液氮蒸气和常规的可编程的或者非可编程的冷冻装置。另外,在不脱离本发明的保护范围的情况下,多种物质或者其组合可用作蛋白质源和/或低温保护剂。这些物质包括上面关于缓冲剂、增补剂、低温保护剂、鞘流体和收集流体描述而提及的物质及其浓度。另外,在不脱离本发明的保护范围的情况下,在该方法中的一些步骤的顺序可被改变。尽管图95中表示在调节分拣系统的浓度后添加低温保护剂,但可以预见的是,在不脱离本发明的保护范围的情况下,可在调节浓度之前添加低温保护剂。例如,低温保护剂可被提供在收集流体中或者流式细胞计所用的鞘流体中。本发明的一些优点也可通过对精细胞进行部分冷却接着添加低温保护剂来获得。同样,添加蛋白质源的顺序可被改变,只要蛋白质源能够在精细胞通过14至8℃的温度范围时保护其不受到冷冲击的影响即可。
低温保藏示例I
如上所述,牛精子被收集、输送和评估。每一个都包含5毫升的TCA缓冲剂(pH7.3)的两个试管被放置在两个水池中的一个中至少5分钟。一个水池在35℃的温度下,另一个在水池在41℃的温度下。24℃的精子被加入到每一个管中以使在每一个管中的最终浓度为150×106个精细胞/毫升。两个管分别被分成两等份,所述等份分别被放置在相应的水池中。在精子已经与TCA缓冲剂平衡5分钟后,80μM的Hoechst 33342被加入到其中一个35℃的等份和其中一个41℃的等份。在添加Hoechst33342后,所有四个等份在它们各自的水池中孵化20分钟。在孵化后,从水池中取出试管并且在室温下(约25℃)保持5分钟。接着利用包含20%的蛋黄和65%的丙三醇(v/v)(pH7.0)的TCA增补剂将每一个试管的内容物稀释到20×106个精细胞/毫升的最终浓度。接着,每一个试管的内容物用于充填0.5ml的人工受精试管。三个试管的每一个被放置在可编程的冷冻装置(来自于Minitubeof America,WI的IceCube 1810CD冷冻装置)中。在可编程的冷冻装置中对下列冷却顺序编程:(1)22℃至4℃@-0.2℃/分钟;(2)在4℃下保持30分钟;(3)4℃至-15℃@-3.0℃/分钟;(4)-15℃至-80℃@-10.0℃/分钟。在达到-80℃后,将试管浸没在液氮(-196℃)中保持45分钟。接着,将试管浸入到37℃的水池中保持50秒以解冻。在相差显微镜下在低温保藏前和后检查精子的游动性。结果如图104中所示。解冻后的游动性通常为60%。这表示与以前的低温保藏相比游动性仅下降了5-11%。变化分析表明Hoechst 33342或者在41℃下的孵化对解冻后的精子游动性没有产生很大的影响。
系统操作
现参照图82对流式细胞术系统9的整体操作813进行描述并且在精细胞的特定范围内(例如,牛精细胞),但应该理解的是,本说明书仅是示例性的,该系统可用于处理其它颗粒。
导致六个第二重复回路的第一系列的步骤包括系统的校准。在初始化769后,执行系统检查771特别是确定处理器131或者多个处理器是否可操作。如果在三个失败的系统检查775后检测到错误,请求使用者交互作用773。如果系统检查是肯定的,微处理器引导该系统利用适合的流体冲洗喷嘴系统,接着质量控制材料779,诸如珠或者牛核通过该系统以对检测参数初始化(见图72中的739)并且确定该系统在可接受的质量控制内操作。这包括控制材料的评估以测试系统的敏感性和精度,确定该系统可正确地识别样本。如果在三次尝试775后不能确定质量控制,请求使用者交互作用773。
如果质量控制材料指示可接受的质量控制水平,样本781被吸入并且待分拣的样本部分或者等份被质量检查783。可利用样本的质量因子(Q-因子)的计算来确定样本质量。例如,在样本的第一等份中检测细胞的类型。在该检测过程中,初始化的检测参数(741)被重新检查并且产生初始的识别参数(745)。如果在等份中的检测的细胞类型表明样本符合或者超过预设标准(例如,样本可被识别以产生某一纯度或者游动性,特别是具有可用于处理的足够的活X细胞),那么该系统继续操作。如果样本质量失败三次775,请求使用者交互作用。
继续的操作包括利用六个第二重复回路分拣样本的其余部分。在该回路的开始时,微处理器确定样本的分拣没有完成789。如果样本的分拣完成789,微处理器继续工作,如果下一个样本781是可用的,则吸入下一个样本781,如果附加的样本不可用,则断开分拣操作793。如果样本没有完成789,微处理器首先检查样本的X/Y识别795以确定它是否在最佳范围内。换言之,进行如上所述的漂移分析(在图72中的761)。如果应该进行任何变化,这样的变化被执行并且再次检查该识别795。如果此时识别仍然是不可接受的,分拣断开793并且请求使用者交互作用。
或者,系统继续工作以确定流体输送系统是否以在最佳范围内的速度输送流体和细胞801。该确定取决于所用的控制策略的类型。对于高回收控制策略,可通过评估纯度或者观察被收集的群组的X/X+~X来确定最佳速度。如果确定的纯度高于所要求的纯度水平,通过增大提供给注射泵的控制信号的速率来提高细胞的供给输入速度803。这可能增加重合细胞以及降低纯度,这是因为更多的包括~X细胞的重合细胞可与X细胞一起被收集。如果确定的纯度低于所要求的纯度,通过减小提供给注射泵的控制信号的速率来降低细胞的供给输入速度以减少重合细胞的频率803。这样,细胞输入速度是收集的群组的确定纯度与所需纯度水平相比的一个函数,例如被收集的识别的~X精细胞的一个函数。
对于高纯度控制策略,可通过计算损失的X细胞来确定最佳速度,例如废弃的X/废弃的X+收集的X。如果损失的X细胞的量或者百分比小于可接受的水平,那么通过增大提供给注射泵的控制信号的速率来提高细胞的供给输入速度803。这可能增加重合细胞以及增大废弃的X细胞的数量,这是因为更多的包括X细胞的细胞可与Y细胞一起被放弃。如果损失的X细胞的量或者百分比大于可接受的水平,那么通过减小提供给注射泵的控制信号的速率来降低细胞的供给输入速度以减少重合细胞803。这样,细胞输入速度是放弃的群组确定的损失的X细胞与在收集的群组中的X细胞数量相比的一个函数,例如没有被收集的X精细胞的一个函数。
如果改变的速度是可接受的805,该系统进行另一个系统检查807。如果系统检查是可接受的807,那么分拣在六个第二回路中继续。如果是不可接受的,系统重新设定809。如果重新设定后,该系统是不可接受的或者如果修改的供给速度是不可接受的811,分拣停止793并且请求使用者交互作用773。
分拣的液滴流被收集系统收集2201。被分拣到X细胞群组中的液滴通过在第一截取装置2247中的离开窗2245以被第二截取装置2249截取。从那里,包含X细胞的液滴流入到收集容器2207中。其它液滴被第一截取装置2247截取并且被引导到废物流槽2805。当然,被第一截取装置截取也可被保存,如上所述。当适量的带X的精细胞已经被收集在收集容器中时,分拣可被中断以使得精细胞在收集容器2207中被浓缩。可将新的收集容器放置在第一截取装置2247的下方或者收集的流体可被注入到一个不同的容器并且更换收集容器。接着,分拣可恢复。在收集流体中的精细胞被浓缩,装在试管中并且如上所述被冷冻。
在操作过程中的温度控制
在整个过程中的温度控制可用于改善处理的结果。如上所述,在该过程中的各个步骤中(例如,着色和低温保藏)精子的温度可被控制。在本发明的几个实施例中,在该方法的各个步骤中精细胞的温度被控制以达到改善的结果。
例如,图105是本发明所涉及的一种温度控制方法的一个实施例的工作流程图。在精子样本被收集时的温度将由收集精子样本的动物体温确定。例如,在步骤2601,牛精子样本在37℃下被收集。在步骤2603利用隔热容器将精子样本从收集地点输送到实验室。隔热容器延迟精子的冷却。
在步骤2605,在样本评估过程中,温度保持在收集温度以下,但超过对应于玻璃态转化温度的温度,精细胞在玻璃态转化温度以下可能遭受膜受损。例如,该温度可保持在18-37℃的范围内。在另一个实施例中,在样本评估过程中,该温度可保持在24-37℃的范围内。在一个特定实施例中,在样本评估过程中,精细胞被放置在温度范围在22-25℃之间的环境中。根据在精子到达实验室的温度,将它们放置在温度范围在22-25℃之间的环境中的效果可是对精子进行持续的慢冷却,以保持精子的温度,或者略微升高精子的温度。在一个实施例中,如在着色段中描述的,在步骤2607可升高温度(例如,升高到40℃或者更高)以进行着色。在另一个实施例中,还如上面所述,在着色步骤中,精细胞的温度可在20-40℃的范围内。
在步骤2609中,着色的精子混合物被放置在水池中直至该混合物被引导到流式细胞计中。水池的温度可与着色步骤所用的温度类似。在一个实施例中,水池的温度在40-47℃的范围内。在另一个实施例中,水池的温度在20-37℃的范围内。在另一个实施例中,水池的温度在20-25℃的范围内。在被放置在水池中保持在一分钟和两小时之间的任何时间后,在步骤2611着色的精细胞被上述流式细胞术分拣。在步骤2613,收集的精细胞被浓缩。浓缩可在温度将不大大改变精细胞的温度的环境下进行。例如,在一个实施例中,浓缩可在温度在20和25℃的范围内的环境下进行。在步骤2615,增补剂、蛋白质源和低温保护剂被加入到浓缩精子。接着,在步骤2617,精细胞被装在人工受精试管中。在一个实施例中,装载步骤可在温度将不大大改变精细胞的温度的环境下进行。最后,在步骤2619,在上述低温保藏过程中,控制精子的温度。
在另一个实施例中,在不脱离本发明的保护范围内,精细胞可在较低的温度下被着色。例如,优选可在较低的温度下(例如,0℃至8℃)在流式细胞计中分拣精细胞。这可需要整体温度控制的改变。首先,当精细胞被引入流式细胞计之前对其冷却时,在玻璃态转化温度以下的温度保护精细胞不受冷冲击的蛋黄和其它常用蛋白质源通常不可用作这样的可能污染和/或堵塞流式细胞计的射流的包含蛋白质的物质。这样,优选在进行着色步骤之前对精细胞冷却以利用在纯精子中发现的自然冷冲击保护剂,例如,精液。在冷却前对精细胞着色的任何努力可能需要添加缓冲剂以保护可能稀释纯精子和降低抵抗冷冲击的天然保护的精子。
因此,在0℃至8℃的范围内的温度下分拣精细胞的本发明的一个实施例包括将精细胞放置在温度低于8℃的环境中以在着色前将精细胞冷却到在0℃至8℃的范围内的温度。任何方法可用于冷却精细胞,但优选使用一种在冷却过程中防止精细胞出现快速的温度波动的方法。例如,在一个实施例中,容纳精细胞的容器被放置在室温水池中,接着将精细胞放置在温度低于8℃的环境中。在另一个实施例中,精细胞的温度被监测并且在水池中加冰以进一步冷却精细胞。如上所述,着色步骤可被执行,除了着色混合物经受在0℃至8℃的范围内的温度以外。由于较低的温度,需要着色细胞的孵化阶段因此较长。在精细胞已经被冷却到8℃或者以下后,优选避免使它们暖化。这样,本发明的另一个实施例是在温度在0℃至8℃的范围内的环境下操作流式细胞计。类似地,本发明的另一个实施例是将分拣的精细胞收集在收集容器中,所述收集容器被温度在0℃至8℃的范围内的环境包围。本发明的另一个实施例是在0℃至8℃的范围内的温度下添加任何增补剂、低温保护剂、缓冲剂、蛋白质源、抗生素、抗氧化剂或者其它添加物。关于低温保护剂的添加,优选可在0℃至8℃的范围内的温度下添加比在没有分拣精细胞的情况下添加的略多的低温保护剂。这样,在一个特定实施例中,在0℃至8℃的范围内的温度下在精细胞已经被分拣后包含7%的丙三醇(v/v)的低温保护剂被加入到精细胞。
如在上面的低温保藏段中描述的从在0℃至8℃的范围内的温度对精细胞进行过冷。但是,在过冷之前在添加低温保护剂后精细胞需要在0℃至8℃的范围内的温度下保持一段时间以为精细胞提供平衡低温保护剂的时间。这样,根据一个实施例,使得精细胞在30分钟到3小时的范围内的时间段平衡低温保护剂。在另一个实施例中,使得精细胞在1-2小时的范围内的时间段平衡低温保护剂。在另一个实施例中,使得精细胞在90分钟的时间段平衡低温保护剂。
常规温度控制设备和方法(例如水池、孵化器、冷却器和冷冻器)可用于加热或者冷却样本以达到或者保持在本发明的以上实施例中的特定温度。应该理解的是,将样本放置在温度不同于样本的环境下将导致样本的温度随时间改变。甚至可在样本内具有温度差。如已经描述的,优选使得样本的温度逐渐变化以有助于维持精子的健康。逐渐的温度变化还用于减小样本内的温度差。本领域技术人员公知的是,样本的温度变化速度将受到许多因素的影响,包括样本量、样本容器的大小和形状以及样本和环境之间的温度差的大小。但是,本领域技术人员容易能够选择适合的方法和设备以在考虑所有相关的因素后达到所需的温度控制。
本领域技术人员应该理解的是,在不脱离本发明的保护范围的情况下,在示例性的温度控制中具有大的变化的可能性。一般地,在精细胞已经被冷却后,优选避免使它们暖化。另外,在不脱离本发明的保护范围的情况下,上面关于样本收集、着色、分拣、液滴收集、浓缩和低温保藏描述的温度差可被结合在整个温度控制中。另外,精细胞保持在任何温度下的时间也可影响精子的健康。这样,根据其中在整个过程中温度被控制的实施例的处理优选在下面描述的时间线内完成。
操作的时间线
通常,优选在可能减小对精子的伤害的最少的时间内完成精子分拣构成。如上所述,本发明还包括在高温下着色以减小精细胞着色所需的时间。例如,所述的改进的着色方法的某些实施例将着色所需的时间减小到10分钟。同样,上述新颖的细胞计数器可用于在比常规细胞计数器所需的时间更短的时间内分拣精细胞。例如,利用上述技术的流式细胞计每秒可收集2000至10000个具有所需DNA特征的精细胞。另外,与常规低温保藏方法相比,低温保藏方法可用于减小被处理的精细胞的低温保藏所需的时间。因此,本发明的一个实施例包括按照一个整体方法处理精子以利用一个或者多个省时创新以减小完成整个过程所需的时间。例如,根据本发明的一个实施例,一批精细胞(例如,一次射出的精液)从雄性哺乳动物(例如公牛)收集,对于质量控制的评估、着色、根据特定的DNA特征分拣,被装在一个或者多个容器中(例如,试管),并且在从收集时刻起12个小时的时间段内低温保藏。在另一个实施例中,时间段小于8小时。在另一个实施例中,时间段小于6小时。在另一个实施例中,时间段小于3小时。在另一个实施例中,时间段小于2小时。在另一个实施例中,时间段小于1小时。
多通道分拣设备和方法
为了在很短的时间内分拣更多的精子,可并行使用多于一个细胞计数器单元分拣同一精子样本。这样做的一种方式是简单地将着色的精子分成多个等份并且使得每一个等份通过不同的细胞计数器。但是,如下面所述的,通过设计一种包括在一个集成多通道细胞计数器单元中的多个细胞计数器单元的设备可提供某些优点。
共享集成(一体)平台的多通道系统
图106-116示出包括多通道细胞计数器系统1001的本发明的一个实施例,其中多个单通道流式细胞计单元1003被结合在一起形成一个整体系统以生产分拣的产品。四个这样的单元被示出在该特定实施例中,但该数量可改变。单元可以各种方式被集成,如通过共享包括下列元件中的一个或者多个的集成平台:(1)公共颗粒供给1005;(2)公共电磁辐射源1007;(3)公共壳体1009;(4)控制单元操作的公共输入1011;(5)提供一个单元相对于另一个单元的操作评估的公共输出1019;(6)公共流体输送系统1021;(7)公共温度控制系统1023;(7)公共电源1025;(8)公共废物回收系统1027;(9)公共偏转板系统1029;以及(9)公共清洁系统1031。在一个实施例中,该系统包括所有这些元件,但应该理解的是,本发明的多通道系统可包括元件的任何组合。公共元件的使用是有益的,这是因为它使得该系统更有效和有益地运转,通过减少变量的数量在通道中达到更一致的结果,有助于可能需要的任何故障检验,并且是经济的。该多通道手段还使得分拣系统更适于按比例增大或者减小。
每一个细胞计数器单元1003具有类似于在前面的实施例的流式细胞计设备9的某些部件,并且为了方便起见,利用相同的附图标记表示相应的部件并且加上符号(′)。一般地,每一个单元包括喷嘴系统101′,安装喷嘴系统的座331′,换能器105′,和用于将光束25′聚焦在离开喷嘴孔103′的流体流21′上的外照射光学系统417′,所有如前面所述的。每一个单元还包括如在第一实施例中操作的光检测器117′以检测来自于流21′中的颗粒的荧光发射31′和将发射31′转换成电信号701′,电信号701′被处理以根据特定的DNA特征对颗粒进行分类。每一个单元1003还可根据包含在液滴35′中的颗粒的分类将液滴33′分拣到不同的组或者群组123′和125′中。被单元分拣的液滴群组被收集系统2201收集。
A.公共壳体和模块化
流式细胞计单元被安装在公共壳体1009中的模块布置中。在图106和109-131中所示的实施例中,壳体具有底座1069和从底座向上延伸的两个侧壁1071。侧壁具有用于在壳体1077的前部支承下盖板1075的一对下台肩1073和一对上台肩1081。在壳体1077的前部的下盖板1075安装在下台肩1073之间。上台肩1081支承在壳体1085的后部的上盖板1083。壳体1077、1085的前部和后部基本是开放的以提供该设备内部的入口。应该理解的是,在不脱离本发明的保护范围的情况下,壳体1009可具有其它的构造。另外,应该理解的是,各个单元可被安装在分离的壳体中。
流式细胞术单元1003作为模块被并排安装在壳体1009中的一个适合的框架1087上。特别是,用于喷嘴101′定位的喷嘴安装座331′可拆卸地与固定在壳体的侧壁1071上的横梁1089相连(图106),并且外照射仪器417′的底座429′可拆卸地紧固在壳体的侧壁1071之间朝向壳体1085的后部延伸的具有一定角度的安装板1093上(图109),该布置是这样的,即,使得特定的单元作为模块被安装或者去除。该模块化有助于在维护和/或更换的情况下安装、拆卸,并且如果需要或者希望的话,能够使得任何数量的流式细胞术单元1003容易被添加以增大系统的生产能力。
B.公共流体供给和输送系统
该实施例的流体输送系统1021能够为每一个细胞计数器单元1003提供适合的流体。如在图108中示意性示出的,系统一般包括用于在压力下从载流体的公共供给1107输送载流体17′的泵1105、用于在压力下从鞘流体19′的公共供给1117输送流体的气体压力系统1115和用于从各个供给接收流体并且根据需要在压力下将流体输送到各个细胞计数器单元1003的歧管系统1121。在图116的特定实施例中,载流体的供给包括包含适量的这样流体(例如,5ml)的容器1123。容器被支架1125固定,支架1125可是具有尺寸适于接收容器1123的腔1135的块1133。该块还具有用于容纳包含在使用过程中调节该系统的适合的缓冲材料的容器1139的第二腔1137,如下面描述的。
用于从容器输送载流体的泵1105优选(但不是必需的)是上述的注射泵1141。泵的柱塞可移动通过吸入行程以从容器1139吸入所选择的载流体17′的量和通过排出行程以通过供给线1147将载流体分配到歧管1177和从那里分配到系统的各个喷嘴101′。注射泵还能够从包含缓冲剂的容器1139吸入流体和以所述的方式通过系统泵送缓冲剂。三通阀1149控制载流体和缓冲流体在泵1141之间的流动。该泵在处理器131′的控制下被变速马达驱动。例如,可利用以选择的变速操作的步进马达驱动泵以便以获得单元1003的所希望的生产量所需的速度将载流体泵送到歧管系统1121。多个注射泵或者其它类型的流体输送装置可代替一个注射泵被使用。
在一个实施例中,鞘流体的供给1117包括容器1155,例如利用供给线1157与歧管1177相连的罐。气体压力系统1115能够为罐加压并且包括通过气体线1163与罐相通的加压气体源1161(例如,空气或者氮),气体线1163中具有调节器1165以控制被供给到罐的压力和两向阀1167,两向阀1167在第一位置建立罐和气源之间的连通并且在第二位置能够使得罐排气。气体压力调节器1165是一种可调的以控制从气源供给的压力的常规调节器。气体压力系统1115还包括用于为可用于以下面所述的方式冲洗流路的清洁溶液(例如罐中的去离子水)的供给1173加压的气体线1169。利用可以与阀1167相同的方式操作的两向阀1167控制通过气体线的流动。
在一个实施例中,歧管1177包括层压材料块1179(图112),层压材料块1179中形成有通道1181以限定流体流路1185,诸如在图116中图解示出的。(通道可通过在组装叠层以形成块之前在叠层的面中机加工沟槽来形成的)。流路包括与注射泵1141和鞘流体供给1117相连的入口1189、1191和用于为流式细胞术单元1003提供这样的流体的出口组1193,每一个这样的组包括载流体出口和一个鞘流体出口。利用阀V1-V6控制通过各个流动通道1181的流动,在一个实施例中,阀V1-V6是在与歧管块1179相连的壳体中的螺线管操作阀。该块优选由基本透明的材料构成(例如,丙烯酸塑料)以有助于监测系统1121和故障排除。在所示的实施例中,歧管1177与框架元件1203相连,框架元件1203靠近在喷嘴系统101′下方的壳体的底部在壳体1009的侧壁1071之间延伸。歧管1177的入口和出口1193可包括以螺纹的方式拧在块中的配件1205,诸如从Upchurch Scientific,a division ofScivex得到的无凸缘螺母和套圈配件。应该理解的是,在不脱离本发明的保护范围的情况下,一般的流路1185以及特别是歧管1177的设计和构造可改变。
参见图116,用于载流体17′的歧管流路1185包括用于容纳有限载流体供给(例如,10ml)的样本存储室1207。如果载流体包含精细胞,例如,靠近喷嘴101′提供这样一个样本存储室有益于精细胞的生存力和游动性,这是因为将这样的细胞存储在小空间内(即使在短时间内)可对游动性产生不利影响。利用一系列分别对应于每一个喷嘴的两向阀V1A-V1D控制载流体从样本存储室1207流到喷嘴101′。每一个阀V1A-V1D具有在样本存储室的针1217和供给喷嘴的针157′之间建立流体连通以在由注射泵1141产生的压力下将载流体17′输送到针的第一位置和在针1217和废物系统1221之间建立流体连通的第二位置,废物系统1221对于所有流式细胞术单元1003是公共的。在所示的实施例中,废物系统1221包括用于容纳废物材料的废物罐1223、诸如真空泵的用于在废物罐中产生真空的机构1225和连接阀V1A-V1D和废物罐的废物线1227。如果需要的话,阀V3被提供在废物罐上游的废物线中以打开和关闭废物线。适合的憎水过滤器1233被提供在连接废物罐1223和真空泵125的线中。
用于鞘流体19′的歧管流路1185包括多个阀V2A-V2D。每一个阀具有建立与罐中的鞘流体的供给1117流体连通以通过鞘供给线1241将鞘流体19′输送到各自流动主体133′的第一位置和通过废物线1247在流动主体和废物罐之间建立流体连通的第二位置。鞘流体被输送到流动主体133′的压力将取决于鞘罐压力(如由调节器1165控制的),鞘罐压力可在1至100psi的范围内,优选在10至50psi的范围内,优选在15至40psi的范围内,并且优选在20至30psi的范围内。
尽管对于所有单元使用一个公共供给具有多个优点,但可以预见的是,可从分离的源为至少一些流式细胞术单元提供样本材料。
C.公共电源和输入和输出控制
流式细胞术单元1003还共享公共电源1025、公共功率输送系统、利用微处理器131′控制通道的操作的公共输入(GUI)715′和提供给微处理器以对一个通道相对于另一个通道的操作进行评估的公共输出。例如,公共输出包括将数字化信号从每一个外照射系统提供给微处理器以指示由每一个通道测量的荧光强度、指示每一个通道分离颗粒的速度、指示着色变化(可由来自于X和Y细胞的荧光脉冲的强度差表示)以及指示由用于在颗粒之间的识别的每一个通道使用的判定边界763。作为另一个示例,公共输出包括将输出信号从分裂传感器389′提供到微处理器以指示每一个通道的液滴分裂位置107′。
D.公共温度控制
另外,温度控制系统1257被提供以调节支座1133中的容器1123的内容物的温度和歧管1177的温度。这样的温度控制减少系统的可变性,从而提供在通道之间的更一致的测量,并且对于某些类型的细胞(例如,精细胞),有助于保持细胞的生存力。
在一个实施例中,温度控制系统1257包括:流体流路159,流体流路159包括在支座1133中的流体通道1263和在歧管座1179中的流体通道1269;以及用于计算在所选择的温度下通过流路的热流体(例如,水)的控制单元1265。该温度优选是这样的,即,使得流体(特别是载流体)保持在最佳温度以使得细胞生存力达到最大,并且如果包含精细胞,使得精子的游动性达到最大。截止阀V6位于流路中以控制通过流路的流动。温度控制单元可用于在如上所述分拣之前使得精细胞保持在所需的温度。
在操作者或者适合的编程的控制下利用常规装置(诸如螺线管)操作在流体输送系统1021中的所有阀。连接在歧管座1179外部的系统的部件的各个流体流线优选是基本透明的塑料管以观察任何堵塞。例如,管可为外径为0.0625英寸的FEP聚合物管。温度控制系统1257的流线优选略长(例如,外径为0.125英寸)以提供较大的流动能力。
E.公共光束和束分裂系统
如上所述,多通道系统共享电磁辐射或者光束1007的公共源。例如(非限定性的),源可是来自于UV多线激光器的激光束,主要具有351.1纳米和363.8纳米的波长。或者,优选使用脉冲激光器(例如,模式锁定激光器),特别是使得数字采样与脉冲激光器同步(如在脉冲激光器段中描述的)以增大被输送到每一个细胞计数器单元的有效功率,从而增加可利用一个激光器操作的细胞计数器单元的数量。
产生激光束所需的功率将根据每一个流式细胞术单元的要求和单元的数量改变。例如,如果具有N个单元并且每一个单元需要具有W瓦的有效功率的光束,那么将需要产生具有功率(W×N)+L的激光束,其中L等于在系统的光学元件之间的系统功率损失。所有流式细胞术单元使用一个激光器与利用多个激光器的系统相比是经济的。这也是有效的并且提供从一个通道到下一个通道的更一致的测量,这是由于不同束特征没有变化(例如,束强度、光偏振、束发散)或者因没有利用多个激光器而导致的电子噪声。
根据本发明的一个实施例,束分裂和引导系统用于将一个激光束分裂成三个或者多个分离束。如图117中所示,例如,50/50束分裂器1270(即,用于将一个束分裂成两个具有基本相等的强度的分离束的束分裂器)可用于将一个束25′分裂成两个束1270A、1270B。利用第二50/50束分裂器1271以将两个束1270B中的一个分裂成两个附加的束1271A、1271B,人们可从一个束25′产生总共3个束1270A、1271A、1271B。每一个束可被引导到流式细胞计的光学系统中,例如图117中所示的外照射光学系统415′。人们还可使用附加的50/50束分裂器以将一个激光束分裂成任何数量的附加的分离束。如图118中示意性示出的,例如,第三束分裂器1272可被加入到3路束分裂系统(图117)以使三个束分裂器1270、1271、1272可用于将一个束25′分裂成四个分离束1271A、1271B、1272A、1272B。由此,人们可容易地理解,一个束可被分裂成任何数量的分离束。其它束分裂布置可用于将入射源束分裂成多个对应于各个单元的光束。
一个束分裂系统的一个希望的实施例被示出在图106和109中。束引导系统1273被提供以将公共束1007引导到各个流式细胞术单元1003的光学仪器417′。在图106和111所示的实施例中,引导系统1273包括安装在壳体1009的一个侧壁1071上的下镜组件1279、在下镜组件上方的安装在侧壁1071上的上镜组件1281和一系列反射滤光器1283,一个与每一个光学仪器417′相关。下镜组件用于将束1007从适合的源向上反射到上镜组件,并且上镜组件用于通过在侧壁1071中的开口将束反射到各个仪器417′的反射滤光器431′。
在一个实施例中,下镜组件包括紧固在壳体1009的侧壁1071上的底座1285、由适合的机构1291在底座上垂直移动的级1289,诸如测微计,在级上的可倾斜的平台1293(例如,从Newport得到的运动光学座型号P100-P)和在平台上的镜1295,可通过将级和镜平台移动到适合的位置来调节镜的位置。上镜组件与下镜组件类似,包括底座1297、可垂直移动的级1299、在级上的可倾斜的平台1301和在平台上的镜1303。一对目标板1309在上镜组件与下镜组件之间固定在壳体1009的侧壁上。目标板1309中具有垂直排列的孔1311以有助于上镜组件与下镜组件的调节使得入射束1007精确地朝向仪器417′的反射滤光器431′反射,所有滤光器与入射束对准。
头三个反射滤光器1315、1317、1319的每一个用作束分裂器,即,它用于反射特定百分比的束并且使得其余百分比的束通过。例如,对于四个外照射仪器,头三个仪器的反射滤光器431′分别反射一定百分比的激光1007,以使该系列的头三个单元的每一个接收初始光束的25%的电磁辐射。例如,第一、第二和第三单元的反射滤光器可分别反射25%、33%和50%的入射光。该系列的最后一个反射滤光器1321优选将所有的剩余光(25%的初始光束)反射到该系列的最后一个仪器。因此,四个仪器中的每一个应该接收相同强度的辐射(光)以询问在各个流中的细胞。
根据在上述系统1273中所用的束分裂装置,激光束优选可具有特定的偏振。介电滤光器的透射反射比可根据光的偏振改变。另外,当涉及线性偏振光时,介电滤光器(所制造的介电滤光器以特定入射角使用)可对于入射角的改变过于敏感。圆形或者椭圆形偏振光在一定程度上缓和该问题,这是由于当光与滤光器相互作用时,光的偏振矢量相对于介电滤光器的光学轴线处于多个不同的取向。这样,圆形或者椭圆形偏振光模拟随机偏振光,从而为介电滤光器上的入射角提供较大的容限。因此,如果上述激光器产生例如具有垂直偏振的光束,那么优选可在它被分裂之前将该光转换成圆形偏振光。本领域技术人员应该理解的是,这可通过使得束通过由偏光材料制成并且其光学轴线相对于激光偏振平面旋转45度的1/4波延迟板(滤光器)来实现。这样由该波板传输的束将具有基本为圆形的偏振,并且它可更容易分裂以为相应的流式细胞术单元的光学系统提供多个束。
另外,通过转动波延迟板以改变激光偏振和用于制造波板的材料的光学轴线之间的角度,偏心度可被引入到束的基本圆形的偏振中(即,可使得偏振更趋于椭圆)。改变束的椭圆偏振的偏心度可通过使得更大百分比的光的偏振矢量相对于介电滤光器的光学轴线具有特定的角度来改变介电滤光器的透射反射比。因此,如果在多个细胞计数器单元中的光的平衡在所需范围外,人们可转动波板以增大或者减小椭圆偏振光的偏心度,从而改变各个滤光器的透射反射比直至达到更好的平衡。类似地,如果波板传输椭圆偏振光,人们可通过转动滤光器来影响其中一个滤光器的透射反射比。
无论采用什么方法将一个光束分裂成多个分离束,都可通过选择性地堵塞一定百分比的光来达到被输送到每一个细胞计数器单元的功率的平衡以将所有细胞计数器单元降至相同的功率水平。例如,每一个外照射系统415′的中性密度滤光片447′可被选择以阻塞或多或少的光,从而平衡由束分裂和引导系统输送到每一个独立的细胞计数器单元的照射功率。如果多通道单元的一个通道从束分裂和引导系统接收较多的照射,传输很少的光的中性密度滤光片467′可用于该通道的外照射系统415′中以使得该通道的照射功率与其它的通道一致。尽管不是必需的,但是优选,通道与通道的照射功率的变化可小于10%。优选,通道与通道的照射功率的变化可小于5%。
应该理解的是,如上所述,脉冲激光扫描对于多通道流式细胞术可能是需要的。例如,UV多线激光器可被以85MHz操作的模式锁定脉冲激光器代替以使得较多的流式细胞术通道被一个激光器提供功率。例如,以85MHz的频率发出宽度(持续时间)为12皮秒的脉冲的模式锁定激光器的每一个脉冲中提供的峰值功率约是激光器平均功率输出的800倍。这样,模式锁定激光器(例如,来自于Spectra-Physics的Vanguard350)可提供足够的照射能量以操作几打细胞计数器单元(例如,32个细胞计数器单元)同时仅以350毫瓦操作。
可以预见的是,使用光纤将光提供给单元。在该实施例中,光纤用于将来自于激光器的光引导到各个单元,从而无需上述引导系统。
F.公共偏转板
在图106和108-116中所示的实施例中,每一个流式细胞术单元1003的分拣系统119′基本与在第一实施例中所述的分拣系统119相同,不同之处在于,单元优选共享在壳体的前部在壳体1009的宽度上延伸的两个公共偏转板1331。利用一组公共的偏转板具有如下优点,包括从一个通道到下一个通道的一致电荷、公共电源的使用、提供更稳定的电场和更均匀的液滴偏转的较大的板区域以及用于分拣的样本收集的一致的偏转角。偏转板1331安装在被紧固在壳体1009上的框架1333上。或者,为每一个单元提供独立的板。
G.公共收集系统
在图107和116中所示的实施例中,公共收集系统2801包括上面关于一个单元的收集系统2201描述的用于每一个细胞计数器单元的两个截取装置。但是,公共框架2803被提供以固定所有八个截取装置。另外,用于每一个细胞计数器单元的两个截取装置中的一个将流体引入到废物溜槽2805而不是收集容器中。废物溜槽使得废弃包含基本没有价值的颗粒的分拣的液滴(例如,对于养殖奶牛的带有Y染色体的精细胞)更容易。如果优选保持所有分拣的液滴,废物溜槽可被去除并且可将收集容器放在每一个截取装置下方。在图107和116中所示的实施例中的四个收集容器放置在收集托架2807的表面中的开口中。公共水池(未示出)可被提供在收集托架的表面下方以控制收集容器的内容物的温度。
H.多通道控制
各个流式细胞术单元被微处理器131′控制(或者其它适合的处理系统),微处理器131′优选具有上述的公共输入和公共输出。
每一个流式细胞术单元1003的操作参数优选可以与其它单元独立的形式被设定以使这样的参数可在单元之间被改变。这些参数例如可包括液滴形成的频率、特定单元所用的控制和分拣策略、每一个单元所用的用于在被供给到单元的流体中分类和分拣颗粒的标准,和其它参数。例如,在某些情况下,优选可以第一流速为一个或者多个单元提供载流体17′并且以第二(不同)流速为其它单元提供载流体。类似地,优选可对于一个或者多个单元使用一种控制分拣策略(例如,“高效率”策略)同时对于其它单元使用不同的策略(例如“低损失”策略)。通过基于历史数据和实时收集的数据控制单元之间的这些参数的变化,单元的处理量可被管理和使得系统的结果达到最佳。独立操作的能力还允许使得所选择的单元在比需要或者使用的所有单元少的情况下被操作。
I.多通道系统的操作
该实施例的多通道系统的操作类似于上述的,不同之处在于,多个流式细胞术单元适于并行地进行流式细胞术操作(即,在同一时间段或者重叠时间段)以使得处理量较高。
在开始运转之前,如果需要的话,通过将阀V5移动到其清洁位置来利用罐1173中的清洁溶液冲洗流体输送系统1021。接着利用注射泵1141用缓冲流体对系统进行调节。在该程序中,阀V1A-V1D和阀V2A-V2D移动以建立与在真空下的废物容器1223的连通。因此,清洁溶液和/或缓冲流体流过系统废弃。该构成清洁系统1021,启动注射泵1141和将空气泡从系统去除。
对于适当定位的三向阀1149,注射泵1141被操作通过吸入行程以吸入一定量的包含颗粒(例如精细胞)的载流体17′,接着阀1149被移动以建立与歧管1177的连通,并且注射泵移动通过排出行程以将一定量的载流体泵送到样本存储室1207中以充填其。利用温度控制系统1257控制载流体17′的温度以使得载流体中的细胞保持在所需温度。对于位置适于建立与样本存储室207连通的阀V1A-V1D,注射泵1141的进一步操作迫使载流体通过线到达各个喷嘴组件的针以流过喷嘴101′,如上所述。同时,并且对于位置适于建立与鞘流体罐1155连通的阀V2A-V2D,鞘流体19′被迫通过供给线到达各自流动主体和并且通过喷嘴,也如上所述。该过程持续足以将适量的流体泵送通过系统1001的适当的时间。一种特定运转的持续时间将根据各个容器中的载流体的质量、载流体被泵送通过系统的速度以及系统中的通道数量而改变。例如,运转仅持续有限的时间段(例如,15分钟,在该过程中1ml的载流体被输送给每一个喷嘴)或者它可无限连续,如果需要的话,流体的供给被补充。
在针157′被堵塞的情况下,适合的阀V1被移动以建立与废物容器1223的连通。进入流动主体133′的鞘流体19′接着将在真空1225的作用力下流回通过针157′废弃,这样冲洗和清洁针。如果需要停止流到特定喷嘴,阀V1和V2被简单地切换到它们的废弃位置。
尽管这里上面关于单通道和多通道构造描述的系统已经对于颗粒分离,诸如X和Y细胞的分离被描述,但可以预见的是,这样的颗粒包括任何具有不同特征(可任意地被表示为特征A和特征B)的颗粒。另外,应该理解的是,在一些实施例中,分拣功能可被完全取消,以使流式细胞术设备(单通道或多通道)仅用作对颗粒分类而表示对它们进行分拣。
尽管上面在并行地操作流式细胞术单元的范围内对多通道系统进行了描述,但是应该理解的是,单元也可串行地操作。例如,可以预见的是,在一个流中的颗粒可被一个单元分拣到多个群组中,并且这样分拣的群组的一个或者多个接着通过串行的一个或者多个其它的单元以进行附加的分拣操作,利用相同或者不同的分拣策略分拣不同的颗粒。
J.垂直多通道实施例
图119和120示出另一个示例性多通道流式细胞术系统。该系统4001包括结合在一起的四个细胞计数器单元4009。喷嘴系统101′、外照射光学系统450′、偏转板629′、样本台4051、污染防止机构4031和每一个单元4009的其它部件安装在共享的垂直安装板4011上。参见图120,一个激光器4013和基本类似于上述束分裂和引导系统1273的束分裂和引导系统4015为每一个外照射系统450′提供照射。激光器4013通过在包含束分裂和引导系统4115的公共壳体4021中的孔4019(图119)。束分裂和引导系统4115和外照射系统450′在板4011的一侧。每一个外照射系统450′的聚焦透镜组件491′通过板4011延伸到另一侧(与图26和27所示的单通道系统中所示的构造类似),单元4009的其余部件安装在该另一侧。
单元4009都是这样取向的,即,使得它们的喷嘴系统101′向下引导流体流21′。每一个单元4009还具有收集系统4031,收集系统4031包括用于收集包含所需颗粒群组的液滴33的收集容器4033和用于收集其它液滴33的废物容器4035。水池(未示出)或者其它温度控制可用于控制收集容器4033的温度。
多个流式细胞术单元4009也可共享一个公共电源(未示出)、用于控制单元的操作的公共输入(未示出)和使得单元4009的操作的相互之间的比较评估的公共输出(未示出)。两个示例性多通道实施例1001、4001的比较证明,在不脱离本发明的保护范围的情况下,在一个多通道系统中的集成平台的性质和多个流式细胞术单元之间的特征共享可被大大改变。
多通道处理对整个方法的影响
可利用多通道精子分拣执行上述整个方法以减小分拣精细胞所需的时间。除了很少的例外,该方法不改变。一个微小的变化是,分拣的精细胞将被收集在多个收集容器中。如果需要的话,多个收集容器的内容物可被结合以浓缩。或者,每一个收集容器的内容物可被独立浓缩。应该理解的是,利用多个细胞计数器单元处理该批精细胞可使得从收集到低温保藏步骤的完成分拣一批精细胞(例如,一次射出的精液)所需的时间被大大减少。例如,如果四个细胞计数器单元并行操作以处理该批精细胞,完成分拣所需的时间被减小到利用一个细胞计数器单元分拣该批精细胞所需的时间的四分之一。这样,通过利用四个并行操作的细胞计数器单元分拣精子的步骤代替利用一个细胞计数器单元分拣精子的步骤,完成该方法从收集到完成冷冻步骤的示例性时间线可被减小。还可通过增加并行操作以分拣在样本中的精细胞的细胞计数器的数量来进一步减少该时间,经受在具有多于四个这样的单元的并行系统的操作中包含的实践限制。这样,根据本发明的一个实施例,通过在一个多通道流式细胞术设备中根据特定的DNA特征分拣精细胞执行上述整个过程中的分拣步骤。在另一个实施例中,精子处理方法包括在一个多通道流式细胞术设备中根据特定的DNA特征分拣精细胞的步骤,其中每一个通道每秒收集在2000-10000个范围内的具有所需DNA特征的精细胞。
多通道分拣示例I
利用人工阴道从性成熟的公牛收集公牛精子并且在37℃下在温度控制容器中将样本输送到附近的着色设施。在接收后,利用Hamilton-Thorn游动性分析器(IVOS)根据标准的和公知的程序(Farrel等的Theriogenology49(4):871-9(Mar 1998))对精子的浓度、视觉游动性、游动性和前进性进行分析。
通过在41℃的包含10mM丙酮酸盐的TCA #2缓冲剂中悬浮一个精子的等份使得整个pH为7.35来制备1mL的150×106个精子/mL的精子悬浮液的六个管。接着,不同量的在水中的10mM的Hoechst 33342溶液被加入精子样本以产生最终染料浓度为200、300、400、500、600和700μM的Hoechst33342。六个样本中的每一个在41℃下被孵化约30分钟。利用流式细胞术对样本进行分析并且对于200、300和400μM的Hoechst 33342利用迭代计算机算法评估X细胞群组的%CV。300和200μM的Hoechst 33342的%CV被确定在接近1.3%的可接受的范围内。因此,可以确定浓度为250μM的Hoechst33342可用于对一批精细胞进行着色以进一步处理。
通过在41℃的包含10mM丙酮酸盐的TCA #2缓冲剂中悬浮一个精子的等份(也使得整个pH为7.35)来制备每一个包含2mL的150×106个精子/mL的精子悬浮液的两个管。接着,10mM的Hoechst 33342水溶液被加入到两个精子悬浮液中的每一个以产生最终染料浓度为250μM的Hoechst33342。精子悬浮液在41℃的水池中保持30分钟。在30分钟后,将精子悬浮液从41℃的水池中取出并且4μL的25mg/mL的FD&C #40被加入到其中一个悬浮液中。另一个被储放在环境温度下以为评估实验提供比较样本。
着色的和冷却的精子悬浮液被装在一个四通道液滴分拣流式细胞计的一个通道的样本端口上。Delbecco′s PBS用作鞘流体。细胞计装有上述定向喷嘴并且具有60微米的孔。如上所述垂直于喷嘴的纵向轴线安装半圆形挡板。换能器以54KHz操作并且液滴分裂位置被人工控制。上述的一种外照射光学系统用于引导连续波激光束的25%以垂直角度与流体流相交。聚焦和收集透镜具有0.65的数值孔径。束被聚焦成宽度小于3微米的斑以缝隙扫描精细胞。利用数字信号处理抽取临界斜坡差和对于每一个检测脉冲波形的脉冲区域。在两维CSD中的对X细胞、Y细胞和未确定的细胞分类的分类参数和脉冲区域特征空间被人工输入到处理系统中以根据染色体含量对精细胞分类。
利用用于收集X细胞的重合接受分拣策略根据X和Y染色体含量对精子分拣,分配每一个未分类的精子为X细胞或者Y细胞的50/50概率。样本流体速度被人工调节以使得收集的X细胞群组的纯度(用GUI表示)保持在85%或者更高并且使得X细胞分拣速度保持在最小速度以上。在15000000个X精子已经被收集在已经在鞘流体中浸泡至少一个小时接着涂有0.5mL的pH为7.0的在TCA#2缓冲剂中的10%的蛋黄的管中后,该管被取出并且利用已经被类似制备的附加管代替。
在从流式细胞计中取出收集管后,立刻制备着色的但未被分拣的精子悬浮液的比较样本。分拣的和比较样本在15mL管中以7min@750g被离心分离。利用转移吸管去除上清液以产生约40000000个精子/mL的浓度。pH7.0的TCA #2缓冲剂被加入到精子悬浮液以产生约20000000个精子/mL的最终浓度。该过程持续直至流式细胞计已经产生四个收集管(A2-A5)。利用IVOS评估分拣的样本和“未分拣的”比较样本。利用差分干涉对比显微镜对于分拣的样本A3及其未分拣的比较样本的纯的精子的顶体的百分比进行测试。利用血球计对分拣的样本计数以确定每小时分拣的精子的输出速度。利用流式细胞计再次分析确定带X染色体的精子的百分比。对于分拣的样本和“未分拣的”比较样本的IVOS评估结果被提供在图121(游动性)和122(前进性)中。被分拣到每一个收集管中的精子总数被示出在图123中,每一个收集阶段的每小时分拣精子的速度被示出在图124中。每一个被分拣的样本的带X染色体的精子的百分比被列在图125中。精子的顶体完整性评估的结果为被分拣的样本纯的精子的顶体为72%,未分拣的比较样本为78%。
结果表明了多通道流式细胞术系统的每一个通道在保持时间内以大于85%的纯度每秒产生多于5000个分拣X细胞的技术能力。该结果还表示在理想条件下在保持时间内以大于85%的纯度每秒产生多于7000个分拣X细胞的技术能力。另外,该结果表示利用这样的高速流式细胞术分拣获得的分拣精细胞的样本将仅在游动性上略微降低,表示分拣的精子具有良好的生育性。
多通道分拣示例II
利用人工阴道从性成熟的公牛收集公牛精子。一次射出的精液被分成两个等份。第一个250μL的精子等份被悬浮在5mL的37℃Triladyl_中。包含一次射出的精液的其余部分的第二等份被悬浮在两部分37℃的碳酸盐缓冲剂中(pH6.1-6.2)。两个等份在37℃下在温度控制容器中被输送到处理设施。在处理设施,第一等份浮在200mL的烧杯中的120mL的37℃的水中并且被放置在冷室中以慢冷到5℃。利用Hamilton-Thorn游动性分析器(IVOS)根据标准的和公知的程序(Farrel等的Theriogenology 49(4):871-9(Mar 1998))对第二等份的浓度、游动性和前进性进行分析。
通过将来自于第二等份的包含150000000个精子的子等份转移到空管,以500g离心分离5分钟,去除上清液并且使得精子丸在1mL的28℃的pH为7.35的包含10mM丙酮酸盐的TCA #2缓冲剂再次悬浮来制备1mL的150×106个精子/mL的精子悬浮液的三个管。不同量的10mM的Hoechst33342溶液被加入到三个管的每一个以产生最终染料浓度为100、150和200μM的Hoechst 33342。三个管的每一个在28℃下保持60分钟。利用流式细胞术对三个管的每一个中的精子进行分析并且利用交互计算机算法对于100、150和200μM的Hoechst 33342着色条件确定X群组的总荧光强度的CV。150和200μM的Hoechst 33342的CV被确定在接近1.3%的可接受的范围内。因此,可以确定使用包括浓度为150μM的Hoechst 33342的着色条件进行分拣。
通过转移来自于第二等份的包含750000000个精子的子等份,以500g离心分离5分钟,去除上清液并且使得精子丸在28℃的pH为7.35的包含10mM丙酮酸盐的TCA #2缓冲剂再次悬浮来制备5mL的150×106个精子/mL的精子悬浮液的一个管。一定量10mM的Hoechst 33342水溶液被加入到管中以产生最终染料浓度为150μM的Hoechst 33342。该管在28℃下保持60分钟。在60分钟后,从28℃的水池中取出管并且加入10μL的25mg/mL的FD&C #40。
现着色的和冷却的精子悬浮液被装在一个多通道液滴分拣流式细胞计系统的一个通道的样本端口上。精子悬浮液被保持在28℃。利用如在多通道示例I中所述的基本相同仪器设置,利用重合中断分拣策略在将具有18000000个精子的浓缩的X细胞群组放置在一个收集管中所需的时间内由流式细胞术系统分离带X和Y染色体的精子,所述收集管是通过已经在鞘流体中浸泡至少一个小时接着加入0.5mL的pH为6.6的包含10mM丙酮酸盐的Triladyl_低温保藏介质来制备。精细胞以在每秒25000和30000个细胞之间的速度被引入到流式细胞术系统中。以在每秒4500个至6000个的速度收集浓缩的X细胞群组。当约18000000个精子已经被分拣到收集管中时,该管被取出并且利用已经被类似制备的附加管代替。在从流式细胞计中取出收集管后,分拣的精子悬浮液以7min@750g被离心分离。利用转移吸管去除上清液以产生约100000000个精子/mL的浓度。pH为6.6的包含10mM丙酮酸盐的Triladyl_低温保藏介质被加入到精子悬浮液以产生约50000000个精子/mL的最终浓度。该过程持续直至流式细胞计已经产生三个收集管(D1-D3)。约52000000个精子在259分钟内被分拣以产生每小时分拣约12000000个浓缩X精细胞的平均收集速度。重新悬浮的分拣的样本管浮在200mL的烧杯中的120mL的28℃的水中并且被放置在5℃的冷室中以慢冷。
在分拣的样本达到5℃后,分拣精子的三个管被结合在一个管中。利用IVOS分析汇集的样本以确定游动性百分比、前进性百分比和浓度。附加的pH为6.6的包含10mM丙酮酸盐的Triladyl_低温保藏介质被加入样本以产生约50000000个精子/mL的最终浓度。如由流式细胞计再次分析确定的,在分拣的汇集的样本中的带X染色体精子的百分比为87%。IVOS评估与同一一次射出的精液的未分拣的样本相比的概述被示出在图126中。
在5℃的冷室中汇集的分拣的样本和第一等份被装在标准0.25cc的试管中。装载的试管被转移到可编程的冷冻装置并且被下列程序冷冻:5min@5℃,从5℃冷却到-12℃@4℃/min,从-12℃冷却到-100℃@40℃/min,从-100℃冷却到-140℃@20℃/min,保持在-140℃。在试管已经达到-140℃后,将它们从冷冻装置快速取出并且放入液氮中。
在37℃孵化30和120分钟后对利用IVOS分析解冻的试管的游动性百分比和前进性百分比。一组两个分拣的和未分拣的试管的结果概括在图127和128中。
多通道分拣示例III
利用人工阴道从性成熟的公牛收集公牛精子。一次射出的精液被分成两个等份。第一个250μL的精子等份被悬浮在5mL的37℃Triladyl_中。包含一次射出的精液的其余部分的第二等份被悬浮在两部分37℃的碳酸盐缓冲剂中(两部分NaHCO3为0.097摩尔/升,KHCO3为0.173摩尔/升以及C6H8O7-H2O为0.090摩尔/升)(pH6.1-6.2)。两个等份在37℃下在温度控制容器中被输送到处理设施。在处理设施,第一等份浮在200mL的烧杯中的120mL的37℃的水中并且被放置在冷室中以慢冷到5℃。利用Hamilton-Thorn游动性分析器(IVOS)根据标准的和公知的程序(Farrel等的Theriogenology 49(4):871-9(Mar 1998))对第二等份的浓度、游动性和前进性进行分析。
通过将来自于第二等份的包含900000000个精子的部分分别转移到两个空管中,每一个管以500g离心分离5分钟,从每一个管中去除上清液并且使得每一个精子丸在6mL的28℃的pH为7.35的包含10mM丙酮酸盐的TCA#2缓冲剂再次悬浮来制备150×106个精子/mL的精子悬浮液的两个管。10mM的Hoechst 33342水溶液被加入到两个管的每一个以在一个管中产生最终染料浓度为200μM的Hoechst 33342和在其它管中的400μM的Hoechst33342。两个管的每一个在28℃下保持120分钟。利用流式细胞术对每一个管中的精子进行分析并且利用交互计算机算法对于200和400μM的Hoechst33342着色条件确定X群组的总荧光强度的CV。200和400μM的Hoechst33342的CV被确定在接近1.3%的可接受的范围内。着色有浓度为200μM的Hoechst 33342的精子悬浮液被选择用于分拣。在分拣前在该着色的精子悬浮液的管中加入10μL的25mg/mL的FD&C #40。
着色的精子悬浮液被装在一个多通道液滴分拣流式细胞计系统的一个通道的样本端口上。精子悬浮液被保持在28℃。利用如在多通道示例I中所述的基本相同仪器设置,利用重合中断分拣策略在将具有18000000个精子的浓缩的带X染色体的细胞群组放置在一个收集管中所需的时间内由流式细胞术系统分离带X和Y染色体的精子,所述收集管是通过已经在鞘流体中浸泡至少一个小时接着加入0.5mL的pH为6.6的包含10mM丙酮酸盐的Triladyl_低温保藏介质来制备。精细胞以在每秒25000和30000个细胞之间的速度被引入到流式细胞术系统中。以在每秒4500个至6000个的速度收集浓缩的X细胞群组。当约18000000个精子已经被分拣到收集管中时,该管被取出并且利用已经被类似制备的附加管代替。在从流式细胞计中取出收集管后,分拣的精子悬浮液以7min@700g被离心分离。利用转移吸管去除上清液以产生约100000000个精子/mL的浓度。pH为6.6的包含10mM丙酮酸盐的Triladyl_低温保藏介质被加入到精子悬浮液以产生约50000000个精子/mL的最终浓度。该过程持续直至流式细胞计已经产生两个收集管(C1-C3)。约35000000个精子在193分钟内被分拣以产生每小时分拣约11000000个浓缩X精细胞的平均收集速度。重新悬浮的分拣的样本管浮在200mL的烧杯中的120mL的28℃的水中并且被放置在5℃的冷室中以慢冷。
在分拣的样本达到5℃后,分拣精子的三个管被结合在一个管中。利用IVOS分析汇集的样本以确定游动性百分比、前进性百分比和浓度。附加的pH为6.6的包含10mM丙酮酸盐的Triladyl_低温保藏介质被加入样本以产生约50000000个精子/mL的最终浓度。如由流式细胞计再次分析确定的,在分拣的汇集的样本中的带X染色体精子的百分比为88%。IVOS评估与同一一次射出的精液的未分拣的样本相比的概述被示出在图129中。
在5℃的冷室中汇集的分拣的样本和未分拣的样本(即,上面的第一等份)被装在标准0.25cc的试管中。装载的试管被转移到可编程的冷冻装置并且被下列程序冷冻:5min@5℃,从5℃冷却到-12℃@4℃/min,从-12℃冷却到-100℃@40℃/min,从-100℃冷却到-140℃@20℃/min,保持在-140℃。在试管已经达到-140℃后,将它们从冷冻装置快速取出并且放入液氮中。
在37℃孵化30和120分钟后对利用IVOS分析解冻的试管的游动性百分比和前进性百分比。一组两个分拣的和未分拣的试管的结果概括在图130和131中。
多通道分拣示例IV
利用人工阴道从性成熟的公牛收集公牛精子。一次射出的精液被分成两个等份。第一个250μL的精子等份被悬浮在5mL的37℃Triladyl_中。包含一次射出的精液的其余部分的第二等份被悬浮在两部分37℃的碳酸盐缓冲剂中(两部分NaHCO3为0.097摩尔/升,KHCO3为0.173摩尔/升以及C6H8O7-H2O为0.090摩尔/升)(pH6.1-6.2)并且在二氧化碳下保存。两个等份在37℃下在温度控制容器中被输送到处理设施。在处理设施,第一等份浮在200mL的烧杯中的120mL的37℃的水中并且被放置在冷室中以慢冷到5℃。利用Hamilton-Thorn游动性分析器(IVOS)根据标准的和公知的程序(Farrel等的Theriogenology 49(4):871-9(Mar 1998))对第二等份的浓度、游动性和前进性进行分析。
通过将来自于第二等份(pH6.1-6.2)的包含750000000个精子的部分转移到空管中并且加入28℃的碳酸盐缓冲剂(pH为7.35)达到最终5ml的量来制备5mL的150×106个精子/mL的精子悬浮液的一个管。10mM的Hoechst 33342水溶液被加入该精子悬浮液以产生最终染料浓度为150μM的Hoechst 33342。悬浮液在二氧化碳下在41℃保持40分钟并且被放置在28℃以用于分拣。在分拣前在该着色的精子悬浮液的管中加入10μL的25mg/mL的FD&C #40。
着色的精子悬浮液被装在一个多通道液滴分拣流式细胞计系统的一个通道的样本端口上。精子悬浮液被保持在28℃。利用如在多通道示例I中所述的基本相同仪器设置,利用重合中断分拣策略在将具有18000000个精子的浓缩的带X染色体的细胞群组放置在一个收集管中所需的时间内由流式细胞术系统分离带X和Y染色体的精子,所述收集管是通过已经在鞘流体中浸泡至少一个小时接着加入0.5mL的pH为6.6的包含10mM丙酮酸盐的Triladyl_低温保藏介质来制备。精细胞以在每秒25000和30000个细胞之间的速度被引入到流式细胞术系统中。以在每秒4500个至6000个的速度收集浓缩的X细胞群组。当约18000000个精子已经被分拣到收集管中时,该管被取出并且利用已经被类似制备的附加管代替。在从流式细胞计中取出收集管后,分拣的精子悬浮液以7min@700g被离心分离。利用转移吸管去除上清液以产生约100000000个精子/mL的浓度。pH为6.6的包含10mM丙酮酸盐的Triladyl_低温保藏介质被加入到精子悬浮液以产生约50000000个精子/mL的最终浓度。该过程持续直至流式细胞计已经产生两个收集管(C2-C3)。重新悬浮的分拣的样本管浮在200mL的烧杯中的120mL的28℃的水中并且被放置在5℃的冷室中以慢冷。
在分拣的样本达到5℃后,分拣精子的三个管被结合在一个管中。利用IVOS分析汇集的样本以确定游动性百分比、前进性百分比和浓度。附加的pH为6.6的包含10mM丙酮酸盐的Triladyl_低温保藏介质被加入样本以产生约50000000个精子/mL的最终浓度。IVOS评估与同一一次射出的精液的未分拣的样本相比的概述被示出在图132中。
在5℃的冷室中汇集的分拣的样本和未分拣的样本(即,上面的第一等份)被装在标准0.25cc的试管中。装载的试管被转移到可编程的冷冻装置并且被下列程序冷冻:5min@5℃,从5℃冷却到-12℃@4℃/min,从-12℃冷却到-100℃@40℃/min,从-100℃冷却到-140℃@20℃/min,保持在-140℃。在试管已经达到-140℃后,将它们从冷冻装置快速取出并且放入液氮中。
在解冻后和在37℃孵化30分钟后对利用IVOS分析解冻的试管的游动性百分比和前进性百分比。一组两个分拣的和未分拣的试管的结果概括在图133和134中。
毛细管喷嘴系统
图135示出另一个可选择的喷嘴系统1335,与上述的类似,不同之处在于,毛细管1337(例如,石英或者熔融石英)与喷嘴137相连以使离开喷嘴孔103的流体被引入和通过管。流式细胞计的光学系统109以一种适合的方式与管的一侧光耦合,例如利用充填有具有已知折射率的油或者凝胶体的透光介质的腔室1341。毛细管的使用,与通过开放空间喷射流体流相比,具有减小由于换能器105供给的声能而导致的流21的透镜化的优点,并且能够使得聚焦透镜1343的位置紧靠流体流以增大发射信号的分辨率。
在颗粒已经被询问和分类后,可利用本领域技术人员已知的任何常规技术对它们进行分拣,诸如利用如图137中所示的流体切换装置或者诸如光破坏系统或者液滴分拣系统的其它适合的装置。
液滴分拣以外的分拣技术
光破坏分拣
本发明的流式细胞术改进不仅可用于上述液滴细胞分拣,还可用于其它分拣技术,诸如利用光破坏分拣(激光破坏)。光破坏分拣如在美国专利US 4,395,397中描述的,该文献全部内容在这里合并参考。图136示意性地示出单通道流式细胞术光破坏系统1351的一个实施例。
如图136中所示,光破坏分拣系统1351与图2的液滴分拣系统类似,并且相应的部件用相应的附图标记表示但加上标记(″)。一般地,该系统包括与图2的系统相同的部件,不同之处在于,液滴分拣部件被取消(例如,换能器105、充电装置627、偏转板629和相关功率源635)。利用响应于来自于微处理器131″的指令以破坏在流体流21″中的不希望的颗粒的激光器1353或者类似的装置代替这些部件。因此,被收集在收集容器1355中的流包含所需的颗粒群组。例如,如果待分析的颗粒是精细胞并且希望的结果是收集具有特征A(例如所需染色体含量)的精细胞,那么微处理器接收来自于外照射系统415″的信号,识别没有特征A的细胞并且选择性地激发激光器破坏这样的细胞或者使它们无效。
不同的控制分拣策略可用于光破坏系统中,包括上面关于液滴分拣装置描述的“高回收”和“高纯度”分拣策略。在光破坏系统中,被包含在流体流中的颗粒沿着流以各个间隔被分隔并且通常以一个接着一个的形式排成一列。颗粒具有不同的特征,一些具有特征A,例如,其它具有特征B。颗粒的顺序是随机的,因此可被看做连续过程,颗粒可被分成不同的颗粒组,一个跟着另一个,包括仅包含具有特征A的一个或者多个颗粒的第一颗粒组、仅包含具有特征B的一个或者多个颗粒的第二颗粒组和包含其中至少一个具有特征A和其中至少一个具有特征B的两个或者多个近间隔的颗粒的第三颗粒组。后一个(第三)颗粒组通常对应于在上述“重合”颗粒组中的近间隔的颗粒,至少用于分拣策略。这样,在第三组中的两个或者多个颗粒可是近间隔的意义是颗粒之间的空间间隔不足以进行准确的颗粒识别/分类,或者由于这样的分离不足以能够在不破坏在同一组中的其它颗粒的情况下使得在该组中的一个颗粒被激光器破坏。在任何情况下,在第三组颗粒中的每一个(或者至少一些)中的近间隔颗粒可被破坏或者不被破坏,这取决于所用的分拣策略。应该注意的是,在第一组中的多个颗粒或者在第二组中的多个颗粒可是“近间隔”的,但由于在这样的组中的颗粒具有相同的特征(A或者B),它们作为单颗粒组被处理,至少用于分拣策略。
光破坏系统可是单通道系统或者多通道系统,如上所述。
流体切换分拣
可以预见的是,本发明的原理可用于使用流体切换技术的流式细胞术系统,例如在美国专利US 6,432,246(Adair)、US 4,756,427(G_hde等)和US 3,791,517(Friedman)中披露的,这些文献的全部内容在这里合并参考。图137是表示这样一个系统1357的部分视图。它基本与图2中所示的系统相同,不同之处在于,喷嘴101″包括毛细管1369(例如,见图135),并且该分拣系统包括在询问位置115′下游的与毛细管1369相连的流体切换装置1359。流体切换装置的构造和操作可结合诸如在上述参考专利中披露的任何常规流体切换技术。一般地,该装置用于通过间歇性地将包含所需/不希望的颗粒的流体流的部分沿着独立的流动路径1361、1365转向以收集在容器等中响应于从处理器接收的指令从不希望的颗粒中分拣所需的颗粒。该切换通常是通过选择性地驱动在其中一个流动路径中的换能器1367来实现的。
上面关于液滴分拣和光破坏分拣描述的各个分拣策略也可用于流体切换系统中。在流体切换系统中,包含在流体流中的颗粒也沿着流以各个间隔被分隔并且通常以一个接着一个的形式排成一列。颗粒具有不同的特征,一些具有特征A,例如,其它具有特征B,并且颗粒的顺序是随机的。因此,如上面关于光破坏分拣描述的,颗粒可被分成不同的颗粒组,一个跟着另一个,包括仅包含具有特征A的一个或者多个颗粒的第一颗粒组、仅包含具有特征B的一个或者多个颗粒的第二颗粒组和包含其中至少一个具有特征A和其中至少一个具有特征B的两个或者多个近间隔的颗粒的第三颗粒组。后一个(第三)颗粒组通常对应于在上述“重合”颗粒组中的近间隔的颗粒,至少用于分拣策略。这样,在第三组中的两个或者多个颗粒可是近间隔的意义是颗粒之间的空间间隔不足以进行准确的颗粒识别/分类,或者由于这样的分离不足以使得在该组中的一个颗粒被流体切换装置转向与同一组中的另一个颗粒分离。在任何情况下,在第三组颗粒中的每一个(或者至少一些)中的近间隔颗粒可被转向到一个收集位置或者另一个,这取决于所用的分拣策略。如上面关于光破坏分拣描述的,在第一组中的多个颗粒或者在第二组中的多个颗粒可是“近间隔”的,但由于在这样的组中的颗粒具有相同的特征(A或者B),它们作为单颗粒组被处理,至少用于分拣策略。
流体切换系统可是单通道系统或者多通道系统,如上所述。
液滴干涉分拣
还可以预见的是,本发明的技术可与液滴干涉流体切换技术结合使用。例如在图138中示意性示出的高速液滴干涉分拣系统1371可用于通过使得同轴的载流体流和鞘流体流的选择段转向来分拣颗粒。
与其它一些分拣技术不同,液滴干涉分拣技术不需要同轴的载流体流和鞘流体流形成液滴。这样,无需与使得用于输送载流体和鞘流体的喷嘴系统101_与液滴产生系统相连。仅作为一个示例,以60psi使得载流体和鞘流体通过喷嘴系统以形成直径50微米的流是一种适于形成用于将颗粒输送到液滴干涉分拣系统的层流同轴流体流的布置。在同轴流体流中的颗粒在移动通过询问位置115_时被光学系统109_和处理器131_分析和分类,如上面关于其它分拣系统描述的。分拣发生在询问位置的下游,在同轴流体流与高速液滴干涉流1373相交的位置处。
液滴干涉流1373由类似于液滴分拣所用的液滴产生系统的液滴产生系统1375产生。高速流体流1379通过与压电换能器1381或者其它声能源相连的高速喷嘴系统1377以使得高速流体流在高速喷嘴下游分裂成液滴1383。例如,无颗粒流体以1500psi通过高速喷嘴以形成直径70微米的高速射流。高速喷嘴可以400KHz振荡以形成高速液滴。高速液滴1383通过由一个或者多个电偏转板1387形成的电场以使高速液滴的路径可通过在液滴上选择性施加电荷来控制,与液滴分拣系统中的控制液滴路径的情况类似。高速液滴干涉流被引导以使一些高速液滴在位于询问位置下游的点1399处与同轴流体流相交。例如,未带电的液滴1389可被引导与流体流碰撞同时带电的液滴1391被偏离同轴流体流。当高速液滴碰撞同轴流体流时,流体流的一段1397和包含在其中的任何颗粒偏离它们将采用的路径。电荷施加在高速液滴上或者不施加在高速液滴上可被定时以使液滴到达与同轴流体流相交部分1399处与同轴流体流的特定段的到达一致。这样,基于通过被包含在同轴流体流段内的颗粒的分类选择性地对高速液滴充电,人们可通过使得所有包含一个或者多个被选择的颗粒的流体流段转向和使得其它同轴流段不转向或者反之亦然来分拣颗粒。具有微小真空的收集毛细管1403可用于收集转向的1397或者不转向的同轴流段。液滴干涉分拣系统可被建立以使高速液滴与转向的同轴流段合并或者在与同轴流段碰撞后使得高速液滴保持与转向的同轴流段分离。
由于在高速液滴干涉流1373中没有颗粒或者细胞,因此能够在不破坏被分拣的颗粒或者细胞的情况下利用很高的压力和很高的液滴频率。这使得每一个具有体积小于在液滴分拣系统中的液滴体积的流体流段分拣。这大大增大系统的最大生产量同时还减小了被分拣的颗粒的稀释因素。另外,由于没有细胞或者颗粒的细过滤的液体用于形成液滴干涉流,因此液滴形成更一致,这是因为与在液滴分拣系统中所用的喷嘴系统相比,液滴形成喷嘴堵塞或者遭遇蛋白质堆积的可能性很小。另一个优点是在颗粒分析的询问位置和分拣点1399之间的距离可被减小(例如四倍),能够对于特定颗粒到达分拣点处的时间的预测更准确。另外,液滴干涉系统对于喷嘴尺寸的调节或者同轴流体流的压力的调节更灵活。如果需要的话,液滴干涉分拣系统可与毛细管喷嘴系统结合使用。多通道液滴干涉分拣系统可使用高压流体泵以从公共流体供给为多个液滴干涉流产生喷嘴提供流体。
当说明本发明的元件或者其实施例时,词语“a”、“an”、“the”和“said”指的是具有一个或者多个元件。词语“comprising”、“including”和“having”是包括并且指的是除了所列出的元件以外还可包括分拣的元件。词语“or”指的是包括“and/or”并且指的是“一个或者两个或者两者”。这样,“ABC或者DEF”的表示形式指的是(1)ABC、(2)DEF或者(3)ABC和DEF。词语“and/or”指的是具有与上述“or”相同的意义。这样,“and/or”指的是“一个或者两个或者两者”。例如,“ABC和/或DEF”的表示形式指的是(1)ABC、(2)DEF或者(3)ABC和DEF。
如上所述,可以看出,本发明的几个目的被达到并且获得其它优势结果。
在不脱离本发明的保护范围的情况下可对上述的构造、产品和方法进行多种改变,所有包含在上述说明书中和附图中所示的内容应该是说明性的不是限定性的。
对发明特征的评论
本领域中技术人员应理解的是,以上所述的本发明包括许多发明方面,所述发明方面至少包括以下内容:
A.多通道分拣设备
A1.一种根据颗粒的一个或者多个特征对颗粒进行分拣的多通道系统,所述系统包括:
多个流式细胞术单元,每一个流式细胞术单元通过利用电磁辐射束询问包含所述颗粒的流体流来对颗粒混合物中的颗粒的期望群组进行分拣;
所述单元共享一个集成平台,所述集成平台包括下列元件中的至少一个:(1)颗粒的公共供给;(2)电磁辐射的公共源;(3)公共壳体;(4)用于控制单元操作的公共输入;(5)用于接收和处理来自于单元的信息的公共处理器;以及(6)用于将包含所述颗粒的流体输送到所述流式细胞术单元的公共流体输送系统。
A2.A1所述的系统,其中,所述颗粒是细胞。
A3.A1所述的系统,其中,所述颗粒是精细胞。
A4.A1所述的系统,其中,所述系统至少包括元件(2),并且其中,一个或多个所述多个流式细胞术单元包括空气中喷射液滴分拣流式细胞术单元。
A5.A1所述的系统,其中,所述集成平台至少包括元件(2)和(3)。
A6.A1所述的系统,其中,所述集成平台至少包括元件(4)和(5)。
A7.A1所述的系统,其中,所述集成平台至少包括元件(2),所述公共源包括单一激光束。
A8.A7所述的系统,还包括用于将单一激光束分裂成多个光束并且将所述多个光束引导到各个流式细胞术单元的光学系统中的射束分裂系统。
A9.A8所述的系统,其特征在于,所述单一激光束包括多个脉冲,每个脉冲都具有大于所述激光器的平均功率输出的峰值功率。
A10.A1所述的系统,其中,所述集成平台至少包括元件(3),所述流式细胞术单元包括安装在壳体中的可互换的模块。
A11.A1所述的系统,其中,每个流式细胞术单元都包括用于询问各个流体流的外照射光学系统。
A12.A1所述的系统,还包括用于从每个单元中收集所述颗粒的所需群组的收集系统。
A13.A1所述的系统,其中,所述集成平台至少包括元件(5),并且所述公共输出包括由每个单元测量的荧光强度指示。
A14.A1所述的系统,其中,所述集成平台至少包括元件(5),并且所述公共输出包括每个单元分离颗粒的速度的指示。
A15.A1所述的系统,其中,所述集成平台至少包括元件(5),并且所述公共输出包括颗粒着色变化的指示。
A16.A1所述的系统,其中,所述集成平台至少包括元件(5),并且所述公共输出包括由每个单元用于在颗粒之间进行识别的判定边界的指示。
A17.A1所述的系统,其中,每个所述流式细胞术单元都包括液滴分拣系统。
A18.A1所述的系统,其中,所述集成平台至少包括元件(5),并且所述公共输出包括每个单元的液滴分裂位置的指示。
A19.A1所述的系统,其中,至少一个所述流式细胞术单元都包括光破坏系统。
A20.A1所述的系统,其中,至少一个所述流式细胞术单元都包括流体切换分拣系统。
A21.A1所述的系统,其中,所述流式细胞术单元适于并行地操作。
A22.A1所述的系统,其中,所述集成平台至少包括用于发出多个电磁辐射脉冲的共享激光器,其中每个所述脉冲都具有大于所述激光器的平均功率的峰值功率,并且一个或多个流式细胞术单元包括:
用于通过颗粒询问位置引导包含样本颗粒的流体流的流动通道;
用于将一个脉冲中的电磁辐射的一部分引导到询问位置的束引导系统;
用于产生电磁辐射到达询问位置的定时信号指示的定时电路;
适于从询问位置中检测电磁辐射并用于输出所检测的电磁辐射的强度的时间改变模拟信号指示的检测器;
适于接收作为输入的时间改变模拟信号并且适于采样所述模拟信号以产生数字化输出的模拟数字转换器;以及
用于作为时限信号的函数分析来自于模拟数字转换器的数字化输出的电子处理器。
A23.A1所述的系统,其中,所述多个流式细胞术单元包括三个或多个流式细胞术单元。
A24.A1所述的系统,其中,所述多个流式细胞术单元包括至少十二个流式细胞术单元。
A25.A1所述的系统,其中,所述集成平台至少包括元件(5),并且所述公共处理器执行以下至少一项:(1)实时地接收并处理所述信息;(2)接收并处理所述信息以便于允许相对于另一个单元对一个单元的操作的评价。
A26.A1所述的系统,其中,每个流式细胞术单元都包括用于产生所述颗粒至少一个特征的时间改变输出信号指示的传感器,所述集成平台至少包括元件(5),并且由所述公共处理器接收的所述信息包括来自于各个传感器的输出信号,并且所述处理器用于作为基本连续流接收输出信号并且基本连续地实时处理所述输出信号。
A27.A1所述的系统,其中,所述集成平台包括用于在分拣处理期间实时地将控制信号传送给流式细胞术单元的公共处理器从而作为由所述公共处理器接收的所述信息的函数调节其操作,并且所述流式细胞术单元对控制信号起反应。
B.多通道分拣方法
B1.一种根据颗粒的一个或者多个特征对颗粒进行分拣的多通道方法,所述方法包括:
提供多个流式细胞术单元;
操作所述流式细胞术单元以引导多个流式细胞术操作,所述操作包括形成独立的流体流,每一个流体流包含颗粒混合物,以及通过利用电磁辐射束询问所述流体流来对颗粒混合物中的颗粒进行分类;以及
共享下列元件中的至少一个以引导所述操作:(1)用于所述流的公共颗粒供给;(2)用于所述束的电磁辐射的公共源;(3)公共操作控制输入;(4)用于接收和处理来自于单元的信息;(5)用于将流体输送到所述流的公共系统;以及(6)用于所述流式细胞术单元的公共壳体。
B2.B1所述的方法,其中,所述颗粒是细胞。
B3.B1所述的方法,其中,所述颗粒是精细胞。
B4.B1所述的方法,其中,至少一个所述多个流式细胞术单元包括空气中喷射液滴分拣流式细胞术单元。
B5.B1所述的方法,还包括共享单一激光束形式的电磁辐射的所述公共源,所述方法还包括将单一射束分裂成多个光束并且将所述多个光束引导到各个流式细胞术单元的光学系统中。
B6.B5所述的方法,还包括:朝向一个所述流式细胞术单元的光学系统反射一定百分比的单一束的光束,以及使得一定百分比的单一束的光束穿过以便于传输到另一个所述流式细胞术单元的光学系统。
B7.B6所述的方法,还包括使用固态激光器以形成所述单一激光束。
B8.B7所述的方法,还包括模式锁定所述固态激光器以使得所述单一激光束包括多个脉冲,其中每个脉冲都具有大于所述激光器的平均功率输出的峰值功率。
B9.B1所述的方法,还包括共享至少元件(6),并且所述方法还包括以可移除的方式将所述流式细胞术单元安装在所述公共壳体中。
B10.B1所述的方法,还包括至少共享共享激光器形式的电磁辐射的所述公共源;所述方法还包括以下步骤:
从激光器中发出多个电磁辐射(EMR)脉冲,其中每个脉冲的峰值功率都超过所述激光器的平均功率;
通过沿束路径将来自于激光器中的脉冲中的一部分能量引导到每个询问位置而将每个脉冲引导到束分裂和引导系统中以便于间歇地照射每个流体流和包含于其中的颗粒;
检测来自于至少一个询问位置的EMR;
产生从所述询问位置中检测的EMR的强度的时间改变模拟信号指示;
产生脉冲到达所述询问位置的定时信号指示;
将时间改变模拟信号转换为数字信号;以及
分析所述数字信号以确定流过各个询问位置的流体流中的颗粒的特征。
B11.B1所述的方法,还包括在所述操作的第一操作中使用第一分拣策略和在所述操作的第二操作中使用不同于第一分拣策略的第二分拣策略。
B12.B1所述的方法,还包括收集由每个流式细胞术单元分拣的所需颗粒的群组,以及将从一个单元中收集的群组与从另一个单元中收集的群组相组合以产生所需颗粒的混合群组。
B13.B1所述的方法,还包括作为以下至少一项的函数改变流体被输送到一个或多个流式细胞术单元的速度,所述项包括:第一分拣群组的纯度;以及(2)第二群组中所需颗粒的量。
B14.B1所述的方法,还包括以并行的方式引导所述流式细胞术操作。
B15.B1所述的方法,其中,共享步骤包括共享至少元件(4),所述方法还包括使用公共处理器进行以下操作中的至少一项:(1)实时地接收并处理所述信息;(2)接收并处理所述信息以允许相对于另一个单元对一个单元的操作的评价。
B16.B1所述的系统,其中,共享步骤包括共享至少元件(4),所述方法还包括使用用于每个独立细胞术单元的传感器以便于产生所述颗粒至少一个特征的时间改变输出信号指示,并且使用公共处理器作为基本连续流接收各个输出信号并且实时处理所输出的信号。
B17.B1所述的系统,其中,共享步骤包括共享至少元件(4),所述方法还包括在分拣处理期间实时地将控制信号传送给一个或多个流式细胞术单元从而作为由所述公共处理器接收的所述信息的函数调节所述单元的操作。
C.[保留]
D.多通道分析器
D1.一种根据颗粒的一个或者多个特征对颗粒进行分类的多通道系统,所述系统包括:
多个流式细胞术单元,每一个流式细胞术单元通过利用电磁辐射束询问包含所述颗粒的流体流来对颗粒混合物中的颗粒的所需群组进行分类;
所述单元共享一个集成平台,所述集成平台包括下列元件中的至少一个:(1)颗粒的公共供给;(2)公共壳体;(3)用于控制单元操作的公共输入;(4)用于接收和处理来自于单元的信息的公共处理器;以及(5)用于将包含所述颗粒的流体输送到所述流式细胞术单元的公共流体输送系统。
D2.D1所述的系统,其中,所述集成平台还包括电磁辐射的公共源。
D3.D1所述的系统,其中,所述颗粒是细胞。
D4.D1所述的系统,其中,所述颗粒是精细胞。
D5.D1所述的系统,其中,所述集成平台至少包括元件(3)和(4)。
D6.D5所述的系统,其中,所述集成平台还包括电磁辐射的公共源。
D7.D1所述的系统,其中,所述集成平台还包括电磁辐射的公共源,所述公共源包括单一激光束。
D8.D7所述的系统,还包括用于将单一激光束分裂成多个光束并且将所述多个光束引导到各个流式细胞术单元的光学系统中的射束分裂系统。
D9.D8所述的系统,其中,所述集成平台至少包括元件(2),所述流式细胞术单元包括安装在壳体中的可互换的模块。
D10.D1所述的系统,其中,每个流式细胞术单元都包括用于询问各个流体流的外照射光学系统。
D11.D1所述的系统,其中,所述集成平台至少包括元件(4),并且所述处理器用于输出由每个单元测量的荧光强度指示。
D12.D1所述的系统,其中,所述集成平台至少包括元件(4),并且所述处理器用于输出每个单元分离颗粒的速度的指示。
D13.D1所述的系统,其中,所述集成平台至少包括元件(4),并且所述处理器用于输出颗粒着色变化的指示。
D14.D1所述的系统,其中,所述集成平台至少包括元件(4),并且所述处理器用于输出由每个单元用于在颗粒之间进行识别的判定边界的指示。
D15.D1所述的系统,其中,所述流式细胞术单元适于并行地操作。
D16.D1所述的系统,其中,所述多个流式细胞术单元用于分拣所述颗粒。
D17.D16所述的系统,其中,所述集成平台还包括电磁辐射的公共源,并且所述多个流式细胞术单元包括空气中喷射液滴分拣流式细胞术单元。
D18.D1所述的系统,其中,所述集成平台至少包括元件(4),并且所述公共处理器用于执行以下至少一项:(1)实时地接收并处理所述信息;(2)接收并处理所述信息以便于执行相对于另一个单元对一个单元的操作的评价。
D19.D1所述的系统,其中,每个流式细胞术单元都包括用于产生所述颗粒至少一个特征的时间改变输出信号指示的传感器,所述集成平台至少包括元件(4),并且由所述公共处理器接收的所述信息包括从各个传感器中输出信号,并且所述处理器用于作为基本连续流接收输出信号并且实时处理所述输出信号。
D20.D1所述的系统,其中,所述集成平台包括用于在分拣处理期间实时地将控制信号传送给流式细胞术单元从而作为由所述公共处理器接收的所述信息的函数调节其操作,并且所述流式细胞术单元对控制信号起反应。
E.多通道分析方法
E1.一种根据颗粒的一个或者多个特征对颗粒进行分类的多通道方法,所述方法包括:
提供多个流式细胞术单元;
操作所述流式细胞术单元以便于引导多个流式细胞术操作,所述操作包括形成分离流体流,每个所述流体流都包含所述颗粒的混合物,并且通过利用电磁辐射束询问所述流来对所述颗粒混合物中的颗粒进行分类;以及
共享以下元件中的至少一个以引导所述操作:(1)用于所述流的颗粒的公共供给;(2)公共操作控制输入;(3)用于接收和处理来自于单元的信息的公共处理器;(4)用于将流体输送到所述流的公共系统;以及(5)用于所述流式细胞术单元的公共壳体。
E2.E1所述的方法,还包括共享用于所述束的电磁辐射的公共源。
E3.E2所述的方法,其中,所述多个流式细胞术单元包括空气中喷射液滴分拣流式细胞术单元。
E4.E1所述的方法,还包括操作所述多个流式细胞器以根据其分类分拣所述颗粒的混合物。
E5.E1所述的方法,所述颗粒是细胞。
E6.E1所述的方法,其中,所述颗粒是精细胞。
E7.E1所述的方法,还包括共享用于单一激光束形式的所述束的电磁辐射的公共源、将单一激光束分裂为多个激光束,并且将多个激光束引导到各个流式细胞术单元的光学系统中。
E8.E7所述的方法,其中,共享步骤包括至少元件(5),所述方法还包括在分裂所述束之前将所述单一激光束引导到所述公共壳体中。
E9.E7所述的方法,还包括朝向一个所述流式细胞术单元的光学系统反射一定百分比的单一束的光束,以及使得一定百分比的单一束的光束穿过以便于传输到另一个所述流式细胞术单元的光学系统。
E10.E1所述的方法,其中,共享步骤包括至少元件(5),所述方法还包括以可移除的方式将所述流式细胞术单元安装在公共壳体中。
E11.E1所述的方法,包括操作每个流式细胞术单元以便于使用外照射光学系统询问各个流体流。
E12.E1所述的方法,还包括并行地操作所述流式细胞术单元。
E13.E1所述的方法,其中,所述多个流式细胞术单元包括十二个或多个流式细胞术单元。
E14.E1所述的方法,其中,所述共享步骤包括至少共享元件(4),所述方法还包括使用公共处理器执行以下至少一项:(1)实时地接收并处理所述信息;(2)接收并处理所述信息以便于允许相对于另一个单元对一个单元的操作的评价。
E15.E1所述的方法,其中,所述共享步骤包括至少共享元件(4),所述方法还包括使用用于各个流式细胞术单元的传感器产生所述颗粒的至少一个特征的时间改变输出信号指示以及使用公共处理器作为基本连续流接收各个输出信号并且实时处理所述输出信号。
E16.E1所述的方法,其中,所述共享步骤包括至少共享元件(4),所述方法还包括在分拣处理期间实时地将控制信号输送到一个或多个流式细胞术单元以作为公共处理器所接收的信息的函数调节所述单元的操作。
F.[保留]
G.为多通道细胞术分裂单一激光的方法
G1.使用包括三个或多个流式细胞术单元的系统分拣颗粒的方法,每个所述单元都用于通过使用光束询问包含所述颗粒的流体流从颗粒的混合物分拣颗粒的所需群组,所述方法包括:
产生单一激光束;
将所述单一束分裂为三个或多个光束并且将所述光束引导到流式细胞术单元的光学系统中;以及
操作流式细胞术单元以分拣颗粒。
G2.G1所述的方法,其中,每个细胞术单元使用约相同强度的光束询问流体流。
G3.G1所述的方法,其中,每个单元需要具有W瓦功率的光束,所述方法还包括产生具有(W×N)+L的所述单一激光束,其中N等于流式细胞术单元的数量以及L等于系统中的功率损耗。
G4.G1所述的方法,还包括通过利用一个或者多个滤光器使所述三个或者多个光束中的至少一个的强度减小而平衡细胞计数单元用以询问各自的流体流的光束量。
G5.G4所述的方法,还包括调节进入各个单元的光束的强度以使得每个单元在10%的公差内接收相同量的光束。
G6.G1所述的方法,其中,至少一个所述流式细胞术单元使用液滴分拣处理以分拣所述颗粒。
G7.G1所述的方法,其中,至少一个所述流式细胞术单元使用光破坏处理以分拣所述颗粒。
G8.G1所述的方法,其中,至少一个所述流式细胞术单元使用流体切换分拣处理以分拣所述颗粒。
G9.G1所述的方法,其中,所述流式细胞术单元被安装在公共壳体中,所述方法还包括在分裂所述束之前将所述单一激光束引导到所述公共壳体中。
G10.G9所述的方法,还包括朝向一个所述流式细胞术单元的光学系统反射一定百分比的单一激光束的光束,以及使得一定百分比的单一激光束的光束穿过以便于传输到另一个所述流式细胞术单元的光学系统。
G11.G1所述的方法,其中,分裂单一束的步骤包括将单一束分裂为四个独立束。
G12.G11所述的方法,其中,分裂步骤包括使用50/50射束分离器以将单一束分裂为两个射束,使用第二个50/50射束分离器以将这两个射束中的一个分裂为两个补充射束,以及使用第三个50/50射束分离器以将这两个射束中的另一个分裂为另外两个补充射束。
H.用于使用分拣策略进行分拣的设备
H1.在一种用于分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的流式细胞术系统中,所述系统包括:用于输送包含所述颗粒的流体的流体输送系统;用于接收所述流体、使其形成流体流以及根据所述特征利用流式细胞术对颗粒分类的流式细胞术设备;以及根据所述分类并根据分拣策略分拣颗粒以提供至少一个包含所需颗粒的群组的分拣系统,改进包括:
作为下列因素至少一个的函数响应于从流式细胞术设备接收的信息而控制分拣系统以改变其分拣策略或者控制流体输送系统以改变输送流体的速度的控制装置,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
H2.H1所述的系统,其中,所述颗粒是细胞并且特征A和B与所述细胞的物理特征有关。
H3.H1所述的系统,其中,所述颗粒是精细胞,特征A表示活X精细胞。
H4.H3所述的系统,其中,特征B表示活X细胞以外的细胞(~X)。
H5.H4所述的系统,还包括将所述至少一个群组的纯度保持得大于85%但是小于95%。
H6.H1所述的系统,其中,所述控制装置在所述纯度大于所需纯度时增大流体输送的速度,并且在所述纯度小于所述所需纯度时减小流体输送的速度。
H7.H1所述的系统,其中,所述控制装置根据来自于流式细胞术设备的输出信号确定所述至少一个群组的纯度,所述系统还包括用于显示所需纯度的控制装置的操作者输入,并且所述控制装置改变流体输送的速度以使得所述纯度与所需纯度基本一致。
H8.H7所述的系统,其中,当所述至少一个群组中的特征A颗粒的量大于至少一个群组中的特征A颗粒的可接受的量时该控制装置增大流体输送的速度,并且当所述至少一个群组中的特征A颗粒的量小于所述可接受的量时该控制装置减小流体输送的速度。
H9.H8所述的系统,其中,所述控制装置根据来自于流式细胞术设备的输出信号确定所述至少一个群组中特征A颗粒的纯度,所述系统还包括用于指示所述至少一个群组中特征A颗粒的可接受的量的控制装置的操作者输入,并且所述控制装置改变流体输送的速度以在所述至少一个群组中获得所述接受的量。
H10.H1所述的系统,其中,所述流被构成得包含通常在一个系列中一个跟着另一个的颗粒,所述系列包括连续的颗粒组,所述组包括每一个都包含具有特征A的一个或者多个颗粒的第一颗粒组、每一个都包含具有特征B的一个或者多个颗粒的第二颗粒组,以及每一个都包含其中至少一个具有特征A和其中至少一个具有特征B的两个或者多个近间隔的颗粒的第三颗粒组。
H11.H10所述的系统,其中,所述分拣系统用于使用分拣策略,其中所述第一颗粒组被选择以收集在所述至少一个群组中而所述第二和第三颗粒组未被选择以收集在所述至少一个群组中。
H12.H10所述的系统,其中,所述分拣系统用于使用分拣策略,其中所述第一和第三颗粒组被选择以收集在所述至少一个群组中而所述第二颗粒组未被选择以收集在所述至少一个群组中。
H13.H1所述的系统,其中,所述分拣系统包括液滴分拣系统。
H14.H1所述的系统,其中,所述分拣系统包括光破坏分拣系统。
H15.H1所述的系统,其中,所述分拣系统包括流体切换分拣系统。
I.用于使用分拣策略分拣颗粒的方法
I1.一种利用流式细胞术系统分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的方法,所述方法包括:
输送包含所述颗粒的流体;
使流体形成流体流以及根据所述特征利用流式细胞术对流体流中的颗粒分类;
根据所述分类并根据分拣策略在流体流中分拣颗粒以提供至少一个包含所需颗粒的群组;以及
作为下列因素至少一个的函数改变所述分拣策略或者改变输送流体的速度,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
I2.I1所述的方法,其中,所述颗粒是细胞并且特征A和B与所述细胞的物理特征有关。
I3.I1所述的方法,其中,所述颗粒是精细胞,特征A表示活X精细胞。
I4.I3所述的方法,其中,特征B表示活X细胞以外的细胞(~X)。
I5.I3所述的方法,还包括将所述纯度保持得大于85%但是小于95%。
I6.I1所述的方法,还包括在所述纯度大于所需纯度时增大流体输送的速度,并且在所述纯度小于所述所需纯度时减小流体输送的速度。
I7.I1所述的方法,还包括当所述至少一个群组中的特征A颗粒的量大于至少一个群组中的特征A颗粒的可接受的量时该控制装置增大流体输送的速度,并且当所述至少一个群组中的特征A颗粒的量小于所述可接受的量时该控制装置减小流体输送的速度。
I8.I1所述的方法,其中,将所述流构成得包含通常在一个系列中一个跟着另一个的颗粒,所述系列包括连续的颗粒组,所述组包括每一个都包含具有特征A的一个或者多个颗粒的第一颗粒组、每一个都包含具有特征B的一个或者多个颗粒的第二颗粒组,以及每一个都包含其中至少一个具有特征A和其中至少一个具有特征B的两个或者多个近间隔的颗粒的第三颗粒组。
I9.I8所述的方法,还包括依照分拣策略分拣所述颗粒,其中只有第一颗粒组被选择以收集在所述至少一个群组中。
I10.I8所述的方法,还包括依照分拣策略分拣所述颗粒,其中第一和第三颗粒组被选择以收集在所述至少一个群组中。
I11.I1所述的方法,其中,所述分拣包括使用液滴分拣处理。
I12.I1所述的方法,其中,所述分拣包括使用光破坏分拣处理。
I13.I1所述的方法,其中,所述分拣包括使用流体切换分拣处理。
J.包括分拣策略的液滴分拣器
J1.一种用于分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的系统,所述系统包括:
用于输送包含所述颗粒的流体流的流体输送系统;
用于接收所述流体流、形成包含所述颗粒的液滴以及根据分拣策略将所述液滴分拣成不同的群组的流式细胞术设备;所述液滴包括每个都包含具有特征A的一种或者多种颗粒的第一液滴、每个都包含具有特征B的一种或者多种颗粒的第二液滴以及每个包含具有特征A的一种或者多种颗粒和具有特征B的一种或者多种颗粒的第三液滴;以及
作为下列因素至少一个的函数响应于从流式细胞术设备接收的信息而控制分拣系统以改变其分拣策略或者控制流体输送系统以改变输送流体的速度的控制装置,这些因素包括:(1)所述至少一个液滴群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个液滴群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
J2.J1所述的系统,其中,所述控制装置控制流体输送系统以使得输送流体的速度保持基本恒定,并且所述控制装置改变分拣策略。
J3.J2所述的系统,其中,所述控制装置改变分拣策略以改变第三液滴在其中一个液滴群组中的百分比。
J4.J1所述的系统,其中,所述控制装置控制流体输送系统以作为所述至少一个液滴群组的纯度的函数改变输送流体的速度。
J5.J4所述的系统,其中,所述纯度至少为85%并且不大于95%。
J6.J1所述的系统,其中,所述控制装置控制流体输送系统以作为在所述至少一个液滴群组中的具有特征A的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒的总量的函数改变输送流体的速度。
J7.J6所述的系统,其中,改变输送流体的速度以使得在所述至少一个液滴群组中的具有特征A的颗粒的量表示为所述流中的具有特征A的颗粒的总量的至少约60%。
J8.J1所述的系统,其中,所述颗粒是精细胞,特征A表示活X精细胞。
J9.J1所述的系统,其中,在所述混合物中特征A的颗粒与特征B的颗粒的比率是一个已知的比率,并且所述控制装置用于将一些颗粒分类为具有特征A或者具有特征B的并且作为已分类的颗粒的比率相对于已知比率的函数改变流体输送速度。
J10.J1所述的系统,其中,控制装置基于来自于流式细胞术设备的输出信号确定被分拣的颗粒的纯度,所述系统还包括用于显示所需纯度的控制装置的操作者输入,并且控制装置改变速度以使所述至少一个液滴群组的纯度与所需纯度基本一致。
K.包括分拣策略的液滴分拣方法
K1.一种分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的方法,所述方法包括:
输送包含所述颗粒的流体流;
形成包含所述颗粒的液滴;
根据分拣策略将所述液滴分拣成不同的群组,所述液滴包括都包含具有特征A的一种或者多种颗粒的第一液滴、都包含具有特征B的一种或者多种颗粒的第二液滴以及都包含具有特征A的一种或者多种颗粒和具有特征B的一种或者多种颗粒的第三液滴;以及
作为下列因素至少一个的函数改变所述分拣策略或者改变输送流体的速度,这些因素包括:(1)所述至少一个液滴群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个液滴群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
K2.K1所述的方法,还包括使得输送流体的速度保持基本恒定,并且改变分拣策略。
K3.K2所述的方法,还包括改变分拣策略以改变第三液滴在其中一个液滴群组中的百分比。
K4.K1所述的方法,还包括作为所述至少一个液滴群组的纯度的函数改变输送流体的速度。
K5.K1所述的方法,还包括将所述纯度保持在85%到95%的范围内。
K6.K1所述的方法,还包括作为在所述至少一个液滴群组中的具有特征A的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒的总量的函数改变输送流体的速度。
K7.K6所述的方法,其中,改变输送流体的速度以使得在所述至少一个液滴群组中的具有特征A的颗粒的量表示为所述流中的具有特征A的颗粒的总量的至少约60%。
K8.K1所述的方法,其中,所述颗粒是精细胞,特征A表示活X精细胞。
K9.K1所述的方法,还包括在所述至少一个液滴群组的纯度大于所需纯度时增大速度,并且在所述至少一个液滴群组的纯度小于所需纯度时减小速度。
L.具有反馈回路的可变流速液滴分拣器
L1.一种用于分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的系统,所述系统包括:
用于输送包含所述颗粒的流体流的流体输送系统;
用于接收所述流体流、形成包含所述颗粒的液滴以及根据分拣策略将所述液滴分拣成不同的群组的流式细胞术设备;所述液滴包括每个都包含具有特征A的一种或者多种颗粒的第一液滴、每个都包含具有特征B的一种或者多种颗粒的第二液滴以及每个包含具有特征A的一种或者多种颗粒和具有特征B的一种或者多种颗粒的第三液滴;以及
作为下列因素至少一个的函数控制控制流体输送系统以改变输送流体的速度的响应于从流式细胞术设备接收的信息的控制装置,这些因素包括:(1)所述至少一个液滴群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个液滴群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
L2.L1所述的系统,其中,所述控制装置控制流体输送系统以作为所述至少一个液滴群组的纯度的函数改变输送流体的速度。
L3.L2所述的系统,其中,所述纯度至少为85%并且不大于95%。
L4.L1所述的系统,其中,所述控制装置控制流体输送系统以作为在所述至少一个液滴群组中的具有特征A的颗粒的量或百分比相对于在所述流中的具有特征A的颗粒的总量的函数改变输送流体的速度。
L5.L4所述的系统,其中,改变输送流体的速度以使得在所述至少一个液滴群组中的具有特征A的颗粒的量表示为所述流中的具有特征A的颗粒的总量的至少约60%。
L6.L1所述的系统,其中,所述颗粒是细胞,并且特征A和B与所述细胞的物理特征有关。
L7.L1所述的系统,其中,所述颗粒是精细胞,特征A表示活X精细胞。
L8.L7所述的系统,其中,所述至少一个液滴群组中至少一些液滴在同一个液滴中包含至少一个活X细胞和至少一个Y细胞,并且所述至少一个液滴群组的所述纯度被测量为X/(X+Y)。
L9.L8所述的系统,其中,所述控制装置用于改变流体输送速度以便于将所述纯度保持得大于85%但小于95%。
L10.L7所述的系统,其中,特征B表示非活X细胞的细胞。
L11.L7所述的系统,其中,所述控制装置用于改变流体输送速度以使得所述至少一个液滴群组中的活X细胞的百分比是所述第一、第二和第三多个液滴中活X细胞的总量的至少60%。
L12.L11所述的系统,其中,所述至少一个液滴群组的纯度被保持得小于95%。
L13.L1所述的系统,其中,在所述混合物中特征A的颗粒与特征B的颗粒的比率是一个已知的比率,并且所述控制装置用于将一些颗粒分类为具有特征A或者具有特征B的并且作为已分类的颗粒的比率相对于已知比率的函数改变流体输送速度。
L14.L1所述的系统,其中,具有特征A的颗粒是活X精细胞,具有特征B的颗粒是非活X精细胞的精细胞,并且所述控制装置用于作为已分类的精细胞的比率的函数将流体输送速度改变为50%。
L15.L1所述的系统,其中,在所述至少一个液滴群组的纯度大于所需纯度时增大速度,并且在所述至少一个液滴群组的纯度小于所需纯度时减小速度。
L16.L1所述的系统,其中,控制装置基于来自于流式细胞术设备的输出信号确定被分拣的颗粒的纯度,所述系统还包括用于显示所需纯度的控制装置的操作者输入,并且控制装置改变速度以使所述至少一个液滴群组的纯度与所需纯度基本一致。
M.使用可变流速和反馈的液滴分拣方法
M1.一种用于分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的方法,所述方法包括:
输送包含所述颗粒的流体流;
形成包含所述颗粒的液滴;
根据分拣策略将所述液滴分拣成不同的群组,所述液滴包括每个都包含具有特征A的一种或者多种颗粒的第一液滴、每个都包含具有特征B的一种或者多种颗粒的第二液滴以及每个包含具有特征A的一种或者多种颗粒和具有特征B的一种或者多种颗粒的第三液滴;以及
作为下列因素至少一个的函数改变输送流体的速度,这些因素包括:(1)所述至少一个液滴群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个液滴群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
M2.M1所述的方法,还包括作为所述至少一个液滴群组的纯度的函数改变输送流体的速度。
M3.M2所述的方法,其中,所述纯度至少为85%并且不大于95%。
M4.M1所述的方法,还包括作为在所述至少一个液滴群组中的具有特征A的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒的总量的函数改变输送流体的速度。
M5.M4所述的方法,还包括改变输送流体的速度以使得在所述至少一个液滴群组中的具有特征A的颗粒的量表示为所述流中的具有特征A的颗粒的总量的至少约60%。
M6.M1所述的方法,其中,所述颗粒是细胞,并且特征A和B与所述细胞的物理特征有关。
M7.M1所述的方法,其中,所述颗粒是精细胞,特征A表示活X精细胞。
M8.M7所述的方法,其中,所述至少一个液滴群组中至少一些液滴在同一个液滴中包含至少一个活X细胞和至少一个Y细胞,并且所述至少一个液滴群组的所述纯度被测量为X/(X+Y)。
M9.M8所述的方法,还包括改变流体输送速度以便于将所述纯度保持得大于85%但小于95%。
M10.M7所述的方法,其中,特征B表示非活X细胞的细胞。
M11.M7所述的方法,还包括改变流体输送速度以使得所述至少一个液滴群组中的活X细胞的百分比是所述第一、第二和第三多个液滴中活X细胞的总量的至少60%。
M12.M11所述的方法,还包括将所述至少一个液滴群组的纯度保持得小于95%。
M13.M1所述的方法,其中,在所述混合物中特征A的颗粒与特征B的颗粒的比率是一个已知的比率,并且所述方法还包括作为已分类的颗粒的比率相对于已知比率的函数改变流体输送速度。
M14.M1所述的方法,其中,具有特征A的颗粒是活X精细胞,具有特征B的颗粒是非活X精细胞的精细胞,并且所述方法还包括作为已分类的精细胞的比率的函数将流体输送速度改变为50%。
M15.M1所述的方法还包括在所述至少一个液滴群组的纯度大于所需纯度时增大速度,并且在所述至少一个液滴群组的纯度小于所需纯度时减小速度。
N.用于高纯度分拣策略的精细胞分拣系统
N1.一种用于分拣X和Y精细胞的系统,所述系统包括:
用于输送包含X和Y精细胞的流体流的可变速流体输送系统;
用于(1)接收所述流和形成包含所述颗粒的液滴,所述液滴包括都包含一个或者多个X精细胞的第一液滴、都包含一个或者多个Y精细胞的第二液滴以及都包含一个或者多个X精细胞和一个或者多个Y精细胞的多个第三液滴,(2)从所述第二和第三液滴分拣所述第一液滴,(3)收集所述第一液滴以提供X精细胞的至少一个群组,以及(4)在至少一个群组中确定X精细胞的量的流式细胞术设备;以及
响应于从流式细胞术设备接收的指令以作为所确定的X精细胞在所述至少一个群组中的量相对于在所述第一、第二和第三液滴中的X细胞的总量的函数改变流体被输送到流式细胞术设备的速度的控制装置。
N2.N1所述的系统,其中,所述流式细胞术设备用于确定在所述至少一个群组中收集的X细胞的数量,并且控制装置改变流体被输送到流式细胞术设备的速度以使得在所述至少一个群组中收集的X细胞的量相对于在所述第一、第二和第三液滴中的X细胞的总量保持在可接受的量或者在该可接受的量以上。
N3.N2所述的系统,其中,所述可接受的量为X细胞的所述总量的至少60%。
N4.N3所述的系统,其中,所述X细胞为活X细胞。
N5.N2所述的系统,其中,所述控制装置用于当所述至少一个群组中的X细胞的量在可接受的量以上时增大流体输送速度以及当所述至少一个群组中的X细胞的量在可接受的量以下时减小流体输送速度。
O.用于高纯度分拣策略的精细胞分拣方法
O1.一种用于分拣X和Y精细胞的方法,所述方法包括:
将包含X和Y精细胞的流体流输送到第一位置并且使得所述流在第二位置分裂成液滴,所述液滴包括都包含一个或者多个X精细胞的第一液滴、都包含一个或者多个Y精细胞的第二液滴以及都包含一个或者多个X精细胞和一个或者多个Y精细胞的多个第三液滴;
从所述第二和第三液滴分拣所述第一液滴;
收集所述第一液滴以提供X精细胞的至少一个群组;
确定在所述至少一个群组中收集的X精细胞的量;以及
以作为所确定的在所述至少一个群组中收集的X精细胞的量相对于在所述第一、第二和第三液滴中的X细胞的总量的函数改变流体被输送到所述第一位置的速度。
O2.O1所述的方法,还包括改变流体被输送到所述第一位置的速度以使得在所述至少一个群组中收集的X细胞的量相对于在所述第一、第二和第三液滴中的X细胞的总量保持在可接受的量或者在该可接受的量以上。
O3.O2所述的方法,其中,所述可接受的量为X细胞的所述总量的至少60%。
O4.O3所述的系统,其中,所述X细胞为活X细胞。
O5.O2所述的系统,还包括当收集在所述至少一个群组中的X细胞的量或百分比在所述可接受的量以上时增大流体输送速度以及当收集在所述至少一个群组中的X细胞的量或百分比在所述可接受的量以下时减小流体输送速度。
P.用于高回收分拣策略的精细胞分拣器
P1.用于分拣X和Y精细胞的系统,所述系统包括:
用于输送包含X和Y精细胞的流体流的可变速流体输送系统;
用于(1)接收所述流和形成包含所述颗粒的液滴,所述液滴包括都包含一个或者多个X精细胞的第一液滴、都包含一个或者多个Y精细胞的第二液滴以及都包含一个或者多个X精细胞和一个或者多个Y精细胞的多个第三液滴,(2)从所述第二液滴分拣所述第一和第三液滴,(3)收集所述第一和第三液滴以提供X精细胞的至少一个群组,以及(4)在至少一个群组中确定X精细胞的量的流式细胞术设备;以及
响应于从流式细胞术设备接收的指令以作为所确定的X精细胞在所述至少一个群组中的量的函数改变流体被输送到流式细胞术设备的速度的控制装置。
P2.P1所述的系统,其中,所述控制装置改变流体被输送到流式细胞术系统的速度以使得所述至少一个群组的纯度保持在所需的纯度或者在该所需的纯度以上。
P3.P2所述的系统,其中,所述控制装置用于当所述至少一个群组的纯度大于所需的纯度时增大流体输送速度以及当所述至少一个群组的纯度小于所需的纯度时减小流体输送速度。
P4.P2所述的系统,其中,所述所需纯度不大于95%。
P5.P2所述的系统,其中,所述X精细胞为活细胞。
Q.包括高回收分拣策略的精细胞分拣方法
Q1.一种用于分拣X和Y精细胞的方法,所述方法包括:
将包含X和Y精细胞的流体流输送到第一位置并且使得所述流在第二位置分裂成液滴,所述液滴包括都包含一个或者多个X精细胞的第一液滴、都包含一个或者多个Y精细胞的第二液滴以及都包含一个或者多个X精细胞和一个或者多个Y精细胞的多个第三液滴;
从所述第二液滴分拣所述第一和第三液滴;
收集所述第一和第三液滴以提供X精细胞的至少一个群组;
确定在所述至少一个群组中收集的X精细胞的量;以及
以作为所确定的在所述至少一个群组中收集的X精细胞的量的函数改变流体被输送到所述第一位置的速度。
Q2.Q1所述的方法,还包括改变流体输送速度以使得所述至少一个群组关于X细胞的纯度保持在所需的纯度或者在该所需的纯度以上。
Q3.Q2所述的方法,还包括当所述至少一个群组的纯度大于所需的纯度时增大流体输送速度以及当所述至少一个群组的纯度小于所需的纯度时减小流体输送速度。
Q4.Q2所述的方法,其中,所述所需纯度不大于95%。
Q5.Q2所述的方法,其中,所述X精细胞为活细胞。
Q6.一种利用流式细胞术分拣X和Y精细胞的方法,所述方法包括:
将包含X和Y精细胞的流体流输送到第一位置并且使得所述流在第二位置分裂成液滴,所述液滴包括都包含一个或者多个X精细胞的第一液滴、都包含一个或者多个Y精细胞的第二液滴以及都包含一个或者多个X精细胞和一个或者多个Y精细胞的多个第三液滴;
从所述第二液滴分拣所述第一和第三液滴;
收集所述第一和第三液滴以提供X精细胞的至少一个群组。
Q7.Q6所述的方法,其中,所述X精细胞为活细胞而非死X细胞。
Q8.一种利用流式细胞术分拣X和Y精细胞的方法,所述方法包括:
输送包含X和Y精细胞的流体流并且使得所述流分裂成液滴;
在其分裂成液滴之前询问所述流体流以确定哪种精细胞将存在于所述液滴中;
从不包含X精细胞的液滴中分拣包含X精细胞的液滴;
收集包含X精细胞的所述液滴,包括包含至少一个X精细胞和至少一个Y精细胞的液滴。
Q9.Q8所述的方法,其中,所述X精细胞为活X细胞而非死X细胞。
R.具有分拣策略的光破坏分拣
R1.在一种用于分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的流式细胞术系统中,所述系统包括:用于输送包含所述颗粒的流体的流体输送系统;用于接收所述流体、使其形成流体流以及根据所述特征利用流式细胞术对颗粒分类的流式细胞术设备;以及包括用于根据所述分类并根据分拣策略熔化所述流中所选择的颗粒以提供至少一个包含所需颗粒的群组的激光器的分拣系统,改进包括:
作为下列因素至少一个的函数控制激光器以改变其分拣策略或者控制流体输送系统以改变输送流体的速度的响应于从流式细胞术设备接收的信息的控制装置,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的未熔化特征A的颗粒或者未熔化特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
R2.R1所述的系统,其中,所述颗粒是细胞并且特征A和B与所述细胞的物理特征有关。
R3.R1所述的系统,其中,所述细胞是精细胞,并且特征A表示活X精细胞。
R4.R3所述的系统,其中,特征B表示活X细胞以外的细胞(~X)。
R5.R1所述的系统,其中,当所述至少一个群组的纯度大于所需纯度时该控制装置增大流体输送的速度,并且当所述纯度小于所述所需纯度时减小流体输送的速度。
R6.R1所述的系统,其中,所述控制装置根据来自于流式细胞术设备的输出信号确定所述纯度,所述系统还包括用于显示所需纯度的控制装置的操作者输入,并且所述控制装置改变流体输送的速度以获得所需纯度。
R7.R1所述的系统,其中,所述流被构成为包含通常在一个系列中一个跟着另一个的颗粒的流,所述系列包括连续的颗粒组,所述组包括每一个都包含具有特征A的一个或者多个颗粒的第一颗粒组、每一个都包含具有特征B的一个或者多个颗粒的第二颗粒组,以及每一个都包含其中至少一个具有特征A和其中至少一个具有特征B的两个或者多个近间隔的颗粒的第三颗粒组。
R8.R7所述的系统,其中,所述激光器仅熔化第二颗粒组。
R9.R7所述的系统,其中,所述控制系统将所述至少一个群组的纯度保持得大于85%但是小于95%。
R10.R7所述的系统,其中,特征B表示活X细胞以外的细胞(~X)并且所述激光器用于熔化所述流中的第二颗粒组和第三颗粒组。
R11.R10所述的系统,其中,所述控制装置当所述至少一个群组中未熔化特征A颗粒的量大于所述至少一个群组中未熔化特征A颗粒的可接受的量时增大流体输送的速度,并且当所述至少一个群组中未熔化特征A颗粒的量小于所述可接受的量时减小流体输送的速度。
R12.R10所述的系统,其中,所述控制装置根据来自于流式细胞术设备的输出信号确定所述至少一个群组中未熔化特征A颗粒的量,所述系统还包括用于显示所述至少一个群组中未熔化特征A颗粒的可接受的量的控制装置的操作者输入,并且所述控制装置改变流体输送的速度以获得所述至少一个群组中未熔化特征A颗粒的可接受的量。
S.包括分拣策略的光破坏分拣方法
S1.使用流式细胞术系统分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的方法,所述方法包括:
输送包含所述颗粒的流体;
使所述流体形成流体流以及根据所述特征使用流式细胞术对所述流中的颗粒分类;
根据所述分类并根据分拣策略通过熔化所选择的颗粒分拣所述流中的颗粒以提供至少一个包含所需颗粒的群组;以及
作为下列因素至少一个的函数改变分拣策略或改变输送流体的速度,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的未熔化特征A的颗粒或者未熔化特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
S2.S1所述的方法,其中,所述颗粒是细胞并且特征A和B与所述细胞的物理特征有关。
S3.S1所述的方法,其中,所述细胞是精细胞,并且特征A表示活X精细胞。
S4.S1所述的方法,还包括当所述至少一个群组的纯度大于所需纯度时该控制装置增大流体输送的速度,并且当所述纯度小于所述所需纯度时减小流体输送的速度。
S5.S1所述的方法,还包括将所述流体被构成为包含通常在一个系列中一个跟着另一个的颗粒的流,所述系列包括连续的颗粒组,所述组包括每一个都包含具有特征A的一个或者多个颗粒的第一颗粒组、每一个都包含具有特征B的一个或者多个颗粒的第二颗粒组,以及每一个都包含其中至少一个具有特征A和其中至少一个具有特征B的两个或者多个近间隔的颗粒的第三颗粒组。
S6.S5所述的方法,还包括熔化第二颗粒组而不熔化第一和第三颗粒组。
S7.S6所述的方法,还包括将所述至少一个群组的纯度保持得大于85%但是小于95%。
S8.S5所述的方法,还包括熔化第二和第三颗粒组而不熔化第一颗粒组。
S9.S8所述的方法,还包括当所述至少一个群组中未熔化特征A颗粒的量大于所述至少一个群组中未熔化特征A颗粒的可接受的量时增大流体输送的速度,并且当所述至少一个群组中未熔化特征A颗粒的量小于所述可接受的量时减小流体输送的速度。
T.具有可变流速和反馈的光破坏分拣器
T1.在一种用于分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的流式细胞术系统中,所述系统包括:用于输送包含所述颗粒的流体的流体输送系统;用于接收所述流体、使其形成流体流以及根据所述特征利用流式细胞术对颗粒分类的流式细胞术设备;以及包括用于根据所述分类并根据分拣策略熔化所述流中所选择的颗粒以提供至少一个包含所需颗粒的群组的激光器的分拣系统,改进包括:
作为下列因素至少一个的函数控制激光器以改变输送流体的速度的响应于从流式细胞术设备接收的信息的控制装置,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的未熔化特征A的颗粒或者未熔化特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
T2.T1所述的系统,其中,所述颗粒是细胞并且特征A和B与所述细胞的物理特征有关。
T3.T1所述的系统,其中,所述细胞是精细胞,并且特征A表示活X精细胞。
T4.T3所述的系统,其中,特征B表示活X细胞以外的细胞(~X)并且所述激光器仅熔化第二颗粒组。
T5.T4所述的系统,还包括将所述至少一个群组的纯度保持得大于85%但是小于95%。
T6.T2所述的系统,其中,特征B表示活X细胞以外的细胞(~X)并且所述激光器用于熔化第二和第三颗粒组。
T7.T1所述的系统,其中,当所述至少一个群组的纯度大于所需纯度时该控制装置增大流体输送的速度,并且当所述纯度小于所述所需纯度时减小流体输送的速度。
T8.T1所述的系统,其中,所述控制装置根据来自于流式细胞术设备的输出信号确定所述纯度,所述系统还包括用于显示所需纯度的控制装置的操作者输入,并且所述控制装置改变流体输送的速度以获得所需纯度。
T9.T8所述的系统,其中,当所述至少一个群组中特征A颗粒的量大于所述至少一个群组中特征A颗粒的可接受的量时所述控制装置增大流体输送的速度,并且当所述至少一个群组中特征A颗粒的量小于所述至少一个群组中特征A颗粒的可接受的量时所述控制装置减小流体输送的速度。
T10.T8所述的系统,其中,所述控制装置根据来自于流式细胞术设备的输出信号确定所述至少一个群组中特征A颗粒的总量,所述系统还包括用于显示所述至少一个群组中特征A颗粒的可接受的量的控制装置的操作者输入,并且所述控制装置改变速度从而改变至少一个群组中特征A颗粒的量以获得所述可接受的量或百分比。
T11.T1所述的系统,其中,所述流被构成为包含通常在一个系列中一个跟着另一个的颗粒的流,所述系列包括连续的颗粒组,所述组包括每一个都包含具有特征A的一个或者多个颗粒的第一颗粒组、每一个都包含具有特征B的一个或者多个颗粒的第二颗粒组,以及每一个都包含其中至少一个具有特征A和其中至少一个具有特征B的两个或者多个近间隔的颗粒的第三颗粒组。
T12.T11所述的系统,其中,特征A表示活X精细胞(X),特征B表示活X细胞以外的细胞(~X),所述激光器用于熔化第二颗粒组和第三颗粒组而不熔化第一颗粒组,并且所述控制装置作为至少一个群组中活X精细胞的量的函数改变流体输送到流式细胞术设备中的速度。
T13.T11所述的系统,其中,特征A表示活X精细胞(X),特征B表示活X细胞以外的细胞(~X),所述激光器用于熔化第二颗粒组而不熔化第一和第三颗粒组,并且所述控制装置作为至少一个群组中活X精细胞的量的函数改变流体输送到流式细胞术系统中的速度。
U.包括可变流速分拣策略的光破坏分拣方法
U1.使用流式细胞术系统分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的方法,所述方法包括:
输送包含所述颗粒的流体;
使所述流体形成流体流以及根据所述特征使用流式细胞术对所述流中的颗粒分类;
根据所述分类并根据分拣策略通过熔化所选择的颗粒分拣所述流中的颗粒以提供至少一个包含所需颗粒的群组;以及
作为下列因素至少一个的函数改变输送流体的速度,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的未熔化特征A的颗粒或者未熔化特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
U2.U1所述的方法,其中,所述颗粒是细胞并且特征A和B与所述细胞的物理特征有关。
U3.U2所述的方法,其中,所述细胞是精细胞,并且特征A表示活X精细胞。
U4.U3所述的方法,其中,特征B表示活X精细胞以外的精细胞(~X),并且所述激光器仅熔化第二颗粒组。
U5.U4所述的方法,还包括将所述至少一个群组的纯度保持得大于85%但是小于95%。
U6.U2所述的方法,其中,特征B表示活X精细胞以外的精细胞(~X),并且所述激光器仅熔化第二和第三颗粒组。
U7.U1所述的方法,其中当所述至少一个群组的纯度大于所需纯度时该控制装置增大流体输送的速度,并且当所述纯度小于所述所需纯度时减小流体输送的速度。
U8.U7所述的系统,其中,所述控制装置根据来自于流式细胞术设备的输出信号确定所述至少一个群组的纯度,所述系统还包括用于显示所需纯度的控制装置的操作者输入,并且所述控制装置改变流体输送速度以获得所述所需纯度。
U9.U8所述的系统,其中,当所述至少一个群组中特征A颗粒的量大于所述至少一个群组中特征A颗粒的可接受的量时所述控制装置增大流体输送的速度,并且当所述至少一个群组中特征A颗粒的量小于所述至少一个群组中特征A颗粒的可接受的量时所述控制装置减小流体输送的速度。
U10.U8所述的系统,其中,所述控制装置根据来自于流式细胞术设备的输出信号确定所述至少一个群组中特征A颗粒的总量,所述系统还包括用于显示至少一个群组中特征A颗粒的可接受的量的控制装置的操作者输入,并且所述控制装置改变速度从而改变至少一个群组中特征A颗粒的量以获得所述可接受的量或百分比。
U11.U1所述的系统,其中,所述流被构成为包含通常在一个系列中一个跟着另一个的颗粒的流,所述系列包括连续的颗粒组,所述组包括每一个都包含具有特征A的一个或者多个颗粒的第一颗粒组、每一个都包含具有特征B的一个或者多个颗粒的第二颗粒组,以及每一个都包含其中至少一个具有特征A和其中至少一个具有特征B的两个或者多个近间隔的颗粒的第三颗粒组。
U12.U11所述的系统,其中,特征A表示活X精细胞(X),特征B表示活X细胞以外的细胞(~X),所述激光器用于熔化第二颗粒组和第三颗粒组而不熔化第一颗粒组,并且所述控制装置作为至少一个群组中活X精细胞的量的函数改变流体输送到流式细胞术设备中的速度。
U13.U11所述的系统,其中,特征A表示活X精细胞(X),特征B表示活X细胞以外的细胞(~X),所述激光器用于熔化第二颗粒组而不熔化第一颗粒组和第三颗粒组,并且所述控制装置作为至少一个群组中活X精细胞的量的函数改变流体输送到流式细胞术设备中的速度。
V.包括分拣策略的流体切换颗粒分拣器
V1.在一种用于分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的流式细胞术系统中,所述系统包括:用于输送包含所述颗粒的流体的流体输送系统;用于接收所述流体、使其形成流体流以及根据所述特征利用流式细胞术对颗粒分类的流式细胞术设备;以及用于根据所述分类并根据分拣策略在所述流中分拣所选择的颗粒以提供包含所需颗粒的至少一个群组的流体切换分拣系统,改进包括:
作为下列因素至少一个的函数控制流体切换分拣系统以改变其分拣策略或者控制流体输送系统以改变输送流体的速度的响应于从流式细胞术设备接收的信息的控制装置,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的特征A的颗粒或者特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
V2.V1所述的系统,其中,所述颗粒是细胞并且特征A和B与所述细胞的物理特征有关。
V3.V1所述的系统,其中,所述细胞是精细胞,并且特征A表示活X精细胞。
V4.V3所述的系统,其中,特征B表示活X细胞以外的细胞(~X)。
V5.V1所述的系统,其中,当所述至少一个群组的纯度大于所需纯度时该控制装置增大流体输送的速度,并且当所述纯度小于所述所需纯度时减小流体输送的速度。
V6.V1所述的系统,其中,所述控制装置根据来自于流式细胞术设备的输出信号确定所述纯度,所述系统还包括用于显示所需纯度的控制装置的操作者输入,并且所述控制装置改变流体输送的速度以获得所需纯度。
V7.V1所述的系统,其中,所述流被构成为包含通常在一个系列中一个跟着另一个的颗粒的流,所述系列包括连续的颗粒组,所述组包括每一个都包含具有特征A的一个或者多个颗粒的第一颗粒组、每一个都包含具有特征B的一个或者多个颗粒的第二颗粒组,以及每一个都包含其中至少一个具有特征A和其中至少一个具有特征B的两个或者多个近间隔的颗粒的第三颗粒组。
V8.V7所述的系统,其中,所述激光器仅熔化第二颗粒组。
V9.V8所述的系统,其中,所述控制装置将所述至少一个群组的纯度保持得大于85%但是小于95%。
V10.V7所述的系统,其中,特征B表示活X细胞以外的细胞(~X)并且所述激光器用于熔化所述流中的第二颗粒组和第三颗粒组。
V11.V10所述的系统,其中,当所述至少一个群组中未熔化的特征A颗粒的量大于所述至少一个群组中未熔化的特征A颗粒的可接受的量时所述控制装置增大流体输送的速度,并且当所述至少一个群组中未熔化的特征A颗粒的量小于所述可接受的量时所述控制装置减小流体输送的速度。
V12.V10所述的系统,其中,所述控制装置根据来自于流式细胞术设备的输出信号确定所述至少一个群组中未熔化的特征A颗粒的量,所述系统还包括用于显示所述至少一个群组中未熔化的特征A颗粒的可接受的量的控制装置的操作者输入,并且所述控制装置改变速度从而获得所述至少一个群组中未熔化的特征A颗粒的可接受的量。
W.包括分拣策略的流体切换分拣方法
W1.使用流式细胞术系统分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的方法,所述方法包括:
输送包含所述颗粒的流体;
使所述流体形成流体流以及根据所述特征使用流式细胞术对所述流中的颗粒分类;
根据所述分类并根据分拣策略通过使得所选择的颗粒转向分拣所述流中的颗粒以提供至少一个包含所需颗粒的群组;以及
作为下列因素至少一个的函数改变输送流体的速度,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的特征A的颗粒或者特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
W2.W1所述的方法,其中,所述颗粒是细胞并且特征A和B与所述细胞的物理特征有关。
W3.W1所述的方法,其中,所述细胞是精细胞,并且特征A表示活X精细胞。
W4.W1所述的方法,还包括当所述至少一个群组的纯度大于所需纯度时该控制装置增大流体输送的速度,并且当所述纯度小于所述所需纯度时减小流体输送的速度。
W5.W1所述的方法,还包括将所述流构成为包含通常在一个系列中一个跟着另一个的颗粒的流,所述系列包括连续的颗粒组,所述组包括每一个都包含具有特征A的一个或者多个颗粒的第一颗粒组、每一个都包含具有特征B的一个或者多个颗粒的第二颗粒组,以及每一个都包含其中至少一个具有特征A和其中至少一个具有特征B的两个或者多个近间隔的颗粒的第三颗粒组。
W6.W5所述的方法,还包括熔化第二颗粒组而不熔化第一和第三颗粒组。
W7.W6所述的方法,还包括将所述至少一个群组的纯度保持得大于85%但是小于95%。
W8.W5所述的方法,还包括熔化第二和第三颗粒组而不熔化第一颗粒组。
W9.W8所述的方法,还包括当所述至少一个群组中未熔化的特征A颗粒的量大于所述至少一个群组中未熔化的特征A颗粒的可接受的量时所述控制装置增大流体输送的速度,并且当所述至少一个群组中未熔化的特征A颗粒的量小于所述可接受的量时所述控制装置减小流体输送的速度。
X.包括可变流速分拣策略的流体切换分拣器
X1.在一种用于分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的流式细胞术系统中,所述系统包括:用于输送包含所述颗粒的流体的流体输送系统;用于接收所述流体、使其形成流体流以及根据所述特征利用流式细胞术对颗粒分类的流式细胞术设备;以及用于根据所述分类在所述流中分拣所选择的颗粒的以提供包含所需颗粒的至少一个群组的流体切换分拣系统,改进包括:
作为下列因素至少一个的函数控制流体输送系统以改变输送流体的速度的响应于从流式细胞术设备接收的信息的控制装置,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的特征A的颗粒或者特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
X2.X1所述的系统,其中,所述颗粒是细胞并且特征A和B与所述细胞的物理特征有关。
X3.X1所述的系统,其中,所述细胞是精细胞,并且特征A表示活X精细胞。
X4.X3所述的系统,其中,特征B表示活X细胞以外的细胞(~X)。
X5.X1所述的系统,其中,当所述至少一个群组的纯度大于所需纯度时该控制装置增大流体输送的速度,并且当所述纯度小于所述所需纯度时减小流体输送的速度。
X6.X1所述的系统,其中,所述控制装置根据来自于流式细胞术设备的输出信号确定所述纯度,所述系统还包括用于显示所需纯度的控制装置的操作者输入,并且所述控制装置改变流体输送的速度以获得所需纯度。
X7.X1所述的系统,其中,所述流被构成为包含通常在一个系列中一个跟着另一个的颗粒的流,所述系列包括连续的颗粒组,所述组包括每一个都包含具有特征A的一个或者多个颗粒的第一颗粒组、每一个都包含具有特征B的一个或者多个颗粒的第二颗粒组,以及每一个都包含其中至少一个具有特征A和其中至少一个具有特征B的两个或者多个近间隔的颗粒的第三颗粒组。
X8.X7所述的系统,其中,所述激光器仅熔化第二颗粒组。
X9.X8所述的系统,其中,所述控制装置将所述至少一个群组的纯度保持得大于85%但是小于95%。
X10.X7所述的系统,其中,特征B表示活X细胞以外的细胞(~X)并且所述激光器用于熔化所述流中的第二颗粒组和第三颗粒组。
X11.X10所述的系统,其中,当所述至少一个群组中未熔化的特征A颗粒的量大于所述至少一个群组中未熔化的特征A颗粒的可接受的量时所述控制装置增大流体输送的速度,并且当所述至少一个群组中未熔化的特征A颗粒的量小于所述可接受的量时所述控制装置减小流体输送的速度。
X12.X10所述的系统,其中,所述控制装置根据来自于流式细胞术设备的输出信号确定所述至少一个群组中未熔化的特征A颗粒的量,所述系统还包括用于显示所述至少一个群组中未熔化的特征A颗粒的可接受的量的控制装置的操作者输入,并且所述控制装置改变速度从而获得所述至少一个群组中未熔化的特征A颗粒的可接受的量。
Y.包括可变流速和反馈的流体切换分拣方法
Y1.使用流式细胞术系统分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的方法,所述方法包括:
输送包含所述颗粒的流体;
使所述流体形成流体流以及根据所述特征使用流式细胞术对所述流中的颗粒分类;
根据所述分类通过使得所选择的颗粒转向分拣所述流中的颗粒以提供至少一个包含所需颗粒的群组;以及
作为下列因素至少一个的函数改变输送流体的速度,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的特征A的颗粒或者特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
Y2.Y1所述的方法,其中,所述颗粒是细胞并且特征A和B与所述细胞的物理特征有关。
Y3.Y1所述的方法,其中,所述细胞是精细胞,并且特征A表示活X精细胞。
Y4.Y1所述的方法,还包括当所述至少一个群组的纯度大于所需纯度时该控制装置增大流体输送的速度,并且当所述纯度小于所述所需纯度时减小流体输送的速度。
Y5.Y1所述的方法,还包括将所述流构成为包含通常在一个系列中一个跟着另一个的颗粒的流,所述系列包括连续的颗粒组,所述组包括每一个都包含具有特征A的一个或者多个颗粒的第一颗粒组、每一个都包含具有特征B的一个或者多个颗粒的第二颗粒组,以及每一个都包含其中至少一个具有特征A和其中至少一个具有特征B的两个或者多个近间隔的颗粒的第三颗粒组。
Y6.Y5所述的方法,还包括熔化第二颗粒组而不熔化第一和第三颗粒组。
Y7.Y6所述的方法,还包括将所述至少一个群组的纯度保持得大于85%但是小于95%。
Y8.Y5所述的方法,还包括熔化第二和第三颗粒组而不熔化第一颗粒组。
Y9.Y8所述的方法,还包括当所述至少一个群组中未熔化的特征A颗粒的量大于所述至少一个群组中未熔化的特征A颗粒的可接受的量时所述控制装置增大流体输送的速度,并且当所述至少一个群组中未熔化的特征A颗粒的量小于所述可接受的量时所述控制装置减小流体输送的速度。
Z.[保留]
AA.用于PMT输出信号和DSP分析和分类的A/D转换器
AA1.在一种用于分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的流式细胞术系统中,所述系统包括:用于输送包含所述颗粒的流体的流体输送系统;用于接收所述流体、使其形成流体流以及根据所述特征利用流式细胞术对颗粒分类的流式细胞术设备;以及用于根据所述分类并根据分拣策略分拣颗粒以提供包含所需颗粒的至少一个群组的分拣系统,改进包括:
对来自于所述流式细胞术设备的随时间变化的模拟输出进行同步采样并且提供包括对应于所述随时间变化的模拟输出的数字信息的输出的模拟数字转换器,其中所述随时间变化的模拟输出和相应的数字信息表示特征A或者特征B;
分析和分类数字信息并且为所述分拣系统提供作为被分析和分类的数字信息的函数的分拣信号的数字信号处理器。
AA1A.如AA1所述的系统,其中,所述随时间变化的模拟输出包括一系列波形脉冲,每一个波形脉冲表示颗粒的特征,其中数字信号处理器检测数字信息中对应于波形脉冲的部分并且对所检测的部分分类,并且所述数字信号处理器提供作为所述被检测和分类的部分的函数的所述分拣信号。
AA1B.如AA1所述的系统,还包括作为下列因素至少一个的函数响应于从流式细胞术设备接收的信息而控制分拣系统以改变其分拣策略或者控制流体输送系统以改变输送流体的速度的控制装置,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
AA2.AA1B所述的系统,其中,所述颗粒是细胞并且特征A和B与所述细胞的物理特征有关。
AA3.AA1B所述的系统,其中,所述细胞是精细胞,并且特征A表示活X精细胞。
AA4.AA3所述的系统,其中,特征B表示活X细胞以外的细胞(~X)。
AA5.AA4所述的系统,还包括将所述至少一个群组的纯度保持得大于85%但是小于95%。
AA6.AA1所述的系统,其中,所述控制装置在所述纯度大于所需纯度时增大流体输送的速度,并且在所述纯度小于所述所需纯度时减小流体输送的速度。
AA7.AA1所述的系统,其中,所述控制装置根据来自于流式细胞术设备的输出信号确定所述至少一个群组的纯度,所述系统还包括用于显示所需纯度的控制装置的操作者输入,并且所述控制装置改变流体输送的速度以使得所述纯度与所需纯度基本一致。
AA8.AA7所述的系统,其中,当所述至少一个群组中特征A颗粒的量大于所述至少一个群组中特征A颗粒的可接受的量时所述控制装置增大流体输送的速度,并且当所述至少一个群组中特征A颗粒的量小于所述可接受的量时所述控制装置减小流体输送的速度。
AA9.AA8所述的系统,其中,所述控制装置根据来自于流式细胞术设备的输出信号确定所述至少一个群组中特征A颗粒的量,所述系统还包括用于显示所述至少一个群组中特征A颗粒的可接受的量的控制装置的操作者输入,并且所述控制装置改变流体输送速度从而获得所述至少一个群组中的所述可接受的量。
AA10.AA1所述的系统,其中,所述流被构成为包含通常在一个系列中一个跟着另一个的颗粒的流,所述系列包括连续的颗粒组,所述组包括每一个都包含具有特征A的一个或者多个颗粒的第一颗粒组、每一个都包含具有特征B的一个或者多个颗粒的第二颗粒组,以及每一个都包含其中至少一个具有特征A和其中至少一个具有特征B的两个或者多个近间隔的颗粒的第三颗粒组。
AA11.AA10所述的系统,其中,所述分拣系统用于使用分拣策略,其中所述第一颗粒组被选择得用于收集在所述至少一个群组中并且所述第二和第三颗粒组未被选择得用于收集在所述至少一个群组中。
AA12.AA10所述的系统,其中,所述分拣系统用于使用分拣策略,其中所述第一和第三颗粒组被选择得用于收集在所述至少一个群组中并且所述第二颗粒组未被选择得用于收集在所述至少一个群组中。
AA13.AA1所述的系统,其中,所述分拣系统包括液滴分拣系统。
AA14.AA1所述的系统,其中,所述分拣系统包括光破坏分拣系统。
AA15.AA1所述的系统,其中,所述分拣系统包括流体切换分拣系统。
AA16.AA1所述的系统,其中,所述数字信号处理器包括用于检测对应于所述数字信息的脉冲的指令、用于在检测的脉冲中抽取特征的指令以及识别作为它们被抽取的特征的函数的被检测的脉冲的指令。
AA17.AA16所述的系统,其中,所述数字信号处理器包括用于限定在表示特征A的被抽取的特征和表示特征B的被抽取的特征之间识别的判定边界的指令。
AA18.AA17所述的系统,其中,所述数字信号处理器作为下列因素至少一个的函数调节判定边界相对于表示特征A的被抽取的特征和相对于表示特征B的被抽取的特征的相对位置,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在
所述至少一个群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
AA19.AA1所述的系统,其中,所述数字信号处理器包括用于将数字信息汇集成连续流的数据管理处理器。
AA20.AA1所述的系统,其中,所述数字信号处理器包括用于检测由数字信息表示的波形脉冲的脉冲检测处理器,并且所述数字信号处理器作为所检测的波形脉冲的函数分类所述数字信息。
AA21.AA20所述的系统,还包括用于在等于或小于所述转换器连续采样速度的一半的频率下过滤模拟输出的滤波器,其中所述转换器将已过滤的模拟输出转换为相应的数字信息,并且所述数字信号处理器作为判定边界的函数分类所述数字信息。
AA22.AA21所述的系统,所述连续采样速度约为109MHZ或更高。
AA23.AA21所述的系统,其中,所述数字信号处理器包括用于限定识别表示特征A的已抽取特征和表示特征B的已抽取特征的特征抽取和识别处理器,并且特征抽取和识别处理器抽取由所述数字信息表示的特征以及作为判定边界的函数分类所述特征。
AA24.AA1所述的系统,其中,所述数字信号处理器包括对所述分类起反应以便于向所述分拣系统提供分拣信号的分拣处理器。
AA25.AA1所述的系统,其中,所述处理器计算(innumerates)具有特征A或具有特征B的已分类颗粒的量。
AA26.AA1所述的系统,其中,所述数字信号处理器作为将具有特征A颗粒的群组的改变系数减小得基本等于或小于预设量的函数或作为将具有特征B颗粒的群组的改变系数最小化得基本等于或小于预设量的函数而分类数字信息。
AA27.AA26所述的系统,其中,所述预设量约为1.5%或更小。
AA27a.AA26所述的系统,其中,所述预设量约为1.3%或更小。
AA28.AA1所述的系统,其中,所述数字信号处理器分类数字信息以使具有特征A的颗粒群组和具有特征B的颗粒群组对应于包括具有特征A的颗粒的第一模型群组、具有特征B的颗粒的第二模型群组和未对准的颗粒的第三模型群组的三个群组的计算机模型,所述模型评估第一、第二和第三模型群组中的每一个的群组统计。
AA29.AA28所述的系统,其中,第三模型群组包括未对准的颗粒的两个群组,并且所述模型评估这两个群组的群组统计。
AA30.AA1所述的系统,其中,所述数字信号处理器包括用于检测由数字信息表示的用于检测波形脉冲的脉冲检测处理器,并且所述数字信号处理器作为具有特征A颗粒的群组的改变系数的函数或作为具有特征B颗粒的群组的改变系数的函数而分类所述数字信息。
AA30a.AA30所述的系统,还包括用于在等于或小于所述转换器连续采样速度的一半的频率下过滤模拟输出的滤波器,其中所述转换器将已过滤的模拟输出转换为相应的数字信息,并且所述数字信号处理器作为具有特征A颗粒的群组的改变系数的函数或作为具有特征B颗粒的群组的改变系数的函数而分类所述数字信息。
AA30b.AA1所述的系统,其中,所述数字信号处理器包括用于限定识别表示特征A的已抽取特征和表示特征B的已抽取特征的特征抽取和识别处理器,并且特征抽取和识别处理器抽取由所述数字信息表示的特征以及作为具有特征A颗粒的群组的改变系数的函数或作为具有特征B颗粒的群组的改变系数的函数而分类所述特征。
AA31.一种利用流式细胞术系统分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的方法,所述方法包括:
输送包含所述颗粒的流体;
使流体形成流体流以及根据所述特征利用流式细胞术检测流体流中的颗粒;
根据分拣策略在流体流中分拣颗粒以提供至少一个包含所需颗粒的群组;
将来自于所述流式细胞术的模拟输出转换成相应的数字信息,其中模拟输出表示特征A或者特征B;以及
分析和分类数字信息并且作为被分析和分类的数字信息的函数分拣颗粒。
AA31A.AA31所述的方法还包括作为下列因素至少一个的函数改变所述分拣策略或者改变输送流体的速度,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
AA32.AA31所述的方法,其中,所述颗粒是细胞并且特征A和B与所述细胞的物理特征有关。
AA33.AA31所述的方法,其中,所述细胞是精细胞,并且特征A表示活X精细胞。
AA34.AA33所述的方法,其中,特征B表示活X细胞以外的细胞(~X)。
AA35.AA33所述的方法,还包括将所述纯度保持得大于85%但是小于95%。
AA36.AA31所述的方法,还包括在所述纯度大于所需纯度时增大流体输送的速度,并且在所述纯度小于所述所需纯度时减小流体输送的速度。
AA37.AA31所述的方法,还包括当所述至少一个群组中特征A颗粒的量大于所述至少一个群组中特征A颗粒的可接受的量时增大流体输送的速度,并且当所述至少一个群组中特征A颗粒的量小于所述可接受的量时减小流体输送的速度。
AA38.AA31所述的方法,还包括将所述流构成为包含通常在一个系列中一个跟着另一个的颗粒的流,所述系列包括连续的颗粒组,所述组包括每一个都包含具有特征A的一个或者多个颗粒的第一颗粒组、每一个都包含具有特征B的一个或者多个颗粒的第二颗粒组,以及每一个都包含其中至少一个具有特征A和其中至少一个具有特征B的两个或者多个近间隔的颗粒的第三颗粒组。
AA39.AA38所述的方法,还包括根据分拣策略分拣所述颗粒,其中只有第一颗粒组被选择得用于收集在所述至少一个群组中。
AA40.AA38所述的方法,还包括根据分拣策略分拣所述颗粒,其中第一和第三颗粒组被选择得用于收集在所述至少一个群组中。
AA41.AA31所述的方法,其中,所述分拣包括使用液滴分拣处理。
AA42.AA31所述的方法,其中,所述分拣包括使用光破坏分拣处理。
AA43.AA31所述的方法,其中,所述分拣包括使用流体切换分拣处理。
AA44.AA1所述的方法,还包括检测由所述数字信息表示的波形脉冲、从数字信息中抽取波形脉冲的特征以及作为它们被抽取的特征的函数识别被检测的波形脉冲。
AA45.AA44所述的方法,还包括限定在表示特征A的被抽取的特征和表示特征B的被抽取的特征之间识别的判定边界。
AA46.AA45所述的方法,还包括作为下列因素至少一个的函数调节判定边界相对于表示特征A的被抽取的特征和相对于表示特征B的被抽取的特征的相对位置,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
AA47.AA31所述的方法,其中,所述转换包括同步采样所述模拟输出。
AA48.AA31所述的方法,其中,分类数字信息包括作为将具有特征A颗粒的群组的改变系数最小化得基本等于或小于预设量的函数或作为将具有特征B颗粒的群组的改变系数最小化得基本等于或小于预设量的函数而分类数字信息。
AA49.AA48所述的方法,其中,所述预设量约为1.5%或更小。
AA50.AA31所述的方法,其中,分类数字信息包括类数字信息以使具有特征A的颗粒群组和具有特征B的颗粒群组对应于包括具有特征A的颗粒的第一模型群组、具有特征B的颗粒的第二模型群组和未对准的颗粒的第三模型群组的三个群组的计算机模型,所述模型评估第一、第二和第三模型群组中的每一个的群组统计。
AA51.AA31所述的系统,分类所述数字信息包括作为具有特征A颗粒的群组的改变系数的函数或作为具有特征B颗粒的群组的改变系数的函数而分类所述数字信息。
BB.确定初始检测参数
BB1.在一种用于分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的流式细胞术系统中,所述系统包括:用于输送包含所述颗粒的流体的流体输送系统;用于接收所述流体、使其形成流体流以及根据所述特征利用流式细胞术对颗粒分类的流式细胞术设备;以及用于根据所述分类并根据分拣策略分拣颗粒以提供包含所需颗粒的至少一个群组的分拣系统,改进包括:
对来自于所述流式细胞术设备的随时间变化的模拟输出进行同步采样并且提供包括对应于所述随时间变化的模拟输出的数字信息的输出的模拟数字转换器,其中所述随时间变化的模拟输出和相应的数字信息表示特征A或者特征B;
确定来自于所述数字信息中所述随时间变化的模拟输出背景特征的数字信号处理器;
检测作为所确定的背景特征的函数的由所述数字信息表示的波形脉冲;以及
为所述分拣系统提供作为被检测的波形脉冲的函数的分拣信号。
BB2.BB1所述的系统,其中,所述数字信号处理器使用用于确定限定背景特征的脉冲检测阈值的迭代法,所述迭代法包括:
从数字信息中计算背景统计评估;
利用计算的评估为所述数字信息提供脉冲检测逻辑以确定表示特征A或者特征B的脉冲;
不利用对应于确定的脉冲的数字信息再次计算评估;以及
重复上述步骤直至背景统计评估收敛或者固定的最大迭代数出现。
BB3.BB1所述的系统,其中,所述数字信号处理器包括用于检测由所述数字信息表示的波形脉冲的指令、用于在检测的脉冲中抽取特征的指令以及识别作为它们被抽取的特征的函数的被检测的脉冲的指令。
BB4.BB3所述的系统,其中,所述数字信号处理器包括用于限定在表示特征A的被抽取的特征和表示特征B的被抽取的特征之间识别的判定边界的指令。
BB5.BB4所述的系统,其中,所述数字信号处理器作为下列因素至少一个的函数调节判定边界相对于表示特征A的被抽取的特征和相对于表示特征B的被抽取的特征的相对位置,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
BB6.BB1所述的系统,还包括作为下列因素至少一个的函数响应于从流式细胞术设备接收的信息而控制分拣系统以改变其分拣策略或者控制流体输送系统以改变输送流体的速度的控制装置,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
BB7.B1所述的系统,其中,所述数字信号处理器包括用于检测由数字信息表示的波形脉冲的脉冲检测处理器,并且所述数字信号处理器作为所检测的波形脉冲的函数分类所述数字信息。
BB8.BB7所述的系统,还包括用于在等于或小于所述转换器采样速度的一半的频率下过滤模拟输出的滤波器,其中所述转换器将已过滤的模拟输出转换为相应的数字信息。
CC.产生初始识别参数
CC1.在一种用于分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的流式细胞术系统中,所述系统包括:用于输送包含所述颗粒的流体的流体输送系统;用于接收所述流体、使其形成流体流以及根据所述特征利用流式细胞术对颗粒分类的流式细胞术设备;以及根据所述分类并根据分拣策略分拣颗粒以提供至少一个包含所需颗粒的群组的分拣系统,改进包括:
对来自于所述流式细胞术设备的随时间变化的模拟输出进行同步采样并且提供包括对应于所述随时间变化的模拟输出的数字信息的输出的模拟数字转换器,其中所述随时间变化的模拟输出和相应的数字信息表示特征A或者特征B;以及
从数字信息中产生初始识别参数、识别作为初始识别参数的函数的数字信息以及为所述分拣系统提供作为被识别的数字信息的函数的分拣信号的数字信号处理器。
CC2.CC1所述的系统,其中,所述数字信号处理器使用下列算法中的至少一种以产生初始识别参数,这些算法包括:k-平均(k-Means)、模糊k-平均(Fuzzy k-Means)和凝聚分级(Agglomerative Hierarchical)。
CC3.CC1所述的系统,其中,所述数字信号处理器包括用于检测由所述数字信息表示的波形脉冲的指令、用于在检测的脉冲中抽取特征的指令以及识别作为它们被抽取的特征的函数的被检测的脉冲的指令。
CC4.CC3所述的系统,其中,所述数字信号处理器包括用于限定在表示特征A的被抽取的特征和表示特征B的被抽取的特征之间识别的判定边界的指令。
CC5.CC4所述的系统,其中,所述数字信号处理器作为下列因素至少一个的函数调节判定边界相对于表示特征A的被抽取的特征和相对于表示特征B的被抽取的特征的相对位置,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
CC6.CC1所述的系统,还包括作为下列因素至少一个的函数响应于从流式细胞术设备接收的信息而控制分拣系统以改变其分拣策略或者控制流体输送系统以改变输送流体的速度的控制装置,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
DD.同步采样波形脉冲以进行分类
DD1.在一种用于分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的流式细胞术系统中,所述系统包括:
用于输送包含所述颗粒的流体的流体输送系统;和用于接收所述流体、使其形成流体流以及根据所述特征利用流式细胞术对颗粒分类的流式细胞术设备;
对来自于所述流式细胞术设备的包括一系列波形脉冲的随时间变化的模拟输出进行同步采样并且提供包括对应于所述随时间变化的模拟输出的数字信息的输出的模拟数字转换器,其中所述波形脉冲和相应的数字信息表示特征A或者特征B;以及
分析数字信息并且作为与其相对应的被分析的数字信息的函数的分拣信号的数字信号处理器。
DD2.DD1所述的系统,其中,所述数字处理器使用用于限定波形脉冲的检测阈值,并且所述检测阈值是背景平均评估和在结束于当前样本的样本移动窗内计算的数字信息的标准偏差的函数。
DD3.DD1所述的系统,其中,数字控制装置使用统计异常检测分析,并且与数字信息的背景特征统计异常的数字信息是数字脉冲被考虑的部分。
DD4.DD1所述的系统,其中,所述数字信号处理器包括用于检测与数字信息相对应的脉冲的指令、用于在检测的脉冲中抽取特征的指令以及识别作为它们被抽取的特征的函数的被检测的脉冲的指令。
DD5.DD4所述的系统,其中,所述数字信号处理器包括用于限定在表示特征A的被抽取的特征和表示特征B的被抽取的特征之间识别的判定边界的指令。
DD6.DD5所述的系统,其中,所述数字信号处理器作为下列因素至少一个的函数调节判定边界相对于表示特征A的被抽取的特征和相对于表示特征B的被抽取的特征的相对位置,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
DD7.DD1所述的系统,还包括用于在等于或小于所述转换器采样速度的一半的频率下过滤模拟输出的滤波器,其中所述转换器将已过滤的模拟输出转换为相应的数字信息。
DD8.DD1所述的系统,还包括作为下列因素至少一个的函数响应于从流式细胞术设备接收的信息而控制分拣系统以改变其分拣策略或者控制流体输送系统以改变输送流体的速度的控制装置,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
DD9.DD1所述的系统,其中,所述处理器计算(innumerates)具有特征A或具有特征B的已分类颗粒的量。
DD10.DD1所述的系统,还包括用于照射颗粒以产生相应的波形脉冲的与同步采样同步的脉冲照射装置。
DD11.DD10所述的系统,其中,所述数字信号处理器包括用于检测由数字信息表示的波形脉冲的脉冲检测处理器,并且所述数字信号处理器作为具有特征A颗粒的群组的改变系数的函数或作为具有特征B颗粒的群组的改变系数的函数而分类所述数字信息。
EE.特征抽取
EE1.在一种用于分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的流式细胞术系统中,所述系统包括:用于输送包含所述颗粒的流体的流体输送系统;用于接收所述流体、使其形成流体流以及根据所述特征利用流式细胞术对颗粒分类的流式细胞术设备;以及根据所述分类并根据分拣策略分拣颗粒以提供至少一个包含所需颗粒的群组的分拣系统,改进包括:
对来自于所述流式细胞术设备的随时间变化的模拟输出进行同步采样并且提供包括对应于所述随时间变化的模拟输出的数字信息的输出的模拟数字转换器,其中所述随时间变化的模拟输出和相应的数字信息表示特征A或者特征B;
从数字信息抽取特征并且为所述分拣系统提供作为被抽取的特征的函数的分拣信号的数字信号处理器。
EE2.EE1所述的设备,其中,被抽取的特征对应于下列特征的一个或者多个,这些特征包括:脉冲区域、脉冲峰值、脉冲内区域(pulse innerarea)、脉冲宽度、脉冲高斯分布(pulse gaussianity)、脉冲滞后峰值或者脉冲斜度。
EE3.EE2所述的设备,其中,被抽取的特征包括在脉冲的一点处相对于脉冲的平均峰值高度的脉冲的导数的近似值或者脉冲的效率。
EE4.EE3所述的设备,其中,沿着脉冲的所述点对应于在由具有特征A的颗粒产生的脉冲的第一导数和由具有特征B的颗粒产生的脉冲的第一导数之间存在差值的点。
EE5.EE3所述的设备,其中,随时间变化的模拟输出对应于来自于颗粒的荧光发射脉冲,并且沿着脉冲的所述点对应于在由具有特征A的颗粒产生的脉冲的第一导数和由具有特征B的颗粒产生的脉冲的第一导数之间的差值为最大值或者接近最大值的点。
EE6.EE3所述的设备,其中,随时间变化的模拟输出对应于来自于颗粒的荧光发射脉冲,并且沿着脉冲的所述点是荧光发射脉冲的峰值高度的函数。
EE7.EE3所述的设备,其中,所述数字信号处理器包括用于检测由数字信息表示的波形脉冲的指令、用于在检测的波形脉冲中抽取特征的指令以及识别作为它们被抽取的特征的函数的被检测的波形脉冲的指令。
EE8.EE7所述的设备,其中,所述数字信号处理器包括用于限定在表示特征A的被抽取的特征和表示特征B的被抽取的特征之间识别的判定边界的指令。
EE9.EE8所述的设备,其中,所述数字信号处理器作为下列因素至少一个的函数调节判定边界相对于表示特征A的被抽取的特征和相对于表示特征B的被抽取的特征的相对位置,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
EE10.EE1所述的设备,还包括作为下列因素至少一个的函数响应于从流式细胞术设备接收的信息而控制分拣系统以改变其分拣策略或者控制流体输送系统以改变输送流体的速度的控制装置,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
EE11.EE1所述的设备,其中,所述数字信号处理器包括用于检测由数字信息表示的波形脉冲并且用于分类所检测的波形脉冲的脉冲检测处理器。
EE12.EE1所述的设备,还包括用于在等于或小于所述转换器采样速度的一半的频率下过滤模拟输出的滤波器,其中所述转换器将已过滤的模拟输出转换为相应的数字信息。
FF.识别波形脉冲
FF1.在一种用于分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的流式细胞术系统中,所述系统包括:用于输送包含所述颗粒的流体的流体输送系统;用于接收所述流体、使其形成流体流以及根据所述特征利用流式细胞术对颗粒分类的流式细胞术设备;以及根据所述分类并根据分拣策略分拣颗粒以提供至少一个包含所需颗粒的群组的分拣系统,改进包括:
对来自于所述流式细胞术设备的包括波形脉冲的随时间变化的模拟输出进行同步采样并且提供包括对应于所述波形脉冲的数字信息的输出的模拟数字转换器,其中所述波形脉冲和相应的数字信息表示特征A或者特征B;
以表示特征A或者特征B的形式识别数字信息并且为所述分拣系统提供作为被识别的数字信息的函数的分拣信号的数字信号处理器。
FF2.FF1所述的设备,其中,所述数字信号处理器包括用于检测由所述数字信息表示的波形脉冲的指令、用于在检测的波形脉冲中抽取特征的指令以及识别作为它们被抽取的特征的函数的被检测的波形脉冲的指令。
FF3.FF2所述的设备,其中,所述数字信号处理器包括用于限定在表示特征A的被抽取的特征和表示特征B的被抽取的特征之间识别的判定边界的设备。
FF4.FF3所述的设备,其中,所述数字信号处理器作为下列因素至少一个的函数调节判定边界相对于表示特征A的被抽取的特征和相对于表示特征B的被抽取的特征的相对位置,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
FF5.FF1所述的设备,其中,所述数字信号处理器包括用于检测与数字信息相对应的波形脉冲的脉冲检测处理器,并且所述数字信号处理器作为所检测的波形脉冲分类所述数字信息。
FF6.FF5所述的设备,还包括用于在等于或小于所述转换器采样速度的一半的频率下过滤模拟输出的滤波器,其中所述转换器将已过滤的模拟翰出转换为相应的数字信息。
FF7.FF1所述的设备,还包括作为下列因素至少一个的函数响应于从流式细胞术设备接收的信息而控制分拣系统以改变其分拣策略或者控制流体输送系统以改变输送流体的速度的控制装置,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
FF8.FF1所述的设备,还包括用于照射颗粒以产生相应的波形脉冲的与同步采样同步的脉冲照射装置。
FF9.FF所述的设备,其中,所述数字信号处理器包括用于检测由数字信息表示的波形脉冲的脉冲检测处理器,并且所述数字信号处理器作为具有特征A颗粒的群组的改变系数的函数或作为具有特征B颗粒的群组的改变系数的函数而分类所述数字信息。
GG.LED阵列分裂传感器
GG1.一种与在分裂位置处分裂为液滴的连续流体流结合使用的设备,所述设备包括:
布置在所述流的一侧上以照射所述流的光源;
布置在所述流的另一侧上以便于沿着基本平行于所述流的轴线被取向的线性光敏元件阵列,所述光敏元件阵列适于检测穿过所述流的来自于所述光源的光并且所述光敏元件阵列适于提供对应于检测光的输出信号;
用于接收输出信号并且提供与分裂位置相对应的位置的位置信号的控制装置。
GG2.GG1所述的设备,还包括用于提供表示分裂位置的位置的显示的显示器。
GG3.GG1所述的设备,还包括用于向所述流施力以改变分裂位置的位置的换能器,所述换能器作为输入信号的函数改变所述力的振幅,并且来自于检测器的位置信号作为输入信号被提供给所述换能器。
GG4.GG3所述的设备,还包括用于指定作为分裂位置的位置的函数的施加于所述流的力的振幅的改变的查阅表。
HH.流式细胞术分裂传感器
HH1.在一种用于分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的流式细胞术系统中,所述系统包括:用于输送包含所述颗粒的流体的流体输送系统;用于接收所述流体、使其形成流体流以及根据所述特征利用流式细胞术对颗粒分类的流式细胞术设备;以及根据所述分类并根据分拣策略分拣颗粒以提供至少一个包含所需颗粒的群组的分拣系统,改进包括:
布置在所述流的一侧上第二位置处以照射所述流的光源;
布置在所述流的另一侧上第二位置处以便于沿着基本平行于所述流的轴线被取向的线性光敏元件阵列,所述光敏元件阵列适于检测穿过所述流的来自于所述光源的光并且所述光敏元件阵列适于提供对应于检测光的输出信号;
用于接收表示第二位置的位置的输出信号的控制装置,所述控制装置作为输出信号的函数改变所述换能器的操作。
HH2.HH1所述的设备,还包括作为下列因素至少一个的函数响应于从流式细胞术设备接收的信息而控制分拣系统以改变其分拣策略或者控制流体输送系统以改变输送流体的速度的控制装置,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
HH3.HH1所述的设备,还包括用于提供表示分裂位置的位置的显示的显示器。
HH4.HH1所述的设备,还包括用于向所述流施力以改变分裂位置的位置的换能器,所述换能器作为输入信号的函数改变所述力的振幅,并且来自于检测器的位置信号作为输入信号被提供给所述换能器。
HH5.HH4所述的设备,还包括用于指定作为分裂位置的位置的函数的施加于所述流的力的振幅的改变的查阅表。
II.具有外照射光学系统的液滴分拣器
II1.一种根据颗粒的一个或者多个特征分拣包含在流体流中的颗粒的设备,所述系统包括:
用于将包含所述颗粒的流体流输送到第一位置并且使得流体流在第二位置分裂成液滴的流式细胞术设备,所述流式细胞术设备利用流式细胞术根据所述特征对颗粒进行分类并且根据包含在液滴中的颗粒的分类分拣所述液滴;
所述流式细胞术设备包括外照射光学系统,所述外照射光学系统包括聚焦透镜、所述光学系统可沿着在所述第一位置与流体流相交的射束轴线在向前的方向上引导激光束穿过所述聚焦透镜以使所述细胞穿过光束,导致电磁辐射在向后的方向上沿着所述射束轴线从被引导的细胞发出。
II2.II1所述的设备,其中,所述颗粒是细胞。
II3.II1所述的设备,其中,所述颗粒是精细胞。
II4.II3所述的系统,其中,所述射束在所述第一位置处以斑点的形式被所述光学系统聚焦在流体流上,所述斑点的形状基本为椭圆形,并且其具有沿着相对于流体流的方向基本以直角延伸的长轴的长度和沿着基本平行于流体流的方向延伸的短轴的宽度,所述宽度小于穿过斑点的精细胞的头部的长度。
II5.II3所述的设备,其中,所述光学系统包括在所述聚焦透镜后面用于检测所述发射的一个光检测器。
II6.II1所述的设备,其中,所述流式细胞术设备还包括喷嘴,所述喷嘴具有这样构造的内表面,即,能够在颗粒穿过所述光束之前在颗粒上施加作用力以将它们带到所需取向。
II7.II4所述的设备,其中,所述喷嘴可围绕所述喷嘴的纵向轴线转动以调节相对于射束轴线的所述所需颗粒取向。
II8.II1所述的设备,其中,所述流式细胞术设备包括喷嘴,所述喷嘴被取向为沿向上、非竖直的方向引导所述流体流。
II9.II1所述的设备,其中,所述喷嘴具有涂有非反射性、非发射性涂层。
II10.II1所述的设备,其中,所述光学系统包括在所述聚焦透镜后面用于检测所述发射的一个光检测器。
II11.II1所述的设备,其中,所述流式细胞术设备包括具有喷嘴孔的喷嘴,以及从所述喷嘴孔处延伸的毛细管,所述流体流通过所述喷嘴孔被输送到所述第一位置。
II12.II9所述的设备,其中,所述第一位置位于所述毛细管的内部。
II13.II1所述的系统,其中,所述流式细胞术设备包括多个流式细胞术单元,所述多个流式细胞术单元可同时分析多个流体流,每一个流式细胞术单元包括所述外照射光学系统。
JJ.使用外照射光学系统分拣颗粒的方法
JJ1.一种根据颗粒的一个或者多个特征分拣包含在流体流中的颗粒的方法,所述方法包括:
将包含所述颗粒的流体流输送到第一位置并且使得流体流在第二位置分裂成液滴;
利用流式细胞术根据所述特征对颗粒进行分类并且根据包含在液滴中的颗粒的分类分拣所述液滴,
所述流式细胞术包括可沿着在所述第一位置与流体流相交的射束轴线在向前的方向上引导激光束穿过所述聚焦透镜以使所述细胞穿过光束,导致电磁辐射在向后的方向上沿着所述射束轴线从被引导的细胞发出。
JJ2.JJ1所述的方法,其中,所述颗粒是细胞。
JJ3.JJ1所述的方法,其中,所述颗粒是精细胞。
JJ4.JJ3所述的方法,其中,输送流体流的步骤包括在20-40psi的压力下以及以每秒30000至50000个精细胞的速度引导所述流体通过直径为50至70微米的喷嘴孔。
JJ5.JJ3所述的方法,还包括所述射束在所述第一位置处以斑点的形式被聚焦在流体流上,所述斑点的形状基本为椭圆形,并且其具有沿着相对于流体流的方向基本以直角延伸的长轴的长度和沿着基本平行于流体流的方向延伸的短轴的宽度,所述宽度小于穿过斑点的精细胞的头部的长度。
JJ6.JJ5所述的方法,其中,所述精细胞的头部包括具有在流体流的方向上的长度的DNA区域,并且所述光束斑点的宽度小于所述DNA区域的长度。
JJ7.JJ3所述的方法,还包括产生都包含精细胞的多个独立的流体流,并且对于每一个这种流体流,执行步骤(a)(b)。
JJ8.JJ7所述的方法,还包括利用公共激光束照射所述流体流。
JJ9.JJ1所述的方法,还包括在颗粒穿过所述光束之前在颗粒上施加作用力以将它们带到所需取向。
JJ10.JJ4所述的方法,还包括使得所述流体流流过被构成得用于施加所述力的喷嘴,并且使得所述喷嘴围绕所述喷嘴的纵向轴转动以相对于射束轴线调节所需颗粒取向。
JJ11.JJ1所述的方法,其中,所述流式细胞术处理还包括仅利用一个光检测器检测电磁辐射的发射。
KK.具有外照射光学系统的光破坏分拣器
KK1.一种根据颗粒的一个或者多个特征分拣包含在流体流中的颗粒的设备,所述系统包括:
用于将包含所述颗粒的流体流输送到第一位置、根据所述特征对颗粒进行分类以及根据所述分类将所述颗粒分拣所到包含所需颗粒的至少一个群组中的流式细胞术设备;以及
用于熔化所述流中的颗粒的激光器,
所述流式细胞术设备包括外照射光学系统,所述外照射光学系统包括聚焦透镜、所述光学系统可沿着在所述第一位置与流体流相交的射束轴线在向前的方向上引导激光束穿过所述聚焦透镜以使所述细胞穿过光束,导致电磁辐射在向后的方向上沿着所述射束轴线从被引导的细胞发出。
KK2.KK1所述的设备,其中,所述颗粒是细胞。
KK3.KK2所述的设备,其中,所述颗粒是精细胞。
KK4.KK1所述的设备,其中,所述流式细胞术设备还包括喷嘴,所述喷嘴具有这样构造的内表面,即,能够在颗粒穿过所述光束之前在颗粒上施加作用力以将它们带到所需取向。
KK5.KK4所述的设备,其中,所述喷嘴可围绕所述喷嘴的纵向轴线转动以调节相对于射束轴线的所述所需颗粒取向。
KK6.KK1(拷贝权利要求AA2等)
LL.使用外照射光学系统和光破坏分拣颗粒的方法
LL1.一种根据颗粒的一个或者多个特征分拣包含在流体流中的颗粒的方法,所述方法包括:
使用流式细胞术处理以根据所述特征对流体流中的颗粒进行分类以及根据所述颗粒的分类分拣所述颗粒;以及
熔化所述流体流中的颗粒,
所述流式细胞术处理包括沿着与流体流相交的射束轴线在向前的方向上引导激光束穿过所述聚焦透镜以使所述细胞穿过光束,导致电磁辐射在向后的方向上沿着所述射束轴线从被引导的细胞发出。
MM.具有外照射光学系统的精细胞分拣器
MM1.一种根据染色体DNA特征对精细胞进行分类的系统包括:
用于将包含所述细胞的流体流输送到第一位置并且使得所述流在第二位置处分裂为液滴的流式细胞术设备,所述流式细胞术设备用于根据DNA特征对所述细胞进行分类并且根据包含在液滴中的细胞分类分拣所述液滴,
所述流式细胞术设备包括外照射光学系统,所述外照射光学系统包括聚焦透镜、所述光学系统可沿着在所述第一位置与流体流相交的射束轴线在向前的方向上引导激光束穿过所述聚焦透镜以使所述细胞穿过光束,导致电磁辐射在向后的方向上沿着所述射束轴线从被引导的细胞发出。
MM2.MM1所述的系统,其中,所述光学系统还包括在所述聚焦透镜后面的所述射束轴线上的用于检测所述辐射的至少一些并且将所述辐射的至少一些转换成表示所述DNA特征的电信号的光检测器。
MM3.MM1所述的系统,其中,所述液滴被分拣于每个都包含至少一个活X精细胞的第一液滴和每个都包含至少一个Y细胞的第二液滴中。
MM4.MM3所述的系统,其中,第一液滴中的至少一些包含活X细胞和活Y细胞。
MM5.MM1所述的系统,其中,所述流式细胞术设备包括喷嘴,所述喷嘴具有这样构造的内表面,即,能够在细胞穿过所述光束之前在细胞上施加作用力以将它们带到所需取向。
MM6.MM5所述的系统,其中,所述喷嘴可围绕所述喷嘴的纵向轴线转动以调节相对于射束轴线的所述所需细胞取向。
MM7.MM1所述的系统,其中,所述射束轴线在所述第一位置处在相对于所述流的纵向轴的斜入射角下与所述流体流相交。
MM8.MM1所述的系统,其中,所述射束在所述第一位置处以斑点的形式被所述光学系统聚焦在流体流上,所述斑点的形状基本为椭圆形,并且其具有沿着相对于流体流的方向基本以直角延伸的长轴的长度和沿着基本平行于流体流的方向延伸的短轴的宽度,所述宽度小于穿过斑点的精细胞的头部的长度。
MM9.MM8所述的系统,其中,所述精细胞的所述头包括在流体流的方向上具有长度的DNA区域,并且所述光束斑点宽度小于所述DNA区域的长度。
MM10.MM1所述的系统,其中,所述流式细胞术设备包括多个流式细胞术单元,所述多个流式细胞术单元用于同时分析多个流体流,每一个流式细胞术单元包括所述外照射光学系统。
MM11.MM1所述的系统,其中,所述流式细胞术设备包括喷嘴,所述喷嘴被取向为沿向上、非竖直的方向引导所述流体流。
MM12.MM1所述的系统,其中,所述光学系统仅包括用于检测所述发射的一个光检测器。
MM13.MM1所述的系统,还包括用于收集至少所述第一液滴的收集器。
MM14.MM1所述的系统,其中,所述流式细胞术设备包括具有喷嘴孔的喷嘴,以及从所述喷嘴孔处延伸的毛细管,所述流体流通过所述喷嘴孔被输送到所述第一位置。
MM15.MM14所述的系统,其中,所述第一位置位于所述毛细管的内部。
MM16.MM15所述的系统,其中,所述光学系统与所述毛细管光学地连接从而将所述射束传输到流过所述管的所述流中。
NN.使用外照射光学系统分拣精细胞的方法
NN1.一种通过染色体DNA特征对动物精细胞进行分类的方法,所述方法包括下列步骤:
(a)将包含所述细胞的流体流输送到第一位置并且使得所述流在第二位置处分裂为液滴;
(b)沿着在所述第一位置与所述流体流相交的射束轴线在向前的方向上引导激光束穿过聚焦透镜以使所述细胞穿过射束,导致电磁辐射在向后的方向上沿着所述射束轴线从被引导的细胞发出;
(c)检测所述辐射的至少一些并且将所述辐射的至少一些转换成表示所述DNA特征的电信号;
(d)处理所述电信号和根据所述DNA特征对细胞进行分类;以及
(e)根据包含在所述液滴中的细胞分类分拣所述液滴。
NN2.NN1所述的方法,其中,所述液滴被分拣于每个都包含至少一个活X精细胞的第一液滴和每个都包含至少一个Y细胞的第二液滴中。
NN3.NN2所述的方法,其中,第一液滴中的至少一些包含活X细胞和活Y细胞。
NN4.NN1所述的方法,其中,步骤(a)包括在20-40psi的压力下以及以每秒30000至50000个精细胞的速度引导所述流体通过直径为50至70微米的喷嘴孔。
NN5.NN1所述的方法还包括在颗粒穿过所述光束之前在颗粒上施加作用力以将它们带到所需取向。
NN6.NN5所述的方法,其中,所述精细胞具有头部,所述头部具有宽面和窄边,并且其中,所述所需取向是射束击打所述宽面的方向。
NN7.NN6所述的方法,其中,所述流体输送步骤包括通过喷嘴引导所述流,并且所述方法还包括使得所述喷嘴围绕所述喷嘴的纵向轴线转动以调节相对于射束轴线的所述所需细胞取向。
NN8.NN1所述的方法还包括将所述射束以斑点的形式聚焦在流体流上,所述斑点的形状基本为椭圆形,并且其具有沿着相对于流体流的方向基本以直角延伸的长轴的长度和沿着基本平行于流体流的方向延伸的短轴的宽度,所述宽度小于穿过斑点的精细胞的头部的长度。
NN9.NN8所述的方法,其中,所述精细胞的所述头包括在流体流的方向上具有长度的DNA区域,并且所述光束斑点宽度小于所述DNA区域的长度。
NN10.NN5所述的方法,其中,步骤(d)包括至少使得所述第一液滴偏转。
NN11.NN1所述的方法,还包括引导所述发射的至少一些通过包括空间滤光器的过滤系统,所述空间滤光器具有长度和宽度尺寸的孔,至少一个所述尺寸可调节以改变所述孔的尺寸。
NN12.NN1所述的方法,还包括沿向上的、非竖直轨迹引导所述流体流。
NN13.NN1所述的方法还包括产生都包含精细胞的多个独立的流体流,并且对于每一个这种流体流,执行步骤(a)、(b)、(c)和(d)。
NN13A.NN13所述的方法还包括使用公共激光束照射所述流体流。
NN14.NN13所述的方法,其中,所述流体流包含来自于公共流体供应的流体。
NN15.NN1所述的方法,其中,所述流体流通过毛细管被输送到所述第一位置。
OO.具有外照射光学系统的精细胞分析器
OO1.一种通过染色体DNA特征分类动物精细胞的设备,所述设备包括:
用于将包含精细胞的流体流输送到第一位置并且用于在细胞到达所述第一位置之前在精细胞上施加作用力以将它们带到所需取向的喷嘴系统;
外照射光学系统,所述外照射光学系统沿着在所述第一位置在非零的入射角下与所述流体流相交的射束轴线在向前的方向上引导电磁辐射的激光束以使所述细胞穿过光束,导致电磁辐射在向后的方向上沿着所述射束轴线从被引导的细胞发出;
光检测器,所述光检测器用于检测和将所述辐射发射的至少一些转换成表示所述DNA特征的电信号;以及
用于处理所述电信号并根据所述DNA特征对细胞分类的处理器。
OO2.OO1所述的设备,其中,所述喷嘴系统是液滴细胞分拣系统的一部分。
OO3.OO1所述的设备,其中,所述喷嘴系统是光破坏细胞分拣系统的一部分。
OO4.OO1所述的设备,其中,所述喷嘴系统是流体切换细胞分拣系统的一部分。
OO5.OO1所述的设备,其中,所述光学系统还包括在所述聚焦透镜后面的胜诉射束轴线上的光检测器,所述光检测器用于检测和将辐射发射的至少一些转换成表示所述DNA特征的电信号。
OO6.OO1所述的设备,其中,所述流式细胞术设备包括喷嘴,所述喷嘴具有这样构造的内表面,即,能够在细胞穿过所述光束之前在细胞上施加作用力以将它们带到所需取向。
OO7.OO6所述的设备,其中,所述喷嘴可围绕所述喷嘴的纵向轴线转动以调节相对于射束轴线的所述所需细胞取向。
OO8.OO1所述的设备,其中,所述射束轴线在所述第一位置处在相对于所述流的纵向轴的斜入射角下与所述流体流相交。
OO9.OO1所述的设备,其中,所述射束在所述第一位置处以斑点的形式被所述光学系统聚焦在流体流上,所述斑点的形状基本为椭圆形,并且其具有沿着相对于流体流的方向基本以直角延伸的长轴的长度和沿着基本平行于流体流的方向延伸的短轴的宽度,所述宽度小于穿过斑点的精细胞的头部的长度。
OO10.OO1所述的设备,其中,所述精细胞的所述头包括在流体流的方向上具有长度的DNA区域,并且所述光束斑点宽度小于所述DNA区域的长度。
OO11.OO1所述的设备,其中,所述流式细胞术设备包括多个流式细胞术单元,所述多个流式细胞术单元用于并行地同时分析多个流体流,每一个流式细胞术单元包括所述外照射光学系统。
OO12.OO1所述的设备,其中,所述喷嘴系统包括喷嘴,所述喷嘴被取向为沿向上、非竖直的方向引导所述流体流。
OO13.OO1所述的设备,其中,所述光学系统仅包括用于检测所述发射的一个光检测器。
OO14.OO1所述的设备,其中,所述流式细胞术设备包括具有喷嘴孔的喷嘴,以及从所述喷嘴孔处延伸的毛细管,所述流体流通过所述喷嘴孔被输送到所述第一位置。
OO15.OO14所述的设备,其中,所述第一位置位于所述毛细管的内部。
OO16.OO15所述的设备,其中,所述光学系统与所述毛细管光学地连接从而将所述射束传输到流过所述管的所述流中。
PP.使用外照射光学系统分析精细胞的方法
PP1.一种通过染色体DNA特征对动物精细胞进行分类的方法,所述方法包括下列步骤:
(a)用于将包含精细胞的流体流输送到第一位置并且在流到达所述第一位置之前在精细胞上施加作用力以将它们带到所需取向;
(b)沿着在所述第一位置与所述流体流相交的射束轴线在向前的方向上以与所述流成非零的入射角引导电磁辐射束以使所述细胞穿过射束,导致电磁辐射在向后的方向上沿着所述射束轴线从被引导的细胞发出;
(c)检测所述辐射的至少一些并且将所述辐射的至少一些转换成表示所述DNA特征的电信号;以及
(d)处理所述电信号和根据所述DNA特征对细胞进行分类。
PP2.PP1所述的方法,还包括根据所述DNA特征分拣细胞。
PP3.PP1所述的方法,还包括使用光破坏分拣处理以分拣所述细胞。
PP4.PP1所述的方法,还包括使用流体切换分拣处理以分拣所述细胞。
PP5.PP1所述的方法,还包括使用液滴分拣处理以分拣所述细胞。
PP6.PP1所述的方法,其中,步骤(a)包括在20-40psi的压力下以及以每秒30000至50000个精细胞的速度引导所述流体通过直径为50至70微米的喷嘴孔。
PP7.PP1所述的方法,还包括在精细胞穿过所述光束之前在精细胞上施加作用力以将它们带到所需取向。
PP8.PP7所述的方法,其中,所述精细胞具有头部,所述头部具有宽面和窄边,并且其中,所述所需取向是射束击打所述宽面的方向。
PP9.PP8所述的方法,其中,所述流体输送步骤包括通过喷嘴引导所述流,并且所述方法还包括使得所述喷嘴围绕所述喷嘴的纵向轴线转动以调节相对于射束轴线的所述所需细胞取向。
PP10.PP1所述的方法还包括将所述射束以斑点的形式聚焦在流体流上,所述斑点的形状基本为椭圆形,并且其具有沿着相对于流体流的方向基本以直角延伸的长轴的长度和沿着基本平行于流体流的方向延伸的短轴的宽度,所述宽度小于穿过斑点的精细胞的头部的长度。
PP11.PP10所述的方法,其中,所述精细胞的所述头包括在流体流的方向上具有长度的DNA区域,并且所述光束斑点宽度小于所述DNA区域的长度。
PP12.PP1所述的方法,还包括引导所述发射的至少一些通过包括空间滤光器的过滤系统,所述空间滤光器具有长度和宽度尺寸的孔,至少一个所述尺寸可调节以改变所述孔的尺寸。
PP13.PP1所述的方法,还包括沿向上的、非竖直轨迹引导所述流体流。
PP14.PP1所述的方法还包括产生都包含精细胞的多个独立的流体流,并且对于每一个这种流体流,执行步骤(a)、(b)、(c)和(d)。
PP15.PP14所述的方法还包括使用公共激光束照射所述流体流。
PP16.PP14所述的方法,其中,所述流体流包含来自于公共流体供应的流体。
PP17.PP1所述的方法,其中,所述流体流通过毛细管被输送到所述第一位置。
QQ.具有斜入射角外照射光学系统的颗粒分析器
QQ1.用于分析包含在流体流中的颗粒的设备,包括:
用于沿着射束轴线在向前的方向上引导电磁辐射束的外照射光学系统,所述射束轴线在相对于所述流体流的纵向轴的斜入射角下与所述流体流相交;
所述外照射光学系统包括所述射束轴线路径上的用于以斑点的形式将电磁辐射的射束聚焦在流体流上的聚焦透镜,所述颗粒适于穿过所述斑点,导致电磁辐射在向后的方向上沿着所述射束轴线从被引导的颗粒发出;以及
在聚焦透镜后面的光检测器,所述光检测器用于检测和将来自于所述DNA区域的辐射发射的至少一些转换成待处理的电信号以获得与所述颗粒有关的信息。
QQ2.QQ1所述的设备,其中,所述入射角在5至45度的范围内。
QQ3.QQ1所述的设备,其中,所述入射角在15至30度的范围内。
QQ4.QQ1所述的设备,其中,所述颗粒是细胞,并且所述信息涉及所述细胞的DNA特征。
QQ5.QQ1所述的设备,其中,所述颗粒是精细胞,所述信息涉及所述细胞的X/Y染色体DNA特征。
QQ6.QQ5所述的设备,还包括喷嘴系统,用于引导所述流体流并且用于在所述流穿过所述光束之前在精细胞上施加作用力以将它们带到所需取向。
QQ7.QQ1所述的设备,其中,所述喷嘴系统包括喷嘴,并且所述射束在距离所述喷嘴不到1.0mm的位置处击打所述流体流。
QQ8.QQ1所述的设备,还包括用于根据所述信息分拣所述颗粒的液滴细胞分拣系统。
QQ9.QQ1所述的设备,还包括用于根据所述信息分拣所述颗粒的光破坏细胞分拣系统。
QQ10.QQ1所述的设备,还包括用于根据所述信息分拣所述颗粒的流体切换细胞分拣系统。
RR.使用斜外照射光学系统分析颗粒的方法
RR1.用于分析包含在流体流中的颗粒的方法,包括:
沿着射束轴线在向前的方向上引导电磁辐射束,所述射束轴线在相对于所述流体流的纵向轴的斜入射角下与所述流体流相交;
以斑点的形式将电磁辐射的射束聚焦在流体流上,所述颗粒适于穿过所述斑点,导致电磁辐射在向后的方向上沿着所述射束轴线从被引导的颗粒发出;
检测和将来自于所述DNA区域的辐射发射的至少一些转换成表示颗粒特征的电信号;以及
处理所述电信号以获得与所述特征有关的信息。
RR2.RR1(增加与QQ2等相似的权利要求)
SS.具有外照射光学系统和椭圆形斑点焦点的细胞分析器
SS1.一种分析在流体流中的细胞的DNA特征的设备,所述每一个细胞包括在流体流的方向上具有一定长度的DNA区域,所述设备包括:
用于沿着射束轴线在向前的方向上引导电磁辐射束以使射束与所述流体流相交的外照射光学系统;
所述光学系统包括在所述射束轴线上的聚焦透镜,所述聚焦透镜以基本椭圆形斑点的形式将射束聚焦在流体流上,并且所述斑点具有沿着相对于流体流的方向基本以直角延伸的长轴的长度和沿着基本平行于流体流的方向延伸的短轴的宽度,射束斑点的宽度小于所述DNA区域的长度,所述细胞适于穿过所述斑点,导致电磁辐射在向后的方向上沿着所述射束轴线从被引导的细胞发出,包括从表示所述DNA特征的所述DNA区域发射;
在聚焦透镜后面的光检测器,所述光检测器用于检测和将来自于所述DNA区域的辐射发射的至少一些转换成表示所述DNA特征的电信号;以及
用于处理所述电信号、确定所述DNA特征和根据所述DNA特征对细胞分类的系统。
SS2.SS1所述的设备,其中,所述斑点宽度小于3.0微米。
SS3.SS2所述的设备,其中,所述斑点长度大于80微米。
SS4.SS1所述的设备,其中,所述细胞是精细胞并且所述DNA特征表示精细胞的性别。
SS5.SS1所述的设备,还包括喷嘴系统,用于在所述流穿过所述光束之前在所述流中的细胞上施加作用力以将它们带到所需取向。
SS6.SS1所述的设备,还包括用于根据所述DNA特征分拣所述颗粒的液滴细胞分拣系统。
SS7.SS1所述的设备,还包括用于根据所述DNA特征分拣所述颗粒的光破坏细胞分拣系统。
SS8.SS1所述的设备,还包括用于根据所述DNA特征分拣所述颗粒的流体切换细胞分拣系统。
SS9.一种分析在具有流动方向的流体流中的动物精细胞的染色体DNA特征的设备,所述每一个精细胞具有带核的头部,所述核包括包含至少一个染色体的局部染色体区域,所述核在流体流的方向上具有一定长度,所述设备包括:
用于以基本椭圆形斑点的形式将电磁辐射束聚焦在流体流上的光学系统,所述斑点具有沿着相对于流体流的方向基本以直角延伸的长轴的长度和沿着基本平行于流体流的方向延伸的短轴的宽度,射束斑点的宽度小于所述核的长度,所述精细胞适于穿过所述斑点,导致电磁辐射从精细胞发出,包括从表示所述区域的染色体特征的所述染色体区域发出的辐射;
光检测器,所述光检测器用于检测来自于所述染色体区域的辐射发射的至少一些和将来自于所述染色体区域的辐射发射的至少一些转换成表示所述染色体特征的电信号;以及
用于处理所述电信号、确定所述染色体特征和根据所述染色体特征对精细胞分类的处理器。
SS10.SS9所述的设备,其中,所述染色体特征表示精细胞的性别。
SS11.SS10所述的设备,其中,所述精细胞是牛的精细胞。
SS12.SS10所述的设备,其中,所述染色体区域位于在核的纵向中心的任何一侧上延伸不大于核长度的20%的核的区域内。
SS13.SS10所述的设备,其中,所述染色体区域位于在核的纵向中心的任何一侧上延伸不大于核长度的10%-15%的核的区域内。
SS14.SS9所述的设备,还包括模拟数字转换器,用于对随时间变化的输出进行同步采样并且提供包括对应于所述随时间变化的模拟输出的数字信息的输出,其中所述随时间变化的模拟输出和相应的数字信息表示所述所述染色体特征;并且所述处理器包括分析和分类所述数字信息的数字信号处理器。
SS15.SS9所述的设备,其中,所述斑点宽度小于3.0微米。
SS16.SS15所述的设备,其中,所述斑点长度大于80微米。
SS17.SS9所述的设备,还包括喷嘴系统,用于在所述流穿过所述光束之前在所述流中的精细胞上施加作用力以将它们带到所需取向。
SS18.SS9所述的设备,还包括用于根据所述染色体DNA特征分拣所述精细胞的液滴细胞分拣系统。
SS19.SS9所述的设备,还包括用于根据所述染色体DNA特征分拣所述精细胞的光破坏细胞分拣系统。
SS20.SS9所述的设备,还包括用于根据所述染色体DNA特征分拣所述精细胞的流体切换细胞分拣系统。
TT.使用外照射光学系统和椭圆形斑点焦点分析细胞的方法
TT1.一种分析在流体流中的细胞的DNA特征的方法,每一个细胞包括在流体流的方向上具有一定长度的DNA区域,所述方法包括:
沿着射束轴线在向前的方向上引导电磁辐射束以使射束与所述流体流相交;
以基本椭圆形斑点的形式将所述电磁辐射束聚焦在流体流上,并且所述斑点具有沿着相对于流体流的方向基本以直角延伸的长轴的长度和沿着基本平行于流体流的方向延伸的短轴的宽度,射束斑点的宽度小于所述DNA区域的长度,所述细胞适于穿过所述斑点,导致电磁辐射在向后的方向上沿着所述射束轴线从被引导的细胞发出;
检测和将所述辐射发射转换成表示所述DNA特征的电信号;以及
处理所述电信号,包括在从精子头部的DNA区域发射辐射的电信号和精细胞的其它区域发射辐射的电信号之间的微分,以及
根据所述DNA特征对细胞分类。
TT2.TT1所述的方法,其中,所述细胞是精细胞。
TT3.TT1所述的方法,还包括在所述流穿过所述光束之前在所述流中的细胞上施加作用力以将它们带到所需取向。
TT4.TT1所述的方法,还包括根据所述DNA特征液滴分拣所述细胞。
TT5.TT1所述的方法,还包括根据所述DNA特征光破坏分拣所述细胞。
TT6.TT1所述的方法,还包括根据所述DNA特征流体切换分拣所述细胞。
TT7.一种分析在具有流动方向的流体流中的动物精细胞的染色体DNA特征的方法,所述每一个精细胞具有带核的头部,所述核包括包含至少一个染色体的局部染色体区域,所述核在流体流的方向上具有一定长度,所述方法包括:
用于以基本椭圆形斑点的形式将电磁辐射束聚焦在流体流上,所述斑点具有沿着相对于流体流的方向基本以直角延伸的长轴的长度和沿着基本平行于流体流的方向延伸的短轴的宽度,射束斑点的宽度小于所述核的长度,所述精细胞适于穿过所述斑点,导致电磁辐射从精细胞发出,包括从表示所述区域的染色体特征的所述染色体区域发出的辐射;
检测来自于所述染色体区域的辐射发射的至少一些和将来自于所述染色体区域的辐射发射的至少一些转换成表示所述染色体特征的电信号;
处理所述电信号、包括确定所述染色体特征;和
根据所述染色体特征对精细胞分类。
TT8.TT7所述的方法,其中,所述染色体特征表示精细胞的性别。
TT9.TT8所述的方法,其中,所述精细胞是牛的精细胞。
TT10.TT8所述的方法,其中,所述染色体区域位于在核的纵向中心的任何一侧上延伸不大于核长度的20%的核的区域内。
TT11.TT10所述的方法,其中,所述染色体区域位于在核的纵向中心的任何一侧上延伸不大于核长度的10%-15%的核的区域内。
TT12.TT7所述的方法,其中,所述电信号包括随时间变化模拟输出,并且还包括用于对随时间变化的输出进行同步采样并且提供包括对应于所述随时间变化的模拟输出的数字信息的输出,其中所述随时间变化的模拟输出和相应的数字信息表示所述所述染色体特征;并且所述处理包括分析所述数字信息;其中所述分类包括分类所述模拟数字信息。
TT13.TT7所述的方法,其中,所述斑点宽度小于3.0微米。
TT14.TT13所述的方法,其中,所述斑点长度大于180微米。
TT15.TT7所述的方法,还包括在所述流穿过所述光束之前在所述流中的精细胞上施加作用力以将它们带到所需取向。
TT16.TT7所述的方法,还包括根据所述染色体DNA特征液滴分拣所述精细胞。
TT17.TT7所述的方法,还包括根据所述染色体DNA特征光破坏分拣所述精细胞。
TT18.TT7所述的方法,还包括根据所述染色体DNA特征流体切换分拣所述精细胞。
UU.仅具有一个光检测器的精细胞分拣器
UU1.一种根据细胞的染色体DNA特征对精细胞进行分类和分拣的设备,所述设备包括:
用于将包含精细胞的流体流输送到第一位置并且使流在第二位置分裂成液滴的喷嘴系统,所述喷嘴系统包括喷嘴,所述喷嘴具有这样构造的内表面,即,能够在细胞到达所述第一位置之前在细胞上施加作用力以将它们带到所需取向;
光学系统,所述光学系统引导电磁辐射在所述第一位置与流体流相交以使流中的细胞穿过所述射束,导致电磁辐射从细胞发出;
仅一个用于检测所述辐射的至少一些并且将所述辐射的至少一些转换成电信号的光检测器;以及
根据所述DNA特征对细胞进行分类和根据被包含在液滴中的细胞的分类分拣所述液滴的系统。
UU2.UU1所述的设备,其中,所述光学系统是外照射系统。
VV.定向喷嘴
VV1.一种用在通过染色体含量在流体流中分拣动物精细胞的流式细胞术设备中的喷嘴,所述喷嘴包括:
具有内表面和所述流体流适于流过的孔的喷嘴主体;
所述喷嘴的所述内表面包括用于在朝向所述喷嘴孔的下游方向上使得所述流体流的速度逐渐增加的第一、第二和第三轴向锥形区域,所述区域中的至少两个具有在不同方向上定向的基本为椭圆形的横截面形状以在所述流体流上施加扭力以趋于将精细胞带到所需取向。
VV2.VV1所述的喷嘴,其中,所述至少两个区域中的一个的基本为椭圆形的横截面形状以相对于所述至少两个区域中的另一个的基本为椭圆形的横截面形状成90度定向。
VV3.VV2所述的喷嘴,其中,第一和第二区域的所述基本为椭圆形的横截面形状以基本相同方向定向以限定第一扭转区域,并且构成第二扭转区域的第三区域的所述基本为椭圆形的横截面形状以相对于第一和第二区域的所述基本为椭圆形的横截面形状成90度定向。
VV4.VV3所述的喷嘴,其中,所述第一扭转区域具有3.0-4.5mm的轴向长度,所述第二扭转区域具有3.5-5.0mm的轴向长度。
VV5.VV1所述的喷嘴,其中,所述第三区域在42-48的角度下逐渐变细。
VV6.VV1所述的喷嘴,其中,所有所述区域具有基本为椭圆形的横截面形状。
VV7.VV1所述的喷嘴,其中,所述喷嘴主体具有其上带有非反射涂层的外表面。
VV8.VV1所述的喷嘴,还包括用于将所述喷嘴安装在朝上的位置以沿着向上的轨迹引导所述流体流的安装座。
VV9.VV1所述的喷嘴,其中,所述喷嘴主体可在所述主体的纵向轴线上在所述安装座上转动。
WW.定向精细胞的方法
WW1.一种用于在流式细胞术设备中为动物精细胞定向的方法,所述方法包括:
将包含精细胞的流体引入到流体流中;
在20至40psi的范围内的压力下引导包含所述精细胞的流体流通过喷嘴,所述喷嘴具有一个或者多个用于在朝向喷嘴孔的下游方向上增加所述流体流的速度的锥形区域,所述喷嘴孔的直径在50至70微米的范围内,所述区域的一个或者多个具有基本为椭圆形的横截面形状以细胞以每秒30000至50000个精细胞的范围内的速度通过所述孔时在所述流体流上施加扭力以趋于将精细胞带到所需取向。
WW2.WW1所述的方法,其中,所述喷嘴具有三个或者多个用于使得流体流朝向喷嘴孔逐渐加速的锥形区域。
WW3.WW2所述的方法,其中,所述喷嘴在所述三个或者多个锥形区域中具有由喷嘴的内表面限定的两个扭转区域。
WW4.WW3所述的方法,其中,所述喷嘴具有通过所述孔的流动轴,所述喷嘴的内表面的至少一些具有基本为椭圆形的横截面形状,它们围绕所述轴线相对于彼此转动。
WW5.WW1所述的方法,还包括沿向上、非竖直轨迹引导所述流体流。
WW6.WW1所述的方法,还包括在引导所述流的同时使得所述喷嘴主体在所述主体的中央纵向轴上转动。
XX.具有向上指示喷嘴的颗粒分拣器
XX1.一种用于使用流式细胞术分拣颗粒的设备,包括:
用于沿向上、非竖直轨迹通过喷嘴孔输送包含所述颗粒的流体流的喷嘴系统;
光学系统,所述光学系统引导电磁辐射的射束在所述第一位置与流体流相交,导致电磁辐射从颗粒中发出;
用于检测所述辐射的至少一些并且将所述辐射的至少一些转换成表示所述颗粒特征的电信号的光检测器;
用于处理所述电信号并根据所述特征分类所述颗粒的处理器;以及
用于根据所述颗粒的分类分拣所述颗粒的系统。
XX2.XX1所述的设备,其中,所述分拣系统包括液滴分拣系统。
XX3.XX1所述的设备,其中,所述分拣系统包括光破坏分拣系统。
XX4.XX1所述的设备,其中,所述分拣系统包括流体切换分拣系统。
XX5.XX1所述的设备,其中,所述喷嘴系统包括其上具有非反射涂层的喷嘴。
XX6.XX1所述的设备,其中,喷嘴孔处的所述向上的轨迹是处于偏离水平方向的5-85度范围内的角度下。
XX7.XX1所述的设备,其中,喷嘴孔处的所述向上的轨迹是处于偏离水平方向的15-75度范围内的角度下。
XX8.XX1所述的设备,其中,喷嘴孔处的所述向上的轨迹是处于偏离水平方向的30-65度范围内的角度下。
XX9.XX1所述的设备,其中,喷嘴孔处的所述向上的轨迹是处于偏离水平方向的45-60度范围内的角度下。
YY.使用向上指示喷嘴分拣颗粒的方法
YY1.一种使用流式细胞术分拣颗粒的设备,包括:
沿向上、非竖直轨迹通过喷嘴孔将包含所述颗粒的流体流输送到第一位置;
引导电磁辐射的射束在所述第一位置与流体流相交,导致电磁辐射从颗粒中发出;
检测所述辐射的至少一些并且将所述辐射的至少一些转换成表示所述颗粒特征的电信号;
处理所述电信号并根据所述特征分类所述颗粒;以及
根据所述颗粒的分类分拣所述颗粒。
YY2.YY1所述的方法,其中,所述分拣步骤包括使用液滴分拣处理进行分拣。
YY3.YY1所述的方法,其中,所述分拣步骤包括使用光破坏分拣处理进行分拣。
YY4.YY1所述的方法,其中,所述分拣步骤包括使用流体切换分拣处理进行分拣。
ZZ.处理参数
ZZ1.一种使用流式细胞术设备从细胞的混合物中分离所需细胞群组的方法,所述群组具有光线可检测特征,所述方法包括:
在20至40psi的范围内的压力下引导包含所述细胞的流体流以每秒30000至50000个细胞的范围内的细胞速度通过喷嘴孔,所述喷嘴孔的直径在50至70微米的范围内;
使得所述流体流在20到100KHz的频率下分裂为液滴;以及
使用流式细胞术分拣所述液滴以便于从细胞的混合物中分离所述所需细胞群组。
ZZ2.ZZ1所述的方法,其中,所述细胞是精细胞。
ZZ3.ZZ2所述的方法,其中,所述所需细胞群组包含活X细胞。
AAA.商业方法
AAA1.一种包括处理其中具有细胞的精液的经商方法,所述方法包括:
获得精液的供应;
使用可编程机器执行多个集成流式细胞术操作,所述操作包括:(a)接受精液的所述供应;(b)形成包含所述细胞的多个流;以及(c)将所述细胞分拣于具有特征A的第一细胞群组和包含具有特征B的第二细胞群组中;以及
分配第一或第二群组以用于商业用途。
AAA2.AAA1所述的方法,其中,所述细胞是精细胞,并且特征A表示活X精细胞。
AAA3.AAA2所述的方法,其中,所述精液为牛精液,并且作为用在人工受精牛方面出售所述第一群组。
AAA4.AAA3所述的方法,其中,所述可编程机器用于并行地执行所述操作。
BBB.商业方法
BBB1.一种包括处理其中具有细胞的精液样本的经商方法,所述方法包括:
获得精液的供应;
使用可编程机器执行多个集成流式细胞术操作,所述操作包括:(a)接受精液的所述供应;以及(b)从所述供应的最初部分中将所述细胞分拣于不同群组中,所述群组包括包含具有特征A细胞的第一群组和包含具有特征B细胞的第二群组;以及
仅在从所述最初部分中最初分拣的细胞满足或超过预设标准时,从所述供应的剩余部分中将所述细胞分拣于不同组中,所述组包括包含具有特征A细胞的第一组和具有特征B细胞的第二组。
BBB2.BBB1所述的方法,还包括分配第一或第二群组以用于商业用途。
BBB3.BBB1所述的方法,其中,所述预设标准是具有特征A或特征B的细胞的最小回收率或者所述群组中至少一个的最小纯度。
BBB4.BBB1所述的方法,还包括并行地执行所述多个集成操作流式细胞术。
CCC.商业方法
CCC1.一种包括处理其中具有细胞的精液样本的经商方法,所述方法包括:
获得精液的供应;
使用机器执行多个集成流式细胞术操作,所述操作包括:(a)接受精液的所述供应;以及(b)从所述供应的第一部分中将所述细胞分拣于不同群组中,所述群组包括包含具有特征A细胞的第一群组和包含具有特征B细胞的第二群组,以及从所述供应的第二部分中将所述细胞分拣于不同群组中,所述群组包括包含具有特征A细胞的第一群组和包含具有特征B细胞的第二群组,
将第一部分的一个群组与第二部分的一个群组相混合以获得混合群组。
CCC2.CCC1所述的方法,其中,第一部分的第一群组具有不可接受的纯度,第二部分的第一群组具有可接受的纯度,并且混合群组具有可接受的纯度。
DDD.液滴干扰分拣W/外照射
DDD1.一种用于根据染色体DNA特征分拣精细胞的液滴干扰系统,包括:
流式细胞术设备,用于将包含所述细胞的流体流输送到第一位置并且使得所选择的流体流的流部分在第二位置处被来自于液滴干扰流体流的液滴击打,从而将所选择的部分和包含于其中的细胞与所述流体流相分离,所述流式细胞术设备用于根据所述DNA特征分类所述细胞以及根据包含在所述流部分中的细胞的分类分拣所述流部分,
所述流式细胞术设备包括外照射光学系统,所述外照射光学系统包括聚焦透镜、所述光学系统可沿着在所述第一位置与流体流相交的射束轴线在向前的方向上引导激光束穿过所述聚焦透镜以使所述细胞穿过光束,导致电磁辐射在向后的方向上沿着所述射束轴线从被引导的细胞发出。
DDD2.DDD1所述的系统,其中,所述光学系统还包括所述聚焦透镜后部的所述射束轴线上的光检测器,用于检测和将所述辐射发射转换成表示所述DNA特征的电信号。
DDD3.DDD1所述的系统,其中,所述细胞是精细胞并且所述DNA特征包括所述精细胞的性染色体含量。
DDD4.DDD3所述的系统,其中,所述射束在所述第一位置处以斑点的形式被所述光学系统聚焦在流体流上,所述斑点的形状基本为椭圆形,并且其具有沿着相对于流体流的方向基本以直角延伸的长轴的长度和沿着基本平行于流体流的方向延伸的短轴的宽度,所述宽度小于穿过斑点的精细胞的头部的长度。
DDD5.DDD4所述的系统,其中,所述精细胞的头部包括具有在流体流的方向上的长度的DNA区域,并且所述光束斑点的宽度小于所述DNA区域的长度。
DDD6.DDD1所述的系统,其中,所述流式细胞术设备还包括喷嘴,所述喷嘴具有这样构造的内表面,即,能够在细胞穿过所述光束之前在细胞上施加作用力以将它们带到所需取向。
DDD7.DDD6所述的系统,其中,所述喷嘴可围绕所述喷嘴的纵向轴线转动以调节相对于射束轴线的所述所需颗粒取向。
DDD8.DDD1所述的系统,其中,所述流式细胞术设备包括用于同时分析多个流体流的多个流式细胞术单元,每个流式细胞术单元都包括所述外照射光学系统。
DDD9.DDD1所述的系统,其中,所述光学系统仅包括一个用于检测所述发射的光检测器。
DDD10.DDD1所述的系统,其中,所述流式细胞术设备包括具有喷嘴孔的喷嘴,以及从所述喷嘴孔处延伸的毛细管,所述流体流通过所述喷嘴孔被输送到所述第一位置。
DDD11.DDD10所述的系统,其中,所述第一位置位于所述毛细管的内部。
DDD12.DDD11所述的系统,其中,所述光学系统与所述毛细管光学地连接从而将所述射束传输到流过所述管的所述流中。
A′.低温贮藏
a.(加入低温保护剂之后冷却)
A1′.一种低温贮藏精细胞的方法,包括以下步骤:
将低温保护剂加入到一定量精细胞中;
将所述量的精细胞和所述低温保护剂冷却到约0-8℃范围内的保温温度;
使得所述精细胞和所述低温保护剂在所述保温温度下保持小于60分钟的时间;以及
将所述一定量精细胞过度冷却到-40℃的温度。
A2′.A1′所述的方法,其中,所述保温温度在约2-6℃范围内。
A3′.A1′所述的方法,其中,所述保温温度在约4-5℃范围内。
A4′.A1′所述的方法,其中,加入低温保护剂的步骤包括加入丙三醇。
A5′.A1′所述的方法,其中,加入低温保护剂的步骤包括加入约6%的丙三醇(v/v)。
A6′.A1′所述的方法,其中,所述保温周期小于40分钟。
A7′.A1′所述的方法,其中,所述保温周期为约30分钟。
A8′.A1′所述的方法,其中,所述冷却步骤包括在基本恒定的冷却速度下冷却所述一定量精细胞。
A9′.A8′所述的方法,其中,所述冷却速度被选择得使得所述一定量精细胞在约90分钟内从高于玻璃转换温度的温度冷却到保温温度,在所述玻璃转换温度下所述精细胞会受到冷冲击的损害。
A10′.A8′所述的方法,其中,所述基本恒定的冷却速度在每分钟0.1-0.3℃的范围内。
A11′.A8′所述的方法,其中,所述基本恒定的冷却速度在每分钟0.15-0.25℃的范围内。
A12′.A11′所述的方法,其中,所述保温周期的长度小于40分钟。
A13′.A1′所述的方法,其中,使用可编程冷冻器执行所述冷却步骤以便于在可编程速度下冷却所述精细胞。
A14′.A13′所述的方法,其中,所述保温周期的长度小于40分钟。
A15′.A14′所述的方法,其中,编程的冷却速度包括约每分钟0.2℃的恒定冷却速度。
A16′.A1′所述的方法,其中,过度冷却所述一定量精细胞的步骤包括在第一冷却速度下将精细胞冷却到接近临界温度区的温度,在所述临界温度区冰晶形成和渗透压力方面的改变损害精细胞,以及在比第一冷却速度快的第二冷却速度下将精细胞冷却到低于-30℃的温度。
A17′.A16′所述的方法,其中,所述第一冷却速度在每分钟1-5℃的范围内。
A18′.A16′所述的方法,其中,所述第一冷却速度在每分钟2-4℃的范围内。
A19′.A16′所述的方法,其中,所述第一冷却速度为每分钟3℃。
A20′.A16′所述的方法,其中,所述第二冷却速度在每分钟8-12℃的范围内。
A21′.A16′所述的方法,其中,所述第二冷却速度约为每分钟10℃。
A22′.A16′所述的方法,其中,所述精细胞在所述第一冷却速度下被冷却到约-15℃的温度下。
A23′.A22′所述的方法,其中,所述精细胞在所述第二冷却速度下从约-15℃被冷却到约-80℃的温度下。
A24′.A16′所述的方法,其中,所述精细胞在所述第一冷却速度下被冷却到约-18℃的温度下。
A25′.A24′所述的方法,其中,所述精细胞在所述第二冷却速度下从约-18℃被冷却到约-80℃的温度下。
A26′.A16′所述的方法,其中,所述精细胞在所述第一速度和所述第二速度下在可编程冷冻器中被冷却。
A27′.A1′所述的方法,其中,向一定量精细胞中加入低温保护剂的步骤包括向鞘流中加入低温保护剂并且使用用于分析精细胞的流式细胞器中的所述鞘流。
A28′.A27′所述的方法,还包括使用所述流式细胞器以便于将所述精细胞分拣于具有所需特征的精细胞群组中以获得所述一定量的精细胞的步骤。
A29′.A1′所述的方法,其中,冷却所述一定量的精细胞、将所述精细胞保持在保温温度下以及过度冷却所述一定量的精细胞的步骤全部在小于220分钟内完成。
A30′.A1′所述的方法,其中,冷却所述一定量的精细胞、将所述精细胞保持在保温温度下以及过度冷却所述一定量的精细胞的步骤全部在小于190分钟内完成。
A31′.A1′所述的方法,其中,冷却所述一定量的精细胞、将所述精细胞保持在保温温度下以及过度冷却所述一定量的精细胞的步骤全部在小于150分钟内完成。
A32′.A1′所述的方法,还包括在已将低温保护剂加入到所述一定量的精细胞中之后将所述一定量的精细胞放入到人工受精麦杆中的步骤。
A33′.A1′所述的方法,其中,所述一定量的精细胞构成第一量精细胞,所述方法还包括以下步骤:从流式细胞器中中获得包含多于500×106精细胞的已分拣精细胞群组,从而获得包含所述第一量精细胞的多量的精细胞、将所述多量的精细胞中的每个放入到人工受精麦杆中、以及在批处理中在所述多量的精细胞中的每个上执行冷却、保持和过度冷却的步骤以获得一批包含低温储藏精细胞的人工受精麦杆。
A34′.A33′所述的方法,其中,所述分拣精细胞群组包含多于800×106精细胞。
A35′.A33′所述的方法,其中,所述方法的步骤在小于240分钟内完成。
A36′.A33′所述的方法,其中,所述方法的步骤在小于210分钟内完成。
A37′.A33′所述的方法,其中,所述方法的步骤在小于170分钟内完成。
A38′.A1′所述的方法,还包括在所述冷却步骤之前用DNA选择性荧光染料为所述一定量的精细胞着色。
A39′.A38′所述的方法,其中,所述DNA选择性荧光染料包括Hoechst33342。
A40′.A39′所述的方法,其中,为所述一定量的精细胞着色的步骤包括在超过40℃的温度下在包含Hoechst33342的溶液中培育所述一定量的精细胞一定时间周期。
b.冷却温度分拣
A41′.一种低温贮藏精细胞的方法,包括以下步骤:
将一定量的精细胞冷却到约0-8℃范围内的保温温度;
向所述一定量的精细胞中加入低温保护剂;以及
使得所述精细胞和所述低温保护剂在所述保温温度下保持小于60分钟的时间。
A42′.A41′所述的方法,其中,所述周期在约30分钟到小于60分钟的范围内。
A43′.A41′所述的方法,其中,加入低温保护剂的步骤包括加入丙三醇。
A44′.A41′所述的方法,其中,加入低温保护剂的步骤包括加入约7%的丙三醇(v/v)。
B′.具有挡板的喷嘴
B1′.一种用于分析在流体流中的颗粒的流式细胞术设备中的喷嘴,所述流体流包括包围包含所述颗粒的芯流的鞘流,所述喷嘴包括:
喷嘴,所述喷嘴具有为所述流体流限定流动路径的内表面和用于使得流体流从喷嘴排出的孔;以及
在喷嘴中的在所述孔上游位于所述流动路径中的挡板,所述挡板能够在流体流沿着所述流动路径移动时使流体流偏转,
所述挡板和喷嘴的内表面被构成得适于当颗粒离开孔时使得颗粒处于所需取向。
B2′.B1′所述的喷嘴,其中,所述挡板被构成得用于远离喷嘴的中心纵向轴线和朝向喷嘴的所述内表面偏转所述芯流。
B3′.B1′所述的喷嘴,其中,所述喷嘴具有位于所述挡板上游的第一横截面流动区域和所述挡板处的不同于所述第一横截面流动区域的第二横截面流动区域。
B4′.B3′所述的喷嘴,其中,所述第二横截面流动区域小于所述第一横截面流动区域。
B5′.B3′所述的喷嘴,其中,所述第一和第二横截面流动区域具有不同形状。
B6′.B5′所述的喷嘴,其中,所述第二横截面流动区域通常为半圆形的。
B7′.B1′所述的喷嘴,其中,所述喷嘴的所述内表面适于在所述挡板的下游限定至少两个轴向锥形区域,所述锥形区域用于在朝向喷嘴孔的下游方向上逐渐增加所述流体流的速度。
B8′.B7′所述的喷嘴,其中,所述挡板朝向喷嘴的所述内表面中限定所述至少两个轴向锥形区域中的至少一个的一部分偏转所述芯流。
B9′.B8′所述的喷嘴,其中,所述至少两个轴向锥形区域具有在不同方向上定向的基本为椭圆形的横截面形状以在所述流体流上施加扭力以趋于将颗粒带到所需取向。
B10′.B9′所述的喷嘴,其中,所述至少两个区域中一个的所述基本为椭圆形的横截面形状相对于所述至少两个区域中另一个的所述基本为椭圆形的横截面形状在约90度下取向。
B11′.B1′所述的喷嘴,其中,所述喷嘴具有其上带有非反射涂层的外表面。
B12′.B1′所述的喷嘴,还包括用于将所述喷嘴安装在朝上的位置以沿着向上的轨迹引导所述流体流的安装座。
B13′.B13′所述的喷嘴,其中,所述喷嘴可在所述喷嘴的纵向轴线上在所述安装座上转动。
B14′.B1′所述的喷嘴,其中,所述挡板包括用于偏转所述流体流的挡板元件和用于将所述挡板元件固定在所述喷嘴中的固定位置中的固定器。
B15′.B14′所述的喷嘴,其中,所述挡板元件包括挡板。
B16′.B15′所述的喷嘴,其中,所述挡板具有基本相对于所述流体流横向延伸的第一支脚和基本沿所述流体流的方向延伸的第二支脚。
B17′.B15′所述的喷嘴,其中,所述固定器包括容纳所述挡板并且布置在所述喷嘴中的基本圆柱形的外壳。
B18′.B16′所述的喷嘴,其中,所述喷嘴的所述内表面在所述挡板的下游具有基本为椭圆形横截面的区域,并且所述挡板元件的第一和第二支脚沿基本与所述基本为椭圆形横截面的长轴平行的线相交。
B19′.B16′所述的喷嘴,其中,所述喷嘴的所述内表面在所述挡板的下游具有基本为椭圆形横截面的区域,并且所述挡板元件的第一和第二支脚沿基本与所述基本为椭圆形横截面的长轴垂直的线相交。
B20′.B15′所述的喷嘴,其中,所述挡板基本垂直于所述喷嘴的纵向轴。
B21′.B20′所述的喷嘴,其中,所述挡板具有半圆形形状。
B22′.B20′所述的喷嘴,其中,所述挡板具有半椭圆形形状。
B23′.B20′所述的喷嘴,其中,所述喷嘴的内表面被构成得限定出侧翼,并且所述固定器包括能够将所述挡板压制在所述侧翼上以将所述挡板保持在所需位置中的O形密封件件。
B24′.B20′所述的方法,其中,所述挡板固定器将所述挡板保持在位置中,其中所述挡板横断所述喷嘴的纵向轴。
B25′.B1′所述的喷嘴,其中,所述颗粒包括精细胞。
C′.具有挡板的喷嘴(方法)
C1′.一种用于在流式细胞术设备中为颗粒定向的方法,所述方法包括:
使得具有包含所述颗粒的样本流体的芯流和包围所述芯流的鞘流体的鞘流的流体流流过喷嘴,所述喷嘴具有从喷嘴的上游部分到位于喷嘴的下游端的孔减缩的内表面;以及
当芯流流过喷嘴时偏转芯流以使得芯流中的颗粒受到流体动力的作用趋于使得颗粒呈现所需取向。
C2′.C1′所述的方法,其中,所述喷嘴具有纵向轴线,偏转芯流的步骤包括远离纵向轴线朝向所述内表面偏转所述芯流。
C3′.C1′所述的方法,其中,所述喷嘴具有纵向轴线,偏转芯流路径的步骤包括将芯流从通常与纵向轴线共中心的路径中偏转到偏转路径,至少一部分偏转路径远离所述喷嘴的纵向轴线。
C4′.C1′所述的方法,其中,所述喷嘴具有纵向轴线,所述方法还包括在偏离纵向轴线的位置处将所述芯流引入到所述鞘流中。
C5′.C1′所述的方法,其中,所述偏转步骤包括利用挡板偏转芯流。
C6′.C1′所述的方法,其中,所述偏转步骤包括利用挡板偏转芯流并且使用挡板固定器将所述挡板保持在所述喷嘴中的位置中。
C7′.C1′所述的方法,其中,所述挡板横断所述喷嘴的纵向轴。
C8′.C1′所述的方法,其中,所述喷嘴具有形状适于限定至少一个使得颗粒受到定向流体动力的作用的扭转区域的内表面。
C9′.C8′所述的方法,其中,所述至少一个扭转区域包括具有基本为椭圆形横截面的渐缩区域。
C10′.C8′所述的方法,其中,所述内表面被构成得用于限定多个扭转区域。
C11′.C10′所述的方法,其中,每个所述多个扭转区域都包括具有基本为椭圆形横截面的喷嘴的渐缩区域。
C12′.C11′所述的方法,其中,第一所述多个扭转区域的基本为椭圆形横截面沿与第二所述多个扭转区域的基本为椭圆形横截面不同的方向取向。
C13′.C1′所述的方法,其中,所述偏转芯流的步骤包括利用挡板偏转芯流,所述方法还包括使得流体流流过第一横截面流动区域之后从第一横截面流动区域下游流过第二横截面流动区域的步骤,其中所述第一和第二横截面流动区域具有不同的形状。
C14′.C1′所述的方法,其中,第二横截面流动区域的形状小于第一横截面流动区域。
D′.具有不对称注射针的喷嘴(设备)
D1′.一种用于分析在流体流中的颗粒的流式细胞计数器中的喷嘴系统,所述流体流包括包围包含所述颗粒的芯流的鞘流,所述喷嘴系统包括:
具有纵向轴线的喷嘴、限定所述流体流的流动路径的内表面、以及用于使得所述流体流从所述喷嘴中排出的所述喷嘴下游端处的孔,所述内表面的形状被构成得用于限定至少一个包括具有基本为椭圆形横截面的轴向渐缩区域的扭转区域,用于当所述流体流朝向所述孔流过扭转区域时使得颗粒处于所需取向;以及
从颗粒源到喷嘴的导管,所述导管被布置得在相对于所述喷嘴的纵向轴线偏离的位置处将所述芯流引入到喷嘴中。
D2′.D1′所述的喷嘴系统,其中,所述位置为所述至少一个扭转区域的上游。
D3′.D1′所述的喷嘴系统,其中,所述至少一个扭转区域构成第一扭转,所述喷嘴还包括第二扭转区域。
D4′.D3′所述的喷嘴系统,其中,所述位置为第一扭转区域的上游和第二扭转区域的至少一部分。
D5′.D3′所述的喷嘴系统,其中,所述第二扭转区域包括具有基本为椭圆形横截面的喷嘴的轴向渐缩区域。
D6′.D5′所述的喷嘴系统,其中,所述第一扭转区域的基本为椭圆形横截面的长轴沿不同于所述第二扭转区域的基本为椭圆形横截面的长轴的方向取向。
D7′.D6′所述的喷嘴系统,其中,所述第一扭转区域的基本为椭圆形横截面在相对于所述第二扭转区域的基本为椭圆形横截面约90度的角度下取向。
D8′.D7′所述的喷嘴系统,其中,所述位置为第一扭转区域的上游和第二扭转区域的至少一部分。
E′.不对称样本引入(方法)
E1′.一种用于在流式细胞计数器中取向颗粒的方法,包括:
使得鞘流流过具有纵向轴线的喷嘴和包括具有基本为椭圆形横截面的喷嘴的轴向渐缩区域的至少一个扭转区域;以及
在偏离所述纵向轴线的位置处将包含颗粒的芯流体流引入到鞘流体流中以便于鞘流体流和芯流体流流过至少一个扭转区域。
E2′.E1′所述的方法,其中,使得流体流流过至少一个扭转区域的步骤包括使得芯流沿流动路径流动,一部分所述流动路径偏离所述喷嘴的纵向轴线,并且在所述颗粒沿所述流动路径的所述偏离部分移动的同时使得所述颗粒受到所述扭转区域所产生的流体动力定向力。
E3′.E1′所述的方法,其中,所述至少一个扭转区域构成第一扭转区域,所述方法还包括使得所述鞘流体流和芯流体流流过第二扭转区域以便于沿所需定向取向所述颗粒的步骤。
E4′.E3′所述的方法,其中,所述第二扭转区域包括具有基本为椭圆形横截面区域的喷嘴中的渐缩区域。
E5′.E4′所述的方法,其中,所述第一扭转区域的基本为椭圆形横截面区域的长轴沿不同于所述第二扭转区域的基本为椭圆形横截面区域的长轴的方向取向。
E6′.E4′所述的方法,其中,所述第一扭转区域的基本为椭圆形横截面区域垂直于于所述第二扭转区域的基本为椭圆形横截面区域。
F′.通过二级离心分离进行的已分拣精细胞的浓缩
F1′.一种处理动物精细胞的方法,包括下列步骤:
从雄性动物收集精细胞;
基于一个或者多个特定DNA特征将精细胞分拣到多个精细胞群组中的一个中;
从所述多个精细胞群组中的一个获得具有所需DNA特征的一定量精细胞,所述量的精细胞被包含在一定量的收集流体中;
使得所述一定量的收集流体受到第一离心分离处理以形成第一精细胞丸和覆盖第一丸的上层清液;
使得第一丸与上层清液分离;
使得上层清液经受附加的离心分离以在第一离心分离后形成保留在上层清液中的第二精细胞丸;以及
将一定量的再悬浮流体加入到第一和第二丸以获得具有所需DNA特征的精细胞的悬浮液,选择所述再悬浮流体的量以在悬浮液中形成所需浓度的精细胞。
F2′.F1′所述的方法,其中,所述第一离心分离处理包括在足以产生550-800g范围内的重力的速度下进行离心分离。
F3′.F2′所述的方法,其中,所述第一离心分离处理包括在所述速度下对所述量的收集流体进行7-10分钟的周期离心分离。
F4′.F1′所述的方法,其中,所述一个或多个特定DNA特征包括所述精细胞是否包含X或者Y性别染色体。
F5′.F1′所述的方法,还包括获得具有所需DNA特征的多个量的精细胞以及通过商业流通系统分配所述多个量的精细胞。
G′.利用低压力的过滤
G1′.一种处理动物精细胞的方法,包括下列步骤:
从雄性动物收集精细胞;
分拣精细胞以获得具有所需特征的一定量的精细胞,所述一定量的被分拣的精细胞被包含在其中具有精细胞第一浓度的第一体积的流体中;以及
使得精细胞经受浓缩步骤,其中所述精细胞的浓度增加到大于所述第一浓度的第二浓度;
其中,所述浓缩步骤包括使得所述第一体积的流体的至少一部分流过第一过滤器,其中作用在第一过滤器上的压力差小于20英寸汞柱,所述过滤器具有足够小以阻止所述精细胞通过的过滤孔,并且保持包含所述精细胞的第二体积的未过滤的流体。
G2′.G1′所述的方法,其中,在所述流动期间作用在过滤器上的压力差基本是恒定的。
G3′.G1′所述的方法,还包括在一定周期内间歇地减小压力差之后基本恢复压力差的步骤。
G4′.G3′所述的方法,其中,减小压力差的步骤包括将所述压力差减小到零的步骤。
G5′.G1′所述的方法,其中,所述过滤孔具有0.2-1.0微米范围内的尺寸。
G6′.G1′所述的方法,其中,约所述第一体积的流体的80%到90%流过第一过滤器。
G7′.G1′所述的方法,其中,所述第二体积的未过滤流体足以避免所述精细胞粘结在所述第一过滤器上。
G8′.G1′所述的方法,还包括使得所述第二体积的未过滤流体的至少一部分流过具有用以抑制所述精细胞通过的足够小的过滤孔的第二过滤器、保留包含所述精细胞的第三体积的未过滤流体、以及用再悬浮流体冲刷所述第二过滤器以从第二过滤器上去除精细胞,以将所述第三体积达到所述第二浓度。
G9′.G8′所述的方法,其中,约所述第二体积的未过滤流体的80%流过第二过滤器。
G10′.G8′所述的方法,其中,所述第三体积的未过滤流体足以避免所述精细胞粘结在所述第二过滤器上。
G11′.G8′所述的方法,其中,所述第二过滤器是具有50-500微米的范围内厚度的薄过滤器。
G12′.G8′所述的方法,其中,所述第二过滤器是具有75-250微米的范围内厚度的薄过滤器。
G13′.G8′所述的方法,其中,所述第二过滤器是具有100-150微米的范围内厚度的薄过滤器。
G14′.G1′所述的方法,其中,所述第一过滤器是具有50-500微米的范围内厚度的薄过滤器。
G15′.G1′所述的方法,其中,所述第一过滤器是具有75-250微米的范围内厚度的薄过滤器。
G16′.G1′所述的方法,其中,所述第一过滤器是具有100-150微米的范围内厚度的薄过滤器。
H′.总温度控制(高温着色)
H1′.一种用于处理精细胞的方法,包括以下步骤:
从雄性动物收集包含精细胞的精液样本;
将所述精液样本输送到精细胞处理厂;
在精液上执行初始质量控制检查;
利用DNA选择性荧光染料使得所述精液样本中的精细胞着色,通过将所述精细胞暴露于所述DNA选择性荧光染料以形成着色混合物,并使得所述着色混合物经受约至少40℃的温度而使得所述DNA选择性荧光染料选择性地粘结于精细胞的DNA上;
使用流式细胞计数器根据特定DNA特征分拣精细胞;
获得悬浮在一定体积流体中具有所需DNA特征的一定量的精细胞;
通过执行浓度处理调节所述悬浮液中精细胞的浓度以获得所需浓度;以及
使得所述一定量的精细胞过度冷却。
H2′.H1′所述的方法,还包括从收集所述精细胞到开始着色步骤的时间内将精细胞的温度保持在20-37℃的范围内并且在所述时间内隔离所述精细胞以避免出现温度波动。
H3′.H2′所述的方法,其中,隔离所述精细胞的步骤包括在输送到处理厂期间将精液样本保存在绝热容器中。
H4′.H1′所述的方法,还包括在将所述着色精细胞引入到所述流式细胞计数器中以便于从分拣步骤开始之前的着色期间所述精细胞所达到的温度下冷却所述精细胞之前,将所述着色精细胞放置在具有18-25℃范围内的温度环境中的步骤。
H5′.H1′所述的方法,其中,所述过度冷却步骤包括将精细胞从超过20℃的温度冷却到0-8℃范围内的温度下,并且在所述精细胞的温度已被冷却到20℃下之前向所述精细胞中加入蛋白质源和低温保护剂。
H6′.H5′所述的方法,还包括使用可编程冷冻器以便于:(a)将所述精细胞冷却到约0-8C范围内的保温温度;(b)使得所述精细胞在所述保温温度下保持小于60分钟的时间以允许精细胞基本与所述低温保护剂均衡;(c)在第一冷却速度下将所述精细胞冷却到接近临界温度区的温度下,在所述临界温度区冰晶形成和渗透压力方面的改变损害精细胞,以及(d)在比第一冷却速度快的第二冷却速度下通过所述临界温度区冷却精细胞。
H7′.H6′所述的方法,还包括在所述第一冷却速度下将所述精细胞从保温温度冷却到约-15℃。
H8′.H7′所述的方法,还包括在所述第二冷却速度下将所述精细胞从约-18℃冷却到约-30℃。
H9′.H6′所述的方法,还包括在所述第一冷却速度下将所述精细胞从保温温度冷却到约-18℃。
H10′.H6′所述的方法,还包括使用可编程冷冻器以便于在每分钟0.1-0.3℃范围内的冷却速度下将所述精细胞冷却到所述保温温度。
H11′.H10′所述的方法,还包括使用可编程冷冻器以便于在每分钟1-5℃的所述第一速度下将所述精细胞从所述保温温度冷却到约-15℃的温度。
H12′.H6′所述的方法,还包括使用可编程冷冻器以便于在每分钟8-12℃的所述第二冷却速度下将所述精细胞从约-18℃的温度冷却到至少约-30℃。
H13′.H12′所述的方法,还包括使用可编程冷冻器以便于在每分钟1-5℃的所述第一冷却速度下将所述精细胞从所述保温温度冷却到至少约-15℃的温度。
H14′.H6′所述的方法,其中,将所述精细胞保持在所述保温温度下30分钟。
H15′.H1′到H14′中任意一项所述的方法,其中,所述着色混合物还包括抗氧化剂。
H16′.H15′所述的方法,其中,所述抗氧化剂是从包含丙酮酸盐、维他命K、硫辛酸及其组合的组中选择出来的。
H17′.H1′或H5′到H16′中任意一项所述的方法,还包括在将所述着色精细胞引入到所述流式细胞计数器中之前,将所述着色精细胞放置在具有至少37℃的温度的环境中。
H18′.H1′或H5′到H16中任意一项所述的方法,还包括在将所述着色精细胞引入到所述流式细胞计数器中之前,将所述着色精细胞放置在具有至少40℃的温度的环境中。
H19′.H1′所述的方法,其中,获得一定量精细胞的步骤包括在至少每秒钟5,000精细胞的速度下获得具有所述所需DNA特征的活精细胞群组。
H20′.H19′所述的方法,其中,所述群组的所述纯度至少为85%。
J′.总温度控制(没有高温着色)
J1′.一种用于处理精细胞的方法,包括以下步骤:
从雄性动物收集包含精细胞的精液样本;
将所述精液样本输送到精细胞处理厂;
在精液上执行初始质量控制检查;
利用DNA选择性荧光染料使得所述精液样本中的精细胞着色;
使用流式细胞计数器分拣精细胞以获得具有所需DNA特征的一个或多个精细胞群组;
获得悬浮在流体中具有所需DNA特征的一定量的精细胞;
调节悬浮液中所述一定量精细胞的浓度以获得具有所需DNA特征的精细胞的所需浓度;
在所述一定量精细胞具有超过玻璃转换温度时向具有所述所需特征的精细胞中加入低温保护剂,其中在所述玻璃转换温度下所述精细胞会受到冷冲击的损害;
将所述一定量的精细胞和低温保护剂冷却到约0-8℃的保温温度;
使得所述一定量的精细胞和所述低温保护剂在所述保温温度下保持小于60分钟的时间;以及
将所述一定量精细胞过度冷却到-40℃的温度。
J2′.J1′所述的方法,其中,在所述一定量精细胞具有超过20℃的温度时加入所述低温保护剂。
J3′.J1′所述的方法,其中,在流式细胞计数器中分拣所述着色精细胞之前,将所述着色精细胞放置在具有20-25℃范围内的温度环境中。
J4′.J1′所述的方法,还包括使用可编程冷冻器在第一冷却速度下将所述精细胞从保温温度冷却到接近临界温度区的温度下,在所述临界温度区冰晶形成和渗透压力方面的改变损害精细胞,之后在比所述第一冷却速度快的第二冷却速度下通过所述临界温度区冷却所述一定量精细胞。
J5′.J1′所述的方法,其中,保持所述一定量精细胞的步骤包括将所述精细胞保持在所述保温温度下小于40分钟的时间周期。
J6′.J1′所述的方法,其中,保持所述一定量精细胞的步骤包括将所述精细胞保持在所述保温温度下小于30分钟的时间周期。
J7′.J1′到J6′中任意一项所述的方法,其中,所述着色步骤还包括向所述精细胞中加入抗氧化剂。
J8′.J7′所述的方法,其中,所述抗氧化剂是从包含丙酮酸盐、维他命K、硫辛酸及其组合的组中选择出来的。
J9′.J1′所述的方法,其中,获得一定量精细胞的步骤包括在至少每秒钟5,000精细胞的速度下获得具有所述所需DNA特征的活精细胞群组。
J10′.J9′所述的方法,其中,所述精细胞的群组的所述纯度至少为85%。
K′.总温度控制(冷着色)
K1′.一种用于处理精细胞的方法,包括以下步骤:
从雄性动物收集包含精细胞的精液样本;
将所述精液样本输送到精细胞处理厂;
在所述精液样本上执行初始质量控制检查;
在执行精细胞的任何实质性稀释之前将所述精细胞冷却到约0-8℃的温度;
形成包含精细胞和DNA选择性染料的混合物并且使得所述混合物经殳约0-8℃的温度以便于为精细胞着色;
使用流式细胞计数器分拣精细胞以获得具有所需DNA特征的一个或多个精细胞群组;
获得悬浮在流体中具有所需DNA特征的一定量的精细胞;
调节悬浮液中所述一定量精细胞的浓度以获得具有所需DNA特征的精细胞的所需浓度;
在所述一定量精细胞中加入低温保护剂;
将所述一定量的精细胞和低温保护剂保持在约0-8℃范围内的保温温度下约30分钟到3小时;以及
将所述一定量精细胞过度冷却到低于40℃的温度。
K2′.K1′所述的方法,还包括在所述处理期间的任何时间基本避免暖化所述细胞的步骤。
K3′.K1′所述的方法,其中,将所述精细胞冷却到约0-8℃范围内的温度下的步骤包括将容纳所述精细胞的容器放置在基本与所述预冷却精细胞相同温度的水槽中并且将所述水槽放置在具有低于8℃的温度的环境中。
K4′.K3′所述的方法,其中,所述冷却步骤还包括当所述精细胞冷却时监测所述精细胞的温度并且在所述精细胞已被冷却到小于10℃时向水槽中加入冰。
K5′.K1′所述的方法,其中,所述保持周期在1-2小时的范围内。
K6′.K1′所述的方法,其中,所述保持周期在约90分钟的范围内。
K7′.K1′所述的方法,其中,所述保持周期在约30分钟到小于60分钟的范围内。
K8′.K1′所述的方法,其中,过度冷却所述一定量精细胞的步骤包括使用可编程冷冻器在第一冷却速度下将所述精细胞从保温温度冷却到接近临界温度区的温度下,在所述临界温度区冰晶形成和渗透压力方面的改变损害精细胞,之后在比所述第一冷却速度快的第二冷却速度下通过所述临界温度区冷却所述一定量精细胞。
K9′.K1′所述的方法,其中,加入低温保护剂的步骤包括加入丙三醇。
K10′.K1′所述的方法,其中,加入低温保护剂的步骤包括加入约7%的丙三醇(v/v)。
K11′.K1′所述的方法,其中,获得一定量精细胞的步骤包括在至少每秒钟5,000精细胞的速度下获得具有所述所需DNA特征的活精细胞群组。
K12′.K11′所述的方法,其中,所述精细胞的群组的所述纯度至少为85%。
L′.收集系统(设备)
L1′.一种收集系统,用于收集由液滴分拣流式细胞计数器所分拣的液滴流,所述液滴分拣流式细胞计数器产生沿包括水平分量的轨迹移动的液滴流,所述系统包括用于当所述液滴沿所述轨迹移动时截取所述流中的液滴的截取装置,以及布置得用于收集所截取的液滴的收集容器。
L2′.L1′所述的收集系统,其中,所述截取装置包括设置得横过所述轨迹的冲击表面,所述液滴适于撞击在所述冲击表面上。
L3′.L2′所述的收集系统,其中,所述冲击表面被设置得在所述液滴具有向上加速度分量的位置处横过所述轨迹。
L4′.L2′所述的收集系统,其中,至少一些所述液滴包含颗粒并且所述冲击表面被涂以用于在与所述冲击表面撞击时减小对于所述颗粒的损坏的物质。
L5′.L4′所述的收集系统,其中,所述物质包括从包含蛋黄、牛血清蛋白和磷酸盐缓冲盐水的组中选择出来的一种或多种物质。
L6′.L4′所述的收集系统,其中,所述颗粒是精细胞。
L7′.L2′所述的收集系统,其中,所述截取装置被构成得用于将所述所截取的液滴引导到所述收集容器。
L8′.L7′所述的收集系统,其中,所述截取装置包括位于所述冲击表面下面的导向器,用于将所述液滴向下引导到所述收集容器。
L9′.L7′所述的收集系统,其中,所述截取装置包括限定所述冲击表面并且具有用于使得沿所述轨迹移动的液滴进入到所述包络线中已撞击所述冲击表面的入口窗的中空包络线。
L10′.L1′所述的收集系统,其中,所述液滴流构成第一液滴流、所述截取装置构成第一截取装置、所述收集容器构成第一收集容器、并且所述细胞计数器还产生沿不同于所述第一轨迹的第二轨迹移动的第二液滴流,所述收集系统还包括用于截取沿第二轨迹移动的第二液滴的第二截取装置和用于收集由所述第二截取装置截取的液滴的第二收集容器。
L11′.L10′所述的收集系统,其中,所述第一截取装置中具有所述第二流适于从中穿过的窗,并且所述第二截取装置被布置在所述第一截取装置后面用于截取穿过所述窗的所述第二流中的液滴。
L12′.L10′所述的收集系统,其中,所述第二截取装置被构成得用于将第二流中的所述被截取的液滴引导到第二收集容器。
L13′.L1′所述的收集系统,其中,所述液滴包含颗粒,所述收集系统还包括涂在所述截取装置的冲击表面上以减少在冲击时对于所述颗粒的损坏的物质。
L14′.L13′所述的收集系统,其中,所述颗粒包含活精细胞。
L15′.L13′所述的收集系统,其中,所述物质包括从由包含蛋黄、牛血清蛋白和磷酸盐缓冲盐水的组中选择出来的一种物质。
L16′.L1′所述的收集系统与布置得用于将液滴流引导到所述截取装置的流式细胞计数器相组合。
M′.收集系统(方法)
M1′.一种用于收集由液滴分拣流式细胞计数器所分拣的液滴流,所述液滴分拣流式细胞计数器产生沿包括水平分量的轨迹移动的液滴流,所述方法包括以下步骤:
当所述液滴沿所述轨迹移动时截取所述液滴;以及
将所述截取的液滴收集在第一收集容器中。
M2′.M1′所述的方法,其中,所述收集步骤包括将所述截取的液滴引导到所述第一收集容器中。
M3′.M2′所述的方法,其中,所述截取步骤包括在所述液滴具有向上加速度分量的位置处横过所述轨迹设置冲击表面。
M4′.M3′所述的方法,还包括调节所述冲击表面的位置以适应不同的液滴轨迹。
M5′.M1′所述的方法,其中,所述流式细胞计数器产生沿各自的第一和第二轨迹移动的第一和第二液滴流,每个轨迹都具有水平分量,所述方法还包括当其沿所述第二轨迹移动时截取所述第二流中的所述液滴,以及将第二流的所述截取的液滴收集在第二收集容器中。
M6′.M5′所述的方法,其中,所述第一和第二轨迹基本位于同一个平面中。
M7′.M5′所述的方法,其中,所述第一流中的液滴通过在所述液滴具有向上加速度分量的位置处横过所述第一轨迹布置第一冲击表面被截取,所述第二流中的液滴通过在所述液滴具有向上加速度分量的位置处横过所述第二轨迹布置第二冲击表面被截取。
M8′.M7′所述的方法,其中,所述第二冲击表面被布置在不同于所述第一冲击表面的海拔高度处。
M9′.M1′所述的方法,其中,所述液滴包含颗粒并且截取所述液滴的步骤包括使用截取装置截取所述液滴,所述方法还包括使得所述截取装置与合成物相接触以减小对于所述颗粒的损坏。
M10′.M9′所述的方法,其中,所述颗粒包括活精细胞。
M11′.M10′所述的方法,其中,所述合成物包括从包含蛋黄、牛血清蛋白和磷酸盐缓冲盐水的组中选择出来的一种物质。
M12′.M10′所述的方法,其中,使得所述截取装置与合成物相接触的步骤包括将所述截取装置浸泡在所述合成物中一段周期,所述周期足以使得所述合成物由所述截取装置吸收和/或黏附于所述截取装置。
M13′.M12′所述的方法,其中,所述周期在约30-90分钟的范围内。
M14′.M13′所述的方法,其中,所述周期在约30-60分钟的范围内。
M15′.M14′所述的方法,其中,所述周期约为60分钟。
M16′.M10′-M15′所述的方法,其中,将所述液滴收集在收集容器中,所述方法还包括使得所述收集容器与合成物相接触以减小对于所述颗粒的损坏。
M17′.M16′所述的方法,其中,使得所述收集容器与合成物相接触以减小对于所述颗粒的损坏的步骤包括使得所述收集容器与用于接触所述截取装置相同的合成物相接触。
M18′.M16′所述的方法,其中,使得所述收集容器与合成物相接触以减小对于所述颗粒的损坏的步骤包括将所述收集容器浸泡在所述合成物中一段周期,所述周期足以使得所述合成物由所述收集容器吸收和/或黏附于所述收集容器。
M19′.M18′所述的方法,其中,所述周期在约30-90分钟的范围内。
M20′.M18′所述的方法,其中,所述周期约为60分钟。
N′.增效组合
a.多通道FCM(具有分拣策略)
Na1′.一种处理动物精细胞的方法,包括以下步骤:
利用流式细胞术基于一个或者多个特定DNA特征将精细胞分拣成不同的精细胞群组中,所述流式细胞术包括:将包含精细胞的样本流体输送到多个流式细胞术单元,每一个流式细胞术单元基于所述一个或者多个DNA特征分拣精细胞;操作所述单元同时共享一个集成平台,所述集成平台包括下列元件中的至少一个:(1)精细胞的公共供给;(2)电磁辐射的公共源;(3)公共壳体;(4)用于控制单元操作的公共输入;(5)用于接收和处理来自于单元的信息以对一个单元相对于另一个单元的操作进行评估的公共处理器;以及(6)用于将包含所述精细胞的流体输送到所述流式细胞术单元的公共流体输送系统;以及
作为下列因素至少一个的函数改变输送流体的速度,这些因素包括:(1)具有所需DNA特征的第一分拣的精细胞群组的纯度;以及(2)在第二分拣群组中的具有所述所需DNA特征的精细胞量。
Na2′.Na1′所述的方法还包括并行地操作所述流式细胞术单元。
Na3′.Na1′所述的方法,其中,所述一个或者多个特定DNA特征包括精细胞是否包含X或Y性别染色体。
b.具有数字处理的多通道FCM
Nb1′.一种处理动物精细胞的方法,包括下列步骤:
利用流式细胞术基于一个或者多个特定DNA特征将精细胞分拣成不同的精细胞群组中,所述流式细胞术包括:将包含精细胞的样本流体输送到多个流式细胞术单元,每一个流式细胞术单元基于所述一个或者多个DNA特征分拣精细胞;操作所述单元同时共享一个集成平台,所述集成平台包括下列元件中的至少一个:(1)精细胞的公共供给;(2)电磁辐射的公共源;(3)公共壳体;(4)用于控制单元操作的公共输入;(5)用于接收和处理来自于单元的信息以对一个单元相对于另一个单元的操作进行评估的公共处理器;以及(6)用于将包含所述精细胞的流体输送到所述流式细胞术单元的公共流体输送系统;以及
利用一个或者多个模拟数字转换器对来自于每一个流式细胞术单元的随时间变化的输出进行同步采样并且提供包括对应于所述随时间变化的模拟输出的数字信息的输出,其中所述随时间变化的模拟输出和相应的数字信息表示所述特定DNA特征。
Nb2′.Nb1′所述的方法,其中,所述一个或者多个特定DNA特征包括精细胞是否具有X或Y性别染色体。
c.多通道FCM(w/高温着色)
Nc1′.一种处理动物精细胞的方法,包括下列步骤:
形成包含精细胞和DNA选择性荧光染料的着色混合物,以及使得着色混合物经受至少40℃的温度;以及
利用流式细胞术基于一个或者多个特定DNA特征将精细胞分拣成不同的精细胞群组中,所述流式细胞术包括:将包含精细胞的样本流体输送到多个流式细胞术单元,每一个流式细胞术单元基于所述一个或者多个DNA特征分拣精细胞;操作所述单元同时共享一个集成平台,所述集成平台包括下列元件中的至少一个:(1)精细胞的公共供给;(2)电磁辐射的公共源;(3)公共壳体;(4)用于控制单元操作的公共输入;(5)用于接收和处理来自于单元的信息以对一个单元相对于另一个单元的操作进行评估的公共处理器;以及(6)用于将包含所述精细胞的流体输送到所述流式细胞术单元的公共流体输送系统。
Nc2′.Nc1′所述的方法,其中,所述染料是UV激发或可见光激发染料。
Nc3′.Nc2′所述的方法,其中,所述染料是从由二苯甲亚胺、SYBR-14和其变体、类似物或衍生物构成的组中选择出来的。
Nc4′.Nc1′-Nc3′中的任意一项所述的方法,其中,所述着色混合物经历这样一种时间周期,所述时间周期足以使得所述染料粘结DNA以使得可根据荧光分别分拣X和Y精细胞。
Nc5′.Nc4′所述的方法,其中,所述时间周期在1-160分钟的范围内。
Nc6′.Nc1′-Nc5′中的任意一项所述的方法,其中,所述着色混合物还包括抗氧化剂。
Nc7′.Nc1′所述的方法,其中,所述一个或者多个特征包括精细胞是否包含X或Y性别染色体。
d.多通道(具有快速低温储藏)
Nd1′.一种处理动物精细胞的方法,包括以下步骤:
利用流式细胞术基于一个或者多个特定DNA特征将精细胞分拣成不同的精细胞群组中,所述流式细胞术包括:将包含精细胞的样本流体输送到多个流式细胞术单元,每一个流式细胞术单元基于所述一个或者多个DNA特征分拣精细胞;操作所述单元同时共享一个集成平台,所述集成平台包括下列元件中的至少一个:(1)精细胞的公共供给;(2)电磁辐射的公共源;(3)公共壳体;(4)用于控制单元操作的公共输入;(5)用于接收和处理来自于单元的信息以对一个单元相对于另一个单元的操作进行评估的公共处理器;以及(6)用于将包含所述精细胞的流体输送到所述流式细胞术单元的公共流体输送系统;
从一个或者多个分拣的精细胞群组获得具有所需DNA特征的一定量的精细胞;
将低温保护剂加入到所述一定量的精细胞;
将所述一定量的精细胞和低温保护剂冷却到约0-8℃的保温温度;
使得所述精细胞和所述低温保护剂在所述保温温度下保持小于60分钟的时间;以及
将所述一定量精细胞过度冷却到-40℃的温度。
Nd2′.Nd1′所述的方法,其中,加入低温保护剂的步骤包括加入丙三醇。
Nd3′.Nd1′所述的方法,其中,所述一个或者多个特定DNA特征包括精细胞是否具有X或Y性别染色体。
Nd4′.Nd1′所述的方法,其中,将所述一定量精细胞冷却到所述保温温度的步骤包括使用被选择得在约90分钟内将所述一定量精细胞从高于玻璃转换温度的温度冷却到保温温度的冷却速度,在所述玻璃转换温度下所述精细胞会受到冷冲击的损害。
Nd5′.Nd4′所述的方法,其中,所述冷却速度是每分钟0.1-0.3℃的范围内的基本恒定的冷却速度。
Nd6′.Nd1′所述的方法,其中,过度冷却所述一定量精细胞的步骤包括在第一冷却速度下将精细胞冷却到接近临界温度区的温度,在所述临界温度区冰晶形成和渗透压力方面的改变损害精细胞,以及在比第一冷却速度快的第二冷却速度下将精细胞冷却到低于-30℃的温度。
Nd7′.Nd1′所述的方法,还包括:
形成包含精细胞和DNA选择性荧光染料的着色混合物,以及使得着色混合物经受至少40℃的温度。
e.分拣策略(具有高温着色)
Ne1′.一种处理动物精细胞的方法,包括下列步骤:
形成包含精细胞和DNA选择性荧光染料的着色混合物,以及使得着色混合物经受至少40℃的温度;
将包含精细胞的所述着色混合物的流体流输送到第一位置并且使得所述流在第二位置分裂成液滴,所述液滴包括每个都包含一个或者多个具有所需性别染色体的精细胞的第一液滴、每个都包含一个或者多个具有非所需性别染色体的精细胞的第二液滴以及每个都包含一个或者多个具有所需性别染色体的精细胞和一个或者多个具有非所需性别染色体的精细胞的第三液滴;
从所述第二和第三液滴分拣所述第一液滴;
收集所述第一液滴以提供至少一个具有所需性别染色体的精细胞的群组;
确定所述至少一个群组中具有所需性别染色体的精细胞的量;以及
以作为所确定的在所述至少一个群组中的具有所需性别染色体的精细胞的量相对于在所述第一、第二和第三液滴中的具有所需性别染色体的精细胞的总量的函数改变流体被输送到所述第一位置的速度。
Ne2′.一种处理动物精细胞的方法,包括下列步骤:
形成包含精细胞和DNA选择性荧光染料的着色混合物,以及使得着色混合物经受至少40℃的温度;
将包含精细胞的所述着色混合物的流体流输送到第一位置并且使得所述流在第二位置分裂成液滴,所述液滴包括每个都包含一个或者多个具有所需性别染色体的精细胞的第一液滴、每个都包含一个或者多个具有非所需性别染色体的精细胞的第二液滴以及每个都包含一个或者多个具有所需性别染色体的精细胞和一个或者多个具有非所需性别染色体的精细胞的第三液滴;
从所述第二液滴分拣所述第一和第三液滴;
收集所述第一和第三液滴以提供至少一个具有所需性别染色体的精细胞的群组;
确定所述至少一个群组中具有非所需性别染色体的精细胞的量;以及
以作为所确定的在所述至少一个群组中的具有非所需性别染色体的精细胞的量的函数改变流体被输送到所述第一位置的速度。
f.高温着色(w/快速低温储藏)
Nf1′.一种处理动物精细胞的方法,包括下列步骤:
形成包含精细胞和DNA选择性荧光染料的着色混合物,以及使得着色混合物经受至少40℃的温度;
基于特定DNA特征将分拣所述着色混合物中的所述精细胞;
获得具有所需DNA特征的一定量的精细胞;
将低温保护剂加入到所述一定量的精细胞;
将所述一定量的精细胞和低温保护剂冷却到约0-8℃的保温温度;
使得所述精细胞和所述低温保护剂在所述保温温度下保持小于60分钟的时间;以及
将所述一定量精细胞过度冷却到-40℃的温度。
Nf2′.Nf1′所述的方法,其中,加入低温保护剂的步骤包括加入丙三醇。
Nf3′.Nf1′所述的方法,其中,所述特定FNA特征为精细胞是否包含X或Y性别染色体。
Nf4′.Nf1′所述的方法,其中,冷却所述一定量精细胞的步骤包括使用被选择得在约90分钟内将所述一定量精细胞冷却到约0-8℃的冷却速度。
Nf5′.Nf4′所述的方法,其中,所述冷却速度是每分钟0.1-0.3℃的范围内的基本恒定的冷却速度。
Nf6′.Nf1′所述的方法,其中,过度冷却所述一定量精细胞的步骤包括在第一冷却速度下将精细胞冷却到接近临界温度区的温度,在所述临界温度区冰晶形成和渗透压力方面的改变损害精细胞,以及在比所述第一冷却速度快的第二冷却速度下将精细胞冷却到低于-30℃的温度。
g.多重组合
Ng1′.(高温着色/多通道分拣/快速低温储藏)
一种处理动物精细胞的方法,包括下列步骤:
形成包含精细胞和DNA选择性荧光染料的着色混合物,以及使得着色混合物经受至少40℃的温度;
利用流式细胞术基于一个或者多个特定DNA特征将所述着色混合物中的精细胞分拣成不同的精细胞群组中,所述流式细胞术包括:将样本流体输送到多个流式细胞术单元,每一个流式细胞术单元基于所述一个或者多个DNA特征分拣精细胞;操作所述单元同时共享一个集成平台,所述集成平台包括下列元件中的至少一个:(1)精细胞的公共供给;(2)电磁辐射的公共源;(3)公共壳体;(4)用于控制单元操作的公共输入;(5)用于接收和处理来自于单元的信息以对一个单元相对于另一个单元的操作进行评估的公共处理器;以及(6)用于将包含所述精细胞的流体输送到所述流式细胞术单元的公共流体输送系统;
获得具有所需DNA特征的一定量的精细胞;
将低温保护剂加入到所述一定量的精细胞;
将所述一定量的精细胞和低温保护剂冷却到约0-8℃的保温温度;
使得所述精细胞和所述低温保护剂在所述保温温度下保持小于60分钟的时间;以及
将所述一定量精细胞过度冷却到-40℃的温度。
Ng2′.(高温着色/多通道分拣/高纯度分拣策略)
一种处理动物精细胞的方法,包括下列步骤:
形成包含精细胞和DNA选择性荧光染料的着色混合物,以及使得着色混合物经受至少40℃的温度;
将包含精细胞的所述着色混合物的流体流输送到所述多个流式细胞术单元中的每一个并且将每个流体流分裂为液滴,所述液滴包括每个都包含一个或者多个具有所需性别染色体的精细胞的第一液滴、每个都包含一个或者多个具有非所需性别染色体的精细胞的第二液滴以及每个都包含一个或者多个具有所需性别染色体的精细胞和一个或者多个具有非所需性别染色体的精细胞的第三液滴;
利用液滴分拣流式细胞术从所述第二和第三液滴中分拣所述第一液滴,所述液滴分拣流式细胞术包括:操作所述多个流式细胞术单元同时共享一个集成平台,所述集成平台包括下列元件中的至少一个:(1)精细胞的公共供给;(2)电磁辐射的公共源;(3)公共壳体;(4)用于控制单元操作的公共输入;(5)用于接收和处理来自于单元的信息以对一个单元相对于另一个单元的操作进行评估的公共处理器;以及(6)用于将包含所述精细胞的流体输送到所述流式细胞术单元的公共流体输送系统;
收集所述第一液滴以提供至少一个具有所需性别染色体的精细胞的群组;
确定所述至少一个群组中具有所需性别染色体的精细胞的量;以及
以作为所确定的在所述至少一个群组中的具有所需性别染色体的精细胞的量相对于在所述第一、第二和第三液滴中的具有所需性别染色体的精细胞的总量的函数改变流体被输送到一个或多个流式细胞术单元的速度。
Ng3′.(高温着色/多通道分拣/高回收率分拣策略)
一种处理动物精细胞的方法,包括下列步骤:
形成包含精细胞和DNA选择性荧光染料的着色混合物,以及使得着色混合物经受至少40℃的温度;
将包含精细胞的所述着色混合物的流体流输送到所述多个流式细胞术单元中的每一个并且将每个流体流分裂为液滴,所述液滴包括每个都包含一个或者多个具有所需性别染色体的精细胞的第一液滴、每个都包含一个或者多个具有非所需性别染色体的精细胞的第二液滴以及每个都包含一个或者多个具有所需性别染色体的精细胞和一个或者多个具有非所需性别染色体的精细胞的第三液滴;
利用液滴分拣流式细胞术从所述第二液滴中分拣所述第一和第三液滴,所述液滴分拣流式细胞术包括:操作所述多个流式细胞术单元同时共享一个集成平台,所述集成平台包括下列元件中的至少一个:(1)精细胞的公共供给;(2)电磁辐射的公共源;(3)公共壳体;(4)用于控制单元操作的公共输入;(5)用于接收和处理来自于单元的信息以对一个单元相对于另一个单元的操作进行评估的公共处理器;以及(6)用于将包含所述精细胞的流体输送到所述流式细胞术单元的公共流体输送系统;
收集所述第一和第三液滴以提供至少一个具有所需性别染色体的精细胞的群组;
确定所述至少一个群组中具有所需性别染色体的精细胞的量;以及
以作为所确定的在所述至少一个群组中的具有非所需性别染色体的精细胞的量的函数改变流体被输送到一个或多个流式细胞术单元的速度。
Ng4′.(高温着色/多通道分拣/分拣策略/快速低温储藏)
一种处理动物精细胞的方法,包括下列步骤:
形成包含精细胞和DNA选择性荧光染料的着色混合物,以及使得着色混合物经受至少40℃的温度;
将包含精细胞的所述着色混合物的流体流输送到所述多个流式细胞术单元中的每一个并且将每个流体流分裂为液滴,并且利用流式细胞术根据包含在液滴中精细胞的一个或者多个特定DNA特征分拣所述液滴,以获得一个或多个具有所需DNA特征的精细胞的群组,所述流式细胞术包括:操作所述单元同时共享一个集成平台,所述集成平台包括下列元件中的至少一个:(1)精细胞的公共供给;(2)电磁辐射的公共源;(3)公共壳体;(4)用于控制单元操作的公共输入;(5)用于接收和处理来自于单元的信息以对一个单元相对于另一个单元的操作进行评估的公共处理器;以及(6)用于将包含所述精细胞的流体输送到所述流式细胞术单元的公共流体输送系统;
作为下列因素至少一个的函数改变输送流体的速度,这些因素包括:(1)所述具有所需DNA特征的精细胞的一个或多个群组的纯度;以及(2)在一个或多个精细胞群组中具有所述所需DNA特征的精细胞量相对于所述液滴中具有所述所需DNA特征的精细胞的总量;
加入低温保护剂以保护从所述一个或多个精细胞群组中获得的一定量的精细胞;
将所述一定量的精细胞和低温保护剂冷却到约0-8℃的保温温度;
使得所述精细胞和所述低温保护剂在所述保温温度下保持小于60分钟的时间;以及
将所述一定量精细胞过度冷却到-40℃的温度。
O′.总时间线
O1′.一种处理动物精细胞的方法,包括下列步骤:
从雄性动物收集精细胞;
利用DNA选择性荧光染料使得精细胞着色;
利用电磁辐射照射精细胞以使得DNA选择性荧光染料发出荧光;
检测由精细胞发出的荧光;
分析由精细胞发出的荧光以确定精细胞的一个或者多个特定的DNA特征;
基于所述一个或者多个特定的DNA特征将精细胞分拣成多个精细胞群组;
从所述多个精细胞群组中的一个获得具有所需DNA特征的一定量的精细胞;以及
使得所述一定量的精细胞过度冷却;
其中,在精细胞收集后在小于12小时的时间内完成过度冷却的步骤。
O2′.O1′所述的方法,其中,在精细胞收集后在小于8小时的时间内完成所述一定量的精细胞过度冷却的步骤。
O3′.O1′所述的方法,其中,在精细胞收集后在小于6小时的时间内完成所述一定量的精细胞过度冷却的步骤。
O4′.O1′所述的方法,其中,在精细胞收集后在小于3小时的时间内完成所述一定量的精细胞过度冷却的步骤。
O5′.O1′所述的方法,其中,在精细胞收集后在小于2小时的时间内完成所述一定量的精细胞过度冷却的步骤。
O6′.O1′所述的方法,其中,在精细胞收集后在小于1小时的时间内完成所述一定量的精细胞过度冷却的步骤。
O7′.O1′所述的方法,其中,所述精细胞包括活精细胞
O8′.O7′所述的方法,其中,所述一个或者多个DNA特征包括精细胞是否包含X或Y性别染色体。
O9′.O7′所述的方法,还包括在过度冷却步骤之后解冻所述一定量精细胞之后通过人工受精使用来自于所述一定量的精细胞使得卵细胞受精的步骤。
O10′.O1′所述的方法,还包括产生大量具有所需特征的精细胞并且通过商业分配系统将所述大量精细胞分配给动物育种家。
P′.分拣速度
P1′.一种根据染色体含量分拣活精细胞的方法,包括:
(a)将DNA选择性荧光染料加入到活精细胞供给;
(b)使得包含所述精细胞的样本流体和鞘流体流过趋于使得精细胞转动到所需取向的定向喷嘴,所述样本流体和鞘流体以流体流的形式离开喷嘴,所述流体流包括由样本流体和精细胞形成的芯流和包围芯流的鞘流体流;
(c)为喷嘴提供声能以使得流体流在喷嘴下游的液滴分裂位置处分裂成液滴流;
(d)引导电磁辐射束在液滴分裂位置上游的询问位置处与流体流相交以激发在精细胞中的荧光染料,从而使得精细胞发出荧光;
(e)利用输出表示被检测的荧光发射的强度的随时间改变的模拟信号的光检测器检测发出的荧光;
(f)对所述随时间改变的模拟信号进行电子处理以确定多个精细胞的染色体含量;
(g)根据包含在液滴中的精细胞的染色体含量选择性地为流体流提供静电荷以选择性地为液滴提供电荷或者不提供电荷;
(h)利用电场根据它们的电荷使得液滴偏转,从而使得包含在具有相同电荷的液滴中精细胞与包含在具有不同电荷的液滴中精细胞分离;以及
(i)以至少每秒5000个精细胞的速度收集至少一个活精细胞群组。
P2′.P1′所述的方法,其中,收集步骤中收集的至少一个群组具有至少85%的纯度。
P3′.P1′所述的方法,其中,所述收集步骤包括以至少每秒6000个精细胞的速度收集至少一个活精细胞群组。
P4′.P1′所述的方法,其中,所述收集步骤包括以至少每秒7000个精细胞的速度收集至少一个活精细胞群组。
P5′.P1′所述的方法还包括并行操作两个或者多个细胞计数单元以使每一个执行步骤(b)至(i)同时共享一个集成平台,所述集成平台包括下列元件中的至少一个:(1)颗粒的公共供给;(2)电磁辐射的公共源;(3)公共壳体;(4)用于控制单元操作的公共输入;(5)用于接收和处理来自于单元的信息以对一个单元相对于另一个单元的操作进行评估的公共处理器;以及(6)用于将包含所述颗粒的流体输送到所述流式细胞术单元的公共流体输送系统。
P6′.P5′所述的方法,其中,操作两个或者多个细胞计数单元同时共享一个集成平台的步骤包括:操作模式锁定的固态激光器以产生包括多个电磁脉冲的单一束,每个脉冲的峰值功率都大于所述激光器的平均功率输出;将所述单一束分裂为两个或多个束;以及将所述两个或多个束中的每个引导到流式细胞计数单元。
R′.CSD或缝隙扫描
a.精细胞
R1′.一种分析在具有流动方向的流体流中的动物精细胞的染色体DNA特征的方法,所述每一个精细胞具有带核的头部,所述核包括包含至少一个染色体的局部染色体区域,所述核在流体流的方向上具有一定长度,所述方法包括:
以基本椭圆形斑点的形式将电磁辐射束聚焦在流体流上,所述斑点具有沿着相对于流体流的方向基本以直角延伸的长轴的长度和沿着基本平行于流体流的方向延伸的短轴的宽度,射束斑点的宽度小于所述核的长度,所述精细胞适于穿过所述斑点,导致电磁辐射从精细胞发出,包括从表示所述区域的染色体特征的所述染色体区域发出的辐射;
检测来自于所述染色体区域的辐射发射的至少一些和将来自于所述染色体区域的辐射发射的至少一些转换成表示所述染色体DNA特征的随时间变化的模拟电信号;
数字化地采样随时间变化的模拟信号并且提供包含与所述随时间变化的模拟信号相对应的数字信息的输出;
分析所述数字信息以抽取表示随时间变化的模拟信号的微分特性的信息;以及
至少部分地根据所述抽取信息分析作为具有特定染色体DNA特征对至少一些精细胞分类。
R2′.R1′所述的方法,其中,所述染色体特征表示精细胞的性别。
R3′.R2′所述的方法,其中,所述精细胞是牛的精细胞。
R4′.R3′所述的方法,其中,所述染色体区域位于在核的纵向中心的任何一侧上延伸不大于核长度的20%的核的区域内。
R5′.R3′所述的方法,其中,所述染色体区域位于在核的纵向中心的任何一侧上延伸不大于核长度的10%-15%的核的区域内。
R6′.R1′所述的方法,其中,数字化采样步骤包括同步采样所述随时间变化的模拟输出。
R7′.R1′所述的方法,其中,所述斑点宽度小于3.0微米。
R8′.R7′所述的方法,其中,所述斑点长度大于100微米。
R9′.R1′所述的方法,还包括在所述流穿过所述光束之前在所述流中的精细胞上施加作用力以将它们带到所需取向。
R10′.R1′所述的方法,还包括根据所述染色体DNA特征液滴分拣所述细胞。
R11′.R1′所述的方法,还包括根据所述染色体DNA特征光破坏分拣所述细胞。
R12′.R1′所述的方法,还包括根据所述染色体DNA特征流体切换分拣所述细胞。
R13′.R1′所述的方法,其中,所述微分特性包括在所述信号相对于阈值的一点处随时间变化的模拟信号的斜度。
b.一般颗粒
R14′.一种分析在具有流动方向的流体流中的颗粒的方法,所述方法包括:
以基本椭圆形斑点的形式将电磁辐射束聚焦在流体流上,所述斑点具有沿着相对于流体流的方向基本以直角延伸的长轴的长度和沿着基本平行于流体流的方向延伸的短轴的宽度,射束斑点的宽度小于所述核的长度,所述颗粒适于穿过所述斑点,导致电磁辐射从颗粒发出;
检测和将辐射发射的至少一些转换成表示颗粒特征的随时间变化的模拟电信号;
数字化地采样随时间变化的模拟信号并且提供包含与所述随时间变化的模拟信号相对应的数字信息的输出;
分析所述数字信息以抽取表示随时间变化的模拟信号的微分特性的信息;以及
至少部分地根据所述抽取信息分析作为具有特定特征对至少一些颗粒分类。
R15′.R14′所述的方法,其中,数字化采样步骤包括同步采样所述随时间变化的模拟输出。
R16′.R14′所述的方法,还包括根据所述分类液滴分拣所述颗粒。
R17′.R14′所述的方法,还包括根据所述染色体DNA特征光破坏分拣所述精细胞。
R18′.R14′所述的方法,还包括根据所述染色体DNA特征流体切换分拣所述精细胞。
R19′.R14′所述的方法,其中,所述微分特性包括在所述信号相对于阈值的一点处随时间变化的模拟信号的斜度。
S′.脉冲激光器FCM设备
S1′.一种流式细胞术设备,包括:
用于通过颗粒询问位置引导包含样本颗粒的流体流的流动通道;
用于发出多个电磁辐射(EMR)脉冲的激光器,其中每个脉冲都具有超过所述激光器的平均功率的峰值功率,所述脉冲沿射束路径从所述激光器被引导到颗粒询问位置;
用于产生脉冲到达询问位置的定时信号指示的定时电路;
适于从询问位置中检测EMR并用于输出所检测的EMR的强度的时间改变模拟信号指示的检测器;
适于接收作为输入的时间改变模拟信号并且适于采样所述模拟信号以产生数字化输出的模拟数字转换器;以及
用于作为时限信号的函数分析来自于模拟数字转换器的数字化输出的电子处理器。
S2′.S1′所述的设备,其中,所述激光器用于在约100-500皮秒的功率下在约50-150MHz的脉冲频率下发射具有1-100皮秒宽度的EMR脉冲。
S3′.S2′所述的设备,其中,所述激光器用于在约70-100MHz的脉冲频率下发射具有5-20皮秒宽度的EMR脉冲。
S4′.S1′所述的设备,其中,所述定时电路包括适于感测与EMR脉冲相对应的光线的传感器,所述光线包括由每一个激光脉冲和流体流21相互作用产生的散射光或包括EMR脉冲的光。
S5′.S1′所述的设备,其中,所述定时电路包括用于触发所述激光器以发射脉冲的时钟。
S6′.S1′所述的设备,其中,所述检测器适于检测由所述脉冲的激发能激励的荧光发射。
S7′.S1′所述的设备,其中,所述激光器包括模式锁定固态激光器。
S8′.S1′所述的设备,其中,所述激光器包括Q-切换激光器,
S9′.S1′所述的设备,其中,所述激光器包括倾腔激光器。
S10′.S1′所述的设备,其中,所述检测器是光电增倍管。
S11′.S9′所述的设备,其中,所述光电增倍管具有小于2毫微秒的响应时间。
S12′.S1′所述的设备,其中,所述电子处理器用于作为脉冲波形处理数字化输出。
S13′.S12′所述的设备,其中,所述电子处理器用于从数字化输出中抽取以下特征中的至少一个:临界斜度差异;脉冲上升时间;脉冲峰值;以及脉冲区域。
T′.脉冲激光器方法
T1′.一种用于当其流过询问位置时分析包含在流体流中颗粒的方法,所述方法包括以下步骤:
从激光器中发出多个电磁辐射(EMR)脉冲,其中每个脉冲的峰值功率都超过所述激光器的平均功率;
通过沿束路径将来自于激光器中的所述脉冲引导到询问位置而间歇地照射流体流和包含于其中的颗粒;
检测来自于询问位置的EMR;
产生从检测的EMR的强度的时间改变模拟信号指示;
产生脉冲到达所述询问位置的定时信号指示;
将时间改变模拟信号转换为数字信号;以及
分析所述数字信号以确定流体流中的颗粒的特征。
T2′.T1′所述的方法,其中,将时间改变模拟信号转换为数字信号的步骤包括在与用脉冲照射流体流同步的时间下采样所述模拟信号。
T3′.T1′所述的方法,其中,照射流体流的步骤导致与所述颗粒相关的荧光团的激发,并且将时间改变模拟信号转换为数字信号的步骤包括在询问位置的照射之后在所述荧光团的荧光寿命衰退的预定时间下采样所述模拟信号。
T4′.T1′所述的方法,其中,每个脉冲都包含使得所述荧光团饱和的充足功率。
T5′.T1′所述的方法,其中,检测来自于询问位置的光线的步骤包括使用光电增倍管检测来自于与所述颗粒相关的荧光团中的荧光发射。
T6′.T1′所述的方法,其中,发出电磁辐射脉冲的步骤包括发射每秒钟50-150百万之间的脉冲的步骤,其中每个脉冲具有1-100皮秒之间的宽度。
T7′.T1′所述的方法,其中,产生定时信号的步骤包括感测由于所述脉冲与所述流体流相互作用而产生的散射光。
T8′.T1′所述的方法,其中,产生定时信号的步骤包括产生时钟信号的步骤并且从激光器中发出多个EMR脉冲的步骤包括使用所述时钟信号以触发所述激光器发出脉冲。
T9′.T1′所述的方法,其中,分析所述数字信号的方法包括作为脉冲波形分析数字信号。
T10′.T1′所述的方法,其中,分析所述数字信号的方法还包括从所述信号中抽取以下特征中的至少一个:临界斜度差异;脉冲上升时间;脉冲峰值;以及脉冲区域。
T11′.T1′所述的方法,其中,所述颗粒包括精细胞。
U′.[保留]
V′.CV最优化
V1′.一种评估对用于分拣的细胞群组着色的一组条件的程序,所述群组包括第一类型和第二类型的细胞,所述程序包括:
(a)在一组着色条件下利用荧光染料使得细胞群组的一部分着色;
(b)当着色的细胞以速度R通过流式细胞计的询问位置时使得着色细胞暴露在电磁辐射下;
(c)确定暴露的细胞的荧光发射特征;
(d)利用确定的荧光特征将暴露的细胞分类成两个或者多个细胞的子群组,其中一个子群组是第一细胞类型的浓缩子群组;
(e)确定浓缩子群组的细胞的荧光发射特征的改变系数以提供对着色条件的分拣效率的指示;以及
(f)确定在细胞被着色的情况下改变任何着色条件或者着色的细胞通过流式细胞计的询问位置的速度R以提高分拣效率。
V2′.V1′所述的程序,其中,所述部分包括第一部分并且所述一组着色条件包括第一组着色条件,所述程序还包括在不同于第一组着色条件的第二组着色条件下着色所述细胞群组的第二部分并且通过所述细胞群组的第二部分执行步骤(b)到(e)。
V3′.V2′所述的程序,其中,在已为第一部分确定了改变系数之后着色第二部分。
V4′.V2′所述的程序,其中,所述第二组着色条件由于以下至少一项而导致不同于第一组着色条件:(1)荧光染料的浓度;(2)用于着色细胞的着色周期的长度;以及(3)用于着色细胞的着色周期期间细胞的温度。
V5′.V2′所述的程序,还包括在不同于第一和第二组着色条件的第三组着色条件下着色所述细胞群组的第三部分并且通过所述细胞群组的第三部分执行步骤(b)到(e)。
V6′.V5′所述的程序,还包括在不同于第一、第二和第三组着色条件的第四组着色条件下着色所述细胞群组的第四部分并且通过所述细胞群组第四部分执行步骤(b)到(e)。
V7′.V6′所述的程序,还包括在不同于第一、第二、第三和第四组着色条件的第五组着色条件下着色所述细胞群组的第五部分并且通过所述细胞群组的第五部分执行步骤(b)到(e)。
V8′.V2′所述的程序,还包括根据所述确定选择性地改变第一组着色条件中的条件从而获得第二组着色条件。
V9′.V2′所述的程序,其中,作为通过在第二部分上执行步骤(7)而确定的改进着色条件被应用于所述细胞群组的剩余部分的着色。
V10′.V2′所述的程序,其中,在步骤(a)中多部分细胞被着色,每个部分都在独特的着色条件组下被着色,其中,为每个部分执行步骤(b)到(e),步骤(f)包括使用各种改变系数以确定用于着色所述群组中其它细胞的着色条件组。
V11′.V1′所述的程序,其中,所述细胞为精细胞。
V12′.V11′所述的程序,其中,所述第一细胞类型包括携带X染色体的精细胞。
V13′.V1′所述的程序,其中,步骤(a)包括用Hoechst33342着色所述细胞。
V14′.V1′所述的程序,其中,所述荧光发射特征包括与细胞穿过询问位置的运动相对应的荧光脉冲波形的特征,并且所述特征表示以下至少一项:(1)总荧光强度;以及(2)峰值荧光强度。
V15′.V1′所述的程序,还包括在步骤(f)之前确定来自于步骤(e)的改变系数是否等于或小于预定改变系数并且使用每次都着色不同细胞部分的不同着色条件组重复步骤(a)到(e)直到步骤(e)中确定的改变系数等于或小于预定改变系数,并且步骤(f)包括如果对于各个着色条件来说来自于步骤(e)的改变系数都等于或小于预定改变系数的话,确定使用所述着色条件着色所述其它细胞。
V16′.一种评估对用于分拣的细胞群组着色的一组条件的程序,所述群组包括第一类型和第二类型的细胞,所述程序包括:
(a)在一组着色条件下利用荧光染料使得细胞群组的一部分着色;
(b)当着色的细胞以速度R通过流式细胞计的询问位置时使得着色细胞暴露在电磁辐射下;
(c)确定暴露的细胞的荧光发射特征;
(d)利用确定的荧光特征将暴露的细胞分类成两个或者多个细胞的子群组,其中一个子群组是第一细胞类型的浓缩子群组;
(e)确定浓缩子群组的细胞的荧光发射特征的改变系数以提供对着色条件的分拣效率的指示;
(f)确定在细胞被着色的情况下改变任何着色条件或者着色的细胞通过流式细胞计的询问位置的速度R以提高分拣效率;以及
(g)将改进的着色条件应用于所述细胞群组的其余部分。
V17′.V16′所述的程序,还包括在流式细胞计数器中分拣所述细胞群组的其余部分以获得第一细胞类型的浓缩样本群组;
V18′.V16′所述的程序,其中,所述部分包括第一部分并且所述一组着色条件包括第一组着色条件,所述程序还包括在不同于第一组着色条件的第二组着色条件下着色所述细胞群组的第二部分并且通过所述细胞群组的第二部分执行步骤(b)到(e)。
V19′.V18′所述的程序,其中,在已为第一部分确定了改变系数之后着色第二部分。
V20′.V18′所述的程序,其中,所述第二组着色条件由于以下至少一项而导致不同于第一组着色条件:(1)荧光染料的浓度;(2)用于着色细胞的着色周期的长度;以及(3)用于着色细胞的着色周期期间细胞的温度。
V21′.V18′所述的程序,还包括在不同于第一和第二组着色条件的第三组着色条件下着色所述细胞群组的第三部分并且通过所述细胞群组的第三部分执行步骤(b)到(f)。
V22′.V21′所述的程序,还包括在不同于第一、第二和第三组着色条件的第四组着色条件下着色所述细胞群组的第四部分并且通过所述细胞群组的第四部分执行步骤(b)到(f)。
V23′.V22′所述的程序,还包括在不同于第一、第二、第三和第四组着色条件的第五组着色条件下着色所述细胞群组的第五部分并且通过所述细胞群组的第五部分执行步骤(b)到(f)。
V24′.V18′所述的程序,在步骤(g)之前,还包括在选择用作步骤(g)中的一组着色条件,所述着色条件产生用于荧光发射特征的改变系数水平,所述改变系数水平等于或小于预定改变系数。
V25′.V24′所述的程序,其中,预定改变系数约为1.3%或更小。
V26′.V16′所述的程序,还包括在步骤(f)之前确定来自于步骤(e)的改变系数是否等于或小于预定改变系数并且使用每次都着色不同细胞部分的不同着色条件组重复步骤(a)到(e)直到步骤(e)中确定的改变系数等于或小于预定改变系数,并且步骤(f)包括如果对于各个着色条件来说来自于步骤(e)的改变系数都等于或小于预定改变系数的话,确定使用所述着色条件着色所述其它细胞。
V27′.V16′所述的程序,其中,所述细胞为精细胞。
V28′.V27′所述的程序,其中,所述第一细胞类型包括携带X染色体的精细胞。
V29′.V16′所述的程序,其中,步骤(a)包括用Hoechst33342着色所述细胞。
V30′.V1′所述的程序,其中,所述荧光发射特征包括与细胞穿过询问位置的运动相对应的荧光脉冲波形的特征,并且所述特征表示以下至少一项:(1)总荧光强度;以及(2)峰值荧光强度。
W′.使用外照射传感器的自动化校准
W1′.用于自动化校准液滴分拣流式细胞计数器的设备,当在液滴分裂位置分裂连续流体流时所述液滴分拣流式细胞计数器选择性地向多个液滴施加或不施加一组一个或多个电荷中的一个,并且静电地将所述液滴分拣到两个或多个独立液滴流中,取决于所述液滴的所需容量为每个液滴选择的电荷,在流式细胞计数器的询问位置和所述颗粒到达液滴分裂位置处检测根据表示连续的流体流中所包含的颗粒的瞬间之间的时间消释的估计值的滴落延迟设定,所述设备包括:
(a)询问位置下游的外照射传感器,用于照射一个所述独立液滴流中的液滴,检测由包含在所述液滴中的颗粒发出的任何荧光发射,并且产生表示所检测的荧光发射的输出信号;以及
(b)用于分析所述输出信号并且自动化地调节以下至少一项的控制装置:(1)滴落延迟设定;以及(2)所述电荷组中电荷的幅度。
W2′.W1′所述的设备,其中,所述控制装置作为所检测的荧光发射与应由具有所需容量的液滴产生的荧光发射之间差异的函数调节所述滴落延迟设定。
W3′.W1′所述的设备,其中,所述控制装置作为为包含荧光颗粒的液滴所检测的荧光发射的平均峰值强度中变化的函数调节所述电荷组中电荷的幅度。
W4′.W1′所述的设备,其中,所述外照射传感器包括光源、二向性滤光器、透镜系统、以及光检测器。
W5′.W4′所述的设备,其中,所述外照射传感器还包括用于将来自于光源的光线引导到所述传感器照射所述液滴的位置的纤维光缆。
W6′.W5′所述的设备,其中,通过一对充电的偏转板产生电场,并且所述外照射传感器被布置得用于当所述液滴在所述偏转板之间穿过时照射所述液滴。
W7′.W6′所述的设备,其中,所述外照射传感器被布置得用于在所述液滴穿过由一个或多个偏转板产生的电场时通过电绝缘支承物中的孔照射所述液滴,所述支承物用于支承至少一个偏转板。
W8′.W4′所述的设备,其中,所述光源用于在询问位置处照射颗粒。
W9′.W1′所述的设备,还包括W1′的段落(a)所述的用于所述两个或多个独立液滴流的剩余部分的外照射传感器,所述控制装置用于分析来自于所述外照射传感器的输出信号并且自动化地调节以下至少一项:(1)作为所检测的荧光发射与应由具有所需容量的液滴产生的荧光发射之间差异的函数的滴落延迟设定;以及(2)作为为包含荧光颗粒的液滴所检测的荧光发射的平均峰值强度中变化的函数的节所述电荷组中电荷的幅度。
W10′.W9′所述的设备,其中,通过一对充电的偏转板产生电场,并且所述外照射传感器被布置得用于当所述液滴在所述偏转板之间穿过时照射所述液滴。
W11′.W10′所述的设备,其中,所述外照射传感器被布置得用于在所述液滴穿过由一个或多个偏转板产生的电场时通过电绝缘支承物中的孔照射所述液滴,所述支承物用于支承至少一个偏转板。
W12′.W1′所述的设备,其中,所述控制装置用于将液滴充电的相位保持在关于液滴形成的最佳相位上下的约36度内。
W13′.W12′所述的设备,其中,所述控制装置用于将液滴充电的相位保持在关于液滴形成的最佳相位上下的约10.8度内。
X′.自动化校准方法
X1′.用于连续地校验流式细胞计数器中适当分拣刻度的方法备,当在液滴分裂位置由连续流体流构成时所述液滴分拣流式细胞计数器选择性地向多个液滴施加或不施加一组一个或多个电荷中的一个,并且静电地将所述液滴分拣到两个或多个独立液滴流中,取决于所述液滴的所需容量为每个液滴选择的电荷,在流式细胞计数器的询问位置和所述颗粒到达液滴分裂位置处检测根据表示连续的流体流中所包含的颗粒的瞬间之间的时间消释的估计值的滴落延迟设定,所述方法包括:
(a)通过沿向前的方向引导照射射束沿射束轴线穿过透镜系统而照射一个所述独立液滴流中的液滴,从而产生由包含在所述液滴中的颗粒发出的任何荧光发射;
(b)使用所述透镜系统收集一些荧光光线并且沿射束轴线沿向后的方向引导所述荧光光线;
(c)检测所收集的荧光光线中至少一些并产生表示所检测的光线的输出信号;以及
分析所述输出信号并且根据所述分析自动化地调节以下至少一项的控制装置:(1)滴落延迟设定;以及(2)所述电荷组中电荷的幅度。
X2′.X1′所述的方法,其中,所述调节步骤包括作为所检测的荧光发射与应由具有所需容量的液滴产生的荧光发射之间差异的函数调节所述滴落延迟设定。
X3′.X1′所述的方法,其中,所述调节步骤包括作为为包含荧光颗粒的液滴所检测的荧光发射的平均峰值强度中变化的函数调节所述电荷组中电荷的幅度。
X4′.X1′所述的方法,其中,所述照射步骤包括使用纤维光缆将来自于光源的光线引导到邻近所述分拣液滴流的位置。
X5′.X1′所述的方法,其中,通过一对充电的偏转板产生电场,并且照射步骤包括当所述液滴在所述偏转板之间穿过时照射所述液滴。
X6′.X5′所述的方法,其中,至少一个偏转板由电绝缘支承物支承,并且照射步骤包括在所述液滴穿过所述电场时通过支承物中的孔照射所述液滴。
X7′.X1′所述的方法,还包括使用光源在询问位置处照射颗粒。
X8′.X1′所述的方法,还包括执行用于所述两个或多个独立液滴流的剩余部分的步骤(a)-(c),并且步骤(d)还包括分析各个输出信号并且自动化地调节以下至少一项:(1)作为所检测的荧光发射与应由具有所需容量的液滴产生的荧光发射之间差异的函数的滴落延迟设定;(2)作为为包含荧光颗粒的液滴所检测的荧光发射的平均峰值强度中变化的函数的节所述电荷组中电荷的幅度。
X9′.X8′所述的方法,其中,通过一对充电的偏转板产生电场,并且照射步骤包括当所述液滴在所述偏转板之间穿过时照射所述液滴。
X10′.X9′所述的方法,其中,至少一个偏转板由电绝缘支承物支承,并且照射步骤包括在所述液滴穿过所述电场时通过支承物中的孔照射所述液滴。
Y′.测试流校准方法
Y1′.用于连续地校验流式细胞计数器中适当分拣刻度的方法,当在液滴分裂位置由连续流体流构成时所述液滴分拣流式细胞计数器选择性地向多个液滴施加或不施加一组一个或多个电荷中的一个,并且静电地将所述液滴分拣到两个或多个独立液滴流中,取决于所述液滴的所需容量为每个液滴选择的电荷,在流式细胞计数器的询问位置和所述颗粒到达液滴分裂位置处检测根据表示连续的流体流中所包含的颗粒的瞬间之间的时间消释的估计值的滴落延迟设定,所述方法包括:
选择估计其包含所述颗粒的可能性基本为零的液滴;
向所选择的液滴施加所述电荷组的一个电荷,以便于形成所选择液滴以外的测试流;
照射所述测试流中的液滴;以及
检测由所选择的液滴中的任何颗粒发出或散射的任何光线。
Y2′.Y1′所述的方法,还包括:如果检测步骤中检测的光线超过阈值水平的话,调节所述滴落延迟设定;
Y3′.Y2′所述的方法,其中,自动地执行所述调节步骤。
Y4′.Y1′所述的方法,其中,在所述充电步骤施加的电荷是中性电荷。
Y5′.Y1′所述的方法,其中,使用外照射传感器执行照射步骤和检测步骤。
Z′.分拣校正系统
Z1′.一种用于液滴分拣流式细胞计数器所分拣系统校正系统,包括:
充电元件,用于当所述液滴由液滴分裂位置处的连续流体流构成时选择性地向液滴流中的每个液滴施加来自于一组电荷中的一个电荷;
充电元件下游的一对充电偏转板,被布置得用于使得液滴穿过所述偏转板之间以便于依照其电荷分拣所述液滴;
以及清除残损物系统,包括以下元件中的至少一个:(1)用于从充电元件中去除残损物的可选择性地启动的空气系统;以及(2)用于从偏转板中去除残损物的可选择性地启动的空气系统。
Z2′.Z1′所述的系统,其中,所述清除残损物系统包括元件(1)和元件(2)。
Z3′.Z1′所述的系统,其中,所述清除残损物系统适于在所述处理器确定来自于偏离液滴的残损物妨碍了液滴分拣时由处理器自动地启动。
Z4′.Z1′所述的系统,其中,所述清除残损物系统包括元件(1),并且元件(1)的可选择性地启动的空气系统包括具有邻近所述充电元件的开口的真空通路以便于将残损物真空吸离所述充电元件。
Z5′.Z1′所述的系统,其中,所述清除残损物系统包括元件(2),并且元件(2)的可选择性地启动的空气系统包括具有开口的空气通路,通过所述空气通路输送压缩空气以便于将残损物吹离所述偏转板。
Z6′.一种操作液滴分拣流式细胞计数器系统的方法,所述方法包括:
使用充电元件将来自于一组电荷中的一个电荷选择性地施加于作为由液滴分裂位置处的连续流体流构成的液滴的液滴流中的每个液滴;
使得所述液滴穿过充电元件下游的一对充电偏转板之间以便于依照其电荷分拣所述液滴;
使用处理器确定残损物是否妨碍了液滴分拣;以及
如果处理器确定残损物妨碍了液滴分拣的话,在处理器的控制下使用清除残损物系统去除所述残损物,所述清除残损物系统包括以下元件中的至少一个:(1)用于从充电元件中去除残损物的可选择性地启动的空气系统;以及(2)用于从偏转板中去除残损物的可选择性地启动的空气系统。
                       权利的保留
本申请人明确保留在任何指定国家中关于归档的修正权利要求和附加和/或分案申请的所有权利,从而追诉涉及以上指定的发明方面所涉及的权利要求和说明书中所述或附图中所示的其它主题。

Claims (148)

1.一种根据颗粒的一个或者多个特征对颗粒进行分类的多通道系统,所述系统包括:
多个流式细胞术单元,每一个流式细胞术单元通过利用电磁辐射束询问包含所述颗粒的流体流来对颗粒混合物中的颗粒进行分类;
所述单元共享一个集成平台,所述集成平台包括下列元件中的至少一个:(1)颗粒的公共供给源;(2)公共壳体;(3)用于控制单元操作的公共输入装置;(4)用于接收和处理来自于单元的信息以对一个单元相对于另一个单元的操作进行评估的公共处理器;以及(5)用于将包含所述颗粒的流体输送到所述流式细胞术单元的公共流体输送系统。
2.根据权利要求1所述的系统,其特征在于,所述集成平台还包括公共电磁辐射源。
3.根据权利要求1所述的系统,其特征在于,所述颗粒是精细胞。
4.根据权利要求1所述的系统,其特征在于,所述流式细胞术单元适于并行操作。
5.根据权利要求1所述的系统,其特征在于,所述多个流式细胞术单元用于分拣颗粒。
6.根据权利要求5所述的系统,其特征在于,所述集成平台还包括公共电磁辐射源,所述多个流式细胞术单元包括空气中喷射液滴分拣流式细胞术单元。
7.一种根据颗粒的一个或者多个特征对颗粒进行分类的多通道方法,所述方法包括:
提供多个流式细胞术单元;
操作所述流式细胞术单元以进行多个流式细胞术操作,所述操作包括形成包含颗粒混合物的独立的流体流,以及通过利用电磁辐射束询问所述流体流来对所述颗粒混合物中的颗粒进行分类;以及
共享下列元件中的至少一个以进行所述操作:(1)用于所述流体流的公共颗粒供给;(2)公共操作控制输入;(3)用于接收和处理来自于单元的信息以对一个单元相对于另一个单元的操作进行评估的公共处理器;(4)用于将流体输送到所述流体流的公共系统;以及(5)用于所述流式细胞术单元的公共壳体。
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,还包括共享用于所述电磁辐射束的公共电磁辐射源。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述多个流式细胞术单元包括空气中喷射液滴分拣流式细胞术单元。
10.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,还包括操作所述多个流式细胞计以基于它们的分类分拣所述颗粒混合物。
11.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,所述颗粒是精细胞。
12.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,还包括并行操作所述流式细胞术单元。
13.一种利用包括三个或者多个流式细胞术单元的系统分拣颗粒的方法,其中,每一个流式细胞术单元通过利用光束询问包含所述颗粒的流体流来从颗粒混合物中分拣所需颗粒群组,所述方法包括:
产生单一激光束;
将该单一激光束分裂成三个或者多个光束并且将所述光束引导到流式细胞术单元的光学系统中;以及
操作流式细胞术单元以分拣颗粒。
14.根据权利要求13所述的方法,其特征在于,还包括通过利用一个或者多个滤光器使所述三个或者多个光束中的至少一个的强度减小而平衡细胞术单元用以询问各自的流体流的光束量。
15.根据权利要求13所述的方法,其特征在于,所述流式细胞术单元安装在公共壳体中,该方法还包括在分裂光束之前将所述单一激光束引导到所述公共壳体中。
16.在一种用于分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的流式细胞术系统中,所述系统包括:用于输送包含所述颗粒的流体的流体输送系统;用于接收所述流体、使其形成流体流以及根据所述特征利用流式细胞术对颗粒分类的流式细胞术设备;以及根据所述分类并根据分拣策略分拣颗粒以提供包含所需颗粒的至少一个群组的分拣系统,改进包括:
作为下列因素至少一个的函数响应于从流式细胞术设备接收的信息而控制分拣系统以改变其分拣策略或者控制流体输送系统以改变输送流体的速度的控制装置,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流体流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
17.根据权利要求16所述的系统,其特征在于,所述颗粒是精细胞,特征A表示活X精细胞。
18.根据权利要求16所述的系统,其特征在于,所述控制装置在所述纯度大于所需纯度时增大流体输送的速度,并且在所述纯度小于所述所需纯度时减小流体输送的速度。
19.一种利用流式细胞术系统分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的方法,所述方法包括:
输送包含所述颗粒的流体;
使流体形成流体流以及根据所述特征利用流式细胞术对流体流中的颗粒分类;
根据所述分类并根据分拣策略在流体流中分拣颗粒以提供包含所需颗粒的至少一个群组;以及
作为下列因素至少一个的函数改变所述分拣策略或者改变输送流体的速度,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流体流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
20.根据权利要求19所述的方法,其特征在于,所述颗粒是精细胞,特征A表示活X精细胞。
21.根据权利要求19所述的方法,其特征在于,还包括在所述纯度大于所需纯度时增大流体输送的速度,并且在所述纯度小于所述所需纯度时减小流体输送的速度。
22.一种用于分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的系统,所述系统包括:
用于输送包含所述颗粒的流体流的流体输送系统;
用于接收所述流体流、形成包含所述颗粒的液滴以及根据分拣策略将所述液滴分拣成不同的群组的流式细胞术设备;所述液滴包括都包含具有特征A的一种或者多种颗粒的第一液滴、都包含具有特征B的一种或者多种颗粒的第二液滴以及都包含具有特征A的一种或者多种颗粒和具有特征B的一种或者多种颗粒的第三液滴;以及
作为下列因素至少一个的函数响应于从流式细胞术设备接收的信息而控制分拣系统以改变其分拣策略或者控制流体输送系统以改变输送流体的速度的控制装置,这些因素包括:(1)所述至少一个液滴群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个液滴群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流体流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
23.根据权利要求22所述的系统,其特征在于,所述控制装置控制流体输送系统以使得输送流体的速度保持基本恒定,所述控制装置改变分拣策略。
24.根据权利要求23所述的系统,其特征在于,所述控制装置改变分拣策略以改变第三液滴在其中一个液滴群组中的百分比。
25.根据权利要求22所述的系统,其特征在于,所述控制装置控制流体输送系统以作为所述至少一个液滴群组的纯度的函数改变输送流体的速度。
26.根据权利要求22所述的系统,其特征在于,所述控制装置控制流体输送系统以作为在所述至少一个液滴群组中的具有特征A的颗粒的量相对于在所述流体流中的具有特征A的颗粒的总量的函数改变输送流体的速度。
27.根据权利要求22所述的系统,其特征在于,所述颗粒是精细胞,特征A表示活X精细胞。
28.根据权利要求22所述的系统,其特征在于,在所述混合物中特征A的颗粒与特征B的颗粒的比率是一个已知的比率,并且所述控制装置根据具有特征A或者特征B对一些颗粒进行分类并且作为已分类的颗粒的比率相对于已知比率的函数改变流体输送速度。
29.根据权利要求22所述的系统,其特征在于,所述控制装置基于来自于流式细胞术设备的输出信号确定被分拣的颗粒的纯度,所述系统还包括用于显示所需纯度的控制装置的操作者输入,并且控制装置改变速度以使所述至少一个液滴群组的纯度与所需纯度基本一致。
30.一种分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的方法,所述方法包括:
输送包含所述颗粒的流体流;
形成包含所述颗粒的液滴;
根据分拣策略将所述液滴分拣成不同的群组,所述液滴包括都包含具有特征A的一种或者多种颗粒的第一液滴、都包含具有特征B的一种或者多种颗粒的第二液滴以及都包含具有特征A的一种或者多种颗粒和具有特征B的一种或者多种颗粒的第三液滴;以及
作为下列因素至少一个的函数改变所述分拣策略或者改变输送流体的速度,这些因素包括:(1)至少一个液滴群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在至少一个液滴群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流体流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
31.根据权利要求30所述的方法,还包括使得输送流体的速度保持基本恒定,并且改变分拣策略。
32.根据权利要求31所述的方法,还包括改变分拣策略以改变第三液滴在其中一个液滴群组中的百分比。
33.根据权利要求30所述的方法,还包括作为至少一个液滴群组的纯度的函数改变输送流体的速度。
34.根据权利要求30所述的方法,还包括作为在所述至少一个液滴群组中的具有特征A的颗粒的量相对于在所述流体流中的具有特征A的颗粒的总量的函数改变输送流体的速度。
35.根据权利要求30所述的方法,其特征在于,所述颗粒是精细胞,特征A表示活X精细胞。
36.根据权利要求30所述的方法,还包括在所述至少一个液滴群组的纯度大于所需纯度时增大速度,并且在所述至少一个液滴群组的纯度小于所需纯度时减小速度。
37.一种用于分拣X和Y精细胞的系统,所述系统包括:
用于输送包含X和Y精细胞的流体流的可变速流体输送系统;
用于(1)接收所述流体流和形成包含颗粒的液滴,所述液滴包括都包含一个或者多个X精细胞的第一液滴、都包含一个或者多个Y精细胞的第二液滴以及都包含一个或者多个X精细胞和一个或者多个Y精细胞的多个第三液滴,(2)从所述第二和第三液滴分拣所述第一液滴,(3)收集所述第一液滴以提供X精细胞的至少一个群组,以及(4)在所述至少一个群组中确定X精细胞的量的流式细胞术设备;以及
响应于从流式细胞术设备接收的指令以作为所确定的X精细胞在所述至少一个群组中的量相对于在所述第一、第二和第三液滴中的X细胞的总量的函数改变流体被输送到流式细胞术设备的速度的控制装置。
38.根据权利要求37所述的系统,其特征在于,所述流式细胞术设备用于确定在所述至少一个群组中收集的X细胞的数量,所述控制装置改变流体被输送到流式细胞术设备的速度以使得在所述至少一个群组中收集的X细胞的量相对于在所述第一、第二和第三液滴中的X细胞的总量保持在可接受的量或者在该可接受的量以上。
39.一种用于分拣X和Y精细胞的方法,所述方法包括:
将包含X和Y精细胞的流体流输送到第一位置并且使得所述流体流在第二位置分裂成液滴,所述液滴包括都包含一个或者多个X精细胞的第一液滴、都包含一个或者多个Y精细胞的第二液滴以及都包含一个或者多个X精细胞和一个或者多个Y精细胞的多个第三液滴;
从所述第二和第三液滴分拣所述第一液滴;
收集所述第一液滴以提供X精细胞的至少一个群组;
确定在所述至少一个群组中收集的X精细胞的量;以及
以作为所确定的在所述至少一个群组中收集的X精细胞的量相对于在所述第一、第二和第三液滴中的X细胞的总量的函数改变流体被输送到所述第一位置的速度。
40.根据权利要求39所述的方法,其特征在于,还包括改变流体被输送到所述第一位置的速度以使得在所述至少一个群组中收集的X细胞的量相对于在所述第一、第二和第三液滴中的X细胞的总量保持在可接受的量或者在该可接受的量以上。
41.一种用于分拣X和Y精细胞的系统,所述系统包括:
用于输送包含X和Y精细胞的流体流的可变速流体输送系统;
用于(1)接收所述流体流和形成包含颗粒的液滴,所述液滴包括都包含一个或者多个X精细胞的第一液滴、都包含一个或者多个Y精细胞的第二液滴以及都包含一个或者多个X精细胞和一个或者多个Y精细胞的多个第三液滴,(2)从所述第二液滴分拣所述第一和第三液滴,(3)收集所述第一和第三液滴以提供X精细胞的至少一个群组,以及(4)确定在至少一个群组中Y精细胞的量的流式细胞术设备;以及
响应于从流式细胞术设备接收的指令以作为所确定的X精细胞在所述至少一个群组中的量的函数改变流体被输送到流式细胞术设备的速度的控制装置。
42.根据权利要求41所述的系统,其特征在于,所述控制装置改变流体被输送到流式细胞术系统的速度以使得所述至少一个群组的纯度保持在所需的纯度或者在该所需的纯度以上。
43.一种用于分拣X和Y精细胞的方法,所述方法包括:
将包含X和Y精细胞的流体流输送到第一位置并且使得所述流体流在第二位置分裂成液滴,所述液滴包括都包含一个或者多个X精细胞的第一液滴、都包含一个或者多个Y精细胞的第二液滴以及都包含一个或者多个X精细胞和一个或者多个Y精细胞的多个第三液滴;
从所述第二液滴分拣所述第一和第三液滴;
收集所述第一和第三液滴以提供X精细胞的至少一个群组;
确定在所述至少一个群组中收集的Y精细胞的量;以及
以作为所确定的在所述至少一个群组中收集的Y精细胞的量的函数改变流体被输送到所述第一位置的速度。
44.根据权利要求43所述的方法,其特征在于,还包括改变流体输送速度以使得所述至少一个群组关于X细胞的纯度保持在所需的纯度或者在该所需的纯度以上。
45.一种利用流式细胞术分拣X和Y精细胞的方法,所述方法包括:
将包含X和Y精细胞的流体流输送到第一位置并且使得所述流体流在第二位置分裂成液滴,所述液滴包括都包含一个或者多个X精细胞的第一液滴、都包含一个或者多个Y精细胞的第二液滴以及都包含一个或者多个X精细胞和一个或者多个Y精细胞的多个第三液滴;
从所述第二液滴分拣所述第一和第三液滴;
收集所述第一和第三液滴以提供X精细胞的至少一个群组。
46.在一种用于分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的流式细胞术系统中,所述系统包括:用于输送包含所述颗粒的流体的流体输送系统;用于接收所述流体、使其形成流体流以及根据所述特征利用流式细胞术对颗粒分类的流式细胞术设备;以及根据所述分类并根据分拣策略分拣颗粒以提供包含所需颗粒的至少一个群组的分拣系统,改进包括:
对来自于所述流式细胞术设备的随时间变化的模拟输出进行同步采样并且提供包括对应于所述随时间变化的模拟输出的数字信息的输出的模拟数字转换器,其中所述随时间变化的模拟输出和相应的数字信息表示特征A或者特征B;
分析和分类数字信息并且为所述分拣系统提供作为被分析和分类的数字信息的函数的分拣信号的数字信号处理器。
47.根据权利要求46所述的系统,其特征在于,所述随时间变化的模拟输出包括一系列波形脉冲,每一个波形脉冲表示颗粒的特征,所述数字信号处理器检测数字信息中对应于波形脉冲的部分并且对所检测的部分分类,所述数字信号处理器提供作为所述被检测和分类的部分的函数的所述分拣信号。
48.根据权利要求46所述的系统,其特征在于,还包括作为下列因素至少一个的函数响应于从流式细胞术设备接收的信息而控制分拣系统以改变其分拣策略或者控制流体输送系统以改变输送流体的速度的控制装置,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流体流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
49.根据权利要求48所述的系统,其特征在于,所述颗粒是精细胞,特征A表示活X精细胞。
50.根据权利要求46所述的系统,其特征在于,所述数字信号处理器包括用于检测对应于所述数字信息的脉冲的指令、用于在所检测的脉冲中抽取特征的指令以及识别作为它们被抽取的特征的函数的被检测的脉冲的指令。
51.根据权利要求50所述的系统,其特征在于,所述数字信号处理器包括用于限定在表示特征A的被抽取的特征和表示特征B的被抽取的特征之间识别的判定边界的指令。
52.根据权利要求51所述的系统,其特征在于,所述数字信号处理器作为下列因素至少一个的函数调节判定边界相对于表示特征A的被抽取的特征和相对于表示特征B的被抽取的特征的相对位置,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流体流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
53.根据权利要求46所述的系统,其特征在于,所述数字信号处理器包括用于将数字信息汇集成连续流的数据管理处理器。
54.根据权利要求46所述的系统,其特征在于,所述数字信号处理器分类数字信息以使具有特征A的颗粒群组和具有特征B的颗粒群组对应于包括具有特征A的颗粒的第一模型群组、具有特征B的颗粒的第二模型群组和未对准的颗粒的第三模型群组的三个群组的计算机模型,所述模型评估第一、第二和第三模型群组中的每一个的群组统计。
55.一种利用流式细胞术系统分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的方法,所述方法包括:
输送包含所述颗粒的流体;
使流体形成流体流以及根据所述特征利用流式细胞术对流体流中的颗粒进行检测;
根据所述分类并根据分拣策略在流体流中分拣颗粒以提供包含所需颗粒的至少一个群组;
将来自于所述流式细胞术系统的模拟输出转换成相应的数字信息,其中模拟输出表示特征A或者特征B;以及
分析和分类数字信息并且作为被分析和分类的数字信息的函数分拣颗粒。
56.根据权利要求55所述的方法,其特征在于,还包括作为下列因素至少一个的函数改变所述分拣策略或者改变输送流体的速度,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流体流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
57.根据权利要求55所述的方法,其特征在于,所述颗粒是精细胞,特征A表示活X精细胞。
58.根据权利要求55所述的方法,其特征在于,还包括检测由数字信息表示的波形脉冲、从数字信息中抽取波形脉冲的特征以及识别作为它们被抽取的特征的函数的被检测的波形脉冲。
59.根据权利要求58所述的方法,其特征在于,还包括限定在表示特征A的被抽取的特征和表示特征B的被抽取的特征之间识别的判定边界。
60.根据权利要求59所述的方法,其特征在于,还包括作为下列因素至少一个的函数调节判定边界相对于表示特征A的被抽取的特征和相对于表示特征B的被抽取的特征的相对位置,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流体流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
61.根据权利要求46所述的方法,其特征在于,分类数字信息包括分类数字信息以使具有特征A的颗粒群组和具有特征B的颗粒群组对应于包括具有特征A的颗粒的第一模型群组、具有特征B的颗粒的第二模型群组和未对准的颗粒的第三模型群组的三个群组的计算机模型,所述模型评估第一、第二和第三模型群组中的每一个的群组统计。
62.根据权利要求46所述的方法,其特征在于,分类数字信息包括作为具有特征A的颗粒的群组的变异系数的函数或者作为具有特征B的颗粒的群组的变异系数的函数分类数字信息。
63.在一种用于分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的流式细胞术系统中,所述系统包括:用于输送包含所述颗粒的流体的流体输送系统;用于接收所述流体、使其形成流体流以及根据所述特征利用流式细胞术对颗粒分类的流式细胞术设备;以及根据所述分类并根据分拣策略分拣颗粒以提供包含所需颗粒的至少一个群组的分拣系统,改进包括:
对来自于所述流式细胞术设备的随时间变化的模拟输出进行同步采样并且提供包括对应于所述随时间变化的模拟输出的数字信息的输出的模拟数字转换器,其中所述随时间变化的模拟输出和相应的数字信息表示特征A或者特征B;
确定来自于所述数字信息的所述随时间变化的模拟输出的背景特征的数字信号处理器;
检测作为所述确定的背景特征的函数的由所述数字信息表示的波形脉冲;以及
为所述分拣系统提供作为所检测的波形脉冲的函数的分拣信号。
64.根据权利要求63所述的系统,其特征在于,所述数字信号处理器使用用于确定限定背景特征的脉冲检测阈值的迭代法,所述迭代法包括:
根据数字信息计算背景统计评估;
利用计算的评估为所述数字信息施加脉冲检测逻辑以确定表示特征A或者特征B的脉冲;
在不利用对应于确定的脉冲的数字信息情况下再次计算评估;以及
重复上述步骤直至背景统计评估收敛或者固定的最大迭代数出现。
65.在一种用于分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的流式细胞术系统中,所述系统包括:用于输送包含所述颗粒的流体的流体输送系统;用于接收所述流体、使其形成流体流以及根据所述特征利用流式细胞术对颗粒分类的流式细胞术设备;以及根据所述分类并根据分拣策略分拣颗粒以提供包含所需颗粒的至少一个群组的分拣系统,改进包括:
对来自于所述流式细胞术设备的随时间变化的模拟输出进行同步采样并且提供包括对应于所述随时间变化的模拟输出的数字信息的输出的模拟数字转换器,其中所述随时间变化的模拟输出和相应的数字信息表示特征A或者特征B;以及
从数字信息中产生初始识别参数、识别作为初始识别参数的函数的数字信息以及为所述分拣系统提供作为被识别的数字信息的函数的分拣信号的数字信号处理器。
66.根据权利要求65所述的系统,其特征在于,所述数字信号处理器使用下列算法中的至少一种以产生初始识别参数,这些算法包括:k-平均、模糊k-平均和凝聚分级。
67.在一种用于分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的流式细胞术系统中,所述系统包括:
用于输送包含所述颗粒的流体的流体输送系统;和用于接收所述流体、使其形成流体流以及根据所述特征利用流式细胞术对颗粒分类的流式细胞术设备;
对来自于所述流式细胞术设备的包括一系列波形脉冲的随时间变化的模拟输出进行同步采样并且提供包括对应于所述随时间变化的模拟输出的数字信息的输出的模拟数字转换器,其中所述波形脉冲和相应的数字信息表示特征A或者特征B;以及
分析数字信息并且作为与其相对应的被分析的数字信息的函数而分拣信号的数字信号处理器。
68.根据权利要求67所述的系统,其特征在于,所述数字处理器使用用于限定波形脉冲的检测阈值,所述检测阈值是背景平均评估和在结束于当前样本的样本移动窗内计算的数字信息的标准偏差的函数。
69.根据权利要求67所述的系统,其特征在于,数字控制装置使用统计异常检测分析,并且与数字信息的背景特征统计异常的数字信息是数字脉冲被考虑的部分。
70.根据权利要求67所述的系统,其特征在于,还包括与同步采样同步用于照射颗粒以产生相应的波形脉冲的脉冲照射装置。
71.在一种用于分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的流式细胞术系统中,所述系统包括:用于输送包含所述颗粒的流体的流体输送系统;用于接收所述流体、使其形成流体流以及根据所述特征利用流式细胞术对颗粒分类的流式细胞术设备;以及根据所述分类并根据分拣策略分拣颗粒以提供包含所需颗粒的至少一个群组的分拣系统,改进包括:
对来自于所述流式细胞术设备的随时间变化的模拟输出进行同步采样并且提供包括对应于所述随时间变化的模拟输出的数字信息的输出的模拟数字转换器,其中所述随时间变化的模拟输出和相应的数字信息表示特征A或者特征B;
从数字信息抽取特征并且为所述分拣系统提供作为被抽取的特征的函数的分拣信号的数字信号处理器。
72.根据权利要求71所述的设备,其特征在于,被抽取的特征对应于下列特征的一个或者多个,这些特征包括:脉冲区域、脉冲峰值、脉冲内区域、脉冲宽度、脉冲高斯分布、脉冲滞后峰值或者脉冲斜度。
73.根据权利要求72所述的设备,其特征在于,被抽取的特征包括在脉冲的相对于脉冲的平均峰值高度的一点处的脉冲的导数或者脉冲的斜度的近似值。
74.根据权利要求73所述的设备,其特征在于,沿着脉冲的所述点对应于在由具有特征A的颗粒产生的脉冲的第一导数和由具有特征B的颗粒产生的脉冲的第一导数之间存在差值的点。
75.根据权利要求73所述的设备,其特征在于,随时间变化的模拟输出对应于来自于颗粒的荧光发射脉冲,并且沿着脉冲的所述点对应于在由具有特征A的颗粒产生的脉冲的第一导数和由具有特征B的颗粒产生的脉冲的第一导数之间的差值为最大值或者接近最大值的点。
76.根据权利要求73所述的设备,其特征在于,随时间变化的模拟输出对应于来自于颗粒的荧光发射脉冲,并且沿着脉冲的所述点是荧光发射脉冲的峰值高度的函数。
77.在一种用于分拣包括具有特征A的颗粒和具有特征B的颗粒的颗粒混合物的流式细胞术系统中,所述系统包括:用于输送包含所述颗粒的流体的流体输送系统;用于接收所述流体、使其形成流体流以及根据所述特征利用流式细胞术对颗粒分类的流式细胞术设备;以及根据所述分类并根据分拣策略分拣颗粒以提供包含所需颗粒的至少一个群组的分拣系统,改进包括:
对来自于所述流式细胞术设备的包括波形脉冲的随时间变化的模拟输出进行同步采样并且提供包括对应于所述波形脉冲的数字信息的输出的模拟数字转换器,其中所述波形脉冲和相应的数字信息表示特征A或者特征B;
以表示特征A或者特征B的形式识别数字信息并且为所述分拣系统提供作为被识别的数字信息的函数的分拣信号的数字信号处理器。
78.根据权利要求77所述的系统,其特征在于,所述数字信号处理器包括用于检测由所述数字信息表示的波形脉冲的指令、用于在检测的波形脉冲中抽取特征的指令以及识别作为它们被抽取的特征的函数的被检测的波形脉冲的指令。
79.根据权利要求78所述的系统,其特征在于,所述数字信号处理器包括用于限定在表示特征A的被抽取的特征和表示特征B的被抽取的特征之间识别的判定边界的指令。
80.根据权利要求79所述的系统,其特征在于,所述数字信号处理器作为下列因素至少一个的函数调节判定边界相对于表示特征A的被抽取的特征和相对于表示特征B的被抽取的特征的相对位置,这些因素包括:(1)所述至少一个群组关于具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的纯度;以及(2)在所述至少一个群组中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的量相对于在所述流体流中的具有特征A的颗粒或者具有特征B的颗粒的总量。
81.一种根据颗粒的一个或者多个特征分拣包含在流体流中的颗粒的设备,所述系统包括:
用于将包含所述颗粒的流体流输送到第一位置并且使得流体流在第二位置分裂成液滴的流式细胞术设备,所述流式细胞术设备利用流式细胞术根据所述特征对颗粒进行分类并且根据包含在液滴中的颗粒的分类分拣所述液滴;
所述流式细胞术设备包括外照射光学系统,所述外照射光学系统包括聚焦透镜,所述光学系统用于沿着在所述第一位置与流体流相交的射束轴线在向前的方向上引导激光束穿过所述聚焦透镜以使所述细胞穿过光束,导致电磁辐射在向后的方向上沿着所述光束轴线从被引导的细胞发射。
82.根据权利要求81所述的设备,其特征在于,所述颗粒是精细胞。
83.根据权利要求82所述的系统,其特征在于,所述射束在所述第一位置处以斑点的形式被所述光学系统聚焦在流体流上,所述斑点的形状基本为椭圆形,并且其具有沿着相对于流体流的方向基本以直角延伸的长轴的长度和沿着基本平行于流体流的方向延伸的短轴的宽度,所述宽度小于穿过斑点的精细胞的头部的长度。
84.根据权利要求83所述的系统,其特征在于,所述精细胞的头部包括具有在流体流动方向上的长度的DNA区域,并且所述光束斑点的宽度小于所述DNA区域的长度。
85.根据权利要求81所述的设备,其特征在于,所述光学系统包括在所述聚焦透镜后面用于检测所述发射的一个光检测器。
86.根据权利要求81所述的设备,其特征在于,所述流式细胞术设备还包括喷嘴,所述喷嘴具有这样构造的内表面,即,能够在颗粒穿过所述光束之前在颗粒上施加作用力以将它们带到所需取向。
87.根据权利要求86所述的设备,其特征在于,所述喷嘴可围绕所述喷嘴的纵向轴线转动以调节相对于光束轴线的所述所需颗粒取向。
88.根据权利要求81所述的系统,其特征在于,所述流式细胞术设备包括多个流式细胞术单元,所述多个流式细胞术单元用于同时分析多个流体流,每一个流式细胞术单元包括所述外照射光学系统。
89.一种根据颗粒的一个或者多个特征分拣包含在流体流中的颗粒的方法,所述方法包括:
(a)将包含所述颗粒的流体流输送到第一位置并且使得流体流在第二位置分裂成液滴;
(b)利用流式细胞术根据所述特征对颗粒进行分类并且根据包含在液滴中的颗粒的分类分拣所述液滴,
所述流式细胞术包括沿着在所述第一位置与流体流相交的射束轴线在向前的方向上引导激光束穿过所述聚焦透镜以使所述细胞穿过光束,导致电磁辐射在向后的方向上沿着所述光束轴线从被引导的细胞发射。
90.根据权利要求89所述的方法,其特征在于,所述颗粒是精细胞。
91.根据权利要求90所述的方法,其特征在于,输送流体流的步骤包括在20-40psi的压力下以及以每秒30000至50000个精细胞的速度引导所述流体流通过直径为50至70微米的喷嘴孔。
92.根据权利要求90所述的方法,其特征在于,还包括将所述射束在所述第一位置处以斑点的形式聚焦在流体流上,所述斑点的形状基本为椭圆形并且其具有沿着相对于流体流的方向基本以直角延伸的长轴的长度和沿着基本平行于流体流的方向延伸的短轴的宽度,所述宽度小于穿过斑点的精细胞的头部的长度。
93.根据权利要求92所述的方法,其特征在于,所述精细胞的头部包括具有在流体流流动方向上的长度的DNA区域,并且所述光束斑点的宽度小于所述DNA区域的长度。
94.根据权利要求90所述的方法,其特征在于,还包括产生多个都包含精细胞的独立的流体流,并且对于每一个这种流体流,执行步骤(a)和(b)。
95.根据权利要求94所述的方法,其特征在于,还包括利用公共激光束照射所述流体流。
96.根据权利要求89所述的方法,其特征在于,还包括在颗粒穿过所述光束之前在颗粒上施加作用力以将它们带到所需取向。
97.根据权利要求89所述的方法,其特征在于,所述流式细胞术还包括仅利用一个光检测器检测电磁辐射的发射。
98.一种利用染色体DNA特征对动物精细胞进行分类的设备,包括:
用于将包含精细胞的流体流输送到第一位置并且在所述流体流到达所述第一位置之前在精细胞上施加作用力以将它们带到所需取向的喷嘴系统;
外照射光学系统,所述外照射光学系统沿着在所述第一位置与所述流体流相交的射束轴线在向前的方向上以与所述流体流成非零的入射角引导电磁辐射束以使所述细胞穿过射束,导致电磁辐射在向后的方向上沿着所述光束轴线从被引导的细胞发射;
能够检测所述辐射的至少一些并且将所述辐射的至少一些转换成表示所述DNA特征的电信号的光检测器;以及
用于处理所述电信号和根据所述DNA特征对细胞进行分类的处理器。
99.根据权利要求98所述的设备,其特征在于,所述流式细胞术设备包括喷嘴,所述喷嘴具有这样构造的内表面,即,能够在细胞穿过所述光束之前在细胞上施加作用力以将它们带到所需取向。
100.根据权利要求98所述的设备,其特征在于,用所述光学系统将所述射束在所述第一位置处以斑点的形式聚焦在流体流上,所述斑点的形状基本为椭圆形,并且其具有沿着相对于流体流的方向基本以直角延伸的长轴的长度和沿着基本平行于流体流的方向延伸的短轴的宽度,所述宽度小于穿过斑点的精细胞的头部的长度。
101.根据权利要求98所述的设备,其特征在于,所述流式细胞术设备包括多个流式细胞术单元,所述多个流式细胞术单元用并行工作以同时分析多个流体流,每一个流式细胞术单元包括所述外照射光学系统。
102.根据权利要求98所述的设备,其特征在于,所述光学系统仅包括用于检测所述发射的一个光检测器。
103.一种利用染色体DNA特征对动物精细胞进行分类的方法,所述方法包括下列步骤:
(a)用于将包含精细胞的流体流输送到第一位置并且在所述流体流到达所述第一位置之前在精细胞上施加作用力以将它们带到所需取向;
(b)沿着在所述第一位置与所述流体流相交的射束轴线在向前的方向上以与所述流体流成非零的入射角引导电磁辐射束以使所述细胞穿过射束,导致电磁辐射在向后的方向上沿着所述光束轴线从被引导的细胞发射;
(c)检测所述辐射的至少一些并且将所述辐射的至少一些转换成表示所述DNA特征的电信号;以及
(d)处理所述电信号和根据所述DNA特征对细胞进行分类。
104.根据权利要求103所述的方法,其特征在于,步骤(a)包括在20-40psi的压力下以及以每秒30000至50000个精细胞的速度引导所述流体流通过直径为50至70微米的喷嘴孔。
105.根据权利要求103所述的方法,其特征在于,还包括在精细胞穿过所述光束之前在精细胞上施加作用力以将它们带到所需取向。
106.根据权利要求103所述的方法,其特征在于,还包括将所述射束在所述第一位置处以斑点的形式聚焦在流体流上,所述斑点的形状基本为椭圆形,并且其具有沿着相对于流体流的方向基本以直角延伸的长轴的长度和沿着基本平行于流体流的方向延伸的短轴的宽度,所述宽度小于穿过斑点的精细胞的头部的长度。
107.根据权利要求103所述的方法,其特征在于,还包括产生都包含精细胞的多个独立的流体流,并且对于每一个这种流体流,执行步骤(a)、(b)、(c)和(d)。
108.一种用于分析在流体流中的细胞的DNA特征的设备,所述每一个细胞包括在流体流流动方向上具有一定长度的DNA区域,所述设备包括:
用于沿着射束轴线在向前的方向上引导电磁辐射束以使射束与所述流体流相交的外照射光学系统;
所述光学系统包括在所述射束轴线上的聚焦透镜,所述聚焦透镜以基本椭圆形斑点的形式将射束聚焦在流体流上,并且所述斑点具有沿着相对于流体流的方向基本以直角延伸的长轴的长度和沿着基本平行于流体流的方向延伸的短轴的宽度,射束斑点的宽度小于所述DNA区域的长度,所述细胞适于穿过所述斑点,导致电磁辐射在向后的方向上沿着所述光束轴线从被引导的细胞发射,包括从表示所述DNA特征的所述DNA区域发射;
在聚焦透镜后面的光检测器,所述光检测器用于检测来自于所述DNA区域的所述发射的至少一些和将来自于所述DNA区域的所述发射的至少一些转换成表示所述DNA特征的电信号;以及
用于处理所述电信号、确定所述DNA特征和根据所述DNA特征对细胞进行分类的系统。
109.根据权利要求108所述的设备,其特征在于,所述斑点宽度小于3.0微米。
110.一种分析在具有流动方向的流体流中的动物精细胞的染色体DNA特征的设备,所述每一个精细胞具有带核的头部,所述核包括包含至少一个染色体的局部染色体区域,所述核在流体流的方向上具有一定长度,所述设备包括:
用于以基本椭圆形斑点的形式将电磁辐射束聚焦在流体流上的光学系统,所述斑点具有沿着相对于流体流的方向基本以直角延伸的长轴的长度和沿着基本平行于流体流的方向延伸的短轴的宽度,射束斑点的宽度小于所述核的长度,所述精细胞适于穿过所述斑点,导致电磁辐射从精细胞发出,包括从表示所述区域的染色体特征的所述染色体区域发射;
光检测器,所述光检测器用于检测来自于所述染色体区域的所述发射的至少一些和将来自于所述染色体区域的所述发射的至少一些转换成表示所述染色体特征的电信号;以及
用于处理所述电信号、确定所述染色体特征和根据所述染色体特征对精细胞进行分类的处理器。
111.根据权利要求110所述的设备,其特征在于,所述染色体特征表示精细胞的性别。
112.根据权利要求111所述的设备,其特征在于,所述染色体区域位于在核的纵向中心的任何一侧上延伸不大于核长度的20%的核的区域内。
113.一种分析在流体流中的细胞的DNA特征的方法,每一个细胞包括在流体流的方向上具有一定长度的DNA区域,所述方法包括:
沿着射束轴线在向前的方向上引导电磁辐射束以使射束与所述流体流相交;
以基本椭圆形斑点的形式将所述电磁辐射束聚焦在流体流上,并且所述斑点具有沿着相对于流体流的方向基本以直角延伸的长轴的长度和沿着基本平行于流体流的方向延伸的短轴的宽度,射束斑点的宽度小于所述DNA区域的长度,所述细胞适于穿过所述斑点,导致电磁辐射在向后的方向上沿着所述光束轴线从被引导的细胞发射;
检测所述发射和将所述发射转换成表示所述DNA特征的电信号;以及
处理所述电信号,包括在从精子头部的DNA区域发射辐射的电信号和精细胞的其它区域发射辐射的电信号之间的微分,以及
根据所述DNA特征对细胞进行分类。
114.根据权利要求113所述的方法,其特征在于,所述细胞是精细胞。
115.根据权利要求113所述的方法,其特征在于,还包括根据所述DNA特征分拣所述细胞的液滴。
116.一种分析在具有流动方向的流体流中的动物精细胞的染色体DNA特征的方法,所述每一个精细胞具有带核的头部,所述核包括包含至少一个染色体的局部染色体区域,所述核在流体流的方向上具有一定长度,所述方法包括:
用于以基本椭圆形斑点的形式将电磁辐射束聚焦在流体流上,所述斑点具有沿着相对于流体流的方向基本以直角延伸的长轴的长度和沿着基本平行于流体流的方向延伸的短轴的宽度,射束斑点的宽度小于所述核的长度,所述精细胞适于穿过所述斑点,导致电磁辐射从精细胞发出,包括从表示所述区域的染色体特征的所述染色体区域发出的辐射;
检测来自于所述染色体区域的辐射发射的至少一些和将来自于所述染色体区域的辐射发射的至少一些转换成表示所述染色体特征的电信号;以及
用于处理所述电信号、包括确定所述染色体特征;和
根据所述染色体特征对精细胞进行分类。
117.根据权利要求116所述的方法,其特征在于,所述染色体特征表示精细胞的性别。
118.一种根据细胞的染色体DNA特征对精细胞进行分类和分拣的设备,所述设备包括:
用于将包含精细胞的流体流输送到第一位置并且使流体流在第二位置分裂成液滴的喷嘴系统,所述喷嘴系统包括喷嘴,所述喷嘴具有这样构造的内表面,即,能够在细胞到达所述第一位置之前在细胞上施加作用力以将它们带到所需取向;
光学系统,所述光学系统引导电磁辐射在所述第一位置与流体流相交以使流体流中的细胞穿过所述射束,导致电磁辐射从细胞发射;
仅一个用于检测所述辐射的至少一些并且将所述辐射的至少一些转换成电信号的光检测器;以及
根据所述DNA特征对细胞进行分类和根据被包含在液滴中的细胞的分类分拣所述液滴的系统。
119.根据权利要求118所述的设备,其特征在于,所述光学系统是外照射系统。
120.一种用在根据染色体含量分拣在流体流中的动物精细胞的流式细胞术设备中的喷嘴,所述喷嘴包括:
具有内表面和所述流体流适于流过的喷嘴孔的喷嘴主体;
所述喷嘴的所述内表面包括用于在朝向所述喷嘴孔的下游方向上使得所述流体流的速度逐渐增加的第一、第二和第三轴向锥形区域,所述区域中的至少两个具有在不同方向上定向的基本为椭圆形的横截面形状以在所述流体流上施加扭力以趋于将精细胞带到所需取向。
121.根据权利要求120所述的喷嘴,其特征在于,所述至少两个区域中的一个的基本为椭圆形的横截面形状以相对于所述至少两个区域中的另一个的基本为椭圆形的横截面形状成90度定向。
122.根据权利要求121所述的喷嘴,其特征在于,第一和第二区域的所述基本为椭圆形的横截面形状以基本相同方向定向以限定第一扭转区域,并且构成第二扭转区域的第三区域的所述基本为椭圆形的横截面形状以相对于第一和第二区域的所述基本为椭圆形的横截面形状成90度定向。
123.根据权利要求120所述的喷嘴,其特征在于,还包括用于将所述喷嘴安装在朝上的位置以沿着向上的轨迹引导所述流体流的安装座,并且所述喷嘴主体可在所述主体的纵向轴线上在所述安装座上转动。
124.一种用于在流式细胞术设备中为动物精细胞定向的方法,所述方法包括:
将包含精细胞的流体引入到流体流中;
在20至40psi的范围内的压力下引导包含所述精细胞的流体流通过喷嘴,所述喷嘴具有一个或者多个用于在朝向喷嘴孔的下游方向上增加所述流体流的速度的锥形区域,所述喷嘴孔的直径在50至70微米的范围内,所述区域的一个或者多个具有基本为椭圆形的横截面形状以细胞以每秒30000至50000个精细胞的范围内的速度通过所述孔时在所述流体流上施加扭力以趋于将精细胞带到所需取向。
125.根据权利要求124所述的方法,其特征在于,所述喷嘴具有三个或者多个用于使得流体流朝向喷嘴孔逐渐加速的锥形区域。
126.根据权利要求125所述的方法,其特征在于,所述喷嘴在所述三个或者多个锥形区域中具有由喷嘴的内表面限定的两个扭转区域。
127.一种用于分析在流体流中的颗粒的流式细胞术设备中的喷嘴,所述流体流包括包围包含所述颗粒的芯流的鞘流,所述喷嘴包括:
喷嘴,所述喷嘴具有为所述流体流限定流动路径的内表面和用于使得流体流从喷嘴排出的孔;以及
在喷嘴中的在所述孔上游位于所述流动路径中的挡板,所述挡板能够在流体流沿着所述流动路径移动时检测流体流,挡板和喷嘴的内表面被构造成当颗粒离开孔时使得颗粒处于所需取向。
128.根据权利要求127所述的喷嘴,其特征在于,所述挡板被构造成使所述芯流偏转离开喷嘴的中心纵向轴线并朝向喷嘴的所述内表面。
129.根据权利要求127所述的喷嘴,其特征在于,所述喷嘴的所述内表面成形为在所述挡板的下游限定至少两个轴向锥形区域,所述锥形区域用于在朝向喷嘴孔的下游方向上逐渐增加所述流体流的速度。
130.根据权利要求129所述的喷嘴,其特征在于,所述挡板被构造成朝向喷嘴的所述内表面中限定所述至少两个轴向锥形区域中的至少一个的一部分偏转所述芯流。
131.根据权利要求130所述的喷嘴,其特征在于,所述至少两个轴向锥形区域具有在不同方向上定向的基本为椭圆形的横截面形状以在所述流体流上施加扭力以趋于将颗粒带到所需取向。
132.一种用于在流式细胞术设备中为颗粒定向的方法,所述方法包括:
使得具有包含所述颗粒的样本流体的芯流和包围所述芯流的鞘流体的鞘流的流体流流过喷嘴,所述喷嘴具有从喷嘴的上游部分到位于喷嘴的下游端的孔基本呈锥形的内表面;以及
当芯流流过喷嘴时偏转芯流以使得芯流中的颗粒受到流体动力的作用趋于使得颗粒呈现所需取向。
133.根据权利要求132所述的方法,其特征在于,所述喷嘴具有纵向轴线,偏转芯流的步骤包括使所述芯流偏转离开纵向轴线而朝向所述内表面。
134.根据权利要求132所述的方法,其特征在于,所述偏转步骤包括利用挡板偏转芯流。
135.根据权利要求132所述的方法,其特征在于,所述喷嘴具有形状适于限定至少一个使得颗粒受到定向流体动力的作用的扭转区域的内表面。
136.一种处理动物精细胞的方法,包括下列步骤:
从雄性动物收集精细胞;
基于一个或者多个特定DNA特征将精细胞分拣到多个精细胞群组中的一个中;
从所述多个精细胞群组中的一个获得具有所需DNA特征的一定量精细胞,所述量的精细胞被包含在一定量的收集流体中;
使得所述一定量的收集流体受到第一离心分离处理以形成第一精细胞丸和覆盖第一丸的上层清液;
使得第一丸与上层清液分离;
使得上层清液经受附加的离心分离以在第一离心分离后形成保留在上层清液中的第二精细胞丸;以及
将一定量的再悬浮流体加入到第一和第二丸以获得具有所需DNA特征的精细胞的悬浮液,选择所述再悬浮流体的量以在悬浮液中形成所需浓度的精细胞。
137.根据权利要求136所述的方法,其特征在于,所述一个或者多个特定的DNA特征包括精细胞是否包含X或者Y性别染色体。
138.一种处理动物精细胞的方法,包括下列步骤:
利用流式细胞术基于一个或者多个特定DNA特征将精细胞分拣成不同的精细胞群组中,所述流式细胞术包括:将包含精细胞的样本流体输送到多个流式细胞术单元,每一个流式细胞术单元基于所述一个或者多个DNA特征分拣精细胞;操作所述单元同时共享一个集成平台,所述集成平台包括下列元件中的至少一个:(1)精细胞的公共供给源;(2)电磁辐射的公共源;(3)公共壳体;(4)用于控制单元操作的公共输入装置;(5)用于接收和处理来自于单元的信息以对一个单元相对于另一个单元的操作进行评估的公共处理器;以及(6)用于将包含所述精细胞的流体输送到所述流式细胞术单元的公共流体输送系统;以及
作为下列因素至少一个的函数改变输送流体的速度,这些因素包括:(1)具有所需DNA特征的第一分拣的精细胞群组的纯度;以及(2)在第二分拣群组中的具有所述所需DNA特征的精细胞量。
139.一种处理动物精细胞的方法,包括下列步骤:
利用流式细胞术基于一个或者多个特定DNA特征将精细胞分拣成不同的精细胞群组中,所述流式细胞术包括:将包含精细胞的样本流体输送到多个流式细胞术单元,每一个流式细胞术单元基于所述一个或者多个DNA特征分拣精细胞;操作所述单元同时共享一个集成平台,所述集成平台包括下列元件中的至少一个:(1)精细胞的公共供给源;(2)电磁辐射的公共源;(3)公共壳体;(4)用于控制单元操作的公共输入装置;(5)用于接收和处理来自于单元的信息以对一个单元相对于另一个单元的操作进行评估的公共处理器;以及(6)用于将包含所述精细胞的流体输送到所述流式细胞术单元的公共流体输送系统;以及
利用一个或者多个模拟数字转换器对来自于每一个流式细胞术单元的随时间变化的输出进行同步采样并且提供包括对应于所述随时间变化的模拟输出的数字信息的输出,其中所述随时间变化的模拟输出和相应的数字信息表示所述特定DNA特征。
140.一种处理动物精细胞的方法,包括下列步骤:
利用流式细胞术基于一个或者多个特定DNA特征将精细胞分拣成不同的精细胞群组中,所述流式细胞术包括:将包含精细胞的样本流体输送到多个流式细胞术单元,每一个流式细胞术单元基于所述一个或者多个DNA特征分拣精细胞;操作所述单元同时共享一个集成平台,所述集成平台包括下列元件中的至少一个:(1)精细胞的公共供给源;(2)电磁辐射的公共源;(3)公共壳体;(4)用于控制单元操作的公共输入装置;(5)用于接收和处理来自于单元的信息以对一个单元相对于另一个单元的操作进行评估的公共处理器;以及(6)用于将包含所述精细胞的流体输送到所述流式细胞术单元的公共流体输送系统;
从一个或者多个分拣的精细胞群组获得具有所需DNA特征的一定量的精细胞;
将低温保护剂加入到所述一定量的精细胞;
将所述一定量的精细胞和低温保护剂冷却到约0-8℃的保温温度;
使得所述精细胞和所述低温保护剂在基本所述保温温度下保持小于60分钟的时间;以及
将所述一定量精细胞过度冷却到-40℃的温度。
141.根据权利要求140所述的方法,其特征在于,还包括:
形成包含精细胞和DNA选择性荧光染料的着色混合物,以及使得着色混合物经受至少40℃的温度。
142.根据权利要求141所述的方法,其特征在于,着色混合物还包括抗氧化剂。
143.一种处理动物精细胞的方法,包括下列步骤:
从雄性动物收集精细胞;
利用DNA选择性荧光染料使精细胞着色;
利用电磁辐射照射精细胞以使得DNA选择性荧光染料发出荧光;
检测由精细胞发出的荧光;
分析由精细胞发出的荧光以确定精细胞的一个或者多个特定的DNA特征;
基于所述一个或者多个特定的DNA特征将精细胞分拣成多个精细胞群组;
从所述多个精细胞群组中的一个获得具有所需DNA特征的一定量的精细胞;以及
使得所述一定量的精细胞过度冷却;
其中,在收集精细胞后在小于约12小时的时间内完成过度冷却的步骤。
145.一种根据染色体含量分拣活精细胞的方法,包括:
(a)将DNA选择性荧光染料加入到活精细胞供给;
(b)使得包含所述精细胞的样本流体和鞘流体流过趋于使得精细胞转动到所需取向的定向喷嘴,所述样本流体和鞘流体以流体流的形式离开喷嘴,所述流体流包括由样本流体和精细胞形成的芯流和包围芯流的鞘流体流;
(c)为喷嘴提供声能以使得流体流在喷嘴下游的液滴分裂位置处分裂成液滴流;
(d)引导电磁辐射束在液滴分裂位置上游的询问位置处与流体流相交以激发在精细胞中的荧光染料,从而使得精细胞发出荧光;
(e)利用输出表示被检测的荧光发射的强度的随时间改变的模拟信号的光检测器检测发出的荧光;
(f)对所述随时间改变的模拟信号进行电子处理以确定多个精细胞的染色体含量;
(g)根据包含在液滴中的精细胞的染色体含量选择性地为流体流施加静电荷以选择性地为液滴施加电荷或者不施加电荷;
(h)利用电场根据它们的电荷使得液滴偏转,从而使得包含在具有相同电荷的液滴中精细胞与包含在具有不同电荷的液滴中精细胞分离;以及
(i)以至少每秒5000个精细胞的速度收集至少一个活精细胞群组。
146.根据权利要求145所述的方法,其特征在于,所述收集步骤包括以至少每秒7000个精细胞的速度收集至少一个活精细胞群组。
147.根据权利要求145所述的方法,其特征在于,还包括并行操作两个或者多个细胞术单元以使每一个执行步骤(b)至(i)同时共享一个集成平台,所述集成平台包括下列元件中的至少一个:(1)颗粒的公共供给源;(2)电磁辐射的公共源;(3)公共壳体;(4)用于控制单元操作的公共输入装置;(5)用于接收和处理来自于单元的信息以对一个单元相对于另一个单元的操作进行评估的公共处理器;以及(6)用于将包含所述颗粒的流体输送到所述流式细胞术单元的公共流体输送系统。
148.一种对用于分拣的细胞群组的着色的一组条件进行评估的程序,所述群组包括第一类型和第二类型的细胞,所述程序包括:
(a)在一组着色条件下利用荧光染料使得细胞群组的一部分着色;
(b)当着色的细胞以速度R通过流式细胞计的询问位置时使得着色细胞暴露在电磁辐射下;
(c)确定暴露的细胞的荧光发射特征;
(d)利用确定的荧光特征将暴露的细胞分类成两个或者多个细胞的子群组,其中一个子群组是第一细胞类型的浓缩子群组;
(e)确定浓缩子群组的细胞的荧光发射特征的变异系数以提供对着色条件的分拣效率的指示;以及
(f)确定是否改变在其下细胞要被着色的任何着色条件或者着色的细胞要通过流式细胞计的询问位置的速度R以提高分拣效率。
149.一种处理动物精细胞的方法,包括下列步骤:
从雄性动物收集精细胞;
分拣精细胞以获得具有所需特征的一定量的精细胞,所述一定量的被分拣的精细胞被包含在其中具有精细胞第一浓度的第一体积的流体中;以及
使得精细胞经受浓缩步骤,其中所述精细胞的浓度增加到大于所述第一浓度的第二浓度;
其中,所述浓缩步骤包括使得所述第一体积的流体的至少一部分在第一过滤器上的压力差小于20英寸汞柱下流过第一过滤器,所述过滤器具有足够小以阻止所述精细胞通过的过滤孔,并且保持包含所述精细胞的第二体积的未过滤的流体。
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