CN102037014A - 生物标记物 - Google Patents
生物标记物 Download PDFInfo
- Publication number
- CN102037014A CN102037014A CN2009801086204A CN200980108620A CN102037014A CN 102037014 A CN102037014 A CN 102037014A CN 2009801086204 A CN2009801086204 A CN 2009801086204A CN 200980108620 A CN200980108620 A CN 200980108620A CN 102037014 A CN102037014 A CN 102037014A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- ins
- level
- seq
- antibody
- acd
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07H—SUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
- C07H21/00—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids
- C07H21/04—Compounds containing two or more mononucleotide units having separate phosphate or polyphosphate groups linked by saccharide radicals of nucleoside groups, e.g. nucleic acids with deoxyribosyl as saccharide radical
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
- C07K16/26—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against hormones ; against hormone releasing or inhibiting factors
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
- C07K14/575—Hormones
- C07K14/62—Insulins
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
- C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
- G01N33/6893—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids related to diseases not provided for elsewhere
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
- G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
- G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
- G01N33/74—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving hormones or other non-cytokine intercellular protein regulatory factors such as growth factors, including receptors to hormones and growth factors
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/435—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
- G01N2333/575—Hormones
- G01N2333/62—Insulins
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/04—Endocrine or metabolic disorders
- G01N2800/042—Disorders of carbohydrate metabolism, e.g. diabetes, glucose metabolism
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/32—Cardiovascular disorders
- G01N2800/324—Coronary artery diseases, e.g. angina pectoris, myocardial infarction
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/50—Determining the risk of developing a disease
Abstract
本发明提供了胰岛素信号肽的结合剂和测定法。上述结合剂和测定法可用于预测、诊断、评估或监测对象的急性心脏疾病、葡萄糖代谢障碍以及糖尿病的方法中。还提供了可用于本发明的方法中的核苷酸、多肽、以及试剂盒。
Description
技术领域
本发明涉及胰岛素信号肽(INS-SP)以及其在预后、诊断和监测生物事件障碍或状态方面的应用,其中上述生物事件疾病或状态导致标记物释放到循环(血循环,circulation)中。上述事件包括葡萄糖代谢障碍、糖尿病以及相关病症如心血管疾病,尤其是急性心脏疾病。
背景技术
糖尿病是一种代谢病,其特征在于胰岛素分泌、胰岛素作用其中之一缺乏或全部缺乏。这些缺乏导致慢性高血糖症。糖尿病还具有许多相关病症(包括肥胖症)以及增加风险的心脏疾病(包括心血管疾病)。糖尿病在全世界影响1.7亿以上的人,并且预计在未来20年会加倍。
糖尿病分为两种类型,称作I型糖尿病和II型糖尿病。I型糖尿病是一种自身免疫相关疾病,其中个体的免疫系统会破坏胰腺的β细胞。患有I型糖尿病的个体通常是胰岛素依赖的。他们呈现有限的胰岛素分泌(若有的话)。
II型糖尿病是最常见形式,占90至95%的病例。大多数II型糖尿病对象并不是胰岛素依赖的,但呈现胰岛素分泌和胰岛素作用缺乏,从而导致高血糖症。高血糖症常常是温和的并具有难以识别的症状。因此,许多II型糖尿病对象许多年间都未被确诊。在任何特定时间,据估计,10至15%的群体可能具有发展成II型糖尿病的危险,但未被确诊。
糖尿病最常见是基于用来评估葡萄糖代谢(葡萄糖处理,glucose handling)的口服葡萄糖耐量试验来诊断。在隔夜空腹以后给予个体葡萄糖饮料以测试个体对葡萄糖的耐受性。该测试进行数小时以测量反应。不幸的是,葡萄糖耐量试验和空腹胰岛素水平测试缺乏敏感性,并且存在假阳性,其限制了它们作为糖尿病的预后指标的有用性。
糖尿病是心血管疾病的重要的危险因子,会使心脏事件的风险增加两至三倍。尽管认识到需要诊断和预后工具来评估个体发展糖尿病、前体葡萄糖代谢障碍、以及相关病症如心血管疾病的风险,但并没有简单而准确的测试。
本发明的一个目的是以一定方式来满足这些需要和/或至少为公众提供有用的选择。
糖尿病和前体葡萄糖代谢障碍、或任何其它形式的血糖代谢障碍或胰岛素血异常的早期诊断和正在进行的评估是重要的,不仅用于处理糖尿病,而且用于处理相关病症,如心血管疾病。除为与血糖代谢障碍或胰岛素血异常有关的病症、疾病提供早期检测方法以外,例如,本发明还具有更广泛的应用(包括在心血管领域)。
包括急性冠状动脉综合征(ACS)的急性心脏疾病涉及各种不同的心肌缺血事件:从不稳定型心绞痛到急性心肌梗死(AMI)。AMI表现为这些事件中最严重的事件,因而需要快速和准确的诊断。呈现两种或更多种所描述特点(缺血性胸部不适的病史、系列心电图(ECG)迹线的进化改变以及血浆心脏生物标记物的起落)的对象被明确确定为正经历AMI26。然而,相当一部分呈现疑似AMI的对象(40%-50%)并不具有ECG的系列变化、或典型的症状,因此更关注循环生物标记物浓度,以获得准确的诊断26,27。
心肌梗死的准确的早期诊断便于立刻采用再灌注治疗,包括有效的经皮或溶栓血管再生成以及附属的抗凝血和抗血小板治疗。随着每小时的诊断和处理延迟,上述治疗在减小死亡率和发病率方面的有效性逐步降低2-4。鉴于在这种临床情况中需要加速决策,所以需要鉴定循环生物标记物,以提供急性心脏疾病(尤其是,例如AMI)的早期和具体诊断。
目前的临床指南确实强调在鉴定心肌梗死和急性冠状动脉综合征中生物标记物测量的重要性26。许多生物标记物已被提出用于此目的,包括肌酸激酶-MB(CK-MB)、肌钙蛋白T(TnT)、肌钙蛋白I(TnI)、BNP、N-BNP(还称作NP-BNP)、BNP信号肽(BNP-SP)以及肌红蛋白,但对它们的使用存在限制。至血浆心脏生物标记物的可检测或异常升高的时间可以是6小时(肌红蛋白,CK-MB)至12小时(TnT、TnI、BNP、N-BNP),其中最高水平直到损伤发作以后的24-48小时才发生,这对精确的诊断和治疗强加了延迟窗口1-4。此外,肌红蛋白和CK-MB均是非特异性的并且可以分泌自心外来源,尤其是在外伤或手术期间1。
因而,已知标记物的长期诊断/预测能力缺乏特异性标记物的伴随能力,其中特异性标记物在临床表现的最初几小时内提供急性心脏疾病如急性心肌损伤的早期具体诊断。因此仍然需要早期标记物。
本发明的另一个目的是提供急性心脏疾病的早期标记物,和/或至少向公众提供有用的选择。
发明内容
人胰岛素信号肽(INS-SP)是切割自胰岛素原(前胰岛素原)(1-110)SEQ ID NO:1的24个氨基酸肽。人胰岛素的处理示于图4中。INS-SP(1-24)被分开显示在SEQ ID NO:14中。
本发明的申请人已首次发现,INS-SP以及其片段被释放到循环中。确定和提供了有用的循环生物标记物。先前认为,INS-SP仅在细胞内产生25。
基于此发现,本发明的申请人在本发明的一个方面提供了用于在对象中预测、诊断、评估或监测生物事件或障碍的方法,其中上述事件或障碍与一种或多种INS-SP生物标记物释放到循环中有关,该方法包括测量在获自或源自对象的样品中一种或多种INS-SP生物标记物的水平,然后连同所述一种或多种生物标记物的各自的参考值范围对上述水平进行分析。
在一种实施方式中,INS-SP生物标记物是INS-SP。在另一种实施方式中,INS-SP生物标记物是INS-SP片段。在一种优选实施方式中,INS-SP片段是人INS-SP(1-9)(SEQ ID NO:16)。在另一种优选实施方式中,INS-SP片段是人INS-SP(15-24)SEQ ID NO:18。在其它优选实施方式中,INS-SP片段包括人INS-SP(1-9)(SEQ IDNO:16)或人INS-SP(15-24)SEQ ID NO:18。
在另一种实施方式中,该方法包括比较在获自或源自对象的一个或多个样品中INS-SP生物标记物、优选INS-SP片段的水平与来自对照的INS-SP生物标记物水平,其中测量水平与对照水平的偏差指示生物事件或障碍。
在糖尿病对象如I型糖尿病对象中,或在患有另一种血糖代谢障碍(由降低的胰岛素分泌水平造成)的对象中,胰岛素水平将不同于正常水平,如INS-SP和/或INS-SP片段水平。此发现表明,INS-SP可用作上述病症的标记物。取决于对象的胰岛素状态,在对象中的INS-SP生物标记物水平将比正常水平更高或更低。
在糖尿病对象,如II型糖尿病对象中,或在患有另一种胰岛素血异常(dysinsulinemia)的对象中,胰岛素水平将不同于正常水平,如INS-SP和/或INS-SP片段水平。此发现表明,INS-SP和/或INS-SP片段也可用作上述病症以及其它高胰岛素血状态(hyperinsulinemic states)如代谢综合征的标记物。取决于对象的胰岛素状态,在对象中的INS-SP生物标记物水平将比正常水平更高或更低。
因此,在另一个方面,本发明提供了用于预测、诊断、评估或监测糖尿病或糖尿病可能性(潜在糖尿病,diabetes potential)、以及特点在于血糖代谢障碍和/或胰岛素血异常的其它病症的方法,该方法包括测量在获自或源自对象的样品中一种或多种INS-SP生物标记物的水平,然后连同所述一种或多种生物标记物的各自的参考值范围对上述水平进行分析。
在另一种实施方式中,该方法包括比较在获自或源自对象的一个或多个样品中INS-SP生物标记物、优选INS-SP片段的水平与来自对照的INS-SP生物标记物的水平,其中偏离对照水平的INS-SP的测量水平指示糖尿病或易患糖尿病的体质、或与血糖代谢障碍和/或胰岛素血异常有关的另一种病症。在一种实施方式中,INS-SP生物标记物水平可以低于对照水平。
本发明还提供了用于评估对象的葡萄糖代谢的方法,该方法包括:
(a)在给予葡萄糖以后,测量对象中INS-SP生物标记物、优选INS-SP片段的水平;以及
(b)比较所述INS-SP与来自对照INS-SP的水平,
其中INS-SP的测量水平与对照水平的偏差指示葡萄糖代谢障碍。
本发明的申请人还令人惊讶地发现,在疑似急性冠状动脉综合征(ACS)的发作或临床表现以后的最初几小时内INS-SP生物标记物的循环浓度是最高的。在上述最初的几小时内,峰值是正常对照群体的约5至15倍。
因此,在另外的方面,本发明提供了用于在对象中预测、诊断或监测急性心脏疾病(ACD)的方法,该方法包括测量在来自对象的生物样品中INS-SP生物标记物、优选INS-SP片段的水平,然后比较所述INS-SP生物标记物的水平与来自对照或参考值或数值范围的INS-SP和/或INS-SP片段的水平,其中高于对照水平、或预先确定的参考值或数值范围的INS-SP生物标记物的测量水平指示ACD。
本发明还提供了用于对象中监测对急性心脏疾病(ACD)的治疗的响应的方法,该方法包括测量在获自或源自对象的生物样品中INS-SP生物标记物、优选INS-SP片段的水平,然后比较所述INS-SP生物标记物的水平与来自对照或参考值或数值范围的INS-SP生物标记物水平,其中INS-SP生物标记物的测量水平相比对照水平、或预先确定的参考值或数值范围的变化指示响应治疗。
在另一个方面,本发明还提供了用于在对象中预测、诊断或监测心脏移植排斥反应的方法,该方法包括在心脏移植以后测量在获自或源自对象的生物样品中INS-SP生物标记物、优选INS-SP片段的水平,然后比较所述INS-SP生物标记物的水平与来自对照或参考值或数值范围的INS-SP生物标记物水平,其中高于对照水平、或预先确定的参考值或数值范围的INS-SP生物标记物的测量水平指示移植排斥或移植排斥反应。
本发明还提供了用于在对象中区别肺疾病和急性心脏疾病(ACD)的方法,该方法包括测量在获自或源自对象的生物样品中INS-SP生物标记物、优选INS-SP片段的水平,然后比较所述INS-SP生物标记物的水平与来自对照、或预先确定的参考值或数值范围的INS-SP生物标记物水平,其中高于对照水平、或预先确定的参考值或数值范围的INS-SP生物标记物的测量水平指示ACD。
本发明还提供了用于在对象中预测、诊断或监测急性心脏疾病(ACD)、心脏移植排斥、或ACD/肺疾病的方法,该方法包括在ACD、心脏移植排斥或ACD/肺疾病的发作或临床表现的约最初的2小时内,测量在获自或源自对象的生物样品中INS-SP生物标记物、优选INS-SP片段的水平,比较INS-SP生物标记物的测量水平与来自对照、或参考值或数值范围的INS-SP生物标记物水平,其中高于对照水平、或预先确定的参考值或数值范围的INS-SP生物标记物的测量水平指示ACD或心脏移植排斥、或移植排斥反应(transplant rejection episode)。
在一种更广泛的实施方式中,本发明的申请人的发现可以用来预测、诊断、评估或监测任何事件,其中INS-SP、或INS-SP片段被释放到循环中。
在本发明的心脏方法的一种实施方式中,在疾病表现或其发生的约6小时、约4小时、约2小时、约1小时、约30分钟内,或约15分钟内,测量获自对象的样品(样品衍生物)的INS-SP生物标记物水平一次或多次。本发明包括在6小时、4小时、2小时、1小时、半小时、以及四分之一小时内的单次或多次INS-SP生物标记物测量。还包括在6小时以后,对随后获自或源自对象的样品,测量INS-SP生物标记物或另外测量INS-SP生物标记物。
在一种实施方式中,本发明的方法是体外方法。
在一种实施方式中,样品是血液、唾液、间质液、血浆、尿液、血清或心脏组织。在一种优选实施方式中,样品是血液或血浆。
在一种实施方式中,测量步骤包括检测INS-SP和结合剂之间的结合,其中结合剂选择性地结合INS-SP。在一种实施方式中,测量步骤包括:
(a)使INS-SP生物标记物结合于结合剂;以及
(b)测量结合INS-SP生物标记物的水平。
在一种实施方式中,结合剂是抗体或其抗原结合片段。最常见地,抗体是单克隆、多克隆、双特异性、嵌合或人源化抗体。在一种实施方式中,抗体是单克隆抗体。
在另一种实施方式中,利用质谱法来测量INS-SP生物标记物的水平。
由抗体结合或检测的INS-SP生物标记物是全长人INS-SP分子(SEQ ID NO:14)或其抗原变体或片段。在一种实施方式中,片段的长度为至少4个连续氨基酸。在另一种实施方式中,结合或检测的片段是人INS-SP(1-9)(SEQ ID NO:16)、INS-SP(15-24)SEQ ID NO:18。抗体可以结合INS-SP或INS-SP片段的N端或C端。
结合剂选择性地结合的特异性抗原肽包括人INS-SP(1-9)(SEQ ID NO:16)、INS-SP(15-24)SEQ ID NO:18、或它们的抗原结合片段或变体。
在一种实施方式中,利用固定在固相上的抗体或抗体片段来测量INS-SP生物标记物的结合。
通常可以借助于一种测定来测量INS-SP生物标记物的水平,其中上述测定选自RIA、ELISA、荧光免疫测定法、免疫荧光测定试验、质谱法以及免疫放射测定试验。
因此,本发明还提供了用于在来自对象的生物样品中对INS-SP生物标记物的测定,该测定包括利用任何已知方法来检测和测量在样品或样品衍生物中的INS-SP生物标记物的水平。
本发明还提供了对INS-SP生物标记物的测定,包括:
(a)结合来自样品的一种或多种INS-SP生物标记物;以及
(b)测量结合的INS-SP生物标记物的水平。
可以利用本发明的INS-SP生物标记物-结合剂来结合INS-SP生物标记物。
本发明还提供了INS-SP生物标记物测定,用于预测、诊断、评估或监测对象中的生物事件或障碍。
在一种实施方式中,该测定是体外测定。
本发明的血糖代谢障碍相关方法可以进一步包括测量例如糖尿病的一种或多种非INS-SP/INS-SP片段标记物的水平,并比较所述水平与来自对照的标记物水平,其中测量水平与非INS-SP标记物的对照水平的偏差、连同偏离或低于INS-SP的对照水平的INS-SP的测量水平一起,可以预测或诊断例如糖尿病,或可以用来监测例如糖尿病。用于糖尿病的非INS-SP/INS-SP片段标记物可以包括葡萄糖、胰岛素、乳酸酯以及甘油三酯或脂肪酸水平或它们的标记物。其它标记物包括HbAlC和果糖胺。
本发明的心脏相关方法可以进一步包括测量所述ACD、或心脏移植排斥、或ACD/肺疾病的一种或多种非INS-SP或非INS-SP片段标记物的水平,并比较上述水平与来自对照或参考值或数值范围的标记物水平,其中测量水平与非INS-SP标记物的对照或参考水平的偏差、连同高于对照或参考INS-SP生物标记物水平的INS-SP生物标记物的测量水平一起,可以预测或诊断ACD,或可以用来评估或监测所述ACD(包括心脏移植排斥)或ACD/肺疾病。
用于急性冠状动脉综合征的标记物包括肌钙蛋白、肌钙蛋白T、肌钙蛋白I、肌酸激酶MB、肌红蛋白、BNP、NT-BNP、BNP-SP、BNP-SP片段、ANP、ANP-SP、ANP-SP片段、LDH、天冬氨酸转氨酶、心脏特异性脂肪酸结合蛋白(H-FABP)、缺血修饰白蛋白、内皮素、肾上腺髓质素以及血管紧张素II。
在另一个方面,本发明还提供了INS-SP生物标记物结合剂。在一种实施方式中,本发明的INS-SP生物标记物结合剂结合或检测:
(a)INS-SP(1-24)SEQ ID NO:14;
(b)INS-SP(1-9)SEQ ID NO:16;
(c)INS-SP(15-24)SEQ ID NO:18;
(d)由选自SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:17以及SEQ ID NO:19的核苷酸序列编码的氨基酸序列;或
(e)(a)至(d)的任何一种的变体或片段。
结合剂可用于预测、诊断、评估或监测生物事件或障碍,其与INS-SP或INS-SP片段释放到循环中有关。上述事件或障碍包括对象的糖尿病、葡萄糖代谢障碍、以及急性心脏疾病(ACD)。
在一种实施方式中,结合剂是抗INS-SP抗体或抗INS-SP片段抗体或任何一种的抗原结合片段。
本发明还提供了抗INS-SP生物标记物抗体或其抗原结合片段,其结合:
(a)INS-SP 1-24(SEQ ID NO:14);
(b)INS-SP 1-9(SEQ ID NO:16);
(c)INS-SP 15-24(SEQ ID NO:18);以及
(d)由选自SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:17以及SEQ ID NO:19的核苷酸序列编码的氨基酸序列;或
(e)(a)至(d)的任何一种的变体或片段。
抗体可以是单克隆、多克隆、双特异性、嵌合、或人源化抗体,或任何一种的结合片段或构建体(construct)。
本发明还涉及INS-SP生物标记物结合剂在制备(manufacture)INS-SP生物标记物测定以评估对象中的生物事件或障碍中的应用,或涉及INS-SP生物标记物结合剂在制造一种工具中的应用,该工具用于预后、诊断、评估或监测对象中的生物事件或障碍。在一种实施方式中,事件或障碍与INS-SP和/或INS-SP片段释放到循环中有关,包括来自葡萄糖代谢障碍、糖尿病、或急性心脏疾病(ACD)。
本发明还涉及本发明的抗体或抗原结合片段在制造预后、诊断、评估或监测生物事件的工具中的应用,其中上述生物事件与INS-SP和/或INS-SP片段释放到循环中有关并且包括对象中的葡萄糖代谢障碍、糖尿病、急性心脏疾病(ACD)、心脏移植排斥或ACD/肺疾病。
在一种实施方式中,对预后、诊断或监测工具进行校准以测量约0.1至约500pmol/L、或约1至约300pmol/L、或约10至约250pmol/L范围内的INS-SP水平。
在另一个方面,本发明提供了用于在对象中预测、诊断或监测生物事件的试剂盒,该试剂盒包括本发明的INS-SP生物标记物结合剂。
在一种实施方式中,对试剂盒进行校准以测量约0.1至约500pmol/L、约1至约300pmol/L、或约10至约250pmol/L范围内的INS-SP生物标记物水平。
在一种实施方式中,试剂盒还包括用法说明书,用于根据在样品或样品衍生物中测得的INS-SP生物标记物水平并通过比较测量水平与对照或参考水平,来预测、诊断、评估或监测对象中的生物事件或障碍,包括,例如糖尿病或ACD。偏离对照或参考水平的INS-SP生物标记物的测量水平指示生物事件或障碍,如,例如,葡萄糖代谢障碍、糖尿病或ACD(包括移植排斥)。
在另一个方面,本发明涉及编码本发明的INS-SP片段的核酸分子,其中所述核酸选自
(a)SEQ ID NO:17或其变体或片段;
(b)SEQ ID NO:19或其变体或片段;
(c)相对于(a)或(b)具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%、或99%序列同一性的序列;
(d)在严格条件下能够杂交于(a)至(c)的任何一种的长度为至少10个核苷酸的序列;以及
(e)(a)至(d)的任何一种的补体
条件是该序列不是SEQ ID NO:15。
在一种实施方式中,由核酸分子编码的INS-SP片段是INS-SP(1-9)SEQ ID NO:16、或INS-SP(15-24)SEQ ID NO:18。
本发明还提供了包含本发明的核酸分子的基因构建体。在一种实施方式中,基因构建体是表达构建体。本发明还提供了包含基因构建体的载体,包含基因构建体或载体的宿主细胞,由本发明的核酸分子编码的多肽,选择性地结合本发明的多肽的抗体,以及用于重组产生本发明的多肽的方法。
因此,在另一个方面,本发明提供了分离的INS-SP生物标记物多肽或其变体或片段,它们选自
(a)INS-SP(1-9)SEQ ID NO:16或其变体或片段;
(b)INS-SP(15-24)SEQ ID NO:18或其变体或片段;
(c)相对于(a)或(b)具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%、或99%氨基酸同一性的氨基酸序列;以及
(d)由本发明的核酸分子编码的INS-SP多肽。
本发明还涉及本发明的多肽在制备抗INS-SP生物标记物抗体中的应用。
用于重组产生本发明的多肽的方法包括以下步骤:
(a)培养包含本发明的基因构建体并且能够表达本发明的多肽的宿主细胞;
(b)选择表达本发明的多肽的细胞;
(c)从细胞中分离表达的多肽;以及可选地
(d)纯化表达的多肽。
在一种实施方式中,该方法包括用构建体转染宿主细胞的预先步骤。
附图说明
现将参照附图来描述本发明,其中
图1是条线图,其示出患者中的循环INS-SP生物标记物浓度源自心脏来源。
图2示出放射免疫测定的结果,其示出,在从入院时开始,在获自AMI患者(n=9)的血浆中INS-SP生物标记物的浓度(实心圆点(filled circles))。在入院时,观测到INS-SP生物标记物的最高水平,该最高水平平均为正常健康个体中测得水平的大约5至15倍;
图3示出放射免疫测定的结果,该结果表明,通过口服摄入75g葡萄糖(一种用于代谢负荷下胰岛素敏感性和释放的常用试验),在正常的健康志愿者中,免疫反应性血浆胰岛素-SPn生物标记物,与胰岛素本身相比,被显著降低。
图4是示意图,其概述人前胰岛素原的加工,导致产生自由信号C肽以及胰岛素α和β链。
图5示出来自小鼠、猫、羊、猪、人以及大鼠的胰岛素信号肽的共有序列比对(一致性比对,consensus alignment)。
定义
急性心脏疾病(ACD)包括但不限于:急性冠状动脉综合征,包括在呈现ECG时具有ST段抬高的急性心肌梗死(AMI),不稳定型心绞痛,以及急性非ST段抬高型心肌梗死;心肌缺血;急性心肌损伤;急性药物毒性造成的急性心肌损害,急性心肌病,以及心脏移植排斥。这些疾病的充分描述、定义可参见参考文献1。
ACD/肺疾病是指患有未确诊的、或疑似ACD或肺疾病的对象。
急性冠状动脉综合征(ACS)包括各种不同的心肌缺血事件,包括不稳定型心绞痛,在呈现的心电图(ECG)上具有ST段抬高的急性心肌梗死,以及在ECG上没有ST段抬高的急性心肌梗死。
术语″抗体″是指具有特定结构的免疫球蛋白分子,其特异性地相互作用(结合)于包含抗原(用于合成抗体)的分子或特异性地相互作用(结合)于与它密切相关的抗原。如在本文中所使用的,术语″抗体″广泛地包括全长抗体并且还可以包括它们的某些抗体片段。还包括单克隆和多克隆抗体、多价和单价抗体、多特异性抗体(例如双特异性抗体)、嵌合抗体、人抗体、人源化抗体以及具有成熟亲和力的抗体。如果抗体优先结合于INS-SP,例如与非INS-SP多肽具有小于25%、或小于10%、或小于1%或小于0.1%的交叉反应性,则抗体选择性地或特异性地结合于本发明的INS-SP多肽。通常,对于抗原或表位,抗体将具有不大于10-6、或10-7M、或小于约10-8M、或10-9M、或10-10、或10-11或10-12M的结合亲和力(解离常数(Kd)值)。可以例如利用表面等离子体共振、或标准Scatchard分析,来评估结合亲和力。
如在本文中所使用的,″抗原结合片段″或″抗体片段″是指完整抗体的一部分,该部分保留它从其衍生的抗体的正常的抗原结合。抗体片段的实例包括Fab、Fab′、F(ab′)2以及Fv片段、线性抗体、双体分子(diabodies)、单链抗体(ScFV)以及多特异性抗体。
如在本文中所使用的,″单克隆抗体″是指这样的抗体,其相对于单靶抗原是高度特异性抗体。单克隆抗体可以获自同源或基本同源抗体的群体,其中,除了可能少量发生的自然突变,每个单克隆抗体是相同的和/或结合相同表位。
″分离的抗体″是已鉴定的抗体,其已分离或回收(或分离并回收)自它的自然环境的部分中。例如,分离自包括酶和激素的蛋白质。在一种实施方式中,将抗体纯化至按重量计至少95%、或96%或97%或98%或99%的抗体。可以通过例如劳氏法来确定纯度。通常,通过至少一个纯化步骤来制备抗体。
如在本文中所使用的,术语″结合剂″是指任何固体或非固体材料,其能够结合INS-SP或其片段或变体。在一种实施方式中,该术语是指任何天然或非天然分子,其结合于INS-SP或其片段或变体。结合剂的实例包括蛋白质、肽、核酸、碳水化合物、脂质、以及小分子化合物。一种选择性或特异性结合剂是抗体或其抗原结合片段。
如在本文中所使用的,样品或生物样品是指获自或源自待筛查对象的任何样品。样品可以是本领域已知的任何样品,其中可以检测INS-SP生物标记物。包括任何体液如血浆、血液、唾液、间质液、血清、尿液、滑液、脑脊液、淋巴液、精液、羊膜液、心包液和腹水,以及组织如心脏组织,但不限于此。
术语″表位″包括任何蛋白质决定子,其能够特异结合于免疫球蛋白和/或T细胞受体。即,在抗原上的B和/或T细胞对其响应的位点。抗原决定簇(表位决定子,epitopic determinant)通常包括分子的化学活性表面基团如氨基酸或糖侧链,并且通常具有特定的三维结构特征、以及特定的电荷特性。表位通常包括至少3、5或通常8-10个氨基酸。这些氨基酸可以是连续的、或通过三级折叠并列的非连续氨基酸。
术语“在发作或临床表现的6小时内”包括在医疗设施处例如ACD、心脏移植排斥或未确诊的或疑似ACD/肺疾病的发作或表现的1分钟直至并包括360分钟。可以在发作或表现的4小时(从1分钟直至并包括240分钟)内、在2小时(从1分钟直至并包括120分钟)内或在1小时(从1分钟直至并包括60分钟)内、在发作或表现的5至45分钟、15至40分钟、20至35分钟内、或在25至30分钟内,进行测量。
在一种实施方式中,比对照或参考值″更高″或″更低″的水平,或与对照或参考值的变化、差异、或偏差是统计上显著的。如果和对照或参考水平相比,与对照或参考水平的水平差异为约5%或更大、约10%或更大、约20%或更大、或约50%或更大,则可以认为存在更高水平、更低水平,与对照或参考水平或平均对照或参考水平存在差异、或偏差,或变化。统计上的显著性可以可替换地被计算为P≤0.05。在一种进一步的可替换实施方式中,可以通过借助于测定参考限度或参考区间来确定更高水平、更低水平、偏差、以及变化。这些可以计算自直观评估或非参数方法。一般来说,这些方法计算0.025以及0.975分位数作为0.025*(n+1)以及0.975(n+1)。这样的方法在本领域是众所周知的22,23。存在对照中不存在的标记物(包括INS-SP),例如,也被设想为更高水平、偏差或变化。不存在在对照中存在的标记物(包括INS-SP)也被设想为更低水平、偏差或变化。
包括获自或源自任何对象的样品如来自没有生物事件或障碍(包括葡萄糖代谢障碍、糖尿病或ACD)的临床病史的正常健康对象以及患有各种ACD的对象,其中上述ACD包括但不限于在呈现的ECG上具有ST段抬高的急性冠状动脉综合征(AMI),不稳定型心绞痛,以及急性非ST段抬高型MI;心肌缺血;急性心肌损伤;急性药物毒性造成的急性心肌损害、急性心肌病、以及心脏移植排斥。
如在本文中所使用的,术语″心肌病″是指心肌的疾病,其中心肌变虚弱。这可以导致心脏抽吸减少。心肌病的常见原因是心脏病发作、病毒感染、高血压、酒精中毒、以及自身免疫病。
如在本文中所使用的,生物事件或障碍是指这样一类事件,其中INS-SP生物标记物被释放到对象的循环中,包括急性和慢性病症。典型的病症包括代谢病如肥胖症、糖尿病、肾病、葡萄糖代谢障碍,其包括代谢综合征、葡萄糖不耐受、高血糖、以及胰岛素抗性;非酒精性脂肪肝病(包括非酒精性脂肪肝炎(steatohepatitis))和脂肪肝病(包括酒精性肝病)、心血管疾病(包括ACD如但不限于急性冠状动脉综合征)。慢性病症的实例是糖尿病和心血管疾病。
术语INS-SP是指用于人前胰岛素原序列(1-110)(SEQ ID NO:1)的完全24个氨基酸INS信号肽。INS-SP(1-24)分开显示在SEQ IDNO:14中。INS-SP生物标记物包括INS-SP以及INS-SP衍生或INS-SP相关的多肽,其包括INS-SP的变体或片段,或基本上由、或由INS-SP的变体或片段组成。可用作INS-SP生物标记物的片段包括INS-SP(1-9)SEQ ID NO:16以及INS-SP(15-24)SEQ ID NO:18。在一种实施方式中,INS-SP作为信号多肽,或作为抗体可以与其结合的抗原多肽。INS-SP的变体和片段包括保留至少抗原性功能的变体和片段。
如在本说明书和权利要求中所使用的,术语″包括″是指“至少部分由...组成”;这就是说,当解释在包括″包括″的本说明书和权利要求中的陈述时,在每个陈述中以此术语为开端的特征均需存在,但也可以存在其它特征。以类似方式解释相关术语如″包含″。
如在本文中所使用的,术语″糖尿病″包括I型(糖尿病)和II型糖尿病。I型糖尿病被定义为慢性高血糖的状态。在葡萄糖耐量试验2小时以后、或在随机样品中,大于7.0mmol/L和/或超过11.1mmol/L的数值的空腹静脉血浆葡萄糖水平指示I型糖尿病(参见Oxford Textbook of Medicine,Warrell et al;4th Ed,2005,p317)。
如在本文中所使用的,术语″葡萄糖代谢障碍″包括高血糖和低血糖的各种状态(包括代谢综合征)。高血糖状态包括糖耐量减低(IGT)和空腹血糖受损(IFG)。小于7.0mmol/L的空腹静脉血浆葡萄糖水平和在2小时的葡萄糖耐量试验值在7.8和11.1mmol/L之间指示IGT。6.1至6.9mmol/L的空腹血糖水平指示IFG(参见OxfordTextbook of Medicine,上文)。
如在本文中所使用的,术语″葡萄糖耐量试验″是指众所周知的葡萄糖试验,其通常在空腹以后进行,其中对象喝溶解在250ml水中的75g无水葡萄糖(参见Oxford Textbook of Medicine,上文)。
如在本文中所使用的,术语″多核苷酸″是指任何长度的单或双链脱氧核糖核苷酸或核糖核苷酸聚合物,并且作为非限制性实例包括基因的编码和非编码序列、有义和反义序列、外显子、内含子、基因组DNA、cDNA、mRNA前体、mRNA、rRNA、siRNA、miRNA、tRNA、核酶、重组多核苷酸、分离和纯化的天然存在的DNA或RNA序列、合成RNA和DNA序列、核酸探针、引物、片段、基因构建体、载体以及修饰多核苷酸。可以类似地理解核酸分子。
本文提供的多核苷酸序列的″片段″是连续核苷酸的亚序列,该亚序列能够特异性地杂交于感兴趣的靶,例如,长度为至少10个核苷酸的序列。在一种实施方式中,本发明的片段包含SEQ ID NO:15的多核苷酸中至少10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、或71个连续核苷酸。多核苷酸序列的片段可以用作引物、探针、包括在微阵列中、或用于本文的基于多核苷酸的选择方法中。应当类似地理解本发明的其它多核苷酸的片段(如SEQ ID NO:17或SEQ ID NO:19)或本文描述的多核苷酸。例如,INS-SP(1-9)SEQ ID NO:17和INS-SP(15-24)SEQ ID NO:19片段分别具有SEQ ID NO:17或SEQ ID NO:19的至少10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28或29个连续核苷酸。
术语″引物″是指短多核苷酸,通常具有自由的3′OH基团,其杂交于模板并用于引发互补于靶的多核苷酸的聚合作用。
术语″探针″是指短多核苷酸,在基于杂交的测定中,该短多核苷酸用来检测互补于探针的多核苷酸序列。探针可以包括如本文所定义的多核苷酸的″片段″。
如在本文中所使用的,术语″多肽″包括任何长度的氨基酸链,包括全长序列,其中通过共价键来连接氨基酸残基。可用于本发明的多肽可以是纯化的天然产物,或可以部分或全部地利用重组或合成技术来产生。该术语可以指多肽、多肽的聚集体如二聚体或其它多聚体、融合多肽、多肽片段、多肽变体、或它们的衍生物。本文中的多肽可以具有全长INS-SP蛋白(SEQ ID NO:14)的至少4个氨基酸、至少5个氨基酸、至少6、至少7、至少8、至少9、至少10、至少11、至少12、至少13、至少14、至少15、至少16、至少17、至少18、至少19、至少20、至少21、至少22、至少23、或所有24个氨基酸的链长。应当类似地理解本发明的其它多肽(如SEQ IDNO:16或SEQ ID NO:18)、或本文描述的其它多肽。
多肽的″片段″是多肽的亚序列,其执行生物活性或结合所需要的功能和/或提供多肽的三维结构。该术语可以指多肽、多肽的聚集体如二聚体或其它多聚体、融合多肽、多肽片段、多肽变体、或它们的衍生物。在一种实施方式中,片段能够执行上述信号肽活性,或保留INS-SP(1-24)、INS-SP(1-9)、或INS-SP(15-24)、或本发明的其它多肽或本文描述的多肽的抗原结合特性。
当应用于本文披露的多核苷酸或多肽序列时,术语″分离的″用来指从它们的天然细胞环境中分离出来的序列。可以通过任何方法或方法的组合来获得分离的分子,包括生化、重组、以及合成技术。可以通过至少一个纯化步骤来制备多核苷酸或多肽序列。
如在本文中所使用的,术语″纯化的″并不需要绝对纯度。在一种实施方式中,纯化的是指在样品中多核苷酸、多肽抗体、或宿主细胞至少90%、或95%、或98%、或99%的同源性。相对于本文描述的其它分子和构建体,应类似地理解该术语。
当用于细胞或宿主细胞时,术语″分离的″描述这样的细胞或宿主细胞,其已获得或分离自生物体或其自然环境,并且随后被保持在如本领域已知的实验室环境中。该术语并不限于单细胞本身,而且指包含在细胞培养中的细胞或宿主细胞,并且可以包括单细胞或单宿主细胞。
术语″重组″是指这样的多核苷酸序列,其从自然情况下围绕它的序列分离出来和/或重组于在自然情况下并不存在的序列。
由″重组″多核苷酸序列翻译而产生″重组″多肽序列。
如在本文中所使用的,术语″变体″是指不同于具体鉴定序列的多核苷酸或多肽序列,其中1至18或更多核苷酸、以及1至6或更多氨基酸残基被缺失、取代、或添加。具体设想1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17或18个核苷酸的取代。还设想1、2、3、4、5或6个氨基酸的取代、添加或缺失。变体可以是天然存在的等位基因变体、或非天然存在的变体。变体可以来自相同或来自其它物种并且可以包括同源物、旁系同源物(paralogues)以及直系同源物(orthologues)。在某些实施方式中,可用于本发明的多肽的变体具有包括信号肽活性或抗原结合特性的生物活性,其相同于或类似于亲代多肽或多核苷酸的生物活性。关于多核苷酸和多肽的术语″变体″包括如本文所定义的所有形式的多核苷酸和多肽。
相对于本发明的序列,变体多核苷酸序列呈现至少50%、至少60%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%的同一性。借助于至少10个核苷酸位置、至少15个核苷酸位置、至少20个核苷酸位置、至少27个核苷酸位置、至少40个核苷酸位置、至少50个核苷酸位置、至少60、至少65、或至少70个核苷酸位置的对比窗,或借助于SEQ ID NO:15的全长多核苷酸,来确定同一性。对于本文披露的其它多核苷酸,可以类似地确定同一性。例如,对于SEQ ID NO:17或SEQ ID NO:19,对比窗可以是至少10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30个核苷酸位置。
可以基于候选和主题多核苷酸序列之间的重叠序列的全长来计算多核苷酸序列同一性,其中利用全局序列比对(global sequence alignment)程序(例如Needleman,S.B.and Wunsch,C.D.(1970)J.MoI.Biol.48,443-453)。Needleman-Wunsch全局比对算法的全面实施参见EMBOSS程序包中的针程序(Rice,P.Longden,I.and Bleasby,A.EMBOSS:The European Molecular Biology Open Software Suite,Trends in Genetics June 2000,vol 16,No 6.pp.276-277),其可以获自http://www.hgmp.mrc.ac.uk/Software/EMBOSS/。欧洲生物信息研究所服务器还提供设施以在两个序列之间在线进行EMBOSS-针全局比对(http:/www.ebi.ac.uk/emboss/align/)。
可替换地,可以使用GAP程序,其计算两个序列的最佳全局比对而没有罚分末端间隙。在以下论文中描述了GAP:Huang,X.(1994)On Global Sequence Alignment(Computer Applications in the Biosciences 10,227-235)。
多核苷酸变体还包括那些变体,其呈现与一个或多个具体鉴定序列的相似性,其很可能保存那些序列的功能对等并且将不能合理地预计以随机机会已发生。
此程序发现在序列之间相似性的区域并且对于每个这样的区域报道″E值″,该E值是在包含随机序列的固定参考大小的数据库中可以预计偶然看到这样的配对的次数的预计数。这种数据库的大小在bl2seq程序中默认设置。对于较小的E值(远小于1),E值大约是这样的随机配对的概率。
当和任何一种具体鉴定序列比较时,变体多核苷酸序列优选呈现小于1x10-5、小于1x10-6、小于1x10-9、小于1x10-12、小于1x10-15、小于1x10-18或小于1x10-21的E值。
还可以下述方式来确定多核苷酸序列同一性和相似性。利用序列比对算法和序列相似性搜索工具如在Genbank、EMBL、Swiss-PROT以及其它数据库中,比较主题多核苷酸序列和候选多核苷酸序列。Nucleic Acids Res 29:1-10 and 11-16,2001提供了在线资源的实例。
BLASTN优选用于确定根据本发明的多核苷酸变体的序列同一性。
BLASTN(来自BLAST成套程序,版本2.2.,2008年4月18日,在bl2seq中(Tatiana A.et al,FEMS Microbiol Lett.174:247-250(1999)、Altschul et al.,Nuc.Acis Res 25:3389-3402,(1997))可公开获自NCBI(ftp://fto.ncbi.nih.gov/blast/)或获自NCBl(于Bethesda,Maryland,USA)。除了应关闭低复杂性部分的过滤,采用bl2seq的默认参数。
可以使用以下UNIX命令行参数来检查多核苷酸序列的同一性:
bl2seq-inucleotideseql-jnucleotideseq2-F F-p blastn
参数-F F关闭低复杂性部分的过滤。参数-p选择用于序列对的适当的算法。在行″Identities=″中,bl2seq程序将序列同一性报道为相同核苷酸的数量和百分比。
可替换地,变体多核苷酸是这样的多核苷酸,该多核苷酸在严格条件下杂交于指定的多核苷酸序列、或其补体。
术语″在严格条件下杂交″、以及其语法等效表述,是指在温度和盐浓度的规定条件下,多核苷酸分子杂交于靶多核苷酸分子(如固定在DNA或RNA印迹上的靶多核苷酸分子,如Southern印迹或Northern印迹)的能力。可以通过在较低严格条件下的最初杂交,然后增加严格性至所期望的严格性,来确定在严格杂交条件下杂交的能力。
关于长度大于约100个碱基的多核苷酸分子,典型的严格杂交条件是低于天然双链体的解链温度(Tm)不大于25至30℃(例如,10℃)(一般地参见,Sambrook et al,Eds,1987,Molecular Cloning,ALaboratory Manual,2nd Ed.Cold Spring Harbor Press;Ausubel et al,1987,Current Protocols in Molecular Biology,Greene Publishing,其以引用方式结合于本文)。可以通过公式Tm=81.5+0.41%(G+C-log(Na+)来计算大于约100个碱基的多核苷酸分子的Tm(Sambrook et al,Eds,1987,Molecular Cloning,A Laboratory Manual,2nd Ed.ColdSpring Harbor Press;Bolton and McCarthy,1962,PNAS 84:1390)。用于长度大于100个碱基的多核苷酸的典型的严格条件将是杂交条件如在6X SSC、0.2%SDS的溶液中预洗涤;在65℃、6X SSC、0.2%SDS下杂交过夜;接着两次30分钟的洗涤,每次在IX SSC、0.1%SDS中,于65℃下,以及两次30分钟的洗涤,每次在0.2X SSC、0.1%SDS中,于65℃下。
在一种实施方式中,严格条件使用在42℃下的50%甲酰胺、5xSSC、50mM磷酸钠(pH 6.8)、0.1%焦磷酸钠、5x登哈特溶液、经超声处理的鲑鱼精子DNA(50μg/ml)、0.1%SDS、以及10%硫酸葡聚糖,在42℃下在0.2xSSC中洗涤以及在55℃下在50%甲酰胺中洗涤,接着在55℃下用包含EDTA的0.1xSSC洗涤。
关于长度小于100个碱基的多核苷酸分子,典型的严格杂交条件是低于Tm 5至10℃。平均来说,长度小于100bp的多核苷酸分子的Tm被降低大约(500/寡核苷酸长度)℃。
关于DNA模拟物,其称作肽核酸(PNA)(Nielsen et al,Science.1991 Dec 6;254(5037):1497-500),Tm值高于DNA-DNA或DNA-RNA杂交体的Tm值,并且可以利用在Giesen et al,Nucleic Acids Res.1998 Nov l;26(21):5004-6中描述的公式来计算。对于长度小于100个碱基的DNA-PNA杂交体,典型的严格杂交条件是低于Tm 5至10℃。
变体多核苷酸也包括这样的多核苷酸,其不同于本发明的序列,但是由于遗传密码的简并性,其编码与由本发明的多核苷酸编码的多肽具有类似活性的多肽。并不改变多肽的氨基酸序列的序列改变是″沉默变化(silent variation)″。除了ATG(蛋氨酸)和TGG(色氨酸),通过技术领域公认的技术,可以改变用于相同氨基酸的其它密码子,例如,以在特定宿主生物体中优化密码子表达。
在编码多肽序列中导致一个或若干氨基酸的保守取代而没有显著改变其生物活性的多核苷酸序列改变也包括在本发明中。本领域技术人员将明了用于进行表型沉默氨基酸取代的方法(参见,例如,Bowie et al,1990,Science 247,1306)。
利用bl2seq程序并借助于tblastx算法(如上所述),可以确定由于编码多肽序列中的沉默变化和保守取代而产生的变体多核苷酸。
相对于多肽,术语″变体″还包括天然存在的、重组和合成产生的多肽。相对于本发明的序列,变体多肽序列优选呈现至少50%、至少60%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、或至少99%的同一性。基于至少5、至少7、至少10、至少15、至少20、至少21、至少22、至少23个氨基酸位置的对比窗,或基于SEQ ID NO:14的多肽、或在本发明中披露或使用的其它多肽的全长,来确定同一性。例如,对于SEQ ID NO:16或SEQ ID NO:18,对比窗可以是至少5、6、7、8或9个氨基酸位置,或多肽的全长。
多肽变体还包括那些变体,其呈现与一个或多个具体鉴定序列的相似性,其很可能保存那些序列的功能对等(funtional equivalence)并且将不能合理地预计通过随机机会已发生。正如上面所讨论的,在INS-SP变体的情况下,功能可以是作为信号多肽、或抗原多肽、或这两者。
可以下述方式来确定多肽序列同一性和相似性。利用bl2seq中的BLASTP(来自BLAST成套程序,版本2.2.18[2008年4月]),其可公开获自NCBI(ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/),比较主题多肽序列和候选多肽序列。除了应关闭低复杂性区域的过滤,采用bl2seq的默认参数。
可以使用以下UNIX命令行参数来检查多肽序列的相似性:
bl2seq-i peptideseql-j peptideseq2-F F-p blastp
参数-F F关闭低复杂性部分的过滤。参数-p选择用于序列对的适当的算法。此程序发现在序列之间具有相似性的区域并且对于每个这样的区域报道″E值″,该E值是在包含随机序列的固定参考大小的数据库中可以预计偶然看到这样的配对的次数的预计数。对于较小的E值(远小于1),E值大约是这样的随机配对的概率。
当和任何一种具体鉴定序列比较时,变体多肽序列通常呈现小于1x10-5、小于1x10-6、小于1x10-9、小于1x10-12、小于1x10-15、小于1x10-18或小于1x10-21的E值。
也可以基于在候选和主题多肽序列之间重叠序列的全长并利用全局序列比对程序来计算多肽序列同一性。EMBOSS针(可获自http:/www.ebi.ac.uk/emboss/align/)和GAP(Huang,X.(1994)OnGlobal Sequence Alignment.Computer Applications in the Biosciences10,227-235.),正如上面所讨论的,也是适宜的用来计算多肽序列同一性的全局序列比对程序。
如上所述的BLASTP的应用优选用于确定根据本发明的多肽变体。
在一种实施方式中,变体包括这样的肽,其序列与本文中的人INS-SP(1-24)SEQ ID NO:14、INS-SP(1-9)SEQ ID NO:16或INS-SP(15-24)SEQ ID NO:18相差1、2、3、4、5、6或更多保守性或非保守性氨基酸取代、缺失或添加或插入。保守突变并不影响肽的生物活性。保守取代通常包括一种氨基酸取代另一种具有类似特性的氨基酸,例如,在以下组内的取代:缬氨酸、甘氨酸;甘氨酸、丙氨酸;缬氨酸、异亮氨酸、亮氨酸;天冬氨酸、谷氨酸;天冬酰胺、谷氨酰胺;丝氨酸、苏氨酸;赖氨酸、精氨酸;以及苯丙氨酸、酪氨酸。保守取代的实例还可以参见如示于序列表中的INS-SP的序列,从而示出和人序列相比在不同哺乳动物物种中的取代。其它保守取代可以获自图5和以下表1。
表1
基于常见的侧链性能,天然存在的残基被分组:
(1)疏水的:正亮氨酸、met、ala、val、leu、ile;
(2)中性亲水的:cys、ser、thr;
(3)酸性的:asp、glu;
(4)碱性的:asn、gln、his、lys、arg;
(5)影响链定向的残基:gly、pro;以及
(6)芳族的:trp、tyr、phe。
非保守取代将意味着这些中的一种类型的一个成员替换为另一种类型的一个成员。
其它变体包括具有影响肽稳定性的修饰的肽。这样的类似物可以包含,例如,在肽序列中的一个或多个非肽键(其代替肽键)。还包括类似物,这些类似物包括不同于天然存在的L-氨基酸的残基,例如D-氨基酸或非天然存在的合成氨基酸,例如β或γ氨基酸以及环状类似物。
可以通过本领域已知的诱变方法来进行取代、缺失、添加或插入。技术人员将明了用于进行表型沉默氨基酸取代的方法。参见例如Bowie et al.,1990,Science 247,1306.9,Kunkel,T;1985,PNAS,85p 488.27。
本发明的多肽还包括那些在合成期间或以后已被修饰的多肽,例如通过生物素化、苄基化、糖基化、磷酸化、酰胺化,通过衍化,其中使用封闭/保护基团等。上述修饰可以提高多肽的稳定性或活性。上述修饰在本领域是众所周知的。参见例如,Sambrook and Ausubel(上文)、以及Lundblad,R,CRC Press,1995.28。
术语″基因构建体″是指多核苷酸分子,通常双链DNA,其可以在其中已插入另一种多核苷酸分子(插入多核苷酸分子)如但不限于cDNA分子。基因构建体可以包含必要元件,其允许转录插入多核苷酸分子,并且可选地,将转录物翻译到多肽中。插入多核苷酸分子可以源自宿主细胞,或可以源自不同的细胞或生物体和/或可以是重组多核苷酸。在宿主细胞内以后,基因构建体可以被整合于宿主染色体DNA。基因构建体可以连接于载体。
术语″载体″是指多核苷酸分子,通常双链DNA,其用来将基因构建体转运到宿主细胞中。载体能够在至少一种另外的宿主系统如大肠杆菌中复制。
术语″表达构建体″是指基因构建体,该基因构建体包括必要元件,其允许转录插入片段多核苷酸分子,并且可选地,将转录物翻译到多肽中。表达构建体通常在5′至3′方向包含:
(a)启动子,其在构建体将被转化进入的宿主细胞中起作用,
(b)待表达的多核苷酸,以及
(c)终止子,其在构建体将被转化进入的宿主细胞中起作用。
术语″编码区″或″开放阅读框″(ORF)是指基因组DNA序列或cDNA序列的有义链,其能够在适当调节序列的控制下产生转录产品和/或多肽。通过5′翻译起始密码子和3′翻译终止密码子的存在来鉴定编码序列。当被插入基因构建体时,并且当它可操作连接于启动子和终止子序列和/或其它调节元件时,″编码序列″能够被表达。
″调节元件″和″多核苷酸调节元件″是指任何元件,其控制或影响多核苷酸插入(片段)表达自载体、基因构建体或表达框,并且包括启动子、转录控制序列、翻译控制序列、复制起点、组织特异性调节元件、时间调节元件(temporal regulatory element)、增强子、聚腺苷酰化信号、阻遏物以及终止子。根据本发明,相对于待表达自载体、基因构建体或表达框的多核苷酸插入(片段),调节元件可以是同源的或异源的。
如在本文中所使用的,关于多核苷酸调节元件(PRE)和在基因构建体中PRE可操作连接的序列之间的关系,″同源″是指,PRE通常在性质上与在构建体中它可操作连接的编码序列有关。根据本发明,同源多核苷酸调节元件可以可操作连接于感兴趣的多核苷酸以致感兴趣的多核苷酸可以表达自载体、基因构建体或表达框。
如在本文中所使用的,关于多核苷酸调节元件(PRE)和在基因构建体中PRE可操作连接的序列之间的关系,″异源″是指PRE并不通常在性质上与在构建体中它可操作连接的编码序列有关。上述PRE可以包括通常与不同基因(不同于INS)有关的启动子,和/或分离自任何其它细菌、病毒、真核细胞、或哺乳动物细胞的启动子。
″可操作连接″是指待表达的序列置于调节元件的控制下,其中上述调节元件包括启动子、转录控制序列、翻译控制序列、复制起点、组织特异性调节元件、时间调节元件、增强子、聚腺苷酰化信号、阻遏物以及终止子。
术语″非编码区″是指非翻译序列,其是翻译起始位点的上游和翻译终止位点的下游。这些序列还分别称作5′UTR和3′UTR。这些区包括为转录起始和终止以及为翻译效率调节所需要的元件。
终止子是这样的序列,其终止转录并存在于在翻译序列下游的基因的3′未翻译末端。终止子是mRNA稳定性的重要的决定子(determinants)并在某些情况下已发现具有空间调节功能。
术语″启动子″是指在编码区上游的非转录顺式调节元件,其调节基因转录。启动子包括顺式起始元件,其指定转录起始位点以及保守盒如TATA盒,以及由转录因子结合的基序。
术语本发明的多核苷酸或多肽的″改变表达″用来包括这样的情况,其中对应于本发明的多核苷酸的基因组DNA被修饰,从而导致本发明的多核苷酸或多肽的改变表达。基因组DNA的修饰可以通过基因转化或本领域已知的用于诱导突变的其它方法进行。″改变表达″可以涉及所产生的信使RNA和/或多肽的量的增加或减少并且还可以导致多肽的改变的活性,这是由于所产生的多核苷酸和多肽的序列的改变。
如在本文中所使用的,″对象″优选是哺乳动物并且包括人、以及非人哺乳动物如猫、狗、马、牛、羊、鹿、小鼠、大鼠、灵长类动物(包括大猩猩、猕猴以及黑猩猩)、负鼠以及其它家庭农场或动物园动物。在一种实施方式中,哺乳动物是人。
如在本文中所使用的,术语″表现″是指对象在医疗设施如诊所或医院中的表现。
如在本文中所使用的,″治疗有效量″或″治疗有效剂量″是指足以产生所期望的生理效应的量或能够实现所期望的结果的量,尤其用于治疗所期望的疾病或病症,包括减少或消除疾病或病症的一种或多种症状或表现。
术语″治疗″以及″预防″是指治疗或预防措施,其缓和、改善、处理、防止、抑制、阻止或逆转生物事件的进展,其中上述生物事件的特征在于INS-SP水平显示与正常对照水平的偏差并且包括葡萄糖代谢障碍、糖尿病、高血糖症、肥胖症、ACD、或心脏移植排斥或其效应,尤其是ACS。对象可以显示以下一种或多种的可观测或可测量的(统计上显著的)减小:葡萄糖、乳酸酯、胰岛素、脂肪酸、甘油三酯、Tn、TnI、TnT、BNP、N-BNP、BNP-SP、BNP-SP片段、ANP、ANP-SP、ANP-SP片段、肌酸激酶-MB、肌红蛋白、LDH、天冬氨酸转氨酶、H-FABP、内皮素、肾上腺髓质素、缺血修饰白蛋白、肾素、血管紧张素II、以及本领域技术人员已知的其它常用临床标记物,这表明得到改善。
如在本文中所使用的,术语″质谱法″是指基于它们的质荷比来过滤、检测、以及测量离子的方法。参见例如US 5,719,060、US6,204,500、US 6,107,623、US 6,124,137、US 6,225,047、US 6,268,144、US 7,057,165、以及US 7,045,366。通常的质谱技术包括基质辅助激光解吸电离(MALDI)和表面增强激光解吸电离(SELDI)。两者均可结合飞行时间分析器(MALDI-TOF和SELDI-TOF),其便于分析在非常短的离子脉冲中的毫微微摩尔水平的分析物。
例如在US 5,719,600、US 6,124,137、以及US 6,225,047中讨论的并可用于本发明的SELDI的版本包括表面增强亲和捕获(Surface-Enhanced Affinity Capture(SEAC))、表面增强完全解吸(Surface-Enhanced Neat Desorption(SEND))、以及表面增强感光性附着与释放(Surface-Enhanced Photolabile Attachment and Release(SEPAR))。
提及本文披露的一系列的数字(例如1至10)还旨在包括在所述范围内的所有相关数字(例如,1、1.1、2、3、3.9、4、5、6、6.5、7、8、9以及10)以及在上述范围内的任何范围的有理数(例如2至8、1.5至5.5以及3.1至4.7),因而,明确披露了本文明确披露的所有范围的所有子范围。这些仅是具体设想的实例并且在列举的最低值和最高值之间的数值的所有可能的组合被认为以类似方式明确陈述在本申请中。
具体实施方式
胰岛素(INS)是一种众所周知的由胰腺的β细胞分泌的多肽激素。它对代谢作用具有广泛的影响。胰岛素的主要作用是使细胞从血液吸收葡萄糖并将它作为糖原储存在肝脏和肌肉中,并停止使用脂肪作为能源。在糖尿病对象中,胰岛素水平较低或甚至缺乏,从而有害地影响葡萄糖代谢。
如在SEQ ID NO:1中所示,前胰岛素原是一种110个氨基酸分子。它由通过二硫桥连接的两个多肽链(A和B)构成。前胰岛素原(1-110)被剪切以产生24个氨基酸的信号肽(SEQ ID NO:14)、C肽以及胰岛素。人前胰岛素原的加工示于图5中。
长期以来一直认为,INS-SP的功能作用限于控制胰岛素在内质网中的运输。据推断,一旦做到这一点后,信号肽即被降解,甚至不再被细胞所分泌25。
不同于惯常观点,本发明的申请人现已发现,INS-SP,通常以INS-SP片段的形式,出现在循环中。此发现本身意味着INS-SP和INS-SP片段可用作一系列的生物事件的循环生物标记物。例如,可预计在糖尿病对象和未确诊的糖尿病对象中,例如,ISN-SP的水平将高于或低于正常对照或参考水平,其取决于对象是低胰岛素血还是高胰岛素血(insulinemic)。更低水平则指示缺乏胰岛素作用或分泌。
因此,在一个方面,本发明提供了用于在对象中预测、诊断或监测生物事件的方法,其中生物事件与INS-SP生物标记物释放到循环中有关,该方法包括:
(a)测量在来自对象的生物样品中INS-SP生物标记物的水平;以及
(b)比较INS-SP生物标记物的水平和来自对照的INS-SP水平或参考值。
其中测量水平与对照或参考水平的偏差指示生物事件或障碍。
生物事件或障碍包括葡萄糖代谢障碍、糖尿病以及ACD。
因此,本发明还提供了用于在对象中评估葡萄糖代谢的方法,该方法包括:
(a)在给予葡萄糖以后测量在对象中INS-SP生物标记物的水平;以及
(b)比较所述INS-SP生物标记物的水平和来自对照或参考的INS-SP水平。
其中INS-SP的测量水平与对照或参考水平的偏差指示葡萄糖代谢障碍。
通常,和对照水平相比,偏差将是更低的INS-SP测量水平。例如,在患有高血糖症的对象中31。
在此方法中,按照众所周知的葡萄糖耐量试验规程(Oxford Textbook of Medicine,上文),可以作为第一步骤给予葡萄糖。
可以在按照标准规程进行葡萄糖试验以后2小时,来评估INS-SP生物标记物的血浆浓度,通常为静脉血浆INS-SP。然而,例如在给予葡萄糖以后的15、30、45、60、90以及105分钟进行中间测量也是有用的。
本发明还提供了用于在对象中预测、诊断、评估或监测糖尿病、或糖尿病可能性(潜在糖尿病,diabetic potential)的方法,该方法包括:
(a)测量在来自对象的生物样品中INS-SP生物标记物的水平;以及
(b)比较INS-SP生物标记物的水平和来自对照或参考的INS-SP水平,
其中INS-SP生物标记物的测量水平比对照水平更高或更低指示糖尿病或易患糖尿病体质31。
INS-SP生物标记物水平是高于还是低于正常水平,将取决于对象的胰岛素状态。
本发明的申请人还已令人惊讶地发现,在患有急性心肌梗死(AMI)的患者中,在患者的症状发作以后的最初几小时内(实际是在医院或诊所表现时),INS-SP的循环浓度为最高。在最初2小时至6小时、或4小时内观测到的水平令人惊讶地非常高,经常达到峰值,该峰值为正常对照群体中水平的大约5至15倍。过去没有暗示胰岛素或INS-SP或INS-SP片段可用作ACD、心脏移植排斥的标记物或用于未确诊或疑似ACD或肺疾病的标记物。
这些发现暗示,INS-SP生物标记物可用作心脏移植排斥、ACD包括急性冠状动脉综合征(ACS)如AMI,尤其是非ST段抬高MI,以及急性心肌缺血的非常清楚的早期标记物,并且可以用来区分ACD和肺疾病。
基于这些令人惊讶的发现,本发明的申请人已首次确定,在获自对象的生物样品中筛查循环INS-SP或其变体或片段,以及或可替换地编码INS-SP或其变体和片段的核苷酸序列(尤其是在疾病发作或临床表现的约6、约4或约2小时内),将是有用的。
可用于本发明的是INS-SP的抗原片段或变体,其长度为至少4或5个氨基酸。已知具有少至4个氨基酸的肽具有生物活性。参见例如Gilchrist et al,Biology and Reproduction,21,732-739,2004;以及Sela et al.,Behring Ins.Mitt.,91,54-66,1992。特别有用的片段是在INS-SP的N端(1-10)或C端(15-24)。特异性抗原肽的实例是INS-SP(1-9)SEQ ID NO:16和INS-SP(15-24)SEQ ID NO:18。在SEQ ID NO:17和19中分别给出相应的核苷酸序列。由本发明的申请人首次提供这些序列。核酸分子和肽均形成本发明的多个方面。
因此,在另一个方面,本发明提供了编码INS-SP片段的核酸分子,其中所述核酸是
(a)SEQ ID NO:17或其变体或片段;
(b)SEQ ID NO:19或其变体或片段;
(c)相对于SEQ ID NO:17或SEQ ID NO:19具有至少70%、75%、80%、90%、95%或99%序列同一性的序列;
(d)能够在严格条件下杂交于(a)或(b)的长度为至少10个核苷酸的序列;或
(e)(a)至(d)任何一种的补体;
条件是该序列不是SEQ ID NO:15。SEQ ID NO:15是编码信号肽的全长核酸序列。
本发明还提供了由本发明的核酸分子编码的分离的INS-SP多肽和INS-SP片段多肽。
本发明的具体多肽包括具有SEQ ID NO:16和18的氨基酸序列的多肽,均如所附序列表中所列出的。还设想如本文定义的这些多肽的变体和片段,或相对于SEQ ID NO:16或SEQ ID NO:18的多肽具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%或99%氨基酸同一性的氨基酸序列。在一种实施方式中,变体或片段是功能等效变体或片段。即,变体或片段保持SEQ ID NO:16或SEQ ID NO:18作为抗原或信号肽的功能。并不要求已知的全长INS-SP(1-24)SEQID NO:14本身,但可用于本发明。例如,这些多肽可以用于抗INS-SP抗体的制备。
在一种实施方式中,分离了本发明的或本文描述的核酸分子。利用本领域技术人员已知的各种技术,它们可以分离自生物样品。例如,可以通过使用在Mullis et al.,Eds.1994 The Polymerase Chain Reaction,Birkhauser中描述的聚合酶链式反应(PCR)来分离上述多核苷酸。可以利用源自本发明的多核苷酸序列的引物(如本文定义的)来扩增本发明的核酸分子。(参见例如Mullis,Sambrook,上文;以及Molecular Diagnostic PCR Handbook Gerrit,V et al.,Springer,2005)。
用于分离多核苷酸的另外的方法包括使用所有、或部分的本发明的多核苷酸,尤其是具有在SEQ ID NO:17或SEQ ID NO:19中陈述的序列的多核苷酸,作为杂交探针。将标记多核苷酸探针杂交于固定在固体载体如硝酸纤维素滤膜或尼龙膜上的多核苷酸的技术可以用来筛选基因组或cDNA文库。类似地,可以将探针结合于珠粒以及杂交于靶序列。可以利用已知的技术领域的规程如磁性分离来进行分离。典型的严格的杂交和洗涤条件如上文所给出的。
可以通过本领域众所周知的技术如限制性内切酶消化和寡核苷酸合成来产生多核苷酸片段。
在本领域众所周知的方法中,部分多核苷酸序列可以用作探针,以鉴定样品中的相应全长多核苷酸序列。上述方法包括基于PCR的方法、5′RACE(Methods Enzymol.218:340-56(1993);Sambrook et al,上文)以及杂交为基础的方法、计算机/数据库为基础的方法。可检测标记如放射性同位素标记、荧光标记、化学发光标记以及生物发光标记可以用来方便检测。基于已知区域起始于引物,反向PCR还允许获得未知序列,其侧接本文披露的多核苷酸序列(Triglia et al.,Nucleic Acids Res 16,8186,(1998))。该方法使用若干种限制性内切酶,以在基因的已知区域中产生适宜的片段。然后通过分子内连接作用,片段被环化,并用作PCR模板。趋异性引物设计自已知区。为了实际组装全长克隆,可以采用标准的分子生物学方法(Sambrook et al,上文)。便于本发明的多核苷酸的扩增的引物和引物对还形成本发明的另一方面。
可以通过所描述的方法来鉴定变体(包括直系同源物)。可以利用基于PCR的方法来鉴定变体多核苷酸(Mullis et al,Eds.1994 ThePolymerase Chain Reaction,Birkhauser)。通常,引物的多核苷酸序列,其可用来扩增多核苷酸分子的变体(通过PCR),可以基于编码相应氨基酸序列的保守区的序列。
用于鉴定变体多核苷酸的另外的方法包括使用所有、或部分的指定的多核苷酸作为杂交探针来筛选如上所述的基因组或cDNA文库。通常,可以使用这样的探针,其基于编码相应氨基酸序列的保守区的序列。与筛选相同于探针的序列时所用的那些杂交条件相比,杂交条件的严格性也可以较弱。
变体序列,包括多核苷酸和多肽变体,还可以通过上述基于计算机的方法来鉴定。
此外,相关序列的组的多序列比对可以借助于CLUSTALW(Thompson,et al,Nucleic Acids Research,22:4673-4680(1994),http://www-igbmc.u-strasbg.fr/BioInfo/ClustalW/Top.html)或T-COFFEE(Cedric Notredame et al,J.MoI.Biol.302:205-217(2000)))或PILEUP(其采用累进的、成对对比)而进行。(Feng etal.,J.Mol.Evol.25,351(1987))。
模式识别应用软件可用来发现基序或标签序列(特征序列,signature sequence)。例如,MEME(基序启发的多Em(Multiple Em for MotifElicitation))发现在一组序列中的基序和标签序列,以及MAST(基序比对和搜索工具(Motif Alignment and Search Tool))使用这些基序以在查询序列中鉴定类似或相同基序。MAST结果提供为一系列的与所发现的基序的适当统计数据和可视概观的序列比对。MEME和MAST由加利福尼亚大学(圣迭哥)开发。
PROSITE(Bairoch et al.,Nucleic Acids Res.22,3583(1994);Hofmann et al,Nucleic Acids Res.27,215(1999))是鉴定由基因组或cDNA序列翻译的未识别蛋白的功能的方法。PROSITE数据库(www.expasy.org/prosite)包含生物学上重要的模式和线谱(profiles)并且被加以设计,以致它可以和适当的计算工具一起用来将新序列指定给已知家族的蛋白质,或确定哪个(哪些)已知结构域存在于序列中(Falquet et al,Nucleic Acids Res.30,235(2002))。Prosearch(蛋白搜索)是一种工具,该工具可以搜索具有给定序列模式或特征的SWISS-PROT和EMBL数据库。
可以按照它们与在相同基因组(旁系同源物)或不同基因组(直系同源物)中的其它蛋白质的序列相关性来对蛋白质进行分类。直系同源基因(orthologous)是这样的基因,其通过物种形成而由共同的祖先基因进化得到并且在它们进化时通常保留相同功能。旁系同源基因(paralogous)是这样的基因,其被复制在基因组中并且基因可以获得新特异性或改变的功能,其可以与最初的特异性和功能有关。在Tatusov et al,Science 278,631-637,1997中述评了种系发育分析方法。
如上所述,本发明还涉及由本发明的核酸分子编码的INS-SP多肽,并且包括这些多肽的变体和片段。
除上述计算机/数据库方法以外,还可以通过物理方法来鉴定多肽变体,例如通过使用相对于本发明的多肽产生的抗体来筛查表达文库(Sambrook et al,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,2ndEd.Cold Spring Harbor Press,1987),通过同样由Sambrook等描述的重组DNA技术,或通过在上述抗体的帮助下鉴定来自天然来源的多肽。
多肽(包括变体多肽)的制备可以利用本领域众所周知的肽合成方法如使用固相技术的直接肽合成(例如Merrifield,1963,in J.Am Chem.Soc.85,2149;Stewart et al,1969,in Solid-Phase PeptideSynthesis,WH Freeman Co,San Francisco California;Matteucci et al.J.Am.Chem.Soc.103:3185-3191,1981,以及Atherton et al.,in SolidPhase Peptide Synthesis:a practical approach,.IRL press(1989))或自动化合成,例如利用来自Applied Biosystems(California,USA)的合成仪。还可以利用合成方法来产生多肽的突变形式,如编码氨基酸序列的DNA的位点特异性诱变,如由Adelmen et al;DNA 2,183(1983)所描述的。还参见Protein Protocols Handbook;Walker,J.Humana Press 2002。
在一种实施方式中,分离了本文中的多肽以及变体多肽。它们可以分离或纯化自天然来源,其中利用本领域众所周知的各种技术(例如Deutscher,1990,Ed,Methods in Enzymology,Vol.182,Guide to Protein Purification,以及Protein Protocols Handbook,上文)。这些技术包括但不限于HPLC、离子交换色谱、以及免疫色谱。
可替换地,多肽和变体多肽可以重组表达在适宜的宿主细胞中并分离自细胞(如下文所述)。多肽和变体可用于产生抗体,以及在其它用途中产生配体。
本文描述的基因构建体可以包含一种或多种所披露的多核苷酸序列和/或本发明的编码所披露的多肽的多核苷酸,并且可以用于转化,例如,细菌、真菌、昆虫、哺乳动物或植物生物体。本发明的基因构建体旨在包括如本文所定义的表达构建体。包括有载体(如pBR322、pUC18、pU19、Mp18、Mp19、Co1El、PCRl以及pKRC),噬菌体(如λgt10),以及M13质粒(如pBR322、pACYC184、pT127、RP4、p1J101、SV40以及BPV),粘粒,YACS,BAC穿梭载体如pSA3,PAT28转座子(如在US 5,792,294中所描述的)等。
构建体可以方便地包括选择基因或选择性标记。通常使用抗生素抗性标记如氨苄青霉素、氨甲蝶呤、或四环素。
可用于构建体中的启动子包括β-内酰胺酶、碱性磷酸酶、色氨酸、以及tac启动子体系,其是本领域中众所周知的。酵母启动子包括但不限于3-磷酸甘油酸激酶、烯醇化酶、己糖激酶、丙酮酸脱羧酶、葡糖激酶、以及甘油醛-3-磷酸酯脱氢酶。
增强子还可以用来作用于启动子以增强转录。用于本文的适宜的增强子包括SV40增强子、巨细胞病毒(cytomeglovirus)早期启动子增强子、珠蛋白、白蛋白、胰岛素等。
用于产生和使用基因构建体和载体的方法在本领域是众所周知的并且一般性描述在Sambrook et al.(上文)、以及Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology,Greene Publishing,1987中。用于用载体转化所选择的宿主细胞的方法也是已知的,例如,由Cohen,SN;PNAS 69,2110,1972描述的氯化钙处理。
关于构建体、启动子、增强子、以及宿主细胞的一般性讨论,参见Principles of Gene Manipulation and Genomics;Primrose,S et al.,Blackwell Publishing 2006,Ed.7.,以及From Genes to Genomes:Concepts and Applications of DNA Technology,Dale,J et al.,Wiley-Interscience,2007,Ed.2。
包含所描述的基因构建体和载体的宿主细胞可以源自原核或真核来源,例如酵母、细菌、真菌、昆虫(例如杆状病毒)、动物,哺乳动物或植物生物体。在一种实施方式中,宿主细胞是分离的宿主细胞。最常用作宿主细胞的原核细胞是大肠杆菌的菌株。其它原核宿主包括但不限于假单胞菌属(Pseudomonas)、芽孢杆菌属(Bacillus)、沙雷氏菌属(Serratia)、克雷伯氏菌属(Klebsiella)、链霉菌属(Streptomyces)、李斯特氏菌属(Listeria)、酵解属(Sachharomyces)、沙门菌属(Salmonella)以及分枝杆菌属(Mycobasteria)。
用于表达重组蛋白的真核细胞包括但不限于Vero细胞、HeLa、CHO(中国仓鼠卵巢细胞)、293、BHK细胞、MDCK细胞、COS细胞,以及前列腺癌细胞系如PrEC、LNCaP、Du 145以及RWPE-2。这些细胞可获自ATCC(维吉尼亚,USA)。
与本发明的核酸分子的表达相容的原核启动子包括本领域已知的组成型启动子(如λ噬菌体的int启动子和pBR322的β-内酰胺酶基因序列的bla启动子)和可调节启动子(如lacZ、recA以及gal)。为了表达,还可能需要在编码序列上游的核糖体结合位点。
包含基因构建体如表达构建体的宿主细胞可用于重组生产多肽的方法。这样的方法在本领域是众所周知的(参见例如Sambrook et al,上文)。这些方法通常涉及在适当介质中并在适合于或有利于本发明的多肽的表达和选择的条件下培养宿主细胞。可以另外在适合于选择宿主细胞(表达本发明的多肽)的介质中生长包含选择性标记的细胞。在适合于表达多肽的条件下,选择和培养表达本发明的多肽的转化宿主细胞。利用本领域众所周知的方法,表达的重组多肽可以分离和纯化自培养基,上述方法包括硫酸铵沉淀、离子交换色谱、凝胶过滤、亲和色谱、电泳等(例如Deutscher,Ed,1990,Methods in Enzymology,VoI 182,Guide to Protein Purification)。宿主细胞还可以用于这样的方法,这些方法用于生产由本发明的表达的多肽产生的产物。
在另一个方面,本发明提供了用于在对象中预测、诊断或监测急性心脏疾病(ACD)的方法,该方法包括:
测量在获自或源自对象的生物样品中INS-SP生物标记物的水平并比较所述INS-SP的水平和来自对照或参考或参考范围的INS-SP生物标记物水平,其中高于对照或参考水平的INS-SP生物标记物的测量水平指示ACD。
在另一个方面,本发明提供了用于在对象中监测对急性心脏疾病(ACD)的治疗的响应的方法,该方法包括测量在来自对象的生物样品中INS-SP生物标记物的水平并比较所述INS-SP生物标记物的水平和来自对照、参考、或参考范围的INS-SP水平,其中INS-SP生物标记物的测量水平相比于对照或参考水平的变化指示响应于治疗。
本领域已知,BNP前体如BNP27-102前体(proBNP27-102)、BNP27-47前体(proBNP27-47)可以用于预测或诊断心脏移植排斥反应(episode)以及用来区分呼吸困难(呼吸短促)的肺原因和心血管原因。参见US 2005/0244902。设想,INS-SP可以用作心脏移植排斥的早期标记物(基于心脏组织分析),以及用来区分肺疾病和急性心脏疾病。
因此,本发明还提供了用于在对象中预测、诊断或监测心脏移植排斥反应的方法,该方法包括测量在心脏移植以后在来自对象的生物样品中INS-SP生物标记物的水平并比较所述INS-SP生物标记物的水平和来自对照、参考或参考范围的INS-SP水平,其中高于对照或参考水平的INS-SP生物标记物的测量水平指示移植排斥。
在一种实施方式中,本发明提供了用于在对象中预测、诊断或监测急性心脏疾病(ACD)、心脏移植排斥、或ACD/肺疾病的方法,该方法包括在ACD、心脏移植排斥或ACD/肺疾病的发作或临床表现的最初约2小时内测量在来自对象的生物样品中INS-SP生物标记物的水平。
对INS-SP生物标记物的测量水平和来自对照、参考或参考范围的INS-SP生物标记物水平进行比较,其中高于对照或参考水平的INS-SP生物标记物的测量水平指示ACD或移植排斥。
技术性读者将明了,为了评估的目的,INS-SP生物标记物水平将通常与参考值或范围或对照值相关。
如在本文中所使用的,对照可以是个体或组,从其获得INS-SP生物标记物样品并确定平均INS-SP生物标记物水平。通常,个体或组将包括正常健康个体或不知道患有待监测的生物事件的个体组,如葡萄糖代谢障碍、糖尿病、ACD(包括心脏移植排斥)、或ACD/肺疾病。在大多数个体中INS-SP生物标记物水平为0.5-40pmol/L,并且平均对照水平为约9pmol/L。可替换地,可以基于来自先前测试个体或组的多个读数来评估对照水平。
对照水平的另一个实例是在心脏组织或来自糖尿病对象或患有葡萄糖代谢障碍的个体的组织中在INS-SP生物标记物和胰岛素水平之间的比例量度(ratiometric measure)。可以比较对象的INS-SP生物标记物水平和对照群体的平均INS-SP生物标记物水平。在心脏组织对照群体中的INS-SP水平可以为约1.5至3、通常约2至3或约2.5至3倍(或更多倍)正常对照群体中的INS-SP水平。和正常对照群体中的INS-SP水平相比,在糖尿病对象、或葡萄糖代谢障碍对照群体中的INS-SP水平可以为约2至3倍更低或更高(取决于糖尿病的特性)31。可替换地,对照可以是在较早时间获自相同对象的一个或多个读数或上述读数的平均值。为特定方法确定适当的对照和对照水平是本领域众所周知的。
应当明了,测量样品中INS-SP生物标记物水平的步骤可以是对单一样品的单次测量、或对若干样品的重复测量,这取决于待研究的生物事件。在ACD的情况下,测量可以包括,例如,在不同时间,对获自或源自对象的样品,进行INS-SP生物标记物的1至20次测量、1至10次、1至5次、1至3次、1或2次、或2或3次测量。在一种实施方式中,在疾病发作或临床表现的约最初6、5、4、3、2小时内、或在1小时内,进行测量。还可以在以上采样周期之外进行单次或重复测量,以确定和正常对照水平、或心脏组织对照水平、或有关参考水平或范围相比,INS-SP水平生物标记物是否已升高或降低。
在一种实施方式中,该方法包括测量在发作或表现的约最初1小时内获得的1或2个样品中的INS-SP生物标记物水平,接着测量在发作或表现、或初始测量INS-SP水平的约2至约4小时、或约2至约3小时内获得的1或2个样品中的INS-SP生物标记物水平。
如上所述,在发作或表现的最初6、4、或2小时内测得的INS-SP水平可以为5至15倍正常对照中测得的INS-SP生物标记物水平。
在另一种实施方式中,在样品中,约40至约350pmol/L、或约45至约300pmol/L、约50至约250pmol/L、或约55至约200pmol/L范围内的INS-SP生物标记物的水平指示ACD、心脏移植排斥,或用来区分ACD和肺疾病。
在生物事件如糖尿病、或葡萄糖代谢障碍的情况下,测量可以包括多次计算并连同确定的临床评估,如经常用于胰岛素。
如上述所定义的生物样品可以是任何生物材料,其中可以定位(locate)或分泌INS-SP生物标记物。在一种实施方式中,生物样品是循环生物样品,例如血液、血清或血浆。在一种实施方式中,生物样品是心脏组织。
核酸测定
可以按照本领域已知方法来确定在样品中INS-SP的存在以及其表达水平,如Southern印迹法、Northern印迹法、FISH或定量PCR(用来量化mRNA的转录)[(Thomas,Proc.Nat,Acad.Sci.USA77:5201-5205 1980),(Jain KK,Med Device Technol.2004 May;15(4):14-7)]、斑点印迹(DNA分析)或原位杂交,其中利用适当标记的探针并基于本文提供的序列。
因此,本发明还提供了用于在样品中检测本发明的核酸分子的存在的测定方法,该方法包括:
(a)使样品接触多核苷酸探针,该探针在严格杂交条件下杂交于核酸序列;以及
(b)检测样品中杂交复合体的存在。
在一种实施方式中,核酸分子是SEQ ID NO:17或SEQ ID NO:19或它们的变体或片段。
在一种实施方式中,杂交探针是标记探针。标记的实例包括荧光标记、化学发光标记、放射酶标记以及生物素-亲和素标记。按照本领域已知的方法如上述那些方法来进行标记探针的标记和可视化(显现,visulisation)。
为方便起见,可以将核酸探针固定于固体载体上,其中固体载体包括但不限于树脂(如聚丙烯酰胺)、碳水化合物(如琼脂糖)、塑料(如聚碳酸酯)、以及乳胶珠粒。
正如上面所讨论的,核酸分子探针可以优选为RNA、cDNA或DNA分子。在一种实施方式中,探针是、或包括SEQ ID NO:17和19。
严格杂交条件是如上面所讨论的。
可以利用已知技术如RT-PCR和电泳技术(包括SDS-PAGE)来确定核酸标记物的表达水平。利用这些技术,可以扩增在对象样品中的本发明的核酸分子的DNA或cDNA序列,以及测量DNA或cDNA或RNA的水平。
在一种可替换的方法中,可以直接在样品中而没有扩增的情况下测量DNA、cDNA或RNA水平。
在一种实施方式中,该方法是Northern印迹杂交分析。可以基于本文鉴定的INS-SP生物标记物序列来制备用于Northern印迹杂交分析的探针。在一种实施方式中,探针包括参考序列的至少10、12、15、18、21、24、27、30、36、42、51、60、63、66、69、70或72或更多连续核苷酸。
可替换地,可以利用基于逆转录的PCR(RT-PCR)测定并利用对于核酸序列具有特异性的引物来测量表达水平。如果需要的话,可以相对于对照核酸分子来比较样品中NS-SP生物标记物多核苷酸的水平,其中对照核酸分子的表达与待测量的参数或条件无关。对照核酸分子是指一种分子,其中在疾病或移植排斥状态和健康状态之间水平并没有差异。对照分子的水平可以用来归一化在比较群体中的水平。这样的对照分子的实例是GAP-DH。本发明的INS-SP生物标记物多核苷酸的水平将随着生物事件或障碍而变化。
肽测定
在一种实施方式中,测量步骤包括检测INS-SP生物标记物和结合剂之间的结合,其中结合剂结合(包括选择性地或特异性地结合)INS-SP或其片段或变体。作为测量的预先步骤,可以使INS-SP生物标记物多肽结合于结合剂,该结合剂结合INS-SP或其片段或变体。
因此,在一种实施方式中,本发明提供了用于测定生物样品的INS-SP生物标记物的方法,该测定方法包括利用任何已知方法来检测和测量在样品中的INS-SP生物标记物的水平。
在一种实施方式中,生物样品是在ACD、心脏移植排斥、或ACD/肺疾病发作的6或4小时内、或在ACD、心脏移植排斥、或ACD/肺疾病的临床表现的4小时内获自对象。
在一种实施方式中,本发明提供了用于测定INS-SP生物标记物的方法,该方法包括:
(a)结合来自生物样品的一种或多种INS-SP生物标记物多肽;以及
(b)测量结合INS-SP生物标记物多肽的水平。
在一种实施方式中,INS-SP生物标记物多肽选自组INS-SP1-9、以及INS-SP 15-24、或它们的变体或片段。应当明了,在测定中,可以结合多于一种类型的INS-SP多肽,例如INS-SP 1-9和INS-SP 15-24。
在一种实施方式中,利用结合剂来结合INS-SP生物标记物多肽。上述结合剂是选择性(特异性)结合剂。即,它与生物事件的其它标记物,并且更具体地说胰岛素,具有低交叉反应性。在一种实施方式中,结合剂是抗体或其抗原结合片段。在抗体用于测定的情况下,可以相对于INS-SP生物标记物的任何抗原部分来产生(raise)抗体,包括在N端(1-9)或C端(15-24)或INS-SP。在一种实施方式中,相对于INS-SP 1-24、1-9或15-24(SEQ ID NO:14、16以及18)或由本发明的核苷酸序列编码的氨基酸序列来产生抗体;或它们的变体或片段。
本发明还涉及上述结合剂、抗体、抗体的抗原结合片段、以及它们的应用。应用包括在测定中的应用,或在制造INS-SP生物标记物的预后、诊断或监测工具中的应用。上述测定或工具可以用来监测对象中的生物事件或障碍,其包括葡萄糖代谢障碍、糖尿病以及ACD。
抗体可以具有分离或纯化形式。结合于INS-SP或其片段或变体的抗体可以具有任何形式,包括所有类型的多克隆抗体、单克隆抗体、双特异性抗体、单链抗体、人抗体、人源化抗体以及嵌合抗体(通过基因重组产生)。还包括通过用INS-SP或其片段或变体来免疫动物如小鼠、大鼠或兔而获得的抗血清。抗体可以结合于在一组INS-SP片段中的共同INS-SP序列,或结合于特异性INS-SP片段,或甚至结合于INS-SP片段的组。
本文中还可以使用抗体或修饰抗体的片段,只要它结合BNP-SP或其片段或变体。抗原结合片段可以是Fab、F(ab′)、F(ab′)、Fc或Fv片段或单链Fv(scFv),其中通过适当的接头连接来自H和L链的Fv片段(Huston et al.Proc.Natl.Acad.Sci.USA 85:5879-83(1988))。抗体的″Fc″部分是指免疫球蛋白重链的一部分,其包含一个或多个重链恒定区结构域、CH1、CH2以及CH3,但并不包括重链可变区。
抗体的″Fv″部分是包含完全抗原识别和抗原结合位点的最小抗体片段。该区由紧密、非共价结合的一个重链和一个轻链可变域的二聚体构成。
Fab片段包含轻链的恒定域和重链的第一恒定域(CHI)。Fab′片段具有加入CHI域的Fab羧基末端的几个残基,包括来自抗体铰链区的一个或多个半胱氨酸。F(ab′)2片段表示其间具有半胱氨酸铰链并已被分开的成对的Fab′片段。F(ab′)2片段具有两个抗原结合位点。可以通过抗体的木瓜蛋白酶消化来产生Fab片段。
关于抗体和片段的讨论,参见例如PNAS USA 81:6851-6855(1984),Protein Eng 8(10)1057-1062(1995);The Pharmacology of Monoclonal Antibodies,vol.113,Springer-verlag 1994,Rosenburg andMoore Eds;PNAS USA 90:6444-6448(1993);Nature 321:522-525(1986);Nature 332:323-329(1988),以及WO 2005/003154。
用于制备、检测、修饰以及分离抗体的方法在本领域是众所周知的(参见例如Maintaining and using Antibodies:A Practical Handbook,Howard,G et al.,CRC Press 2006;Protein-protein Interactions:A Molecular Cloning Manual,Golemis E(Ed),CSHLPress,2002;Harlow and Lane(1998,11Milstein18,Suresh19,以及Brennan20)。在一种实施方式中,通过免疫适宜的宿主哺乳动物来产生所使用的抗体。包含INS-SP生物标记物的融合蛋白也可以用作免疫原。
可以通过与各种分子的结合来修饰抗体,如聚乙二醇(PEG)、生物素、链霉亲合素、化学发光标记、荧光标记、量热标记、以及放射免疫标记(如本文讨论的)。可以通过化学修饰抗体来获得修饰抗体。这些修饰方法是本领域中的常规方法。
可替换地,抗体可以获得为嵌合抗体,在源自非人抗体的可变区和源自人抗体的恒定区之间,或获得为人源化抗体,其包含源自非人抗体的互补性决定区(CDR)、源自人抗体的框架区(FR)、以及恒定区。可以利用本领域已知方法来制备上述抗体16,17,22。
简而言之,制备多克隆抗体的方法是技术人员已知的。可以在哺乳动物中产生多克隆抗体,例如,通过一次或多次注射免疫剂以及,如果需要的话,佐剂。通常,将通过多次皮下或腹膜内注射在哺乳动物中注射免疫剂和/或佐剂。免疫剂可以包括INS-SP或其片段或变体或其融合蛋白。可以有利的是,在要免疫的哺乳动物中,将免疫剂结合于已知为免疫原性的蛋白。上述免疫原性蛋白的实例包括但不限于钥孔血蓝蛋白(keyhole limpet hemocyanin)、牛血清白蛋白、牛甲状球蛋白、以及大豆胰蛋白酶抑制剂。可以采用的佐剂的实例包括弗氏完全佐剂和MPL TDM佐剂(单磷酰脂质A、合成海藻糖二霉菌酸脂(dicorynomycolate))。本领域技术人员可以无需过度实验而选择免疫方案。
可以利用本领域众所周知的杂交瘤方法来制备单克隆抗体。参见例如Kohler and Milstein,197511、US 4,196,265、US 4,816,567以及Golemis(上文)。可以在适宜的培养基中培养杂交瘤细胞,可替换地,杂交瘤细胞可以在哺乳动物体内生长为腹水。优选的永生细胞系(immortalized cell lines)是小鼠骨髓瘤细胞系,其可以获自,例如,美国典型培养物库(American Type Culture Collection)(维吉尼亚,USA)。免疫测定可以用来筛选分泌感兴趣抗体的永生细胞系。在筛选中可以使用INS-SP或其片段或变体的序列。
因此,本文还设想杂交瘤,其是能够分泌INS-SP特异性单克隆抗体的永生细胞系。
用于确定由杂交瘤细胞所产生的单克隆抗体的结合特异性的众所周知的方式包括免疫沉淀、放射性连接免疫测定(RIA)、酶联免疫吸附测定(ELISA)以及Western印迹。(Lutz et al.,Exp.Cell.Res.175:109-124(1988)、Golemis(上文)、以及Howard(上文))。例如,单克隆抗体的结合亲和力可以,例如,通过在Munson et al.,AnalBiochem 107:220(1980)中描述的斯卡查德分析法来确定。对于来自免疫动物的样品,可以类似地筛查多克隆抗体的存在。
单克隆抗体还可以获自重组宿主细胞。编码抗体的DNA可以获自杂交瘤细胞系。然后将DNA置于表达载体中,转染到宿主细胞(例如,COS细胞、CHO细胞、大肠杆菌(E.coli)细胞)以及在宿主细胞中产生的抗体。然后可以利用标准技术来分离和/或纯化抗体。
还可以使用用于单克隆抗体生产的其它已知技术如从噬菌体文库生产。参见例如,Nature 352:624-628(1991)。
为了方便检测,本文的抗体和片段可以标记有可检测标记如荧光化合物、生物发光化合物、以及化学发光化合物,以及放射性同位素、磁珠和亲和标记(例如生物素和亲和素)。允许间接测量结合的标记的实例包括酶,其中底物可以提供有色荧光产物,适宜的酶包括辣根过氧化物酶、碱性磷酸酶、苹果酸脱氢酶等。可以连同荧光激活细胞分选仪一起使用荧光色素(例如得克萨斯红、荧光素、藻胆蛋白、以及藻红蛋白)。标记技术在本领域是众所周知的。
通过常规的免疫球蛋白纯化程序如,例如,反相HPLC、蛋白质A-琼脂糖、羟基磷灰石色谱、凝胶电泳、透析、或亲和色谱,可以从培养基或腹水流体分离或纯化由细胞分泌的单克隆抗体。参见例如,Scopes,Protein Purification:Principles and Practice,Springer-Verlag,NY(1982)。
还可以通过重组DNA方式来产生单克隆抗体或片段(参见例如美国专利号4,816,567)。DNA修饰如人重链和轻链恒定域的编码序列替代来代替同源鼠序列(以上美国专利号4,816,567)也是可能的。抗体可以是单价抗体。用于制备单价抗体的方法在本领域是众所周知的(美国专利号5,334,708、5,821,047、以及7,476,724)。本文还设想(US 6,020,153)嵌合(US 4,816,567)、双价抗体(US 5,843,708)以及多价抗体的生产。
嵌合单克隆抗体是这样的抗体,其中重链和/或轻链的一部分相同于或同源于源自特定物种或属于特定抗体(亚)类的抗体中的相应序列。链的剩余部分相同于或同源于源自另一物种或属于另一抗体(亚)类的抗体中的相应序列、以及其片段,只要它们呈现所需的生物活性。(参见US 4,816,567上文)。
本发明的抗体可以进一步包括人源化抗体或人抗体。人源化抗体包括人免疫球蛋白,其中来自受体的互补决定区(CDR)的残基被来自非人物种的CDR的残基取代。由非人来源如兔、大鼠以及小鼠生产人源化抗体是众所周知的13,14,15。
还可以利用本领域已知的各种技术来产生人抗体,包括噬菌体展示文库16;以及转基因方法,参见,例如Neuberger 199617;以及Vaughan et al,199818。
双特异性抗体也可以是有用的。这些抗体是单克隆抗体,优选人抗体或人源化抗体,其对于至少两种不同的抗原具有结合特异性。例如INS-SP或其变体或片段,以及抗原,该抗原选自包括前胰岛素原、ANP、ANP-SP、BNP、CK-MB、TnT、TnI、BNP、BNP-SP、NT-BNP、肌红蛋白、LDH、天冬氨酸转氨酶、H-FABP、内皮素、肾上腺髓质素、肾素、缺血修饰白蛋白以及血管紧张素II的组。本文还设想具有多于两种特异性的抗体例如三特异性抗体。
用于制备双特异性抗体的方法在本领域是已知的。参见例如Milstein and Cuello 198319、Suresh et al,198620以及Brennan et al.,198521。
由抗体结合或选择性地结合的INS-SP生物标记物是INS-SP或其变体或片段(正如上面所讨论的)。
在一种实施方式中,抗体结合INS-SP的N端(1-9)或C端(15-24)。结合剂选择性地结合的特异性抗原肽的实例包括INS-SP(1-9)以及INS-SP(15-24)SEQ ID NO:16和18。
可以通过本领域已知的任何方式来检测INS-SP生物标记物的结合,包括特异的(基于抗体)和非特异的(如HPLC固相)。最常见地,利用测定方法如ELISA或RIA(如上所述)来检测本文的抗体。竞争性结合测定、夹心测定、非竞争性测定、荧光免疫测定法、免疫荧光测定试验、或免疫放射测定试验、发光测定、化学发光测定以及质谱分析如表面增强激光解吸和电离(SELDI)、电喷雾电离(ESI)、基质辅助激光解吸电离(MALDI)、傅立叶变换离子回旋共振质谱(FTICR),单独或连同非特异性结合剂,如色谱形式(chromatography format),也是可行的。参见例如,Golemis,E以及Howard G.(上文)。
方便地,可以将抗体固定于固态底物以方便INS-SP/抗体复合物的洗涤和分离。利用本领域已知技术,可以实现抗体与固体载体的结合。参见例如Handbook of Experimental Immunology,4th edition,Blackwell Scientific Publications,Oxford(1986)。用于抗体的有用固态底物包括玻璃、尼龙、纸以及塑料。类似地,可以将INS-SP吸附于固态底物如吸附性二氧化硅、或树脂颗粒、或硅片,其可选地涂布或衍化有(derivatise)离子交换、反相(例如Cl8涂层)或其它材料。底物可以具有珠粒、平板、管、棒或生物芯片的形式。生物芯片的实例包括Ciphergen,ProteinChip阵列(Ciphergen Biosystems(CA,USA))、以及可获自Perkin Elmer,USA的Packard BioChip。还参见US 6,225,047、US 6,329,209。生物芯片可以包括色谱表面。具有可寻址位置的生物芯片或平板(plates)以及分立的(discreet)微量滴定板是特别有用的。此外优选使用的是多重系统,其中包含针对多种分析物的抗体的珠粒用来测量单一样品中的分析物水平。待测量的分析物可以包括其它心脏标记物以及INS-SP或其变体或片段。本文使用的适宜的多重珠粒系统的一个实例是LuminexFlurokine Multianalyte Profiling系统。
抗体测定方法在本领域是众所周知的,参见例如US 5,221,685、US 5,310,687、US 5,480,792、US 5,525,524、US 5,679,526、US5,824,799、US 5,851,776、US 5,885,527、US 5,922,615、US 5,939,272、US 5,647,124、US 5,985,579、US 6,019,944、US 6113,855、US6,143,576和US 5,955,377(关于未标记测定)、以及US 5,631,171,还参见Zola,Monoclonal Antibodies:A Manual of Techniques ppl47-158(CRC Press,Inc 1987),Harlow and Lane(1998)Antibodies,A Laboratory Manual,Cold Spring Harbour Publications,New York,以及US 2005/0064511(关于测定形式和条件的描述)。所有上述参考文献的全部内容以引用方式结合于本文。
免疫测定分析仪也是众所周知的并且除其它很好描述的系统22以外还包括Beckman Access、Abbott AxSym、Roche ElecSys以及Dade Behring Status系统。
可以直接或间接检测INS-SP生物标记物和抗体结合形成复合物。利用标记如荧光、发光、放射性核素、金属、染料等来进行直接检测。间接检测包括结合可检测标记如地高辛或酶如辣根过氧化物酶和碱性磷酸酶以形成标记抗体,接着为通过添加检测试剂来检测标记的步骤。
辣根过氧化物酶(例如)可以用底物,如,邻苯二胺二盐酸盐(OPD)和过氧化物温育而产生可以测量其吸光度的有色产物,或用鲁米诺和过氧化物加以温育而产生化学发光,其可以用光度计加以测量(如在本领域中已知的)。生物素或地高辛可与强烈结合于它们的结合剂进行反应。例如,蛋白质亲和素和链霉亲合素将强烈结合于生物素。然后另一种可测量的标记与其共价结合或连接,其中通过与蛋白质的直接反应、或通过使用通常可获得的交联剂如MCS和碳二亚胺、或通过添加螯合剂结合或连接。
通常,复合物分离自未复合试剂,例如通过离心。如果抗体被标记,则复合物的量将由所检测的标记的量来反映。可替换地,可以通过结合于抗体来标记INS-SP生物标记物,然后在竞争性测定中通过测量当用包含未标记INS-SP生物标记物的生物样品温育抗体标记INS-SP生物标记物时所结合的标记INS-SP生物标记物的减少来检测INS-SP生物标记物。可以使用其它免疫测定例如夹心测定。
在一种实施方式中,与抗体接触以后,通常在4℃下过夜18至25小时、或在25℃至40℃下1至2至4小时,将结合于结合剂(抗体)的标记INS-SP生物标记物与未结合的标记INS-SP生物标记物分离。在溶液相测定中,可以通过添加结合于固相颗粒如纤维素、或磁性材料的抗γ球蛋白抗体(二抗)来完成分离。二抗(secondary antibody)在不同于用于产生一抗的物种中产生并结合一抗(primary antibody)。因此,经由二抗,所有一抗结合于固相。通过离心或磁吸引从溶液移除这种复合物,然后利用结合于它的标记来测量所结合的标记肽。用于分离与自由标记结合的其它可选方法包括形成免疫复合物(其沉淀自溶液),通过聚乙二醇沉淀抗体,或将自由标记的肽结合于活性炭并通过离心或过滤从溶液除去。通过适当方法(如上述那些方法)来测量在分离的结合或自由相中的标记。
竞争性结合测定还可以设计为固相测定,其更易于进行,因而优于上述那些方法。这种类型的测定使用具有孔的平板(通常称作ELISA或免疫测定平板)、固体珠粒或管表面。一抗被吸附或共价结合于平板、珠粒或管的表面,或通过吸附或共价结合第二抗γ球蛋白或抗Fc区抗体被间接结合于平板。一起或顺序地将样品和标记肽(如上述)加入平板,然后在便于在样品中的INS-SP和标记肽之间进行抗体结合竞争的条件下加以温育。可以随后吸出未结合的标记肽并冲洗平板,从而留下附着于平板的抗体结合的标记肽。然后可以利用上述技术测量标记肽。
夹心型测定具有更高的特异性、速度以及更大的测量范围。在这种类型的测定中,借助于吸附、共价结合、或用于固相竞争结合测定的抗Fc或γ球蛋白抗体(如上所述),将相对于INS-SP生物标记物过量的一抗附着于ELISA平板的孔、珠粒或管。使样品液或提取物接触附着于固相的抗体。由于抗体过量,所以这种结合反应通常是快速的。还用样品并和一抗同时或顺序地温育相对于INS-SP生物标记物的二抗。选择这种二抗以结合于INS-SP生物标记物上的位点,该位点不同于一抗的结合位点。上述两种抗体反应导致夹层,其中来自样品的INS-SP生物标记物被夹在两种抗体之间。二抗通常标记有如上文详细描述的用于竞争性结合测定的容易测量的化合物。可替换地,可以使标记的第三抗体(其特异性地结合于二抗)接触样品。在冲走未结合材料以后,可以通过针对竞争性结合测定所概述的方法来测量和量化结合的标记抗体。
还可以使用浸渍片型测定(dipstick type assay)。这些测定方法在本领域是众所周知的。它们可以例如,采用较小颗粒如附着有特异性抗体的金或有色乳胶颗粒。可以将待测量的液体样品加入预加载有颗粒的膜或纸条带的一端,并允许沿着条带进行迁移。样品中的抗原与颗粒的结合会改善颗粒结合于捕获位点的能力,其中进一步沿着条带,上述捕获位点包含用于颗粒的结合剂,如抗原或抗体。有色颗粒在这些位点的累积导致显色并取决于样品中竞争性抗原的浓度。其它浸渍片可以采用共价结合于纸或膜条带的抗体以捕获样品中的抗原。采用结合于酶如辣根过氧化物酶的二抗的随后反应以及用底物温育以产生颜色、荧光或化学发光输出,将使得能够量化样品中的抗原。
如在以下实施例中所讨论的,在一种实施方式中,放射免疫测定(RIA)是所使用的实验室技术。在一种RIA中,放射性标记抗原和未标记抗原用于与抗体的竞争性结合。常见放射性标记包括125I、131I、3H以及14C。
涉及用特异性抗体和放射性标记抗体结合蛋白沉淀INS-SP生物标记物的放射免疫测定可以测量在沉淀物中标记抗体的量,其与样品中INS-SP生物标记物的量成正比。可替换地,产生了标记的INS-SP生物标记物并使用未标记的抗体结合蛋白。然后添加要测试的生物样品。来自标记INS-SP生物标记物的计数的减少与样品中INS-SP生物标记物的量成正比。
在RIA中,还可以分离结合INS-SP生物标记物和自由的INS-SP生物标记物。这可能涉及用二抗沉淀INS-SP生物标记物/抗体复合物。例如,如果INS-SP生物标记物/抗体复合物包含兔抗体,那么驴抗兔抗体可以用来沉淀复合物并计数标记的量。例如在LKB,伽玛主计数器(Gammamaster counter)中。参见Hunt et al22。
本发明的方法进一步包括测量葡萄糖代谢障碍、糖尿病、ACD、心脏移植排斥、或ACD/肺疾病的一种或多种其它标记物的水平,其不是INS-SP生物标记物。可以比较其它(一种或多种)标记物的水平和来自对照群体的平均对照水平。测量水平与平均对照水平的偏差可以预测或诊断葡萄糖代谢障碍、糖尿病或易患该病的体质、ACD或心脏移植排斥。
虽然依据INS-SP生物标记物的更高水平或水平增加指示ACD、或心脏移植排斥以及INS-SP生物标记物的更低、不同或偏离水平指示糖尿病或葡萄糖代谢障碍描述了本发明的方法,但还可以是,在某些事件或障碍中,INS-SP生物标记物的水平将降低或更低或将升高或更高,这取决于事件或障碍的代谢作用。还设想高于或低于对照水平的测量偏差。
本文中对于ACD和心脏移植排斥特别有用的其它标记物包括肌钙蛋白、肌钙蛋白T、肌钙蛋白I、肌酸激酶MB、肌红蛋白、BNP、NT-BNP、BNP-SP、BNP-SP片段、ANP、ANP-SP、ANP-SP片段、LDH、天冬氨酸转氨酶、H-FABP、内皮素、肾上腺髓质素、肾素、缺血修饰白蛋白、以及血管紧张素II1。这些标记物均涉及心脏功能不良或疾病。对于糖尿病、以及葡萄糖代谢障碍,其它标记物包括胰岛素、乳酸酯、葡萄糖、脂肪酸以及甘油三酯或它们的标记物。用于上述标记物的测定方法是众所周知的并用于本领域。例如,各种上述测定例行用于临床环境,如由Vogel,H,(2007)DrugDiscovery and Evaluation:Pharmacological Assays Ed 3.Springer pp.Ed.:3,pp 2071和由Runge et al.(2006)Principles of Molecularmedicine Ed.2Springer,pp 1268所描述的。用于进行上述测定的试剂盒和试剂可商业上获自若干供应商,包括QuantiChromTM和EnzyChromeTM葡萄糖、脂肪酸和甘油三酯测定(BioAssay Systems,加利福尼亚,USA)以及葡萄糖、甘油三酯和自由脂肪酸测定试剂盒(BioVision,加利福尼亚,USA)。使INS-SP水平相关于其它标记物可以提高INS-SP的预测、诊断或监测价值。在ACD、心脏移植排斥或ACD/肺疾病的情况下,INS-SP标记物水平与已知心脏标记物的结合可以增加患者结果的预测或诊断价值。
可以使用单试样同时或分别进行若干肽标记物的分析。同时、两个或多位点形式测定是优选的。多重珠粒、微量测定物(microassay)或生物芯片系统是特别有用的。上述珠粒、测定物(assays)或芯片可以具有若干分立的、经常可寻址的位置,包括相对于一种或多种标记物(包括INS-SP和INS-SP片段)的抗体。上述一种或多种标记物包括多于一种的INS-SP标记物。例如,它可以有利于测定N端和C端INS-SP片段以及结合测定结果。许多其它这样的标记物组合是可行的。US2005/0064511、US 6,019,944、以及Ng and Hang,J.Cell MoI.Med.,6:329-340(2002)描述了可用于本发明的微阵列、芯片、毛细管装置以及技术。Luminex提供了可用于本发明的多重珠粒系统。还参见The Protein Protocols Handbook,上文。适用于单独或顺序测定的实验室分析仪包括AxSym(Abbott,USA)、ElecSys(Roche)、Access(Beckman)、ADVIA(Bayer)以及Nichols(Nichols Institute)免疫测定系统。
在一种实施方式中,在单一表面如芯片或阵列上进行多种多肽的同时测定。
在另一种实施方式中,进行一种或多种非INS-SP标记物的单独测定,并且结果对照或合并于INS-SP生物标记物结果。
在监测对象的情况下,可以随着时间的推移获取若干生物样品。连续取样便于随着时间的推移测量标记物水平的变化,尤其是INS-SP生物标记物。采样可以提供关于事件的大概发作时间、事件的严重性的信息,表明哪些治疗方案可能是合适的、响应于所采用的治疗方案、或长期预后。可以在医疗点如在救护车中、医生办公室,在临床表现时、在住院期间,对门诊患者,或在例行健康检查期间,进行分析。
还可以连同一种或多种风险因素的分析一起进行本发明的方法,其中风险因素如但不限于年龄、体重、身体活动水平、性别以及事件(如糖尿病、葡萄糖代谢障碍、以及心脏事件)的家史。还可以连同本发明的方法一起来使用测试结果。例如,葡萄糖耐量试验、ECG结果以及临床检查。INS-SP的循环水平的统计上显著的变化、连同一种或多种另外的风险因素或测试结果,可以用来更准确地诊断或预后对象的病症。
本文的方法还可以用作治疗指南(guide)。例如开始何种治疗以及何时治疗监测、检测治疗的阳性或不利影响(例如抗有丝分裂药物的心脏毒性)、胰岛素、葡萄糖代谢、甘油三酯以及脂肪酸浓度,二甲双胍和/或抑制素(斯达汀)治疗,以及如果需要或在需要时(取决于结果)治疗方案的调节。这可以改善患者的短期、中期和长期结果。关于治疗指南,参见Troughton et al8。
急性心脏疾病
本发明的申请人已表明,INS-SP生物标记物如INS-SP(1-9)的浓度与急性心脏疾病相关。此外,在患者呈现有疑似急性心肌梗死(AMI)或心脏病发作的情况下,在临床表现以后,INS-SP生物标记物水平处于最高值。呈现有急性心脏疾病,以及尤其是由(心脏病发作,在心脏肌肉或心肌中留下瘢痕)引起的急性心肌缺血冠状动脉疾病的对象可以或可以不经历随后的心肌梗死(MI)。利用目前的临床技术和标记物,并不能容易地诊断不经历MI的组。因此本发明的申请人首次提供了有用的早期和特异性标记物,用于与MI有关的心肌损伤。这可以便于起因于不良事件(AE)的心肌损伤的早期诊断以及便于医师区分上述情况与其它急性冠状动脉综合征以及区分其与胸痛的其它原因。例如心绞痛、胃肠疾病、肺/胸膜疾病等。这显著缩短了在等待目前的心脏生物标记物如肌红蛋白、CK-MB、TnT以及TnI的水平升高所经历的6小时至12小时的窗口。因而可以更早进行更准确的诊断和治疗,从而减小发病率和死亡率并产生更好的预后结果。
在另一种实施方式中,本发明可用于监测在心脏病患者中的再灌注治疗。再灌注治疗通常包括经皮冠状动脉介入治疗(例如血管成形术)和/或药物治疗。在药物治疗中通常采用用于血管再生的溶栓药物。辅助疗法包括抗凝和抗血小板治疗。当在诊断以后尽快采用时,再灌注治疗是最有效的。为加速诊断所进行的INS-SP测试便于再灌注治疗的快速采用。还可以通过重复测试来监测治疗的有效性,并在适当情况下调整疗法。关于再灌注治疗的全面讨论,参见本文的Braunwald et al1。
心脏疾病
本发明的方法还可以用于诊断或预测对象的心脏疾病。
心脏移植排斥
本发明还用于监测心脏移植,通常心脏异体移植排斥反应,其中在移植期间和以后之后通过定期组织活检并利用INS-SP生物标记物测量进行检测。相对于对照水平,在心脏移植的6、4或2小时内测得的INS-SP生物标记物水平的增加可以用来预测或诊断排斥反应。
本发明还提供了在生物样品中测定INS-SP生物标记物的方法。在一种实施方式中,样品是在ACD、心脏移植排斥或ACD/肺疾病发作约6、4或2小时内、或在ACD、心脏移植排斥或ACD/肺疾病临床表现约6、4或2小时内获自对象。该测定方法包括利用任何已知方法来检测和测量样品中的INS-SP生物标记物水平。在一种实施方式中,该测定方法是体外测定方法。这样的方法包括但不限于所有上面讨论的已知的测定技术以及凝胶电泳技术、Western印迹、气相光谱(gas phase spectroscopy)、原子力显微术(atomicforce microscopy)、表面等离子体共振、质谱法23。
在一种实施方式中,该测定方法包括一种或多种核酸序列,其结合于本发明的一种或多种INS-SP生物标记物核酸序列。大范围的有义和反义探针和引物可以设计自本文的核酸序列。利用上面讨论的已知技术来确定INS-SP生物标记物序列的表达水平。阵列可以是固态底物例如″芯片″(如在美国专利号5,744,305中所描述的)或硝酸纤维素膜。关于有用阵列的讨论,参见例如Microarray Technology and its Application,U et al.,Springer 2005,以及Gene Expression Profiling by Microarrays:Clinical Implications,Hofmann,W-K;Cambridge University Press 2006。
由本文的INS-SP生物标记物表达的蛋白质还可以用于测定,并且结果与表达在正常对照样品中的相同蛋白质的表达水平加以比较。可以利用本领域已知的和本文讨论的测定形式来评估蛋白质的存在和量。
优选通过使INS-SP生物标记物结合于结合剂如本发明的抗体并测量结合INS-SP生物标记物的存在量,来检测样品中INS-SP生物标记物的存在。
如上所述,结合或选择性地结合INS-SP的抗体(包括其变体和片段)形成本发明的另一方面并且通过上面讨论的技术可以制备这些抗体。这些抗体可用于本发明的方法和测定。
在另外的方面,本发明提供了用于在对象中预测、诊断、评估或监测生物事件的试剂盒,其中生物事件包括葡萄糖代谢障碍、糖尿病、急性心脏疾病ACD、(包括心脏移植排斥)、或ACD/肺疾病,上述试剂盒包括INS-SP生物标记物结合剂(或用于多种INS-SP生物标记物的结合剂),该结合剂包括本发明的抗体或抗原结合片段。当试剂盒用于诊断ACD、心脏移植排斥、或ACD/肺疾病时,在一种实施方式中,生物样品,例如,是在ACD、心脏移植排斥、或ACD/肺疾病的发作或临床表现的6、4或2小时内获自对象。
本发明还提供了用于预测、诊断、评估或监测急性心脏疾病(ACD)、心脏移植排斥、或ACD/肺疾病的试剂盒,该试剂盒包括本发明的结合剂,其中对试剂盒进行校准以测量约0.1至约500pmol/L、优选约1至约300pmol/L、优选约10至约250pmol/L范围内的INS-SP水平。
可以按照已知技术,例如利用具有已知水平的INS-SP生物标记物的血液样品、或各自具有不同已知水平的INS-SP的一组校准,来进行测定校准。用于诊断试剂盒的试验条带(test strips)通常是在制造期间加以校准。参见例如US 6,780,645。试剂盒可用于测量生物样品中的INS-SP生物标记物水平。检测试剂可以是互补于INS-SP或INS-SP标记物的片段的寡核苷酸序列、或结合于由标记物编码的多肽的抗体。试剂可以结合于固态基质(如上面所讨论的)或包装(packaged)有用于将它们结合于基质的试剂。固态基质或底物可以具有珠粒、平板、管、浸渍片、条带或生物芯片的形式(所有如上面所讨论的)。
检测试剂包括洗涤剂和能够检测结合抗体(如标记二抗)的试剂、或能够和标记抗体反应的试剂。
试剂盒还将方便地包括对照试剂(阳性和/或阴性)和/或用于检测核酸、多肽、或抗体的装置。试剂盒还可以包括用法说明书,如在ACD、心脏移植排斥或ACD/肺疾病发作或表现的6、4或2小时内从对象获取生物样品,测量样品中的INS-SP水平,比较测量水平与对照水平,以及关联比较结果和心脏状况。通常,和对照相比,INS-SP标记物水平的增加指示ACD或心脏移植排斥、或ACD(与肺疾病相对)。
在糖尿病的情况下,和对照相比,更低或更高INS-SP生物标记物水平指示糖尿病或易患糖尿病体质,是更高还是更低则取决于糖尿病的特性和对象的糖尿病状态。
最常见地,试剂盒形式化为用于本领域已知的测定,在一种实施方式中用于PCR、Northern杂交或Southern ELISA测定(如在本领域中已知的)。
试剂盒还可以包括用于ACD、移植排斥、或ACD/肺疾病的标记物的一种或多种另外的测定。在ACS的情况下,另外的标记物测定可以包括用于以下一种或多种的测定:肌钙蛋白、肌钙蛋白T、肌钙蛋白I、肌酸激酶MB、肌红蛋白、BNP、BNP-SP、BNP-SP片段、ANP、ANP-SP、ANP-SP片段、NT-BNP、LDH、天冬氨酸转氨酶、H-FABP、内皮素、肾上腺髓质素、缺血修饰白蛋白、肾素以及血管紧张素II。在一种实施方式中,所有标记物包括在试剂盒中。
在糖尿病的情况下,另外的试剂盒成分可以是用于标记物的测量装置,其中标记物可以包括胰岛素、葡萄糖、乳酸酯、甘油三酯以及脂肪酸或其标记物。
试剂盒将包括一个或多个容器并且还可以包括收集装置,例如,瓶、袋(如静脉输液袋)、小瓶、注射器、以及试管。至少一个容器容纳产品,该产品可有效用于预测、诊断、或监测生物事件如糖尿病、ACD(尤其是ACS)、移植排斥、或ACD/肺疾病。上述产品通常是核酸分子、多肽或结合剂,尤其是本发明的抗体或抗原结合片段,或包含任何这些成分的组合物。在一种优选实施方式中,在容器上或伴随容器的用法说明或标签指明,上述组合物可用于预测、诊断、或监测生物事件。其它成分可以包括针、稀释剂以及缓冲剂。有益地,试剂盒可以包括至少一个容器,该容器包含缓冲液,如磷酸缓冲盐溶液、林格氏液以及葡萄糖溶液。
试剂盒中理想地包括结合或选择性地结合INS-SP生物标记物(以及,可选地,非INS-SP生物标记物)的结合剂。在一种实施方式中,结合剂是抗体,优选本发明的抗体或抗原结合片段。在测定和试剂盒中所使用的抗体,在一种实施方式中,可以是单克隆或多克隆抗体,并且可以在任何哺乳动物(如上面所讨论的)中制备。抗体可以针对由本发明的INS-SP生物标记物核酸序列、INS-SP(1-24)、INS-SP(1-9)、INS-SP(15-24)编码或指示的天然肽、或基于或包括上述肽的合成肽而制备,或可以相对于外源性序列而产生,其中外源性序列融合于编码本发明的INS-SP生物标记物肽的核酸序列。
在一种试剂盒的实施方式中,将INS-SP生物标记物检测试剂固定于固态基质如多孔条带或芯片以形成至少一个INS-SP生物标记物检测位点。多孔条带的测量或检测区可以包括多个检测位点,这样的检测位点包含INS-SP生物标记物检测试剂。可以以长条、交叉或点或其它排列方式来安排位点。测试条带或芯片还可以包含用于阴性和/或阳性对照的位点。对照位点可以可替换地是在不同条带或芯片上。不同的检测位点可以包含不同量的固定核酸或抗体,例如在第一检测位点有较高量以及在随后的位点有较低量。在添加生物试样以后,显示可检测信号的位点的数目提供了在样品中存在的INS-SP生物标记物的量的定量或半定量指示。
在试剂盒中还可以包括用于样品分析的装置,该装置包括包含适当成分(标记物、抗体以及试剂)的一次性测试筒以进行样品测试。该装置将适宜地包括测试区和测试结果窗口。免疫色谱筒是上述装置的实例。参见例如US 6,399,398、US 6,235,241以及US 5,504,013。
可替换地,该装置可以是电子装置,其便于输入、存储以及评价所测得的标记物水平(相对于对照水平)以及其它标记物水平。US 2006/0234315提供了上述装置的实例。此外可用于本发明的是Ciphergen′s Protein利用Ciphergen′s Protein软件包,其可以用来处理SELDI结果。
在本说明书中,其中已参考专利说明书、其它外部文件、或其它来源的信息,这通常是为了给讨论本发明的特点提供背景。除非另有具体说明,参考上述外部文件并不认为是承认上述文献、或上述来源的信息(在任何司法中)是现有技术、或形成本领域的公知常识的一部分。
现将以非限制性方式参照以下实施例来说明本发明。
实施例1
方法
所有人方案得到Upper South Regional Ethics Committee of the Ministry of Health(新西兰)的准予,并按照赫尔辛基宣言进行。
化学制品
合成人INS信号肽INS-SP(1-9)和INS-SP(15-24)(SEQ ID NO:16和18)由Mimotopes(澳大利亚)合成,其中利用温和Fmoc固相合成方法30。
所有缓冲试剂购买自(UK)和/或Sigma(Mo,USA)。借助于用于定向载体结合的半胱氨酸,合成了INS-SP(1-9)和INS-SP(15-24)。还借助于用于在相同肽上示踪物(tracer)制备的酪氨酰残基合成了上述两种肽。
人类研究
为了进行健康志愿者参考范围研究,静脉血液样品获自隔夜空腹以后的20位健康志愿者(13位妇女,平均年龄48.8±3.2岁(范围21-72岁),BMI 25.9±1.0kg/m2)。将获得的样品放入冰上的管中并于+4.0℃和2700g下离心5分钟,然后将血浆储存于-80℃直至分析。
为了分析在急性心肌损伤中的INS-SP生物标记物浓度,我们研究了9位连续患者(consecutive patients)(4位妇女,平均年龄70±8岁(范围59-79岁)),在克赖斯特彻奇医院的心脏特诊室中,在呈现胸痛发作和ST段抬高急性MI的明确证据、连同血浆肌钙蛋白T(TnT)上升然后下降的6小时内。排除患有心源性休克的患者。所有9位对象在位院期间均具有ECG。胸痛发作和基线(时间0)静脉样品的抽取(drawing)之间的时间为3.7±0.2小时。将18规格(18-gauge)的静脉插管插入前臂静脉以采血。在进入心脏特诊室(时间0)时以及在作为住院患者以后的0.5、1、2、4、8、12、24以及72小时抽取静脉样品(10ml)。将获得的样品放入冰上的管中并+4℃和2700g下离心5分钟,然后将血浆储存于-80℃直至分析。
血浆提取
如先前所描述的22,用SepPak Cartridges(Waters,USA)提取所有血浆样品,并在RIA和HPLC以前,干燥和储存于-20℃。
INS-SP RIA
为了测量推定的人INS-SP生物标记物肽,我们产生了新的IRRIA,其针对人前胰岛素原(1-24)信号序列(SEQ ID NO:14)的氨基酸INS-SP 1-9(SEQ ID NO:16)和15-24(SEQ ID NO:18)。
抗体生成
在室温下通过温和混合,将前INS原(1-9)Cys10和(15-24)Cys14结合于经顺丁烯二酰亚胺(malemide)处理的在PBS(pH 7.0)中的N-e-马来酰亚胺己酸琥珀酰亚胺酯(EMCS)衍生的BSA。用弗氏佐剂(2ml)乳化结合肽并以每月间隔在4-5个部位皮下注射(总共2ml)给2只新西兰白兔。在注射后12天对兔进行放血以评估抗体滴度直至达到适当水平。关于RIA,利用最终稀度为1∶30,000的抗血清来确定INS-SP IR。
碘化和测定方法
借助于氯胺T法来碘化带有结合酪氨酰残基的前INS原(1-9)和(15-24),然后用反相HPLC(RP-HPLC)加以纯化,如先前描述的21。按照这种制备,测试了RP-HPLC以后的碘化示踪物形式。将所有样品、标准物、放射性示踪物以及抗血清溶液稀释在基于钾的测定缓冲液中22。测定温育液包含100μL样品或标准(0-640pmol)人前INS原(1-10)或(15-24)结合l0μL抗血清,在4℃下对其进行旋转和温育24小时。然后添加100μL示踪物(4000-5000cpm)并在4℃下进一步温育24小时。通过固相二抗方法(驴抗羊IDS Ltd,英国)最终分离自由和结合的免疫反应活性并用Gammamaster计数器(LKB,乌普萨拉,瑞典)加以计数。
统计分析
所有结果表示为平均值±SEM。利用用于重复测量的双因素(two-way)ANOVA,接着最低显著性差异事后测试(post-hoctesting),分析了时间过程数据(time-course data)。利用一般线性回归模型,进行了血浆激素浓度的相关分析。在所有分析中,P值<0.05被认为是显著的。
结果
为了确定胰岛素的24个氨基酸信号肽或从其衍生的片段是否存在于人类的循环中,我们开发了特异的放射免疫测定(RIA),其针对前胰岛素原(1-24)的残基1-9和15-24。血浆提取物的稀释显示了与标准曲线(未示出)的平行性。在健康人中INS-SP生物标记物的血浆浓度为8.8±2.6pmol/L(n=20)(图1)。
在已确定了IR INS-SP(1-9)肽存在于人血浆中以后,我们测量了在患有文件证明的AMI的患者中IR INS-SP的连续浓度(n=9,图2)。在入院时观测到IR INS-SP的最高浓度,然后经12至72小时缓慢下降至稳定水平。重要的是,入院时的平均峰值水平是正常健康志愿者中水平的5至15倍。
优选地,检测IR INS-SP片段。
实施例2
对具有临床上稳定的疑似ACS的6位患者进行插管并从多个器官部位获得血液样品,上述多个器官部位是股动脉FA(1)和FA(2)、股静脉(FV)、肾静脉(RV)、肝静脉(HV)、下腔静脉(IVC)、颈静脉(JUG)、心脏冠状窦静脉(CS)以及肺动脉(PA)。血液被收集到冷冻EDTA管中,通过离心从血浆制备以及对血浆进行INS-SPRIA。图2示出,INS-SP生物标记物浓度最高的部位是颈静脉、肾静脉以及股静脉。
实施例3
为了评估在控制代谢作用和/或能量平衡方面INS-SP可能具有的作用,口服给予7位正常的健康志愿者75g葡萄糖。如在图3中可以看到的,在摄取葡萄糖以后,血浆INS-SP生物标记物水平显著降低,这与它在能量平衡中发挥作用是一致的。相反,在葡萄糖摄取以后,胰岛素的血浆浓度显著增加,这强烈暗示两种肽在控制能量平衡方面的对比点。
结论
在临床上稳定的患者中,循环INS-SP生物标记物浓度可能源自颈静脉、肾或外周来源。响应文件证明的AMI的INS-SP肽和亚肽(subpeptides)的增加支持以下想法:它们具有作为代谢和心脏疾病的生物标记物的作用。INS-SP生物标记物血浆水平对血浆葡萄糖的增加的响应还暗示它在能量平衡中可能发挥作用。
讨论
此证据首次证实前胰岛素原的信号肽、以及其片段存在于循环和细胞外腔隙(extracellular space)中。我们表明了,首先血液中INS-SP IR的测量具有潜力作为急性心肌缺血和/或随后损伤的快速生物标记物,以及其次事件以后INS-SP的测量具有潜在价值可作为长期预后和结果的标记物。
我们还表明,血浆中INS-SP生物标记物的测量可潜在地用于代谢作用和/或能量平衡领域,尤其用于葡萄糖代谢的评估。
本领域技术人员当然明了,以上描述是通过举例方式来提供且本发明并不限于此。
参考文献
1.Braunwald E,Zipes DP,Libby P.Acute myocardial infarction Chp.35 Heart disease:a textbook of cardiovascular medicine,6th ed.2001.pgs.1114-1231.
2.Richards AM,Nicholls MG,Yandle TG,Frampton C,Espiner EA,Turner JG,Buttimore RC,Lainchbury JG,Elliott JM,Ikram H,Crozier IG,Smyth DW.Plasma N-terminal pro-brain natriuretic peptide and adrenomedullin:new neurohormonal predictors of left ventricular function and prognosis after myocardial infarction.Circulation 199897:1921-1929.
3.Jernberg T,Stridsberg M,Venge P,Lindahl B.N-terminal pro Brain Natriuretic Peptide on admission for early risk stratification of patients with chest pain and no ST-segment elevation.J.Am.Coll.Cardiology 200240:437-445.
4.Omland T,Persson A,Ng L,O′Brien R,Karlsson T,Herlitz J,Hartford M,Caidahl K.N-terminal pro-B-type natriuretic peptide and long-term mortality in acute coronary syndromes.Circulation.2002106:2913-2918.
5.Pemberton CJ,Johnson ML,Yandle TG,Espiner EA.Deconvolution Analysis of the Secretion and Elimination of Cardiac Natriuretic Peptides During Acute Volume Overload.Hypertension2000;36:355-359.
6.Richards AM,Nicholls MG,Troughton RW,Lainchbury JG,Elliott J,Frampton C,Espiner EA,Crozier IG,Yandle TG,Turner J.Antecedent hypertension and heart failure after myocardial infarction.J.Am.Coll.Cardiology.2002 39:1182-1188.
7.Troughton RW,Prior DL,Pereira JJ,Martin M,Fogarty A,Morehead A,Yandle TG,Richards AM,Starling RC,Young JB,Thomas JD,Klein AL.Plasma B-type natriuretic peptide levels insystolic heart failure:importance of left ventricular diastolic function and right ventricular systolic function.J Am Coll Cardiol.200443:416-422.
8.Troughton RW,Frampton CM,Yandle TG,Espiner EA,Nicholls MG,Richards AM.Treatment of heart failure guided by plasma amino-terminal brain natriuretic peptide(N-BNP)concentrations.Lancet 2000 355:1126.1130.
9.Multiple Sequence Alignment with the Clustal series of programs Nucleic Acids Res(2003)31(13):3497-500.
10.Bowie,J.U et al,(1990).Decipeing the message in Protein Sequences:Tolerance to Amino Acid Substitutions.Science 247,1306-1310.
11.Harbour and Lane 1998.Antibodies:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbour Press New York.27
12.Kohler and Milstein 1975.continuous Cultures of Fused CellsSecreting Antibody of Predefined Specficity.Nature,256,495-497.
13.Verhoeyen M.C Milstein,and G Winter Reshaping human antibodies:grafting an antilysozyme activity.Science 1988 Mar25;239(4847):1534-6.
14.Jones,P.T.,Dear,P.H.,Foote,J.,Neuberger,M.S.and Winter,G.″Replacing the complementarity-determining regions in a human antibody with those from a mouse.″Nature(1986)321:522-525.
15.Riechmann L,Clark M,Waldmann H,Winter G.Reshapinghuman antibodies for therapy.Nature.1988 Mar 24;332(6162):323-7.
16.Hoogenboom HR,Winter G(1992)Human antibodies from synthetic repertoires of germline VH gene segments rearranged in vitro.J MoI Biol.1992 Sep 20;227(2):381-8.
17.Michael Neuberger(1996)Generating high-avidity human Mabs in mice Nature Biotechnology 14,826
18.Tristan J.Vaughan,Jane K.Osbourn & Philip R.Tempest (1998)Human antibodies by design.Nature Biotechnology 16,535-539
19.Milstein and Cuello (1983)The co-expression of two immunoglobulin heavy-chain/light-chain pairs,where the two heavy chains have different specificities,Nature,305:537-539.
20.Suresh,M.R.,Cuello,A.C.and Milstein,C.(1986)Bi-specific monoclonal antibodies from hybrid hybridomas.Methods in Enzymology,121:210-228.
21.Brennan et al.,″Preparation of bispecific antibodies by chemical recombination of monoclonalimmunoglobulin Gl fragments″Science 229:81-83(1985).
22.Hunt PJ,Richards AM,Nicholls MG,Yandle TG,Doughty RN,Espiner EA.Immunoreactive amino terminal pro brain natriuretic peptide(NT-proBNP):a new marker of cardiac impairment.Clin.Endocrinol.199747:287-296.
23.The Immunoassay Handbook.3rd edition,ed.David Wild.Elsevier Ltd,2005.
24.Solber H.Approved recommendation(1987)on the theory of reference values.Part 5.Statistical treatment of collected reference values.Determination of reference limits.Journal of clinical Chemistry and Cilinical Biochemistry 198725:645-656.
25.Braud VM,Allan DS,O′Callaghan CA,Soderstrom K,D′Andrea A,Ogg GS,Lazetic S,Young NT,Bell JI,Phillips JH,Lanier LL,McMichael AJ.HLA-E binds to natural killer cell receptors CD94/NKG2A,B and C.Nature 1998391:795-799.
26.Universal definition of myocardial infarction.Consensus statement from the Joint ESC/ACCF/AHA/WHF Taskforce for the redefinition of myocardial infarction.Circulation 2007 116:2634-2653.
27.National Academy of Clinical Biochemistry and IFCC Committee for standardisation of markers of cardiac damage laboratory medicine practice guidelines:analytical issues for biochemical markers of acute coronary syndromes.Circulation 2007 115:e352-e355.
28.Kunkel,Thomas A.Rapid and efficient site-specificmutagenesis without phenotypic selection.Proc.Natl.Acad.Sci.USA Vol.82,pp.488-492,January 1985.
29.Techniques in Protein Modification By Roger L.Lundblad Edition:2 Published by CRC Press,1995 288 pages.
30.Atherton et al.(1989)Solid Phase Synthesis:a practical approach,IRL press.
31.Skyler JS.Non-insulin-dependent diabetes mellitus:a clinical strategy.Diabetes Care.1984 May-Jun;7 Suppl ILl 18-29.
本发明并不限于上述特定的优选实施方式。本领域技术人员可以对所披露的优选实施方式进行各种改进而没有偏离本发明的构思。所有这样的改进都将在本发明的范围内。
本文参考或提及的所有专利、出版物、科学论文、万维网站、以及其它文件和材料表明与本发明有关领域中的技术人员的水平,并且每个上述引用的文件和材料以引用方式结合于本文,其结合程度等同于如果其单独地以引用方式作为整体结合或作为整体在本文中描述。申请人保留物理上将来自任何上述专利、出版物、科学论文、万维网站、以电子方式可获得的信息、以及其它引用的材料或文件的任何及所有材料和信息加入本说明书的权利。
本专利的书面说明部分包括所有权利要求。另外,所有权利要求,包括所有原权利要求以及所有来自任何及所有优先权文件的权利要求,其全部内容以引用方式结合于本说明书的书面说明部分,并且申请人保留将任何及所有上述权利要求物理上加入本申请的书面说明或任何其它部分的权利。因此,例如,在任何情况下本专利都不可以解释为据宣称未提供权利要求的书面说明(基于权利要求的精确措辞未用这些文字陈述在本专利的书面说明部分中)。
在本说明书中披露的所有特点可以以任何组合加以结合。因此,除非另有明确陈述,所披露的每个特点仅是等效或类似特点的通用系列的一个实例。
应当明了,虽然已连同详细描述来描述了本发明,但上述描述用来说明而不是限制本发明的范围,本发明的范围是由所附权利要求的范围加以限定。因此,根据上述内容,应当明了,虽然为说明的目的本文已描述了本发明的具体实施方式,但可以进行各种改进而不偏离本发明的精神和范围。其它方面、优点、以及改进是在以下权利要求的范围内并且本发明仅受限于所附权利要求。
本文描述的具体方法和组合物代表优选实施方式并且是示例性的,而不是用于限制本发明的范围。鉴于本说明书,本领域技术人员将明了其它目的、方面、以及实施方式,并且包括在本发明的精神内,如由权利要求的范围所限定的。本领域技术人员显而易见的是,可以对本文披露的本发明进行多种替代和改进而不偏离本发明的范围和精神。本文说明性地描述的发明可以适当地在没有任何要素或多种要素、或限制或多种限制(其在本文中并没有明确披露为必不可少的)的条件下实施。因此,例如,在本文的每种情况下,在本发明的实施方式或实施例中,术语″包含″、″包括″、″含有″等要广泛而没有限制地加以理解。本文说明性地描述的方法和过程可以适当地以步骤的不同次序来实施,以及它们不一定限于在本文或权利要求中所指定的步骤次序。
已采用的术语和措辞是用作描述而不是限制的术语,并且并不是要使用这样的术语和措辞来排除所示和所描述的特点的任何等同替代或其一部分,而是应当明了,在如要求的本发明的范围内各种改进是可能的。因此,应当理解,虽然通过各种实施方式和/或优选实施方式以及可选的特点,已具体披露了本发明,但本领域技术人员可以采取的本文所披露构思的任何及所有改进和变化被认为是在如所附权利要求所限定的本发明的范围内。
本文已广泛和一般地描述了本发明。属于属类披露内容的每个更窄的种和亚属组也形成本发明的一部分。这包括本发明的带有附带条件或负面限制而从属中消除任何主题的属类描述,不论本文中是否明确列举缺失的材料。
还应当明了,如在本文中以及在所附权利要求中所使用的,单数形式″一″、″一种″以及″该″包括复数指称(除非上下文另有明确规定),术语″X和/或Y″是指″X″或″Y″或者″X″和″Y″,以及名词后的字母″s″是指上述名词的复数和单数形式。此外,在按照马库什组来描述本发明的特点或方面的情况下,它是指,并且本领域技术人员将明了,本发明包括马库什组的任何个体成员和成员的任何亚组并且还按照马库什组的任何个体成员和成员的任何亚组加以描述,以及申请人保留修改申请或权利要求的权利以具体提到马库什组的任何个体成员或成员的任何亚组。
其它实施方式落在以下权利要求内。本专利不可以解释为限于本文具体和/或明确披露的具体实施例或实施方式或方法。在任何情况下,本专利不可以解释为限于由专利局的任何审查员或任何其它官员或雇员作出的任何陈述,除非这样的陈述是由申请人采用书面回应形式确定地表达和无限定条件或保留地表达。
Claims (47)
1.一种胰岛素信号肽(INS-SP)结合剂。
2.根据权利要求1所述的INS-SP结合剂,所述INS-SP结合剂结合:
(a)INS-SP(1-24)SEQ ID NO:14;
(b)INS-SP(1-9)SEQ ID NO:16;
(c)INS-SP(15-24)SEQ ID NO:18;
(d)由选自SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:17以及SEQ IDNO:19的核苷酸序列编码的氨基酸序列;或
(e)(a)至(d)中任何一种的变体或片段。
3.根据权利要求1或权利要求2所述的INS-SP结合剂,所述INS-SP结合剂是抗INS-SP抗体或其抗原结合片段。
4.根据权利要求2或权利要求3所述的结合剂,所述结合剂选择性地结合INS-SP(1-9)(SEQ ID NO:16)或INS-SP(15-24)SEQID NO:18。
5.根据权利要求3或权利要求4所述的结合剂,所述结合剂是多克隆、单克隆、双特异性、嵌合或人源化抗体或它们的抗原结合片段。
6.根据权利要求1至5中任一项所述的结合剂,所述结合剂标记有可检测标记。
7.一种编码INS-SP片段的分离的核酸分子,其中,所述核酸选自:
(a)SEQ ID NO:17或其变体或片段;
(b)SEQ ID NO:19或其变体或片段;
(c)相对于SEQ ID NO:17或SEQ ID NO:19具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%或99%序列同一性的序列;
(d)长度为至少10个核苷酸、能够在严格条件下杂交于SEQ ID NO:17或SEQ ID NO:19或它们的变体或片段的序列;
(e)(a)至(d)中任何一种的补体,
条件是所述序列不是SEQ ID NO:15。
8.一种包含根据权利要求7所述的核酸分子的基因构建体,其包括载体、表达构建体、或宿主细胞。
9.一种分离的INS-SP多肽,选自:
(a)INS-SP(1-9)(SEQ ID NO:16)或其变体或片段;
(b)INS-SP(15-24)(SEQ ID NO:18)或其变体或片段;
(c)相对于SEQ ID NO:16或SEQ ID NO:18的多肽具有至少70%、75%、80%、85%、90%、95%或99%的氨基酸序列同一性的氨基酸序列;以及
(d)由根据权利要求7所述的核酸分子编码的INS-SP多肽。
10.根据权利要求9所述的多肽在制备抗INS-SP抗体中的应用。
11.一种对来自对象的生物样品中的INS-SP的测定法,所述测定法包括利用任何已知方法检测和测量在所述样品中的INS-SP水平。
12.根据权利要求11所述的测定法,其中,通过使INS-SP结合于结合剂来检测所述样品中的INS-SP水平,所述结合剂结合或选择性结合INS-SP。
13.一种对INS-SP的测定法,包括:
(a)结合来自生物样品的一种或多种INS-SP;以及
(b)测量结合INS-SP的水平。
14.根据权利要求12或13所述的测定法,其中,利用根据权利要求1至6中任一项所述的INS-SP结合剂结合所述INS-SP。
15.根据权利要求11至14中任一项所述的测定法,其中,所述生物样品是来自循环来源的样品。
16.根据权利要求11至15中任一项所述的测定法,其中,利用质谱法,包括通过SELDI、ESI、MALDI或FTICR,或利用选自RIA、ELISA、荧光免疫测定法以及免疫放射测定法的测定法,来测量INS-SP的水平。
17.根据权利要求16所述的测定法,其中,所述测量包括提供SELDI探针,所述探针包含附着于底物的抗INS-SP抗体或其抗原结合片段;使所述抗体或片段接触所述生物样品使得所述抗体或片段捕获来自所述样品的一种或多种INS-SP;以及利用SELDI测量结合INS-SP的水平。
18.一种INS-SP测定法,用于在对象中预测、诊断或监测生物事件或障碍。
19.一种用于在对象中预测、诊断或监测生物事件或障碍的方法,其中,所述事件或障碍与INS-SP释放到循环中有关,所述方法包括:
(a)测量来自所述对象的生物样品中的INS-SP水平;以及
(b)比较INS-SP的水平与来自对照的INS-SP水平,
其中所述测量水平与所述对照水平的偏差指示生物事件或障碍。
20.一种用于在对象中预测、诊断或监测糖尿病、或糖尿病可能性的方法,所述方法包括:
(a)测量来自所述对象的生物样品中的INS-SP水平;以及
(b)比较INS-SP的水平与来自对照的INS-SP水平,
其中,INS-SP的测量水平低于所述对照水平指示糖尿病或易患糖尿病体质。
21.一种用于评估对象中葡萄糖代谢的方法,所述方法包括:
(a)在给予葡萄糖后测量对象中INS-SP的水平;以及
(b)比较所述INS-SP的水平与来自对照的INS-SP水平,
其中,INS-SP的测量水平与所述对照水平的偏差指示葡萄糖代谢障碍。
22.一种用于在对象中预测、诊断或监测急性心脏疾病(ACD)的方法,所述方法包括:
(a)测量来自所述对象的生物样品中的INS-SP水平;以及
(b)比较所述INS-SP的水平与来自对照的INS-SP水平,
其中,INS-SP的测量水平高于所述对照水平指示ACD。
23.根据权利要求22所述的方法,其中,所述方法用于评估或监测对象中对急性心脏疾病(ACD)的治疗的响应,其中INS-SP的测量水平相比于所述对照水平的变化指示响应所述治疗。
24.根据权利要求22或权利要求23所述的方法,所述方法包括在ACD发作或临床表现的最初6小时、4小时或2小时内测量来自所述对象的生物样品中的INS-SP水平。
25.根据权利要求20至24中任一项所述的方法,其中,在ACD发作或临床表现ACD的最初6小时、4小时、2小时、1小时、或30分钟内测量INS-SP水平。
26.根据权利要求22至25中任一项所述的方法,其中,在所述样品中INS-SP水平在40至250pmol/L、45至200pmol/L、或50至150pmol/L的范围内指示ACD。
27.根据权利要求22至25中任一项所述的方法,其中,在所述样品中INS-SP水平为所述对照水平的5至15倍则指示ACD。
28.根据权利要求22至27中任一项所述的方法,其中,所述急性心脏疾病是在呈现的ECG上具有ST段抬高的急性心肌梗死(AMI)、不稳定型心绞痛、急性非ST段抬高型心肌梗死;心肌缺血、急性心肌损伤、急性药物毒性造成的急性心肌损害、急性心肌病、或心脏移植排斥反应。
29.根据权利要求20至28中任一项所述的方法,其中,所述生物样品是血液、血浆、血清、唾液、间质液、尿液或心脏组织样品。
30.根据权利要求20至29中任一项所述的方法,其中,所述测量步骤包括
(a)使INS-SP结合于结合剂;以及
(b)测量结合INS-SP的水平。
31.根据权利要求20至30中任一项所述的方法,其中,所述结合剂是根据权利要求1至6中任一项所述的结合剂。
32.根据权利要求20至31中任一项所述的方法,其中,利用选自质谱法(包括SELDI、ESI、MALDI或FTIC)、RIA、ELISA、荧光免疫测定法、免疫荧光测定法、以及免疫放射测定法的测定法测量INS-SP水平。
33.根据权利要求22至32中任一项所述的方法,所述方法进一步包括测量所述ACD的一种或多种非INS-SP标记物的水平,以及比较所述水平和来自对照的标记物水平,其中所述测量水平与所述对照水平的偏差、连同高于INS-SP对照水平的INS-SP测量水平,可预测或诊断所述ACD,或可以用来监测所述ACD。
34.根据权利要求33所述的方法,其中,所述非INS-SP标记物选自由肌钙蛋白T、肌钙蛋白I、肌酸激酶-MB、肌红蛋白、ANP、ANP-SP、BNP、NT-BNP、BNP-SP、LDH、天冬氨酸转氨酶、H-FABP、内皮素、肾上腺髓质素、肾素、缺血修饰白蛋白以及血管紧张素II构成的组。
35.根据权利要求20以及权利要求29至32中任一项所述的方法,当从属于权利要求20时,所述方法进一步包括测量糖尿病的一种或多种非INS-SP标记物的水平并比较所述水平与来自对照的标记物水平,其中,所述测量水平与非INS-SP标记物的对照水平的偏差、连同高于INS-SP对照水平的INS-SP测量水平,可以预测或诊断糖尿病或可以用来监测糖尿病。
36.根据权利要求35所述的方法,其中,所述非INS-SP标记物选自由葡萄糖、胰岛素、乳酸酯、甘油三酯以及脂肪酸或其标记物组成的组。
37.INS-SP结合剂在制备用于评估对象中生物事件或障碍的INS-SP测定物中的应用。
38.INS-SP结合剂在制造用于评估对象中生物事件或障碍的预后、诊断或监测工具中的应用。
39.根据权利要求37或权利要求38所述的应用,其中,所述生物事件或障碍是糖尿病或糖尿病可能性。
40.根据权利要求37或权利要求38所述的应用,其中,所述生物事件或障碍是葡萄糖代谢障碍。
41.根据权利要求37或权利要求38所述的应用,其中,所述生物事件或障碍是ACD。
42.根据权利要求37至41中任一项所述的应用,其中,所述结合剂是根据权利要求1至6中任一项所述的结合剂。
43.根据权利要求37至41中任一项所述的应用,其中,利用根据权利要求11至18中任一项所述的测定法、或根据权利要求19至36中任一项所述的方法,进行所述评估、预测、诊断或监测。
44.一种用于预测、诊断或监测生物事件或障碍的试剂盒,包括INS-SP结合剂;以及可选的用法说明书,用于根据在来自对象的生物样品中测得的INS-SP水平来预测、诊断或监测所述对象中的生物事件或障碍。
45.一种用于预测、诊断或监测急性心脏疾病(ACD)的试剂盒,包括INS-SP结合剂;以及可选地包括用法说明书,用于在对象中在发作或临床表现的6或4小时内,根据在ACD发作或临床表现的6或4小时内获得的生物样品中测得的INS-SP水平来预测、诊断或监测ACD。
46.根据权利要求44或权利要求45所述的试剂盒,其中,所述INS-SP结合剂是根据权利要求1至6中任一项所述的结合剂。
47.根据权利要求44至46中任一项所述的试剂盒,其中,所述试剂盒被校准以测量0.1至500pmol/L、1至300pmol/L、或10至250pmol/L范围内的INS-SP水平。
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CN201710106732.2A CN107043418A (zh) | 2008-03-12 | 2009-03-12 | 生物标记物 |
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US3577008P | 2008-03-12 | 2008-03-12 | |
US61/035,770 | 2008-03-12 | ||
PCT/NZ2009/000031 WO2009113879A1 (en) | 2008-03-12 | 2009-03-12 | Biomarkers |
Related Child Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201710106732.2A Division CN107043418A (zh) | 2008-03-12 | 2009-03-12 | 生物标记物 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN102037014A true CN102037014A (zh) | 2011-04-27 |
Family
ID=41065427
Family Applications (2)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201710106732.2A Withdrawn CN107043418A (zh) | 2008-03-12 | 2009-03-12 | 生物标记物 |
CN2009801086204A Pending CN102037014A (zh) | 2008-03-12 | 2009-03-12 | 生物标记物 |
Family Applications Before (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201710106732.2A Withdrawn CN107043418A (zh) | 2008-03-12 | 2009-03-12 | 生物标记物 |
Country Status (9)
Country | Link |
---|---|
US (2) | US9630985B2 (zh) |
EP (1) | EP2265641B1 (zh) |
JP (1) | JP5818440B2 (zh) |
CN (2) | CN107043418A (zh) |
AU (1) | AU2009224113B2 (zh) |
CA (1) | CA2715914C (zh) |
DK (1) | DK2265641T3 (zh) |
ES (1) | ES2666725T3 (zh) |
WO (1) | WO2009113879A1 (zh) |
Families Citing this family (5)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
AU2009224113B2 (en) | 2008-03-12 | 2013-02-21 | Otago Innovation Limited | Biomarkers |
US20140147874A1 (en) * | 2011-03-04 | 2014-05-29 | The Johns Hopkins University | Biomarkers of cardiac ischemia |
EP2592422A1 (en) * | 2011-11-08 | 2013-05-15 | Zora Biosciences OY | Lipidomic biomarkers for the prediction of cardiovascular outcomes in coronary artery disease patients undergoing statin treatment |
MX2020002879A (es) | 2017-09-14 | 2020-11-06 | Lixivia Inc | Metodos y composiciones de aislamiento de metales del grupo del cobre. |
WO2019238686A1 (en) * | 2018-06-13 | 2019-12-19 | Aziende Chimiche Riunite Angelini Francesco - A.C.R.A.F. S.P.A. | Peptides having inhibitory activity on muscarinic receptor m3 |
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN1346680A (zh) * | 2000-10-09 | 2002-05-01 | 北京大学 | 一种用于直接肌肉注射治疗糖尿病的人胰岛素前体基因和含有该基因的质粒 |
CN101039953A (zh) * | 2004-07-23 | 2007-09-19 | 沃尔特及伊莱萨霍尔医学研究院 | 治疗和诊断剂 |
Family Cites Families (56)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US4196265A (en) | 1977-06-15 | 1980-04-01 | The Wistar Institute | Method of producing antibodies |
US4208479A (en) * | 1977-07-14 | 1980-06-17 | Syva Company | Label modified immunoassays |
US4816567A (en) * | 1983-04-08 | 1989-03-28 | Genentech, Inc. | Recombinant immunoglobin preparations |
US5310687A (en) | 1984-10-31 | 1994-05-10 | Igen, Inc. | Luminescent metal chelate labels and means for detection |
US5843708A (en) | 1988-01-05 | 1998-12-01 | Ciba-Geigy Corporation | Chimeric antibodies |
GB8800077D0 (en) | 1988-01-05 | 1988-02-10 | Ciba Geigy Ag | Novel chimeric antibodies |
US5223409A (en) | 1988-09-02 | 1993-06-29 | Protein Engineering Corp. | Directed evolution of novel binding proteins |
US5939272A (en) | 1989-01-10 | 1999-08-17 | Biosite Diagnostics Incorporated | Non-competitive threshold ligand-receptor assays |
US5028535A (en) | 1989-01-10 | 1991-07-02 | Biosite Diagnostics, Inc. | Threshold ligand-receptor assay |
US5744101A (en) | 1989-06-07 | 1998-04-28 | Affymax Technologies N.V. | Photolabile nucleoside protecting groups |
US5922615A (en) | 1990-03-12 | 1999-07-13 | Biosite Diagnostics Incorporated | Assay devices comprising a porous capture membrane in fluid-withdrawing contact with a nonabsorbent capillary network |
CA2082265A1 (en) | 1990-05-07 | 1991-11-08 | Chien-Hsing Chang | Method for radiolabeling monovalent antibody fragments |
WO1992005282A1 (en) | 1990-09-14 | 1992-04-02 | Biosite Diagnostics, Inc. | Antibodies to complexes of ligand receptors and ligands and their utility in ligand-receptor assays |
ATE164395T1 (de) | 1990-12-03 | 1998-04-15 | Genentech Inc | Verfahren zur anreicherung von proteinvarianten mit geänderten bindungseigenschaften |
US5221685A (en) | 1991-02-01 | 1993-06-22 | Ube Industries, Ltd. | Thiazoline derivative, process for preparing the same and chemical for controlling noxious organisms containing the same |
US5955377A (en) | 1991-02-11 | 1999-09-21 | Biostar, Inc. | Methods and kits for the amplification of thin film based assays |
WO1992018868A1 (en) | 1991-04-10 | 1992-10-29 | Biosite Diagnostics Incorporated | Crosstalk inhibitors and their uses |
ATE195808T1 (de) | 1991-04-12 | 2000-09-15 | Biosite Diagnostics Inc | Neue konjugate und testverfahren für die gleichzeitige bestimmung von multiplen liganden |
US5885527A (en) | 1992-05-21 | 1999-03-23 | Biosite Diagnostics, Inc. | Diagnostic devices and apparatus for the controlled movement of reagents without membrances |
US6143576A (en) | 1992-05-21 | 2000-11-07 | Biosite Diagnostics, Inc. | Non-porous diagnostic devices for the controlled movement of reagents |
US5494829A (en) | 1992-07-31 | 1996-02-27 | Biostar, Inc. | Devices and methods for detection of an analyte based upon light interference |
US5605798A (en) | 1993-01-07 | 1997-02-25 | Sequenom, Inc. | DNA diagnostic based on mass spectrometry |
PT700521E (pt) | 1993-05-28 | 2003-10-31 | Baylor College Medicine | Metodo e espectrometro de massa para dessorcao e ionizacao de analitos |
US5824799A (en) | 1993-09-24 | 1998-10-20 | Biosite Diagnostics Incorporated | Hybrid phthalocyanine derivatives and their uses |
ZA948782B (en) | 1993-11-12 | 1996-05-07 | Unipath Ltd | Reading devices and assay devices for use therewith |
EP0653639B1 (en) | 1993-11-12 | 2000-03-22 | Unilever Plc | Analytical devices and methods of use thereof |
US5647124A (en) | 1994-04-25 | 1997-07-15 | Texas Instruments Incorporated | Method of attachment of a semiconductor slotted lead to a substrate |
GB9419267D0 (en) | 1994-09-23 | 1994-11-09 | Unilever Plc | Assay devices |
US5792294A (en) | 1995-11-16 | 1998-08-11 | Otis Elevator Company | Method of replacing sheave liner |
US5719600A (en) | 1995-12-12 | 1998-02-17 | Hewlett-Packard Company | Gradient calculation system and method |
US6113855A (en) | 1996-11-15 | 2000-09-05 | Biosite Diagnostics, Inc. | Devices comprising multiple capillarity inducing surfaces |
US5947124A (en) | 1997-03-11 | 1999-09-07 | Biosite Diagnostics Incorporated | Diagnostic for determining the time of a heart attack |
US6057098A (en) | 1997-04-04 | 2000-05-02 | Biosite Diagnostics, Inc. | Polyvalent display libraries |
NZ516848A (en) | 1997-06-20 | 2004-03-26 | Ciphergen Biosystems Inc | Retentate chromatography apparatus with applications in biology and medicine |
GB9717926D0 (en) | 1997-08-22 | 1997-10-29 | Micromass Ltd | Methods and apparatus for tandem mass spectrometry |
US6040575A (en) | 1998-01-23 | 2000-03-21 | Analytica Of Branford, Inc. | Mass spectrometry from surfaces |
US6406921B1 (en) | 1998-07-14 | 2002-06-18 | Zyomyx, Incorporated | Protein arrays for high-throughput screening |
US6831060B2 (en) | 1999-05-07 | 2004-12-14 | Genentech, Inc. | Chimpanzee erythropoietin (CHEPO) polypeptides and nucleic acids encoding the same |
US6811785B2 (en) * | 2001-05-07 | 2004-11-02 | Mount Sinai School Of Medicine Of New York University | Multivalent MHC class II—peptide chimeras |
US6784154B2 (en) | 2001-11-01 | 2004-08-31 | University Of Utah Research Foundation | Method of use of erythropoietin to treat ischemic acute renal failure |
CA2477563A1 (en) | 2001-12-21 | 2003-07-03 | Sense Proteomic Limited | Probe for mass spectrometry |
AUPS169202A0 (en) | 2002-04-11 | 2002-05-16 | Goetze, Jens Peter | Neuropeptide assay |
US6780645B2 (en) | 2002-08-21 | 2004-08-24 | Lifescan, Inc. | Diagnostic kit with a memory storing test strip calibration codes and related methods |
US7045366B2 (en) | 2003-09-12 | 2006-05-16 | Ciphergen Biosystems, Inc. | Photocrosslinked hydrogel blend surface coatings |
US20040091961A1 (en) | 2002-11-08 | 2004-05-13 | Evans Glen A. | Enhanced variants of erythropoietin and methods of use |
JP2006527190A (ja) | 2003-04-17 | 2006-11-30 | サイファージェン バイオシステムズ インコーポレイテッド | ナトリウム利尿ペプチドに関連したポリペプチド、並びにこれらの同定および使用法 |
AU2004253953A1 (en) | 2003-07-02 | 2005-01-13 | Genentech, Inc. | Compositions and methods for the diagnosis and treatment of tumor |
WO2005052593A1 (en) | 2003-10-29 | 2005-06-09 | The University Of Leicester | Detection |
US7423139B2 (en) | 2004-01-20 | 2008-09-09 | Insight Biopharmaceuticals Ltd. | High level expression of recombinant human erythropoietin having a modified 5′-UTR |
CN101035808B (zh) | 2004-08-05 | 2012-10-31 | 健泰科生物技术公司 | 人源化抗c-met拮抗剂 |
JP2006292623A (ja) | 2005-04-13 | 2006-10-26 | Univ Of Dundee | 心不全における突然死のマーカー |
EP1731910A1 (en) | 2005-06-07 | 2006-12-13 | F. Hoffmann-La Roche Ag | Use of NT-proANP and NT-proBNP for diagnosing cardiac diseases |
CN101611318B (zh) | 2006-09-07 | 2015-03-04 | 奥塔哥创新有限公司 | 生物标记物 |
GB0712670D0 (en) * | 2007-06-29 | 2007-08-08 | King S College London | Isolated peptides and uses thereof |
AU2009224114B2 (en) | 2008-03-12 | 2013-02-21 | Otago Innovation Limited | Biomarkers |
AU2009224113B2 (en) | 2008-03-12 | 2013-02-21 | Otago Innovation Limited | Biomarkers |
-
2009
- 2009-03-12 AU AU2009224113A patent/AU2009224113B2/en not_active Ceased
- 2009-03-12 US US12/922,438 patent/US9630985B2/en not_active Expired - Fee Related
- 2009-03-12 JP JP2010550627A patent/JP5818440B2/ja not_active Expired - Fee Related
- 2009-03-12 DK DK09719459.1T patent/DK2265641T3/en active
- 2009-03-12 CA CA2715914A patent/CA2715914C/en not_active Expired - Fee Related
- 2009-03-12 CN CN201710106732.2A patent/CN107043418A/zh not_active Withdrawn
- 2009-03-12 EP EP09719459.1A patent/EP2265641B1/en not_active Not-in-force
- 2009-03-12 CN CN2009801086204A patent/CN102037014A/zh active Pending
- 2009-03-12 ES ES09719459.1T patent/ES2666725T3/es active Active
- 2009-03-12 WO PCT/NZ2009/000031 patent/WO2009113879A1/en active Application Filing
-
2017
- 2017-03-16 US US15/461,326 patent/US10106575B2/en not_active Expired - Fee Related
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN1346680A (zh) * | 2000-10-09 | 2002-05-01 | 北京大学 | 一种用于直接肌肉注射治疗糖尿病的人胰岛素前体基因和含有该基因的质粒 |
CN101039953A (zh) * | 2004-07-23 | 2007-09-19 | 沃尔特及伊莱萨霍尔医学研究院 | 治疗和诊断剂 |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
L. CHANG等: "Novel strategy for identification of candidate cytotoxic T-cell epitopes from human preproinsulin", 《TISSUE ANTIGENS》 * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
EP2265641A4 (en) | 2012-08-01 |
EP2265641A1 (en) | 2010-12-29 |
US10106575B2 (en) | 2018-10-23 |
CA2715914C (en) | 2019-01-22 |
ES2666725T3 (es) | 2018-05-07 |
EP2265641B1 (en) | 2018-01-24 |
DK2265641T3 (en) | 2018-04-23 |
US20180051050A1 (en) | 2018-02-22 |
JP2011516037A (ja) | 2011-05-26 |
JP5818440B2 (ja) | 2015-11-18 |
US20110104723A1 (en) | 2011-05-05 |
AU2009224113B2 (en) | 2013-02-21 |
CN107043418A (zh) | 2017-08-15 |
CA2715914A1 (en) | 2009-09-17 |
WO2009113879A1 (en) | 2009-09-17 |
US9630985B2 (en) | 2017-04-25 |
AU2009224113A1 (en) | 2009-09-17 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
CN101977933A (zh) | 生物标记物 | |
DK2089722T3 (en) | BIOMARKET FOR EARLY DETECTION OF ACUTE HEART DISORDERS | |
CN102084251A (zh) | 用于急性冠状动脉疾病的生物标志物 | |
US10106575B2 (en) | Biomarkers |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
C06 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
C10 | Entry into substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
RJ01 | Rejection of invention patent application after publication |
Application publication date: 20110427 |
|
RJ01 | Rejection of invention patent application after publication |